Acta Biológica Colombiana

Ontogeny and Physiognomy of the Epigenetic Landscape: A General Model to Explain Developmental Systems

El paisaje epigenético es una metáfora gráfica propuesta por Conrad H. Waddington para explicar el desarrollo de los organismos mediante la imagen de un paisaje compuesto por una superficie ondulante con cimas y valles, que representan las vías por las cuales se desplazan las células del organismo en su proceso de diferenciación. C.H. Waddington, considerado como el padre de la epigenética, es notable por sus aportes teóricos, que incluyen las nociones de asimilación genética, la canalización del desarrollo y el epigenotipo. Estas ideas surgieron a partir de estudios experimentales en biología del desarrollo, los cuales resultaron en el descubrimiento del "organizador" en embriones de aves y, posteriormente, de fenocopias inducidas por factores ambientales en Drosophila. En el presente artículo se presenta una interpretación del paisaje epigenético y conceptos relacionados, que ponen en evidencia el poder heurístico de este modelo y su importancia para la biología contemporánea. Este trabajo es un homenaje a la vida de C. H. Waddington, cuya obra continúa siendo de gran actualidad.

The epigenetic landscape is a graphic metaphor proposed by Conrad H. Waddington to explain the development of organisms and their parts. It is depicted as a wavy surface with summits and descending valleys, representing the paths followed by cells along their differentiation process, as part of organismal development. Conrad H. Waddington, regarded as the father of epigenetics, stands out for his theoretical contributions, that include the notions of genetic assimilation, canalization of development and epigenotype. These ideas were inspired by experimental works in developmental biology, that lead to the discovery of the organizer in bird embryos, as well as environmentallyinduced phenocopies in Drosophila. In the current essay, I present an interpretation of the epigenetic landscape and related concepts that highlight the heuristic power of this model and its importance for contemporary biology. This work is a tribute to the life of C. H. Waddington, whose work is still of great significance.

BIOPROSPECTING AS A POSSIBLE DEVELOPMENT MECHANISM FOR COLOMBIA

Bioprospecting has been on the agenda for discussion by the government, the academic community, businesses and other pertinent actors for many years now; it is an integral topic representing a potential approach to exploit biodiversity to the fullest. This document presents some definitions of what bioprospecting is (some restrictive, others with a broader perspective, depending on different approaches, actors, target markets and countries) in the context of a mechanism for development and cooperation concerning the construction of capacities, advantages and disadvantages. It was found that bioprospecting in Colombia has been developing from a broad perspective (systematic study of biological-genetic resources, transformation into a product which has led to strengthening some value chains, small- and/or large-scale marketing and some advances in intellectual property rights and the distribution of benefits) in order to provide greater benefits for the nation.

La bioprospección ha sido durante varios años tema de discusión por los gobiernos, la comunidad académica, las empresas, y otros actores que se integran en el proceso, como potencial de acercamiento y uso de la diversidad biológica. A través del presente documento se presentan algunas definiciones de lo que es la bioprospección (algunas restrictivas otras de perspectiva amplia, dependientes de diferentes aproximaciones, actores, blanco de mercado, contexto del país, entre otros), la bioprospección como mecanismo de desarrollo y cooperación para la construcción de capacidades, ventajas y desventajas. Se encuentra que en Colombia se ha venido desarrollando bioprospección desde la perspectiva amplia (estudio sistemático del recurso biológico-genético, transformación en un producto lo que ha permitido el fortalecimiento de algunas cadenas de valor, comercialización a pequeña o gran escala y algunos avances en temas de propiedad intelectual y distribución de beneficios) lo cual puede brindar mayores beneficios para la nación.

Consequences of Biome Depletion

El microbioma constituye el conjunto de microorganismos asociados a un hospedero principal. El superorganismo o holobionte humano está constituido por el hospedero y su microbioma que han coevolucionado desde los primeros días de la existencia de la especie humana. La modificación del microbioma, sumado a los cambios en los hábitos sociales y alimentarios del ser humano a lo largo de su historia biológica ha llevado a la emergencia de numerosas enfermedades. En contraste con la visión darwiniana de la naturaleza de egoísmo y competencia, nuevos enfoques holísticos has surgido. Con esta visión, la reconstitución del microbioma surge como una terapia fundamental ante la emergencia de enfermedades causadas por la continua pérdida del mismo.

The human microbiome is an integral part of the superorganism together with their host and they have co-evolved since the early days of the existence of the human species. The modification of the microbiome as a result changes in food and social habits of human beings throughout their life history has led to the emergence of many diseases. In contrast with the darwinian view of nature of selfishness and competence, new holistic approaches are rising. Under these views, the reconstitution of the microbiome comes out as a fundamental therapy for emerging diseases related to biome depletion.

Biodiesel Production from Microalgae: Cultivation Parameters that Affect Lipid Production

Las microalgas poseen la capacidad para mitigar las emisiones de CO2 y producir lípidos, por lo que se consideran con potencial para la obtención de biocombustibles de tercera generación. La presente revisión proporciona información actualizada de la influencia de las condiciones de cultivo, sobre la obtención de lípidos con una productividad elevada y perfil adecuado para la producción de biodiesel, se proporciona una síntesis de resultados de investigaciones realizadas en los últimos 13 años en diversas partes del mundo. En la literatura consultada, los autores concluyen que aunque el comportamiento de las microalgas ante condiciones de estrés fisiológico es variable entre especies; la limitación de nutrientes especialmente nitrógeno y fósforo, asociado al crecimiento heterotrófico o a altas intensidades luminosas en fototrofía se consideran como las estrategias más eficientes para incrementar el contenido de lípidos en las microalgas, en particular de triglicéridos constituidos por ácidos grasos saturados y monoinsaturados, ideales para la producción de biodiesel. De igual forma, señalan que la presencia de pequeñas cantidades de CO2 y la cosecha de la biomasa en la fase estacionaria de crecimiento, incrementan el contenido de lípidos y disminuyen el número de insaturaciones de los ácidos grasos que lo conforman.

The microalgae have the capacity to mitigate CO2 emissions and to produce lipids, which are considered with potential to obtain third-generation biofuel. This review provides updated information of the influence of culture conditions on the lipids production with high productivity and profile suitable for the biodiesel production. This document presents a compilation of research conclusions over the last 13 years around the world. In the literature consulted, the authors conclude that although the behavior of microalgae at physiological stress conditions, varies between species; the nutrients limitation, especially nitrogen and phosphorus, associated with heterotrophic growth or high irradiances in phototrophy are considered the most efficient strategies to increase the lipid content in microalgae, particularly triglycerides (consisting of saturated and monounsaturated fatty acids), which are excellent for the production of biodiesel. Also, it is reported that the lipid content increase and the number of unsaturated fatty acids decrease with the addition of small amounts of CO2 and harvesting the biomass it the stationary phase of growth.

Biogeographic Analysis of the Characiformes Fishes of Venezuela

Se realizó un análisis biogeográfico basado en los peces Characiformes de Venezuela con el objetivo de explorar la importancia relativa de los procesos que han contribuido con el establecimiento de los patrones de distribución actuales de la ictiofauna continental venezolana. La información geográfica y filogenética disponible se analizó siguiendo los métodos de Análisis de Parsimonia de Endemismos (PAE) y Análisis de Parsimonia de Brooks (BPA). El PAE señaló fundamentalmente a los Llanos Occidentales y el sur del Amazonas como áreas de endemismo. El BPA realizado con la información filogenética de siete géneros mostró un patrón generalizado con los clados (Caribe + Maracaibo) y ((((Río Negro+Orinoco) + Paria) + Valencia) + Cuyuní), donde se destaca un evento de dispersión desde la cuenca del río Negro hacia el río Orinoco. Los resultados de ambos métodos biogeográficos indican que la región de los llanos - amazonas, donde se conjugó la biota del incipiente Orinoco con la biota amazónica, contiene el mayor número de especies, las áreas de endemismo mejor sustentadas, así como distintos eventos de especiación y posterior dispersión hacia otras regiones. La biota de la región nortecostera del país parece más bien gobernada por procesos de especiación vicariante de carácter puntual por el aislamiento histórico de sus drenajes.

Based on the information available on fishes of the order Characiformes of Venezuela a biogeographical analysis was performed to explore the relative importance of the processes that may have contributed to the establishment of current distribution patterns of the Venezuelan continental ichthyofauna. Geographic and phylogenetic information available for this group of fishes was analyzed by Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) and Brooks Parsimony Analysis (BPA). PAE uncovered the western plains and southern Amazonas as areas of endemism. BPA, using the phylogenetic information of seven genera, showed a general pattern with two major clades (Caribbean + Maracaibo) and ((((Rio Negro + Orinoco River) + Paria) + Valencia) + Cuyuní), where the proposed hypothesis highlights a dispersion event from the Rio Negro basin to the Orinoco River. The results indicate that the plains-Amazonas region, where the Amazon biota mixed with that of the incipient Orinoco s biota, contains the largest species richness, areas of endemism, and well as many speciation events with posterior dispersion to other regions of Venezuela. The biota of the northern coastal region in turn seems rather governed by punctual vicariant speciation processes, which may have been conditioned by the historical isolation of the basins draining this region.

Effect of the Hydrocarbon Phenanthrene on Chlorella vulgaris (Chlorellaceae) Growth

Se evaluó el efecto del hidrocarburo policíclico aromático fenantreno sobre el crecimiento de la microalga Chlorella vulgaris bajo condiciones de laboratorio. Las microalgas fueron expuestas a diferentes concentraciones de fenantreno (0, 1, 10, 100, 1000 y 10000 µg/l). El tiempo de exposición fue de 72 h, determinándose diariamente la densidad algal mediante recuento en cámara de Neubauer. Se determinó la tasa promedio de crecimiento, la biomasa total y el porcentaje de inhibición de la biomasa. También se evaluó el contenido de clorofila a, al inicio y final del experimento. Los ensayos fueron realizados en recipientes de vidrio de 0,4 l, utilizando como medio de cultivo fertilizante inorgánico del complejo NPK (REMITAL® m - 17-6-18) a razón de 1 g/l. Los resultados mostraron que el fenantreno inhibió progresivamente el crecimiento de la microalga, observándose el menor crecimiento celular en el medio con la mayor concentración de fenantreno, el cual alcanzó un porcentaje de inhibición del crecimiento del 59 %. Las tasas de crecimiento diario se mantuvieron relativamente constantes en los demás tratamientos. La concentración de clorofila a, medida mediante espectrofotometría, no se afectó por las diferentes concentraciones del hidrocarburo. En conclusión, el crecimiento de la microalga C. vulgaris puede afectarse negativamente por la exposición a concentraciones nominales superiores a 1 µg/l de fenantreno.

The effects of the polycyclic aromatic hydrocarbon phenanthrene on the growth of Chlorella vulgaris alga were evaluated under laboratory conditions. The algae were exposed during 72 h to different concentrations of phenanthrene (0, 1, 10, 100, 1000 and 10000 µg/l). The alga density was daily determined by a Neubauer chamber. The average growth average, total biomass and inhibition percentage of the biomass were also determined. In addition, the content of chlorophyll a was determined at the beginning and the end of the experiment. The assays were carried out in glass bottles of 0,4 l using the complex NPK (REMITAL® m - 17-6-18) at 1 g/l as an organic fertilizing. The results showed that phenanthrene inhibited progressively the alga growth being the lowest cellular growth observed in the medium with the highest phenanthrene concentration, reaching an inhibition percentage of 59 %. In the other treatments, the daily growth rate was relatively constant. The chlorophyll a concentration evaluated by spectrophotometry was not affected by the phenanthrene concentration. In conclusion, the growth of the alga C. vulgaris was affected negatively by the exposure to nominal concentrations of the polycyclic aromatic hydrocarbon phenanthrene higher than 1 µg/l.

Effect of Water and Saline Stress on Germination of Atriplex nummularia (Chenopodiaceae)

Los suelos salinos, característicos de zonas áridas, pueden afectar la germinación de las especies por presentar bajos potenciales hídricos o por toxicidad iónica. En este trabajo se determinó el efecto del estrés hídrico y salino sobre la germinación de Atriplex nummularia, una alternativa forrajera para zonas áridas. Las semillas fueron escarificadas para minimizar el efecto inhibidor de las brácteas y germinadas a 23 ºC sobre papel de germinación en soluciones con diferente potencial hídrico (-0,5, -1,0 y -1,5 MPa) de cloruro de sodio (NaCl) y polietilenglicol (PEG), utilizando agua destilada como control. El porcentaje de germinación y la velocidad de germinación fueron significativamente afectados por la concentración de la solución y el soluto utilizado. A valores de potencial osmótico más negativos el porcentaje de germinación y velocidad de germinación fueron significativamente menores. En los tres potenciales hídricos ensayados la velocidad y el porcentaje de semillas germinadas en NaCl fue significativamente menor que en PEG, siendo especialmente notoria esta diferencia a -1,0 MPa. Los datos sugieren que las semillas de A. nummularia presentan sensibilidad a la presencia de los iones Na+ y Cl- que afectan el proceso de germinación.

Saline soils, characteristic of arid zones, can affect the germination of the species due to low water potential or ion toxicity. The effect of water and saline stress on germination was evaluated in Atriplex nummularia a potential source of forage for arid zones. The seeds were scarified to reduce the inhibitory effect on germination and incubated in at 23 ºC on germination paper imbibed with solutions of sodium chloride (NaCl) and polyethylen glycol (PEG) at three water potentials: -0,5; -1,0 and -1,5 MPa. The percentage germination and germination speed were significantly affected by the concentration of the solution and the solute used. While more negative osmotic potentials, the percentage of germination and germination speed were significantly lower. The seeds germinated in PEG solution have higher germination and germination speed than the seeds germinated in NaCl, specially in -1,0 MPa. The data suggest that the seeds of A. nummularia show sensitivity to the presence of Na+ and Cl- ions affecting the germination process.

Identification of cisregulatory Elements and Bioinformatic Prediction of Transcriptional Factors Involved in Regulation of miRNAs in Plants

Los microARNs (miARNs) son pequeños ARN no codificantes que juegan un papel importante en el control de la expresión génica a través de la degradación de ARNm complementarios a su secuencia. La expresión de los miARNs es dependiente de la ARN polimerasa II como la mayoría de genes que codifican para proteínas. La regulación de la expresión de miARNs está bajo el control coordinado y combinatorio de factores de transcripción (FT). En este trabajo, se realizó una aproximación bioinformática para identificar sitios de unión de FT, TFBS (del inglés Transcription Factors Binding Sites) en regiones promotoras de genes miRNAs en 17 especies vegetales y se analizó el papel de algunos FT en defensa contra bacterias. Se encontró que nueve de las plantas analizadas presentaban diferencias significativas entre la distribución de TFBS presentes en los promotores de los miRNAs cuando se compara con los presentes en los genes codificantes de proteínas. En varios de los promotores de los miRNAs de yuca que son inducidos en respuesta a la infección por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis se identificaron elementos de unión como CCA1, T-box y SORLREP3, los cuales se presentan también en los genes que codifican proteínas implicadas en respuestas al ciclo circadiano y a la luz, sugiriendo que estos procesos y las respuestas inmunes en plantas pueden ser coordinados. En conjunto este trabajo aporta luces sobre los posibles mecanismos transcripcionales del control de la expresión génica de los miARNs.

MicroRNAs (miRNAs) are a group of small non coding RNAs involved in the control of gene expression through the degradation of mRNAs in a sequence specific manner. miRNAs expression is dependent on RNA polymerase II as most of the coding protein genes. The regulation of miRNAs expression is under the coordinated and combinatorial control of transcription factors (TFs). A bionformatic approach was carried out to identify transcription factor binding sites (TFBS) in the promoter of miRNAs genes in 17 different plant species and the possible involvement of TF in antibacterial response was analyzed. In nine of the plants studied significant differences in TFBS distribution in the promoter of miRNAs were observed when compare to the promoter of protein coding genes. TFBS as CCA1, T-box y SORLREP3 were present on the promoters of the cassava miRNAs induced in response to the infection by the bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. These TFBS are also present in the promoter of genes coding for proteins involved in circadian rhythm and light responses, suggesting a crosstalk between these process and immune plant responses. Taken together, the results here described give insight about the transcriptional mechanisms involved in the expression of miRNAs.

Detection and Quantification of Spongospora subterranea f. sp. subterranea in Bait Plants and Potato Fields in Colombia using qPCR

La sarna polvosa de la papa (Solanum tuberosum, S. phureja) causada por Spongospora f. sp. subterranea (Sss), es una de las enfermedades más limitantes de este cultivo. En Colombia, se han empleado diferentes métodos de detección asintomática de Sss, incluyendo bioensayos con plantas señuelo, PCR de ITS y pruebas de ELISA. Sin embargo, sus niveles de sensibilidad son bajos o requieren tiempos extensos. Una alternativa para complementar dichas herramientas es la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR). En este trabajo se evaluó dicha técnica utilizando los juegos de cebadores SsTQF1-SsTQR1; Spon421F-Spon494R y SscolF-SscolR (diseñados en este estudio), bajo la metodología de SYBR Green®; mientras que con Taqman® se evaluaron los cebadores SponFSponR y la sonda SponP. Una vez determinada la funcionalidad de los cebadores, se descartó por inespecificidad, el par Spon421F-Spon494R ; para los restantes se realizaron curvas estándar basadas en diluciones seriadas de quistosoros. Las pruebas de qPCR detectaron a Sss en las 20 muestras evaluadas de plantas señuelo de Nicotiana benthamiana y papa, utilizando los cebadores SsTQF1-SsTQR1 (Ct: 10,57-29,34) y SscolF-SscolR (Ct: 14,39-34,08); mientras que 19 de las muestras fueron positivas con SponF-SponR-SponP (Ct: 15,63-38,93). A partir de 20 muestras de raíces de papa de cultivos de La Unión (Antioquia, Colombia), fue posible detectar el patógeno en 17 de ellas con SscolF-SscolR, estimándose una concentración de 6470 a 1,39 x 10(10) quistorosos/mL. Estos resultados indican la ocurrencia de altos niveles de inóculo de Sss en esta región y enfatizan en la necesidad de fortalecer los programas de certificación de tubérculo-semilla en Colombia.

In recent years, potato crops (Solanum tuberosum, S. phureja) have been seriously affected by powdery scab; a disease caused by Spongospora subterranea f.sp. subterranea (Sss). In Colombia, asymptomatic detection of Sss has been achieved with bait plants, PCR of ITS regions and ELISA tests. Unfortunately, these techniques have low sensitivity and may require long processing times. In this work, Quantitative real time PCR (qPCR) was tested for detection of Sss using different sets of primers. Primers SsTQF1-SsTQR1, Spon421F-Spon494R and SscolF-SscolR (designed in this study), were tested using SYBR Green®, while primers SponFSponR were tested using the Taqman® probe SponP. Primers Spon421F-Spon494R were discarded due to lack of specificity. Standard curves were obtained from serial dilutions of cystosori. The 20 N. benthamiana and potato bait plants evaluated tested positive for Sss using primers SsTQF1-SsTQR1 (Ct: 10.57-29.34) and SscolF-SscolR (Ct: 14.39-34.08) and 19 samples were positive with primers SponF-SponR-SponP, with Ct values ranging between 15,63 and 38,93. Sss was detected in 17 out of 20 root samples from potato crops in La Unión (Antioquia) using primers SscolF-SscolR, with an estimated concentration of 6470 to 1,39x10(10) cystosori/ mL. These results suggest high levels of Sss in the potato fields from this region and recall the importance of strengthening seed-certification programs in Colombia.

Interaction Between Two Predator Mites of Tetranychus urticae Koch (Acariformes: Tetranychidae) in Laboratory

Tetranychus urticae (Acari: Tetranychidae) es una de las principales plagas de cultivos ornamentales, entre las especies más utilizadas para su control se encuentran Neoseiulus californicus y Phytoseiulus persimilis (Parasitiformes: Phytoseiidae). En el presente trabajo se propone el manejo de la plaga mediante el empleo de liberaciones simultáneas de los dos fitoseidos. Se evaluaron varias situaciones, por un lado se estudiaron las interacciones cuando un depredador se encuentra en una densidad baja mientras que el otro depredador se presenta en alta densidad (esta situación se analizó tanto en presencia como en ausencia de la presa). Por otro lado, se evaluaron las interacciones cuando los P. persimilis y N. californicus dos están presentes en igual densidad y en presencia de T. urticae. Cuando uno de los depredadores está en mayor densidad y hay presencia de la presa, se observa que al incrementar la edad del depredador que tiene menor densidad, aumenta también la interferencia en el consumo de presas por parte de los depredadores que están en mayor densidad. Además cuando disminuye el consumo de T. urticae se incrementa el consumo intraguilda. Phytoseiulus persimilis en ausencia de T. urticae y en presencia de N. californicus adopta un comportamiento de depredación intraguilda sobre todos los estados de desarrollo de su conespecifico, mientras que N. californicus únicamente consume larvas de conespecíficos en ausencia del fitófago y en presencia de P. persimilis. Cuando se encontraban los dos depredadores en el mismo montaje y la misma densidad de población, no se observó un mayor consumo de T. urticae que cuando cada depredador es empleado por separado.

Tetranychus urticae (Acari: Tetranychidae) is an important pest of ornamental crops. A species of predatory mite used for its control is Neoseiulus californicus and Phytoseiulus persimilis (Acari: Phytoseiidae). This research proposes the use of joint releases of the two cited predators for the control of the pest. Several situations leading to interaction were evaluated: High density of one predator and low density of the other one, being the prey present or absent. The scenario with predators in equal densities and in presence of the prey was also evaluated. When a predator is in higher density and the prey present, the predator with the lower density increases the interference with the comsumption of preys by the predator with higher density. On the other hand, when the comsumption of T. urticae reduces, intraguild predation increases. P. persimilis shows intraguild predation behaviour when T. urticae is absent and N. californicus is present, consuming all developmental stages of its conspecific. Instead, N. californicus only feed on conspecific larvae, when the fitofagous was absent and P. persimilis was present. When the two predators were present in the same assemblage and with the same population density, the quantity of T. urticae consumed by both of them was not higher than the consumed one when each predator was present in separate way.

Modeling the Trophic State of Wetland Jaboque, Bogotá D. C., Colombia

Se construyó un modelo de simulación dinámica con la intención de explicar el comportamiento del fósforo total en el agua y su relación con el estado trófico del humedal de Jaboque, Bogotá D. C., Colombia. En el modelo se incluyen los flujos de entrada y salida del agua y los aportes de fósforo total en cada una de las tres secciones de la cubeta con características morfométricas y condiciones físicas y químicas del agua muy diferentes. La modelación dinámica se basó en ecuaciones diferenciales y para ella se utilizó el programa computacional Stella 9.1®. En los meses con mayores caudales (época de lluvias), la carga de fósforo disminuye en las tres secciones del humedal, mientras que en los meses con menores caudales (época de sequía), la misma se incrementa. En la sección uno (tercio alto) el valor del índice de estado trófico fue de 45,09 mg/m³ y el tiempo de retención hidráulica de 14 días/año. En la segunda sección (tercio medio) el valor del mencionado índice fue de 35,89 mg/m³ y el THR fue de 34 días/año. Finalmente, en la tercera sección (tercio bajo) los valores fueron 19,5 mg/m³ y 40 días/año respectivamente. Estos valores indican que la primera y segunda sección se encuentran en condiciones de eutrofía y la tercera de mesotrofía. El análisis de sensibilidad permitió estimar que con una carga de 0,62 mg/m³ de fósforo total se podrían mantener las condiciones de mesotrofía en la tercera sección y que para las dos primeras secciones se debería reducir la carga hasta 0,2 mg/m³, para alcanzar un estado de mesotrofía.

A dynamic simulation model to explain the behavior of the total phosphorus in water and its relationship to the trophy status of wetland Jaboque, Bogotá D. C., Colombia, in three sections with particular physical and chemical characteristics is presented. The model includes the inflow and outflow flows of water and total phosphorus contributions in each of the three sections of the wetland with morphometric and water physicochemical conditions very different. The dynamic modelling was based on differential equations; we used the computer program Stella 9.1®. In the months with higher flow (rainy season), the phosphorus load decreases in the three sections of the wetland, while in the months with lower flow (dry season) increases. In section one (third highest) trophy state index was 45.09 mg/m³ and hydraulic retention time of 14 days/year in the second section (middle third) trophy state index was 35.89 mg/m³ and the THR was 34 days/year. In the third section (lower third) values were 5.19 mg/m³ and 40 days/year respectively. These values indicate that the first and second sections are able to eutrophic state and third to mesotrophic. Sensitivity analysis allowed estimating that with a load of 0.62 mg/m³ total phosphorus could be maintained mesotrophic conditions in the third section and for the first two sections should be reduced to 0.2 mg/m³ load to achieve a mesotrophic state.

Describing Species: A Standpoint of Colombian Biodiversity in the Global Setting

La descripción formal de especies ha sido el método básico, durante 250 años, para documentar la biodiversidad del planeta. El análisis de los patrones de la descripción de especies permite identificar tendencias y vacios del conocimiento taxonómico. Aquí, presento un análisis de las especies nuevas descritas para Colombia durante 20002009. Los datos los obtuve mediante una búsqueda en una base de datos bibliográfica de acuerdo a ciertas palabras y seguida por una clasificación de cada registro donde se describió una especie nueva para Colombia. Mis resultados los comparo con la información existente para el planeta. Durante la década del 2000 se describieron 1272 especies nuevas para Colombia que corresponden al 0,72 % de las especies nuevas del planeta. Algunos taxones tales como Ascomycota y Proteobacteria estuvieron pobremente representados para Colombia mostrando menos del 0,14 % de las especies descritas en esos grupos para el planeta. Por su parte las plantas y los vertebrados descritos como nuevos para el país representan entre el 1,2 y el 10 % de las especies nuevas de esos grupos. Dado que Colombia es un país megadiverso el descubrimiento y la descripción de las especies desconocidas en su territorio tendrá un gran efecto en el conocimiento de la biodiversidad global, no obstante, es necesario aumentar el apoyo a la investigación taxonómica e intensificar el trabajo en ciertos taxones (e.g., Insecta).

The formal description of new species has been the basic method, during 250 years, of documenting the Planet's biodiversity. Analysis of species description patterns identifies trends and gaps in taxonomic knowledge. Here, I present an analysis of Colombian new species described during 20002009. I constructed a dataset by bibliographic database searching with specific key words, and then classified each record where a new species was described for Colombia. I compared my results against information for the entire Planet. During the years 2000-2009, 1272 new species where described for Colombia, which represents 0.72 % of the new species for the Planet. Some taxa as Ascomycota and Proteobacteria where poorly represented for Colombia representing less than 0.14 % of the new species for those taxa in the planet; while new plant and vertebrate species described for the country comprised between 1.2 and 10 % of the new species in these groups. Because Colombia is a megadiverse country, the discovery and description of its unknown species would have a great effect at the global biodiversity knowledge. However, it is necessary more support for taxonomic research and strengthening the taxonomic work in some groups (e.g., Insecta).

POPULATION GENETICS OF Atta sexdens rubropilosa (HYMENOPTERA: FORMICIDAE)

The genetic variability of Atta sexdens rubropilosa leaf-cutting ants collected from five brazilian localities was evaluated with PCR-RAPD technique. We used 15 primers producing 148 fragments of which 123 (83.11 %) contained polymorphisms. The estimated Shannon index was 0.3836 ± 0.2335 showing that these ants possess high genetic diversity. The G ST value was 0.2372 and ΦPT = 0.184, indicating that the analyzed populations are moderately differentiated and 82 % of the variation obtained occur within populations. Although Mantel's test had shown correlation between genetic distances and geographic was observed that Ivatuba and Itambé (33.8 km) have the small geographical distance and the largest genetic distance. The lower genetic distance was estimated for Maringá and Ivatuba but this localities have a small geographic distance (42.3 km), indicating that there are no barriers for mating among reproducers in these populations. The high degree of polymorphism (83.11 %) and the ability to cross among the populations in the studied regions indicate that this species of leaf-cutting ant is well adapted to the region; therefore, integrated control programs can be developed.

La variabilidad genética de las hormigas Atta sexdens rubropilosa colectadas en cinco lugares distintos de Brasil fueron evaluados por la técnica PCR-RAPD. Un total de 15 primers produjeron 148 fragmentos, de los cuales 123 fueron polimórficos, lo que corresponden al 83,11 %. La estimación de la diversidad genética por el índice de Shannon fue 0,3836 y el desviación estándar fue de ± 0,2335. Estos valores demuestran una alta diversidad genética. El valor de G ST fue 0,2372 y ΦPT = 0,184 lo que indica que las poblaciones están moderadamente diferenciadas y que el 82 % de la variación obtenida se produce dentro de las poblaciones. Aunque la prueba de Mantel ha demostrado una correlación entre la distancia genética y geográfica se observó que Ivatuba e Itambé (33,8 km) tiene una pequeña distancia geográfica y la mayor distancia genética. La distancia inferior genética fue estimada para Maringá e Ivatuba pero estas localidades cuentan con una distancia geográfica pequeña (42,3 km), lo que indica que no hay barreras para el apareamiento entre los reproductores en estas poblaciones. El alto valor de polimorfismo (83,11 %) y la capacidad de emparejamiento entre las poblaciones presentes en las regiones estudiadas, indican que esta especie de hormiga cortadora está bien adaptada a la región, y deben ser desarrollados programas integrados de control si se convierten en plagas.

Records of New or Poorly Known Migratory Birds from Laguna del Otún, los Nevados National Natural Park, Risaralda, Colombia

Colombia es un sitio importante para las aves migratorias. Sin embargo, aún falta mucho conocimiento de dónde estas se encuentran durante su paso o permanencia por el país y cuáles utilizan los páramos. Registramos nuevas especies de aves migratorias para la laguna del Otún, inmersa en un complejo de humedales declarados sitio Ramsar desde el 2008. La laguna está localizada en el Parque Nacional Natural Los Nevados a 3932 msnm, en ecosistema de páramo, en la Cordillera Central de los Andes de Colombia. Durante cinco salidas entre 2010 y 2012 se registraron cuatro nuevas especies de aves migratorias para el parque: Anas acuta, Pandion haliaetus, Riparia riparia y Dendroica petechia. Adicionalmente, se registró una ampliación del rango altitudinal para dos especies migratorias que solo habían sido registradas en la región a menos de 3500 msnm: Tringa flavipes e Hirundo rustica. Estas observaciones sugieren que dichas especies podrían tolerar condiciones de alta montaña y utilizar el páramo. Es necesario estudiar a fondo las dinámicas migratorias y el uso de hábitat de alta montaña por las aves migratorias.

Five Bird Species Poorly Known for Norte de Santander, Colombia

Registramos cinco especies de aves poco conocidas para la región con base en observaciones realizadas en el área urbana de Cúcuta (departamento de Norte de Santander, Colombia). Dos de ellas son migratorias neárticas/neotropicales (Coccyzus americanus y Protonotaria citrea). Aunque cuatro especies ya habían sido recolectadas en Cúcuta, han pasado inadvertidas para esta región. Uno de los registros corresponde a la ampliación hacia el norte del área de distribución geográfica conocida para Paroaria nigrogenis.

We report five bird species poorly known for Norte de Santander based on observations in the urban area of the city of Cúcuta (department of Norte de Santander, Colombia). Two are nearctic/neotropical migratory birds (Coccyzus americanus and Protonotaria citrea). Although four species had been collected before in Cúcuta, their report has remained unnoticed. We record the geographical range extension for Paroaria nigrogenis to the north of its currently known distribution.

Boxjellyfish (Cnidaria: Cubozoa) from the Caribbean Colombian Waters

Las especies de cubomedusas del Caribe colombiano son aún muy poco conocidas, es por esta razón que se realizaron muestreos exploratorios en la región de Santa Marta, Colombia, durante el periodo comprendido entre febrero y octubre de 2009, para determinar que especies se encuentran en la región. Se colectaron e identificaron un total de cinco ejemplares de cubomedusas pertenecientes a la clase Cubozoa, tres del género Chiropsalmus (familia Chirodropida) y dos del género Alatina (familia Alatinidae), ambos especímenes constituyen el primer registro de cubomedusas para el Caribe colombiano.

Box-jellyfishes of the Colombian Caribbean are still poorly known, it is for this reason that exploratory sampling was done in the region of Santa Marta, Colombia, during the period between February and October 2009, to determine which species are in this region. Were collected and identified a total of five samples of box-jellyfishes to the Cubozoa class, three samples of Chiropsalmus genera (Chirodropida family) and two samples of Alatina (Alatinidae family), both specimens are the first record of boxjellyfishes from the Colombian Caribbean.

DETECTION OF INFECTION WITH Toxoplasma gondii IN MANATEES (Trichechus inunguis) OF THE PERUVIAN AMAZON

The Amazonian manatee (Trichechus inunguis) is an aquatic mammal that inhabits freshwater environments and is endemic to the Amazon Basin. The presence of Toxoplasma gondii antibodies was investigated in 19 manatees in one rescue unit in the northern region of Peru. Antibodies to T. gondii were detected in 12 (63.2 %) of 19 animals by using the modified agglutination test (titer, 1:25), and no association between sex and age of the animals and the presence of T. gondii antibodies was observed (p < 0.05). The results suggest a contamination by T. gondii oocysts in the aquatic environment where these animals live.

El manatí amazónico (Trichechus inunguis) es un mamífero acuático que habita en ambientes de agua dulce y es endémico de la cuenca del Amazonas. La presencia de Toxoplasma gondii se investigó en 19 manatíes, en una unidad de rescate en la región norte del Perú. Los anticuerpos contra T. gondii fueron detectados en 12 (63,2 %), de 19 animales mediante el uso de la prueba de aglutinación modificada (título, 1:25). No fue observada asociación entre el sexo y edad de los animales con la presencia de anticuerpos de T. gondii (p < 0,05). Los resultados sugieren la contaminación por ooquistes de T. gondii en el medio acuático donde viven estos animales.