Infectio

Epidemiologic situation of tuberculosis in Colombia, 2006

Objetivo. Evaluar la situación de la tuberculosis en Colombia en el año 2006, con el fin de identificar su comportamiento, los avances en su control durante los últimos años y reconocer retos y acciones por priorizar en los próximos años a la luz del plan mundial Alto a la tuberculosis y el plan estratégico Colombia libre de tuberculosis 2006-2015. Materiales y métodos. Se analizó mediante metodología descriptiva la información reportada al Sivigila y al Programa Nacional de Tuberculosis durante el 2006; se analizó la incidencia de tuberculosis según: porcentaje de necesidades básicas insatisfechas (NBI), raza, sexo y edad; y la coinfección tuberculosis/VIH. Resultados. En el 2006 se reportaron 10.696 casos nuevos de tuberculosis; la disminución en la incidencia se asocia principalmente a baja captación, aunque hay aumento de la forma extrapulmonar desde 1999 (r2=0,59) y la tuberculosis pulmonar infantil (6%); en los departamentos con el quintil más alto de NBI hay 1,8 veces más riesgo de enfermar que en aquéllos con el quintil más bajo de NBI; los indígenas y los afrocolombianos tienen el doble riesgo de enfermar con respecto al resto de la población; la coinfección tuberculosis/VIH fue de 5,8% en el 2006 y la curación fue de 78,9%. Discusión. La incidencia de tuberculosis está marcada por aspectos políticos, normativos, captación de sintomáticos respiratorios y cumplimiento de normas (como la baciloscopia seriada y el uso de cultivos); la coinfección tuberculosis/VIH tiene un papel importante en la presentación de la forma extrapulmonar. El seguimiento de casos ha mejorado; en el 2006 se evalúo el 90% de los casos registrados en el 2005, frente a 19% del año 2000.

Objective: To evaluate the tuberculosis situation in Colombia in 2006. To identifying tuberculosis present behavior, control advances during the last years and to acknowledge goals and actions to set priorities in the following years under the context of the global plan to stop tuberculosis and the strategic plan Colombia free of tuberculosis, 2006-2015. Materials and methods: Information reported to SIVIGILA and to the National Tuberculosis Program during 2006 was analyzed by descriptive methodology; tuberculosis incidence was analyzed according to percentage of unsatisfied basic need (UBN), ethnic group, gender, age, and TB/HIV co-infection. Outcomes: Colombia reported 10,696 new cases in 2006; incidence decrease is related mainly to low detection, however, there is an increase in extrapulmonary tuberculosis since 1999 (r2=0.59) and child pulmonary tuberculosis (6%). In the departments with the highest quintile of UBN there are 1.8 times more risk to become ill than in departments with the lowest NBI quintile. Indigenous and afro-Colombian population have double risk to become ill than other population. TB/HIV co-infection was 5.8%, during 2006, and cure for TB patients was 78.9% Discussion: Tuberculosis incidence is limited by political and normative aspects, search for respiratory symptomatic patients and norm application (like the baciloscopy application and use of cultures); TB/HIV co-infection has an important roll in the emergence of extrapulmonary tuberculosis. The National Tuberculosis Program has improved the cases followup; 90% of the cases registered in the 2005 cohort were evaluated in 2006, as opposed to 19% in the year 2000.

Contribution of M. tuberculosis IS6110 based RFLP assay to the design and refinement of tuberculosis control strategies in Colombia

Una alternativa de mejoramiento de las estrategias para el control de la tuberculosis, la ofrecen los métodos para la diferenciación de cepas de M. tuberculosis. La literatura evidencia que la técnica RFLP del segmento de inserción IS6110 está ampliamente estandarizada a nivel internacional y ha demostrado ser un buen instrumento para orientar estrategias locales de control. Mediante una revisión exhaustiva de la literatura, el presente estudio pretende establecer si esta técnica molecular puede contribuir al diseño y refinamiento de estrategias para el control de la tuberculosis en Colombia. En esta revisión se analizaron los resultados de los estudios publicados entre 1993 y 2008, realizados con la técnica en países en desarrollo, incluida Colombia. Los resultados sugieren que en el contexto colombiano esta técnica puede ofrecer información útil para los directores del programa de control de tuberculosis y, por tanto, debe seguir siendo realizada. Para establecer la periodicidad, las poblaciones blanco y otras condiciones óptimas para la realización de la técnica, se necesitan estudios de investigación operativa que incluyan análisis de costo-efectividad y costo-utilidad.

Molecular biology methods offer an alternative for improving tuberculosis control strategies through M. tuberculosis strain typing techniques. The international literature shows that RFLP of the insertion element IS6110 is widely standardized internationally and has proved to be a useful tool to guide local tuberculosis control strategies. By means of a thorough literature review, this study aimed to determine if this molecular based method could be useful for the design and refinement of tuberculosis control strategies in Colombia. Results from epidemiologic studies published between 1995 and 2008 which used this technique in developing countries, including Colombia, were analyzed. Our results suggest that in the Colombian context this molecular technique can provide useful information for tuberculosis program control directors and therefore it should continue to be performed. However, to establish periodicity, target populations and other aspects related to optimal conditions for accurate RFLP performance, must await further evidence from operational research studies including cost effectiveness and cost utility analyses.

**Detection of extended spectrum beta-lactamases (ESBL) in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated in a clinic in Villavicencio, Colombia**

Objetivo. Determinar la presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y su prevalencia en aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae causa de infección hospitalaria en una clínica de Villavicencio. Metodología. Se analizaron 50 aislamientos, 29 de E. coli y 21 de K. pneumoniae provenientes de pacientes hospitalizados en una clínica de segundo nivel de la ciudad de Villavicencio; se emplearon los métodos de difusión de disco de CLSI y el método confirmatorio para la detección de las BLEE de MicroScan® ESBL. Resultados. De 50 aislamientos, 3 (6%) presentaban BLEE, 2 K. pneumoniae y 1 E. coli. Estos aislamientos también mostraron resistencia con las fluoroquinolonas y el trimetoprim-sulfametoxazol. Los métodos de difusión de disco de CLSI y MicroScan® ESBL fueron concordantes en los resultados para la confirmación de la producción de BLEE. Conclusiones. El estudio permitió demostrar la producción de BLEE en K. pneumoniae y E. coli en una clínica de Villavicencio. Aunque es baja la frecuencia de BLEE, se sugiere seguir el uso restringido de cefalosporinas de tercera generación y fortalecer los mecanismos de control de la infección.

Introduction: Multirresistant microorganisms that produce ESBL are one of the main problems in hospitals. Objective: To establish the presence of extended spectrum ß-lactamases (ESBL) in Klebsiella pneumonia and Escherichia coli that produce nosocomial infections in a clinic in Villavicencio, Colombia. Methods: 50 strains were studied, 29 K. pneumoniae and 21 E. coli, from patients with nosocomial infections at a clinic in Villavicencio; CLSI disk diffusion of the test and ESBL MicroScan® as the confirmatory method were used. Results: ESBL producers were determined in 3 of 50 (6%) isolates, 2 of 21 K. pneumoniae and 1 of 29 E. coli. The disk diffusion procedure recommended by CLSI and MicroScan ® ESBL were in agreement about production and confirmation of ESBL (p>0.05). Conclusions: The study showed low ESBL producers in K. pneumoniae and E. coli in a second level clinic in Villavicencio. These results suggest restricting the use of broad spectrum β-lactamases cefalosporins to prevent ESBL dissemination at hospital level.

Rol of Hepatitis B virus genotype and precore/core variants on antiviral treatment response and clinical outcome

Entre 500.000 y 1000.000 de personas mueren anualmente en todo el mundo a causa de complicaciones relacionadas con la infección por el virus de la hepatitis B. Este virus presenta la tasa de mutación más alta entre los virus ADN que infectan al hombre. Aunque algunos de los genotipos del virus de la hepatitis B se han asociado al desarrollo de complicaciones durante la infección persistente, los estudios recientes sugieren un papel más importante a la aparición de ciertas variantes de este virus durante la infección. Una de las regiones del genoma del virus de la hepatitis B más analizadas y que presentan mayor frecuencia de mutaciones, es la región precore/core y el promotor correspondiente; la doble mutación (A1762T/G1764A) del promotor es la de mayor impacto sobre la replicación del virus de la hepatitis B y la respuesta a la terapia antiviral. En esta revisión se muestra el papel del genotipo y las variantes de la región precore/core del virus de la hepatitis B en el contexto del curso clínico y el tratamiento antiviral.

It is estimated that among 500,000 to 1 million deaths occurred annually worldwide due to complications associated to hepatitis B virus infection (HBV). The HBV has the higher mutation rate among DNA viruses that infect humans. Although some HBV genotypes have been associated with clinical complications during chronic infection, recently published data suggest a stronger role of HBV variants. Precore/core region and its promoter element are one of the HBV genomic segments with a higher mutation rate. The double mutation (A1762T/G1764A) in basal core promoter sequence results in dramatic viral replication changes and poor response to antiviral treatment. This review summarizes the present knowledge about the genotype and precore/core variants influence in clinical outcome, immune response evasion and antiviral therapy.

Malaria with hyperparasitemia treated with exchange transfusion: a case report

Dentro del cuadro clínico de la malaria y, especialmente, la malaria causada por Plasmodium falciparum, el grado de infestación se correlaciona con la gravedad del mismo y con el pronóstico de morbilidad y mortalidad. La exanguinotransfusión es una alternativa muy efectiva para disminuir la parasitemia de manera rápida y evitar la liberación de toxinas que se produce con la muerte del plasmodio. Presentamos un caso tratado con exanguinotransfusión realizada de manera manual con buen desenlace.

Within the clinical symptoms of malaria and especially malaria caused by Plamodium falciparum, the degree of infestation correlates with the severity of the same and with the prognosis of morbidity and mortality. The exchange transfusion is an alternative very effective in reducing the parasite quickly and prevent the release of toxins that happens with the death of Plasmodium. We report here a case treated with exchange transfusion done manually with good outcome.

Mechanisms of antibiotic resistance in Gram negative bacteria

Las infecciones por bacterias Gram negativas son muy prevalentes en pacientes hospitalizados, especialmente en las unidades de cuidados intensivos. La multirresistencia representa un reto terapéutico que deja pocas posibilidades para el tratamiento de estas infecciones. Los mecanismos que utilizan las bacterias para defenderse de los antibióticos están en constante evolución. Esta revisión describe los mecanismos de resistencia más frecuentemente utilizados por estas bacterias, haciendo énfasis en los antibióticos betalactámicos.

Infections caused by Gram negative bacteria are highly prevalent in hospitalized patients, especially in intensive care units. Multidrug resistant strains represent a therapeutic challenge, leaving very few possibilities for the treatment of such infections. The mechanisms that this bacteria use to defend themselves from antibiotics are constantly evolving. This review describes the most frequently used mechanisms of resistance by these germs, emphasizing on beta-lactam antibiotics.