Acta Biológica Colombiana

NUTRIENT MANAGEMENT PRACTICES FOR ENHANCING SOYBEAN (Glycine max L.) PRODUCTION

Soybean (Glycine max L.), is the most important pulse crop in the world. Soybean is a very energy-rich grain legume containing 40 percent protein and 19 percent oil in the seeds. The magnitude of soybean yield losses due to nutrient deficiency also varies among the nutrients. Deficiencies of N, P, Fe, B and S nutrients may cause yield losses up to 10 %, 29-45 %, 22-90 %, 100 % and 16-30 %, respectively, in soybean depending on soil fertility, climate and plant factors. Soil salinity is one of the major limiting factors of soybean production in semiarid regions, and chloride salinity has a more depressive effect on yield than sulphate salinity. The goal of nutrient management is to maximize soybean productivity while minimizing environmental consequences. Balanced and timely nutrient management practices applied for soybean contributes to sustainable growth of yield and quality, influences plant health and reduces environmental risks. Balanced nutrition with mineral fertilizers can assist in integrated pest management to reduce damage from infestations of pests and diseases and save inputs required to control them. Balanced fertilization generates higher profits for the farmers, not necessarily through reduced inputs. The role of education and extension in delivering the up-to-date knowledge on nutrient management is crucial, challenging, and continuous.

La soya (Glycine max L.), es el cultivo de legumbres más importante en el mundo. La magnitud de las pérdidas en el rendimiento de la soya debido a deficiencias varía dependiendo de los nutrientes. Las deficiencias de N, P, Fe, B y S pueden causar pérdidas en rendimiento de hasta 10 %, 29-45 %, 22-90 %, 100 % y 16-30 %, respectivamente, en la soya dependiendo de la fertilidad del suelo, clima y factores intrínsecos a las plantas. La textura de los suelos utilizados en el cultivo de soya varía entre arenosa y arcillosa. La salinidad del suelo es uno de los mayores factores limitantes en la producción del cultivo en regiones semiáridas, y la salinidad por cloro tiene un mayor efecto en la disminución del rendimiento que la salinidad por sulfatos. Los granos de soya son una gran fuente de energía que contienen 40 % de proteína y 19 % de aceite. El éxito del manejo de nutrientes es maximizar la productividad del cultivo mientras se minimizan los impactos ambientales. Las prácticas de manejo de nutrientes balanceadas y reguladas en el tiempo contribuyen a un crecimiento sostenido del rendimiento y la calidad, influencian la salud de las plantas y reducen los riesgos ambientales. Una nutrición balanceada con fertilizantes minerales puede ayudar en el manejo integrado de plagas para reducir los daños causados por las infestaciones de pestes y enfermedades y reducir los insumos requeridos para su control. Una fertilización balanceada genera mayores ganancias para los agricultores, no necesariamente por reducción de los insumos. El papel de la educación y la extensión en la difusión del conocimiento actual sobre manejo de nutrientes es crucial, desafiante y continuo.

Biodegradation Waste of the Stations Service by Rhodococcus erythropolis ohp-al-gp

La cepa Rhodococcus erythropolis ohp-al-gp fue aislada de un suelo contaminado con aceite de turbinas de la zona norte de la provincia de San Cruz, Argentina. Dado su potencial en la bioremediación, el objetivo del trabajo fue conocer las habilidades para la degradación de compuestos puros y mezclas de hidrocarburos, como también degradación en presencia y ausencia de nitrógeno de gasoil medido por cromatografía gaseosa. La cepa posee la capacidad de utilización de los siguientes hidrocarburos: gasoil, kerosene, aceite lubricante, pristano, hexano, heptano, octano, pentadecano y hexadecano. La cepa R. erythropolis ohp-al- gp presenta un excelente potencial de biorremediación de hidrocarburos conflictivos como son los aceites lubricantes, su posible empleo en la eliminación de barros provenientes de lavados de motores o de estaciones de servicio sería su aplicación más importante. La velocidad de degradación, en condiciones óptimas de cultivo, le confiere una ventaja adicional. Además, posee una degradación baja en ausencia de nitrógeno, factor limitante y frecuente en los suelos patagónicos.

The strain Rhodococcus erythropolis ohp-al-gp was isolated from turbine oil contaminated soil from northern San Cruz province, Argentina. Because of its potential in bioremediation, the aim was to know the abilities for degradation of pure compounds and mixtures of hydrocarbons, as well as degradation in the presence and absence of diesel nitrogen measured by gas chromatography. The strain possesses the ability to use diesel, kerosene, lubricating oil, pristane, hexane, heptane, octane, pentadecane and hexadecane. R. erythropolis ohp-al-gp has excellent potential for bioremediation of hydrocarbons, which are conflictives as lubricating oils, their potential use in removing mud from washing engines or gas stations would be its most important application. The degradation rate in optimal culture conditions, gives it an additional advantage. It also has a low degradation in the absence of nitrogen, a frequent limiting factor in Patagonian soils.

SEARCHING AND PARASITISM OF Diatraea saccharalis (LEPIDOPTERA: CRAMBIDAE) BY Trichospilus diatraeae (HYMENOPTERA: EULOPHIDAE)

The ability of Trichospilus diatraeae Cherian and Margabandhu, 1942 (Hymenoptera: Eulophidae) to search and parasitize Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae) pupae in sugarcane stalks was evaluated. To analyze the ability for search and parasitism were used stalks of sugarcane (20 cm) where it was introduced a pupa of D. saccharalis (T1); a pupa and a caterpillar (T2) or a pupa and fecal matter (T3). Each stalk was placed in a transparent plastic bottle with 21 females of T. diatraeae. These pupae were isolated, after 72 h, in glass tubes at 25 ± 2 °C, 70 ± 10 % relative humidity, 14:10 light/dark. The experiment was developed in an entirely casualized design with three treatments and 12 repetitions. Percentage of D. saccharalis pupa parasitized by T. diatraeae was 50.00 %, 83.33 % and 16.66 % in the T1, T2 and T3, respectively (X² = 3.896, p= 0.04). The presence of D. saccharalis caterpillars favored searching and parasitism of this host.

La capacidad de Trichospilus diatraeae Cherian e Margabandhu, 1942 (Hymenoptera: Eulophidae) para buscar y parasitar las pupas de Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae) en los tallos de la caña de azúcar fue estudiada. Para analizar la habilidad de búsqueda y parasitismo fueron utilizados tallos de la caña de azúcar (20 cm) donde se introdujo una pupa de D. saccharalis (T1); pupas y orugas (T2) o pupa y residuos fecales (T3). Cada tallo fue colocado en una botella plástica transparente con 21 hembras de T. diatraeae. Esas pupas fueron individualizadas, luego de 72 h, en tubos de vidrio a 25 ± 1°C, 70 ± 10 % UR y 14 h de foto período. El experimento se desarrolló en un diseño completamente al azar, con tres tratamientos y 12 repeticiones. Los porcentajes de pupas de D. saccharalis parasitados por T. diatraeae fueron del 50,00 %, 83,33 % y 16,66 % en el T1, T2 y T3, respectivamente (X² = 3.896, p = 0,04). La presencia de D. saccharalis en los tallos de caña de azúcar favorecieron la búsqueda y parasitismo de su hospedero.

A capacidade de Trichospilus diatraeae Cherian e Margabandhu, 1942 (Hymenoptera: Eulophidae) para procurar e parasitar pupas de Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae) em colmos de cana-de-açúcar foi avaliada. Para analisar a capacidade de busca e parasitismo foram usados colmos de cana-de-açúcar (20 cm), onde foi introduzida uma pupa de D. saccharalis (T1); uma pupa e uma lagarta (T2) or uma pupa e resíduo fecal (T3). Cada colmo foi colocado em uma garrafa plástica transparente com 21 fêmeas de T. diatraeae. Essas pupas foram retiradas dos colmos após 72 h, e colocadas em tubos de vidro a 25 ± 2 ° C, 70 ± 10 % de umidade relativa e fotofase de 14 h. O experimento foi desenvolvido em delineamento inteiramente casualizado, com três tratamentos e 12 repetições. A porcentagem de pupas de D. saccharalis parasitadas por T. diatraeae foi de 50,00 %, 83,33 % e 16,66 % em T1, T2 e T3, respectivamente (X²= 3,896, p = 0,04). A presença de lagartas de D. saccharalis favoreceu a busca e parasitismo deste hospedeiro.

Compatibility of Encarsia formosa (Hymenoptera: Aphelinidae) with Commercial Products Under Laboratory Conditions

La mosca blanca de los invernaderos, Trialeurodes vaporariorum, es una de las principales plagas de cultivos de tomate bajo invernadero y es controlada principalmente con insecticidas químicos. Sin embargo, existen estrategias alternativas de control como hongos entomopatógenos (Beauveria bassiana) y enemigos naturales como parasitoides (Encarsia formosa). En el presente estudio se evaluó la compatibilidad de productos comerciales con adultos y pupas de E. formosa bajo condiciones de laboratorio. Se evaluaron ocho tratamientos para pupas y adultos del parasitoide, incluyendo dos concentraciones del hongo entomopatógeno Beauveria bassiana (5 x 10(7) y 5 x 10(9) conidios/ml), dosis comerciales de cuatro productos comúnmente usados para el control de plagas en cultivos de tomate y dos controles. Estos tratamientos fueron aplicados directamente sobre los parasitoides y se registraron a diario mortalidades de pupas y adultos. No se presentaron diferencias significativas entre el control relativo con el producto con ingrediente activo Bacillus thuringiensis (p > 0,05), indicando que este es compatible con pupas del parasitoide bajo condiciones de laboratorio. Finalmente, se encontró que los productos con ingredientes activos de Tiocyclam hidrogenoxalato y B. thuringiensis son incompatibles con adultos de E. formosa bajo condiciones de laboratorio.

The greenhouse white fly, Trialeurodes vaporariorum one of the major pests of tomatoes under greenhouse conditions, but, It s mainly controlled with chemical insecticides. However, there are alternative control strategies as entomopathogens fungi and parasitoids (Encarsia formosa). In this study we evaluated the compatibility of commercial product with adults and pupae of E. formosa under laboratory conditions. Eight treatments were evaluated for adults and pupae of the parasitoid, including two concentrations of the entomopathogenic fungus Beauveria bassiana (5 x 10(7) and 5 x 10(9) conidia/ml), commercial doses of four chemical products commonly used to control pests on tomato crops and two controls. These treatments were applied directly on parasitoids, and their mortality rate on adults and pupae were recorded daily. There was no difference in E. formosa pupae among relative with the Bacillus thuringiensis products (p > 0.05), indicating that it s compatible with the parasitoid pupae under laboratory conditions. Finally, it was found that products with active ingredients of Tiocyclam hidrogenoxalato and B. thuringiensis are incompatibles with E. formosa adults under laboratory conditions.

Lethal and Sublethal Effects of Glyphosate (Roundup® Active) to Embryos of Colombian Anurans

El glifosato es un herbicida usado en la agricultura que puede afectar especies no blanco. El objetivo del trabajo fue determinar los efectos letales (concentración letal media - CL50) y subletales (cambios en el tamaño corporal y desarrollo) del glifosato (Roundup® Activo) sobre embriones de cuatro especies de anuros expuestos durante 96 horas en pruebas de laboratorio y microcosmos. En laboratorio, la especie más tolerante fue Engystomops pustulosus (CL50 = 3033,18 µg a.e./L) y la más sensible Rhinella marina (CL50 = 1421,46 µg a.e./L), la cual mostró una reducción significativa en el tamaño corporal y retrasos en el desarrollo de los individuos. Las demás especies tuvieron un CL50 intermedio (Rhinella humboldti = 2899,36 µga.e./L; Hypsiboas crepitans = 2151,88 µg a.e./L). En todos los casos el CL50 fue menor a la concentración empleada en campo (5392,92 µg a.e./ L) indicando un efecto tóxico alto. En los microcosmos, los embriones de E. pustulosus fueron los más tolerantes (CL50 = 19,41 kg a.e./ha), mientras que los de R. humboldti los más sensibles (CL50 = 10,61 kg a.e./ha). Sin embargo, todas las especies tuvieron un CL50 superiora la concentración asperjada en campo (3,69 kg a.e./ ha), mostrando un efecto tóxico leve, y no hubo diferencias en el tamaño corporalni en el desarrollo de los individuos. Este resultado muestra que el glifosato, en su presentación comercial como Roundup® Activo, genera una mortalidad moderada en los embriones de anuros.

Glyphosate is an herbicide widely used in agriculture, which may affect non-target species. The aim of this study was to determine the lethal (Median lethal concentration - LC50) and sublethal effects (changes on body size and development) of glyphosate (Roundup® Active) to embryos of four anuran species, exposed during 96 hours under laboratory and microcosmtests. Under laboratory conditions, Engystomops pustulosus was the most tolerant species (LC50 = 3033,18 µg a.e./L) and Rhinella marina was the most sensitive (LC50 = 1421,46 µg a.e./L), which also showed a delayed development and significantly reduced body size. The other species had an intermediate LC50 (Rhinella humboldti = 2899,54 µg a.e./L; Hypsiboas crepitans = 2151,88 µg a.e./L). In all cases, the laboratory LC50 was lower than the concentration used in field (5392,92 µg a.e./L), indicating a high toxic effect. In the microcosm tests, embryos of E. pustulosus were the most tolerant (LC50 = 19,41 kg a.e./ha), while R. humboldti were the most sensitive (LC50 = 10,61 kg a.e./ha). In this case, all four study species had a higher LC50 than the concentration sprayed in field (3,69 kg a.e./ ha), so a lower lethal effect, and there were no significant differences in body size and development. This result shows that the glyphosate, as the commercial presentation Roundup® Active, produce a moderate mortality on anuran embryos.

Macroinvertebrate Trophic Groups in an Andean Wetland of Colombia

En el humedal Jaboque (Bogotá, Colombia) se analizaron las condiciones físicas y químicas del agua y se estudió la comunidad de macroinvertebrados acuáticos por grupos dietarios entre abril de 2009 y enero de 2010. Las aguas del humedal presentaron un carácter ligeramente ácido con valores altos de nitratos, nitrógeno amoniacal y fósforo, por lo que este ecosistema se clasifica como eutrófico a hipereutrófico. La comunidad de macroinvertebrados acuáticos registró seis grupos alimenticios, los cuales estuvieron formados por 27 familias, 26 géneros confirmados y nueve géneros aún por confirmar, con un total de 6403 individuos recolectados en 28 muestras de macrófitas. La mayor abundancia correspondió a detritívoros (43,5 %), colectores-raspadores (31,5 %) y colectores-fragmentadores (14,1 %), los cuales fueron más abundantes en los meses de menor precipitación. Los contenidos estomacales de algunos de los organismos evidenciaron que la mayoría de estos individuos consumieron más de un tipo de alimento, además de altas cantidades de materia orgánica. El análisis de correspondencia linealizado (ACL) mostró una organización espacial (estaciones) y temporal (épocas climáticas) en la que los gremios tróficos se agrupan de acuerdo a sus requerimientos de nicho, fluctuaciones ambientales o factores de intervención humana. Las variaciones en los grupos dietarios reflejaron cambios en la comunidad de macroinvertebrados desde una perspectiva funcional e indicaron que el humedal es un sistema muy alterado por las actividades urbanas.

In the wetland Jaboque (Bogotá, Colombia) the physical and chemical properties of the water and the food dietary guilds of the aquatic macroinvertebrate community were analyzed from April 2009 to January 2010. The wetland waters had a slightly acid character with high values of nitrate, ammonia and orthophosphate, so this ecosystem is classified as eutrophic to hypereutrophic. In the aquatic macroinvertebrate community six food groups were recorded; they were conformed by 27 families, 26 confirmed genera and nine to be confirmed, with a total of 6,403 individuals collected in 28 samples of macrophytes. The highest abundances corresponded to detritivores (43.5 %), collector-scrapers (31.5 %), and collector-shredders (14.1 %), which were more abundant in the months of low rainfall. Stomach contents of some of the organisms showed that most of these individuals consumed more than one food type and high amounts of organic matter. Detrended correspondence analysis (DCA) showed a spatial (stations) and temporal (climatic seasons) organization, in which trophic guilds are grouped according to their niche requirements, environmental fluctuations or anthropogenic factors. Variations in dietary groups reflected changes in the macroinvertebrate community from a functional perspective and indicated that the wetland is very disturbed by urban activities.

Molecular Identification of Microorganisms Associated to the Rhizosphere of Vanilla Plants in Colombia

El cultivo de vainilla es altamente promisorio en Colombia, pero se requiere mayor conocimiento de su manejo agronómico y de los microorganismos que crecen asociados a su rizosfera, de los cuales depende esta planta para su nutrición y crecimiento. En este trabajo se realizaron aislamientos de microorganismos de la rizosfera de plantas de vainilla en un cultivo piloto ubicado en el municipio de Sopetrán (Antioquia, Colombia). Los microorganismos se aislaron en medios selectivos de crecimiento para evaluar su capacidad para descomponer celulosa, proteínas, solubilizar fosfato inorgánico y orgánico (fitato) y fijar nitrógeno en forma asimbiótica. Una vez aislados y purificados, se obtuvieron un total de 109 aislamientos, de los cuales se seleccionaron 52 morfotipos para su identificación molecular por secuenciación de las regiones ITS y 16S del ADN ribosomal para hongos y bacterias, respectivamente. Se encontró una alta variedad de microorganismos en la rizosfera de plantas de vainilla, destacándose las bacterias Bacillus megaterium, Pseudomonas koreensis y Acinetobacter sp. y el hongo Plectosphaerella sp., por su potencial para ser utilizados como biofertilizantes destinados a mejorar la nutrición y el crecimiento de estas plantas.

The cultivation of vanilla (Vanilla planifolia) is highly promising in Colombia, but more research is needed on its agronomical management and beneficial microorganisms that grow associated to its rhizosphere, on which the plant depends for its nutrition and growth. This study involved the identification of microorganisms associated to the rhizosphere of vanilla plants in a crop located in Sopetrán, Colombia. The microbes were isolated in selective media for functional groups such as cellulolytic, proteolytic, inorganic and organic phosphate (phytate) solubilizers, and asymbiotic nitrogen fixing bacteria. After isolation and purification, 109 microbial isolates were obtained. DNA was extracted from 52 selected isolates for molecular identification based on ITS and 16S rDNA sequencing, for fungi and bacteria, respectively. The diversity of rhizosphere microorganisms found was significant. Bacteria such as Bacillus megaterium, Pseudomonas koreensis and Acinetobacter sp., and the fungus Plectosphaerella sp., may have a high potential to be used as biofertilizers to improve vanilla plant nutrition and growth.

MOLECULAR PHYLOGENY OF THE NERITIDAE (GASTROPODA: NERITIMORPHA) BASED ON THE MITOCHONDRIAL GENES CYTOCHROME OXIDASE I (COI) AND 16S RRNA

The family Neritidae has representatives in tropical and subtropical regions that occur in a variety of environments, and its known fossil record dates back to the late Cretaceous. However there have been few studies of molecular phylogeny in this family. We performed a phylogenetic reconstruction of the family Neritidae using the COI (722 bp) and the 16S rRNA (559 bp) regions of the mitochondrial genome. Neighbor-joining, maximum parsimony and Bayesian inference were performed. The best phylogenetic reconstruction was obtained using the COI region, and we consider it an appropriate marker for phylogenetic studies within the group. Consensus analysis (COI +16S rRNA) generally obtained the same tree topologies and confirmed that the genus Nerita is monophyletic. The consensus analysis using parsimony recovered a monophyletic group consisting of the genera Neritina, Septaria, Theodoxus, Puperita, and Clithon, while in the Bayesian analyses Theodoxus is separated from the other genera. The phylogenetic status of the species from the genus Nerita from the Colombian Caribbean generated in this study was consistent with that reported for the genus in previous studies. In the resulting consensus tree obtained using maximum parsimony, we included information on habitat type for each species, to map the evolution by habitat. Species of the family Neritidae possibly have their origin in marine environments, which is consistent with conclusions from previous reports based on anatomical studies.

La familia Neritidae cuenta con representantes en regiones tropicales y subtropicales adaptadas a diferentes ambientes, con un registro fósil que data para finales del Cretáceo. Sin embargo no se han realizado estudios de filogenia molecular en la familia. En este estudio se realizó una reconstrucción filogenética de la familia Neritidae utilizando las regiones COI (722 pb) y 16S rRNA (559 pb) del genoma mitocondrial. Se realizaron análisis de distancias de Neighbor-Joining, Máxima Parsimonia e Inferencia Bayesiana. La mejor reconstrucción filogenética fue mediante la región COI, considerándola un marcador apropiado para realizar estudios filogenéticos dentro del grupo. El consenso de las relaciones filogenéticas (COI+16S rRNA) permitió confirmar que el género Nerita es monofilético. El consenso del análisis de parsimonia reveló un grupo monofilético formado por los géneros Neritina, Septaria, Theodoxus, Puperita y Clithon, mientras que en el análisis bayesiano Theodoxus se encuentra separado de los otros géneros. El resultado en las especies del género Nerita del Caribe colombiano fue consistente con lo reportado para el género en estudios previos. En el árbol resultante del análisis de parsimonia se sobrepuso la información del hábitat de cada especie, para mapear la evolución por hábitat. Se obtuvo como resultado que las especies de la familia Neritidae posiblemente tengan su origen en un ambiente marino, siendo congruente con lo reportado en estudios anatómicos realizados anteriormente.

Seasonal Shift of Bycatch in the Artisanal Shrimp Trawl Fishery of the Gulf of Salamanca, Caribbean Sea of Colombia

La evaluación de la fauna acompañante en las pesquerías de arrastre se ha referido generalmente a una escala anual, ignorando eventuales variaciones estacionales. En el golfo de Salamanca, recientemente opera una flota artesanal de arrastre de camarón, cuya fauna acompañante es evaluada por primera vez en el presente estudio, considerando la estacionalidad climática y oceanográfica que domina la región (descargas continentales y surgencia). Para ello, 90 lances en la época de calmas o lluviosa (noviembre 2010) y 86 en la época de vientos (abril 2011) fueron muestreados a bordo de embarcaciones pesqueras. La proporción fauna acompañante - camarón resultó ser 2,69 (2,37 - 3,21; IC 95 %) y 6,37 (5,10 - 8,24; IC 95 %) en la época de calmas y vientos, respectivamente. Un total de 101 taxa se registraron, con un elevado número de juveniles. La estructura comunitaria de la fauna acompañante difirió entre las épocas climáticas (Anosim, P < 0,001), siendo caracterizada en las dos épocas por Stellifer spp., Symphurus caribbeanus y Callinectes sapidus, en tanto que, adicionalmente, la época de calmas fue caracterizada por Cathorops mapale, Anchovia clupeoides, Trichiurus lepturus y la época de vientos por Larimus breviceps, Cnidaria (medusas), Cetengraulis edentulus (Simper). Los resultados evidenciaron un cambio estacional en la fauna acompañante, indicando la necesidad de implementar programas de monitoreo y medidas de manejo que atiendan a esa variabilidad temporal. Los efectos ecológicos negativos de esta pesquería urgen la utilización de estrategias de mitigación, concertadas con los pescadores, para balancear las necesidades sociales y la conservación del ecosistema.

Bycatch assessments in trawl fisheries have been mainly referred to an annual scale, ignoring possible seasonal variations. In the Gulf of Salamanca, an artisanal shrimp trawl fleet operates recently and this study evaluates its bycatch for first time, considering the climatic and oceanographic seasonality that dominates the region (runoff and upwelling). 90 hauls in the calm or rainy season (November 2010) and 86 in the windy season (April 2011) were sampled on board of fishing boats. The bycatch to shrimp ratio was 2,69 (2,37 -3,21, 95 % CI) and 6,37 (5,10 - 8,24, 95 % CI) for the calm season and windy season respectively. We recorded a total of 101 taxa, with a large number of juveniles. The community structure of bycatch differed between seasons (ANOSIM, p < 0,001), being characterized both seasons by Stellifer spp., Symphurus caribbeanus y Callinectes sapidus, whereas, in addition, the calm season was characterized by Cathorops mapale, Anchovia clupeoides, Trichiurus lepturus, and the windy season by Larimus breviceps, Cnidaria (jellyfish), Cetengraulis edentulus (Simper). The results showed a seasonal change in the bycatch, raising the need to implement monitoring programs and management measures that address that temporal variability. Negative ecological effects of this fishery prompt the use of mitigation strategies, involving fishermen, to balance social needs and the ecosystem conservation.

Taxocenosis of mollusks and crustaceans on roots of Rhizophora mangle (Rhizophoraceae) at Cispatá Bay, Córdoba, Colombia

A pesar del conocimiento existente sobre la ecología de los manglares en la bahía de Cispatá, pocos estudios han sido enfocados en la asociación de invertebrados en las raíces del mangle rojo, por lo que entre diciembre 2010 y septiembre 2011, se caracterizó la taxocenosis de moluscos y crustáceos en raíces de Rhizophora mangle en dos sectores de muestreo de la bahía de Cispatá, Colombia. Para la recolección del material biológico se tomaron al azar tres raíces de mangle homogéneas en cuanto al diámetro. Los moluscos y crustáceos fueron obtenidos de la raíz raspando la superficie con un cuchillo, luego fueron separados y fijados en formalina al 10 % para su posterior identificación hasta especie mediante claves taxonómicas especializadas. De los 12289 individuos recolectados en los cuatro muestreos, 10470 pertenecieron al phylum Mollusca (85,2 %) y los restantes 1819 al subphylum Crustacea (14,8 %). De moluscos se identificaron 14 especies distribuidas en 11 familias y dos clases; Bivalvia y Gastropoda. De crustáceos se identificaron 24 especies distribuidas en 16 familias y cuatro órdenes; Sessillia, Decapoda, Isopoda y Amphipoda. En los dos sectores de muestreo Mytella charruana, Balanus eburneus y Crassostrea rhizophorae fueron las especies más importantes en términos de abundancia, no obstante se sabe que moluscos como M. charruana y B. eburneus presentan una gran capacidad de adaptación y ajuste a las variaciones hidroclimáticas, lo que se reflejó en la dominancia de dichas especies en el sector con mayor influencia del río Sinú. La presencia de los crustáceos Petrolisthes armatus y Aratus pisonii en el sector con más cercanía al mar Caribe, indica que son especies de bosques de manglar con gran movilidad y mecanismos de adaptación fisiológicos.

Despite the existing knowledge on the ecology of mangroves at Cispatá Bay, few studies have focused on the association of invertebrates on red mangrove roots, so between December 2010 and September 2011, it was characterized taxocenosis of mollusks and crustaceans on roots of Rhizophora mangle in two study sites at Cispatá Bay, Colombia. For the collections of biological material were randomly taken three homogeneous mangrove roots in diameter. Mollusks and crustaceans were obtained from the root surface with a scraping knife then were removed and fixed in 10 % formalin for later identification to species using specialized taxonomic keys. Of the 12289 individuals collected in the four samples, 10470 belonged to the phylum Mollusca (85,2 %) and the remaining 1819 to subphylum Crustacea (14,8 %). For mollusks were identified 14 species distributed in 11 families and two classes; Bivalvia and Gastropoda. For crustaceans were identified 24 species distributed in 16 families and four orders; Sessillia, Decapoda, Isopoda and Amphipoda. In both sectors sampling Mytella charruana, Balanus eburneus and Crassostrea rhizophorae were the most important species in terms of abundance, however mollusks like M. charruana and B. eburneus have a great ability to adapt and adjust to changing hydroclimatic, which was reflected in the dominance of these species in the sector with the greatest influence Sinu River. The presence of crustaceans Petrolisthes armatus and Aratus pisonii in the sector with more proximity to the Caribbean Sea indicate that are species with great mobility and physiological adaptation mechanisms.

Mercury Bioaccumulation on Tadpoles of a Gold Mining Zone in Dagua River, Buenaventura, Valle del Cauca, Colombia

Los anfibios, particularmente en sus estados larvales, tienen una gran sensibilidad a la concentración de contaminantes; por lo que se han convertido en una herramienta indicadora para evaluar cómo las diferentes actividades humanas afectan los ecosistemas acuáticos. Debido a esto se utilizaron larvas de anuros como bioindicadores en la zona del medio Dagua, en el corregimiento de Zaragoza, donde la actividad minera ha liberado contaminantes al río Dagua (metales pesados principalmente). Utilizando la técnica de espectrofotometría por absorción atómica de vapor frío se midieron las concentraciones de mercurio total en renacuajos de cinco especies, junto con una muestra de sedimentos para cada muestra animal, como un referente ambiental. La evaluación se realizó en dos zonas con diferente grado de intervención y se reportan rangos de concentración de mercurio que van desde 0,07 hasta 0,24 µg/g y desde 0,07 hasta 0,17 µg/g para la zona de alto impacto y de impacto desconocido respectivamente. Pese a que las concentraciones encontradas no superan límites establecidos por las autoridades ambientales, es evidente que en la zona se desarrollan procesos de bioacumulación, porque las concentraciones en los organismos siempre fueron mayores a las del ambiente, de hecho, significativamente diferentes (M-W Utest, p = 0,001), por lo que se propone la implementación de programas de biomonitoreo y bioremediación en la zona, teniendo en cuenta que los renacuajos son principalmente consumidores de primer orden y al incorporarse en la cadena trófica las cargas contaminantes entrarían en procesos de biomagnificación.

Amphibians, particularly larval stages, are strongly sensitive to pollutants, so they have become useful indicators to assess how different human activities affect ecosystems. In this way, tadpoles were used as bioindicators in the Medio Dagua zone, in Zaragoza town, where mining has released pollutants into the Dagua River (mostly heavy metals). Using spectrophotometry by cold vapor atomic absorption, we measured total mercury concentrations in tadpoles of five species, with a sediment sample for each animal sample as an environment reference. The study was realized in two areas with different intervention levels, we report mercury concentration ranges from 0.07 to 0.24 µg/g for high impact zone and from 0.07 to 0.17µg/g for unknown impact zone, these levels do not exceed set limits used by local environmental authorities, however, is evident that bioaccumulation processes are developing in the area because organisms concentrations were always higher than those of the environment, in fact, significantly different (MW Utest, p = 0.001) therefore we propose the implementation of biomonitoring and bioremediation programs in the area, taking in consideration that tadpoles species used here, were mainly first order consumers, and when their mercury concentrations are incorporated into the food chain, these contaminant loads will produce biomagnification processes.

COMPARING THE POTENTIAL FOR IDENTIFICATION OF Lactobacillus spp. OF 16s RDNA VARIABLE REGIONS

El 16s rDNA es utilizado para la identificación bacteriana dada su tasa de variación entre especies. Algunas de las regiones variables de la subunidad ribosomal son más informativas que otras por lo cual en este estudio se evalúa el potencial de identificación aportado por cada región y combinaciones entre ellas. Se extrajeron las regiones variables V1 a la V8 del 16s rDNA de diferentes cepas y especies de Lactobacillus y se analizaron mediante los paquetes de STAP (ss-RNA Taxonomy Assigning Pipeline) y RDP (Ribosomal Database Project) multiclassifier. Adicionalmente se evaluaron árboles filogenéticos de máxima verosimilitud. Nuestros resultados muestran que la mayoría de regiones variables logran dar una correcta clasificación hasta género, sin embargo no son suficientes para clasificar hasta especie usando STAP. La región que presenta el mayor número de amplímeros es V5V6, sin embargo es la que presenta la mayor cantidad de falsos negativos. La que presenta el mayor número de verdaderos positivos es V1V3 (especie) para STAP y V5V8(género) para RDP. Las filogenias evaluadas mostraron que la topología de referencia se puede obtener con diferentes combinaciones de regiones variables e.g., V1V3 y V1V8. El estudio experimental de las cepas contenidas en un tampón comercial mostró que el amplicón V1V8 y el V1V3 dan una misma clasificación correcta. Proponemos la región V1V3 como la región mínima para clasificación correcta de Lactobacillus spp.. En conclusión, la región mínima para clasificar especies del género Lactobacillus es la V1V3, la cual es útil para estudios metagenómicos de muestras de probióticos.

16s rDNA is used for bacterial identification because its variation rate between species allows differentiation. The gene for this ribosomal subunit has 9 variable regions and some of them give more information than others. We were interested in evaluating the potential for species identification of each region and their combinations. We extracted the V1 to V8 regions of 16s rDNA from different strains and species of Lactobacillus and analyzed them using STAP (ss-RNA Taxonomy Assigning Pipeline) and RDP (Ribosomal Database Project) multiclassifier packages. Phylogenetic trees obtained by maximum likelihood analyses were compared. Classification results show that many regions give the correct genus classification using RDP and STAP, however they are not enough to classify up to the level of species. V5V6 region presents the highest quantity of informative fragments but also present the highest rate of false negatives. V1V3 region presents the highest rate of true positives (species) using STAP and the region V5V8 in RDP (genus).The phylogenetic result shows that the reference topology could be obtained using different combination of regions as V1V3 and V1V8.The experimental validation was done using commercial strains from a probiotic tampon. Sequencing analysis show that the V1V3 region gives the same information and result as the complete 16s rDNA; the three isolated strains correspond to the strains indicated in the product. We conclude that the V1V3 region is the minimum required region to classify Lactobacillus spp. in the correct way and this region is useful in metagenomics to analyze probiotics samples.

Effect of Agroforestry Residues Partially Biodegraded by Pleurotus Ostreatus (Pleurotaceae) on Tomato Seedlings Development

Se evaluó el desarrollo de plántulas de tomate (planta bioindicadora de toxicidad) en suelos con aserrín y cascarilla de arroz parcialmente biodegradados por Pleurotus Ostreatus bajo condiciones de invernadero. Se determinaron los componentes orgánicos (carbono, celulosa, lignina, extraíbles y materia orgánica) e inorgánicos (nitrógeno, fósforo y pH) antes y después de inocular el hongo en el aserrín y la cascarilla de arroz. Se realizaron mezclas de cada sustrato con un suelo pobre en nutrientes en proporciones iguales (1:1) y se les determinó el porcentaje de humedad. El experimento estuvo constituido por un diseño completamente aleatorio, con dos grupos de seis tratamientos para cada sustrato, a los 30 días se determinaron los parámetros de crecimiento y desarrollo de las plántulas. Los sustratos biodegradados reportaron bajo contenido de C, N y P. El tratamiento aserrín biodegradado + suelo fertilizado (ASB + SF), presentó los mejores resultados en número de hojas (12,9), altura de las plantas (25,94 cm), longitud radical (5,92 cm), peso seco (0,138 g) y peso fresco (1,012 g). El sustrato ASB + SF puede funcionar como sustrato favorable para el cultivo de plántulas de tomate debido a que aporta los nutrientes necesarios para el buen crecimiento de las plántulas. En la cascarilla de arroz las plantas no crecieron adecuadamente para conseguir ser trasplantadas.

It was evaluated the development of tomato seedlings (plant bioindicator of toxicity) in soils with sawdust and rice husk partially biodegraded by Pleurotus Ostreatus in greenhouse conditions. Both organic compounds (carbon, cellulose, lignin, extractives, and organic matter), and inorganic compounds (nitrogen, phosphorus and pH) were determined, before and after fungus inoculation on sawdust and rice husk. Mixtures were held of each substrate with a nutrient poor soil in equal proportions (1:1) and the moisture content was determined. The experiment consisted of a completely randomized, with two groups of six treatments for each substrate, and 30 days later, parameters of growth and development were identified. Biodegraded substrates presented low C, N and P. BSA + SF treatment (biodegraded sawdust + fertilized soil) presented the best results in the number of leaves (12.9), plant height (25.94 cm), root length (5.92 cm), dry weight (0.138 g), and fresh weight (1.012 g). BSA + SF substrate can work as favorable substrate for growing tomato seedlings, BSA + SF substrate can work as favorable substrate for growing of tomato seedlings, since it provides the nutrients necessary for a good growth. Plants in rice bran did not grow adequately for transplanting.

Lutzomyia abonnenci and Lutzomyia olmeca (Diptera: Psychodidae), New Records for the Department of Sucre, Colombia

Entre los departamentos de la costa Caribe de Colombia, Sucre tiene la mayor diversidad de especies del género Lutzomyia, dentro de las que se encuentran algunas asociadas al ciclo epidemiológico de la leishmaniasis cutánea y visceral. Por su importancia en salud pública, es necesario monitorear periódicamente estas comunidades de flebotomíneos, lo que motivó el desarrollo de un estudio entomológico en el municipio de Colosó, departamento de Sucre, en diciembre de 2009, 2010 y 2011. Los muestreos se realizaron con un aspirador eléctrico en sitios de reposo diurno, durante la noche se emplearon dos trampas de luz CDC y una trampa Shannon. Se recolectaron 566 flebotomíneos pertenecientes a 14 especies del género Lutzomyia, como sigue: Lu. evansi, Lu. panamensis, Lu. micropyga, Lu. gomezi, Lu. cayennensis cayennensis, Lu. trinidadensis, Lu. venezuelensis, Lu. serrana, Lu. abonnenci, Lu. migonei, Lu. dubitans, Lu. olmeca bicolor, Lu. atroclavata y Lu. ovallesi. El 48,2 % de los flebotomíneos recolectados se obtuvo con trampa Shannon, el 36,6 % con trampas CDC y el 15,2 % con aspirador eléctrico. Se destacan Lu. abonnenci y Lu. o. bicolor, especies ampliamente distribuidas en Colombia, como nuevos registros para el departamento de Sucre.

Among Colombia's Caribbean coast departments, Sucre has the greatest species diversity of phlebotomine sand flies (genus Lutzomyia), including several associated with the epidemiological cycles of cutaneous and visceral leishmaniasis. Due to its public health importance, the phlebotomine fauna of Sucre must be monitored periodically. Sand flies were collected in the ecological reserve of the municipality of Colosó, Sucre, during the months of December 2009, 2010 and 2011. Three sampling methods were employed, i.e., daytime collections from diurnal resting sites with a battery-powered aspirator and nocturnal collections using two CDC light traps and a Shannon trap. With these methods 566 phlebotomines were collected belonging to 14 species: Lu. evansi, Lu. panamensis, Lu. micropyga, Lu. gomezi, Lu. cayennensis cayennensis, Lu. trinidadensis, Lu. venezuelensis, Lu. serrana, Lu. abonnenci, Lu. migonei, Lu. dubitans, Lu. o. bicolor, Lu. atroclavata and Lu. ovallesi. Shannon trap collections accounted for 48,2 % of all phlebotomines collected, those with CDC light traps 36,6 % and with battery-powered aspirator 15,2 %. Both Lu. abonnenci and Lu. o. bicolor, species with wide spread in Colombia, represent new species records for the department of Sucre.

Analysis of the Geographical Distribution of Gerridae (Hemiptera, Gerromorpha) in the Andes of Southwestern Colombia

Se presentan la distribución geográfica y altitudinal de las Gerridae en la vertiente occidental de la Cordillera Occidental, suroccidente de los Andes de Colombia. La captura de especímenes se realizó en cuerpos de agua en ocho sitios de muestreo, durante los años 2009 y 2010. Se analizó la composición taxonómica respecto del rango geográfico y altitudinal, los biomas y la similitud entre áreas. La distribución geográfica de las Gerridae esta relacionada con el área geográfica, piedemonte y llanura del Pacífico con rango altitudinal (0-2000 m s. n. m.) y tipo de bioma. Las comunidades de Gerridae de la planicie del Pacífico a pesar de encontrarse en el mismo Zonobioma difieren en su composición taxonómica debido a diferencias en los cuerpos de agua y microhábitats característicos. Se evidencia la relación inversa entre la altitud y la riqueza de especies.

We present the geographical and altitudinal distribution of the Gerridae family on the western slopes of the Western Cordillera of Andes in southwestern Colombia. The specimens were captured in different water bodies, eight sampling sites, during 2009 and 2010. Taxonomic composition was analyzed with respect to geographical and altitudinal range, biomes and the similarity between areas. The geographical distribution of the Gerridae is related to geographic area, foothills and Plain Pacific, altitudinal range (0-2000 masl) and features of type of biome. The communities of Gerridae from Pacific Plain are in the same Zonobioma but differ in taxonomic composition due to differences in water bodies and microhabitats own. On the other hand we show the inverse relationship between altitude and species richness.

New Records and Distribution Expansions of Aquatic Heteropterous from Colombia (Hemiptera, Heteroptera)

Se registran 33 especies de chinches acuáticas; 21 semiacuáticas y 12 acuáticas (Gerromorpha y Nepomorpha). Se amplia el rango geográfico para 24 especies y nueve especies son registradas por primera vez para Colombia: Cryptocricos rufus DeCarlo, 1940; Gelastocoris bolivianus De Carlo, 1954; Ranatra tuberculifrons Montandon, 1907; Neoplea borelii (Kirkaldy, 1899); Hydrometra exalla Drake y Lauck, 1959; Hebrus plaumanni Porter, 1952; Merragata hebroides White, 1877; Rheumatobates drakei (Hungerford,1954); Microvelia hinei Drake, 1920; para cada una de estas especies se considera una diagnosis e ilustración de los caracteres taxonómicos. Para todas las especies se proporcionan la distribución por departamento y municipio y un mapa ilustrativo.

Thirty three species water bugs were registered; 21 semiaquatic and 12 aquatic (Gerromorpha and Nepomorpha). Expansions of the geographical range for 24 species and nine species were recorded for the first time for Colombia Cryptocricos rufus DeCarlo, 1940; Gelastocoris bolivianus De Carlo, 1954; Ranatra tuberculifrons Montandon, 1907; Neoplea borelii (Kirkaldy, 1899); Hydrometra exalla Drake y Lauck, 1959; Hebrus plaumanni Porter, 1952; Merragata hebroides White, 1877; Rheumatobates drakei (Hungerford, 1954); Microvelia hinei Drake, 1920; for each of these species were considered a diagnosis and illustration of taxonomic characters. The distribution by department and municipality and an illustrative map was given for all species.