Infectio

Ethics and Scientific Progress

Bogota, 2,600 Meters Closer to a Cautious Use of Antimicrobial Agents

Antimicrobial resistance of Staphylococus aureus at a hospital from the Colombian Orinoquia

Introducción: El objetivo de este estudio de cohorte retrospectivo fue analizar la resistencia de Staphylococcus aureus a los antibióticos en el Hospital Departamental de Villavicencio, centro de mediana y alta complejidad, entre 2005 y 2009. Materiales y métodos: Se analizaron los resultados de los estudios microbiológicos de los pacientes con cultivo positivo para S. aureus. No se hizo ninguna intervención. La variable de estudio fue la resistencia a la meticilina y el desenlace, la resistencia a los antimicrobianos. Resultados: Se tamizaron 29.451 estudios de microbiología y se encontraron 976 aislamientos de S. aureus, los cuales se analizaron para determinar su resistencia a los antibióticos por el método de microdilución en caldo. El 49,6 % de ellos (484) fueron clasificados como resistentes a la meticilina; se encontró un mayor grado de resistencia múltiple, especialmente para gentamicina (25,0% Vs. 2,9%), ciprofloxacina (25,1% Vs.2,4%), clindamicina (29,4% Vs.4,1%) y eritromicina (31,0% Vs.1,7%), y menor, para trimetoprim/sulfametoxazol (11,8% Vs.4,1%). Aunque era de esperarse que la resistencia simultánea para la vancomicina fuera muy baja, se encontraron algunas cepas intermedias y resistentes, pero este resultado no se puede analizar adecuadamente debido a que estas cepas no se remitieron a un laboratorio de referencia para pruebas de confirmación. La resistencia a la tetraciclina, aun en las cepas sensibles a la meticilina, fue alta. No se identificó ninguna cepa resistente al linezolid. No se realizaron estudios para evaluar la resistencia a la tigeciclina. Conclusiones: La resistencia de S. aureus a la meticilina es frecuente también en esta institución hospitalaria de la orinoquia colombiana. La resistencia múltiple es mayor en S. aureus resistente a la meticilina, especialmente a la gentamicina, la ciprofloxacina y la clindamicina. Cuando S. aureus es sensible a la meticilina, también se observa un alto grado de sensibilidad a estos antibióticos. Los hallazgos de sensibilidad a la ciprofloxacina y a la clindamicina en presencia de resistencia a la meticilina, sugieren la posibilidad de cepas asociadas a la comunidad en Villavicencio, al igual que en otras ciudades de Colombia, lo cual amerita estudios posteriores para confirmarlo.

Objective: Analyze the antimicrobial resistance patterns of Staphylococcus aureus at a hospital in Villavicencio, Colombia from 2005 to 2009. Design: Retrospective cohort study Setting: Villavicencio Departamental Hospital, a second and third level care center Target population: Patients’ microbiological records showing positive strains for S. aureus were analyzed. Interventions: None Variable: Methicillin resistance Outcomes: Antimicrobial resistance Results: Nine hundred and seventy six strains of S. aureus were isolated from 29,451 microbiological screened samples, and their antimicrobial resistance pattern was analyzed by standard micro-dilution broth tests. 49.6% strains were resistant to methicillin, and their co-resistance was higher mainly to gentamycin (25%), ciprofloxacin (25.1%), clindamycin (29.4%) and erythromycin (31.0), but lower to trimethoprim/sulfamethoxazole (11.8%). Although co-resistance to vancomycin was supposed to be low, some intermediate range and resistant isolates were found, but this statement cannot be established because they were not confirmed at a referenced laboratory. Tetracycline resistance was high even for methicillin sensitive stains. No resistance to linezolid was identified. Resistance to tigecycline was not evaluated. Conclusions: S. aureus resistance to methicillin is also common at the target hospital in the Colombian Orinoco region. Co-resistance is higher particularly to gentamycin, ciprofloxacin and clindamycin in methicillin resistant strains. High sensitivity to these antimicrobials is evidenced when S. aureus is also sensitive to methicillin. Some findings related to sensitivity to ciprofloxacin and clindamycin in the presence of methicillin resistance suggest the possibility of community- associated strains in Villavicencio as well as in other Colombian cities. This possibility deserves further confirmatory research.

Sanitary quality indicators and phenotyping of Salmonella enterica isolated from raw chickens marketed in urban area of Mérida, Venezuela

Objetivo: Evaluar la calidad sanitaria del pollo crudo que se expende en supermercados del área urbana del estado Mérida, Venezuela, y caracterizar fenotípicamente las cepas aisladas de Samonella enterica. Materiales y métodos: Se estudiaron 45 muestras de pollo crudo (15 correspondieron a pollo sin aliños, 15 con aliños y 15 de origen industrial). Los indicadores de calidad sanitaria evaluados fueron: bacterias aerobias mesófilas, coliformes totales, Escherichia coli y Staphylococcus aureus, utilizando la metodología de la Comisión Venezolana de Normas Industriales. La identificación microbiológica y serológica de Salmonella spp. se realizó mediante técnicas convencionales. La sensibilidad antimicrobiana se determinó por concentración inhibitoria mínima (CIM) y, para la detección de β-lactamasas de espectro expandido (BLEE), se utilizó la prueba del sinergismo del doble disco. La sensibilidad a desinfectantes se determinó por el método de dilución-neutralización. Resultados: Independientemente de las características de la muestra de pollo crudo (no industrial) y del establecimiento comercial, los indicadores: bacterias aerobias mesófilas, coliforme totales, E. coli y S. aureus, superaron significativamente los recuentos límites de aceptabilidad. Salmonella enterica se aisló en 20% de las muestras, y las serovariedades Heidelberg (55,6%) y Enteritidis (22,2%) fueron las más frecuentes. Estas variedades serológicas presentaron multirresistencia y producción de BLEE, pero fueron sensibles a los desinfectantes probados. Conclusión: Los pollos crudos con aliños y sin ellos, manufacturados en los establecimientos estudiados, no cumplen con la calidad microbiológica adecuada, lo que hace de ellos un producto perecedero a corto plazo y un nicho favorecedor de patógenos importantes que amenazan la salud de los consumidores.

Objectives: Evaluate the sanitary quality of raw chicken sold in the urban area of the State of Merida, Venezuela and characterize the phenotype of isolated Samonella enterica strains. Materials and methods: A total of 45 raw chicken samples were studied; 15 of them were without seasoning, 15 were with seasoning, and 15 were industrially processed. The following sanitary quality indicators were assessed: Mesophiles Aerobic Bacteria (MAB), total coliforms, E. coli and S. aureus, and the Venezuelan Commission of Industrial Norms methodology was used for that purpose. Microbiological and serological identification of Salmonella was carried out using conventional techniques. Antimicrobial susceptibility was determined by minimal inhibitory concentration (MIC) and the detection of extended-spectrum β- lactamases (ESBLs) was carried out by using the double disc synergy test. Susceptibility to disinfectants was determined by the dilution-neutralization method. Results. Regardless of the (not industrial) samples’ characteristics and/or the commercial establishment, it was determined that the ranges for MAB, total coliform, E. coli and S. aureus counts significantly exceeded limits of acceptability. Strains of Salmonella enterica were isolated in 20% of the samples, whose distribution showed that serovars Heidelberg (55.6%) and Enteritidis (22.2%) were the most frequent. These serovars showed multi-resistance to antibiotics and ESBLs production but were susceptible to the tested disinfectants. Conclusion. This study showed that raw chickens, with and without seasoning, processed in the surveyed commercial establishments do not meet the required microbiological quality standards suitable for human consumption. Therefore, these are short-term perishable products and a haven for important pathogens that threaten consumer health.

Secondary metabolite detection in Ambrosia peruviana Willd and determination of antibacterial and antihelmintic activity

En el conocimiento etnofarmacológico, Ambrosia peruviana es conocida como una planta antiinfecciosa y antihelmíntica. Dados los altos índices de resistencia bacteriana y parasitaria, se realizó la tamización fitoquímica preliminar siguiendo la metodología de Sanabria, y ensayos biológicos frente a aislamientos clínicos bacterianos, parásitos caninos y Artemia salina. Los ensayos de citotoxicidad en A. salina se realizaron por exposición de los adultos a concentraciones variables de los extractos. La actividad antibacteriana se realizó por los métodos de difusión en disco y concentración inhibitoria mínima (CIM). Se determinó el porcentaje de huevos que tenían el embrión del parásito, en el medio de cultivo se mantuvieron en lactato de Ringer con suplemento al 10% de RPMI y 1X ATM. Se determinó el porcentaje de huevos con embrión, o fecundados, liberados en el medio de cultivo con adición de extracto etanólico y acuoso secos de A. peruviana. Los ensayos de la especie vegetal frente a helmintos se realizaron al sumergir los adultos en medio con suplemento de extracto etanólico seco (usando diferentes concentraciones) y con fracciones ricas en alcaloides. Se identificó la presencia de alcaloides, glucósidos cardiotónicos, quinonas, flavonoides, carbohidratos, taninos y saponinas. La concentración letal media para el extracto etanólico seco fue 64,2 µg/ml, mientras que para el extracto acuoso fue de 840,4 µg/ml. Los extractos no presentaron actividad antibacteriana. Los ejemplares adultos de T. canis presentaron disminución de la motilidad frente a extractos secos, mientras que en la fracción de alcaloides murieron luego de 4 horas de exposición. Los extractos de A. peruviana sobre huevos de T. canis permitieron una disminución en el porcentaje de huevos con embrión que no dependía del extracto observado sino de la concentración empleada.

Ambrosia peruviana has been reported as an anti-infective and anti-parasitic plant in the ethno-pharmacological environment. Given the high rates of bacterial and parasitic resistance against commercial drugs recorded, we performed the preliminary phytochemical screening following Sanabria´s method and biological tests against clinical bacterial isolates, dog parasites, and Artemia salina. Cytotoxicity tests in Artemia salina were carried out by exposing adults to extracts of varied concentrations. The antibacterial activity was performed using the disk diffusion method and CIM. Toxocara canis nematodes were kept in Ringer´s lactate supplemented with 10% RPMI and 1X ATM. The embryo generation percentage of eggs released into the culture medium was evaluated adding ethanol and aqueous extracts of dried A. peruviana. The tests of A. peruviana against helminths were performed by immersing adults in a medium supplemented with dried ethanol extract (at various concentrations) and fractions rich in alkaloids. Phytochemical screening allowed preliminary identification of alkaloids, cardiotonic glucosides, quinones, flavonoids, carbohydrates, tannins and saponins. The LC50 for dry ethanol extract was 64.2µg/ml, while for the aqueous extract was 840.4µg/ml. The extracts did not show antibacterial activity. T. canis adults showed motility decrease against dried extracts, not so in alkaloid fraction where they died after a 4h exposure. The use of extracts from A. peruviana over Toxocara canis eggs caused a decrease in the percentage of embryo generation, which did not depend on the extract observed but on the concentration used.

Tuberculosis situation in Colombia 2007 - 2008 with emphasis in pediatric cases and coinfection TB-VIH

Objetivo: Describir la situación de la tuberculosis en Colombia durante los años 2007 y 2008, enfatizando en el comportamiento de la infección concomitante con virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) y de la tuberculosis pediátrica. Materiales y métodos: Se trató de un estudio descriptivo. La fuente de información fue el Programa Nacional de Control de la Tuberculosis. Los datos se recolectaron de los informes trimestrales de casos y actividades, y del análisis de cohortes que tiene implementado el programa en los departamentos y distritos del país. Resultados: Entre los años 2007 y 2008, se presentó un leve aumento en el reporte global de casos de tuberculosis en el país, pasando de 11.051 a 11.573; el grupo de edad más afectado fue el comprendido entre los 25 y los 34 años, y se reportaron más casos en hombres que en mujeres. Los casos de tuberculosis en menores de 15 años pasaron de 347 a 419. El número de pacientes con tuberculosis e infección concomitante por VIH reportados al Programa Nacional de Control de la Tuberculosis se duplicó, pasando de 218 casos a 457 entre 2007 y 2008; el mayor número de estos casos se presentó en hombres y en el grupo de edad entre los 25 y 44 años. Conclusiones: Se observa una mejora en la notificación, un aumento en el número de casos de tuberculosis en la población general y en la pediátr8ica, y de infección concomitante tuberculosis y VIH, al comparar los años 2007 y 2008. En cuanto a los indicadores programáticos generales, durante estos años el país no alcanzó las metas de captación, detección y curación.

Objective: To describe the status of Tuberculosis in Colombia during 2007 and 2008, emphasizing TB-HIV co-infection and pediatric TB behavior. Materials and Methods:ºThis is a descriptive study. The information source was the National TB Control Program (PNCT in Spanish). Data were collected from the cases and activities quarterly reports and the cohort analysis the national program has implemented in the departments and districts of the country. Outcomes: In 2007 and 2008 a slight increase, from 11,051 to 11,573 cases, in reporting tuberculosis cases of in the country was documented. The most affected age group included patients 25 to 34 years old, and there were more men than women among the reported cases. TB cases in 15 year olds and younger increased from 347 to 419, and the number of patients with TB-HIV coinfection reported to the NTCP doubled; that is, the number of cases went from 218 to 457 from 2007 to 2008. The largest number of cases occurred among men and the 25 to 44 year old group. Conclusions: An improvement in reporting cases has been observed, as well as an increase in the number of TB cases within the general, pediatric, and TB/HIV populations when comparing 2007 and 2008. In relation to general programmatic indicators, the country did not reach the detection and treatment goals during those years.

Ethics in scientific research: yellow fever, the Reed Commission and the origin of informed consent

Durante el siglo XIX las investigaciones en infectología y microbiología, confirmaron la teoría "contagionista" de la enfermedad, descartando la teoría miasmática, fomentando el desarrollo de técnicas para aislar los microorganismos causantes de las infecciones y descubriendo los mecanismos de trasmisión de la enfermedad. Ante la dificultad de tener modelos animales para varios grupos de enfermedades, la experimentación en seres humanos se hizo necesaria, incluyendo la autoinoculación de los investigadores. La historia de las investigaciones sobre la fiebre amarilla en Cuba es una experiencia paradigmática y fundamental de la salud pública y ejemplo del triunfo del planteamiento de la infectología. Sin embargo, las circunstancias subyacentes a los triunfos científicos sobre la peste americana relatan una historia menos conocida, caracterizada por el sacrificio y el heroísmo, de la cual surgen los fundamentos de la ética en la investigación científica y el origen del moderno consentimiento informado. Mucho antes del Código de Nuremberg, las investigaciones de Walter Reed y las teorías de Carlos Finlay interactuaron para establecer un hito histórico que derivó en el triunfo de la medicina científica, y en el origen de la documentación y formalización estricta del respeto a la integridad de los voluntarios que participan en la investigación.

During the Nineteenth Century, research on infectious diseases and microbiology confirmed the disease´s contagionist theory, thus ruling out the miasma theory and promoting the development of techniques to isolate the microorganisms that cause infections and the discovery of mechanisms for the disease´s transmission. Given the difficulty for having animal models for several disease groups, experimentation with humans, including the researchers´ selfinoculation, became necessary. The history of yellow fever research in Cuba is a Public Health´s fundamental and paradigmatic experience and an example of the approach to infectious diseases´ triumph. However, the circumstances underlying the scientific triumphs in the fight against the American Plague tell a less known story, marked by sacrifice and heroism, which generated the foundations for Scientific Research Ethics and the origin of modern Informed Consent. Long before the Nuremberg Code, Walter Reed´s research and Carlos Finlay´s theories interacted to establish a milestone that led to the triumph of scientific medicine and to the origin of respect for strict documentation related to the integrity of volunteers involved in research.

Intracranial infection and acute rhinosinusitis: three pediatric cases report

La rinosinusitis es una infección común en la población pediátrica, y entre sus complicaciones está la infección intracraneal que se relaciona con alta morbilidad y mortalidad. Es imprescindible un alto índice de sospecha para llegar así al diagnóstico temprano y brindar el tratamiento antibiótico y quirúrgico necesario. Presentamos nuestra experiencia de tres pacientes pediátricos con infección intracraneal secundaria a rinosinusitis.

Rhinosinusitis is a common infection in children and can present with intracranial complications associated with high morbidity and mortality. A high index of suspicion is essential to reach an early diagnosis, confirming it with imaging studies and initiating appropriate antibiotic and surgical treatment. Herein our experience with three pediatric patients with intracranial infection as a result of acute sinus infection has been presented.

Trimethoprim induced hyperkalemia in a patient with primary adrenal insufficiency

La hiperpotasemia inducida por el trimetoprim- sulfametoxasol es un efecto secundario relativamente común pero poco reconocido, independientemente de la dosis utilizada. Descrita inicialmente en 1983, se presenta en diversos tipos de pacientes; no obstante, existen condiciones que aumentan el riesgo de presentarla, entre las que se encuentra la insuficiencia suprarrenal. Reportamos el caso de un paciente con insuficiencia suprarrenal primaria que, posterior al uso de trimetoprim-sulfametoxazol, presentó hiperpotasemia e hiponatremia. Generalmente, la suspensión del fármaco es suficiente para normalizar los niveles séricos; en nuestro paciente, también se aumentó temporalmente la dosis de esteroides, con lo cual se logró una excelente respuesta clínica.

Hyperkalemia induced by trimethoprim therapy is a frequent, yet less thought-off complication associated with its use. Initially described in 1983, it has been reported in several different patient populations; nonetheless, some groups of patients have a higher risk of presenting it, amongst them patients with adrenal insufficiency. We describe a patient with primary adrenal insufficiency who developed hyperkalemia and hyponatremia after trimethoprimsulfamethoxazole therapy. Generally, drug suspension is all that is required to return potassium to normal levels; in our patient, a temporary increase in the steroid dose was also used, achieving an excellent clinical response.

Bacteriemia by Elizabethkingia meningoseptica in acute linfoblastic leukemia patients

Se reporta un caso de bacteriemia por Elizabethkingia meningoseptica en un paciente inmunocomprometido, con antecedentes de leucemia linfoblástica aguda, que ingresa por infiltración al sistema nervioso central y sospecha de proceso infeccioso. Elizabethkingia meningoseptica es una bacteria oportunista en infecciones intrahospitalarias, con notable resistencia antimicrobiana, la cual es un inusual patógeno en humanos.

A case report of bacteraemia by Elizabethkingia meningoseptica in an immunocompromised patient, who was admitted to the hospital with an acute Linfoblastic leukemia and infection diagnosis, is presented. E. meningoseptica is an emerging bacterium in nosocomial infections with remarkable antimicrobial resistance and an unusual pathogen in humans.