Biomédica

Efecto de las medidas preventivas durante la pandemia: más allá del SARS CoV-2

MRI findings on extrapulmonary tuberculosis in a pediatric patient

Resumen: La tuberculosis pulmonar es la más común en niños y su forma extrapulmonar corresponde aproximadamente a 30 a 40 % de los casos. Se presenta el caso de una niña indígena con tuberculosis diseminada: pulmonar, cerebral, medular y musculoesquelética, con importantes secuelas en el neurodesarrollo. Este caso ilustra el espectro de la tuberculosis extrapulmonar pediátrica en países endémicos en desarrollo. Además, evidencia la gravedad de las complicaciones neurológicas causantes de grave discapacidad y resalta el valor de las imágenes radiológicas para orientar la sospecha diagnóstica de compromiso extrapulmonar.

Abstract Pulmonary tuberculosis is the most common in children and its extrapulmonary manifestations are present in 30% to 40% of cases. We present the case of an indigenous girl with disseminated tuberculosis: pulmonary, brain, medullary, and musculoskeletal with substantial neurodevelopmental sequelae. This case exemplifies the spectrum of pediatric extrapulmonary tuberculosis in endemic developing countries. Furthermore, it shows the severity of highly disabling neurological complications and stresses the importance of radiological imaging in guiding diagnostic suspicion of extrapulmonary involvement.

Bacteremia after Bacillus clausii administration for the treatment of acute diarrhea: A case report

Abstract Bacillus clausii is a gram-positive rod used as a probiotic to treat diarrhea and the side effects of antibiotics such as pseudomembranous colitis. We report a case of B. clausii bacteremia in a non-immunocompromised patient with active peptic ulcer disease and acute diarrhea. The probiotic was administered during the patient's hospitalization due to diarrhea of infectious origin. B. clausii was identified in the bloodstream of the patient through Matrix- Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight (MALDI-TOF) days after her discharge. Given the wide use of probiotics, we alert clinicians to consider this microorganism as a causative agent when signs of systemic infection, metabolic compromise, and hemodynamic instability establish after its administration and no pathogens have been identified that could explain the clinical course.

Resumen Bacillus clausii es un bacilo Gram positivo usado como probiótico para tratar la diarrea y efectos adversos de los antibióticos, como la colitis pseudomembranosa. Se reporta un caso de bacteriemia por B. clausii en una paciente inmunocompetente con enfermedad ulcerosa péptica activa y diarrea aguda. El probiótico le fue administrado durante la hospitalización debido al origen infeccioso de la diarrea. B. clausii se identificó en el torrente sanguíneo de la paciente, utilizando espectrometría de desorción/ionización mediante láser asistido por matriz (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization, MALDI), acoplada a un detector de iones (Time of Flight, TOF) (MALDI-TOF), días después de haber sido dada de alta. Dado el amplio uso de los probióticos, alertamos a los clínicos para que consideren este microorganismo como agente causal cuando se detecten signos de infección sistémica, compromiso metabólico, e inestabilidad hemodinámica tras su administración, y no se haya identificado ningún patógeno que pueda explicar el cuadro clínico.

Pitfalls and perils of survival analysis under incorrect assumptions: the case of COVID-19 data

Abstract Non-parametric survival analysis has become a very popular statistical method in current medical research. However, resorting to survival analysis when its fundamental assumptions are not fulfilled can severely bias the results. Currently, hundreds of clinical studies are using survival methods to investigate factors potentially associated with the prognosis of coronavirus disease 2019 (COVID-19) and test new preventive and therapeutic strategies. In the pandemic era, it is more critical than ever to base decision-making on evidence and rely on solid statistical methods, but this is not always the case. Serious methodological errors have been identified in recent seminal studies about COVID-19: One reporting outcomes of patients treated with remdesivir and another one on the epidemiology, clinical course, and outcomes of critically ill patients. High-quality evidence is essential to inform clinicians about optimal COVID-19 therapies and policymakers about the true effect of preventive measures aiming to tackle the pandemic. Though timely evidence is needed, we should encourage the appropriate application of survival analysis methods and careful peer-review to avoid publishing flawed results, which could affect decision-making. In this paper, we recapitulate the basic assumptions underlying non-parametric survival analysis and frequent errors in its application and discuss how to handle data on COVID-19.

Resumen El análisis de supervivencia es un método estadístico muy popular en la investigación médica actual. Sin embargo, el recurrir al análisis de supervivencia cuando no se cumplen sus supuestos fundamentales puede sesgar gravemente los resultados. Actualmente, cientos de estudios clínicos están utilizando esta metodología para estudiar los factores potencialmente asociados con el pronóstico de la COVID-19 y probar nuevas estrategias preventivas y terapéuticas. En la pandemia actual es más importante que nunca que las decisiones se basen en pruebas y en métodos estadísticos sólidos. Sin embargo, este no es siempre el caso. Se han detectado errores metodológicos graves en estudios seminales recientes sobre COVID-19: uno que informa los resultados de los pacientes tratados con remdesivir y otro sobre la epidemiología, el curso clínico y los resultados de los pacientes críticamente enfermos. La evidencia de calidad es esencial para informar a los médicos sobre las terapias óptimas contra la enfermedad y, a los legisladores, sobre el verdadero efecto de las medidas preventivas destinadas a abordar la pandemia. Aunque se necesitan pruebas oportunas, debemos fomentar la aplicación adecuada de los métodos de análisis de supervivencia y una cuidadosa revisión por pares para evitar la publicación de resultados defectuosos que pueden afectar la adopción de decisiones. En este artículo, recapitulamos los supuestos básicos que subyacen al análisis de supervivencia y los errores frecuentes en su aplicación, y discutimos cómo manejar los datos sobre la COVID-19.

Comment on the article “With regard to the bicentennial of the independence of Colombia: Reading practices of Antonio Nariño and the development of a presumably effective vaccine against smallpox”

Resumen: La viruela significó para las colonias americanas un proceso que desestabilizaba de forma dramática las dinámicas sociodemográficas de las colonias, lo que incentivó el desarrollo de estudios científicos sobre el virus causante. Cada libro acerca de la viruela en la biblioteca de Nariño constituyó una herramienta en la lucha contra el virus emprendida por el prócer. Tras la revisión del artículo “A propósito del bicentenario de la independencia de Colombia: las prácticas de lectura de Antonio Nariño y el desarrollo de una vacuna presuntamente efectiva contra la viruela” 1 quise comentar y profundizar en torno al saber médico de Nariño mediante el acercamiento a las obras a las que recurrió para instruirse sobre la enfermedad. A partir de la semblanza de cada una de ellas, analicé el proceso de variolización en el Reino de la Nueva Granada y la necesidad de fabricar una vacuna propia.

Abstract: For the American colonies, smallpox implied a process that dramatically destabilized their sociodemographic dynamics, which explains why scientific development took place around the causative virus. Each book about smallpox in Nariño’s library was a tool in the fight against smallpox undertaken by the founding father. After reviewing the article “About the bicentennial of the independence of Colombia: The reading practices of Antonio Nariño and the development of a vaccine that is presumably effective against smallpox”1, I set myself to study Antonio Nariño’s medical knowledge further. Through the approach to the works that Nariño used to educate himself on smallpox and the development of a biographical sketch of each of them, I analyzed the process of variolization in the Kingdom of Nueva Granada and the need to manufacture a vaccine locally.

Healthiness and disease in Marmato gold mines during the 19th century: Between the smallpox plague and the War of a Thousand Days

Resumen: La minería ha tenido una gran influencia en las sociedades humanas, permeando por igual las riquezas del suelo y la cultura, lo que ha tenido profundas implicaciones para los individuos dedicados a esta labor y para los lugares en los que se lleva a cabo. En el presente artículo, se describen las características socioculturales y de sanidad, así como las enfermedades más frecuentes en las minas de oro de Marmato (Caldas) durante el siglo XIX. Las precarias condiciones de salubridad y las enfermedades tropicales infecciosas persistieron en la población durante todo el siglo.

Abstract: Mining has had a great influence on human societies permeating the riches of the soil and culture in equal proportion. This has led to profound changes in the individuals dedicated to this work and the locations where it takes place. In this historical review, we describe the socio-cultural and health characteristics, as well as the diseases associated with gold mining in Marmato (Caldas) during the 19th century. Poor salubrity conditions and tropical and infectious diseases were constant during the whole century.

Knowledge, attitudes, and practices related to COVID-19 among patients at Hospital Universitario de Caracas triage tent: A cross-sectional study

Abstract Introduction: The studies on knowledge, attitudes, and practices (KAP) regarding COVID-19 help to identify erroneous concepts and inadequate practices related to the disease. This baseline information is essential to design effective strategies and improve adherence to prevention measures. Objective: To identify the COVID-19-related KAP in Venezuelan patients screened at the Hospital Universitario de Caracas triage tent. Materials and methods: We conducted a cross-sectional study among 215 patients between April 25th and May 25th, 2020, with in-person interviews using a KAP survey. Results: Most surveyed patients (53.5%) were asymptomatic. Most of them, both from the symptomatic and the asymptomatic groups, had adequate knowledge about the symptoms and transmission of the disease and the majority said they were practicing quarantine, frequent handwashing, and the use of face masks in public areas. However, the daily replacement of cloth face masks was more frequent in the asymptomatic group whereas replacement every three days was more frequent in the symptomatic group. Finally, more than half of the participants admitted having been in crowded places, a common practice among the symptomatic compared to the asymptomatic patients. Conclusions: This is the first KAP study in Venezuela about COVID-19. Knowledge and practices among Venezuelans could be improved by strengthening education and training programs. This information from the early phase of the pandemic in Venezuela may contribute to the design of COVID-19 promotion and prevention strategies.

Resumen Introducción. Los estudios de conocimientos, actitudes y prácticas (CAP) relacionados con la Covid-19 permiten establecer los conceptos erróneos y las prácticas inadecuadas en torno a esta enfermedad, información fundamental para diseñar estrategias eficaces y mejorar el cumplimiento de las medidas de prevención. Objetivo. Establecer los conocimientos, actitudes y prácticas relacionadas con la Covid-19 en pacientes venezolanos cribados en la carpa de triaje del Hospital Universitario de Caracas. Materiales y métodos. Se hizo un estudio transversal en 215 pacientes entre el 25 de abril y el 25 de mayo de 2020, mediante entrevistas personales y utilizando una encuesta sobre conocimientos, actitudes y prácticas. Resultados. La mayoría (53,5 %) de los pacientes encuestados se encontraba asintomática; los encuestados tenían un conocimiento adecuado sobre los síntomas y la transmisión de la enfermedad, sin distinción entre sintomáticos y asintomáticos. La mayoría de ellos indicó estar respetando las prácticas de cuarentena, lavado de manos frecuente y uso de tapabocas en público; sin embargo, el reemplazo diario de los tapabocas de tela fue más frecuente en el grupo de los asintomáticos, en tanto que el reemplazo cada tres días fue más común entre los sintomáticos. Por último, más de la mitad de los participantes admitió haber estado en lugares concurridos, siendo esta práctica más frecuente entre los sintomáticos que entre los asintomáticos. Conclusiones. Este es el primer estudio de conocimientos, actitudes y prácticas sobre la Covid-19 en Venezuela. El conocimiento y las prácticas de los venezolanos podrían mejorar mediante el fortalecimiento de los programas de educación y capacitación. Esta información, obtenida durante la fase inicial de la pandemia en Venezuela, podría contribuir al diseño de estrategias de promoción y prevención de la Covid-19.

Sentinel surveillance for bacterial pneumonia and meningitis in children under the age of 5 in a tertiary pediatric hospital in Colombia - 2016

Abstract: Introduction: Bacterial pneumonia and meningitis are vaccine-preventable diseases. Sentinel surveillance provides relevant information about their behavior. Objective: To present the data from sentinel surveillance carried out at the Fundación HOMI, Fundación Hospital Pediátrico La Misericordia in 2016. Materials and methods: We conducted a descriptive study from January 1 to December 31, 2016, on the daily surveillance of patients under 5 years of age diagnosed with pneumonia or bacterial meningitis according to PAHO's definitions. We identified the microorganisms using the automated VITEKTM 2 system. Bacterial isolates were sent to the Microbiology Group at the Colombian Instituto Nacional de Salud for confirmation, serotyping, phenotypic, and genotypic characterization. Antimicrobial susceptibility profiles were established. Results: From 1,343 suspected cases of bacterial pneumonia, 654 (48.7%) were probable, 84% had complete Hib vaccination schedules, and 87% had complete pneumococcal vaccination schedules for age. Blood culture was taken in 619 (94.6%) and 41 (6.6%) were positive while S. pneumoniae was isolated in 17 (41%) of them. The most frequent serotype was 19A in five cases (29.4%), and four 19A serotypes were associated with the reference isolate ST320. The incidence rate of probable bacterial pneumonia was 7.3 cases/100 hospitalized patients, and lethality was 2.1%. As for bacterial meningitis, 22 suspected cases were reported, 12 (54%) were probable, four (33%) were confirmed: two by Escherichia coli and two by group C N. meningitidis. The incidence of probable bacterial meningitis was 0.14 cases/100 hospitalized patients. Conclusion: Streptococcus pneumoniae serotypes 19A and 3 were the most frequent cause of pneumonia. Spn19A is related to the multi-resistant clone ST320. Strengthening and continuing this strategy will allow understanding the impact of vaccination.

Resumen: Introducción. La neumonía y la meningitis bacterianas son enfermedades inmunoprevenibles; la vigilancia centinela aporta información relevante acerca de su comportamiento. Objetivo. Presentar los resultados de la vigilancia centinela de neumonía y meningitis llevada a cabo en la HOMI, Fundación Hospital Pediátrico La Misericordia. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo entre el 1 de enero y el 31 diciembre del 2016, de la vigilancia diaria de pacientes menores de 5 años con diagnóstico de neumonía o meningitis bacteriana, según las definiciones de la Organización Panamericana de la Salud (OPS). Los microorganismos fueron identificados usando el sistema automatizado VITEK TM2. Los aislamientos se enviaron al grupo de microbiología del Instituto Nacional de Salud para confirmación, serotipificación, y caracterización genotípica y fenotípica. Asimismo, se establecieron los perfiles de sensibilidad antimicrobiana. Resultados. De 1.343 casos sospechosos de neumonía bacteriana, 654 (48,7 %) fueron probables, el 84 % tenía el esquema de vacunación completo para la edad contra Haemophilus influenzae de tipo b, y el 87 %, contra neumococo. En 619 (94,6 %) pacientes se hizo hemocultivo y 41 (6,6 %) fueron positivos. S. pneumoniae se aisló en 17 (41 %) casos. El serotipo más frecuente fue el 19A, en cinco pacientes (29,4 %), en tanto que cuatro aislamientos de spn19A fueron relacionados con el clon ST320. La tasa de incidencia de neumonía bacteriana probable fue de 7,3 casos/100 pacientes hospitalizados. La letalidad fue de 2,1 %. Hubo 22 casos sospechosos de meningitis bacteriana, 12 (54 %) probables, y cuatro (33 %) confirmados: dos por Escherichia coli y dos por Neisseria meningitidis del grupo C. La incidencia de meningitis bacteriana probable fue de 0,14/100 pacientes hospitalizados. Conclusión. Los serotipos 19A y 3 de S. pneumoniae fueron la causa más frecuente de neumonía. El Spn19A se relacionó con el clon ST320 mulitirresistente. El fortalecimiento continuo de la vigilancia centinela permitirá entender el impacto de la vacunación.

HIV in women over 50 years: An analysis of administrative data in the departments of the Colombian Pacific region (2014-2018)

Resumen Introducción. El HIV es un problema de salud pública relevante en el Pacífico colombiano debido a la gran problemática social de la región y la exposición de las mujeres a más factores de riesgo. Objetivo. Describir las diferencias por sexo y grupos de edad con respecto al código CIE-10 de HIV más frecuente en los cuatro departamentos de la Región Pacífica colombiana durante el periodo de 2014 a 2018. Materiales y métodos. Se hizo un estudio observacional descriptivo, retrospectivo y con unidades de análisis ecológicas (departamentos y municipios) obtenidas por agregación. La fuente de datos fue el SISPRO, una plataforma para el registro obligatorio de las prestaciones de servicios de salud en el país. Para cada grupo de edad y ente territorial, se estimaron las proporciones del código para mujeres y para hombres, y se calcularon las diferencias absolutas (la proporción femenina menos la proporción masculina). Resultados. A nivel regional, en 9 de 22 grupos se observó el predominio de mujeres, con la mayor diferencia en el grupo de 25 a 29 años. Cinco de los nueve grupos de edad con mayor reporte en mujeres correspondían a mayores de 50 años. La mayor diferencia se encontró en el grupo de 50 a 54 años en Chocó y, la menor, en el grupo de 90 a 94 años en Nariño. En el análisis se identificaron dos patrones: antes de los 50 años, con predominio de los hombres, y después de los 50 años, con predominio de las mujeres. Conclusiones. El análisis secundario de una base de datos de recolección rutinaria es útil. Dado que los datos evidenciaron una prevalencia de los adultos mayores, especialmente mujeres, es importante que se considere incluir esta población en las estrategias de promoción y prevención del programa de HIV.

Abstract Introduction: HIV is a public health problem that is relevant in the Colombian Pacific due to major social problems in the region where women are exposed to more risk factors. Objective: To describe the differences by gender and age of the most frequent ICD-10 code related to HIV in four departments of the Colombian Pacific region during the period 2014 to 2018. Materials and methods: We conducted a descriptive, retrospective observational study with ecological units of analysis (departments and municipalities) obtained by aggregation. The data source was SISPRO, a platform for the mandatory registration of health services in the country. For each age group and territorial entity, we estimated the proportions of each code for women and men, as well as the absolute differences (the female proportion minus the male proportion). Results: At the regional level, there was a predominance of women in 9 of 22 groups evaluated. The largest absolute difference was in the 25-29 age group. Five of the nine age groups with a predominance of women represented ages over 50 years. The greatest difference was found in the 50-54 age group in Chocó, and the smallest difference was found in the 90-94 age group in Nariño. The analysis identified the following two patterns: before the age of 50 with a predominance of men and over the age of 50 with a predominance of women. Conclusions: The secondary analysis of databases for routine information collection is useful. Given that the data showed a prevalence of older adults, especially women, it is important to consider including this population in the promotion and prevention strategies of the HIV program.

Immune characterization of a Colombian family cluster with SARS-CoV-2 infection

Abstract Introduction: Immunological markers have been described during COVID-19 and persist after recovery. These immune markers are associated with clinical features among SARS- CoV-2 infected individuals. Nevertheless, studies reporting a comprehensive analysis of the immune changes occurring during SARS-CoV-2 infection are still limited. Objective: To evaluate the production of proinflammatory cytokines, the antibody response, and the phenotype and function of NK cells and T cells in a Colombian family cluster with SARS-CoV-2 infection. Materials and methods: Proinflammatory cytokines were evaluated by RT-PCR and ELISA. The frequency, phenotype, and function of NK cells (cocultures with K562 cells) and T-cells (stimulated with spike/RdRp peptides) were assessed by flow cytometry. Anti-SARS-CoV-2 antibodies were determined using indirect immunofluorescence and plaque reduction neutralization assay. Results: During COVID-19, we observed a high proinflammatory-cytokine production and a reduced CD56bright-NK cell and cytotoxic response. Compared with healthy controls, infected individuals had a higher frequency of dysfunctional CD8+ T cells CD38+HLA-DR-. During the acute phase, CD8+ T cells stimulated with viral peptides exhibited a monofunctional response characterized by high IL-10 production. However, during recovery, we observed a bifunctional response characterized by the co-expression of CD107a and granzyme B or perforin. Conclusion: Although the proinflammatory response is a hallmark of SARS-CoV-2 infection, other phenotypic and functional alterations in NK cells and CD8+ T cells could be associated with the outcome of COVID-19. However, additional studies are required to understand these alterations and to guide future immunotherapy strategies.

Resumen Introducción. Se han descrito diferentes marcadores inmunológicos durante la COVID-19, los cuales persisten incluso después de la convalecencia y se asocian con los estadios clínicos de la infección. Sin embargo, aún son pocos los estudios orientados al análisis exhaustivo de las alteraciones del sistema inmunológico en el curso de la infección. Objetivo. Evaluar la producción de citocinas proinflamatorias, la reacción de anticuerpos, y el fenotipo y la función de las células NK y los linfocitos T en una familia colombiana con infección por SARS-CoV-2. Materiales y métodos. Se evaluaron las citocinas proinflamatorias mediante RT-PCR y ELISA; la frecuencia, el fenotipo y la función de las células NK (en cocultivos con células K562) y linfocitos T CD8+ (estimulados con péptidos spike/RdRp) mediante citometría de flujo, y los anticuerpos anti-SARS-CoV-2, mediante inmunofluorescencia indirecta y prueba de neutralización por reducción de placa. Resultados. Durante la COVID-19 hubo una producción elevada de citocinas proinflamatorias, con disminución de las células NK CD56 bright y reacción citotóxica. Comparados con los controles sanos, los individuos infectados presentaron con gran frecuencia linfocitos T CD8+ disfuncionales CD38+HLA-DR-. Además, en los linfocitos T CD8+ estimulados con péptidos virales, predominó una reacción monofuncional con gran producción de IL-10 durante la fase aguda y una reacción bifuncional caracterizada por la coexpresión de CD107a y granzima B o perforina durante la convalecencia. Conclusión. Aunque la reacción inflamatoria caracteriza la infección por SARS-CoV-2, hay otras alteraciones fenotípicas y funcionales en células NK y linfocitos T CD8+ que podrían asociarse con la progresión de la infección. Se requieren estudios adicionales para entender estas alteraciones y guiar futuras estrategias de inmunoterapia.

Frequency of antibodies and seroconversion against Rickettsia spp in patients consulting health institutions in the department of Caldas, Colombia, 2016-2019

Resumen Introducción. Las rickettsiosis son enfermedades zoonóticas transmitidas por artrópodos que cumplen el papel de vectores y reservorios, y cuyos síntomas son inespecíficos, por lo que su diagnóstico clínico es difícil. La inmunofluorescencia indirecta (IFI) es el método de referencia para el diagnóstico. En Colombia, ha resurgido el interés por su estudio por los casos de rickettsiosis detectados en el norte del departamento de Caldas a partir del 2001. Objetivo. Establecer la frecuencia de anticuerpos y la seroconversión contra Rickettsia spp. en pacientes atendidos en instituciones de salud del departamento de Caldas, Colombia, entre 2016 y 2019. Materiales y métodos. Se hizo un estudio de diseño cuantitativo, observacional y descriptivo, con una muestra no probabilística de 175 pacientes atendidos en diferentes municipios de Caldas, a quienes se les realizó IFI para la detección de anticuerpos en fase aguda y convaleciente contra Rickettsia rickettsii, R. typhi y R. felis. Resultados. El promedio de edad de los pacientes fue de 31 años. Los municipios con mayor proporción de seropositivos fueron Belalcázar, Chinchiná, Filadelfia, La Dorada, La Merced y Manizales. El 66 % tenía mascotas y el 12 % reportó picaduras por artrópodos. Los signos y síntomas más frecuentes fueron cefalea (69,7 %), artromialgia (60 %), y fiebre (58,2 %). La seroprevalencia por IgG fue de 60 % para R. rickettsii, 47,9 % para R. typhi y 24 % para R. felis. Ocho pacientes presentaron seroconversión. Conclusión. Se encontró evidencia de la circulación de rickettsias del grupo de las fiebres manchadas y del grupo del tifus asociada con casos humanos en el departamento de Caldas.

Abstract Introduction: Rickettsioses are zoonotic diseases transmitted by arthropods acting as vectors and reservoirs. Disease symptoms are nonspecific and, therefore, their clinical diagnosis is difficult. Indirect immunofluorescence (IFA) is the gold standard assay for diagnosis. The interest for conducting studies on these pathologies has resurfaced in Colombia since 2001; besides, previous studies have evidenced cases of rickettsiosis in the north of the department of Caldas. Objective: To establish the frequency of antibodies and seroconversion against Rickettsia spp. In patients consulting health institutions in Caldas, Colombia, from 2016 to 2019. Materials and methods: We conducted a quantitative, observational, and descriptive study on a non-probabilistic sample of 175 patients with symptoms compatible with rickettsiosis who consulted in different municipalities of Caldas, Colombia; IFA was performed to detect antibodies in the acute and convalescent phases against Rickettsia rickettsii, Rickettsia typhi, and Rickettsia felis. Results: The average age of the patients was 31 years. The municipalities with the highest proportion of seropositive cases were Belalcázar, Chinchiná, Filadelfia, La Dorada, La Merced, and Manizales; 66% of patients owned pets and 12% reported arthropod bites. The most frequent signs and symptoms were headache (69.7%), arthromyalgia (60%), and fever (58.2%). IgG seroprevalence was 60% for R. rickettsii, 47.9% for R. typhi, and, and 24% for R. felis. Eight patients presented seroconversion. Conclusion: We found evidence of the circulation of Rickettsia species from the spotted fever group and the typhus group associated with human cases in Caldas.

Indirect effects of the SARS CoV-2 pandemic on the prevalence of breastfeeding: Modeling its impact

Abstract: Introduction: Breastfeeding has a protective effect against acute respiratory and diarrheal infections. There are psychological and social effects due to physical isolation in the population in the mother-child group. Objective: To assess the impact on infant mortality due to a decrease in the prevalence of breastfeeding during 2020 due to the physical isolation against the SARS CoV-2 (COVID-19) pandemic in Colombia. Materials and methods: We used the population attributable risk approach taking into account the prevalence of breastfeeding and its potential decrease associated with the measures of physical isolation and the relative risk (RR) of the association between exclusive breastfeeding and the occurrence of acute infection consequences in the growth (weight for height) of children under the age of five through a mathematical modeling program. Results: We found an increase of 11.39% in the number of cases of growth arrest in the age group of 6 to 11 months with a 50% decrease in breastfeeding prevalence, as well as an increase in the number of diarrhea cases in children between 1 and 5 months of age from 5% (5.67%) on, and an increased number of deaths in children under 5 years (9.04%) with a 50% decrease in the prevalence of exclusive breastfeeding. Conclusions: A lower prevalence of breastfeeding has an impact on infant morbidity and mortality in the short and medium-term. As a public health policy, current maternal and childcare strategies must be kept in order to reduce risks in the pediatric population.

Resumen: Introducción. La lactancia materna tiene un efecto protector frente a infecciones respiratorias y diarreicas agudas. Hay efectos psicológicos y sociales por el aislamiento físico en la población en el grupo materno-infantil. Objetivo. Evaluar el eventual impacto en la mortalidad infantil de la disminución en la prevalencia de la lactancia materna durante el 2020 a causa del aislamiento físico por la pandemia del SARS CoV-2 (COVID-19) en Colombia. Materiales y métodos. Se utilizó el enfoque de riesgo atribuible poblacional, teniendo en cuenta la prevalencia de la lactancia materna y su potencial disminución asociada con las medidas de aislamiento físico y el riesgo relativo (RR) de la asociación entre la lactancia materna exclusiva y el efecto de la aparición de infecciones agudas en el crecimiento (peso para la altura) de niños menores de cinco años mediante un programa de modelamiento matemático. Resultados. Se registró un aumento del número casos de detención del crecimiento en el grupo etario de 6 a 11 meses de 11,39 % al disminuir en 50 % la prevalencia de la lactancia materna, así como un mayor número de casos por diarrea en los cinco primeros meses a partir del 5 % (5,67 %), y un incremento en el número de muertes en menores de 5 años (9,04 %) al disminuirse en 50 % la prevalencia de la lactancia materna. Conclusiones. Se registró un impacto en la morbilidad y la mortalidad infantil a corto y mediano plazo al disminuir la prevalencia en la lactancia materna. Como política pública en salud, deben mantenerse las estrategias actuales de atención materno-infantil para disminuir riesgos en la población infantil.

Characterization of sexually transmitted infections, their pharmacological treatment, and recurrence in a Colombian population

Abstract Introduction: Sexually transmitted infections are a public health problem worldwide. Their inadequate antimicrobial management has been associated with a higher risk of recurrence. Objective: To characterize the main sexually transmitted infections, the adherence to clinical practice guidelines, and the factors associated with recurrence in Colombia. Materials and methods: We conducted an observational study to identify the main sexually transmitted infections, the sociodemographic variables, and the pharmacological management in a patient cohort from a population database of 6.5 million people affiliated with the Colombian health system. We made a multivariate analysis to identify the variables associated with recurrence. Results: We detected 3,158 patients with a mean age of 41.8 ± 14.5 years, of whom 63.1% were men. We found 4.030 episodes of sexually transmitted infections, predominantly urethral syndrome (27.5%). Only 13.6% of patients with urethral syndrome, ulcerative syndrome, or genital warts were managed in compliance with clinical practice guidelines and 20.6% were dispensed condoms; 16.7% of patients had recurrences and being male (OR=1.32; 95%CI 1.08-1.63), <30 years old (OR=1.72; 95%CI 1.40-2.13), being treated in municipalities other than capital cities (OR=1.43; 95%CI 1.06-1.94), and having received inadequate treatment for the first episode (OR=1.93; 95%CI 1.52-2.39) were associated with recurrence. Conclusions: The majority of patients with sexually transmitted infections were not treated in compliance with clinical practice guidelines and those who did not have adequate management had a higher risk of recurrence.

Resumen: Introducción. Las infecciones de transmisión sexual constituyen actualmente un problema de salud pública en el mundo. Su inadecuado tratamiento antimicrobiano se ha relacionado con un mayor riesgo de recurrencias. Objetivo. Caracterizar las principales infecciones de transmisión sexual, el cumplimiento de las guías de práctica clínica de Colombia y los factores asociados con las recurrencias. Materiales y métodos. Se hizo un estudio observacional para determinar las principales infecciones de transmisión sexual, las variables sociodemográficas y el tratamiento farmacológico en una cohorte de pacientes registrados en una base de datos poblacional de 6,5 millones de personas afiliadas al Sistema de Salud de Colombia. Se hizo un análisis multivariado para establecer las variables asociadas con las recurrencias. Resultados. Se detectaron 3.158 pacientes; su edad media era de 41,8 ±14,5 años y 63,1 % de ellos correspondía a hombres; se encontraron 4.030 episodios de infecciones de transmisión sexual con predominio del síndrome uretral (27,5 %). El 13,6 % de los pacientes con síndrome uretral, ulceroso o con verrugas genitales se manejó según las guías de práctica clínica. El 20,6 % tenía acceso a condones y el 16,7 % presentó recurrencias. Ser hombre (OR=1,32; IC95% 1,08-1,63), tener <30 años (OR=1,72; IC95% 1,40-2,13), ser tratado en municipios distintos a ciudades capitales (OR=1,43; IC95% 1,06-1,94) y haber recibido un tratamiento inadecuado en el primer episodio (OR=1,93; IC95% 1,52-2,39) fueron factores asociados con las recurrencias. Conclusiones. La mayoría de los pacientes con infecciones de transmisión sexual no fueron tratados según las guías de práctica clínica y quienes no tuvieron un manejo adecuado presentaban mayor riesgo de recurrencias.

Sociodemographic and clinical characteristics of gestational syphilis in Cali, 2018

Resumen Introducción. La sífilis gestacional se considera de interés en salud pública por las repercusiones que tiene en la madre y el hijo. Pese a tener protocolos para su notificación, diagnóstico y manejo, en Colombia se siguen evidenciando limitaciones en su control. Objetivo. Describir las características sociodemográficas, clínicas y de distribución espacial de las pacientes con sífilis gestacional en Cali, Colombia, en el 2018. Materiales y métodos. Se hizo un estudio transversal con 427 casos de sífilis gestacional reportados al Sistema de Vigilancia en Salud Pública (Sivigila). Para el procesamiento estadístico, se utilizó el programa R, versión 3.5.3. Las variables cualitativas se presentan como proporciones y, las cuantitativas, mediante medidas de tendencia central y dispersión, Para la distribución espacial, se usó el programa Qgis 3.0. Resultados. La razón de sífilis gestacional fue de 17 casos por 1.000 vivos (incluidos los mortinatos). El 57,1 % de las pacientes pertenecía al régimen subsidiado de salud y el 16,6 % no estaba asegurado. El 90,4 % de los casos se diagnosticó durante el embarazo; el 47,2% recibió tres dosis de penicilina y el 57,6 % de los contactos recibió tratamiento. Conclusiones. La tasa de sífilis gestacional en Cali en el 2018 fue superior a la nacional y la enfermedad se presentó con mayor frecuencia en mujeres gestantes en condición de vulnerabilidad socioeconómica, lo que coincidió con la distribución espacial en general. Se evidenció la falta de oportunidad en la detección temprana y el manejo de la infección tanto en las pacientes como en sus contactos, lo cual dificulta el control de la enfermedad y refleja la inadecuada aplicación de la ruta integral de atención en salud materno-perinatal.

Abstract Introduction: Gestational syphilis is considered an event of public health interest given its impact on mother and child. In Colombia, despite having specific protocols for its notification, diagnosis, and management, there are still limitations in its control. Objectives: To describe the sociodemographic and clinical characteristics, as well as the spatial distribution of gestational syphilis in Cali, Colombia, in 2018. Materials and methods: We conducted a cross-sectional study of 427 gestational syphilis cases reported to the Colombian national epidemiological surveillance system (Sivigila). For the statistical processing, we used the R program, version 3.5.3. We expressed qualitative variables as proportions and quantitative ones through central tendency and dispersion measures, and to establish the spatial distribution we used the Qgis program, version 3.0. Results: The prevalence of gestational syphilis was 17 cases per 1,000 live births (including stillbirths); 57.1% of patients belonged to the subsidized healthcare system and 16.6% had no health insurance; 90.4% of cases were diagnosed during pregnancy; 47.2% of the pregnant women received three doses of penicillin, yet only 57.6% of contacts were treated. Conclusions: The prevalence of gestational syphilis in Cali during 2018 exceeded the national rate with a higher frequency among women in socioeconomic vulnerability conditions consistent with the general spatial distribution. There was a lack of opportunity in the early detection and management of the infection both among pregnant women and their contacts, which hinders the control of the disease and reflects the inadequate application of the comprehensive maternal and perinatal health care route guidelines.

Prevalence of intestinal parasites in a cohort of HIV- infected patients from Antioquia, Colombia

Abstract Introduction: HIV infection is still a public health problem worldwide and co-infections with other infectious agents including intestinal parasites are of particular concern, mainly in developing countries like Colombia. Objective: To conduct a cross-sectional study in patients attending an HIV care program in Antioquia given that there have been few intestinal parasites prevalence studies among the HIV population in the country. Material and methods: We evaluated stool samples from 192 patients by direct wet mount and concentration, modified Ziehl Neelsen staining, and agar plate culture. Univariate and correlation analyses were done to explore the association between socio-demographic and clinical characteristics and parasitological data. Results: The overall prevalence of intestinal parasites in HIV-positive subjects was 29.2% (56/192; 95% CI: 22.8% - 35.6%). Entamoeba histolytica/dispar/moshkosvkii with 13.0% (25/192; 95% CI: 8.2% - 17.8%) and Blastocystis with 12.0% (23/192; 95% CI: 7.4% -16.6%) were the most frequent. Opportunistic parasites like Cryptosporidium spp. and Cystoisospora belli were less prevalent, each one with 0.5% of positive samples (1/192; 95% CI: 0.1% - 1.5%). Commensal protozoa were also detected with a prevalence of 18.8% (36/192; 95% CI: 13.3% - 24.3%). Most of the individuals in the study had a controlled viral load and an LTCD4 count greater than 200 cel/µL. A small percentage (9.3%) had diarrhea. Bivariate analysis and multivariate logistic regression showed that only age and having pets had a significant association with intestinal parasites in this cohort. Conclusions: Our results confirmed that the evaluated population is at high risk of intestinal parasite infection, which highlights the need for routine screening of gastrointestinal parasites to provide prompt treatment and reduce possible complications.

Resumen Introducción. La infección por HIV y las coinfecciones con otros agentes infecciosos, incluidos los parásitos intestinales, son motivo de especial preocupación en países en desarrollo como Colombia. Objetivo. Hacer un estudio transversal en pacientes que asisten a un programa de atención de HIV en el departamento de Antioquia, dado que los estudios de prevalencia de parásitos intestinales en la población con HIV son escasos en el país. Materiales y métodos. Se evaluaron 192 muestras de materia fecal mediante examen coprológico directo y por concentración, tinción de Ziehl-Neelsen modificada, y aislamiento en agar. Se hicieron análisis univariados y de correlación, para explorar la asociación entre las características sociodemográficas y clínicas, y los datos parasitológicos. Resultados. La prevalencia global de parásitos intestinales en pacientes positivos para VIH fue del 29.2 % (56/192; IC95% 22.8-35.6 %), siendo Entamoeba histolytica/dispar/moshkosvkii, con 13.0 % (25/192; IC95% 8.2-17.8 %), y Blastocystis, con 12.0 % (23/192; IC95% 7.4-16.6 %), los mas frecuentes. Los parásitos oportunistas Cryptosporidium spp. Y Cystoisospora belli fueron menos prevalentes, cada uno con 0.5 % (1/192; IC95% 0.1-1.5 %) de muestras positivas. También, se detectaron protozoos comensales, con una prevalencia del 18,8 % (36/192; IC95% 13,3-24,3 %). La mayoría de los individuos tenía una carga viral controlada y un recuento de linfocitos T CD4 superior a 200 células/μl. Un pequeño porcentaje (9,3 %) presentó diarrea. La edad y el tener mascotas mostraron una asociación significativa con la presencia de parásitos intestinales. Conclusión. Se confirmó que la población evaluada tiene un alto riesgo de infección por parásitos intestinales, lo que resalta la necesidad de un protocolo de diagnóstico para el cribado de dichos agentes, con el fin de brindar un tratamiento rápido y reducir las posibles complicaciones.

Distribution and phenotypic and genotypic characterization of Listeria monocytogenes isolated from food, Colombia, 2010-2018

Resumen Introducción. Listeria monocytogenes es un patógeno transmitido por alimentos que causa infecciones en humanos, entre ellas, meningitis, meningoencefalitis y septicemias, así como abortos. Con la tipificación serológica se han identificado 13 serotipos, siendo el 4b el causante de la mayoría de los brotes en el mundo. Objetivo. Determinar la frecuencia y la distribución de los serotipos y subtipos moleculares de L. monocytogenes aislados de alimentos en Colombia entre el 2010 y el 2018. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo y retrospectivo a partir del análisis de 2.420 aislamientos que fueron identificados como L. monocytogenes y otras especies, por medio de pruebas bioquímicas, serológicas y de subtipificación molecular mediante electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE). Resultados. De los 2.420 aislamientos recibidos, 2.326 fueron confirmados como L. monocytogenes. Los serotipos encontrados fueron: 4b (52%), 4d-4e (14,5%), 1/2a (11%), 1/2c (9,4%), 1/2b (9 %), y 3a, 3b, 3c, 4c, 4d, 4e y 7 (menos de 2%). Procedían de Bogotá (43%), Antioquia (25%), Valle (10%), Nariño (9%) y otros departamentos (7%). La caracterización genotípica agrupó los aislamientos evaluados en 167 patrones de PFGE; los perfiles más frecuentes se presentaron en productos lácteos, cárnicos y alimentos preparados. Conclusión. El 96,1 % de los aislamientos correspondieron a L. monocytogenes, con una buena concordancia entre el aislamiento y la identificación; el serotipo 4b, extremadamente virulento, fue el más frecuente. El análisis molecular evidenció la posible diseminación y permanencia en el tiempo de varios serotipos, lo que resalta la importancia de incluir este patógeno en los programas de vigilancia epidemiológica en alimentos.

Abstract Introduction: Listeria monocytogenes is a food-borne pathogen that may cause infections in humans such as meningitis, meningoencephalitis, and septicemia, as well as abortions. By serological typing 13 serotypes have been identified of which 4b is responsible for most of the outbreaks in the world. Objective: To determine the frequency and distribution of serotypes and molecular subtypes of L. monocytogenes isolated in Colombia from food from 2010 to 2018. Materials and methods: We conducted a retrospective and descriptive study based on the analysis of 2,420 isolates confirmed as L. monocytogenes and other species using biochemical and serological tests, and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) for molecular subtyping. Results: Of the 2,420 isolates received, 2,326 were confirmed as L. monocytogenes. The serotypes found were 4b (52%), 4d-4e (14.5%), 1/2a (11%), 1/2c (9.4%), 1/2b (9%), and 3a, 3b, 3c, 4c, 4d, 4e and 7 (less than 2%). The isolates came from Bogotá (43%), Antioquia (25%), Valle (10%), Nariño (9%), and other departments (7%). The genotypic characterization grouped the isolates in 167 PFGE patterns. The most frequent patterns were identified in various dairy and meat products, and in prepared foods. Conclusion: A 96.1% of the isolates corresponded to L. monocytogenes showing good agreement between isolates and identification. Serotype 4b, highly virulent, was the most frequent. The molecular analysis showed the possible dissemination and permanence over time of several serotypes, which highlights the importance of including this pathogen in epidemiological food surveillance programs.

Molecular characterization of multiresistant enterobacteria in two departments of the Peruvian jungle

Resumen Introducción. La aparición de enterobacterias multirresistentes y productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en pacientes de consulta externa con infecciones urinarias, representa un problema de salud pública en Perú. Objetivos. Caracterizar molecularmente enterobacterias multirresistentes aisladas de pacientes con diagnóstico de infección urinaria y procedentes de dos departamentos de la selva peruana. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo, observacional y retrospectivo de 61 aislamientos de urocultivo procedentes de la selva peruana durante 2017 y 2018. Los perfiles de resistencia se identificaron utilizando el sistema automatizado MicroScan™ y para la detección de los genes bla TEM , bla CTX-M , bla SHV se empleó una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional. Resultados. Las enterobacterias positivas para BLEE más frecuentes por departamento fueron Escherichia coli en Madre de Dios (25%, 10/40) y Ucayali (76,2%, 16/21). En ambos departamentos, el gen blaCTX-M fue el más frecuente (25/61; 41), seguido por bla TEM (15/61; 24,6%) y bla SHV (10/61; 16,4%). En el perfil de sensibilidad antimicrobiana, se detectó 72,6% de resistencia contra ampicilina, 82,3 % contra cefalotina y 88,7% contra nitrofurantoína. Conclusiones. El porcentaje de cepas de enterobacterias multirresistentes productoras de BLEE en ambos departamentos fue del 57,4% y el gen bla CTX-M fue el más frecuente.

Abstract Introduction. The emergence of multiresistant enterobacteria producing extended- spectrum beta-lactamase (ESBL) in outpatients with urinary tract infections represents a public health problem in Perú. Objectives. To characterize multiresistant enterobacteria isolated from patients diagnosed with urinary tract infection in two Peruvian jungle departments using molecular techniques. Materials and methods. We conducted a descriptive, observational, and retrospective study of 61 urine culture isolates from two departments in the Peruvian jungle during 20172018. Resistance profiles were identified using the MicroScan™ automated system and a conventional polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of bla CTX-M , bla TEM and bla SHV genes.. Results. The most common positive ESBL enterobacteria for each department were Escherichia coli in Madre de Dios (10/40; 25%) and Ucayali (16/21; 76.2%). Gene bla CTX-M was the most prevalent in both departments (25/61; 41%), followed by bla TEM (15/61; 24.6%), and bla SHV (10/61; 16.4%). As for the antimicrobial susceptibility profile, we detected resistance levels of 72.6% for ampicillin, 82.3% for cephalothin, and 88.7% for nitrofurantoin. Conclusions. BLEE-producing multi-resistant enterobacteria strains in both departments were 57.4% and bla CTX-M was the most common gene.