Acta Agronómica

**Identification of plant parasitic nematodes in the Germplasm Bank of yellow passion fruit (Passiflora edulis f. flavicarpa Degener) in Colombia**

Los nematodos fitoparásitos son una de las mayores limitantes en la fruticultura tropical causando grandes pérdidas económicas por la reducción de los rendimientos. En Colombia no existe información respecto a estos parásitos que afectan el cultivo del maracuyá y es necesario generarla para crear estrategias de manejo. El objetivo del estudio fue identificar y cuantificar los nematodos fitoparásitos presentes en plantas de maracuyá de la Colección Nacional, conformada por 28 accesiones de diferentes procedencias establecida en la Granja Luker en Palestina, Caldas (Colombia), a 1058 m.s.n.m., 5° 4' 13.2" N y -75° 41' 7.7" O, 23 °C, 2250 mm/año y 75% de HR. La recolección de las muestras se realizó en la zona de plateo de cada planta hasta 60 cm de profundidad. En cada accesión se tomaron tres muestras de 100 g de raíces funcionales y 100 g de suelo. La extracción de nematodos de raíces y suelo se realizó con base en el principio de flotación en azúcar. Para los datos se desarrolló un análisis univariado con la estimación del promedio, el coeficiente de variación, el análisis de varianza y prueba de Tukey al 5%, para establecer las diferencias entre accesiones. Se recuperaron nematodos de siete géneros, Helicotylenchus, Rotylenchulus, Radopholus, Meloidogyne, Tylenchus, Aphelenchoides y Trichodorus. Las especies con mayor frecuencia en las accesiones, tanto en raíces como en suelo, fueron Helicotylenchus dihystera, Rotylenchulus reniformis y Radopholus similis con 100, 75 y 61%, respectivamente. Se encontraron 11, 8 y 16 accesiones de maracuyá sin parasitismo de los géneros Radopholus, Rotylenchulus y Meloidogyne, respectivamente. Dentro de éstas, sobresalen las accesiones AntFla03 y CauFla01 por sus características agronómicas, las cuales constituyen un reservorio genético para programas de fitomejoramiento en la búsqueda de resistencia o tolerancia a nematodos fitoparásitos que involucren hibridación o injertación.

Plant parasitic nematodes are one of the major constraints in tropical fruit causing great economic losses by reducing yields. In Colombia there is not information dealing with the production systems about these parasites affecting passion fruit cultivation so, it is necessary to generate information for management strategies. The aim of this study was to identify and quantify plant parasitic nematodes present in the National yellow passion fruit Collection consisting of 28 accessions from different origin and established in the farm Luker in Palestina (Caldas), Colombia. Sample collection was carried out in the root area of each plant at a depth of 60 cm in each accession. Three samples of 100 g of functional root system and 100 g of soil were taken. The extraction of root and soil nematodes was based on the flotation principle of nematodes in sugar. For data an univariate analysis with the estimated average, the coefficient of variation, analysis of variance and Tukey test at 5%, to establish the differences among accessions was performed. Results showed seven kinds of soil and root phytonematodes: Helicotylenchus, Rotylenchulus, Radopholus, Meloidogyne, Tylenchus, Aphelenchoides and Trichodorus. The species most frequently found in root and soil of accessions were Helicotylenchus dihystera, Rotylenchulus reniformis and Radopholus similis with 100, 75 and 61%, respectively. Results showed 11, 8 y 16 accessions without parasitism of the genera Radopholus, Rotylenchulus and Meloidogyne, respectively. Among these, accession AntFla03 and CauFla01 were outstanding due to their agronomic characteristics which constitute a gene pool for breeding programs in search for phytoparasitic nematode resistance or tolerance that involve hybridization or grafting.

**Effect of gamma rays on vegetative buds of Physalis peruviana L.**

En Colombia los estudios para establecer métodos modernos de propagación y selección de materiales vegetativos de uchuva (Physalis peruviana) son escasos; por tanto, es necesario explorar técnicas alternativas como la aplicación de radiación ionizante, la cual permite ampliar la variabilidad genética, obtener plántulas con características fenotípicas favorables y contribuir al mejoramiento de la productividad. Con el objeto de inducir alteraciones cromosómicas, yemas axilares de P. peruviana cultivadas en medio MS suplementado con 0.1 mg/lt de BA y 0.05 mg/lt de AIB fueron irradiadas con 50, 100, 200 y 300 Grays (Gy) de radiación gamma. El experimento se llevó a cabo utilizando un diseño completamente al azar, con cinco tratamientos, cada uno con 30 unidades experimentales. Después de nueve subcultivos (ciclos de multiplicación de 30 días cada uno), los microtallos regenerados de yemas irradiadas presentaron menor viabilidad que los regenerados de yemas no irradiadas. Las plántulas regeneradas de yemas irradiadas con 100 Gy presentaron mayor porcentaje de enraizamiento, longitud del tallo y número de hojas; la dosis de 300 Gy inhibió el desarrollo de tallos y primordios radicales, aunque los explantes permanecieron viables. En células de ápices radicales tomados de plántulas regeneradas de yemas irradiadas se observaron puentes en anafase y telofase, cromosomas rezagados y cromosomas aislados, siendo mayor la frecuencia de los cromosomas rezagados. El mayor porcentaje de células con alteraciones cromosómicas se cuantificó en ápices radicales de plántulas regeneradas de yemas irradiadas con 200 Gy. En invernadero, 86 - 93.8% de plántulas regeneradas de yemas irradiadas y no irradiadas fueron viables.

In Colombia, studies carried out to establish modern methods for propagation and selection of plant of cape gooseberry (Physalis peruviana) are scarce so, it is necessary to explore alternative techniques such as the application of ionizing radiation, which enables greater genetic variability and to obtain seedlings with phenotypic characteristics that could be beneficial to contribute to improve productivity. To induce chromosomal alterations, axillary buds of P. peruviana with 50, 100, 200 and 300 Gy of gamma radiation were irradiated and were cultured in MS medium supplemented with BA 0.1 mg·L-1 plus IBA 0.05 mg·L-1. The experiment was conducted using a complete random design, five tests each with thirty experimental units were carried out. After nine subcultures (9 multiplication cycles, 30 days each), regenerated shoots of irradiated buds presented smaller viability than the regenerated non irradiated buds. The regenerated plantlets buds irradiated with 100 Gy had higher rooting percentage, shoot length and number of leaves; the dose of 300 Gy inhibited the development of shoots and roots, although the explants remained viable. In cells taken from radical tips of regenerated plantlets of irradiated buds were observed bridges in anaphase and telophase, laggards and isolated chromosomes, being higher the frequency of laggard chromosomes. The higher percentage of cells with chromosomal alterations was quantified in radical tips of regenerated plantlets of buds irradiated with 200 Gy. In greenhouse, 86-93.8% of regenerated plantlets of irradiated or not buds were viable.

**Evaluation of native mycorrhizae in plantain crop (Musa AAB Simmonds) in nursery phase**

En el trabajo se evalúo el efecto de la aplicación de tres géneros nativos de micorrizas vesículo arbusculares sobre el crecimiento de plantas de plátano Hartón (Musa AAB Simmonds) en etapa de vivero. Las cepas se obtuvieron de la colección del Laboratorio de Fitopatología de la Universidad de Córdoba, las cuales fueron aisladas de cultivos de plátano en los municipios de Lorica, Los Córdobas y San Bernardo del Viento. Se utilizó el diseño experimental completamente al azar, con seis tratamientos (T): Glomus sp. (T1), Acaullospora sp. (T2), Scutellospora sp. (T3), una combinación de los géneros Glomus, Acaullospora y Scutellospora (T4), un tratamiento químico de fosfato diamónico, DAP (T5) y un control absoluto (T6), con diez repeticiones por tratamiento. Los resultados mostraron que con la combinación de géneros de micorrizas (T4) se obtuvo un mayor número de esporas y un porcentaje más alto de infección, seguido de los tratamientos T1, T3 y T2. Además, con esta combinación se encontraron diferencias significativas en diámetro del pseudotallo, relación de área foliar:peso fresco y seco de raíz, en comparación con los demás tratamientos. El área foliar y la longitud de raíz fueron más altos en el tratamiento T5.

The objective was to evaluate the effect of three vesicular arbuscular Mycorrhizal native genera application on growth of Hartón plantain plants in nursery stage. The strains were obtained at Universidad de Córdoba from the Plant Pathology Laboratory collection, which were isolated from plantain crops in Lorica, Los Córdobas and San Bernardo del Viento. A completely randomized experimental design with six treatments (T) was used: Glomus sp. (T1), Acaullospora sp. (T2), Scutellospora sp. (T3), a genera combination of Glomus, Acaullospora and Scutellospora (T4), a chemical treatment (diammonium phosphate, DAP, T5) and absolute control (T6), with ten replicates per treatment. Results showed that more spores obtained and larger infection percentage with the combination of mycorrhizae genera (T4), followed by T1, T3 and T2 treatments. Besides the above, with the combination of mycorrhizal genera, they were obtained significant difference compared with other treatments in regard to pseudostem diameter, leaf area ratio:fresh and dry weight of root. Regarding to leaf area and root length, T5 treatment showed the higher measurements.

**Molecular characterization of Guadua angustifolia Kunth using RAMs**

Guadua angustifolia Kunth es un bambú del Neotrópico que se distribuye principalmente en la región Andina. En la región del Eje Cafetero colombiano esta especie presenta gran importancia por su utilización en la construcción, industrialización y fabricación de muebles y artesanías. Para conocer la diversidad genética de nueve materiales superiores de G. angustifolia seleccionados previamente por sus características morfológicas y físico-mecánicas se realizó una caracterización molecular usando marcadores moleculares RAMs. Se obtuvo un valor de He = 0.31 y un porcentaje de loci polimórfico de 81.03% lo que indica una alta diversidad genética de los materiales evaluados.

Guadua angustifolia Kunth is a neotropical bamboo species distributed in the Andean region of Colombia. It has a great industrial importance in the well-known Colombian coffee region due its use in building, industrialization and furniture. In order to know the genetic diversity of nine superior materials of G. angustifolia previously selected by morphologic and physics-mechanic characteristics, a molecular characterization using RAMs molecular markers was carried out. Values of He = 0.31 and polymorphic loci percentage of 81.03% were obtained, indicating a high genetic diversity of the evaluated materials.

**Effect fertilization on dry matter production and extraction of nutrients in three accessions of Lippia origanoides H.B.K.**

En las casas de vegetación de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira (930 m.s.n.m. y 26 °C), se estudió la relación entre la nutrición de plantas de las accesiones Patía, Cítrica y Típica de Lippia origanoides H.B.K., los niveles de extracción de nutrientes y la producción y distribución de materia seca (MS). Para el efecto se determinaron las concentraciones de elementos foliares, los niveles de absorción y extracción de N, P, K, Mg y Ca y su relación con la producción de cada accesión. Se utilizó un diseño en parcelas divididas con once tratamientos y tres repeticiones, las unidades experimentales consistieron en una planta sembrada en sustrato (turba). Los elementos se aplicaron con ferti-riego utilizando solución nutritiva de Hoagland y Arnon modificada. Los resultados mostraron que la accesión Patía presentó los mayores rendimientos de MS (292.0 ± 0.1 g/planta) cuando la concentración original de Mg (49 mg/lt) en la solución cambió para 30 mg/lt; en la accesión Cítrica fueron más altos (287.1 ± 0.1 g/planta) con 72 mg/lt de Mg y en la accesión Típica el rendimiento fue mayor (255.2 ± 0.1 g/planta) con la aplicación de 30 mg/lt de Mg. En términos de absorción de nutrientes, el K fue el elemento más requerido (13.9 kg/t), seguido de Ca (7.9 kg/t).

An experiment under greenhouse conditions at the Universidad Nacional de Colombia, campus Palmira to evaluate the relationship among plant nutrition, levels of nutrient uptake and dry matter production of three accessions of Lippia origanoides (Patía, Cítrica and Típica), was carried out. Also, concentrations of foliar nutrients, absorption and extraction rates (of 5 elements N, P, K, Mg and Ca) and their relationship with the production of each accession were evaluated. A split plot design with 11 treatments and three replications was used. The experimental units consisted of a plant planted in substrate (peat). Fertilization was due by fertirigation using the modified Hoagland and Arnon nutrient solution. The Patía accession showed the maximum dry matter yield (292.0 ± 0.1 g plant-1) with the treatment 8 (Mg decreased), the Cítrica accession yielded 287.1 ± 0.1 g plant-1 with the treatment 9 (Mg increase) and finally Típica accession (255.2 ± 0.1 g plant-1) with the treatment 8. In terms of absorption of nutrients, potassium is the most required element (13.9 kg t-1), followed by calcium (7.9 kg t-1).

**Presence of heavy metals in organic cacao (Theobroma cacao L.) crop**

La presencia de metales pesados en el cultivo de cacao (Theobroma cacao L.) es actualmente un grave problema para agricultores y cooperativas de las regiones Huánuco y Ucayali, Perú. En el presente trabajo se evaluaron los contenidos de cadmio y plomo en suelos y hojas del cacao en estas regiones. Para el efecto se recolectaron y analizaron en laboratorio muestras tomadas en 22 parcelas con cultivos orgánicos de esta especie, 17 en la región Huánuco y cinco en la región Ucayali. Se realizaron análisis de correlación de Pearson entre los contenidos de plomo y cadmio disponibles en el suelo con variables foliares (P, Mg, Ca, Zn, Cd, Pb) y del suelo (arena, arcilla y K). En los suelos, sólo en el caso de potasio se presentan deficiencias; mientras que en el tejido foliar se presentaron deficiencias de N, P, K, Mg y Zn. Los valores promedio de cadmio y plomo disponible en los suelos fueron 0.53 y 3.02 ppm y en las hojas de cacao de 0.21 y 0.58 ppm respectivamente.

The presence of heavy metals in cocoa´s crop is becoming a difficulty for farmers and cooperatives at Huanuco and Ucayali regions, Peru. In this research cadmium and lead content in cocoa´s soils and leaves was evaluated. For it, soil and foliar samples were collected in 22 organic crop plots located at Huánuco (17) and Ucayali (5) region. Pearsons correlation analysis was realized between content of lead and cadmium available in soils with foliar variables (P, Mg, Ca, Zn, Cd, Pb) and soil (Sand, Clay and K). According to the soil analysis only the potassium was deficient; while in leaf tissue deficiencies of N, P, K, Mg and Zn were observed. The average values of cadmium and lead available in soils were 0.53 ppm and 3.02 ppm and in foliar were 0.21 ppm and 0.58 ppm respectively.

**Incidence of the harvesting age on postharvest characteristics behavior of Dominico Hartón Plantain (Musa AAB Simmonds)**

En el departamento de Caldas, Colombia, se realizó la caracterización física, química y fisiológica durante las fases de cosecha y poscosecha del plátano Dominico Hartón (Musa AAB Simmonds) cultivado en el municipio de Belalcázar. La investigación se hizo con frutos de 14, 16 y 18 semanas después de la floración. Cada 2 días y hasta senescencia se evaluaron los cambios de peso, firmeza, parámetros de color L*a*b*, relación pulpa/cáscara, índice de madurez, pH, humedad, almidones, índice de respiración y tasa de etileno. En este trabajo se utilizó un diseño longitudinal de medidas repetidas, balanceado, con un factor en tres niveles. El factor evaluado fue el tiempo de cosecha y las variables de respuesta fueron los parámetros fisicoquímicos. Los resultados mostraron variación en peso cercanas a 7%, el parámetro de color tinte varió entre -61.46 y 86.74, el croma entre 26.31 y 37.11 y el DE entre 1.4603 y 8.360, el pH varió entre 6.2 y 3.98, una relación pulpa/cáscara entre 2.53 y 4.11, la relación °brix/ acidez entre 11.36 y 26.2, la humedad entre 60.56% y 56%, el almidón entre 51.7% y 67% de MS, la tasa de producción de CO2 entre 3.4 y 8.9 g/kg por hora, el etileno entre 24 y 225 µlt/kg por hora. Los parámetros de maduración mostraron comportamiento climatérico y los días a maduración total fueron de 9, 14 y 21 para los frutos de 18, 16 y 14 semanas desde floración.

In this study a physical, chemical and physiological characterization of Dominico Hartón plantain grown in the Belalcázar municipality (Department of Caldas, Colombia) during harvest and post-harvest was carried out. The research was performed with fruits of 14, 16 and 18 weeks after flowering. Every two days until senescence changes in weight, firmness, parameters of color L*a*b*, pulp/peel, the relationship pulp/shell, maturity index, pH, humidity, starch, respiration rate and ethylene rate were measured. This study used a longitudinal repeated measures design, balanced, with a three-level factor. The factor evaluated was harvest time and the response variables were the physicochemical parameters. The results showed variation in weight near to 7%, the color parameter tint was between -61.46 and 86.74, chroma between 26.31 and 37.11 and DE of 1.4603 to 8360, the pH ranged from 6.2 to 3.98, pulp/peel of 2.53 to 4.11, the relationship °Brix/acidity of 11.36 to 26.2, humidity content between 60.56% and 56%, starch, 51.7% to 67% DM, the CO2 production rate between 3.4 and 8.9 g / kg. h, ethylene from 24 to 225 µL / kg. h. The maturation parameters showed climacteric behavior and total days of ripening were 9, 14 and 21 for the fruits of 18, 16 and 14 weeks from flowering.

**Phenotypic correlation and path analysis for yield in soybean (Glycine max (L.) Merril)**

En este trabajo se determinaron correlaciones entre el rendimiento de grano y algunas características agronómicas en soya (Glycine max (L.) Merril) y los efectos directos e indirectos de los componentes de rendimiento sobre la producción. A través del análisis de sendero se identificaron criterios de selección indirecta para alto rendimiento. Para el efecto se empleó un diseño de franjas divididas con cuatro repeticiones y 30 tratamientos en Oxisoles de la Orinoquía colombiana, en siete ambientes, durante 2007 y 2008. Los tratamientos consistieron en la combinación de seis variedades de soya y cinco fuentes de nitrógeno. Los datos unidos por ambientes mostraron una correlación fenotípica positiva entre rendimiento de grano con el número de vainas por planta - VT (r = 0.81**), el número de nudos por planta-NN (r = 0.67**), y el número de semilla por vaina-GV (r = 0.44*), mientras que fue negativa con peso de grano -PS (r = -0.44*). El análisis de sendero mostró que VT presentó el mayor efecto positivo directo (0.628) sobre el rendimiento, seguido por NN (0.260). También, el número de vainas con tres granos (V3) tuvo alta asociación fenotípica con rendimiento (r = 0.84**). Es importante prestar atención a estos componentes de rendimiento VT, NN y V3 como criterios de selección indirecta para el mejoramiento genético del rendimiento de grano en soya.

This research determinate the correlations between seed yield and characteristics agronomic in soybean and the direct and indirect effects of certain yield components on seed yield although the path coefficients analysis and to identification of indirect selection criteria by height seed yields. Thirty treatments were evaluated in a split strips design with four replications in Oxisoils of the Colombian Orinoquía, in seven environmental during 2007 and 2008. The treatments were conformed by the combination of six soybean varieties and five nitrogen sources. Combined data over the locations indicated that seed yield had significant positive correlation with number of pods per plant -VT (r = 0.81**), number of nudes per plant-NN (r = 0.67**), number of seed per pod-GV(r = 0.44*), and correlation negative with weight of seed-PS(r = -0.44*). Path coefficient analysis showed that VT gave the greatest direct positive effect (0.628) on seed yield, followed by NN (0.260). However, the number of pods with three seed (V3) had high association with seed yield (r = 0.84**). The greater attention should be given to these yield components (VT, NN and V3) as indirect selection criterions for genetic improvement of soybean seed yield.

**Evaluation of biological control strategies for Polyphagotarsonemus latus (Banks) and Phyllocoptruta oleivora (Ashmead) on Valencia orange**

El daño ocasionado por los ácaros Polyphagotarsonemus latus (Banks) y Phyllocoptruta oleivora (Ashmead) en el cultivo de naranja Valencia (Citrus sinensis L.) es reconocido tanto por el impacto económico como por el daño externo de los frutos. En este trabajo se evaluó el efecto de agentes biológicos para el control de estas plagas en un cultivo comercial de naranja Valencia en el municipio de Caicedonia, Valle del Cauca, Colombia. Se usó un diseño de bloques completos al azar para evaluar los tratamientos siguientes: (1) liberación de especies de Phytoseiidae nativos (Neoseiulus anonymus, Neoseiulus californicus, Iphiseiodes zuluagai y Amblyseius herbicolus en poblaciones de 500 individuos/árbol; (2) liberación de larvas de Chrysoperla carnea (100 larvas/árbol); (3) aplicación localizada de cipermetrina 2 cm³/lt como tratamiento de exclusión de agentes benéficos; y (4) testigo consistente en el tratamiento utilizado por los agricultores (aplicación localizada de abamectina, 1.5 cm³/lt). Las liberaciones de las especies benéficas y las aplicaciones de los tratamientos se realizaron sobre racimos florales y frutos marcados en el tercio medio de cada árbol. Las evaluaciones de daños se realizaron cada semana hasta la cosecha. Los tratamientos de liberación de Phytoseiidae, liberación de larvas de C. carnea y aplicación de abamectina presentaron el menor daño de P. latus; el tratamiento de exclusión de benéficos demostró la importancia de los agentes controladores naturales sobre la plaga. En el manejo de P. oleivora, los tratamientos de liberación de larvas de C. carnea y aplicación de abamectina presentaron los mejores resultados con el menor daño en frutos. La población de P. oleivora ocasionó daños significativos en el tratamiento de liberación de ácaros Phytoseiidae y exclusión de benéficos.

The mites damage caused by P. latus and P. oleivora in the orange crop Valencia (Citrus sinensis L.) has an economical detrimental impact due to the external damage of the fruits. To evaluate the effect of biological control agents for these two pests, this work was carried out in a commercial crop in Caicedonia, Cauca Valley , Colombia. The experimental design consisted of a randomized complete block, in which the following treatments were evaluated: (1) release of Phytoseiidae native species: Neoseiulus anonymus, Neoseiulus californicus, Iphiseiodes zuluagai and Amblyseius herbicolus (500 individuals / tree); (2) release of Chrysoperla carnea larvae (100 larvae / tree); (3) exclusion of beneficial agents (localized application of cypermethrin 2 cm³/lt) and (4) control farmer (localized application of abamectin, 1.5 cm³/lt). The releases and applications of the treatments were made on floral clusters and fruit marked in the middle third of each tree. Evaluations were made weekly until harvest time. For management of P. latus it was found that the treatments Phytoseiidae release, C. carnea release and abamectin application showed the least damage; exclusion of the beneficial agents demonstrated the importance of the natural control agents on this pest. For management of P. oleivora, C. carnea release and abamectin application showed the least damage. In release treatments of Phytoseiidae native species and the exclusion of beneficial agents, P. oleivora caused significant damage.

Associated microorganisms to the nitrogen cycle in soils under three systems of use: potato crop, livestock and páramo, in Los Nevados National Natural Park, Colombia

En la vereda El Bosque del Parque Nacional Natural de Los Nevados (PNNN), Colombia, se estimó la densidad poblacional de microorganismos asociados con el metabolismo de nitrógeno (N) en suelos bajo tres sistemas de uso: cultivo de papa, ganadería y zonas poco intervenidas (páramo). Indirectamente se cuantificaron microorganismos amonificantes (AMO), proteolíticos (PRO), oxidantes del amonio (BOA), oxidantes del nitrito (BON) y denitrificantes (DEN) en suelos de tres fincas ubicadas a diferente altitud y en épocas seca y lluviosa. Se realizó la prueba no-paramétrica de Kruskal-Wallis por pares, con un nivel de significancia P < 0.05, para detectar diferencias estadísticamente significativas entre las diferentes abundancias de grupos funcionales de microorganismos. Luego, se realizó análisis de componentes principales (ACP) para evaluar las relaciones entre las diferentes variables estudiadas. Los resultados mostraron diferencias para los grupos evaluados, siendo menor la densidad de microorganismos en suelos de páramo. Los PRO fueron más abundantes en todos los tipos de suelos, seguido de los DEN con mayor densidad en el ecosistema páramo. La densidad poblacional microbiana no fue afectada por la altitud, sin embargo se presentaron algunas diferencias que no mostraron un patrón único de comportamiento. Se observaron diferencias como resultado de la época climática, siendo mayor en la época seca para los grupos PRO, AMO, BOA y BON, y en época de lluvias para los DEN. Este estudio contribuye al conocimiento de las relaciones que existen entre el uso del suelo y la presencia de los microorganismos asociados con el ciclo de nitrógeno.

This study estimated the population density of microorganisms associated with the metabolism of nitrogen (N) in soils with three uses: potato crop, livestock and low intervention zones (high plains or páramo) in the El Bosque district of Los Nevados National Natural Park in Colombia. The following microorganisms were indirectly quantified: amonifiers (AMO), proteolytic (PRO), ammonium oxidizing (BOA), nitrite oxidizing (BON) and denitrifiers (DEN) in soils of three farms located at different altitudes and under two climatic seasons. The non-parametric Kruskal-Wallis test paired with a significance level of P < 0.05 was used to detect statistically significant differences among abundances of functional groups of microorganisms. Then a principal component analysis (PCA) was performed to evaluate the relationships among different variables. The results showed differences among all the groups, with páramo soils having the lowest density of microorganisms in the soil. The PRO microorganisms were the most abundant in all soils, followed by DEN, with a higher density in the páramo ecosystem. The microbial population density was not significantly affected by altitude but showed some differences that did not have a unique behavior pattern. Additionally, differences were seen in the seasons, being higher in the dry season for the PRO, AMO, BOA and BON groups; and in the rainy season for DEN. This study provided knowledge of the relationships between land use and the presence of microorganisms associated with the nitrogen cycle.