Infectio

Captive animals at Barranquillas zoo are reservoirs of high resistance bacterial pathogens

Objetivo: Identificar y establecer la suceptibilidad antimicrobiana de bacterias patógenas halladas en el sistema gastrointestinal y el respiratorio de animales en cautiverio en el zoológico de Barranquilla. Materiales y métodos: Se tomaron muestras de cloacas y glotis de 30 aves, y frotis rectales y nasales de 29 mamíferos, los animales fueron inmovilizados mecánicamente y, luego, anestesiados. Las bacterias se identificaron con pruebas bioquímicas como: urea, SIM (sulfide-indole-motility medium), TSI (triple sugar iron), LIA (line immunoassay) y citrato. Algunos aislamientos se confirmaron con el sistema API 20E (Biomerieux, S.A., Marcy IEtoile, France) o Microscan® Neg combo panel type 32 (Dade behring, CA, USA). La sensibilidad a los antimicrobianos se evaluó con el método de Bauer y Kirby, teniendo en cuenta las normas del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Resultados: Se obtuvieron 89 cepas de bacterias; 45 de aves y 44 de mamíferos. Las más frecuentes fueron: Escherichia coli (n=31), K. pneumoniae (n=20), Enterobacter cloacae (n=10), Pseudomonas aeruginosa (n=5), Staphylococcusaureus (n=5) y P. stutzeri (n=4). Las bacterias Gram negativas y Staphylococci fueron resistentes respectivamente a las siguientes familias de antibióticos: tetraciclinas (28% y 57,1%), cloramfenicol (14,6% y 57,1%) y β-lactámicos (54,2% y 42,8%). El porcentaje de resistencia de las bacterias Gram negativas a las fluoroquinolonas fue de 6,1% y, a los aminoglucósidos, de 2,4%; el de los estafilococos a los macrólidos fue de 64,2%. Veinticuatro cepas (27%) fueron multiresistentes a múltiples antibióticos: 16 en aves (36%) y 8 en mamíferos (18%). Conclusión: La resistencia a uno o a varios antibióticos en las bacterias aisladas de los animales cautivos del zoológico de Barranquilla, es un factor de riesgo para su salud. A su vez, estos animales son reservorios de bacterias y de genes de resistencia, potencialmente importantes en la diseminación de estos factores de resistencia. Las similitudes en la resistencia bacteriana hallada en cepas animales y en cepas humanas, hacen presumir una movilidad de los clones de resistencia entre la especie Homo sapiensy las especies animales.

Objective: The objective is to determine respiratory and enteric bacterial pathogens and antimicrobial susceptibility in captive animals at Barranquilla Zoo. Materials and methods: Samples were taken from rectus and glottis in 30 birds and nasal and rectal swabs from 29 mammals, which were restricted mechanically and then anesthetized. Bacteria were identified by using biochemical tests such as: Urea, SIM, TSI, LIA and Citrate, some bacteria isolates were confirmed with API 20E (Biomerieux SA, Marcy IEtoile, France) or Micro scan® Neg combo panel type 32 (Dade Behring, CA, USA). Antimicrobial susceptibility was assessed using the Bauer and Kirby method and taking into account CLSI regulation. Results Eighty-nine strains were obtained, 45 from birds and 44 from mammals. The most frequent bacteria were: E. coli (n = 31), Klebsiella pneumoniae (n = 20), Enterobacter cloacae (n = 10), Pseudomonas aeruginosa (n = 5), Staphylococcusaureus(n = 5) and Pseudomonas stuzeri (n = 4). Gram negative bacteria and Staphylococciwere respectively resistant to the following antibiotics: tetracycline (28% and 57.1%), chloramphenicol (14.6% and 57.1%) and β-lactam (54.2% and 42.8); Gram-negative was (6.1%) resistant to Fluorquinolones and (2.4%) resistant to aminoglycosides; and Staphylococci were (64.2%) resistant to macrolides. Twenty-four (27%) were multi-resistant: 16 (36%) in birds and 8 (18%) in mammals. Conclusion: Resistance to one or more antibiotics in bacteria isolated from captive animals Barranquilla Zoo, is a risk factor for health for the animals themselves. The zoo animals are potential reservoirs for bacteria and resistance genes clinically important in the spread of these resistance factors. The resistance similarities found in animal and human strains suggest clone mobility between the sapiens species and the animals.

Genomic Characterization of HIV-1 in vitro Integration in Peripheral Blood Mononuclear Cells, Macrophages and Jurkat T Cells

Introducción: La mayor parte del genoma celular es accesible a la integración retroviral; sin embargo, se propone que este proceso no es aleatorio y es dependiente de cada retrovirus. Objetivos: Identificar y caracterizar las regiones del genoma humano en donde ocurre la integración del virus de la inmunodeficiencia humana de tipo 1 (VIH-1) en células mononucleares de sangre periférica, macrófagos y células T de Jurkat infectadas. Materiales y métodos: Se seleccionaron 300 secuencias de ADN humano obtenidas por el método de ligación mediada por PCR, previamente depositadas en el GenBank. Utilizando el programa BLAST, sólo 264 de ellas se incluyeron en el estudio, pues se pudo obtener información sobre localización cromosómica, genes anotados, secuencias repetidas, número de islas CpG y tiempo medio de replicación, entre otras variables genómicas. Estas secuencias se exportaron a otras bases de datos. Resultados: El 53% (140/264) de las integraciones se registraron en bandas G. El 70,45% de los provirus se localizaron en los genes humanos anotados, mientras que el restante lo hizo en elementos repetidos. En general, la selección del sitio de integración se relacionó con las características locales genómicas y estructurales de la cromatina, entre las que se incluyen secuencias Alu-Sx y L1, densidad génica y de islas CpG, remodelación de la cromatina y tiempo de replicación. Éstas influenciarían la interacción eficiente del complejo de preintegración con los genomas celulares. Conclusión: Se determinó que la integración del VIH-1 en los genomas celulares estudiados estaría condicionada por características diferenciales de la cromatina y por procesos epigenéticos que influirían la selección del sitio blanco de integración.

Introduction: Most of the infected host cell genome is available for retroviral integration; however, it has been proposed that this process does not occur at random and depends upon each type of retrovirus. Objective: The objective is to identify and characterize differences in human genome regions of peripheral blood mononuclear cells, macrophages and Jurkat T cells in which integration of HIV-1 occurs. Material and Methods: Three hundred human DNA genome sequences, previously deposited in the GenBank, were selected at random. Using program BLAST, only 264 of them were included in the study because relevant information about chromosomal position, associated genes, repetitive sequences, number of CpG islands and average replication time was available; these sequences were exported to other data bases for analysis. Results: 53% (140/264) of integrations were located on G bands. 70.45% of provirus was located in human genes and the rest was located in repetitive elements. In general the integration site selection was correlated with genomics and structural characteristics of cell chromatin including Alu-Sx and L1 sequences, gene and CpG island densities, remodeling of chromatin, and replication time. All of them would influence the efficient interaction between the pre-integration complex and target cell genomes. Conclusion: It was determined that HIV-1 integration in target cellular genomes would be conditioned by differential characteristics of associated chromatin and by epigenetic processes that would influence the selection of integration sites.

Prevalence of intestinal Protozoa in79 Children 2 to 5 years old from a state nursery in Circasia, Quindío

Introducción: Los parásitos intestinales se consideran un problema de salud pública en los países en desarrollo y afecta a individuos de todas las edades y sexos, pero se presentan, sobre todo, en los primeros años de vida. En la actualidad, entre las parasitosis más reportadas para el departamento del Quindío se encuentra la giardiasis, producida por Giardia intestinalis (G. duodenalis o G. lamblia), y la blastocistocis, producida por Blastocystis sp. Objetivo: Determinar la prevalencia de protozoos intestinales en 79 niños con edades comprendidas entre los 2 y 5 años, de un hogar infantil en el municipio de Circasia, Quindío. Materiales y métodos: Se recolectaron tres muestras de heces en 79 niños con previo consentimiento del tutor legal. Las muestras fueron sometidas al análisis de laboratorio por examen directo macroscópico y microscópico, utilizando lugol al 1%, solución salina al 0,83%, solución salina-eosina y la técnica de concentración de Ritchie o formol-éter. Resultados: Para los tres muestras, los parásitos con potencial patógeno tuvieron las siguientes prevalencias: Blastocystis sp., 49,4%, 57% y 64,6%; G. lamblia, 16,5%, 22,8% y 15,2 %; complejo Entamoeba histolytica/dispar, 5,1%, 5,1% y 1,3%, respectivamente. Conclusiones: Este estudio muestra la elevada prevalencia de parásitos protozoarios, y Blastocystis sp. fue el más prevalente. Durante el seguimiento se detectó reinfestación de los niños que participaron en el estudio.

Introduction: Intestinal parasites are a public health problem in developing countries, and they affect individuals of all ages and sexes; nevertheless they are frequent in early childhood. At present, the most reported intestinal parasite conditions in Quindío are giardiasis, caused by Giardia intestinalis (G. lamblia or G.duodenalis), and blastocystosis caused by Blastocystis sp. Objective: The objective is to determine the prevalence of intestinal parasites in children 2 to 5 years old at a State nursery in Circasia, Quindio. Materials and methods: Three fecal samples per child were collected from 79 children following informed consent from their legal guardians. Microscopic and macroscopic laboratory test were made using 1 % Lugol, 0,8 % saline solution, saline-eosin solution and concentration techniques with formaldehyde-ether (Ritchie.) Results: In the three fecal samples, the pathogen parasites had the following prevalence: Blastocystis sp 49,4 %, 57 % and 64,6 % Giardia lamblia 16,5 %, 22,8 % and 15,2 %; and Entamoeba histolytica/dispar 5,1 %, 5,1 % and.1>,3 % respectively. Conclusions: This study shows a high frequency of protozoa parasites, Blastocystis sp being the most prevalent. Re-infection in children was detected during the study.

Occult Hepatitis B co-infection in health center patients with HIV in Barranquilla, Colombia.

Objetivo: Establecer la frecuencia de la infección por Hepatitis B en los pacientes VIH positivos atendidos en la IPS VitalSalud de Barranquilla, Colombia. Métodos: Se realizó un perfil serológico para Hepatitis B en los pacientes VIH positivos, consistente en: HBs Ag, Anticore IgG. Estos exámenes se practicaron entre el mes de junio del 2007 hasta julio del 2009. Resultados: En 24 meses se realizaron exámenes para la detección de Hepatitis B en 103 pacientes VIH positivos. Hubo una prevalencia del 3,1% (tres pacientes) con Hepatitis B crónica. Cuatro pacientes fallecieron durante el período del estudio, ninguno positivo para infección por Hepatitis B. Se detectaron 6 pacientes con Ig G core para VHB positivo aislado, es decir con sospecha de Hepatitis B oculta, la cual se confirmó solo en un paciente con carga viral para ADN de VHB positiva (158 copias/ml). Este paciente no se hallaba usando lamivudina en el momento del examen. Conclusión: La prevalencia de Hepatitis B en nuestros pacientes corresponde a la reportada en todo el territorio nacional. La búsqueda de infección oculta por Virus de Hepatitis B en los pacientes VIH positivos asistentes a nuestra institución arrojó como resultado un solo paciente con esta patología y con una baja carga viral. La estrategia para el diagnóstico la infección oculta por VHB en los pacientes usando lamivudina debe ser más estudiada.

Objective: The objective is to establish the frequency of Hepatitis B (VHB) co-infection in HIV outpatients at VitalSalud Health Center in Barranquilla, Colombia. Methods: Two serological tests to diagnose Hepatitis B in our HIV patients were performed: Hepatitis B surface antigen and Anticore type Ig G (anti HBC Ig G). These tests were run between July, 2007 and July, 2009. Results: The tests were applied to 103 HIV patients. There was a prevalence of 3.1% (3 patients) for chronic Hepatitis B. Four patients passed away during the study term, none of them was Hepatitis B positive. Six patients with isolated anti HBc Ig G were detected, and only one of them had a positive viral load for VHB DNA (158 copies/ml). This patient was not taking lamivudine at the time of the test. Conclusions: The prevalence of VHB in our patients is similar to the prevalence reported in our country as a whole. The search for occult hepatitis B was positive, with a low viral load, in one out of 103 of our patients. The strategies for diagnosis of occult hepatitis B in HIV patients under lamivudine treatment require further research.

Pleural tuberculosis associated with adalimumab in a patient with rheumatoid arthritis

ResumenLa tuberculosis constituye, en nuestro medio, una de las enfermedades infecciosas endémicas. Con el advenimiento de las nuevas terapias para el control de la artritis reumatoide, como los inhibidores del factor de necrosis tumoral, la incidencia de casos de reactivación ha aumentado notoriamente.Se presenta el caso de una mujer de 42 años de edad, con disnea, dolor torácico, tos, derrame pleural con líquido pleural tipo exudado linfocítico, con deaminasa de adenosina (ADA) de 55 U-L e identificación de granuloma en la biopsia pleural. Se revisa la literatura y se hacen recomendaciones.

Tuberculosis (TB) represents one of the endemic infectious diseases in our population. The incidence of reactivate TB cases has grown notoriously with the onset of new therapeutic options for controlling rheumatoid arthritis (RA), such as tumor necrosis factor (TNF) inhibitors. The case of a 42 year old woman is highlighted. Her condition is characterized by shortness of breath, chest pain, cough, pleural effusion, linfocitic exudate pleural fluid, ADA 55 U-L and granuloma in pleural biopsy.A review of relevant literature and recommendations are presented.

Antimicrobial peptides

Resumen Los péptidos antimicrobianos son las moléculas efectoras del sistema inmune innato, cuyas familias se encuentran en casi todos los organismos, desde bacterias hasta mamíferos. Son una familia de sustancias polifacéticas con complejos mecanismos de acción relacionados con la interacción con el patógeno a través de su membrana, o afectando blancos internos, como la replicación del ADN y la síntesis de proteínas, e interactuando con el huésped con funciones inmunomoduladoras de la regulación del proceso inflamatorio y de la cicatrización. Aunque la generación de resistencia a los péptidos antimicrobianos es mucho menor si se compara con la generada por los antibióticos convencionales, existen mecanismos de resistencia ya descritos, como la degradación por proteasas, la liberación de proteínas inhibidoras o los cambios en la conformación de la membrana externa del patógeno. El estudio de estas sustancias ha permitido evidenciar sus usos potenciales en el ámbito clínico para contrarrestar los inconvenientes de la resistencia a los antibióticos; sin embargo, a pesar de los grandes avances logrados en este campo, aún quedan puntos controversiales por dilucidar.

The antimicrobial peptides (AMP) are the effectors molecules of the innate immune system, finding groups of this kind of substances in almost all living organisms from bacteria to mammals. They are a family of versatile substances with complexes action mechanisms in the pathogen they interact with membrane, DNA synthesis and protein synthesis and folding, and also with the host showing immunomodulatory functions in wound healing and inflammation process. Even though the generation of resistance to the AMP is lower compare with conventional antibiotics there are resistance mechanism already describe to this kind of substances like degradation by proteases, releasing of inhibitory substances or conformational changes in the external membrane of the pathogen. Actually the study of this group of substances has make them see as potential tools for clinical use helping to counteract the problem of antibiotic resistance, but even great progress had been made in this field there still exist some controversial issues for future study.

Occupational Exposure and Prevention Guidelines in Dental and Stomatological Settings - Una revisión bibliográfica

A review of the main infectious pathogens potentially transmissible to health care professionals during Dentistry and Odonto-Stomatological procedures is carried out, with particular attention focused on parenteral exposure in the dental, stomatological, and surgical environment. Epidemiological issues and specific risk factors are treated systematically based on available literature sources, together with all available, recommended chemo-prophylactic and immune-prophylactic strategies, as updated by the state of the art in this field.