Infectio

Which will be the future of the education for infectious diseases specialists in Colombia?

Usefulness of lactate in cerebrospinal fluid as a biomarker of bacterial meningitis

Resumen Objetivo: Determinar la utilidad del lactato en líquido cefalorraquídeo como biomarcador de meningitis bacteriana en pacientes atendidos en el Hospital Universitario de San Vicente Fundación en el año 2014. Material y método: Estudio retrospectivo de corte transversal para la evaluación de una prueba diagnóstica, conformado por 103 pacientes con sospecha clínica de meningitis bacteriana y a los cuales se les solicitó: lactato, citoquímico y cultivo bacteriano en líquido cefalorraquídeo durante el año 2014. La meningitis fue clasificada como confirmada, compatible y descartada. Resultado: Se incluyeron 103 pacientes, de los cuales el 69% eran hombres. La edad promedio fue de 37 años (DS ± 22). La concentración de lactato en líquido cefalorraquídeo fue mayor en los pacientes con meningitis bacteriana confirmada que en aquellos con descartada (p < 0,001). Con un punto de corte de 4,0 mmol/L, se obtuvo una sensibilidad de 91% (95% IC 81-100%) y una especificidad de 92% (95% IC 84-99%). Discusión: Se obtuvo una alta sensibilidad y especificidad comparable con estudios previos, mostrando que el lactato en líquido cefalorraquídeo tiene un importante poder discriminatorio para meningitis bacteriana. Conclusiones: El lactato en líquido cefalorraquídeo es un biomarcador rápido, sensible y específico para el diagnóstico de meningitis bacteriana al usar 4,0 mmol/L como valor discriminante.

Abstract Objective: To determine the usefulness of lactate in cerebrospinal fluid as a biomarker of bacterial meningitis in patients treated at the Hospital Universitario de San Vicente Fundación in 2014. Material and method: Retrospective cross-sectional study for the evaluation of a diagnostic test, conformed by 103 patients with clinical suspicion of bacterial meningitis and who were asked for lactate, cytochemistry and bacterial culture in cerebrospinal fluid during 2014. Meningitis was classified as confirmed, compatible and discarded. Results: A total of 103 patients were included, of whom 69% were men. The average age was 37 years (DS ± 22). The concentration of lactate in cerebrospinal fluid was higher in patients with confirmed bacterial meningitis than in those with discarded (p < 0.001). With a cut-off point of 4,0 mmol/L, a sensitivity of 91% was obtained (95% CI 81-100%) and a specificity of 92% (95% CI 84-99%). Discussion: A high sensitivity and specificity was obtained comparable with previous studies, showing that the lactate in cerebrospinal fluid has an important discriminatory power for bacterial meningitis. Conclusions: Lactate in cerebrospinal fluid is a fast, sensitive and specific biomarker for the diagnosis of bacterial meningitis using 4.0 mmol/L as discriminant value.

Fractal behavior of infections associated with health care at Meissen Hospital ESE II Level, for the years 2011, 2012 and 2013.

Resumen Introducción: la dimensión fractal estadística ha sido de utilidad para la caracterización de diversos fenómenos, incluyendo la dinámica cardiaca fetal y del adulto, así como comportamientos asociados al sistema inmune. Las Infecciones Asociadas al Cuidado de la Salud son un problema de salud de alta importancia a nivel mundial. Objetivo: establecer el comportamiento fractal estadístico de la frecuencia de aparición de Infecciones Asociadas al Cuidado de la Salud. Material y métodos: Se aplicó la ley de Zipf-Mandelbrot a la distribución de frecuencias de aparición agrupadas por especialidad de Infecciones Asociadas al Cuidado de la Salud en el Hospital Meissen ESE II Nivel, para los años 2011, 2012 y 2013. Se calculó la dimensión fractal estadística para cada año, hallando los rangos en los que se desenvuelve la dinámica en estos años y posteriormente se realizaron simulaciones de estas dinámicas anuales. Resultados: Se observó un comportamiento a escala de la dinámica de aparición de Infecciones Asociadas al Cuidado de la Salud por especialidad, los valores de la dimensión fractal fue de 0,6104, 0,7560 y 0,4332 para los años 2011, 2012 y 2013 respectivamente. Conclusión: La ley de Zipf/Mandelbrot permite caracterizar de forma objetiva y reproducible el comportamiento de la frecuencia de aparición de las Infecciones Asociadas al Cuidado de la Salud en el tiempo; las dimensiones fractales acotadas consecutivas en el tiempo permitirían generar predicciones, constituyendo una herramienta de ayuda para la vigilancia epidemiológica y la clínica.

Abstract Introduction: The statistical fractal dimension has been useful for the characterization of diverse phenomena, including the fetal and adult cardiac dynamics, as well as the behaviors associated with the immune system. Health Care Associated Infections are a major health problem worldwide. Objective: to establish the statistical fractal behavior of the frequency of occurrence of Health Care Associated Infections. Material and methods: The Zipf-Mandelbrot law was applied to the frequency distribution of occurrences grouped by Health Care Associated Infections in II level at Meissen ESE Hospital for the years 2011, 2012 and 2013. The statistical fractal dimension was calculated for each year, finding the ranges in which the dynamics develops in these years and later simulations of these annual dynamics were carried out. Results: Scale behavior of the dynamics of occurrence of Health Care Associated Infections by specialty was observed; the values of fractal dimension were 0.6104, 0.7560 and 0.4332 for the years 2011, 2012 and 2013 respectively. Conclusion: The law of Zipf / Mandelbrot allows to characterize objectively and reproducibly the behavior of the frequency of occurrence of Health Care Associated Infections over time; the consecutive bounded fractal dimensions over time would allow predictions to be generated, constituting an aid tool for epidemiological and clinical surveillance.

Systematic review: The potency of Zataria multiflora Boiss in treatment of vaginal infections

Abstract Vaginitis as female infectious disease is accompanied with some clinical symptoms such as vaginal abnormal discharges, itching, burning and many other unpleasant signs in patients. The responsible microorganisms in vaginitis are belonged to different kind of microorganisms including bacteria (Gardenella vaginitis), yeast (Candida albicans) and protozoa (Trichomonas vaginalis). The current treatments of these infections are chemical oral and vaginal drugs with many adverse effects for patients. Furthermore, appearance of resistant microorganisms to these drugs has intensified the treatment’s problem. The aim of this review article was to evaluate the potency of “Zataria multiflora” essential oil in treatment of women’s vaginitis. For preparing this manuscript, the information was extracted from different electronic and published resources. Investigation in different resources showed there were 6 clinical trials that evaluate it as suitable treatment for vaginitis. 5 clinical studies have been focused on 0.1% Z. multiflora essential oils in treatment of bacterial vaginosis (n=1), candidiasis (n=1) and trichomoniasis (n=1). Two clinical studies were related to treatments of bacterial vaginosis, trichomoniasis and mixed infection. There is one clinical study for treatment of candidiasis by 1% Z. multiflora methanol extract. Z. multiflora was formulated in cream form and applied for 5-7 continuous days. The results of clinical trials showed that Z. multiflora essential oil (0.1%) can be used as safe and efficient alternative treatment for treatment of bacterial vaginosis, candidiasis and to a lesser extent for trichomoniasis.

Resumen La vaginitis es una enfermedad infecciosa femenina acompañada de algunos síntomas como flujo vaginal, prurito, sensación de ardor y otros síntomas de incomodidad para las pacientes. Los microorganismos responsables de vaginitis son variados e incluyen bacterias (Gardenella vaginitis), hongos (Candida albicans) y protozoos (Trichomonas vaginalis). Los tratamientos utilizados actualmente son medicamentos de uso oral o vaginal con potenciales efectos adversos. Adicionalmente se encuentran organismos resistentes a estos tratamientos, lo que ha llevado a la búsqueda de nuevas alternativas. El propósito de esta revisión sistemática fue evaluar la potencia del aceite esencia de “Zataria multiflora” para el tratamientos de la vaginitis. Se realizó una búsqueda en recursos bibliográficos y bases de datos electrónicos. Se encontraron seis ensayos clínicos que evaluaron este aceite para el tratamiento de la vaginitis. En 5 estudios clínicos se utilizó aceite esencial al 0.1% de Z. multiflora para el tratamiento de vaginosis bacteriana (n=1), candidiasis (n=1) y tricomoniasis (n=1) y en tres estudios se usó para tratamiento tanto de infecciones bacterianas, tricomoniasisi o mixtas. Se encontró un estudio para tratamiento de la candidiasis con extracto en metanol 1% de Z. multiflora. Se hizo formulación de Z. multiflora en crema tópica y aplicada por 5-7 días continuos. Los resultados mostraron que el aceite esencial de Z. multiflora (0.1%) puede ser usado de manera segura y eficiente como alternativa en vaginosis bacteriana, candidiasis y en menor grado para tricomoniasis.

Transmitted HIV-1 resistance in never exposed to antiretroviral therapy patients, Cali-Colombia 2008-2015

Resumen Objetivo: Determinar la frecuencia de resistencias transmitidas en pacientes VIH no expuestos a terapia antirretroviral. Metodología: Estudio transversal, entre 2008 y 2015 participaron 342 pacientes mayores de 18 años, con infección VIH-1, sin exposición a antirretrovirales, con genotipo de resistencias previo al inicio con antirretrovirales y consentimiento informado. Se incluyeron mutaciones de resistencias definidas por Organización Mundial de Salud (OMS)-2009 e internacional AIDS Society-USA 2015. Se recolectaron características sociodemográficas y clínicas relacionadas con VIH. Resultados: Edad promedio 32±10,5 años; 74% hombres. Al genotipo, mediana de carga viral 26.802 copias/mL, y 343 células T-CD4/mm3 . Según lista de Organización Mundial de Salud-2009 la frecuencia de mutaciones fue 3.2% y considerando mutaciones de internacional AIDS Society y base de datos VIH-Stanford, esta fue 7.9%. Mutaciones más comunes: K103N/S (2.1%), Q58E (2%), V108I y E138A (1.2%). Mutaciones en transcriptasa reversa 4.4% para inhibidores no nucleosídicos y 1.2% para nucleosídicos; para inhibidores de proteasa 2.3%. En pacientes con probable infección retroviral <1 año, la prevalencia de resistencias transmitidas, según la lista de OMS-2009, fue 7.3%, mientras que, con infección ≥1 año fue 1.6% (p=0.008). Conclusión: En pacientes con probable infección <1 año, la frecuencia de mutaciones transmitidas superó el umbral recomendado por la Organización Mundial de Salud para implementar genotipo de resistencias.

Abstract Introduction: This study determined the frequency of transmitted drug resistance in patients not exposed to ART, attended in Cali-Colombia. Methodology: A cross-sectional study between 2008 and 2015 involved 342 patients older than 18 years, with confirmed HIV infection, without exposure to antiretrovirals, with resistance genotype prior to initiation of antiretroviral and informed consent. Resistance mutations defined by WHO-2009 and international AIDS Society-USA 2015 were included. Sociodemographic and clinical characteristics related to HIV were also collected. Results: The mean age was 32 ± 10.5 years; 74% were men. At the time of genotype, median viral load was 26,802 copies / mL, and 343 T-CD4 / mm3 cells. According to the WHO-2009 list, the frequency of mutations was 3.2% and considering the AIDS Society-USA list and the Stanford HIV database mutations, this reached 7.9%. The most common mutations were K103N/S (2.1%), Q58E (2%), V108I and E138A (1.2%). Reverse transcriptase mutations were found in 4.4% for non-nucleoside inhibitors and 1.2% for nucleoside; for protease inhibitors were 2.3%. In patients with retroviral infection <1 year, the transmitted resistances prevalence, using only the WHO-2009 list, reach 7.3%, while in those with ≥1 year only was 1.6% (p=0.008). Conclusions: The frequency of transmitted mutations in naïve patients with retroviral infection <1 year exceeded the prevalence threshold recommended by the WHO to implement the resistance genotype.

Survey of Knowledge, Attittudes and Practices about Antibiotic Use in Colombian Physicians

Resumen Describir algunos conocimientos, actitudes y prácticas de médicos en 3 ciudades colombianas con respecto a la prescripción de antibióticos. Se realizó una encuesta sobre conocimientos, actitudes y prácticas de la prescripción de antibióticos en médicos asistentes a 3 conferencias científicas de la Asociación Colombiana de Infectología en Febrero de 2008. La encuesta fue anónima e individual. Los resultados se analizaron usando Excel 2007 y STATA 2000. Se realizaron 96 encuestas a 29 médicos generales y 67 médicos especialistas. Entre el 29,2% y el 67,42% tienen conocimientos equivocados respecto a la prescripción de antibióticos. El 97,4% de los médicos encuestados considera que la venta de antibióticos debe realizarse únicamente bajo prescripción médica. La mayoría de los encuestados reconoce limitaciones del intervalo de dosificación y de la seguridad para la prescripción de antibióticos. El 60% se mostró en desacuerdo con la aplicación de guías de otros países en nuestros medio y el 76% de los consideran que los infectólogos aportan al manejo clínico de los pacientes. El 72% de los encuestados reportó tener apoyo de un infectólogo y en su institución existen estrategias de restricción de uso de antibióticos, refieren además utilizar asilamiento de contacto frente a organismos multiresistentes. Las respuestas no son significativamente diferentes de acuerdo a los años de experiencia. Los médicos reportaron en su mayoría prácticas conservadoras y racionales del uso de antibióticos aunque algunas limitaciones en el conocimiento farmacológico de los mismos.

Abstract Describe knowledge, attittudes and, practices about antibiotic use in Colombian physicians from three different cities. We applied a voluntary survey about knowledge, attittudes and practices about antibiotic prescription at three scientific meetings of the Asociacion Colombiana de Infectología, on February 2008. The survey was anonimous and individual. The results were analyzed using Excel 2007 and STATA 2000. We analyzed 96 surveys, 29 from general practitioners and 67 medical specialists. Physicians had wrong knowledge about antibiotic use between 29,2% and 67,42%. Most physicians (97.4%) considered the antibiotics have to be sold only under medical prescription. Many physicians recognized having limited knowledge about antibiotic dosing interval and security. 60% physicians disagreed with the application of guidelines from other countries in our enviroment and 76% physician consider the infectious disease experts contribute to clinical management of patients. Physicians reported having support from an infectious disease expert on 72%, and had strategies to restrict the use of some antibiotics, likecontact isolation when multi-resistant organisms had been suspected. There were not differences between answers according to years of experience. Several physcians reported conservative practices and rational antibiotic use with limited knowledge about antibiotic pharmacokinetics and pharmacodynamics.

Molecular characterization of rotaviruses isolated from calves with bovine neonatal diarrhea (BND) in Colombia

Abstract Bovine rotaviruses are one of the main agents involved in the presentation of Bovine Neonatal Diarrhea (BND), a disease that affects calves in the first month of life. Objective: The present study aimed to determine the types of bovine rotaviruses that affect dairy herds in the Sabana region of Bogotá, Colombia. Materials and methods: 132 fecal samples were obtained from calves of less than five weeks of age and subjected to an ELISA test. MA104 cell cultures were infected with positive samples in order to isolate rotaviruses. The presence of the viral genome was confirmed by amplification and sequencing of a region of the viral VP7 protein-encoding gene. Results: Of the 132 samples, 26 (19, 7%) were ELISA-positive and nine samples were used for viral isolation. PCR amplification was achieved in all infected cultures. Sequencing showed homology of five samples to the G6 genotype. In addition, the presence of the G10 genotype was first determined for the country. Discussion: A greater presence of the G6 genotype from lineage V was found in the Sabana region of Bogota, showing a high prevalence in cattle and association with the presence of BND. The presence of the G10 genotype is a new report for the country and constitutes a new element of investigation in these viruses.

Resumen Los rotavirus bovinos son unos de los principales agentes involucrados en la presentación del síndrome de Diarrea Neonatal Bovina (DNB), una enfermedad que afecta terneros en el primer mes de vida. Objetivo: El presente estudio buscó determinar los tipos de rotavirus que afectan los hatos ganaderos de leche en la región de la Sabana de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos: Se evaluaron a través de una prueba de ELISA, 132 muestras de materia fecal provenientes de terneros de menos de cinco semanas de edad. Con las muestras positivas, se infectaron células MA 104 con el fin hacer aislamiento. La presencia del genoma viral se verificó por amplificación de una región del gen que codifica para la proteína viral VP-7 y luego se secuenció. Resultados: De las 132 muestras evaluadas, 26 (19,7%) fueron positivas por ELISA. De estas, 9 muestras se emplearon para aislamiento viral. La amplificación de genoma viral por PCR se obtuvo en todos los cultivos infectados. La secuenciación evidenció una homología de 5 muestras con el genotipo G6 y la presencia del genotipo G10, que se encontró por primera vez en el país. Discusión: En la Sabana de Bogotá se encontró una mayor presencia del genotipo G6, linaje V, que tiene alta prevalencia en bovinos y está asociado mayoritariamente con la presencia de DNB. La presencia del genotipo G10 constituye un elemento nuevo de investigación en estos virus.

Frequency of mixed onychomycosis with total nail dystrophy in patients attended in a Guatemalan Dermatology Center

Abstract Introduction: Onychomycosis are fungal nail infections that can be caused by dermatophytes, non-dermatophytic molds and yeasts, which are capable of breaking down keratin. Mixed onychomycosis are a controversial subject and they are the outcome of the combination of two dermatophytes, dermatophytes/nondermatophytic molds or dermatophytes/yeast. Objetives: To determine the frequency of total dystrophic onychomycosis caused by more than one etiological agent (mixed onychomycosis) in outpatients from a Dermatologic Center in Guatemala and to establish the characteristics associated with this fungal infection. Methods: Prospective observational study from August to December of 2012. Nail samples were obtained from patients with total dystrophic onychomycosis to identify the causal agents by culture in Sabouraud dextrose and Mycosel® agar. Results: 32 of 130 patients had mixed onychomycosis. 68.5% were associated to tinea pedis. The most common association was between T. rubrum + Candida, T. rubrum + M. canis and T. rubrum + opportunist fungi. Conclusions: Mixed onychomycosis represent 25% of the total dystrophic onychomycosis in Guatemala. We observed an important relationship between diabetes and the main association was T. rubrum with Candida spp.

Resumen Introducción: Las onicomicosis son infecciones fúngicas de las uñas que pueden ser causadas por dermatofitos, mohos no dermatofitos y levaduras, que son capaces de degradar la queratina. Las onicomicosis mixtas son un tema polémico y es el resultado de la combinación de dos dermatofitos, dermatofitos / mohos no dermatofitos o dermatofitos / levadura. Objetivos: Determinar la frecuencia de la onicomicosis distrófica total causada por más de un agente etiológico (onicomicosis mixta) en pacientes ambulatorios de un Centro Dermatológico en Guatemala y establecer las características asociadas a esta infección fúngica. Métodos: Estudio observacional prospectivo de agosto a diciembre de 2012. Se obtuvieron muestras de uñas de pacientes con onicomicosis distrófica total para identificar los agentes causales en cultivo de agar dextrosa Sabouraud y Mycosel®. Resultados: 32 de 130 pacientes tenían onicomicosis mixta. 68.5% se asociaron a tinea pedis. La asociación más común fue entre T. rubrum + Candida, T. rubrum + M. canis y T. rubrum + hongos oportunistas. Conclusiones: La onicomicosis mixta representa el 25% de la onicomicosis distrófica total en Guatemala. Observamos una relación importante entre la diabetes y la asociación principal fue T. rubrum con Candida spp.

Livestock production and emergency antibiotic resistance in Colombia: Systematic review

Resumen El uso extensivo de antibióticos es una práctica comúnmente realizada para aumentar la producción pecuaria. Así, la crianza animal demanda una fuerte presión selectiva para prevenir brotes de infecciones pero que también podría resultar en la emergencia de cepas multidrogoresistentes. El propósito de esta revisión, es documentar la posible contribución de las practicas pecuarias en la emergencia de patógenos zoonóticos que exhiben resistencia a antibióticos en Colombia. Los patógenos resistentes a antibióticos reportados con mayor frecuencia y asociados a alimentos fueron Salmonella sp. y Escherichia coli. Se encontró que el uso no terapéutico y abuso de antibióticos β-lactámicos, macrólidos y tetraciclinas constituyen la mayor presión selectiva. Adicionalmente, se encontraron estudios locales que reportan la contaminación de fuentes ambientales y alimentos con trazas de antibióticos. La aparición de patógenos resistentes a antibióticos de uso veterinario podría ser producto de la precaria implementación de buenas prácticas pecuarias entorno al componente de sanidad animal.

Abstract The extensive use of antibiotics is a common practice to increase livestock production. Thus, animal husbandry entails a high selective pressure to control infectious outbreaks which also might result in the emergence of multidrug resistant strains. This review’s aim is to survey cases associated with zoonotic pathogens showing antibiotic resistance in Colombia. The resistant pathogens most commonly isolated from the food chain were Salmonella sp. and Escherichia coli. The nontherapeutic and abuse of antibiotics such as β-lactams, macrolides and tetracycline represented the most critical selective pressure. Furthermore, environmental and food contamination with traces of antibiotics have been found in different local studies. Rise of resistant pathogens to veterinary drugs might result due poor implementation of good farming practices in the animal health plan.

Mechanic ventilation complicated with infections: Need of preventive measures