Universitas Scientiarum

Incidental bycatch by ornamental fishing during the low-water season in the influence zone of Puerto Carreño, Colombian Orinoco Basin

Objetivo. El presente estudio evalúa las capturas ícticas incidentales de la pesca de especies ornamentales, en términos de abundancia y riqueza, en la zona de influencia del municipio de Puerto Carreño, Vichada, Colombia. Materiales y métodos. Para esto, se realizaron muestreos en los ríos Bita, Orinoco y en Caño Negro, durante el período de aguas bajas, en marzo y abril de 2007. A partir del acompañamiento realizado a las jornadas de pesca ornamental, se colectaron 152 especies entre incidentales y objeto. Se estimó la captura por unidad de esfuerzo (CPUE) y la composición porcentual de las capturas ícticas de las especies objeto versus las incidentales. Resultados. Los valores más altos de CPUE para especies objeto corresponden a los estimados para: Dicrossus maculatus, Hemigrammus rodhostomus, Corydoras cf. melanistius, Peckoltia sp. 2. y Hemiancistrus sp.; Por otro lado, los valores más altos para las especies ícticas incidentales corresponden a: Hemigrammus sp., Moenkhausia sp., Hemigrammus levis, Aphanothorulus cf. ammophilus, Triportheus angulatus y Moenkhausia lepidura. El porcentaje en riqueza para las especies ícticas incidentales varió entre el 92% y 98%. No obstante, el porcentaje en abundancia de las especies objeto fue mayor que el obtenido para las capturas incidentales variando entre 73% y 83%, con excepción de la obtenida en la pesca en los afloramientos rocosos del río Orinoco que fue del 17%. Conclusiones. El impacto de la pesca ornamental sobre las especies de peces capturadas incidentalmente se observa principalmente a nivel de riqueza, pero no a nivel de abundancia.

Objective. The present study assesses the incidental fish catches in the fishing of ornamental species in terms of richness and abundance within the influence zone of Puerto Carreño, Vichada, Colombia. Materials and methods. Samplings were carried out in the Orinoco River and Bita River and Caño Negro stream during the low-water season, in March and April of 2007. Target and incidental species collected during the ornamental fishing totalized 152. Catches per unit of effort (CPUE) as well as the percentage composition of fish catches of target vs. incidental species were estimated. Results. The highest values of CPUE of fishes with ornamental value correspond to: Dicrossus maculatus, Hemigrammus rodhostomus, Corydoras cf. melanistius, Peckoltia sp. 2 and Hemiancistrus sp., and the highest values of incidental species were for: Hemigrammus sp., Moenkhausia sp., Hemigrammus levis, Aphanothorulus cf. ammophilus, Triportheus sp. y Moenkhausia lepidura. The richness percentage of incidental species varied between 92% and 98%. However the abundance percentage of target species was always higher than the percentage of incidental catches varying between 73% and 83% with the exception of that obtained in the fisheries of the Orinoco River outcrops that was 17%. Conclusions. The impact of the fishing ornamental fish on species taught incidentally is seen mainly at the level of richness, but not at the level of abundance.

Objetivo. Este estudo avalia a captura incidental de peixes produto da pesca ornamental, em termos de abundância e riqueza, na bacia hidrográfica do município de Puerto Carreño, Vichada, Colômbia. Materiais e métodos. Para isso, realizaram-se amostragens nos rios Bita, Orinoco e Caño Negro, durante o período de níveis da água baixos, em Março e Abril de 2007. A partir do acompanhamento direto feito na pescaria ornamental, foram coletadas 152 espécies entre as alvo e as incidentais. Estimaram-se as capturas por unidade de esforço (CPUE) e a composição percentual das capturas das espécies-alvo versus as incidentais. Resultados. Os maiores valores de CPUE para as espécies-alvo correspondem aos estimados para: Dicrossus maculatus, Hemigrammus rodhostomus, Corydoras cf. melanistius, Peckoltia sp. 2 e Hemiancistrus sp., e os maiores valores para espécies incidentais correspondem a: Hemigrammus sp., Moenkhausia sp., Hemigrammus levis, Aphanothorulus cf. ammophilus, Triportheus angulatus e Moenkhausia lepidura. O percentual da riqueza das espécies de peixes incidentais variou entre 92% e 98%. No entanto, o percentual da abundância das espéciesalvo foi maior que aquele pra as espécies incidentais variando entre 73% e 83%, com exceção da obtida na pesca nos afloramentos rochosos do río Orinoco o qual foi de 17%. Conclusões. O impacto da pesca ornamental sobre as espécies de peixes capturadas incidentalmente pode ser observado principalmente ao nível de riqueza, mas não ao nível de abundância.

Characterization and identification of isolates of carotenogenic yeast strains from several natural zones of Ecuador

Objetivo. Identificar y caracterizar levaduras pigmentadas aisladas de ambientes naturales del Ecuador que sean productoras de metabolitos de interés para la industria y puedan ser utilizadas en posteriores aplicaciones biotecnológicas. Materiales y métodos. Se trabajó con 26 aislados pigmentados de la Colección de Levaduras Quito-Católica (CLQCA) que fueron sometidos a pruebas fisiológicas y moleculares para su caracterización, tipificación e identificación. Se evaluó la capacidad de asimilación de azúcares. Se emplearon las técnicas moleculares RFLP-ITS, MSP-PCR, amplificación parcial del segmento 26S del ADNr y secuenciamiento para identificación a nivel de especie. Se incubaron todos los aislados a 20, 30 y 37°C para determinar la temperatura en la que presenten mejor crecimiento. Posteriormente, fueron determinadas las curvas de crecimiento para cada aislado. Resultados. Se identificaron las especies: Rhodotorula mucilaginosa, Rhodosporidium babjevae, Sporidiobolus ruineniae, Rhodotorula glutinis, Rhodotorula slooffiae y una especie nueva del género Rhodotorula. Conclusiones. Se seleccionaron como cepas promisorias para futuros usos industriales los aislados de Rhodotorula mucilaginosa (CLQCA-12-013 y CLQCA-12-008) y Rhodosporidium babjevae (CLQCA-10-188), por presentar características de crecimiento rápido, alta asimilación de azúcares, producción de biomasa e intensidad en la pigmentación.

Objective. To identify and characterize pigmented yeasts isolated from natural environments in Ecuador, producing metabolites with industrial importance and with potential use in further biotechnological applications. Materials and methods. Twenty-six pigmented isolates from the "Colección de Levaduras Quito-Católica" (CLQCA) were exposed to physiological and molecular tests for their characterization, typification and identification. Sugar assimilation ability was evaluated. Molecular techniques such as ITS-RFLP, MSP-PCR, partial amplification of the segment 26S of the rDNA, and sequencing were used for their identification at the species level. Growth curves for each isolate according to their specific optimum growth temperatures. Results. The following species were identified: Rhodotorula mucilaginosa, Rhodosporidium babjevae, Sporidiobolus ruineniae, Rhodotorula glutinis, Rhodotorula slooffiae, as well as a new species of the genus Rhodotorula. Conclusions. Rhodotorula mucilaginosa (CLQCA-12-013 and CLQCA-12-008) and Rhodosporidium babjevae (CLQCA-10-188) isolates were selected as promising strains for industrial applications, because they showed characteristics such as rapid growth, high assimilation of sugars, biomass production, and pigment synthesis.

Objetivo. Identificar e caracterizar leveduras pigmentadas isoladas de ambientes naturais do Equador, que produzem metabólitos de interesse para a indústria e podem ser usadas em subseqüentes aplicações biotecnológicas. Materiais e métodos. Trabalhou-se com 26 isolados pigmentados da Coleção de Leveduras Quito-Católica (CLQCA) que se submeteram a provas fisiológicas e molecular para sua caracterização, tipificação e identificação. Foi avaliada a capacidade de assimilação de açúcares. Foram utilizadas as técnicas moleculares RFLP-ITS, MSP-PCR, amplificação parcial do segmento 26S do ADNr ribossomal e seqüenciamento para sua identificação em nível de espécie. Determinaramse as curvas de crescimento para cada isolado de acordo com a sua temperatura ótima de crescimento. Resultados. Foram identificadas as espécies: Rhodotorula mucilaginosa, Rhodosporidium babjevae, Sporidiobolus ruineniae, Rhodotorula glutinis, Rhodotorula slooffiae e uma nova espécie do gênero Rhodotorula. Conclusões. Foram selecionados como cepas promissoras para futuros usos industriais os isolados de Rhodotorula mucilaginosa (CLQCA-12-013 e CLQCA-12-008) e Rhodosporidium babjevae (CLQCA-10-188), por apresentar características de crescimento rápido, alta assimilação de açúcares, produção de biomassa e síntese de pigmentos.

Effect of cooking time and temperature on sausages artificially inoculated with Listeria monocytogenes

Objetivo. Determinar si los tiempos utilizados por los consumidores para la cocción de chorizos son suficientes para la inactivación de Listeria monocytogenes inoculada artificialmente en este producto. Materiales y métodos. Se realizó una encuesta a 50 amas de casa para preguntar sobre los hábitos de preparación de los chorizos. Se analizaron 60 muestras de chorizos a las que se les inocularon concentraciones de 10³ UFC g-1 de un pool de 5 cepas de L. monocytogenes, se aplicaron los procedimientos de cocción indicados por la encuesta y se hizo recuento inmediatamente. Adicionalmente, se realizó una prueba complementaria donde se inocularon 20 muestras de chorizos con poblaciones de 10³ UFC g-1 y se sometieron a 72 y 73°C durante 30 segundos. Resultados. Mediante la encuesta se logró establecer que 15 minutos de cocción y 5 minutos de fritura es la forma más frecuente de preparación por parte de los consumidores, se logró establecer que el tiempo y las condiciones utilizadas en este ensayo tuvieron un efecto estadísticamente significativo (0,016) sobre la población inoculada. En el ensayo complementario los datos estadísticos (p: 0,0001) indicaron que temperaturas internas de 73°C son suficientes para la inactivación de este patógeno a nivel industrial. Conclusión. Tiempos de 15 minutos de cocción y 5 minutos de fritura son suficientes para inactivar concentraciones de 10³ g-1 de Listeria monocytogenes inoculadas artificialmente en chorizos.

Objective. To find whether the cooking times traditionally used by consumers are enough to inactivate Listeria monocytogenes artificially inoculated into sausages. Materials and methods. A survey asking about sausage cooking habits was completed with 50 housewives. We analyzed 60 samples of sausages previously inoculated with 10³ CFU g-1 from a pool of 5 strains of L. monocytogenes, then the cooking procedures described in the survey were applied to the samples, and counting was done immediately after. Additionally, a complementary test was carried out by inoculating 20 samples of sausages with 10³ CFU g-1 and exposing them to 72°C and 73°C for 30 seg. Results. The survey showed that 15 minute boiling and 5 minute frying are the most frequent ways of preparing sausages by consumers. We established that the time and cooking conditions used in our assay had a statistically significant effect (p: 0.016) on the inoculated samples. In the complementary assay, statistical data (p: 0.0001) indicated that internal temperatures of 73°C are enough to inactivate the pathogen at an industrial scale. Conclusion. Cooking by 15 minute boiling and 5 minute frying are enough to inactive concentrations of 10³ g-1 of Listeria monocytogenes artificially inoculated into sausages.

Objetivo. Determinar se o tempo utilizado pelos consumidores para cozinhar lingüiças são suficientes para a inativação de Listeria monocytogenes inoculada artificialmente neste produto. Materiais e métodos. Foram realizadas entrevistas a 50 donas de casa para perguntar sobre os hábitos de preparação das lingüiças. Foram analisadas 60 amostras de lingüiças para as quais foram inoculadas concentrações de 10³ UFC g-1 de um pool de 5 cepas de L. monocytogenes, foram utilizados procedimentos de cozimento indicados pelas entrevistas e foi feita uma contagem imediatamente. Além disso, foi realizada uma prova complementaria inoculando 20 amostras de lingüiças com populações de 10³ UFC g-1 e submetidas a 72 e 73°C por 30 segundos. Resultados. Através das entrevistas foi estabelecido que 15 minutos de cozimento e 5 minutos de fritura é a forma mais freqüente de preparação por parte dos consumidores, foi estabelecido que o tempo e as condições utilizadas neste estudo foi estatisticamente significativa (0,016) sobre a população inoculada. Na prova complementaria os dados estatísticos (p = 0,0001) indicaram que temperaturas internas de 73°C são suficientes para a inativação deste patógeno ao nível da indústria. Conclusão. Tempo de 15 minutos de cozimento e 5 minutos de fritura são suficientes para desativar as concentrações de 10³ g-1 de Listeria monocytogenes inoculadas artificialmente em lingüiças.

Rotavirus presence in a waste composting process. Organic fertilizers as vehicles for viral contamination

Objetivo: Demostrar la presencia de Rotavirus en las diferentes fases de un proceso de compostaje: matrices utilizadas como materia prima, mezcla a compostar y producto terminado. Materiales y métodos. El Rotavirus se determinó durante los tres procesos de compostaje. La detección viral se realizó por inmunocromatografía, ELISA y RT- PCR. Resultados. Se evidenció presencia viral en el primer proceso de compostaje, ausencia viral en el segundo y en el tercer proceso de compostaje, se presentaron interferencias que dificultaron interpretar los resultados de la PCR, lo cual impidió llegar a un resultado concluyente de su presencia en el abono. Conclusiones. Los abonos orgánicos pueden ser portadores de virus motivo por el cual se deben implementar pruebas de calidad para evitar que este material contribuya con la diseminación viral. Dentro de estos abonos existen sustancias capaces de interferir en las pruebas de detección.

Objective. To show the presence of rotavirus in different stages of a composting process: matrices used as raw material, mixture to be composted and the final product. Materials and methods. Immunochromatography, ELISA and RT-PCR were used for viral detection. Results. Rotavirus was found in the first composting step, no virus was found in the second step, and some inhibitory substances were found in the third step that posed difficulties in interpreting the PCR results and therefore providing a concluding result on rotavirus presence in the final product. Conclusions. Organic fertilizers can be vectors of human pathogenic viruses; therefore quality control tests must be implemented to avoid further viral dissemination. There are inhibitory substances present in organic fertilizers capable of interfering with the detection tests.

Objetivo. Demonstrar a presença de Rotavírus nas diferentes fases de um processo de compostagem: matrizes utilizadas como matéria-prima, mistura de composto e produto final. Materiais e métodos: A determinação do Rotavírus foi realizada nos três processos de compostagem. A detecção viral foi realizada por imunocromatografia, ELISA e RT-PCR. Resultados. Evidenciou-se a presença viral no primeiro processo de compostagem, ausência de vírus no segundo, e no terceiro processo de compostagem, apresentaram-se interferências que dificultaram a interpre tação dos resultados da PCR, tornando impossível chegar a um resultado conclusivo de sua presença no adubo. Conclusões. Os adubos orgânicos podem abrigar o vírus é por isso que se devem implementar provas de qualidade para evitar que esse material contribuía com a disseminação viral. Dentro desses fertilizantes existem substâncias capazes de interferir nas provas de detecção.

Simple preparation of new N-aryl-N-(3-indolmethyl) acetamides and their spectroscopic analysis

Objectives. To prepare new indolic molecules and characterize them by spectroscopic methods. Materials and methods: All reagents were purchased from Aldrich, commercial grade. The purity of the products and the composition of the reaction mixtures were monitored by thin layer chromatography over Silufol UV254 0.25 mm-thick chromatoplates. Product isolation and purification were performed by column chromatography (SiO2), using ethyl acetate-petroleum ether mixtures as eluents. Results. The synthesis of new N-aryl-N-(3-indolmethyl) acetamides based on first step iminization reaction of indol-3-carbaldehyde is accomplished. The structures of the C-3 substituted indoles were confirmed by ¹H-NMR and 13C-NMR studies supported by inverse-detected 2D NMR experiments and also through monocrystal X-ray diffraction. Conclusions. An efficient, economic, and fast synthetic route was designed to the construction of the N-aryl-N-(3-indolmethyl) acetamides, structural analogues of some alkaloids.

Objetivos: Preparar nuevas moléculas indólicas y caracterizarlas por los métodos espectroscópicos. Materiales y métodos. Todos los reactivos fueron adquiridos de Aldrich, de grado comercial. La pureza de los productos y composición de las mezclas de reacción fueron monitoreadas por la cromatografía en capa delgada, Silufol UV254 0.25 mm-grosor de cromatoplacas. El aislamiento y purificación de los productos fueron realizados por la cromatografía en columna (SiO2), usando mezclas de acetato de etilo y éter de petróleo como eluentes. Resultados. Se ha realizado la síntesis de nuevas N-aril-N-(3-indolmetil) acetamidas, basada en la reacción de iminización del indol-3-carbaldehído. Las estructuras de los indoles C-3 sustituidos fueron confirmadas por estudios de ¹H, 13C -RMN, experimentos de 2D RMN y también por difracción monocristal de Rayos X. Conclusiones. Se ha diseñado una nueva ruta de síntesis eficiente, económica y rápida para la construcción de las N-aril-N-(3-indolmetil) acetamidas, análogos estructurales de diversos alcaloides.

Objetivos. Preparar novas moléculas indólicas e caracterizar-las através de métodos espectroscópicos. Materiais e métodos. Todos os reagentes foram obtidos de Aldrich, de tipo comercial. A pureza dos produtos e a composição das misturas de reação foram monitoradas por cromatografia em camada fina, Silufol UV254 0,25 mm de espessura das cromatoplacas. O isolamento e a purificação dos produtos foram feitos através de cromatografia em coluna (SiO2), utilizando misturas de acetato de etila e éter de petróleo como eluente. Resultados. Realizou-se a síntese de novas N-aril-N-(3-indolmetil)acetamidas, baseada na reação de iminización do indol-3-carbaldeído. As estruturas dos indóis C-3 substituídos foram confirmadas por estudos de ¹H, 13C -RMN, experimentos de 2D RMN e também por difração monocristal dos Rayos X. Conclusões. Desenhou-se una nova rota de síntese eficiente, econômica e rápida para a construção das N-aril-N-(3-indolmetil) acetamidas, análogos estruturais de vários alcalóides.