Infectio

Evaluation of the impact of a program of epidemiological surveillance in consumption of antibiotics and flora in a third level clinic

Objetivo. Evaluar el impacto que un programa de vigilancia epidemiológica tiene en las características de la formulación de antibióticos y la frecuencia de gérmenes multirresistentes en una clínica de tercer nivel en la ciudad de Medellín. Materiales y métodos. Es un estudio retrospectivo y observacional, dividido en una fase de 18 meses previa a la intervención, comprendida entre julio 1 de 2004 y diciembre 31 de 2005, y una fase de intervención de 18 meses, comprendida entre enero 1 de 2006 y junio 30 de 2007. El estudio se llevó a cabo en la Clínica Las Vegas de la ciudad de Medellín. Incluyó como universo, los aislamientos de gérmenes multirresistentes y la cantidad de antibiótico formulado. Se evaluaron los cambios en la formulación de antibióticos (dosis diaria definida por 100 día/cama) y los cambios en la frecuencia de aislamientos de gérmenes multirresistentes. Resultados. Se encontró un incremento progresivo en el uso de antibióticos, sin que se hubieran modificado los indicadores de ocupación hospitalaria. La política de intervención demostró una reducción estadísticamente significativa en el uso de ceftriaxona (p >0,001), imipenem (p<0,01), meropenem (p<0,001) y glucopéptidos (p<0,04), asociada a un aumento en la formulación de ampicilina/sulbactam, piperacilina/ tazobactam, quinolonas y aminoglucósidos. No se modificó la frecuencia de aislamientos de gérmenes multirresistentes (p<0,51). Conclusiones. Una política de vigilancia epidemiológica tiene un impacto positivo en el consumo general de antibióticos de gran valor biológico y económico, sin que el presente estudio haya podido demostrar un impacto positivo en la frecuencia de aislamientos multirresistentes.

Objective: To determine the impact of an epidemiological surveillance program in the formulation patterns of antimicrobials, and the frequency of multirresistant bacteria isolated in a third level clinic in Medellin. Materials and methods: A retrospective and observational study, divided in a pre-intervention phase of 18 months, between July 1st 2004 a December 31st 2005, and an intervention phase of 18 months, between January 1st 2006 and June 30th 2007 was carried out. The study was done at Las Vegas Clinic in Medellín on the multiresistant bacteria isolated and the amount of antibiotic prescribed. The observed changes were evaluated in the magnitude of antibiotics formulation (daily defined doses x 100 day-bed) and the changes in the frequency of isolations of multiresistant bacteria. Results: A progressive increase in the use of antibiotics was found without modifying clinic occupation indicators, the intervention policy demonstrated statistically significant reduction in the use of Ceftriaxone (p < 0.001), Imipenem (p 0.01), Meropenem (p < 0.001) and glicopeptides (p 0.04), this was associated with an increase in the Ampicillin/Sulbactam, Piperacillin/Tazobactam, quinolones and aminoglicosides formulation. It did not modify the frequency of evaluated multiresistant germs (p 0.51). Conclusions: An epidemiologic surveillance policy has a positive impact in antibiotic consumption, but this study does not demonstrate a positive impact in multiresistant bacteria isolation frequency.

Vulvovaginal candidiasis in a group of pregnant women from Medellín

Introducción. En la mujer embarazada, factores como la carga hormonal y los altos niveles de glucogéno favorecen la colonización y la infección vaginal por levaduras. Objetivo. Determinar la prevalencia de levaduras del género Candida, aisladas de muestras de flujo vaginal de un grupo de mujeres embarazadas de la ciudad de Medellín y evaluar la sensibilidad a los antifúngicos. Materiales y métodos. Estudio descriptivo en el cual se estudiaron 300 mujeres gestantes que acudieron a los programas de control prenatal de diferentes IPS de Medellín, en el período de febrero de 2006 a junio de 2007. Se determinó la prevalencia de Candida spp. mediante cultivo e identificación de las levaduras obtenidas, y se determinó la sensibilidad a fluconazol e itraconazol por el método comercial del ATB fungus. A las cepas en las que se evidenció crecimiento residual en fluconazol por dicho método, se les realizó antibiograma por los métodos avalados por el Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) microdilución M27-A y método de difusión en disco M-44P. Resultados. La prevalencia de Candida spp. fue de 33,3% (C. albicans, 77%; C. parapsilosis, 11%; C. tropicalis, 5%; C. glabrata, 3%; C. guillermondii, 2%; C. kefyr, 1%, y C. famata, 1%). Todos los aislamientos mostraron sensibilidad al fluconazol. Se halló resistencia al itraconazol en 9% de los aislamientos de C. albicans y en 100% de los de C. glabrata. El 2,5% de los aislamientos de C. albicans y el 100% de los de C. kefyr resultaron sensibles dependiente de la dosis a dicho antifúngico. Conclusiones. C. albicans fue la levadura más frecuentemente aislada de flujo vaginal, seguida por patógenos emergentes, como C. parapsilosis y C. tropicalis. En la población estudiada, las levaduras del género Candida son aún ampliamente sensibles a los antifúngicos. Se recomienda la identificación de la levadura a nivel de especie y hacer pruebas de sensibilidad en el caso de falla terapéutica y en infecciones recidivantes.

During pregnancy, risk factors such as the high hormonal load and high levels of glucogen allow vaginal colonization and infection by yeasts. Objective: To determine the prevalence of Candida spp. isolated from samples of vaginal discharge from pregnant women in Medellín and to test their sensitivity to antimycotic agents. Materials and methods: Descriptive study in which 300 pregnant women were tested between February 2006 to June 2007. The prevalence of Candida spp. was determined by culture, the yeasts were identified, and the sensitivity to fluconazole and itraconazole was determined by the ATB fungus method; the strains with residual growth in fluconazole by such method were submitted to antibiogram by the methods approved by the CLSI. Results: The prevalence of Candida spp. was 33.3% (C. albicans, 77%). All the isolations showed sensitivity to fluconazole. Resistance to itraconazole was found in 9% of C. albicans isolates, and in 100% of C. glabrata; 2.5% of the isolates of C. albicans and 100% of C. kefyr resulted sensitive dose-dependent to such antymicotyc. Conclusions: C. albicans was the yeast most frequently isolated from vaginal discharge, followed by emergent pathogens such as C. parasilopsis and C. tropicalis. In the studied population, yeasts from the Candida gender were still very sensitive to antimycotic agets. It is recommended to identify the yeast to its gender and to perform sensitivity tests in case of therapeutic failure or in recurrent infections.

Molecular variation of Candida spp. isolates using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD), from women in Armenia, Colombia

Objetivos. Caracterizar las especies de Candida que colonizan el conducto vaginal y su relación con sintomatología en las pacientes a quienes se les hace citología vaginal en Armenia (Quindío) y establecer el mejor cebador para la técnica de amplificación aleatoria de ADN polimórfico (Random Amplified Polymorphic DNA, RAPD). Materiales y métodos. Se recolectaron 226 muestras de flujo vaginal de mujeres que asistían a citología rutinaria preventiva y se les realizó cultivo en medio de Sabouraud, prueba de tubo germinal y batería de asimilación de carbohidratos. Se probaron tres cebadores para la amplificación aleatoria de ADN polimórfico. Resultados. Se encontró una prevalencia de cultivos positivos en Sabouraud de 31,8% (77 de 226 muestras) con un predominio de Candida albicans, que representó el 71% de las especies cultivadas (55 de 77 cultivos). La frecuencia de síntomas de vaginitis fue mayor en mujeres con cultivo positivo para levadura (93%) que en las que tuvieron cultivo negativo (37%). El mejor método de extracción de ADN fue congelamiento y descongelamiento, y lisis con liticasa. La técnica de amplificación aleatoria de ADN polimórfico fue aplicada a 47 aislamientos, y entre tres cebadores utilizados, el OPA9 fue el que permitió obtener mayores polimorfismos. Los análisis por dendrogramas mostraron 6 nodos predominantes, entre los cuales dos nodos incluyeron sólo aislamientos que producían síntomas (nodo IV y nodo V). En el nodo V se encontró que todos los aislamientos de C. albicans eran del mismo centro de salud. Conclusiones. En conclusión, C. albicans predomina y produce síntomas en mujeres de Armenia y el método de amplificación aleatoria de ADN polimórfico con el cebador OPA9, permitió obtener polimorfismos suficientes para conformar agrupamientos de las cepas de Candida.

Objectives: To characterize the Candida species in samples of routine vaginal cytology in Armenia (Colombia) and their relationship with symptoms. Also, to select the adequate primer for a random amplified polymorphismc DNA analysis (RAPD) applied to the Candida species to determine the level of genetic relation. Materials and methods: A total of 226 samples of vaginal secretions were obtained in patients that assist for routine preventive vaginal cytology. The samples were cultured in Sabouraud and then germ tube assay and carbohydrates assimilation test were performed. Three primers were assayed to determine the best for a reproducible RAPD technique. Results: The prevalence of Sabouraud positive cultures was 31.8% (77 of 226 samples) and Candida albicans was the predominant species, representing 71% (55 de 77 samples). Vaginitis symptoms were more frequent in women with positive Sabouraud cultures (93%) vs. women with negative Sabouraud cultures (37%). The best extraction method for DNA extraction was freezing and thawing cycles followed by enzymatic lyses with lyticase. In 47 isolates of Candida species, the best primer that resulted in significant polymorphisms was the OPA 9. A 95% similarity coefficient was obtained 6 clusters. Clusters IV and V only included C. albicans isolates producing symptoms. In cluster V all the isolates were from the same consultation center. Conclusions: C. albicans was the predominant yeast in Armenia and was related with a greater frequency of symptoms. The RAPD technique with OPA9 primer in Armenia, unravel genetic relations of C. albicans isolates that could be used for epidemiological studies.

**Isolation and identification of Enterobacter sakazakii in milk feeders of Bogotá, D. C**

Introducción. Enterobacter sakazakii es un patógeno oportunista emergente de alto riesgo, responsable de meningitis grave y enterocolitis necrosante. El principal vehículo de transmisión de esta bacteria son los productos infantiles deshidratados, debido a su contaminación después del tratamiento térmico. Objetivo. Identificar cepas de E. sakazakii en muestras de lactarios recolectadas en la ciudad de Bogotá, D.C. Materiales y métodos. Se analizaron 222 muestras de 9 lactarios, de superficies estériles y no estériles, utensilios empleados para la preparación de biberones y operarios. Se realizó recuento de coliformes totales y detección de E. sakazakii utilizando el protocolo propuesto por la Food and Drug Administration y por el Sistema Automático Bax® Dupont Qualicon. Resultados. De las 222 muestras recolectadas en las clínicas de Bogotá, se reportó que 27,4% (61) de las muestras analizadas presentaban coliformes totales; se detectó la presencia de E. sakazakii en 3,6% por el método automatizado de PCR BAX Dupont a partir de muestras de biberones y superficies. Conclusiones. Se demostró la presencia de E. sakazakii en lactarios en Colombia. Debido a que este microorganismo es un patógeno oportunista de alto riesgo para neonatos y que está asociado a las prácticas higiénicas en los lactarios, la información de este estudio puede ser útil para la toma de medidas profilácticas que reduzcan el riesgo de contaminación con este patógeno para la población infantil y, también, aporta información importante para la salud pública.

Introduction: Enterobacter sakazakii is an emergent opportunistic pathogen of high risk responsible of severe meningitis and necrotizing enterocolitis in neonates and infants with underlying medical conditions. One of the principal transmission vehicles for the transmission of these bacteria, is the infant dehydrated formula after exposing them to the heating treatment. Objective: To identify strains of E. sakazakii in milk feeders samples from Bogotá. Materials and methods: 222 samples from 9 milk feeders including sterile and non sterile surfaces, utensils used for the formula preparation and food handlers were analyzed. Total coliforms counts and identification of E. sakazakii was done using the FDA protocol and the automatic system Bax ® Dupont Qualicon. Results: From de 222 samples collected from hospitals in Bogotá, it was reported that 27.4% (61) had total coliforms, and the presence of E. sakazakii was detected in 3.6% (8) from one feeding bottle and surfaces. Conclusion: The presence of E. sakazakii strains was reported in Colombian milk feeders. Because this microorganism is a high risk opportunistic pathogen for newborn infants, usually associated with hygiene practices in milk feeders, the information of this research could be useful to develop preventive measurements to reduce the risk of contamination in the infant population and provides important public health information.

Molecular characterization of histone H2A and snoRNA-Cl genes of Trypanosoma rangeli: application in diagnostic tests

La aplicación de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para detectar e identificar Trypanosoma rangeli y Trypanosoma rangeli presenta a menudo dificultades de interpretación. Así, algunas pruebas generan la amplificación de bandas similares provenientes de uno de los dos parásitos, fragmentos polimórficos de un mismo parásito, o la prevalencia en la detección de T. cruzi en infecciones mixtas. En este estudio se presentan y analizan los trabajos de investigación básica realizados con el objeto de diseñar y estandarizar pruebas de PCR específicas de cada parásito. Los iniciadores TcH2AF/R se diseñaron sobre la base de la región diferencial observada entre las unidades génicas que contienen los genes h2a en estos tripanosomas. Esta pareja de iniciadores amplifican un fragmento de 234 pb específico para T. cruzi (cepas I y II). Los iniciadores TrF/R2 anillan en las regiones intergénicas del fragmento génico de 801 pb codificante para seis transcritos que forman la agrupación ARNsno-Cl en T. rangeli. Estos iniciadores amplifican un fragmento de 620 pb exclusivo de las cepas KP1(-) y KP1(+) de este parásito. La aplicación de estas PCR en vectores infectados y en pacientes con enfermedad de Chagas muestra que ambas pruebas constituyen herramientas útiles para el diagnóstico y la identificación diferencial de estos tripanosomátidos.

The application of polymerase chain reaction (PCR) to detect Trypanosoma rangeli and Trypanosoma rangeli often presents interpretation challenges. For example, some tests yield the amplification of similar bands from either parasite, polymorphic fragments of the same parasite, or present deviation towards T. cruzi in mixed infections. In this study, the basic researching needed for designing and standardizating specific PCR tests for each parasite species PCR are shown and analyzed. The TcH2AF/R primers were designed on the basis of the differential gene region observed between the histone h2a genic units of these parasites. These primers amplify a specific 234 bp fragment in T. cruzi (T. cruzi I and II strains). The TrF/R2 primers anneal to the intergenic regions of an 801 bp gene fragment encoding for six transcripts that conform the snoRNA-Cl cluster in T. rangeli. These primers amplify a fragment of 620 bp exclusively in KP1(-) and KP1(+) strains of the parasite. The application of these PCR tests in infected vectors and in chagasic patients show that both tests constitute useful tools for the diagnosis and differential identification of these Trypanosomatids.

Tygecicline for the treatment of Multiresistant Gram negative rods causing Mediastinitis: case reports and critic analysis

La mediastinitis es una complicación grave entre los pacientes sometidos a cirugía cardiaca. Los agentes etiológicos más frecuentes son los cocos Gram positivos y los Gram negativos son una causa poco común en la mayoría de las series publicadas. Presentamos nuestra experiencia con cuatro pacientes con mediastinitis debida a bacilos Gram negativos multirresistentes, los cuales fueron tratados con tigeciclina.

Mediastinitis is a life-threatening complication among patients undergoing cardiac surgery. Gram-positives cocci are the most frequent pathogens associated with post-surgical mediastinitis, being the Gram-negative etiology uncommon in most of the published series. We present our experience with four patients with mediastinitis due to multidrug-resistant Gram-negative bacilli, who have been treated with tigecycline.