Infectio

Urbanorum: a case of scientific negligence

Clinical and microbiological characteristics of Gram-negative meningitis in children

Resumen Objetivo: Describir las características clínicas y microbiológicas de niños con meningitis por bacilos Gram negativos en Medellín, Colombia entre 2011 y 2020. Métodos: Estudio multicéntrico observacional. Se incluyeron pacientes menores de 18 años con cultivo de líquido cefalorraquídeo positivo para bacilos Gram negativos. Resultados: Encontramos 68 pacientes (35 menores de 3 meses). Se identificó al menos una comorbilidad en el 83%, la más común fue la prematuridad (30,1%). Las bacterias más comunes fueron E. coli (44%), Pseudomonas spp (19%) y Klebsiella spp (17%). El 75% de los aislamientos fueron multi sensibles a los antibióticos. Se indicó terapia antibiótica combinada en 6,5%. Se curaron 53 pacientes; 62% presentaron complicaciones y nueve pacientes fallecieron. En nuestro medio, la meningitis por bacilos Gram negativos se comportó de forma similar a otras series reportadas. Conclusiones: La meningitis por bacilos Gram negativos ocurrió principalmente en niños con factores predisponentes con alto porcentaje de complicaciones y muerte. Estos datos contribuyen al entendimiento de la enfermedad y a plantear estrategias terapéuticas que mejoren los desenlaces.

Abstract Objective: To describe the microbiological and clinical characteristics of children with Gram-negative meningitis in Medellin, Colombia between 2011 and 2020. Methods: Observational multicenter study. Patients under 18 years of age with positive cerebrospinal fluid culture for Gram-negative bacilli were included. Results: We found 68 patients (35 younger than 3 months). At least one comorbidity was identified in 83%, the most common was prematurity (30.1%). The most common bacteria were E. coli (44%), Pseudomonas spp (19%) and Klebsiella spp (17%). Seventy-five percent of the isolates were multi-sensitive to antibiotics. Combined antibiotic therapy was indicated in 6.5%. Fifty-three patients were cured; 62% presented complications and nine patients died. In our setting, Gram-negative meningitis behaved similarly to other reported series. Conclusions: Gram-negative meningitis occurred mainly in children with predisposing factors with high percentage of complications and death. These data contribute to the understanding of the disease and to propose therapeutic strategies to improve outcomes.

Epidemiological behavior of the Health-care associated infections rates in the newborn unit of San Ignacio University Hospital from January 2011 to December 2020

Abstract Objective: To describe the incidence rates of healthcare associated infections related to devices, presented in the newborn unit of a university hospital in the city of Bogotá, Colombia. Materials and methods: Descriptive observational cross-sectional study period. 83 patients with 84 healthcare-associated infections related with devices hospitalized at the San Ignacio University Hospital from 2011 to 2020 were included. Results: 59.3% of the patients (n=50) were preterm, and 61.9% were male (n=52). The most common healthcare associated infection was catheter-associated bloodstream infection (89.2%; n=75) with an incidence rate of 1,5 to 6,3 per 1000 catheter days, with Staphylococcus epidermidis being the most common microorganism (78.7%). Ventilator-associated pneumonia caused by methicillin-resistant Staphylococcus Aureus (50%) with an incidence rate of 5,3 to 6,3 per 1000 days on the ventilator, ranked second, and catheter-associated urinary tract infection with a rate of incidence from 1,5 to 9,5 per 1000 catheter days, was the third in frequency. Discussion: Neonatal unit incidence rates are comparable to national incidence rates, below those reported by the INICC and above those reported by the NHSN. Prevention strategies are a tool to reduce incidence rates. Conclusion: The incidence rates of device-related HAIs were higher in preterm newborns, and prevention strategies are a challenge to reduce associated morbidity and mortality.

Resumen Objetivo: Describir las tasas de incidencia de las infecciones asociadas a la atención en salud relacionadas con dispositivos, presentadas en la unidad de recién nacidos de un hospital universitario de la ciudad de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos: Estudio observacional descriptivo de corte transversal de periodo. Se incluyeron 83 pacientes con 84 infecciones asociadas a la atención en salud asociadas a dispositivo hospitalizados en el Hospital Universitario San Ignacio del 2011 al 2020. Resultados: El 59.3% de los pacientes (n=50) eran pacientes pretérmino, de sexo masculino (61,9%; n = 52). La IAAS más frecuente fue la infección del torrente sanguíneo asociada a catéter (89,2%; n=75) con una tasa de incidencia de 1,5 a 6,3 por 1000 días catéter, siendo el Staphylococcus epidermidis el microorganismo más común (78,7%). La neumonía asociada al ventilador producida por el Staphylococcus Aureus meticilino resistente (50%) con una tasa de incidencia del 5,3 al 6,3 por 1000 días de ventilador, ocupó el segundo lugar, y la infección de vías urinarias asociada a catéter vesical con una tasa de incidencia de 1,5 a 9,5 por 1000 días catéter, fue la tercera en frecuencia. Discusión: Las tasas de incidencia de la unidad neonatal son comparables con las tasas de incidencia nacionales, por debajo de las reportadas por la INICC y por encima de las reportadas por la NHSN. Las estrategias de prevención son una herramienta para la disminución de las tasas de incidencia. Conclusión: Las tasas de incidencia de las IAAS relacionadas con dispositivo fueron mayores en los recién nacidos pretérmino, y las estrategias de prevención son un desafío para disminuir la morbimortalidad asociada.

Severe community-acquired pneumonia in pediatric patients at a high-complexity center in Cali, Colombia

Abstract Objective: Community-acquired pneumonia (CAP) is one of the leading causes of mortality in the pediatric population. It often leads to pediatric hospitalization, with children under 1-year-old being the most affected and usually requiring management in the intensive care unit. Recent molecular studies indicate that viruses are the most common etiology. The aim of our study was to characterize the pediatric population with severe CAP in a high complexity center in Cali, Colombia, describing demographics, etiologic factors, clinical evolution and outcomes of patients. Method: We conducted retrospective observational study in a private hospital of high-complexity. Ninety-three patients aged between 1 month and 18 years old with the diagnosis of severe CAP admitted to the Pediatric Intensive Care Unit (PICU) during a 5-year period (2015-2020) were included. Results: In our population there was no significant gender difference, our median age was 10 months (IQ 3-31), 77% presented respiratory distress and 48% required invasive mechanical ventilation. The most commonly isolated microorganism was Respiratory Syncytial Virus (RSV) (n = 36), followed by Rhinovirus/Enterovirus complex in 41% (n=21), and Metapneumovirus 12% (n=6). Viral pneumonia was the most common in our patients (44%, n = 41), followed by viral-bacterial co-infection (13.9%, n=13). Seven fatal cases were reported. Conclusions: Our study provides epidemiologic evidence of microorganisms that cause severe CAP in the pediatric population in a cohort of pediatric patients prior to Covid-19 pandemic.

Resumen Objetivo: La neumonía adquirida en la comunidad (NAC) es una de las principales causas de mortalidad en la población pediátrica. Con frecuencia conlleva hospitalización pediátrica, siendo los niños menores de 1 año los más afectados y requiriendo habitualmente manejo en la unidad de cuidados intensivos. Estudios moleculares recientes indican que los virus son la etiología más frecuente. El objetivo de nuestro estudio fue caracterizar la población pediátrica con NAC severa en un centro de alta complejidad en Cali, Colombia, describiendo datos demográficos, factor etiológico, evolución clínica y resultados de los pacientes. Método: Se realizó estudio observacional retrospectivo en un hospital privado de alta complejidad. Se incluyeron 93 pacientes entre 1 mes y 18 años de edad con diagnóstico de NAC grave ingresados a la Unidad de Cuidados Intensivos Pediátricos (UCIP) durante un periodo de 5 años (2015-2020). Resultados: En nuestra población no hubo diferencias significativas entre sexos, nuestra mediana de edad fue de 10 meses (CI 3-31), el 77% presentó distrés respiratorio y el 48% requirió ventilación mecánica invasiva. El microorganismo más frecuentemente aislado fue el Virus Sincitial Respiratorio (VSR) (n = 36), seguido del complejo Rhinovirus/Enterovirus en un 41% (n=21), y Metapneumovirus 12% (n=6). La neumonía vírica fue la más frecuente en nuestros pacientes (44%, n = 41), seguida de la coinfección vírico-bacteriana (13,9%, n=13). Se notificaron siete casos mortales. Conclusiones: Nuestro estudio aporta evidencias epidemiológicas de microorganismos causantes de NAC grave en la población pediátrica en una cohorte de pacientes pediátricos previa a la pandemia de Covid-19.

Long-term neuropsychiatrie sequels in Central nervous system tuberculosis in Mexican patients

Abstract Introduction: Central nervous system tuberculosis (CNS TB), the most serious form of TB, is usually associated with an intense neuroinflammatory response and severe sequels, and it is often accompanied by human immunodeficiency virus (HIV) coinfection. Few works have studied mental functioning sequels in this population. Objective: The aim of this study was to characterize long-term neuropsychiatric sequels in central nervous system tuberculosis (CNS TB) patients and CNS TB/ Human Immunodeficiency Virus (HIV) co-infected patients, and to describe some associated factors. Methods: Retrospective cohort study in CNS TB patients admitted from 2008 to 2018 in a Mexican neurological center in which sociodemographic, clinical, neuroimaging, cognitive, and neuropsychiatric data were collected. Cognitive sequel data were obtained from a screening tool that has been standardized and normalized for the Hispanic population. Neuropsychiatric data were obtained from the Neuropsychiatric Inventory Questionnaire and from medical records. Results: A total of 86 subjects were included, 23 had CNSTB and HIV. The mean age was 40.4 years, and 23% of patients had a history of pulmonary TB. The main symptoms were headache, fever, and cranial nerve palsy. Executive functions, visuospatial, and memory impairment were the most common neurocognitive sequels, while the most frequent neuropsychiatric sequels were depression, irritability, and anxiety. There was a correlation between immunity (CD4+ T cell count) and executive functions. Conclusions: This is the first report in Mexican patients evaluating long-term neurocognitive sequels in CNS TB. Some clinical and sociodemographic traits seem to be neuroprotective factors against long-term neuropsychiatric sequels.

Resumen Introducción: La tuberculosis del SNC (TB-SNC), es la forma más seria de TB, usualmente asociada a una respuesta neuroinflamatoria intensa y secuelas severas, además frecuentemente se acompaña de coinfección por virus de inmunodeficiencia humana (VIH). Pocos estudios han estudiado las secuelas mentales funcionales en esta población. Objetivo: Caracterizar las secuelas neuropsiquiátricas a largo plazo en pacientes con TB-SNC y en pacientes con la coinfección VIH/ TB-SNC, describiendo los factores asociados. Métodos: Estudio de cohorte retrospectiva en los pacientes con TB-SNC admitidos en un centro neurológico mexicano durante los años 2008 a 2018. Se colectaron los datos sociodemográficos, clínicos, de neuroimagen, cognitivos u neuropsiquiátricos Las secuelas cognitivas fueron obtenidas por herramientas normalizadas y estandarizadas para la población hispánica. Los datos neuropsiquiátricos a través del Cuestionario del Inventario neuropsiquiátrico y de los expedientes clínicos. Resultados: Se incluyeron un total de 86 sujetos, 23 tenían coinfección VIH/ TB-SNC. La edad promedio fue 40.4 años y 23% de ellos tenían historia de TB pulmonar. Los síntomas clínicos principales eran cefalea, fiebre y parálisis de nervios craneales. A nivel neurocognitivo, las secuelas más comunes implicaron afección de funciones ejecutivas, visuoespaciales y de memoria, mientras que las manifestaciones neuropsiquiátricas más frecuentes fueron depresión, irritabilidad y ansiedad. Se observe correlación entre la inmunidad (conteo de linfocitos T CD4+) y la afección de funciones ejecutivas. Conclusiones: Este es el primer trabajo evaluando las secuelas neurocognitivas a largo plazo en pacientes con TB en población mexicana. Algunos rasgos clínicos y sociodemográficos parecen ser factores neuroprotectores frente a secuelas neuropsiquiátricas a largo plazo.

SARS-CoV-2 in pediatric patients with immunosuppressed and neoplastic disorders from a cancer center in the Colombian Caribbean

Abstract Introduction: COVID-19 has caused a health, social, and health system emergency, with a dismal infection behavior in patients with special conditions, such as the immunocompromised pediatric population. Objective: To describe the clinical-epidemiological characteristics of infected SARS-CoV-2 pediatric patients with immunocompromised and neoplastic disorders. Methods: Between March 2020 and February 2022, a retrospective descriptive study was carried out in a cancer center in the Colombian Caribbean. Forty-one immunocompromised children with oncological pathologies and a diagnosis of SARS-CoV-2 infection were included. Inflammatory markers associated with severity, such as ferritin, leukocytosis, and lymphocytosis, were analyzed. Results: 24.39% of the children evaluated had sickle cell anemia and acute lymphoid leukemia (in the consolidation or maintenance phase). The most frequent symptoms were fever (31.71%), cough (29.27%), and runny nose (19.51%). The severity of the COVID-19 infection was mild in 39.02% of the cases, and 24.39% were asymptomatic. Inflammatory markers and clinical manifestations were not associated with severity. Severity was also not associated with oxygen requirements, thoracic radiological changes, or admission to the ICU (P-value >0.05). Conclusions: The results suggest that despite immunosuppression, the pediatric population did not present severe cases of COVID-19 infection.

Resumen Introducción: El COVID-19 ha provocado una emergencia sanitaria, social y del sistema de salud, con un desconocido comportamiento entre pacientes con condiciones especiales, como es la población pediátrica inmunocomprometida. Objetivo: Describir las características clínico-epidemiológicas de pacientes pediátricos infectados por SARS-CoV-2 con inmunodepresión y trastornos neoplásicos. Métodos: Entre marzo de 2020 y febrero de 2022 se realizó un estudio descriptivo retrospectivo en un centro oncológico del Caribe colombiano. Se incluyeron 41 niños inmunocomprometidos con patologías oncológicas y diagnóstico de infección por SARS-CoV-2. Se analizaron marcadores inflamatorios asociados a la gravedad, como ferritina, leucocitosis y linfocitosis. Resultados: El 24,39% de los niños evaluados presentaban anemia falciforme y leucemia linfoide aguda (en fase de consolidación o mantenimiento). Los síntomas más frecuentes fueron fiebre (31,71%), tos (29,27%) y secreción nasal (19,51%). La gravedad de la infección por COVID-19 fue leve en el 39,02% de los casos y el 24,39% fueron asintomáticos. Los marcadores inflamatorios y las manifestaciones clínicas no se asociaron con la gravedad. La gravedad tampoco se asoció con las necesidades de oxígeno, los cambios radiológicos torácicos o el ingreso en la UCI (valor de p > 0,05). Conclusiones: Los resultados sugieren que a pesar de la inmunosupresión, la población pediátrica no presentó casos graves de infección por COVID-19.

Prevalence of high-risk Human Papillomavirus in a population of women and men who have sex with men (MSM) HIV (+) treated at the VID Medellín Clinical Laboratory - Colombia; during the years 2020 to 2023

Resumen Objetivo: Identificar la prevalencia de los VPH de alto riesgo en mujeres y en hombres que tienen sexo con hombres VIH positivos, durante el periodo comprendido entre 2020 y 2023. Materiales y método: Estudio observacional descriptivo retrospectivo, de pacientes que acudieron al Laboratorio Clínico VID. Se incluyeron todos los pacientes que llegaron con el propósito de realizarse la prueba de VPH y que cumplían con los criterios para la toma de la muestra. Resultados: El total de pacientes incluidos en el estudio fue de 2.379 mujeres y 2.078 HSH-VIH (+).Se identifica VPH-AR en 586 mujeres y 1.652 HSH-VIH (+).La frecuencia de genotipos de alto riesgo identificados fue de 0,36 % en las mujeres y de 2,52 % en los HSH VIH (+). Los genotipos de VPH más prevalentes en ambos grupos fueron: 16, 52, 58 y 68. Conclusiones: La prevalencia de VPH-AR en las mujeres fue de 26,4 % y en los hombres que tienen sexo con hombres de 79,5 %, la mayoría de los genotipos de alto riesgo presentes en mujeres se encuentran en el rango de edad entre los 30-39 años, mientras que en los HSH VIH (+) se encuentran en el rango de menor de 30 años.

Abstract Objective: To identify the prevalence of high-risk HPV in women and men who have sex with HIV-positive men, during the period between 2020 and 2023. Methods: Retrospective descriptive observational study of patients who attended the VID Clinical Laboratory. All patients who came for the purpose of HPV testing and who met the criteria for sample collection were included. Results: The total number of patients included in the study was 2,379 women and 2,078 MSM-HIV (+).HR-HPV was identified in 586 women and 1,652 MSM-HIV (+).The frequency of high-risk genotypes identified was 0.36% in women and 2.52% in MSM HIV (+). The most prevalent HPV genotypes in both groups were: 16,52, 58 and 68. Conclusions: The prevalence of HR-HPV in women was 26.4 % and in men who have sex with men 79.5 %, most of the high-risk genotypes present in women were in the age range between 30-39 years, while in HIV (+) MSM they were in the range of less than 30 years.

Clinical Practice Guideline for the diagnosis and treatment of histoplasmosis among adults Living with HIV -abridged version

Resumen La histoplasmosis es la infección fúngica ocasionada, en humanos, por el hongo dimórfico Histoplasma spp. que afecta con mayor frecuencia a personas con compromiso del sistema inmune. En las personas que viven con el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) y se encuentran en un estadio avanzado de la enfermedad, la histoplasmosis es una infección oportunista de gran importancia, debido a su frecuencia de presentación, y consecuente impacto en morbilidad, mortalidad y altos costos. La problemática global de resistencia a los antimicrobianos, a la que contribuye el uso inapropiado o indiscriminado de antifúngicos, ha puesto en la mira a Histoplasma spp., por lo que resulta de importancia generar directrices que permitan orientar el uso adecuado de antifúngicos en el manejo de la histoplasmosis, con el objetivo de obtener mejores desenlaces clínicos y propender por un uso racional de antifúngicos. La presente guía contiene recomendaciones para el diagnóstico y tratamiento de la histoplasmosis en personas adultas que viven con el VIH, basadas en la evidencia, realizadas mediante el proceso de adaptación de guías de práctica clínica internacionales para el contexto colombiano.

Abstract Histoplasmosis is the fungal infection caused, in humans, by the dimorphic fungus Histoplasma spp., which most frequently affects people with compromised immune system. In people living with the human immunodeficiency virus (HIV) and are in an advanced stage of the disease, histoplasmosis is an opportunistic infection of great importance, due to its frequency of presentation, and consequent impact on morbidity, mortality and high costs. The global problem of antimicrobial resistance, to which the inappropriate or indiscriminate use of antifungals contributes, has put Histoplasma spp. in the spotlight. It is important to generate guidelines that guide the appropriate use of antifungals in the management of histoplasmosis, with the aim of obtaining better clinical outcomes and promoting rational use of antifungals. This guide contains recommendations for the diagnosis and treatment of histoplasmosis in adults living with HIV, based on evidence, obtained through the process of adapting international clinical practice guidelines to the Colombian context.

Histoplasmosis and persistent methicillin-resistant Staphylococcus aureus bacteremia associated with a ventriculoperitoneal shunt: a case report

Resumen La histoplasmosis es una infección fúngica causada por Histoplasma ssp, que afecta principalmente el sistema respiratorio, mientras que Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SARM) es una bacteria notoria por ser resistente a los antibióticos y asociarse con infecciones graves. Presentamos un informe de caso de una mujer de 33 años con antecedente de hidrocefalia que se sometió a la colocación de una derivación ventriculoperitoneal (VP) y posteriormente fue llevada al servicio de urgencias debido a debilidad muscular progresiva y síntomas sugestivos de infección sistémica. Evaluaciones adicionales revelaron paquimeningitis, anomalías pulmonares y diagnósticos de histoplasmosis y bacteriemia por SARM que persistió durante varias semanas a pesar de la terapia antibiótica dirigida. La bacteriemia solo se resolvió después de que se retirara la derivación. Este caso resalta la importancia de considerar diversas etiologías, realizar investigaciones diagnósticas oportunas con un historial médico completo y adoptar enfoques de tratamiento adaptados para casos complejos que involucran infecciones concomitantes.

Abstract Histoplasmosis is a fungal infection caused by Histoplasma ssp. that primarily affects the respiratory system, while methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a notorious antibiotic-resistant bacterium associated with severe infections. We present a case report of a 33-year-old female with history of hydrocephalus that underwent a VP shunt placement and was brought to the emergency department due to progressive muscle weakness and symptoms suggestive of systemic infection. Further evaluations revealed pachymeningitis, lung abnormalities, and diagnoses of histoplasmosis and methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) bacteremia, which persisted for several weeks despite targeted antibiotic therapy. The bacteremia only resolved after the shunt was removed. This case underscores the importance of considering diverse etiologies, conducting timely diagnostic investigations with a complete medical history, and adopting tailored treatment approaches for complex cases involving concomitant infections.