Acta Biológica Colombiana

Role of the regulatory and accesory proteins of HIV- 1 in its pathogenisis

Desde el descubrimiento del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) como agente etiológico del síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA) se han descrito los procesos más importantes que hacen parte del ciclo replicativo del virus y que a su vez participan de la fisiopatología tan compleja que caracteriza a esta infección. A pesar de los avances realizados en el desarrollo de medicamentos antirretrovirales y de los logros alcanzados en el control de la replicación viral, hechos que se reflejan en un aumento en la expectativa y calidad de vida de los individuos infectados, la terapia actual no permite una reconstitución inmunológica total y está acompañada de efectos tóxicos secundarios y de la aparición de resistencia viral. Esto ha obligado a mantener la búsqueda constante de nuevos blancos terapéuticos que ofrezcan alternativas en la lucha contra esta pandemia. Hasta hace pocos años se creía que las proteínas accesorias y reguladoras del VIH1 no ejercían un papel significativo en el ciclo replicativo del virus y en la patogénesis de la infección; sin embargo, estudios recientes indican que estas proteínas ejercen funciones esenciales en diferentes etapas del proceso replicativo y por ende son responsables de muchos efectos asociados a la patogénesis viral. Por estos hallazgos, las proteínas accesorias y reguladoras del VIH-1 constituyen un blanco promisorio en el desarrollo de nuevos medicamentos que complementen los antirretrovirales disponibles en la actualidad. En esta revisión se describe la función de las proteínas reguladoras y accesorias del VIH-1 en el ciclo replicativo viral y su participación en el proceso patogénico de esta infección.

Since the discovery of HIV-1 as the etiological agent of the acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), the main processes involved in its replication cycle and responsible for the complex physiopathology of this infection have been described. Despite the advances in the development of new antiretrovirals and their impact in the quality and life expectancy of infected individuals, the current therapy does not allow a complete immune reconstitution and is also associated with deleterious side effects and the appearance of viral resistance. Therefore the search for new therapeutic targets is required to face this pandemic. The role of the accessory and regulatory proteins of the HIV- 1 in the replication cycle and in the pathogenesis of the infection has been ignored for several years now; however, recent studies indicated that these proteins play essential roles in the replication cycle, being responsible for several processes associated to viral pathogenesis. These findings have underlined the importance of these proteins as promissory targets in the development of new therapeutic agents. In this review, we detailed the role of each one of the HIV-1s regulatory and accessory proteins in the replicative cycle and in the pathogenesis of this infection.

The Proteomics In The Postgenomic Era

El principal desafío de la biología moderna es entender la expresión, función y regulación del conjunto completo de proteínas codificadas por un organismo, lo cual describe el objetivo del nuevo campo de la proteómica. Las proteínas son las efectoras del trabajo celular, por ello el estudio de sus perfiles globales de expresión y de sus cambios bajo determinadas condiciones fisiológicas o patológicas, permite entender la red compleja de interacciones en que se basa el funcionamiento de una célula. La electroforesis en dos dimensiones (2D-PAGE) es la técnica central de la proteómica. En la actualidad no existe otro método con la capacidad para resolver simultáneamente miles de proteínas en un solo procedimiento y para detectar modificaciones post y co-traduccionales imposibles de predecir a partir de la secuencia genómica. Sus aplicaciones incluyen el análisis de proteomas, señalización, detección de marcadores de enfermedades y cáncer.

The main challenge of modern biology is to understand the expression, function and regulation of the whole set of proteins codified by an organism, which is the objective of the new field of proteomics. Proteins are the effectors of cellular work and the knowledge of their global expression profiles and changes under physiological and pathological conditions can help us to understand the complex network of interactions involved in cellular function. Two-dimensional electrophoresis (2-DE) is the central technology in proteomics. At present no other technique has the throughput and high resolution of 2-DE for the separation of thousands of proteins in one procedure and for the analysis of post-and co-translation modifications, not predictable from the genome sequence. The scope of applications extends from proteome analysis, to cell signaling, disease markers and cancer.

Effects Of Inoculation With Arbuscular Mycorrhizal Fungi On Rubber Seedlings

Hongos formadores de micorrizas arbusculares (HFMA) obtenidos a partir de suelos caucheros se multiplicaron en plantas de Lolium sp., con 73% de colonización radical luego de cuatro meses. Se obtuvieron siete morfotipos de HFMA, con los cuales se inocularon dos grupos de plántulas de Hevea brasiliensis: 1) producidas in vivo a partir de semilla; 2) producidas in vitro por rescate de embrión, para determinar efectos sobre mortalidad, crecimiento, micorrización y contenido de fósforo foliar. Los niveles de colonización por HFMA para las plántulas obtenidas in vitro e in vivo fueron de 12,6% y de 44,7%, respectivamente. La biomasa media total acumulada por las plántulas producidas in vitro fue de 0,41 y de 1,40 g por las procedentes del material in vivo, en comparación con los controles no inoculados, los cuales acumularon 0,37 y 0,40 g , respectivamente. El tratamiento con HFMA disminuyó la mortalidad en las plántulas obtenidas in vitro, aunque no tuvo un efecto significativo sobre el contenido de fósforo foliar. La respuesta del crecimiento de las plántulas inoculadas fue diferente dependiendo del origen del material vegetal y del tipo de inóculo (nativo o no nativo). La simbiosis entre HFMA y H. brasiliensis se desarrolló en condiciones controladas de crecimiento, aunque su avance dependió del estado de desarrollo de la plántula. No obstante, influyó en el crecimiento y en la disminución de la mortalidad de las plántulas, lo que abre la posibilidad de utilizarla como alternativa de inoculación en las fases tempranas de obtención del material vegetal.

Hevea brasiliensis rubber plants were inoculated with native arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) during their greenhouse acclimatization. The AMF were multiplied for 4 months associated with Lolium sp. plants having 73% root colonization. Seven morphotypes were obtained. Two different groups of H. brasiliensis plants were inoculated with these morphotypes to determine AMF effect on mortality rate, growth, mycorrhization and leaf P content: those produced in vivo by seed germination and those produced in vitro by micropropagation. Plantlets produced in vitro returned 12.6% AMF colonization and 0.41 g accumulated dry biomass, whereas seedlings produced in vivo had 44.7% and 1.40 g , respectively, compared to control plants with no AMF inoculation which accumulated 0.37 g (in vitro) and 0.40 g (in vivo). AMF inoculation reduced the plants mortality rate regarding in vitro produced material; however, it did not influence foliar P content. Inoculated plants growth response was different, depending on plant material and the kind of inoculum used (native or foreign). Symbiosis developed between AMF and H. brasiliensis in controlled growth conditions although its advance was limited by the plants growth stage. Nevertheless, such association influenced inoculated plants biomass accumulation and decreased their mortality rate and could be used as an alternative treatment during the earliest stages of H. brasiliensis plantlet production.

Floral Phenology And Flower Visitors In Drimys granadensis L.f. (Winteraceae)

El propósito de este trabajo fue caracterizar las fases fenológicas florales y determinar los visitantes florales en una población natural de Drimys granadensis (nombre común: canelo; Winteraceae) ubicada en Altos de Yerbabuena ( 2.850 m ), cerros orientales de la Sabana de Bogotá, (Colombia). El desarrollo fenológico floral duró 9,5 días cuando la floración ocurrió en época soleada, 12,5 días en época lluviosa y 16 días cuando se excluyeron a los visitantes florales mediante embolsado. Se realizaron observaciones del recurso utilizado, fase fenólogica de la flor visitada y cargas polínicas en los visitante florales, los cuales correspondieron a seis órdenes, 21 familias y 29 morfoespecies de insectos. Cuatro especies de coleópteros y dos de dípteros fueron considerados posibles polinizadores por su abundancia y carga de polen. Los resultados obtenidos se discuten en relación con aquellos reportados en otras especies del género Drimys y de la familia Winteraceae.

The purpose of this research was to characterize the flowering phenological phases and to determine the flower visitors in a natural population of Drimys granadensis (common name: canelo; Winteraceae) in Altos de Yerbabuena, eastern mountains of Sabana de Bogotá ( Colombia ). Floral phenology development lasted 9.5 days when flowering occurred under sunny conditions, 12.5 days under rainy conditions and 16 days when flower visitors were excluded using cloth bags. It was done observations related with the resources used, the phenological phases of visited flowers and the pollen load on the flower visitors. Visitors corresponded with 29 morphospecies, 6 orders y 21 families of insects. Four species of coleoptera and two species of diptera were considered as possible pollinators taking in account abundance and pollen load. The results are analyzed in relation with those reported for other species in the genus Drimys and in the family Winteraceae.

Evaluation Of Antagonism And Multiplication The Trichodermasp. In The Middle Static Liquid Banana Substrate

Se evaluó la capacidad antagónica de nueve aislados del hongo Trichoderma sp. proveniente de la colección de cepas del Laboratorio de Fitopatología de la Universidad de Córdoba, Colombia y su producción de esporas en medios de cultivo líquido estático, a través de pruebas in vitro de antagonismo, utilizando dos hongos fitopatógenos: Fusarium sp. y Rhizoctonia sp.; esta prueba permitió seleccionar el aislado con la mayor actividad antagónica, para así ajustar la producción de esporas mediante un proceso de fermentación en estado líquido en condición estática mediante procesos de buferización y sin buferización con fosfato 0,2N, utilizándose como sustrato principal harina de plátano (HP) 5%, además de complementos nutricionales que constituyeron los tratamientos: HPM (solución de melaza 5%), HPL (solución de levadura granulada al 2%), HPU (solución de urea 0,1%), y como testigo PGL (papa glucosa líquida). En los ensayos de antagonismo se seleccionó el aislado C2 de Trichoderma sp. por presentar la mayor capacidad antagónica frente al hongo Fusarium sp., con un porcentaje de inhibición del 78,30% y reportando un índice 4 de antagonismo, en los procesos de producción de esporas el tratamiento HPL (harina de plátano más levadura sin buffer) se destacó por su favorable producción de conidias, con una concentración de 1,1 x 10(9) conidias/mL. Los procesos de buferización se diferenciaron significativamente, demostrando que la variable buffer influyó en la producción de conidias, los medios que se amortiguaron mostraron una producción de 1,01 x 10(9) conidias/mL, con respecto a los que no se amortiguaron 6,3 x 10(8) conidias/mL.

The antagonistisc ability of nine isolated natives fungi Trichoderma sp from the collection of strains at Laboratory of phytopathology at University of Cordoba, Colombia was assessed so as its production of spores in crop liquid static medium, cross the in vitro proof antagonism using two phytopathogenic fungi: Fusarium sp. and Rhizoctonia sp., this proof let select the isolated with the major antagonistic activity and adjust the production of spores through fermentation process in liquid static by means of buffer and without buffer with phosphate 0,2 N, being used as principal substrate plantain flour (HP) 5%, besides of nutritional supplements that formed the trataments: HPM (molasses solution 5%), HPL (granulated yeast solution at 2%), HPU (urea solution 0.1%), and as witness PGL (potato glucose liquid). In the test of antagonism was selected the isolated C2 of Trichoderma sp. by present the major antagonistic ability in front of the fungi Fusarium sp., with a inhibition percentage at 78,30% and reporting a index 4 of antagonism, in the process of spores production, the tratament HPL (plantain flour plus yeast without buffer) stressed for the favorable production of conidias, with a concentration of 1,1 x 10(9) conidias/mL. The buffer process were significant differentiated, showing that the variable buffer influenced in the production of conidias, the mediums that shocked in the production show 1,01 x 10(9) conidias/mL, Ïwith respect at dont shocked 6,3 x 10(8) conidias/mL.

Modeling of the Hierarchical Structure of Freshwater Macroinvertebrates Using Artificial Neural Networks

El estudio de la estructura jerárquica de comunidades ecológicas, se ha sintetizado de manera regular a través de técnicas multivariadas de ordenación o clasificación. Sin embargo, al contarse actualmente con herramientas analíticas de computación bioinspirada provenientes de la inteligencia artificial, existe la oportunidad de establecer modelos ecológicos, con características deseables como flexibilidad, exactitud, robustez y confiabilidad. En este contexto, esta investigación utilizó dos métodos computacionales de utilidad en ecoinformática, referidos a redes neuronales artificiales (RNARs) para la modelación de la estructura jerárquica de una comunidad de macroinvertebrados bentónicos en términos de auto-organización y predicción. El primer método de modelación consistió en un mapa de auto-organización (MAU), una herramienta de aprendizaje no supervisado que clasificó las especies de macroinvertebrados; este MAU tomó en la capa de entrada la abundancia de cada taxa, y en la de salida proyectó su clasificación en 15 unidades y cuatro agrupamientos jerárquicos. La segunda RNA, correspondió a un Perceptrón multicapa de alimentación adelantada con algoritmo de retropropagación, que modeló separadamente la riqueza y la abundancia de Ephemeroptera, Coleoptera y Trichoptera (ECT), en función de nueve variables fisicoquímicas; la arquitectura del perceptrón correspondió a una constitución de nueve, siete, y una neurona en las capas de entrada, intermedia y salida, respectivamente. Los resultados sugieren que las RNARs utilizadas evidenciaron tanto los patrones jerárquicos, como los de riqueza y abundancia de ECT de manera adecuada, al tiempo que facilitaron el análisis de los datos y el entendimiento de la dinámica de la comunidad de macroinvertebrados, objeto de estudio.

The study of hierarchical structures of ecological communities has been synthesized in an ordinary way by means of multivariated techniques of ordination or clustering. Currently, analytical tools of bio-inspired computation belonging to the area of artificial intelligence are available to achieve ecological models with desirable characteristics, such as; flexibility, accuracy, robustness and reliability. In this context, this study employed two computational methods useful in ecoinformatics referring to artificial neural networks (RNAR) for the modeling of the hierarchical structure of a benthic macroinvertebrate community in self-organization and prediction terms. The first ANN modeling method consisted of a Kohonen self-organization map (SOM), a non-supervised learning tool that classify the species of macroinvertebrates; this SOM in the input layer of gets the abundance of each taxa from the data matrix, while in the output layer was visualized the computational results. Thus, in the output layer the species are organized in fifteen units and four hierarchical clusters. The second ANN method applied consisted of a multilayer feed-forward perceptron net with back-propagation algorithm to predict the three major insect orders; this means, Ephemeroptera, Coleoptera and Trichoptera (ECT) richness and abundance using a set of nine physical-chemical variables. This ANN architecture included a neuron for each environmental variable, a hidden layer with seven neurons and a neuron in the output layer for ECT prediction. The results suggest that both types of ANN used, SOM and perceptron, were correspondingly related to the hierarchical patterns and with the richness and abundance patterns predictions, and gave the data analysis and understanding of the dynamic of the macroinvertebrates community, in a correct way.

Analysis of the Structure Arborea Agroforestry System Cocoa (Theobroma cacao L.) in Soconusco, Chiapas - Mexico

Se determinó la abundancia, riqueza, importancia, equidad y diversidad de los árboles encontrados en sistemas agroforestales de cacao, del Soconusco, Chiapas, México. La presente investigación, se desarrolló en la región costera del Soconusco, ubicada al sur del estado de Chiapas; se muestrearon los municipios de Huehuetán, Tapachula y Tuxtla Chico, por ser los más representativos en área sembrada de cacao. En cada municipio, se establecieron al azar siete parcelas temporales de 50 x 50 m cada una, lo que suma en total 5,25 hectáreas , en las cuales se registraron variables como el diámetro a la altura del pecho (DAP: 1,3 m sobre el nivel del suelo), área basal, y sombrío en el cacaotal. Se encontraron 46 especies agrupadas en 21 familias, las especies con el mayor valor de importancia fueron Mangifera indica y Pouteria sapota, convirtiéndose en las especies de sombra más frecuentemente encontradas. La composición florística denotó una mayor similitud en los municipios de Tapachula y Huehuetán, como lo muestra el mayor porcentaje del índice de Jaccard y en lo que respecta a diversidad, el municipio de Tuxtla Chico presentó el mayor valor según el índice de Shannon. Este estudio determina la existencia de una cobertura definitiva de preferencia asociada a los árboles frutales.

The abundance, wealth, size, fairness and diversity of trees found in cacao agroforestry systems was determined in Soconusco , Chiapas , Mexico . This research was conducted in the coastal region of Soconusco, located in the southern state of Chiapas . The municipalities of Huehuetán Tapachula and Tuxtla Chico were sampled, as the most representative in area planted with cocoa. In each municipality, were created at random seven parcels temporary 50 x 50 m each, which amount totalling 5.25 hectares , in which there were variables such as the diameter at breast height (DBH: 1.3 m above the soil), basal area, and grim in the cacaotal. We found 46 species grouped into 21 families, species with higher importance were Mangifera indica and Pouteria sapota, becoming species of shade most frequently encountered. The floral composition noted greater similarity in the municipalities of Tapachula and Huehuetán, as shown by the largest percentage index Jaccard and with regard to diversity, the town of Tuxtla Chico presenting the greatest value as the index Shannon . This study determined the existence of a definitive coverage preferably associated with fruit trees.

Induced Systemic Resistance Against Fusarium oxysporum In Tomato By Trichoderma koningiopsis Th003

Trichoderma koningiopsis Th003 ha mostrado alta eficacia en el control de diferentes fitopatógenos incluyendo Fusarium oxysporum, agente causal de la pudrición del cuello y la raíz del tomate (Solanum lycopersicum Mill.). Con el propósito de estudiar si este agente tiene la capacidad para inducir respuestas sistémicas de defensa, se utilizó como patosistema modelo Fusarium oxysporum -tomate, cuyas plantas se establecieron en cubos de enraizamiento con el sistema radical separado en dos porciones. Cuando Th003 se inoculó en una porción de la raíz 96 h antes de inocular en la otra porción F. oxysporum, se presentó un retraso de la colonización del fitopatógeno en el sistema vascular de la planta, en comparación con las plantas inoculadas solamente con el fitopatógeno. Este resultado sugiere que Th003 estimuló respuestas sistémicas de defensa en la planta, dado que el antagonista y el fitopatógeno permanecieron separados espacialmente. El microorganismo biocontrolador formulado como gránulos dispersables, se aplicó en un cultivo comercial de tomate bajo invernadero y redujo significativamente la incidencia de la pudrición del cuello y las raíces del tomate en 35%, en comparación con el testigo absoluto. El hongo T. koningiopsis Th003 demostró habilidad para controlar F. oxysporum f. sp. radicislycopersici mediante inducción de respuestas de defensa sistémica en las plantas de tomate.

Trichoderma koningiopsis Th003 has proved to be an efficient biocontrol agent of different plant pathogens including Fusarium oxysporum, causing agent of tomato crown and root rot. With the aim to studying whether Th003 has the ability to induce defense systemic responses to control Fusarium oxysporum infection, tomato plants (Solanumlycopersicum Mill.) were sown in pots using split root modified method. When Th003 was applied to one root portion 96 h before inoculating F. oxysporum in the other root portion, delayed colonization of the plant's vascular system was observed as compared with plants inoculated only with the pathogen. Since the antagonist and the pathogen remained spatially separated in the host, the protection effect in plants was attributed to a systemic activity induced by Th003. In a commercial greenhouse the biopesticide based upon Th003 reduced significantly (P<0.05) by 35% the incidence of crown and root rot caused >F. oxysporum f. sp. Lycopersici, compared with untreated control. T. koningiopsis Th003 showed ability to control F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici by inducing systemic defense responses in tomato plants.

Diversity Of Cultivable Bacteria From The Coast Of Caleta Olivia, Patagonia , Argentina

Caleta Olivia es una ciudad que posee boyas por donde se exporta el petróleo crudo obtenido de la zona norte de la provincia de Santa Cruz, Argentina. Este trabajo tuvo como objetivo estudiar las posibilidades de utilización microbiana de petróleo crudo y sus derivados e identificar las bacterias cultivables que se encuentran presentes en la costa de Caleta Olivia. La mineralización de hidrocarburos se detectó por la producción de dióxido de carbono. Se tomaron muestras de agua de mar y sedimento intermarial de tres sitios. Se realizaron recuentos bacterianos en los medios de cultivo BBR, BRN, medio mineral con petróleo gas oil y ENDO para bacterias coliformes. Las bacterias se identificaron utilizando el sistema de Sherlock de MIDI. Las mineralizaciones evidenciaron la capacidad existente en los microorganismos para la utilización de hidrocarburos. Los recuentos de coliformes fueron negativos. Se aislaron un total de 403 cepas a las que se les realizó la extracción de ácidos grasos e identificación, de ellas solo 172 fueron identificadas por el sistema. Se distribuyeron en 32 géneros y 50 especies bacterianas. El resto, el sistema no las identificó debido a que no halló cepas similares en la base de datos del sistema. Pseudoalteromonas fue el género que más se aisló. El análisis de componentes principales asoció al verano y al otoño con la mayor biodiversidad de géneros. Se encontraron representantes de los siguientes géneros: Arthrobacter, Dietzia, Acinetobacter, Microbacterium, Micrococcus, Bacillus, Pseudomonas y Pseudoalteromonas. Estos microorganismos son citados en la bibliografía como degradadores de hidrocarburos.

The aim of this work was to evaluate the oil utilization and identity of the bacterial strains present in the coast Intertidal sediments and marine water from Caleta Olivia city which were analyzed to determine bacterial counts. Five microcosms were designed for sediments and water sample. The microcosms contained 5 g or 50 mL of samples with 0.01% of gasoline, and 0.1% of kerosene, diesel, crude oil and mineral oils. The CO2 was measured by titration. Four cultural medium were used i.e. BBR, BRN, mineral medium with crude oil and gas oil and ENDO for coliforms. The bacteria were identified by Sherlock - MIDI . The mineralization shows good values. The counts resulted negative to total coliforms and faecal coliforms. 403 strains were analyzed; the system could identify 172 strains in 32 genera in only 50 species. The rest of strains were not found in Sherlock data base (version 6.0). Pseudoalteromonas was the genus that was more frequently isolated. The summer and autumn seasons presented more quantity of biodiversity genera. We found genera, which are mentioned as hydrocarbon degrading genera in the literature.

Brumptomyia hamata (Psychodidae), A New Addition To The Phlebotomine Fauna Of The Colombian Caribbean

La fauna flebotomínea del Caribe colombiano es aún poco conocida, por lo que se hace necesario llevar a cabo estudios para determinar la riqueza de especies de la región. Con este propósito se desarrollaron muestreos entomológicos en enero y marzo de 2007, en el municipio de Colosó, departamento de Sucre, con dos trampas CDC modificadas. En el material recolectado se identificaron dos machos de Brumptomyia hamata, que constituyen el primer registro de este flebotomíneo para el Caribe colombiano. Las características morfológicas observadas en los ejemplares de B. hamata son consistentes con la descripción original de la especie, excepto por las espinas del estilo que se distribuyen en tres grupos. Se plantea que tales diferencias pueden corresponder a variaciones intraespecíficas entre poblaciones geográficas.

The sand fly fauna of the Colombian Caribbean is still not completely known and further surveys are needed in order to determine the richness of species over the region. Entomological samplings were performed in the municipality of Colosó , department of Sucre , using two modified CDC traps, in January and March of 2007. Two males belonging to Brumptomyia hamata were identified. It is the first record of this sand fly species from the Colombian Caribbean. With the exception of the distribution of spines on the style in three distinct groups, all other morphological characters of the individuals of B. hamata agree with the original description of the species. The observed difference could be attributed to intraspecific variation among geographic populations.

**STABILITY OF ANTHOCYANINS FROM Rubus glaucus AND Solanum betaceum Cav.dark-red strain AS AFFECTED BY TEMPERATURE, STORAGE AND WATER ACTIVITY**

The stability of sprayed-dried microencapsulated anthocyanins from Andes berry (Rubus glaucus) and Tamarillo (Solanum betaceum), as affected by storage time, water activity (Aw) and temperature was compared. The fruits were osmotically dehydrated with ethanol and the anthocyanin extract was microencapsulated with maltodextrin DE 20 by spray drying. Half life of the anthocyanins; changes in color, total phenolics, and antioxidant activity of the powders, were analyzed during storage at two different temperatures ( 25 °C and 40 °C) and two Aw levels (0.20 and 0.35). A decrease in monomeric anthocyanin was observed in both samples. The half life of the Andes berry pigments ranged between 11 and 32 days while the half life of the tamarillo pigments ranged between 9 and 21 days. A darkening effect occurred in both samples as a result of storage time. The antioxidant activity decreased while the phenolic content increased with time. Antioxidant activity of Andes berry samples was highly correlated with anthocyanin content and total phenolic content while the antioxidant activity of tamarillo samples was highly correlated with total phenolic content. These results would be useful in developing applications for spray-dried anthocyanins as powdered food-grade colorants.

Se comparó el efecto del tiempo de almacenamiento, la temperatura y la actividad de agua (Aw) sobre la estabilidad de antocianinas microencapsuladas de Mora de Castilla (Rubus glaucus) y tamarillo (Solanum betaceum). Las frutas se sometieron a deshidratación osmótica con etanol y el extracto antociánico se microencapsuló con maltodextrina ED 20 por atomización. La vida media de las antocianinas; los cambios en color, fenoles totales y actividad antioxidante se analizaron durante el almacenamiento a dos temperaturas ( 25 °C y 40 °C) y dos niveles de Aw (0,20 y 0,35). Se observó una disminución de la antocianina monomérica en las dos muestras. La vida media de los pigmentos de mora de Castilla varió entre 11 y 32 días, mientras que la vida media de los pigmentos del tamarillo varió entre 9 y 21 días. Hubo oscurecimiento de las muestras como resultado del tiempo de almacenamiento. La actividad antioxidante de las dos muestras dismi-nuyó, mientras que el contenido fenólico aumentó con el tiempo. La actividad antioxi-dante de las muestras de mora de Castilla presentó una alta correlación con los con-tenidos de antocianinas y fenoles totales mientras que la actividad antioxidante de las muestras de tamarillo se correlacionó con el contenido de fenoles totales. Estos resultados son útiles en el desarrollo de aplicaciones de antocianinas microencapsu-ladas como colorantes alimenticios.

Lichen Community Structure And Morphological Changes In The Genus Sticta (STICTACEAE) Associated To An Altitude Gradient

La distribución y el crecimiento de los líquenes están condicionados por diferentes factores ambientales, entre estos la variación en gradientes altitudinales. En la cordillera Oriental de los Andes de Colombia, no se han realizado estudios sobre zonación altitudinal de líquenes. En este trabajo se estudiaron las variaciones en la estructura de la comunidad de líquenes epifitos en un gradiente altitudinal (2.000- 2.600 m) en el PNN Tatamá. Se encontró que con el aumento en altura hay una disminución en riqueza y diversidad, siendo esto una desviación del patrón encontrado generalmente en otros trabajos sobre líquenes y gradientes altitudinales. La comunidad a bajas alturas se compone principalmente de líquenes fruticosos (cobertura de 30% a 2.070 m y 0% a 2.560 m) y a mayores alturas de líquenes foliosos (cobertura de 15% a 2.070 m y 43% a 2.560 m). La altura, además de influenciar la estructura de la comunidad de los líquenes, puede afectar el desarrollo y la morfología de estos. En el género folioso Sticta se presentaron variaciones intraespecificas en la densidad de cifelas (órganos de intercambio gaseoso) asociadas a la altura, encontrándose un efecto significativo de la altura sobre la densidad de cifelas en las especies S. andensis y S. gyalocarpa (ANOVA, valor p= 0.008 y 0.05 respectivamente). Esto muestra un mecanismo de adaptación a los cambios ambientales que se dan con la altura.

Lichens growth and distribution are conditioned by various environemental factors, altitude being an important one. In the Cordillera Oriental of Colombian Andes, there havent been studies on lichens altitudinal zonation. We studied the variation on lichen community structure along an altitudinal gradient (2000- 2600 m) in PNN Tatamá, we found diversity diminishes as altitude increases, this being a variation from whats generally found in lichen community behavior. At low altitudes, the community was conformed by fruticose lichens (30% cover at 2070 m and 0% at 2560 m), and by foliose lichens at high altitudes (15% cover at 2070 m and 43% at 2560 m). Altitude, besides influencing lichens community structure, may affect their development and morphology. In the foliose genus Sticta we found intraspecific variation on cyphellae (gaseous exchange organs) density associated with altitude, a significant effect of altitude on cyphellae density was found for the species S. andensis and S. gyalocarpa (ANOVA p value= 0.008 and 0.05 respectively). This shows an adaptation mechanism of these organisms to the environmental changes given with altitude.

**GENETIC VARIABILITY OF THE ZEBU CATTLE BREED (Bos indicus) IN THE DEPARTAMENT OF HUILA, COLOMBIA USING MICROSATELLITE MOLECULAR MARKERS**

The polymorphism of 11 microsatellites from zebu cattle (Bos indicus) was studied using a commercial multiplex system to estimate genetic variability. Allele frequencies polymorphism information content and heterozygosis were calculated. Allele frequencies revealed that in the analyzed sample the markers were not equally polymorphic. The average allele was 14.2 with the highest values for the TGLA122 microsatellites. The mean heterozygocity was 0.7056 and the polymorphism information content was 0.668. This multiplex analysis could be used for pedigree information and for adequate genetic improvements in breeding programs and paternity test.

Para estimar la variabilidad genética, el polimosfismo de 11 microsatélites de vacunos zebú (Bos indicus) fue estudiado mediante el sistema comercial multiplex system. Se calcularon frecuencias alélicas, contenido de información polimórfica y heterocigosis. Las frecuencias alélicas de la muestra analizada revelan que los marcadores no fueron equitativamente polimórficos. El alelo promedio fue 14,2 con el mayor valor para los microsatélites TGLA122. El promedio de heterocigosidad fue 0,7056 y el contenido de información polimórfica de 0,668. Este tipo de análisis puede ser usado para información de pedigrí y mejoramiento genético en programas de cría y pruebas de paternidad.

Physiological Responses And Antagonistic Capacity Of Yeast Phyllospheric Isolates Obtained In Blackberry Crops (Rubus glaucus)

La filósfera es un ecosistema complejo que a pesar de contar con un gran número de microorganismos asociados, presenta pocos estudios diseñados para entender las características ecofisiológicas de los microorganismos que lo habitan. Las levaduras, como elemento importante de este hábitat, están expuestas a un ambiente variable afectado por la planta hospedera, edad y posición de la hoja, disponibilidad y calidad de nutrientes, temperatura, pH, radiación y actividad del agua. Estos factores producen una presión de selección para el establecimiento de poblaciones naturales o introducidas de levaduras que puedan desplazar otras poblaciones de hongos fitopatógenos. En este estudio se obtuvieron 80 aislamientos de levaduras filosféricas de dos cultivos de mora (Rubus glaucus), a las que se les determinó su nicho potencial en términos de su capacidad para crecer a diferentes condiciones de temperatura, pH, estrés osmótico y tolerancia a radiación UV. El estrés osmótico fue la condición evaluada más restrictiva para las levaduras obtenidas, ya que únicamente seis aislamientos presentaron un crecimiento superior a 0,3 unidades de DO a 405 nm, cuando fueron crecidas a 50% y 60% de glucosa. Este estudio permitió seleccionar diez aislamientos filosféricos de levaduras, destacados por su capacidad para crecer en un amplio rango de condiciones. De estos, cuatro aislamientos LvF 34, LvF 43, LvF 44 y LvF 50 se destacaron por su capacidad de antagonismo contra el hongo fitopatógeno Botritys cinérea. Su determinación taxonómica permitió reportar por primera vez las especies Candida kunwinensis y Rhodotorula colostri con potencial biocontrolador.

The phyllosphere is a complex ecosystem in which despite of having a great number of associated microorganisms, few studies have been designed to understand the ecophysiological characteristics of the microorganisms inhabitant. Yeasts, as an important element of this habitat, are exposed to a variable environment, affected by the host plant, age and leaf position, availability and nutrient quality, temperature, pH, radiation and water activity. All these factors produce an important selection pressure for the establishment of natural or introduced populations of yeast which may displace other phytopathogenic fungi. In this study 80 isolates of phyllospheric yeast were obtained from two blackberry crops (Rubus glaucus). Its potential niche was determined in terms of its capacity to growth at different conditions of temperature, pH, osmotic stress and UV radiation. The osmotic stress was the most restrictive evaluated condition for the obtained yeast. Only six isolates presented a growth higher to 0.3 OD units at 405 nm, when grown at 50% or 60% of glucose. This study identified the ecological niche of ten yeast phyllospheric isolates, selected for their capacity to growth at a wide range of conditions. Four of these isolates LvF 34, LvF 43, LvF 44 and LvF 50 were selected for their antagonistic capacity against the phytopathogenic fungi Botritys cinérea. Its taxonomic determination allowed us to report for the first time isolates of Candida kunwinensis and Rhodotorula colostri with biocontrol capacity.

**FIRST HOST RECORD FOR THE ROOT PARASITE Corynaea crassa (BALANOPHORACEAE)**

Corynaea crassa is a root hemiparasitc plant infrequent in nature. There is little information regarding their natural history, in particular their host range. In this study we dig 32 tubers and followed their parasitized roots to determine the species host. We found Bocconia frutescens (Papaveraceae), Verbesina sp. (Asteraceae), Cayaponia sp. (Cucurbitaceae) y Palicourea sp.(Rubiaceae) as natural hosts of C. crassa. This is the first host record available for C. crassa and provides some bases for its conservation in natural habitats.

Corynaea crassa es una planta hemiparásita de raíz poco común y de la cual sabemos muy poco acerca de su historia natural y en particular sobre su rango de hospederos. En este estudio excavamos 32 tubérculos de dicha especie y seguimos las raíces que estaban parasitando para determinar su identidad. Encontramos Bocconia frutescens (Papaveraceae), Verbesina sp. (Asteraceae), Cayaponia sp. (Cucurbitaceae) y Palicourea sp. (Rubiaceae). Este es el primer registro de hospederos disponible para la especies y este tipo de información es de gran utilidad para las conservación de C. crassa en hábitats naturales.

CYP1A1, CYP2E1 AND GASTRIC CANCER RISK IN A HIGH-INCIDENCE COLOMBIAN POPULATION

El objetivo fue probar la hipótesis de que en casos y controles, de una población colombiana con alta incidencia de cáncer gástrico, muestran diferencias significativas entre las frecuencias de los polimorfismos genéticos CYP1A1*2A y CYP2E1*5A; y a la vez, probar si hay diferencias entre el hábito del tabaquismo, el consumo de alcohol y el estrato socioeconómico; así como también sus posibles interacciones. Durante dos años consecutivos se diagnosticaron y confirmaron ochenta y siete casos nuevos de pacientes afectados por cáncer gástrico y se colectaron igual número de controles pareados por edad y del mismo grupo poblacional, pertenecientes a la comunidad “paisa” del departamento de Caldas. Se genotipificaron por medio de PCR-RFLPs para los polimorfismos CYP1A1*2A y CYP2E1*5A. Además, se tuvo en cuenta las variables socioeconómicas y el estilo de vida, con respecto al tabaquismo y al consumo de alcohol. Los resultados encontrados sugieren que los portadores del alelo CYP2E1-c2, asociado con mayor actividad metabólica, tienen mayor riesgo a desarrollar cáncer gástrico (OR=3,6 CI95% 1,6-8,1/p=0,002). En contraste, la frecuencia del alelo CYP1A1-m2, también asociado con mayor actividad enzimática, mostró similar frecuencia entre los dos grupos. El tabaquismo y el estrato socioeconómico bajo, también mostraron diferencias significativas. En conclusión, se evidencia una interacción significativa entre gen-ambiente, particularmente entre el tabaquismo y los alelos bioactiavantes CYP2E1-c2 y CYP1A1-m2, que pueden alterar la susceptibilidad a cáncer gástrico en esta región Andina del noroeste de Sur América caracterizada por alta incidencia de esta neoplasia

The aim was to test the hypothesis that some cases and controls, in a Colombian population with a high incidence of gastric cancer, show significant differences among the frequencies of CYP1A1*2A, CYP2E1*5A gene polymorphisms and simultaneously to test the differences between the tobacco smoking habit and the socio-economic stratum as well as their possible interactions. For two consecutive years were diagnosed and confirmed eighty-seven patients affected by gastric cancer and an equal number of controls matched by age and the same population group, belonging to the “paisa” community in the Colombian Province of Caldas. Were genotyped by PCR-RFLP for CYP1A1*2A and CYP2E1*5A polymorphisms. Besides, socio-demographic variables and the lifestyle with reference to tobacco smoking and alcohol consumption were taken into account. The results suggest that carriers of the CYP2E1-c2 allele associated with higher metabolic activity, are more likely to develop gastric cancer (OR = 3.6 95% CI 1,6 - 8,1/p = 0.002). In contrast, the allele frequency of CYP1A1-m2, also associated with increased enzyme activity, showed similar frequency between the two groups. Tobacco smoking and the low socio-economic stratum also showed differences significant. In conclusion, we found a significant interaction gene-environment, particularly between smoking and bioactiavantes CYP2E1-c2 and CYP1A1-m2 alleles which can alter the susceptibility to gastric cancer in the Andean region of northwestern South America characterized by high incidence of this neoplasm.

Quantitative Protease Assay Using Photographic Films

Se han desarrollado dos métodos para la medición cuantitativa de la actividad proteasa basados en la prueba de la película fotográfica. Una prueba discontinua puede ser implementada mediante la cuantificación de la cantidad de pigmento remanente en la película con cualquier programa de edición de imágenes. La medición continua de la actividad proteasa se puede obtener a través del cambio de absorbancia generado por la liberación de las sales de plata unidas al negativo fotográfico si se cuenta con un espectrofotómetro equipado con una celda con agitación.

Two quantitative protease assays have been developed based on the classic photographic film test. A discontinuous assay can be performed by measuring the amount of pigment remaining in the film with any image editor software. A continuous assay can be implemented by the measuring the release of silver halide salts bonded in the film using a recording spectrophometer equipped with a Peltier Cell.