Infectio

The knowledge validation process: the fundamental value of the scientific journal

Ad-hoc group consensus recommendations on the evaluation and quality control of molecular and serological diagnostics tests for SARS CoV-2 human infection

Resumen Se formulan recomendaciones de un grupo de consenso de expertos sobre los criterios para evaluar el desempeño diagnóstico (tamaño y selección de muestras para sensibilidad y especificidad analíticas, criterios para establecer límites de detección, criterios para establecer el estándar de oro para las serologías) que deberían ser tenidos en cuenta al evaluar y validar las pruebas diagnósticas para SARS CoV-2. Con el propósito de asegurar la calidad de las pruebas serológicas a utilizar en el país, se recomienda la participación en un programa de control de calidad externo, que garantice la idoneidad y desempeño en la realización de las pruebas diagnósticas serológicas y moleculares durante esta pandemia, ya que su uso tiene profundas implicaciones para las medidas de intervención clínicas individuales y de seguimiento y control en salud pública.

Abstract We formulate recommendations from a consensus working group on the criteria to evaluate the diagnostic performance (size and criteria of selection of samples to determine sensitivity, analytical specificity, criteria for limit of detection, criteria for gold standard to evaluate serological assays) that should be taken into account during the evaluation and validation/verification of diagnostic tests for SARS CoV-2 infection. A national external quality control program should be established to guarantee the suitability and performance of these diagnostic serological and molecular tests during this pandemic, that will have deep implications for decisions on clinical and public health.

Toward to establish selection criteria for rapid serological tests for COVID-19

Abstract COVID-19, the new pandemic is associated to SARS-CoV-2 virus infection. Social distancing and the testing have been the principal measures that have shown to be effective for the reduction of critical cases. Although the gold standard for diagnosis of COVID-19 is the RT-PCR, rapid serological tests could also be used for prevalence studies, and for epidemiological monitoring. In order to characterize the humoral immune response, we analyzed eight immunochromatographic test and one ELISA test, as a verification or secondary validation analysis used positive and negative control serum samples. Sera from negative and positive individuals [asymptomatic or symptomatic individuals, outpatient or inpatientor (intensive care unit)] were analyzed, and the following results were found: of all these rapid tests, only 4 exhibit clear banding patterns for IgG and two of these also showed results for IgM (only in a few symptomatic patients). Instead, with an ELISA test a preferential recognition was observed for symptomatic patients who were critically ill, whereas in asymptomatic individuals it did not show more than 25% of positivity. Understanding and validating molecular and serological tests are an essential component for the design of public health measures to response to the pandemic.

Resumen COVID-19 la nueva pandemia está asociada con la infección por el virus SARS-CoV-2. La distancia social y el análisis masivo de muestras son las principales medidas que se han mostrado efectivas para la reducción de los casos críticos. Aunque el estándar de oro para el diagnóstico de COVID-19 es la RT-PCR, las pruebas serológicas rápidas podrían también ser usadas en estudios de prevalencia, así como en la vigilancia epidemiológica. Con el fin de caracterizar la respuesta inmune humoral, analizamos ocho pruebas inmunocromatográficas y una prueba de ELISA, en un proceso de verificación de desempeño o validación secundaria, usando sueros control positivos y negativos. Los sueros de pacientes positivos y negativos [individuos asintomáticos o sintomáticos, pacientes ambulatorios u hospitalizados (en cuidados intensivos)] fueron analizados, encontrando los siguientes resultados: de todas las pruebas rápidas examinadas solamente 4 mostraron un claro patrón de bandas para IgG, de éstas, dos de ellas también mostraron resultados para IgM (solamente en pocos pacientes sintomáticos). En cambio, con la prueba de ELISA un reconocimiento preferencial fue observado en pacientes sintomáticos con enfermedad crítica, mientras que los individuos asintomáticos no mostraron más de un 25 % de positividad. Comprender y validar las pruebas serológicas son componentes esenciales en el diseño de las medidas de políticas públicas como respuesta a esta pandemia.

Human immune response to SARS-CoV-2: What is known? A scoping review

Abstract Monitoring literature on the broad spectrum of the human immune response to SARS-CoV-2 is important to understand the mechanisms and progression of COVID-19. The present study undertakes a scoping review of the literature on human immune response to SARS-CoV-2 to determine the characteristics of innate and adaptive responses, as well as biomarkers and cells that play a role in the development of the infection. We searched papers in MEDLINE/PUBMED and EMBASE databases published since December 1st 2019 to to April 9th 2020 from which we selected 56 for this study. We found that the immune response is characterized by high levels of acute phase reactants, neutrophilia, low levels of NKs and eosinophils, lymphopenia, cytokine storm syndrome, exhausted T cells, impaired cytotoxic response, inadequate helper response and production of specific antibodies; concluding that immune dysregulation correlates with disease severity and high mortality.

Resumen El seguimiento de la literatura sobre la respuesta inmune humana al SARS-CoV-2 es importante para comprender los mecanismos y la progresión de COVID-19. En el presente estudio se realizó un Scoping Review de la literatura sobre la respuesta inmune humana al SARS-CoV-2 para determinar las características de la respuesta inmune innata y adaptativa, así como biomarcadores y células que juegan un papel en el desarrollo de la infección. Buscamos artículos en las bases de datos MEDLINE / PUBMED y EMBASE publicados desde el 1 de diciembre de 2019 hasta el 9 de abril de 2020, de los cuales seleccionamos 56 publicaciones para este estudio. Encontramos que la respuesta inmune se caracteriza por altos niveles de reactantes de fase aguda, neutrofilia, bajos niveles de NKs y eosinófilos, linfopenia, síndrome de tormenta de citoquinas, linfocitos T agotados, respuesta citotóxica alterada, respuesta T helper inadecuada y producción de anticuerpos específicos. En conclusión, el desequilibrio inmune se correlaciona con la severidad y la mortalidad de la enfermedad.

Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia

Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud. Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia

RESUMEN I. Antecedentes de infección SARS-CoV-2/COVID-19. La enfermedad por Coronavirus 2019, (Coronavirus Disease 2019, COVID-19), es el nombre asignado a la patología causada por la infección por el Coronavirus del Síndrome Respiratorio Agudo Severo o Grave- 2 (Severe Respiratory Acute Syndrome 2, SARS-CoV-2); descrita desde diciembre de 2019 en pacientes de la ciudad Wuhan, provincia de Hubei, China. Con una rápida expansión mundial, que en menos de tres meses ha sido declarada pandemia y con amplia morbi y mortalidad relacionada. A la fecha, la Organización Mundial de la Salud (OMS) ha declarado siete situaciones epidemiológicas, bajo la evaluación del Comité de Emergencias del Reglamento Sanitario Internacional (de 2005), como Emergencia Sanitaria de Preocupación Internacional. Todas estas epidemias y pandemias previas han provisto información acerca del comportamiento epidemiológico y clínico de dichas enfermedades infecciosas, así como la forma en la cual han respondido los países y las autoridades de salud regionales y nacionales frente a las mismas. II. Definiciones operativas de casos de infección por SARS-CoV-2/COVID-19. Reconocer tempranamente a los pacientes en quien es adecuado sospechar infección por SARS-CoV-2/COVID-19 además de permitir el inicio oportuno de las medidas de prevención y control de infecciones, también facilita el pronto inicio de terapias adecuadas, la admisión hospitalaria y optimización de recursos. Por tal motivo es necesario que las definiciones de infección y enfermedad sean reflejo de las manifestaciones clínicas más frecuentes e idealmente específicas, demostradas en las series de casos y otros estudios realizados a nivel mundial y en lo posible en poblaciones similares. Tras la revisión de la literatura se concluyó que la presencia de síntomas respiratorios y gastrointestinales, así como hallazgos neurológicos como la disgeusia y anosmia, en pacientes con fiebre, sin olvidar que puede haber casos afebriles, son hallazgos que permiten identificar a la mayoría de pacientes con infección por SARS-CoV-2/COVID-19; por otra parte la exposición a pacientes infectados con el virus, en lo que se ha denominado como "contacto estrecho", permite identificar a los individuos con mayor riesgo de infección y que requieren de estrategias epidemiológicas y de salud pública en aras de limitar la diseminación de la infección. Adicionalmente se recomienda una estrategia basada en herramientas tecnológicas para la atención de pacientes con sintomatología leve y sospecha de infección por SARS-CoV-2/COVID-19 y para el direccionamiento hospitalario de casos de mayor severidad, buscando aliviar la congestión hospitalaria en el escenario de la pandemia. III. Clasificación clínica de casos y estratificación del riesgo de infección SARS-CoV-2/COVID-19. Los factores de riesgo para mal pronóstico de la enfermedad incluyen población mayor a 60 años, tabaquismo, enfermedad cardiovascular, diabetes mellitus, enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC), hipertensión arterial (HTA) y cáncer. Las categorías clínicas de la infección por SARS-CoV-2/COVID-19 de acuerdo con la gravedad, se fundamentan en la guía clínica de la Organización Mundial de la Salud (OMS). Se recomienda la búsqueda activa de complicaciones más frecuentes en su orden de aparición: síndrome de dificultad respiratoria aguda, falla renal aguda, lesión miocárdica y alteraciones neurológicas. Así mismo, seguimiento, búsqueda activa y adherencia a paquetes de medidas para prevención de infecciones asociadas a la atención en salud, especialmente neumonía asociada a ventilación mecánica. Se recomienda la evaluación marcadores para mal pronóstico de la enfermedad que incluyen fiebre al ingreso e insuficiencia respiratoria, alteraciones imagenológicas, SOFA score mayor de 2, linfopenia, dímero D elevado, PCR elevada, deshidrogenasa láctica elevada y ferritina elevada.

Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud. Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia

RESUMEN El diagnóstico de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 sigue siendo un reto, se dispone de diferentes pruebas diagnósticas entre ellas la PCR en tiempo real, pruebas de anticuerpos y de antígeno. Cada una de las pruebas tienen una cinética distinta y un rendimiento que difiere a partir del momento en que son realizadas. Actualmente se considera que la RT- PCR es la prueba diagnóstica con mejor rendimiento (sensibilidad 89% y especificidad 99%), sin embargo, esto depende también del tipo de muestra, siendo el aspirado traqueal la de mejor sensibilidad. Es importante mencionar que se dispone de otras técnicas de PCR como las pruebas de PCR multiplex en donde la detección de SARS-CoV-2 está incluida en los paneles. Algunas pruebas serológicas luego de varios estudios y validaciones en nuestro medio solo demostraron utilidad en pacientes luego del día 11 de inicio de síntomas con rendimiento variable (sensibilidad 49, 75 a 100 % y especificidad 87 a 95.83 %). En los pacientes asintomáticos se han evaluado diferentes pruebas para identificación de SARS-CoV-2 con resultados menos contundentes. Sin embargo, se ha encontrado utilidad en la realización de RT-PCR basada en identificación de contacto estrecho, las pruebas de anticuerpos se podrían considerar luego del día 11 de contacto con un rendimiento inferior al de la RT PCR. En ocasiones se debe considerar la realización de estudios invasivos evitando la generación de aerosoles o uso de elementos de protección si se requiere, sin embargo, la realización de mini lavado bronquial y aspirado traqueal a ciegas con sistema cerrado es una alternativa. Se han encontrado diferentes biomarcadores que permiten categorizar la gravedad de los pacientes y orientar el lugar donde deben ser evaluados, entre ellos están el hemograma, proteína c reactiva, enzimas hepáticas, bilirrubinas, función renal, deshidrogenasa láctica, CK, troponinas, dímero D; como también la aplicación de diferentes escalas como CURB 65, qSOFA y SOFA. La procalcitonina aún no ha demostrado utilidad para que sea recomendada en el uso rutinario. Las imágenes de tórax (radiografía de tórax, tomografía de tórax simple) permiten evaluar no solo otras posibles etiologías, sino que también permiten categorizar la gravedad del cuadro y las complicaciones relacionadas con la infección por SARS-CoV-2/COVID-19 como es el SDRA (síndrome de dificultad respiratoria del adulto). La presencia de vidrio esmerilado de localización basal y periférica junto con la presencia de consolidación aumentan la probabilidad de infección por SARS-CoV-2/COVID-19.

Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud. Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia

RESUMEN La enfermedad por coronavirus 19 (COVID-19) tiene amplias manifestaciones clínicas desde formas asintomáticas, enfermedad leve, moderada y crítica. En la literatura mundial se encuentran múltiples publicaciones de diversos fármacos que se han probado en pacientes con la entidad. Sin embargo, a la fecha, solo los corticoides han mostrado cierto beneficio para el manejo de pacientes con formas graves y críticas con trastorno de oxigenación. En este capítulo se resume la evidencia publicada a la fecha para el manejo de la infección por SARS-CoV-2, presentando los fármacos con potencial utilidad, en que pacientes se recomienda su administración y la utilidad de la terapia antibiótica, acorde al consenso de expertos, luego de la revisión crítica de la literatura. Se presentan además las recomendaciones de manejo en el paciente crítico en relación con terapias para oxigenación y ventilación mecánica, y las terapias adyuvantes para la prevención y manejo de complicaciones tromoboembólicas. Se expone la evidencia de algunas terapias promisorias, que sustenta la realización de estudios clínicos como el uso de plasma convaleciente. Como parte integral del tratamiento se encuentra además el control de síntomas (disnea, tos, fiebre, delirium) y los procesos encaminados a la rehabilitación, tópicos ampliamente revisados y discutidos en las reuniones y de las que se generaron recomendaciones y puntos de buena práctica.

Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud. Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia

RESUMEN Para la infección por SARS-CoV-2/COVID-19 se ha considerado población especial con implicación de mayor riesgo de morbimortalidad y complicaciones, a todo paciente con comorbilidad cardiovascular, mujer gestante, neonato, inmunosuprimido de causa oncológica y no oncológica (inmunodeficiencias primarias, enfermedades autoinmunes articulares y extraarticulares, pacientes con virus de la inmunodeficiencia humana adquirida y pacientes trasplantados), patología neurológica y hepática. Los estudios a la fecha demuestran un 50% y un 67% de pacientes con comorbilidades infectados y fallecidos respectivamente. Siendo predominantes la hipertensión arterial, obesidad y la diabetes mellitus tipo 2. En el caso de mujeres gestantes y neonatos, la neumonía es un factor importante que contribuye a la morbimortalidad materna, y los cambios inmunomoduladores durante estas etapas fisiológicas, así como las alteraciones estructurales propias de la gestante, contribuyen como factores facilitadores de la enfermedad, una vez adquirida. Favre et al, sugieren que complicaciones similares a las documentadas durante la epidemia de MERS y SARS podrían aparecer en esta pandemia (mayor riesgo de abortos, restricción en el crecimiento intrauterino, parto pretérmino, entre otros). Aún se encuentra en estudio la posibilidad de trasmisión vertical, así como trasmisión por lactancia, que a la fecha no han sido identificadas. Por lo anterior también se han generado recomendaciones que impactan en las precauciones de aislamiento que se tienen con el binomio madre-hijo. La indicación de cesárea por la infección per- se es controvertida, y se considera por ahora que la vía de atención del parto en principio debe ser vaginal. La población que requiere uso de manejos inmunosupresores para control de enfermedades de base (corticoide, antimaláricos, quimioterapia, etc.), se ve impactada directamente por la posibilidad de infección asintomática y mayor riesgo de complicaciones una vez se administren dichos medicamentos. Se ha dedicado una parte de la sección a las recomendaciones sobre la continuidad de este tipo de manejos y los ajustes respectivos con algunos de ellos. En el caso de pacientes candidatos a trasplante (de órgano sólido o de progenitores hematopoyéticos), el proceso de tamización también ha sido establecido de forma estricta. La evidencia acumulada hasta ahora sugiere que la población de pacientes hematoncológicos podría tener un riesgo mayor de infección por SARS-CoV-2/COVID-19 y morbimortalidad mayor con respecto a la población general, con tasa de letalidad cercana al 6% (vs 2.3% de individuos sanos). Dada la heterogeneidad de este grupo, se han realizado recomendaciones individualizadas para las afecciones previamente mencionadas, que esperan impactar de forma positiva en el diagnóstico y manejo de pacientes con este tipo de comorbilidades durante la pandemia.

Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud. Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia

RESUMEN A pesar de que la infección es más prevalente en los adultos; el número de casos en la población pediátrica ha ido en aumento. La presentación clínica es variable y puede ir desde una infección asintomática hasta presentarse como insuficiencia respiratoria aguda, requiriendo manejo en la unidad de cuidados intensivos. En la población pediátrica, sobre todo en los menores de 15 años, se han descrito manifestaciones que pueden estar o no asociadas a fiebre, presencia de síntomas respiratorios (tos, odinofagia, entre otras) y/o síntomas gastrointestinales que pueden ir desde leves a severos. Según la gravedad de la sintomatología, los casos se han estratificado en asintomáticos, leves, graves o críticos, siguiendo los lineamientos de la OMS. Para considerar un caso como sospechoso se debe tener en cuenta el nexo epidemiológico, los síntomas clínicos, los hallazgos radiológicos y de laboratorio. Un caso confirmado es aquel en el que se tiene una PCR SARS-CoV-2 o estudios serológicos (IgM e IgG) positivos. Respecto al tratamiento de esta nueva enfermedad, se han realizado múltiples ensayos clínicos con medicamentos como hidroxicloroquina, cloroquina, ivermectina, tocilizumab, entre otros, en búsqueda de un manejo apropiado; sin embargo, hasta el momento no existe un medicamento que haya demostrado efectividad, y por lo tanto no es posible recomendar un tratamiento específico para la infección por SARS-CoV-2. Este capítulo del consenso presenta la información que se tiene hasta la fecha, acerca de esta patología en la población pediátrica. Se reportan los principales signos y síntomas basados en las series de casos publicadas. Se sugiere una clasificación clínica según la severidad de la infección; así como la evidencia disponible en cuanto a tratamiento de la infección por SARS-CoV-2/COVID-19. Se describe además lo reportado más recientemente en la literatura, frente al aumento inusual de casos de un síndrome inflamatorio similar a la Enfermedad de Kawasaki, que se ha denominado Síndrome Inflamatorio sistémico temporalmente asociado a SARS-CoV-2/COVID-19, (SIMS-TAC por sus siglas en español o PIMS-TS por sus siglas en inglés Pediatric Inflammatory Multisystem Syndrome Temporally Associated with SARS-CoV-2). Finalmente se realiza una recomendación sobre la necesidad de continuar con los esquemas de vacunación, que son necesarios para evitar infecciones circulantes o el resurgimiento de otras ya erradicadas.

Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-COV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud. Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia

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CONSENSO COLOMBIANO DE ATENCIÓN, DIAGNÓSTICO Y MANEJO DE LA INFECCIÓN POR SARS-COV-2/COVID-19 EN ESTABLECIMIENTOS DE ATENCIÓN DE LA SALUD: RECOMENDACIONES BASADAS EN CONSENSO DE EXPERTOS E INFORMADAS EN LA EVIDENCIA ACIN-IETS. SEGUNDA EDICIÓN.

RESUMEN ANEXOS. Consenso colombiano de atención, diagnóstico y manejo de la infección por SARS-CoV-2/COVID-19 en establecimientos de atención de la salud: Recomendaciones basadas en consenso de expertos e informadas en la evidencia ACIN-IETS. SEGUNDA EDICIÓN.