Scielo RSS <![CDATA[Acta Biológica Colombiana]]> http://www.scielo.org.co/rss.php?pid=0120-548X20210002&lang=en vol. 26 num. 2 lang. en <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.co/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.co <![CDATA[Structure of the aquatic Diptera community in the upper basins of the Fucha and Bogotá rivers]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200147&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Los macroinvertebrados acuáticos son bien conocidos como bioindicadores de la calidad del agua. En Colombia, los estudios sobre este tema se han hecho principalmente a nivel taxonómico de familia. En este trabajo se analizan las respuestas en abundancia, riqueza y diversidad de los dípteros identificados a nivel de género en ríos altoandinos (río Bogotá y río Fucha), en épocas de aguas bajas y aguas altas. Los especímenes se recolectaron con tres métodos: red Surber, red de mano y lavado de rocas. La temperatura promedio fue de 12,9 °C y la saturación de oxígeno estuvo cerca del 100 % o más, con excepción del tramo bajo del río Bogotá antes de Villapinzón. Se colectaron 13 690 dípteros pertenecientes a diez familias y 40 géneros. La riqueza taxonómica fue alta, con una mayor variación en los tramos bajos de las dos corrientes. Las subfamilias de Chironomidae fueron las más abundantes. El análisis de correspondencia canónica (ACC) mostró que los Orthocladiinae se asociaron con la conductividad; el género Gigantodax (Simuliidae) no mostró una relación clara con ninguna variable; por el contrario, el género Simulium se vinculó con el caudal. En términos generales, la asociación entre taxones y variables ambientales fue más clara para los géneros que para las familias, pero no fue suficientemente robusta. Se sugiere que para encontrar un mayor grado de asociación biota-ambiente, es necesario realizar los análisis a nivel de especie, considerando las variaciones locales y temporales.<hr/>ABSTRACT Aquatic macroinvertebrates are recognized as bioindicators of water quality. In Colombia, the studies have mainly been addressed by the family taxonomic level. This work analyzes the responses in abundance, richness, and diversity of the Diptera at the genus level in high Andean rivers (Bogotá River and Fucha River), in periods of low and high waters. The specimens were collected with three methods: Surber net, hand net, and rock washing. The average temperature was 12.9 °C and oxygen saturation was close to 100 % or more, except for the lower section of the Bogotá River, before the Villapinzón town. 13 690 Diptera were collected from ten families and 40 genera. Taxonomic richness was high with the greatest variation in the lower sections of the two streams. The Chironomidae subfamilies were the most abundant. Canonical correspondence analysis (CCA) showed that Orthocladiinae were associated with water conductivity; the Gigantodax genus (Simuliidae) did not show a clear relationship with any variable; conversely, the genus Simulium was linked to the caudal. In general terms, the association between taxa and environmental variables was clearer for genera than for families, but it was not robust enough. It is suggested that to find a higher degree of biota-environment association, it is necessary to carry out analyzes at the species level, considering local and temporal variations. <![CDATA[BASE GROWTH TEMPERATURE AND PHYLLOCHRON FOR KIKUYU GRASS <em><strong><em>(Cenchrus clandestinas;</em> Poaceae)</strong></em>]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200160&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT In order to estimate the base temperature (Bt) of growth through the appearance of leaves and calculate the phyllochron for kikuyu grass, three plots were established on three farms in the Provincia of Ubaté (Cundinamarca, Colombia) located at different altitudes (2560, 2640, 3143 m. a. s. l.). Measurements were made in four cycles in a period of eight months. The Bt was estimated by the least coefficient of variation method using a second order regression model and the model obtained was validated by the cross-validation method. The Bt values for the first, second, third and fourth leafwere 4.02, 3.68, 3.93, and 3.62 °C, respectively. For the appearance of the first leaf, the kikuyu required more thermal time (TT) (97.5 accumulated growing degree days (AGDD)) than for the second (74.2 AGDD), third (73.8 AGDD) and fourth leaf (76.0 AGDD) (p &lt;0.05). There were no differences in TT among farms (p&gt; 0.05). There was a tendency to a greater number of days required to reach each leaf stage in the farm located at higher altitude and with lower mean temperature. The validation showed an adequate adjustment (r2 = 0.94) and a substantial concordance (CCC = 0.97) between the observed values and the predicted values for the estimated TT with the Bt value obtained for each leaf stage. The results ofBt for kikuyu grass obtained, will allow to make more precise predictions about the phyllochron and generate growth models close to reality.<hr/>RESUMEN Con el fin de estimar la temperatura base (Tb) de crecimiento a través de la aparición de hojas y calcular el filocrono para el pasto kikuyo, se establecieron tres parcelas en tres fincas de la provincia de Ubaté (Cundinamarca, Colombia) ubicadas a diferente altitud (2560, 2640, 3143 m. s. n. m.). Se realizaron cuatro ciclos de mediciones en un tiempo total de ocho meses. La Tb se estimó por el método de mínimo coeficiente de variación utilizando un modelo de regresión de segundo grado y el modelo obtenido se validó por el método de validación cruzada. La Tb para la primera, segunda, tercera y cuarta hoja fue 4,02, 3,68, 3,93 y 3,62 °C, respectivamente. El kikuyo requirió mayor tiempo térmico (TT) para la aparición de la primera hoja (97,5 grados día de crecimiento acumulados (GDCA)) que para la segunda (74,2 GDCA), tercera (73,8 GDCA) y cuarta hoja (76,0 GDCA) (p&lt;0,05). No hubo diferencias en el TT entre fincas (p &gt; 0,05). Hubo tendencia a un mayor número de días calendario requeridos para alcanzar cada estado de hoja en la finca ubicada a mayor altitud y con menor temperatura media. La validación mostró un adecuado ajuste (r2 = 0,94) y una concordancia sustancial (CCC= 0,97) entre los valores observados y los valores predichos para el TT estimado con los valores de Tb obtenidos para cada estado de hoja. Los resultados de Tb de crecimiento del pasto kikuyo obtenidos permiten realizar predicciones más precisas sobre el filocrono y generar modelos de crecimiento cercanos a la realidad. <![CDATA[Effect of sequence filtering on the assembly of the <em>Bacillus altitudinis</em> 19RS3 genome isolated from <em>Ilex paraguariensis</em>]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200170&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El filtrado de secuencias es un paso esencial sin importar el tipo de tecnología aplicada para la secuenciación de un genoma, en el cual las lecturas de baja calidad o una parte son eliminadas. En un ensamblado la construcción de un genoma se realiza a partir de la unión de lecturas cortas en cóntigos. Algunos ensambladores miden la relación que existe entre secuencias de una longitud fija (k-mer) que puede verse afectada por la presencia de secuencias de baja calidad. Un enfoque común para evaluar los ensamblados se basa en el análisis del número de cóntigos, la longitud del cóntigo más largo y el valor del N50, definido como la longitud del cóntigo que representa el 50 % de la longitud del conjunto. En este contexto, el presente estudio tuvo como objetivo evaluar el efecto del uso de lecturas crudas y filtradas en los valores de los parámetros de calidad obtenidos en el ensamblado del genoma de Bacillus altitudinis 19RS3 aislada de Ilex paraguariensis. Se realizó el análisis de calidad de ambos archivos de partida con el software FastqC y se filtraron las lecturas con el softwareTrimmomatic. Para el ensamblado se utilizó el software SPAdes y para su evaluación la herramienta QUAST. El mejor ensamblado para B. altitudinis 19RS3 se obtuvo a partir de las lecturas filtradas con el valor de k-mer 79, que generó 16 cóntigos mayores a 500 pb con un N50 de 931 914 pb y el cóntigo más largo de 966 271 pb.<hr/>ABSTRACT Sequence filtering is an essential step regardless of the type of technology applied for sequencing a genome, in which low-quality readings or a portion are eliminated. In an assembly, the construction of a genome is carried out from the union of short reads in contigs. Some assemblers measure the relationship between sequences of a fixed length (k-mer) that can be affected by the presence of low-quality sequences. A common approach to evaluating assemblies is based on the analysis of the number of contigs, the length of the longest contig, and the value of N50 defined as the length of the contig representing 50 % of the length of the assembly. In this context, the objective of this study was to evaluate the effect of the use of crude and filtered reads on the values of the quality parameters obtained from the genome assembly of Bacillus altituidinis 19RS3 isolated from Ilex paraguariensis. The quality analysis of both starting files was performed with the FastqC software and the readings were filtered with the Trimmomatic software. The SPAdes software was used for the assembly and the QUAST tool for its evaluation. The best assembly for B. altitudinis 19RS3 was obtained from the filtered readings with the value of k-mer 79, which generated 16 contigs greater than 500 bp with a N50 of 931 914 bp and the longest contig of 966 271 bp. <![CDATA[Paraquat's herbicide acute toxicity in <em>Oreochromis niloticus</em> (Cichlidae) and <em>Macrobrachium olfersii</em> (Palaemonidae)]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200178&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El Paraquat es un herbicida utilizado en la actividad agropecuaria para controlar hierbas, su modo de acción es por medio de contacto y no selectivo. Debido a su alta solubilidad en agua y baja volatilidad representa un riesgo potencial para organismos acuáticos, principalmente los que son cultivados con aguas superficiales que reciben impacto de la actividad agrícola. La tilapia Oreochromis niloticus y el langostino Macrobrachium olfersii son organismos de importancia comercial para la industria acuícola del estado de Veracruz, México. El objetivo de este estudio fue determinar la Concentración Letal Media (CL50) del herbicida Dasurquat® (ingrediente activo Paraquat) a través de un bioensayo de toxicidad aguda (96 horas). Se utilizaron como especímenes de prueba a juveniles de tilapia O. niloticus (peso promedio = 10 mg, longitud total= 8,75 mm) y otro el ensayo fue con poslarvas de langostino M. olfersii (peso promedio = 5 mg, longitud total= 5,72 mm). Se emplearon cinco concentraciones (5, 10, 20, 40 y 80 μL-1 para el bioensayo con juveniles de tilapia; para el bioensayo con poslarvas de langostino las concentraciones fueron 0,1, 0,2, 0,5, 0,7 y 1 μL-1). El diseño experimental consideró un control negativo, con dos repeticiones y dos réplicas por cada tratamiento. El análisis de datos se realizó con el método Probit para determinar la CL50 a 96 horas, se obtuvo un valor para juveniles de O. niloticus de 17,49 μL-1 con intervalo de confianza (95 %) con límite inferior de 13,75 μL-1 y límite superior 22,25 μL-1, para las larvas de M. olfersii se obtuvo un valor de 0,31 μL-1 con intervalo de confianza (95 %) con límite inferior de 0,26 μL-1 y límite superior 0,35 μL-1. El análisis de varianza demostró que no existió diferencia estadística significativa (p &gt; 0.05) entre las réplicas de los tratamientos. Se concluye que es necesario continuar con estudios para evaluar su toxicidad en organismos acuáticos debido al amplio uso de este herbicida en la actividad agropecuaria, y determinar su riesgo para otras actividades productivas además de la acuicola.<hr/>ABSTRACT Paraquat is an herbicide used in the agricultural industry for weed and undergrowth control, its mode of action is by contact and nonselective. Due to its high-water solubility and low volatility, it represents a potential risk for non-target organisms. Oreochromis niloticus tilapia and the prawn Macrobrachium olfersii are important commercial species for Veracruz's aquaculture industry. The objective of this study was to determine the Mean Lethal Concentration (LC50) of the herbicide Dasurquat® (active ingredient Paraquat) through an acute toxicity bioassay (96 hours). Juvenile O. niloticus (average weight = 10 mg, total length = 8.75 mm) and juvenile M. olfersii postlarvae (average weight = 5 mg, total length = 5.72mm) were used as test specimens. Five herbicide concentrations (5, 10, 20, 40 and 80 μL-1 for tilapia and 0.1, 0.2, 0.5, 0.7 y 1 μL-1 for prawn) were applied. The experimental design considered a negative control, with two replications and two replicates for each treatment. Probit analysis determined that the LC50 at 96 hours for O. niloticus was 17.49 μL-1, with a lower 95 % confidence limit of 13.75 μL-1 and an upper limit of 22.25 μL-1, whereas for M. olfersii the LC50 at 96 hours was 0.31 μL-1, with a lower 95 % confidence limit of 0.26 μL-1 and an upper limit of 0.35 μL-1. The analysis of variance showed that there was no significant statistical difference (p &gt; 0.05) between the replicates of the treatments. It is concluded that it is necessary to continue evaluating its toxicity in aquatic organisms due to the wide use of this herbicide in Veracruz's agricultural activity, to determine its potential risk to other activities. <![CDATA[Influence of herbivory and gap-openness on whole-plant growth of <em>Brosimum alicastrum</em> (Moraceae)]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200186&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN El crecimiento compensatorio y las defensas vegetales son respuestas para lidiar con la herbivoría y la luz. El estudio de la influencia de los componentes morfo-fisiológicos, de la asignación de biomasa y de la defensa vegetal podría arrojar información que ayude a entender estas respuestas. Se evaluaron los efectos de la herbivoría y la apertura de claros sobre el crecimiento, los componentes morfo-fisiológicos, la asignación de biomasa y las defensas químicas y físicas en plántulas de Brosimum alicastrum en una selva mediana subcaducifolia. Se utilizó un diseño anidado con sitios de sotobosque y claros (n = 3 en cada uno) y dentro de ellos plántulas sometidas a tres tratamientos de herbivoría: control (n = 10), simulada (n = 10) y natural (n = 10). Se registró a lo largo de seis meses la influencia de la herbivoría sobre el crecimiento (biomasa, área foliar, altura, diámetro y producción de hojas), la producción de fenoles y la dureza foliar. Se halló un crecimiento compensatorio (todas las variables de crecimiento) con la herbivoría natural, subcompensatorio (biomasa, altura y diámetro) con la simulada, y sobrecompensatorio (producción de hojas) con la herbivoría natural sólo en claros. Los componentes morfológicos como el cociente del área foliar (LAR) y el área foliar específica (SLA) fueron mayores bajo claros y el fisiológico, como la tasa de asimilación neta (NAR), en sotobosque. La proporción de biomasa en sotobosque fue mayor hacia hojas y tallos y en claros más alta hacia raíces. La herbivoría fue mayor en claros y los fenoles foliares en sotobosque. No se encontró una relación (compromiso) entre las defensas y el crecimiento, sólo una tendencia negativa con los fenoles bajo condiciones limitantes de recursos, como ocurre en el sotobosque.<hr/>ABSTRACT Compensatory plant growth and plant defense are responses to deal with herbivory and light availability. The research focused on compensatory growth responses explained through the influence of morphological and physiological components of plant growth, allocation mass, and plant defense could clarify such process. We studied the effects of herbivory and gap-openness on compensatory growth responses, morphological and physiological components, allocation mass, and chemical defenses in seedlings of Brosimum alicastrum in a subhumid tropical forest. We used a nested design with understory and gap-openness site (n = 3 each) within each replicated site seedling belong to three herbivory treatments (n = 10 each): control, simulated, and natural; and along six months we studied the influence of leaf herbivory on plant growth (mass, leaf area, height, diameter, and leaf production) and production of phenols and leaf toughness. We recorded compensatory growth responses (all plant growth variables) with natural herbivory, subcompensatory (mass, height, and diameter) with simulated and, overcompensatory (leaf production) with natural herbivory although only under gap-openness. We found a higher leaf area ratio (LAR) and specific leaf area (SLA) (both morphological components) under gap-openness and high values of net assimilation rate (NAR) on understory. The mass proportion was highest in leaves and stems on the understory and higher in roots under gap-openness. Leafherbivory was highest under gap-openness while the phenols of the leaves on understory. We did not find a relationship (trade-off) between defense with plant growth, but it was possible to underline a negative pattern of the leaf phenols under limiting resources environment such as understory. <![CDATA[IDENTIFICATION OF ENDOPHYTIC BACTERIA OF SEEDS FROM <em>Cedrela odorata</em> L. (Meliaceae) WITH BIOTECHNOLOGICAL CHARACTERISTICS]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200196&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT In the present study, 62 endophytic bacterial strains of cedar seeds (Cedrela odorata L.), collected in the municipalities of Huehuetán, Motozintla, and Pijijiapan in the state of Chiapas, Mexico were isolated. The goal was to identify characteristics of biotechnological interest such as biocontrol, promotion ofplant growth, and growth in aromatic compounds. The strains were identified by the partial sequence of the 16S ribosomal gene as belonging to the Bacillus genus. The biocontrol capacity of phytopathogenic fungi, production of indoleacetic acid (IAA), solubilization of phosphate, and growth in xenobiotic compounds (phenanthrene, benzene, anthracene, or phenol) were detected in 26 strains of the 62 isolates. 21 % of the strains inhibited the mycelial growth of Alternaria solani and Fusarium sp., and 13 % of the Phytophthora capsici oomycete. IAA production was detected in 24 isolates, phosphate solubilizing activity was identified in 18 isolates, while the ability to grow in the presence of phenanthrene and benzene was found in 26 isolates; 24 isolates grew in the presence of anthracene and only two isolates grew in phenol as the only carbon sources. This is the first report of the isolation and identification of endophytic bacteria from cedar seeds, where biotechnological characteristics were detected for biological control, promotion of plant growth, and growth in the presence of xenobiotic compounds.<hr/>RESUMEN En el presente estudio se aislaron 62 cepas bacterianas endófitas de semillas de cedro (Cedrela odorata L.) colectadas en los municipios de Huehuetán, Motozintla y Pijijiapan en el estado de Chiapas, México, con el objetivo de identificar características de interés biotecnológicas como biocontrol, promoción del crecimiento vegetal y crecimiento en compuestos aromáticos. Las cepas se identificaron por la secuencia parcial del gen 16S ribosomal como pertenecientes al género Bacillus. En 26 cepas de las 62 aisladas se detectaron la capacidad de biocontrol de hongos fitopatógenos, la producción de ácido indolacético (AIA), la solubilización de fosfato y el crecimiento en compuestos xenobióticos (fenantreno, benceno, antraceno o fenol). El 21 % de las cepas inhibió el crecimiento miceliar de Alternaria solani y Fusarium sp., y el 13 % del oomiceto Phytophthora capsici. La producción de ácido indolacético se detectó en 24 aislados y la actividad solubilizadora de fosfato se encontró en 18 aislados, mientras que la capacidad de crecer en presencia de fenantreno y benceno se manifestó en 26 aislados (24 aislados crecieron en presencia de antraceno y solo dos aislados crecieron en fenol como únicas fuentes de carbono). Es importante mencionar que este es el primer reporte del aislamiento e identificación de bacterias endófitas de semillas de cedro, en el que se detectaron características biotecnológicas para el control biológico, la promoción del crecimiento vegetal y el crecimiento en presencia de compuestos xenobióticos. <![CDATA[HEMATOLOGYCAL AND BLOOD BIOCHEMISTRY PARAMETERS OF CAPTIVE BIG-HEADED AMAZON RIVER TURTLES, <em>Peltocephalus dumerilianus</em> (TESTUDINES: PODOCNEMIDIDAE)]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200207&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT The determination of hematological values is used to obtain knowledge about the health conditions of animal species. The big-headed Amazon River turtles, (Peltocephalus dumerilianus) are considered one of the least known testudine species concerning their biology and health status. Herein, we determined the hematological and plasma biochemical parameters of17 (eight males and nine females) adult P. dumerilianus to provide reference interval values for clinically healthy individuals. We collected the blood samples by puncturing the femoral vein using long heparinized hypodermic syringes. Sexual dimorphism for individuals was determined by external observation of the shape of the plastron. The average values obtained for the ten hematological and biochemical parameters analyzed were red blood cell count = 0.32 million μL-1; hematocrit = 20.6 %; hemoglobin = 8.5 g dL-1; mean corpuscular volume = 681.6 fL; mean corpuscular hemoglobin = 267.8 pg; mean corpuscular hemoglobin concentration = 41.9 g dL-1; glucose = 80.6 mg dL-1, total protein = 4.1 g dL-1, triglycerides = 388.9 mg dL-1, and total cholesterol = 79.3 mg dL-1. Despite the sexual dimorphism evidenced for the species, there was no significant statistical difference between males and females for both hematological and biochemical parameters analyzed herein. Based on these results, the population is considered healthy, with parameter values coinciding with previously reported reference ranges for testudines species in the region. The results obtained in this study can be used for assessing the health status of other Amazonian turtle populations, especially in actions aimed at cultivation strategies, management, and species conservation.<hr/>RESUMEN La determinación de valores hematológicos se ha utilizado para conocer las condiciones sanitarias de algunas especies animales. La tortuga cabezona del río Amazonas, Peltocephalus dumerilianus, se considera una de las especies de testudines menos conocidas en relación a su biología y estado de salud. Aquí, determinamos los parámetros bioquímicos hematológicos y plasmáticos de 17 adultos (ocho machos y nueve hembras) de P. dumerilianus con el fin de proporcionar valores de intervalo de referencia sobre los individuos clínicamente sanos. Recolectamos las muestras de sangre perforando la vena femoral con jeringas hipodérmicas largas heparinizadas. El dimorfismo sexual de los individuos se determinó mediante la observación externa de la forma del plastrón. Los valores medios obtenidos para los diez parámetros hematológicos y bioquímicos analizados fueron: recuento de glóbulos rojos = 0,32 millones μL-1; hematocrito = 20,6 %; hemoglobina = 8,5 g dL-1; volumen corpuscular medio = 681,6 fL; hemoglobina corpuscular media = 267,8 pg; concentración media de hemoglobina corpuscular = 41,9 g dL-1; glucosa = 80,6 mg dL-1, proteína total = 4,1 g dL-1, triglicéridos = 388,9 mg dL-1 y colesterol total = 79,3 mg dL-1. A pesar del dimorfismo sexual evidente para la especie, no hubo diferencia estadística significativa entre machos y hembras para los parámetros hematológicos y bioquímicos analizados aquí. Con base en estos resultados, la población se considera saludable y los valores de los parámetros coinciden con los rangos de referencia reportados previamente de las especies de testudines en la región. Los resultados obtenidos en este estudio pueden utilizarse en la evaluación del estado de salud de otras poblaciones de tortugas amazónicas, considerando especialmente aquellas acciones dirigidas al manejo, conservación y estrategias de cultivo de la especie. <![CDATA[Bryophytes of rotten logs from El Zafire biological station, Amazonas - Colombia]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200214&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN En el presente trabajo se caracterizó la flora briofítica en troncos en descomposición en la estación meteorológica El Zafire, Amazonas-Colombia. Para ello se realizó un muestreo de 100 unidades muestrales en 20 troncos en diferente estado de descomposición y en dos tipos de bosque (tierra firme y varillal inundable). Se reportan 120 especies, 81 hepáticas y 39 musgos, pertenecientes a 55 géneros (33 hepáticas y 22 musgos) y 21 familias (nueve hepáticas y 12 musgos). Se registran cuatro especies nuevas para el país, 25 para la amazonia colombiana y 41 para el departamento del Amazonas. En términos de riqueza total, el bosque de varillal presentó un valor mayor al de tierra firme. Sin embargo, esta diferencia no es significativa (Kruskal Wallis X 2=0,199; p = 0,05); así mismo la diversidad fue mayor en el bosque de varillal inundable (Shanon = 3,93) en comparación con la del bosque de tierra firme (Shanon = 3,67). La composición de las comunidades de briófitos fue diferente entre los dos tipos de bosques (similitud igual a 40 %). En el estudio florístico de los dos tipos de bosques de la estación biológica, se evidenció una marcada dominancia de la familia Lejeunaceae, que representó el 55,5 % de las hepáticas y el 37,5 % del total de las especies de briófitos.<hr/>ABSTRACT The present study aims to characterize the bryophyte community on rotten logs in El Zafire biological station, Amazonas-Colombia. We sampled 100 plots on 20 trunks with different states of decomposition in two types of forest (terra firme and floodplain). 120 species are reported, 81 liverworts and 39 mosses, belonging to 55 genera (33 liverworts and 22 mosses) and 21 families (nine liverworts and 12 mosses). Four new species are registered for Colombia, 25 for the Colombia Amazon, and 41 for the department of Amazonas. In terms of richness, the floodplain presented a higher value than the terra firme forest. However, no significant difference was found between the two types of forests (Kruskal Wallis X 2c= 0.199, X 2t= 3.81). Diversity was higher in the floodplain (Shanon = 3.93) compared to the terra firme forest (Shanon = 3.67). The composition of the bryophyte communities shows differences between the two types of forests (similarity equal to 40 %). In the floristic study of the two types of forests of the biological station, the most common family was Lejeuneaceae, it represented 55.5 % of the liverworts sampled and 37.5 % of the total of the bryophyte species. <![CDATA[Effect of pH on the bioacumulation rates of heavy metals in macroalgae <em>Bostrychia calliptera</em> (Rhodomelaceae, Ceramiales)]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200226&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Uno de los factores que más influye en las características químicas de un metal en solución es el nivel de acidez. El pH, por lo tanto, afecta la reactividad del ion y por ende su interacción con los puntos de unión de la pared celular de la planta. Este estudio evaluó el efecto del pH en la capacidad de bioacumulación de metales pesados en el alga roja Bostrychia calliptera (Rhodophyta, Rhodomelaceae). Se sometieron talos del alga a diferentes concentraciones de mercurio (Hg) y Plomo (Pb), desde 0,1 hasta 10 mg/L para Hg y desde 0,1 hasta 15 mg/L para Pb, durante periodos exposición de 0, 12, 24 y 96 horas, bajo diferentes niveles de pH. Las concentraciones de metal acumulado se determinaron por espectrofotometría de absorción atómica. Las mayores tasas de acumulación se encontraron en el alga expuesta a pH 8 (tanto para Hg como para Pb), el cual es un nivel de pH muy cercano al medido en el área de muestreo. La concentración de metal en el alga se incrementó de manera lineal hasta las 48 h de exposición, tiempo en el que se evidenció una mayor eficiencia de acumulación durante el primer intervalo del periodo del bioensayo. El presente estudio permitió identificar el uso potencial del alga B. calliptera como especie bioindicadora de metales pesados en ambientes estuarinos.<hr/>ABSTRACT One of the factors with a bigger influence on the chemical characteristics of metal in solution is the level of acidity. Solution pH affects the cell wall metal-binding sites and the metal ion chemistry in water. This study evaluated the effect of pH on the bioaccumulation capacity in the red algae B. calliptera (Rhodophyta, Rhodomelaceae) exposed to different pH ranges. Algae thalli were subjected to different concentrations ofmercury (Hg) and Lead (Pb), at concentrations from 0.1 to 10 mg/L for Hg and from 0.1 to 15 mg/L for Pb, respectively, during the following exposure times: 0, 12, 24 and 96 hours for each ion. Metal concentrations were determined by atomic absorption spectrophotometry according to standard APHA methods. The highest accumulation rates were found when the algae were exposed to pH 8 (for both Hg and Pb), which is a level very close to that measured in the study area. The metal concentration in the algae increased linearly until 48 hrs, a time where a greater accumulation efficiency was evident. The present study allowed to identify the potential use of the alga B. calliptera as a bioindicator species for heavy metals in estuarine environments. <![CDATA[Cassava: bread and meat, a potential alternative to tackle hidden hunger]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200235&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Uno de los retos que encara la humanidad es asegurar la alimentación y la adecuada nutrición para los cerca de ocho billones de habitantes del planeta. Las raíces de yuca constituyen la cuarta fuente más importante de calorías para la población humana siendo uno de los pilares de la seguridad alimentaria. Las raíces de yuca no poseen atributos nutricionales adecuados. Aunque existen variedades con valores relativamente altos de estos compuestos, sus valores están lejos de los necesarios para asegurar los requerimientos mínimos de la población humana. Las hojas de yuca poseen valores altos de contenido proteico, minerales y vitaminas, por lo que representan una fuente nutricional alternativa. Sin embargo, el consumo de hojas de yuca en América Latina es escaso o nulo como consecuencia de los altos niveles de cianuro que poseen. En algunos países de África y Asia las hojas se consumen a través de diversas recetas que incluye su cocción, eliminando así una gran cantidad del contenido cianógeno. En esta revisión se presenta un panorama general de la importancia nutricional de la yuca, las diferentes estrategias de mejoramiento genético clásico y no convencional destinados a incrementar los contenidos nutricionales de raíces y la importancia de la explotación de la variabilidad intrínseca de la yuca como una fuente de variedades y genes que puedan contribuir a la implementación de estrategias encaminadas a desarrollar materiales con los requerimientos nutricionales adecuados. Finalmente, se presenta el potencial que tienen las hojas de yuca para ser empleadas dentro de programas complementarios destinados a mejorar la calidad nutricional de la población humana.<hr/>ABSTRACT One of the challenges facing humanity is to ensure food and adequate nutrition for the nearly eight billion inhabitants of the planet. Cassava roots constitute the fourth most important source of calories for the human population, being one of the pillars of food security. Cassava roots do not have adequate nutritional attributes. Although there are varieties with relatively high values of these compounds, these are far from those necessary to ensure the minimum requirements of the human population. Cassava leaves have a high content of protein, minerals, and vitamins, so they represent an alternative nutritional source. However, their consumption in Latin America is scarce due to the high levels of cyanide they possess. In some countries of Africa and Asia, the leaves are consumed through various recipes that include cooking, thus eliminating a large amount of cyanogen content. This review presents an overview of the nutritional importance of cassava, the different strategies of classical and unconventional genetic improvement aimed at increasing the nutritional content of roots, and the importance of exploiting the intrinsic variability of cassava as a source of varieties and genes that can contribute to the development of strategies directed to developing materials with the appropriate nutritional requirements. Finally, the potential of cassava leaves to be used in complementary programs aimed at improving the nutritional quality of the human population is presented. <![CDATA[VASCULAR EPIPHYTES: THE UGLY DUCKLING OF PHENOLOGICAL STUDIES]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200247&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT The phenology of vascular epiphytes, which account for about 10 % of the world's flowering plants and perform important ecological functions, has been just partially explored. Since phenology is a key tool for the management and conservation of species, the objective of this review was to synthesize the information published so far about the phenology of vascular epiphytes, detect gaps of knowledge, and suggest future lines of investigation to understand the underlying mechanisms. We conducted an online search for articles in Google Scholar and in the ISI Web of Science database from 1800 to 2020, with different combinations of keywords. 107 studies addressing the phenology of different holoepiphyte species were found; 88 % of the studies were performed in the Neotropic, especially in tropical and subtropical wet forests. The phenology of only ca. 2 % (418 spp.) of all reported holoepiphyte species has been explored. There is a bias toward the study of the flowering and fruiting phenology in members of the Orchidaceae (192 spp.) and Bromeliaceae (124 spp.) families. In general, the vegetative and reproductive phenology of epiphytes tends to be seasonal; however, there is a huge gap in our understanding of the proximate and ultimate factors involved. Future research should explicitly focus on studying those factors.<hr/>RESUMEN Las epífitas vasculares, que representan cerca del 10 % de la flora vascular y cumplen funciones ecológicas importantes, se han explorado poco desde el punto de vista fenológico. Dado que la fenología es una herramienta clave para el manejo y conservación de especies, el objetivo de este trabajo fue sintetizar la información publicada, detectar vacíos de conocimiento y sugerir líneas de investigación que permitan entender los mecanismos que regulan la fenología de este grupo. Se realizó una búsqueda de artículos en Google Académico y en la base de datos ISI Web of Science desde 1800 a 2020, con diferentes combinaciones de palabras clave. Se encontraron 107 estudios que abordan la fenología de especies holoepífitas, el 88 % de estos estudios se realizaron en el Neotrópico, principalmente en bosques lluviosos tropicales y subtropicales. Solamente se ha estudiado la fenología de ca. 2 % (418 spp.) del total de especies de holoepífitas reportadas; los trabajos se han enfocado principalmente en estudiar la floración y fructificación de miembros de Orchidaceae (192 spp.) y Bromeliaceae (124 spp.). La fenología vegetativa y reproductiva de las epífitas tiende a ser estacional. Sin embargo, existe un vacío enorme de los factores próximos y últimos implicados; los futuros estudios pueden enfocarse a elucidar qué factores detonan la fenología de epífitas vasculares. <![CDATA[Colombian urban mammals: review of what we know and what we need to do next]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200262&lng=en&nrm=iso&tlng=en RESUMEN Los ecosistemas urbanos están entre los ambientes que más rápido crecen en el planeta debido al incremento de la población humana, y es necesaria información que permita tomar decisiones para el manejo y conservación de su biodiversidad. Por ello se revisaron las publicaciones sobre mamíferos urbanos colombianos y se analizaron cuatro aspectos: 1) la relación entre el número de publicaciones y el año, 2) la representación del conocimiento por regiones naturales y departamentos, 3) la relación entre el número de publicaciones y la población humana por departamento, y 4) la representación de los temas y órdenes de mamíferos estudiados en las diferentes regiones naturales. El número de publicaciones sobre los mamíferos urbanos se ha incrementado exponencialmente con el tiempo, pero estas no están distribuidas uniformemente entre las regiones naturales y departamentos. El número de publicaciones se incrementó con la población humana en los departamentos. Sin embargo, en algunos departamentos existe un número de publicaciones mayor al esperado, mientras que en otros están por debajo de las expectativas. Hay limitada información sobre las respuestas ecológicas de los mamíferos a la urbanización, su posibilidad de transmitir enfermedades, la composición de especies en la mayoría de las áreas urbanas y el efecto de la urbanización sobre la diversidad. Se sugiere aprovechar espacios como los campus universitarios e indicadores comportamentales de bajo costo para hacer experimentación y ayudar a desarrollar estrategias que permitan la coexistencia de humanos y mamíferos silvestres en y alrededor de las ciudades.<hr/>ABSTRACT Urban ecosystems are amongst the fastest growing environments on the planet due to the increase in human population. Hence, it is necessary to obtain information about biodiversity in such environments for their management and conservation. I reviewed the publications about Colombian urban mammals and analyzed four aspects: 1) the relationship between the number of publications and the year, 2) the contribution of publications from natural regions and departments, 3) the relationship between the number of publications and the human population per department, and 4) the contribution of publications about different subjects and mammal orders in different natural regions. The number ofpublications about urban mammals has increased exponentially with time, but the number of publications is not uniformly distributed among natural regions or departments. There was a positive relationship between the human population size per department and the number of publications. Nevertheless, in some departments, there was a higher than expected number of publications, whereas in others it was below the expectations. There is limited information about the ecological responses of mammals to urbanization, their possibility to transfer diseases, the species composition in most urban areas, and the effect of urbanizations on mammal diversity. I suggest that places such as university campuses and low-cost behavioral indicators based on activity or foraging should be used for experiments to develop strategies to allow the coexistence between humans and wild mammals in and around the cities. <![CDATA[PREDATORY INTERACTION BETWEEN TWO ANURAN SPECIES WITH <em>Thamnodynastes chaquensis</em> (COLUBRIDAE) IN THE BRAZILIAN CERRADO]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200273&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT Although predatory events are uncommon to be recorded in nature, these data are important tools for understanding prey-predator interaction of the involved species. Snakes of genus Thamnodynastes are known for having an anuran diet, including some species of hylid frogs in their diet. Despite this, this pattern does not include T. chaquensis since there are no records on predation or trophic interaction with hylid frogs. Here, we report the first predatory interaction between T. chaquensis and two hylid frogs in Brazilian Cerrado. The first predation event with treefrog Boana caiapo occurred with success but, the second with B. albopunctata did not. Connecting trophic links within an ecosystem requires in-depth knowledge of its species and their intraspecific interactions. In this context, records of the predation and predation attempts such as these may help to connect unknown trophic links, which helps to understand aspects of the natural history of the species involved.<hr/>RESUMEN Aunque los eventos depredatorios son poco comunes de registrar en la naturaleza, estos datos son herramientas importantes para comprender la interacción presa-depredador de las especies involucradas. Las serpientes del género Thamnodynastes son conocidas por su dieta basada en anuros y, aunque algunas especies incluyen ranas hílidas en su dieta, esto no ocurre en la especie T. chaquensis porque no hay registros de depredación o interacción trófica con los hílidos. Aquí informamos sobre la primera interacción depredatoria entre T. chaquensis y dos ranas hílidas del Cerrado brasileño. El primer evento de depredación con la rana Boana caiapo fue exitoso, pero el segundo con B. albopunctata no. Conectar los enlaces tróficos dentro de un ecosistema requiere conocer íntimamente sus especies y sus interacciones intraespecíficas. En este contexto, los registros de depredación y de intentos de depredación como estos pueden ayudar a conectar enlaces tróficos no conocidos, lo cual ayuda a comprender los aspectos de la historia natural de las especies involucradas. <![CDATA[PREDATION OF PALE-BREASTED THRUSH EGGS BY THE ARIEL TOUCAN IN BRAZIL: FAILURE OF THE ANTI-PREDATORY STRATEGY]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200278&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT The Channel-billed Toucan (Ramphastos vitellinus) is an omnivorous bird that eventually is nest-robbers. Several birdsongs display anti-predatory strategies such as attacks and mobbing calls to face this kind of predator. This note reports a predatory event of one Channel-billed Toucan upon eggs of Pale-breasted Thrush (Turdus leucomelas) and describes the anti-predatory behavior, principally alert and mobbing calls of the thrush. Even though the Pale-breasted Thrush displayed the anti-predatory behaviors to harass the toucan, the egg predation was not avoided. Although the predation upon eggs by Ramphastos vitellinus has been reported several times, the majority of reports lack the identity of the bird species affected, this being the first confirmed record in Turdus leucomelas.<hr/>RESUMEN El tucán de Ariel (Ramphastos vitellinus ariel) es un ave omnívora que eventualmente es ladrona de nidos. Varias aves paseriformes muestran estrategias anti-depredatorias, tales como ataques y llamadas de acoso para enfrentarse a este tipo de depredadores. Esta nota reporta un evento de depredación de un tucán de Ariel sobre huevos de la mirla pechi pálida (Turdus leucomelas), y describe el comportamiento antipredador, principalmente el relacionado con las llamadas de alerta y de acoso de la mirla. A pesar de que la mirla pechi pálida mostró un comportamiento anti-depredatorio acosando al tucán, no se evitó la depredación de los huevos. Aunque la depredación de huevos por parte del Ramphastos vitellinus se ha registrado varias veces, la mayoría de los reportes carecen de la identidad de la especie de ave afectada, siendo este el primer registro confirmado en Turdus leucomelas. <![CDATA[A NEW RECORD FOR THE MILK FROG <em>Trachycephalus coriaceus</em> (ANURA: HYLIDAE) FROM TELES PIRES RIVER, SOUTH AMAZONIA, BRAZIL]]> http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2021000200283&lng=en&nrm=iso&tlng=en ABSTRACT Herein, we report a new record of the milk frog Trachycephalus coriaceus for the Brazilian southern Amazonia and provide an updated geographic distribution map. We collected one specimen of T. coriaceus on 8 november 2016, during a nocturnal survey inside a dense ombrophilous forest in the right bank of the Teles Pires River, municipality ofJacareacanga, southern of Pará State. The record of T. coriaceus to Jacareacanga is the first to the State. The disjoint geographic distribution of this species along de Amazonia may just reflect the paucity of amphibian knowledge throughout this biome and the difficulty to detect this species in the field, given its explosive reproductive behavior.<hr/>RESUMEN Aquí, informamos sobre un nuevo registro de la rana lechera Trachycephalus coriaceus para el sur de la Amazonía brasileña y proporcionamos un mapa actualizado de su distribución geográfica. Recolectamos un espécimen de esta especie el 8 de noviembre de 2016, durante un muestreo nocturno dentro de un bosque denso ombrófilo en la margen derecha del río Teles Pires, municipio de Jacareacanga, al sur del estado de Pará. El registro de T. coriaceus en Jacareacanga es el primero en este estado. La distribución geográfica disyunta de esta especie a lo largo de Amazonia puede reflejar la escasez de conocimiento de anfibios en todo este bioma y la dificultad de detectar esta especie en campo, debido a su comportamiento reproductivo explosivo.