Infectio

Highly Active Antiretroviral Therapy in the real world: Reaching the challenge of the last 90

Risk factors for the development of community-acquired urinary tract infection, by extended-spectrum beta-lactamase producing microorganisms, at two hospitals in Bogotá, Colombia

Abstract Objetivo: Determinar factores de riesgo para infección urinaria por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) adquirida en la comunidad en pacientes adultos. Material y método: Estudio de casos y controles, en el período comprendido entre enero de 2012 a mayo de 2015, en dos hospitales de Bogotá D.C., Colombia. Pareo por edad, año del aislamiento, microorganismo y género. Se excluyeron pacientes con antecedente de infección por un microorganismo productor de BLEE en el último mes e infección urinaria asociada al cuidado de la salud. Resultados: Se analizaron 555 pacientes: 185 casos y 370 controles. 462 pacientes (83,2%) de la Fundación Clínica Shaio y 93 (16,8%) del Hospital Santa Clara. Factores de riesgo identificados: Infección urinaria recurrente (OR 2,13 con IC de 1,48 a 3,07), enfermedad renal crónica (OR 1,56, IC del 95% de 1,07 a 2,27), uso previo de antibióticos (OR 3,46, IC del 95% de 2,48 a 5,35), hospitalización reciente (OR 3,0, IC del 95% de 1,96 a 2,45), diabetes mellitus (OR 1,61 con IC del 95% de 1,06 a 2,45) e infección urinaria alta (OR 2,64 con IC del 95% de 1,61 a 4,32). Conclusiones: Los factores de riesgo para microorganismos productores de BLEE adquiridos en la comunidad fueron en orden de frecuencia: antecedente de antibioticoterapia reciente, hospitalización previa, presencia de infección urinaria alta, así como los antecedentes de infección urinaria recurrente, enfermedad renal crónica y diabetes mellitus, lo que concuerda con los principales hallazgos descritos en la literatura mundial.

Resumen Aims: To determine risk factors for the development of community-acquired urinary tract infection, by extended-spectrum beta-lactamase producing microorganisms, in adult patients. Materials and methods: A case-control study in the period from January 2012 to May 2015, in two hospitals in Bogota, Colombia. Matching for age, year of isolation, microorganism and gender. We excluded patients with a history of infection with extended-spectrum beta-lactamase producing microorganisms in the last month and urinary infection associated with health care. Results: 555 patients were analyzed.185 cases and 370 controls. 462 patients (83.2%) from Fundación Clínica Shaio and 93 (16.8%) from Hospital Santa Clara. Identified risk factors: recurrent urinary tract infection (OR= 2.13, 95% CI= 1.48 - 3.07), chronic kidney disease (OR= 1.56, 95% CI= 1.07 - 2.27), previous use of antibiotics (OR= 3.46, 95% CI= 2.48 - 5.35), recent hospitalization (OR= 3.0, 95% CI= 1.96 to 2.45), diabetes mellitus (OR= 1.61, 95% CI= 1.06 - 2.45) and upper urinary tract infection (OR= 2.64, 95% CI= 1.61 - 4.32). Conclusions: The risk factors community-acquired urinary tract infection, by extended-spectrum beta-lactamase producing microorganisms, were in order of frequency: history of recent antibiotic therapy, prior hospitalization, the presence of high urinary infection, history of recurrent urinary tract infection, chronic kidney disease and diabetes mellitus. The described risk factors are consistent with the main findings described in the literature.

Early infections in transplant patients in a quaternary care hospital.

Resumen Objetivo: Determinar las características epidemiológicas, clínicas y microbiológicas de las infecciones tempranas en pacientes trasplantados en un hospital de alta complejidad. Materiales y métodos: Se realizó un estudio descriptivo retrospectivo transversal utilizando la base de datos del centro de trasplantes y las historias clínicas de los pacientes trasplantados. Se incluyeron pacientes que adquirieron infección en el primer mes pos trasplante. El análisis de los datos se realizó en el software estadístico SPSS 21.0 (r), se calcularon medidas descriptivas y de asociación (chi cuadrado y test exacto de Fisher). Resultados: Se estudiaron 53 pacientes trasplantados. La prevalencia de infecciones tempranas fue de 24,7%. La prevalencia por tipo de trasplante fue: para trasplante combinado hígado/riñón 50%, para trasplante de intestino 33,3%, para trasplante de hígado 28,8% y para trasplante renal 21,6%. Las infecciones más frecuentes fueron: infección el tracto urinario (43,4%), bacteriemia (26,4%) e infección del sitio operatorio (22,6%). Las infecciones bacterianas fueron las más predominantes con un 88,6%, seguidas por las infecciones fúngicas en un 7,5 % y las virales en un 3,7%. Los microorganismos más frecuentes fueron: Escherichia coli (60,4%), Klebsiella pneumoniae (17%), y Staphylococcus aureus (5,7%). El 41,5% de los microrganismos presentaron multirresistencia, de éstos Escherichia coli con un 54,5% y Klebsiella pneumoniae con un 40,9%, productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE). Conclusiones: Las infecciones bacterianas fueron las más frecuentes, en su mayoría asociadas a la atención en salud, con mayor prevalencia de infección del tracto urinario y un alto porcentaje de multirresistencia antimicrobiana.

Abstract Objective: To determine the epidemiological, clinical and microbiological characteristics of early infections in transplant patients in a quaternary care hospital. Materials and methods: A cross-sectional retrospective study was performed using the database transplant center and the medical records of transplant patients.The study included transplant patients who acquired infection in the first month after transplant. The data analysis was performed using SPSS 21.0 statistical software, descriptive and association measures (chi squared and Fisher exact test) were calculated. Results: The study included 53 transplant patients. The prevalence of early infections was 24.7%. The prevalence according to the type of transplant were: 50% in combined liver-kidney transplantation, 33,3% in intestine, 28,8% in liver and 21,6% in kidney transplantation. The most frecuent infections were: urinary tract infection (43.4 %), bacteremia (26,4%) and surgical site infection (22,6%). Bacterial infections were the most predominant (88,6 %), followed by fungal (7,5%) and viral infections (3,7%). The most frecuent microorganisms were Escherichia coli (60,4%) , Klebsiella pneumoniae (17%), and Staphylococcus aureus (5,7%). 41,5% of microorganisms evidenced multidrug resistance, Escherichia coli (54,5%) and Klebsiella pneumoniae (40,9 %), extended-spectrum beta-lactamase producers ( ESBL). Conclusions: Bacterial infections were the most frecuent, mostly associated with health care, with higher prevalence of urinary tract infection and a high percentage of multidrug resistance.

Salmonella spp. isolation and identification in eggs for human consumption from different urban areas in Bogotá, Colombia, 2015

Objetivo: Determinar la prevalencia de Salmonella spp. en muestras de huevos para consumo humano en localidades de Bogotá. Materiales y métodos: Se obtuvieron 96 muestras en tiendas y plazas de mercado de 4 localidades de la ciudad. Se procesó de forma separada la cáscara y el contenido interno mediante métodos microbiológicos y moleculares para aislamiento e identificación Salmonella spp. Resultados: Se determinó una prevalencia total de Salmonella spp. de 9,4% (n=9), de ésta el 55% (n = 5) provenían del contenido interno y 44% (n = 4) de cáscara, sin embargo no se logró tipificar el serovar de Salmonella enterica presente. Las localidades con mayor presencia del patógeno fueron Usaquén y Fontibón. Discusión: Estudios realizados en Colombia evidencian bajas prevalencias de Salmonella spp. (0 -1,74%) en muestras de huevos, sin embargo los hallazgos de este estudio evidencian una mayor recuperación, lo que podría asociarse con inadecuadas condiciones de manejo y/o almacenamiento del producto. Conclusión: Se estableció la presencia de Salmonella spp. en las muestras de huevo evaluadas, lo que implica un riesgo potencial para la salud pública, por lo que es necesario ampliar este tipo de estudios para conocer la situación real a nivel nacional frente a este patógeno.

Abstract Objective: To determine the prevalence of Salmonella spp presence in eggs for human consumption in urban areas in Bogota. Materials and methods: 96 samples were collected from convenience stores and markets in 4 urban areas in the city. The eggshells were separated from the egg's internal content and both were processed separately using microbiological and molecular techniques to isolate and identify Salmonella spp. strains. Results: A Salmonella spp. prevalence of 9.4% (n=9) was found. Salmonella spp was isolated from the egg's internal content in 55% (n=5) of samples and 44% (n=4) from the eggshells. The Salmonella enterica serovar could not be identified. The pathogen was more frequently isolate in samples from Usaquén and Fontibón urban areas. Discussion: Studies of Salmonella spp. prevalence in eggs done in Colombia have shown it to be low (0-1.74%); However, this study determined a higher prevalence. These results suggest that inadequate handling/storage conditions could have been associated with them. Conclusion: Salmonella spp. was isolated from the egg samples from 4 different urban areas in Bogotá. These findings suggest the existence of a public health risk; therefore, there is a need to perform wider and more complete studies to determine the actual situation of Salmonella ssp. egg contamination in the country.

Morbidity, mortality and therapeutic failure in adolescents with HIV/AIDS in a referal hospital in Caracas, Venezuela

Resumen Objetivo: describir las causas de morbilidad, mortalidad y de falla antirretroviral y relacionarlo con el mecanismo de adquisición del virus en adolescentes con VIH / SIDA atendidos en el Hospital Universitario de Caracas, período 2009 - 2013. Métodos: Estudio descriptivo de tipo retrospectivo a través del seguimiento de una cohorte. Se recolectaron los datos de las historias clínicas de pacientes con infección por VIH/SIDA con edades comprendidas entre 10 y 19 años del Hospital Universitario de Caracas durante el período 2009 - 2013. Resultados: se analizaron 79 historias y registros, según el mecanismo de transmisión, 29 (36,71 %) fueron de transmisión vertical (TV) y 50 (63,29 %) de transmisión horizontal (TH). La principal enfermedad oportunista encontrada fue tuberculosis, y no se encontró diferencias significativas para padecerla según el mecanismo de transmisión (p: 0,54). Al considerar los factores demográficos y diagnóstico inicial se observó que a una mayor edad de diagnóstico hay menor probabilidad de falla antirretroviral (OR: 0,75). Así mismo, independientemente del mecanismo de transmisión, sexo y tratamiento inicial el 50% de los pacientes presentará falla virológica luego de 90 meses de tratamiento. Discusión: el aumento en el número de casos de VIH en la población adolescente en Venezuela es un tema de relevancia en Salud Pública. Se necesita realizar un estudio en donde se apliquen estrategias dirigidas a mejorar las causas asociadas a la poca adherencia a los medicamentos antirretrovirales en esta población y determinar si dicha estrategia permite disminuir el número de fallas.

Abstract Objective: To describe the causes of morbidity, mortality and antiretroviral failure and to relate them to the mechanism of acquisition of the virus in adolescents with HIV / AIDS treated at the Hospital Universitario de Caracas, in the period 2009 - 2013. Methods: Descriptive, retrospective analysis of the follow up of a cohort. Data from patient with HIV / AIDS aged between 10 and 19 years of the Hospital Universitario de Caracas during the period 2009 - 2013. Results: 79 records were analyzed, according to the transmission mechanism 29 (36.7%) acquired the virus by vertical transmission and 50 (63.2%) by horizontal transmission. The main opportunistic disease was tuberculosis, and no significant differences were found to have it according to the transmission mechanism (p: 0.54). When considering demographic factors and initial diagnosis it was observed that when diagnosis was made at older age there were less probability of antiretroviral failure (OR: 0.75). Also, 50% of patients presented virologic failure after 90 months of treatment independently of the transmission mechanism, gender or type of initial treatment. Discussion: The increase in the number of HIV cases in the adolescent population in Venezuela is a major issue in public health. It is important to study which strategies can improve poor adherence to antiretroviral drugs in this population and to determine whether this strategy can decrease the number of failures.

First year monitoring of antiretroviral therapy in naïve patients in a tertiary hospital

Resumen Objetivo: El objetivo principal de este trabajo es determinar la tasa de fracaso virológico (FV) en pacientes naive que inician tratamiento antirretroviral (TAR) a 24 y 48 semanas en vida real en un hospital de tercer nivel. Material y método: Estudio retrospectivo de 3 años de duración. Se seleccionaron pacientes adultos VIH naive que iniciaron TAR entre 2012 y 2014. Se registraron datos demográficos (edad, sexo y nacionalidad), clínicos (mecanismo de trasmisión y estadio clínico), de laboratorio (carga viral (CV), linfocitos CD4 basales y existencia de test de mutaciones previo) y TAR elegido. Tras 24 y 48 semanas se registraron: CV y CD4, adherencia, seguimiento, problemas relacionados con la medicación, cambios de TAR y motivos de cambio. Resultados: Se seleccionaron 253 pacientes. 244 y 226 contaban con datos analíticos a las 24 y 48 semanas respectivamente. 142 (58,23%) tenían CV<50 copias/ml y 204 (83,6%) CV<200 copias/ml tras 24 semanas. 198 (88,4%) tenían CV<50 copias/ml y 217 (96,0%) CV<200 copias/ml tras 48. La CV basal superior a 100.000 copias/ml y la mala adherencia se asociaron con un mayor riesgo de FV. Al 30,0% de pacientes se les cambió el TAR durante el primer año, principalmente por efectos secundarios (31,6%) y simplificación del tratamiento (23,7%). Discusión y Conclusiones: Un alto porcentaje de pacientes que inician TAR están indetectables o con menos de 200 copias/ml dentro del primer año de tratamiento. A pesar de tener fármacos altamente eficaces y cada vez mejor tolerados, los efectos secundarios siguen siendo el motivo mayoritario de cambio de TAR.

Abstract Background and objective: The main objective of this work is to determine the rate of virologic failure (VF) intreatment-naïve patients, 24 and 48 weeks after starting antiretroviral therapy (ART) in real life in a tertiary hospital. Patients and Methods: A retrospective study of 3 years duration. Naïve HIV adult patients who started ART between 2012 and 2014 were selected. Demographics (age, sex and nationality), clinical (transmission mechanism and clinical stage), laboratory (viral load (VL), baseline CD4 and existence of prior mutations test) and TAR chosen were recorded. VL and CD4, adherence, monitoring, medication-related problems, changes and reasons for changing ART were registered at 24 and 48 weeks. Results: Of 253 patients selected, analytical data was available for 244 and 226 at 24 and 48 weeks, respectively. After 24 weeks, VL was <50 copies/ml in 142 (58.23%) patients and <200 copies/ml in 204 (83.6%). After 48 weeks, the same values were 198 (88.4%) and 217 (96.0%), respectively. Baseline VL above 100,000 copies/ml and poor adhesion to treatment were associated with an increased risk of VF. Thirty per cent of patients switched ART during the first year, mainly because of side effects (31.6%) and simplification of treatment (23.7%). Conclusions: VL became undetectable or under 200 copies/ml in a high percentage of patients starting ART within the first year of treatment. Despite the increasingeffectiveness and tolerability of available drugs, side effects remain as the major reason for changing ART.

Chemical composition, antimicrobial and antioxidant activities of Echinophora platyloba essential oil

Resumen Objetivo: Echinophora platyloba se utiliza tradicionalmente como agente antimicrobiano con el fin de preservar los productos caseros de deterioro. El objetivo de este estudio fue evaluar la composición química del aceite esencial, actividad antimicrobiana y antioxidante del aceite esencial de E. platyloba de la provincia de Shahr-e-Kord. Materiales y métodos: la composición química del aceite esencial de E. platyloba mediante técnicas de GC-MS y GC y evaluar su efecto antibacteriano frente a Staphylococcus aureus, Salmonella enterica y Helicobacter pylori por ensayos de difusión en disco y de micro dilución en caldo. La actividad antioxidante del aceite esencial de E. platyloba se evaluó por los radicales ABST. β-ocimeno y α-cariofileno eran los componentes principales del aceite esencial de E. platyloba. El aceite esencial mostró la actividad antibacteriana prometido contra S. aureus, seguido de S. enterica y H. pylori. El aceite esencial presenta actividad antioxidante del aceite esencial mostró la IC50 de 0. 32 mg/ml que fue mayor que la IC50 de ácido ascórbico (0.20 mg/ml). En conclusión : Aceite esencial de E. platyloba ha se recomienda ß-ocimeno y quimiotipo α-cariofileno y su uso como agentes antioxidantes y antibacterianas como sus usos tradicionales.

Abstract Objective: Echinophora platyloba is traditionally used as antimicrobial agent in order to preserve the home-made products from deterioration. The aim of this study was to evaluate chemical composition of essential oil, antimicrobial and antioxidant activity of E. platyloba essential oil from Shahr-E-Kord city, Chaharmahal and Bakhtiari Province. Materials and methods: chemical composition of E. platyloba essential oil by GC and GC-MS techniques and evaluate its antibacterial effect against Staphylococcus aureus, Salmonella enterica and Helicobacter pylori by disc diffusion and micro broth dilution assays. The antioxidant activity of E. platyloba essential oil was evaluated by ABST radicals. β-ocimene and α-caryophyllene were the main components of E. platyloba essential oil. The essential oil showed the promised antibacterial activity against S. aureus, followed by S. enterica and H. pylori. The antioxidant activity evaluation of essential oil showed the IC50 of 0.32 mg/ml that was higher than the IC50 of ascorbic acid (0.20 mg/ml). In conclusion , E. platyloba essential oil has β-ocimene and α-caryophyllene chemotype and its use as antioxidant and antibacterial agents is recommended as its traditional uses.

Practical recommendations for skin preparation of Surgical Site

Resumen La búsqueda de estrategias para la disminución de la infección de sitio operatorio (ISO) es una prioridad, dado el impacto que ésta tiene en los resultados de la atención de los pacientes. Recientemente ha tomado gran relevancia en la prevención de la ISO, la preparación prequirúrgica de la piel del paciente como uno de los factores clave, en los que se puede intervenir y disminuir el riesgo. En los últimos años han aparecido revisiones exhaustivas dedicadas no solo a la comparación de las soluciones antisépticas, y técnica de aplicación, también acerca de la importancia del baño pre operatorio, uso de cintas y compresas quirúrgicas impregnadas con antisépticos y el recorte de cabello preoperatorio. En esta publicación se describen los hallazgos más importantes relacionados con la preparación antiséptica de la piel del paciente y se propone un protocolo con recomendaciones prácticas para ser implementado en las instituciones del país. Se incluyen recomendaciones basadas en niveles de evidencia sobre el uso de las soluciones antisépticas (yodopovidona, clorhexidina, clorhexidina mas alcohol, entre otras) con énfasis en las ventajas y desventajas de cada una de ellas.

Abstract The search for strategies for reduction of Surgical Site infection (SSI) is a priority, given the impact that infections have on the outcome of the patients. The preoperative patient skin antisepsis, has recently gained greater significance in the prevention of SSI, as one of the critical factors, which can be intervened and can reduce the risk of infection. In recent years, comprehensive investigations have been published not only dedicated to the comparison of antiseptic solutions, application techniques, but also about the importance of preoperative bathing, use of surgical tapes and dressings impregnated with antiseptics, and preoperative shaving. This review outlines the key findings related to the preoperative patient's skin antisepsis and offers a protocol with practical recommendations to be implemented in the institutions of our country. It provides evidence based recommendations about the use of antiseptic solutions (povidone iodine, chlorhexidine, chlorhexidine plus alcohol, etc.) with emphasis on the advantages and disadvantages of each one.

First case of haemophagocytic syndrome associated to probable infection with Rickettsia of spotted fever group, Meta, Colombia

Resumen El presente estudio describe un caso de síndrome hemofagocítico (SHF) probablemente asociado a la infección por una especie de Rickettsia del grupo de las fiebres manchadas (GFM). La paciente fue una niña de ocho años procedente de un área rural tropical del departamento del Meta, en el Oriente Colombiano, la cual fue admitida en el Hospital de Villavicencio con fiebre alta de tres días de evolución, dolor de cabeza, erupción, astenia, dolor abdominal, linfadenopatias y hepatoesplenomegalia. Los estudios serológicos para HIV, hepatitis, citomegalovirus, virus Epstein Barr entre otros resultaron negativos. La paciente fue admitida en un estudio de fiebres tropicales indiferenciadas, las muestras de suero pareadas fueron analizadas mediante inmunofluorescencia indirecta (IFI) para detección de anticuerpos IgG contra Rickettsia spp., del GFM y se encontró seroconversión de títulos de anticuerpos entre fase aguda (IgG 1:64) y convaleciente (IgG 1:1024). Dada la rápida remisión de las manifestaciones clínicas tras la instauración del tratamiento con doxiciclina, la causa del síndrome hemofagocítico fue atribuido a la infección por Rickettsia spp del GFM.

Abstract This study describes a case of hemophagocytic syndrome (SHF) probably associated with infection by a species of Rickettsia spotted fever group (SFG). The patient was an eight years old girl from a rural tropical area of Meta department, in eastern of Colombia, which was admitted to the Hospital of Villavicencio with high fever three days of evolution, headache, rash, asthenia, abdominal pain, lymphadenopathy and hepato-splenomegaly. Serological analyses for HIV, hepatitis, cytomega- lovirus, Epstein Barr virus, and other were negatives. The patient was admitted in undifferentiated tropical fevers and paired serum samples were analyzed through the indirect immunofluorescence assay (IFI) to detect antibodies IgG against Rickettsia of SFG. Antibodies titles in acute phase (IgG 1:64) and convalescent phase (IgG 1:1024) demonstrated seroconvertion. Because the rapid remission of clinical manifestations after treatment with doxiciclina, the cause of hematophagocitic syndrome was attributed to the infection by rickettsia of SFG.

Acute disseminated histoplasmosis in an immunocompetent child

Resumen La histoplasmosis es una patología endémica en Colombia. La verdadera incidencia en nuestro país es desconocida. En niños inmunocompetentes generalmente es un proceso autolimitado. Algunos casos pueden resultar un dilema diagnóstico por su amplio espectro de manifestaciones clínicas y diagnósticos diferenciales o por las dificultades de su confirmación sobre todo en zonas endémicas. Describimos el caso de un niño inmunocompetente con histoplasmosis diseminada aguda e importante compromiso respiratorio resaltando los dilemas que podrían presentarse en su diagnóstico y manejo.

Abstract Histoplasmosis is an endemic pathology in Colombia but its real incidence in the country is unknown. In non-immunocompromised children, the mycosis is mainly a self-limited process. In endemic zones certain cases may represent a diagnostic dilemma due to the broad spectrum of clinical manifestations that complicate differential diagnosis and hinder the proper diagnosis. We describe the case of an immunocompetent child diagnosed with acute disseminated histoplasmosis who exhibited extensive respiratory involvement highlighting the dilemmas faced when attempting to establish the diagnosis and defining management.