Universitas Scientiarum

Fishing effects on elasmobranchs from the Pacific Coast of Colombia

During 1995, 2001, 2003, 2004 and 2007; we studied the temporal variation in the structure of the elasmobranch assemblage along the Colombian Pacific coast using: the community index of diversity, heterogeneity, equitability, species composition, average catch sizes, and mean trophic levels. A total of 1711 specimens from 19 species (7 sharks and 12 rays) were collected during the 90 trawling operations. The number of species captured varied between 7 (1995) and 12 (2007) demonstrating a trend towards an imbalance in the assemblage attributes. In 1995, the mean trophic level (TLm) of the assemblage was 3.60, but in 2007 it decreased to 3.55 when the functional level of large predators was absent (TL > 4). These results suggest changes in species composition, structural attributes, and a reduction of the highest functional level. Alterations to the catch proportions were also found: i.e. a greater abundance of rays of lower trophic levels. This study suggests an effect of trawling on the stability of this tropical coastal ecosystem.

Durante 1995, 2001, 2003, 2004 y 2007 estudiamos la variación temporal en la estructura de un ensamblaje de elasmobranquios a lo largo de la costa pacífica colombiana. Para ello utilizamos los índices de diversidad, heterogeneidad, equitatividad y composición de especies, así como el tamaño promedio de capturas y los niveles tróficos promedio. Se colectó un total de 1711 especímenes de 19 especies (7 tiburones y 12 rayas) durante 90 operaciones de pesca de arrastre. El número de especies capturadas varió entre 7 (1995) y 12 (2007), lo cual demuestra una tendencia hacia un desbalance en los atributos del ensamblaje. En 1995 el nivel trófico promedio (TLm) del ensamblaje fue de 3.60, pero en 2001 disminuyó a 3.55, cuando estuvo ausente el nivel funcional de grandes predadores (TL > 4). Estos resultados sugieren cambios en la composición de especies y en los atributos estructurales, y una reducción del nivel funcional superior. Se encontraron también alteraciones en las proporciones de captura, como una mayor abundancia de rayas de niveles tróficos inferiores. Este estudio sugiere un efecto de la pesca de arrastre en la estabilidad de este ecosistema tropical costero.

Durante 1995, 2001, 2003, 2004 e 2007 estudamos a variatilo temporal na estrutura da comunidade de elasmobranquios ao longo da costa pacífica colombiana usando o índice comunitário de diversidade, heterogeneidade, equidade, composic. So de espécies, tamanho médio das capturas e níveis tróficos médios. Um total de 1711 espécimes de 19 espécies (7 tubarões e 12 raias) foram coletadas durante as 90 operações de pescas de arrasto. O número de espécies capturadas variou entre 7 (1995) e 12 (2007), demonstrando uma tendencia ao desequilibrio nos atributos da comunidade. Em 1995, o nível trófico médio (TLm) da comunidade era de 3,60, mas em 2007 decresceu para 3,55 quando o nível funcional de grandes predadores estava ausente (TL ≥ 4). Estes resultados sugerem alterações na compostilo das espécies, em atributos estruturais e uma redução do mais alto nível funcional. Também foram encontradas alterações na propongo de capturas, ou seja, uma maior abundancia de raias de níveis tróficos mais baixos. Este estudo sugere um efeito da pesca de arrasto na estabilidade de este ecossistema costeiro tropical.

Proposal of a non-lethal visual census method to estimate freshwater stingray abundance

There is not a current method to estimate South American freshwater stingray's abundance. Therefore we designed a census method and tested it in the field. It consists of making nocturnal surveys by boat in large rivers (>25m width) and floodplain lagoons of varying sizes, along transects of 100m x 10m (1000 m²). We applied this method in the Tomo River, a tributary of the Orinoco River in Colombia. 110 transects were surveyed in 200 runs. A total of 149 rays of four species were recorded: Potamotrygon motoro, Potamotrygon orbignyi, Potamotrygon schroederi and Paratrygon aiereba. P. motoro was the most abundant with a density of 0.31 individuals /1000 m² (SD=0.5). This method gave optimal results when applied to habitats with high transparency and shallow depth (< 1m) since it permitted the identification of both adults and juveniles present.

No existe actualmente un método para estimar la abundancia de las rayas suramericanas de agua dulce. Por ello se diseño un método para censarlas y se probó en campo. Consiste en hacer recorridos nocturnos en bote por ríos grandes (>25 m de ancho) y lagunas inundables de diversos tamaños, a lo largo de transectos de 100 m x 10 m (1000 m²). Con este método se muestreó el río Tomo, un tributario del río Orinoco en Colombia. Se muestrearon 100 transectos en 200 recorridos. Se registró un total de 149 rayas pertenecientes a cuatro especies: Potamotrygon motoro, Potamotrygon orbignyi, Potamotrygon schroederi and Paratrygon aiereba. P. motoro fue la más abundante, con una densidad de 0.31 individuos/1000 m² (DE=5.06). Este método dio óptimos resultados cuando se aplicó a hábitats con alta transparencia y poca profundidad (<1m), ya que así es posible identificar tanto a los adultos como a los juveniles presentes.

Nao há um método atual para estimar a abundancia de raias de água doce Sul-Americanas, assim que desenliamos um método de censo e o testamos em campo no rio Tomo, um afluente do rio Orinoco, em Colombia. Este método consiste na realização de levantamentos noturnos por barco em grandes rios (> 25m de margem) e lagoas de várzea de tamanhos diversos, usando um transecto de 100m x 10m (1000 m²). Em um total de 200 percursos, 110 transectos foram pesquisados. Um total de 149 raias de quatro espécies foram registradas: Potamotrygon motoro, Potamotrygon orbignyi, Potamotrygon schroederi e Paratrygon aiereba. P. motoro foi a mais abundante, com uma densidade de 0,31 indivíduos/1000 m² e um desvio padrao (DP) de 5,06. Este método forneceu os melhores resultados quando aplicado a habitats com alta transparencia e baixa profundidade (< 1m) uma vez que permite a identificação de espécies tanto adultas quanto jovens.

**Nursery area and size structure of the lemon shark population, Negaprion brevirostris (Poey, 1868), in Los Roques Archipelago National Park, Venezuela**

The protection of the habitats used by juvenile sharks is a management strategy that has recently caught the attention of fishery biologists. In the present study, we evaluated the population of the lemon shark (Negaprion brevirostris) from Los Roques Archipelago in order to identify the nursery area, describe the size composition, and examine the variation in nocturnal activity of the juvenile individuals. The data analysed came from three different sources: commercial shark fishery, tag-recapture sampling, and visual records. A total of 375 lemon sharks with total lengths between 55 and 281 cm were recorded during the study period. Overall data showed that the area occupied by juvenile lemon sharks was clearly partitioned into primary and secondary nurseries. Additionally, nighttime activity seemed to change according to the size of sharks in the primary nursery, suggesting a reduction of time activity overlapping among juveniles of distinct size/age. Results suggest that the strategy of utilization of the primary nurseries by the lemon shark may lead to important ecological benefits by reducing the competition, predation and natural mortality.

La protección de los hábitats utilizados por tiburones juveniles es una estrategia de manejo que ha capturado recientemente la atención de los biólogos de pesquerías. En el presente estudio se evaluó la población del tiburón limón (Negaprion brevirostris) del Archipiélago Los Roques con el fin de identificar su zona de cría, describir su composición de tamaño y examinar la variación en la actividad nocturna de los juveniles. Los datos analizados provienen de 3 fuentes distintas: pesquería comercial de tiburones, muestreo de captura-marcaje-recaptura y registros visuales. Durante el período de estudio se registró un total de 375 tiburones limón, con longitudes totales entre 55 y 281 cm. En general, los datos mostraron que el área ocupada por los tiburones limón estaba claramente dividida entre zonas de cría primarias y secundarias. Adicionalmente, la actividad nocturna parecía cambiar de acuerdo con el tamaño de los tiburones en la zona de cría primaria, lo cual sugiere una reducción de la coincidencia entre juveniles de distinto tamaño/edad. Los resultados sugieren que la estrategia de utilización de la zona de cría primaria por el tiburón limón puede conducir a importantes beneficios ecológicos por la reducción de competencia, predación y mortalidad natural.

A protecao dos habitats utilizados pelos tubaroes jovens é uma estratégia de manejo que recentemente tem chamado á atenção dos biólogos pesqueiros. No presente estudo avaliamos a populacao do tubarao limao (Negaprion brevirostris) no Arquipélago de Los Roques, com o propósito de identificar a área de berçário, descrever a composição de tamanhos, e examinar a variação da atividade noturna dos individuos jovens. Os dados analisados foram originados a partir de tres fontes diferentes: Foram analisados dados da pescaría comercial de tubaroes, trabalhos de marcação e recaptura, e registos visuais. Um total de 375 tubaroes limáo com comprimento total entre 55 e 281 cm foi registado durante o período de estudo. Os dados mostram que a zona ocupada pelos tubaroes limao jovens se encontra claramente dividida em áreas de berçários primaria e secundária. Adicionalmente, a atividade noturna dentro da área de berçário primaria pareceu mudar de acordo com o tamanho dos tubaroes, sugerindo uma separação desta atividade por grupos de idade. Os resultados sugerem que a estratégia de utilizacao da área de berçário primaria do tubarao limao poderia oferecer importantes benefícios ecológicos, como a reducao da competicao, predacao e mortalidade natural.

**Presence of Ruvettus pretiosus (Gempylidae) in the Colombian continental Caribbean**

The first record of Ruvettus pretiosus Cocco, 1833 for the Colombian continental Caribbean is presented. The specimen was collected at Los Cocos, department of Magdalena (11° 16' 33, 84'' N 73° 53' 33, 01'' W), using a demersal longline gear placed at 100 m depth. Biometrics, diagnosis and comments regarding its distribution, ecology and biology are included in the description. This new record expands the distribution of the species in the Caribbean Sea and increases the reported number of gempylids for Colombia to five.

Se presenta el primer registro de Ruvettus pretiosus Cocco, 1833, para el Caribe colombiano continental. El especimen fue colectado en Los Cocos, Departamento de Magdalena, (11° 16' 33, 84'' N 73° 53' 33, 01'' W), usando un palangre sumergible colocado a 100 m de profundidad. En la descripción se incluye biometría, diagnóstico y comentarios sobre su distribución, ecología y biología. Este nuevo registro amplía la distribución de la especie en el Mar Caribe e incrementa a cinco el número de gempílidos reportados en Colombia.

É apresentado o primeiro registro de Ruvettuspretiosus Cocco, 1833, para o Caribe Colombiano continental. O espécime foi capturado na vereda Los Cocos, Departamento de Magdalena (11° 16' 33, 84'' N 73° 53' 33, 01'' W), utilizando palangres horizontais demersales a uma profundidade de 100 m. Estao incluídos neste manuscrito dados biométricos, diagnóstico das espécies e comentários sobre a sua distribuiclo, ecología e biología. Com este novo reporte a distribuiclo das espécies no Mar do Caribe se expande, aumentando para cinco o números de espécies da família Gemphelidae na Colombia.

Scientometric analysis of Colombian research on bio-inoculants for agricultural production

The excessive use of synthetic chemical inputs in agricultural production has led to the disruption of biogeochemical cycles. One of the alternatives that arose within the systems of sustainable agriculture was the partial or total replacement of chemicals by biological substances. The analysis of relevant scientific literature has become a tool for assessing the quality of knowledge generation and its impact on the environment. A scientometric analysis was conducted of Colombian research on bio-inoculants from 2009 through 2014 in journals added to the Web of SciencesTM in order to identify the characteristics of the main target crops, the microorganisms used, and the beneficial effects on agriculture. In this work, 34 articles were identified: 24 (71 %) were research on bio-fertilizer development and 10 (29 %) on bio-pesticides. Articles mainly focused on the study of Gram-negative bacilli affecting the area (77 %), while others focused on issues and topics surrounding vegetables (30 %).The analysis of co-occurrence of keywords identified: i. several genera of microorganisms (e.g. A%otobacter sp., Bradyrhi%obium sp.) and sustainable agriculture as issues that have a leading role in this scientific field, ii. plant growth promoting rhizobacteria (PGPR) as an emerging issue, iii. biological nitrogen fixation (BNF) as a subject which has risen in a complementary manner and iv. endophytic bacteria and biodiversity as issues in growth. This study showed that research in Colombia could be targeted on issues such as endophytic bacteria, diversity and productivity.

El uso excesivo de insumos sintéticos en la producción agrícola ha llevado a la disrupción de los ciclos biogeoquímicos. Como alternativa a este problema, los sistemas de agricultura sostenible han reemplazado parcial o totalmente los químicos por sustancias biológicas. El análisis de literatura científica relevante se ha convertido en una herramienta para determinar la calidad de la generación de conocimiento en este campo y su impacto en el ambiente.Se llevó a cabo un análisis cienciométrico de la investigación en Colombia sobre bioinoculantes entre 2009 y 2014. Se tuvieron en cuenta revistas indizadas en la Red de Ciencias®. Se buscó identificar las características de los principales cultivos, los microorganismos utilizados y sus efectos benéficos en la agricultura. Se seleccionaron 34 artículos: 24 (71%) sobre desarrollo de biofertilizantes y 10 (29%) sobre biopesticidas. Los artículos se enfocaron principalmente en el estudio de bacilos Gram-negativos (77%), mientras que otros se enfocaron en los temas relativos a hortalizas (30%). El análisis de co-ocurrencia de palabras claves identificó: i. Algunos géneros de microorganismos (Azptobacter sp., Bradyrhizobium sp.) y la agricultura sostenible como temas relevantes en este campo, ii. Rizobacterias promotoras del crecimiento en plantas (PGPR) como un tópico emergente, iii. Fijación biológica de nitrógeno (FBN) como un tema emergente y complementario y iv. Bacterias endofíticas y biodiversidad como tópicos en crecimiento. Este estudio mostró también que la investigación en Colombia podría enfocarse en temas como bacterias endofíticas, diversidad y productividad.

O uso excessivo de produtos químicos sintéticos na produção agrícola levou a uma perturbação dos ciclos biogeoquímicos. Uma das alternativas que surgiram dentro dos sistemas de agricultura sustentável foi a substituição total ou parcial de compostos químicos por substancias biológicas. O estudo de literatura científica relevante se tornou uma ferramenta para avaliar a qualidade da geração de conhecimento e seu impacto no meio ambiente. A análise cientométrica foi realizada em investigacoes colombianas sobre bioinoculantes de 2009 a 2014, em revistas disponíveis em Web of ScienceTM, com o intuito de identificar as características das principais culturas alvos, os microorganismos utilizados, e o efeito benéfico na agricultura. Neste trabalho, 34 artigos foram identificados: 24 (71 %) eram pesquisas sobre o desenvolvimiento de biofertilizantes e 10 (29 %) sobre biopesticidas. Os artigos eram focados principalmente no estudo de bacilos Gram-negativos afetando a área (77 %), enquanto que outros eram voltados a questoes e temas de vegetais (30 %). A análise de coocorréncia de palavras-chave identificou: i. diversos géneros de microorganismos (Ex. Azptobacter sp., Bradyrhizpbium sp.) e agricultura sustentável como questóes fundamentais nesta área científica, ii. rizobactéricas promotoras de crescimento de plantas (PGPR) como um tema emergente, iii. fixação biológica de nitrogénio (BNF) como um assunto que tem surgido de maneira complementar e iv. bactérias endofíticas e biodiversidade como temas em crescimento. Este estudo mostrou que a pesquisa na Colombia poderia ser dirigida a questoes como bactérias endofíticas, diversidade e produtividade.

**Ecological aspects of Lebiasina erythrinoides (Characiformes: Lebiasinidae) from an andean piedmont stream in Colombia**

The present study describes ecological aspects of Lebiasina erythrinoides; 200 individuals were sampled throughout an annual hydrological cycle from October 2008 to September 2009 in La Calaboza stream, a Piedmont tributary of the Rio Cravo Sur. The studied population had more females than males (1.5:1) and preferred habitats dominated by shoreline vegetation and rocky substrates. Prior to reproductive events, individuals presented an increase in the condition factor (K) and the gonosomatic index (GSI). On average, 648.8 oocytes are discharged twice a year: at the beginning of the rainy season, and during falling water phase. The mean sizes at sexual maturity found for females were 73.5 mm standard length (SL) and for males 70 mm SL. Rounding up, an average minimum size of capture of 75 mm SL is proposed. Most specimens of the population (65 %) were found to be maturing or mature (stages II and III), 28.5 % immature (stage I), 5.0 % in post reproduction stage V, and 1.5 % in reproductive phase (IV). Results suggest this species is omnivorous with a preference for invertebrates (IRI = 41.2 %) and vegetal material (IRI = 27.8 %), but also includes a variety of other items. The values of the diet are correlated with hydrological cycle and size.

El presente estudio describe aspectos ecológicos de Lebiasina erythrinoides. Se muestrearon 200 individuos a lo largo del ciclo hidrológico anual, de Octubre de 2008 a Septiembre de 2009, en la quebrada La Calaboza, un tributario de piedemonte del Río Cravo Sur. La población estudiada presentó más hembras que machos (1.5:1) y prefirió hábitats dominados por vegetación riparia y sustratos rocosos. Antes de los eventos reproductivos, los individuos presentaron un incremento en el factor de condición (K) y en el índice gonadosomático (GSI). En promedio, se descargaron 648.8 oocitos dos veces en el año: al inicio de la estación lluviosa y durante la fase de descenso de las aguas. Los tamaños promedio de las hembras en madurez sexual fueron de 73.5 mm de longitud estándar (SL), y de los machos, 70 mm SL. De acuerdo con estas cifras, se propone un tamaño mínimo de captura de 75 mm SL. La mayor parte de especímenes de la población (65 %) se encontró en proceso de maduración o de madurez (estadios II y III), 28.5 % en estado inmaduro (estadio I), 5.0 % en estado post-reproductivo (V) y 1.5 % en fase reproductiva (V). Los resultados sugieren que esta especie es omnívora: prefiere invertebrados (IRI = 41.2 %) y material vegetal (IRI = 27.8 %), pero su dieta incluye también variedad de otros ítems. Los valores de la dieta se correlacionan con el ciclo hidrológico y con el tamaño.

O presente estudo descreve aspectos ecológicos de Lebiasina erythrinoides. Foram coletados 200 indivíduos ao longo de um ciclo hidrológico anual, entre Outubro de 2008 e Setembro de 2009 no riacho La Calaboza, um afluente do rio Cravo Sur. A populacho estudada possuía mais fèmeas que machos (1.5:1) e preferiam habitats dominados por vegetalo costeira e substratos rochosos. Prèvio aos eventos reprodutivos, os individuos presentaram um aumento do fator de condicio (K) e do índice gonadosomatico (GSI). Em mèdia, 648.8 ovócitos são desovados duas vezes ao ano: no inicio do período chuvoso, e durante a descida das águas. O tamanho mèdio encontrado para as fèmeas na maturidade sexual foi de 73.5 mm comprimento padrão (SL), e para os machos foi de 70 mm SL. Considerando os valores encontrados, se propoe que o tamanho mínimo de captura seja de 75 mm SL. A maioria dos espècimes da populacho estudada (65 %) se encontrava nos estágios de maturação ou maduros (Estágios II e III), 28.5 % de imaturos (I), 5.0 % em estágio pós-reprodução (V) e 1.5 % em fase reprodutiva (IV). Os resultados sugerem que a espécie é omnívora, com uma preferencia por invertebrados (IRI = 41.2 %) e material vegetal (IRI = 27.8 %), mas também se inclui uma variedade de outros itens. Os valores da dieta estão correlacionados com o ciclo hidrológico e tamanho.