Infectio

La contribución de Manuel Elkin Patarroyo a la ciencia

Recomendaciones para diagnostico y manejo de personas con trombocitopenia trombotica inmune inducida por vacunas (VITT)

Abstract In recent months, rare cases of thrombosis at unusual sites associated with thrombocytopenia, occurring within a typical risk window (i.e., 4-28 days) after receiving SARS CoV2 vaccines, have been reported. Healthcare professionals should be prepared to detect these cases on time. The Expert Panel of the Knowledge Management and Transfer Network conducted a free search of the related literature. With the available information and the clinical expertise of the working group, we formulated, reviewed, and endorsed recommendations for the timely suspicion, diagnosis (case definitions, the use of initial laboratory and imaging tests, specific tests), and management of these thrombotic conditions. This document is considered a living document that will be updated as new evidence emerges, and recommendations may change over time.

Resumen En meses recientes se han reportado casos raros de trombocitopenia y trombosis en sitios inusuales, que ocurren dentro de una ventana de riesgo típica ( por ejemplo de 4 a 28 días) luego de recibir vacunas de SARS CoV 2. Los profesionales de la salud deben estar preparados para detectar estos casos a tiempo. Un panel de expertos y una red de transferencia de conocimiento realizó una búsqueda libre de literatura seleccionada. Con la información disponible y la experticia clínica del grupo de trabajo revisamos y dimos recomendaciones para la sospecha temprana, el diagnostico (definición de caso, el uso de pruebas de laboratorio especificas y de imágenes diagnósticas) para le manejo de estas condiciones tromboticas. Este documento es considerado un documento vivo que debe ser actualizado a medida que surja nueva evidencia y las recomendaciones vayan cambiando con el tiempo

Análisis de la diversidad bacteriana en aguas superficiales usadas para consumo humano en zonas rurales de la región andina colombiana

Abstract Potable water supply and sanitization in rural areas in developing countries are still inadequate. The main risk associated with unsafe drinking water is the infection with pathogenic microorganisms. Objective: In this study, we investigate the bacterial diversity and the potentially pathogenic bacteria in water samples from diffe rent points of distribution in three rural villages from the Andean region of Colombia. Methods: Illumina libraries for water samples were prepared and sequenced using 300 bp paired-end MiSeq protocol, the bioinformatic analyses were performed with Mothur pipeline and the phyloseq package in Rstudio. Results: The mi crobial community composition showed statistically significant differences according to the village and the sample origin. Alpha, Beta, and Gammaproteobacteria were the dominant class detected in all water samples. The most relevant pathogenic genera detected in the surface were Legionella, Mycobacterium, Yersinia, Burkholderia, and Rickettsia. In the tap water samples, potential pathogens like Streptococcus, Staphylococcus, Corynebacterium, Nocardia, and Escherichia/Shige lla were detected.

Resumen El suministro y potabilización del agua de consumo humano en las zonas rurales de los países en vías de desarrollo sigue siendo limitado. El principal riesgo asociado con el uso de agua no potable es la infección con microorganismos patógenos. Objetivo: En este estudio se investigó la diversidad bacteriana y la presencia de bacterias potencialmente patógenas en muestras de agua de diferentes puntos de distribución en tres asentamientos rurales de la región andina de Colombia. Métodos: Se prepararon y secuenciaron bibliotecas de amplicones (rDNA 16S) para muestras de agua utilizando la plataforma Illumina MiSeq con lecturas pareadas de 300 bases. Los análisis bioinformáticos se realizaron con el programa Mothur y el paquete estadístico Phyloseq en Rstudio. Resultados: La composición de la comunidad microbiana mostró diferencias estadísticamente significativas según el sitio y el origen de la muestra. Alfa, Beta y Gammaproteobac terias fueron las clase dominantes detectadas en todas las muestras de agua. Los géneros patógenos más relevantes detectados fueron Legionella, Mycobacterium, Yersinia, Burkholderia y Rickettsia. En las muestras de agua del grifo se detectaron patógenos potenciales como Streptococcus, Staphylococcus, Corynebacterium, Nocardia y Escherichia /Shigella.

Caracterización de la enfermedad de Kawasaki en niños entre 3 meses y 15 años en 2 instituciones de salud en Bogotá, Colombia

Resumen Objetivo: Disminuir la brecha del conocimiento de la Enfermedad de Kawasaki (EK) y dar herramientas al personal médico por medio de la descripción de la demografía, presentación clínica, los hallazgos de laboratorio, la frecuencia de lesiones coronarias y desenlaces en 2 instituciones de salud en Bogotá, Colombia. Metodología: Estudio observacional retrospectivo mediante la revisión de historias clínicas de los códigos CIE-10 de paciente pediátricos donde se evaluaron características demográficas, presentación clínica, datos paraclínicos (incluidos hallazgos ecocardiográficos), tratamiento recibido y respuesta a este, en pacientes admitidos entre junio de 2015 y junio de 2020. Resultados: Se incluyeron 36 pacientes entre 3 meses y 15 años. La edad media de los pacientes fue de 2.9 años, siendo la EK más frecuente en niños en una rela ción 2:1. El 61.1% presentó EK completa o clásica, el 30.5% EK incompleta y el 8.3% EK atípica. Todos los pacientes recibieron inmunoglobulina intravenosa antes del día 10 del curso de la enfermedad, con remisión de la fiebre antes de 12 horas luego de la administración. La incidencia de compromiso coronario fue de 30.6%. Conclusiones: La Enfermedad de Kawasaki tiene un curso clínico característico que afecta especialmente a niños menores de 5 años. Es una entidad clínica que, al ser reconocida con mayor frecuencia por pediatras, permite instaurar diagnóstico y tratamiento tempranos evitando complicaciones y secuelas a mediano y largo plazo.

Abstract Objective: To reduce the knowledge gap about Kawasaki Disease (KD) and to provide tools to medical personnel through the description of demographics, clinical presentation, laboratory findings, frequency of coronary lesions and outcomes in 2 health institutions in Bogota Colombia. Methodology: Retrospective observational study by reviewing the clinical records of the ICD-10 codes of pediatric patients where demographic characteristics, clinical presentation, paraclinical data (including echocardiographic findings), treatment received and response to it were evaluated, in patients admitted between June 2015 and June 2020. Results: The mean age of the patients was 2.9 years, being KD more frequent in boys a 2:1 ratio. 61.1% had complete or classic KD, 30.5% had incomplete KD, and 8.3% atypical KD. All patients received intravenous immunoglobulin before day 10 of the course of the disease, with remission of fever within 12 hours after administration. The incidence of coronary compromise was 30.6%. Conclusions: KD has a characteristic clinical course that especially affects children under 5 years. A more frequent recognition of this clinical entity by pediatricians, allows for an early diagnosis and treatment avoiding complications and sequelae in the medium and long term.

Intervención nutricional estandarizada en pacientes hospitalizados por COVID-19 admitidos en un Hospital en Bogotá, Colombia

Summary Background: Patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) present an increase in oxidative stress, characterized by the production of reactive oxygen species and a concomitant deficiency of antioxidants. There are multiple defense mechanisms including enzymatic scavengers and non-enzymatic molecules (glutathione and vitamins A, C, D, E, and zinc). Methods: In this observational, cross-sectional, retrospective study, we aimed to describe the clinical behavior of patients hospitalized due to COVID-19 (those trea ted with a standardized nutritional intervention versus those who received the COVID-19 standard treatment available at the time). A total of 214 medical records of patients hospitalized due to COVID-19 who required nutritional intervention were analyzed. Descriptive analyses of continuous and categorical variables were performed, and an ANOVA test was performed for numerical variables. A logistic regression model and a propensity score matching determined the differences between the matched groups. Findings: 33·6% of the patients were admitted to the Intensive Care Unit (ICU), 28·5% required invasive mechanical ventilation, and the overall mortality was 19·6%. 44·8% of the patients received the standardized nutritional intervention. There were no statistically significant differences between intervention groups, except for the intervention time, in which the standardized nutritional intervention (days) was identified as a protective factor OR=0·550 (p <0·05; CI=0·324-0·936). Conclusions: This is the first study in Colombia to consider a standardized nutritional intervention in patients hospitalized due to COVID-19. Despite not being able to meet the primary objectives, controlled experiments must be carried out to determine the role and possible therapeutic effects of micro and macronutrients in patients with COVID-19.

Resumen Antecedentes: los pacientes con enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) presentan un aumento del estrés oxidativo, caracterizado por la producción de especies reactivas de oxígeno y una deficiencia concomitante de antioxidantes. Existen múltiples mecanismos de defensa que incluyen eliminadores enzimáticos y moléculas no enzimáticas (glutatión y vitaminas A, C, D, E y zinc). Métodos: En este estudio observacional, transversal y retrospectivo, el objetivo fue describir el comportamiento clínico de los pacientes hospitalizados por CO VID-19 (aquellos tratados con una intervención nutricional estandarizada versus aquellos que recibieron el tratamiento estándar COVID-19 disponible en el tiempo). Un total de 214 historias clínicas de los pacientes hospitalizados por COVID-19 que requirieron intervención nutricional. Se realizaron análisis descriptivos de variables continuas y categóricas. Se realizó una prueba de ANOVA para las variables numéricas. Un modelo de regresión logística y un emparejamiento por puntuación de propensión determinaron las diferencias entre los grupos emparejados. Resultados: el 33,6% de los pacientes ingresaron en la Unidad de Cuidados Intensivos (UCI), el 28,5% requirió ventilación mecánica invasiva y la mortalidad global fue del 19,6%.44 · 8% de los pacientes recibieron la intervención nutricional estandarizada. No hubo diferencias estadísticamente significativas entre los grupos de intervención, excepto por el tiempo de intervención, en el que la intervención nutricional estandarizada (días) se identificó como factor protector OR = 0 · 550 (p <0 · 05; IC = 0 · 324-0 · 936). Conclusiones: Este es el primer estudio en Colombia que considera una intervención nutricional estandarizada en pacientes hospitalizados por COVID-19. A pesar de no poder alcanzar los objetivos primarios, se deben realizar experimentos controlados para determinar el papel y los posibles efectos terapéuticos de los micro y macronutrientes en pacientes con COVID-19

Centros de tamizaje masivo para SARS COV-2 en Colombia: Proyecto CoVIDA

Abstract Objective: The CoVIDA project is a public-private collaboration led by Universidad de los Andes that contributed to the SARS-CoV-2 epidemiological surveillance in Bogotá and nearby municipalities. We aimed to describe the development and performance of the Drive/Walk-through free RT- PCR for SARS-CoV-2 testing strategy implemented by CoVIDA. Material and method: We performed a descriptive analysis of the characteristics and performance of the CoVIDA Drive/Walk-through testing centers. The model and the process indicators to assess the model’s performance were based on international experiences and scientific literature. Two screening centers were imple mented in shopping centers in the north and south of Bogotá. We reported the number of tests taken, the number of positive tests, and the number of participants that used the model by the type of occupations. Results: In total, 36,689 nasopharyngeal RT-PCR tests for SARS-CoV-2 were performed with a 5.75% cumulative positivity. Process indicators showed an excellent performance and an important contribution in reducing barriers to access to testing. Conclusions: the CoVIDA Drive/Walk-through testing centers supported the epidemiological surveillance in asymptomatic or mild-symptomatic population in Bo gotá. Low and middle-income countries can use this model as a cost-effective and innovative solution strategy to intensify testing and help mitigate the pandemic.

Resumen Objetivo: El proyecto CoVIDA es una colaboración público-privada liderada por la Universidad de los Andes que contribuyó a la vigilancia epidemiológica del SARS-CoV-2 en Bogotá y municipios cercanos. Nuestro objetivo fue describir el desarrollo y rendimiento de la estrategia de tamizaje gratuito con RT-PCR mediante un modelo Drive/Walk through para SARS-CoV-2 implementado por CoVIDA. Materiales y métodos: Realizamos un análisis descriptivo de las características y desempeño de los centros de tamizaje Drive/Walk through de CoVIDA. El modelo y los indicadores de proceso para evaluar el desempeño del modelo se basaron en experiencias internacionales y la literatura científica. Se implementaron dos cen tros de tamizaje en centros comerciales del norte y sur de Bogotá. Se reportó la cantidad de pruebas tomadas, pruebas positivas y de participantes que utilizaron el modelo de acuerdo con el tipo de ocupaciones. Resultados : En total, se realizaron 36,689 pruebas RT-PCR nasofaríngeas para SARS-CoV-2 con una positividad acumulada del 5,75%. Los indicadores de proceso mostraron un excelente desempeño y una contribución importante en la reducción de las barreras de acceso a las pruebas. Conclusiones: los centros de tamizaje con modelo Drive/Walk through de CoVIDA apoyaron la vigilancia epidemiológica en población asintomática o con síntomas leves en Bogotá. Los países de ingresos bajos y medianos pueden utilizar este modelo como una estrategia innovadora y rentable para aumentar la realización de las pruebas y ayudar a mitigar la pandemia.

Situación epidemiológica de la Tuberculosis infantil en el departamento de Caldas 2016-2018

Resumen Objetivo: Describir la epidemiología de la tuberculosis infantil en el Departamento de Caldas (2016-2018). Materiales y métodos: Estudio observacional-descriptivo. Resultados: se registraron 41 casos (4%, 41/1.029). La incidencia fue 2,96/100.000 (2016), 6,31/100.000 (2017) y 4,34 /100.000 (2018). La mediana de edad fue 10 años (RI 2-16). El sexo femenino aporto 53,66%, predominó el estrato socioeconómico bajo (90,24%, 37/41), Manizales aportó la mayor carga de casos (43,9%, 18/41). La TB pulmonar se presentó en 39,02% de los casos de tuberculosis infantil. 68,29% (28/41) reportaron haber tenido síntomas alrededor de 15 días de evolución. 70,73% (29/41) presentarón tos con expectoración y 65,85% (27/41) reportaron astenia o disnea. La PPD se midió en 65,85% de la población (27/41) siendo positiva (> 10 mm) en 62,96% (17/27). El diagnóstico radiológico se realizó en 56,1% (23/41). Se reportaron 10 casos de TB extrapulmonar, la presentación más frecuente fue ganglionar (7/10). Se presentaron dos casos fatales. Discusión: La tuberculosis infantil en Caldas refleja la naturaleza de la enfermedad, afectándose principalmente niñas con vulnerabilidades sociales. El síntoma más común es tos húmeda con expectoración, similar a otros estudios desarrollados en Colombia. No se cuenta con una herramienta diagnostica con rendimiento suficiente, por lo que este sigue siendo un desafío clínico.

Abstract Objective: To describe the epidemiology of childhood TB in the Department of Caldas (2016-2018). Materials and methods: Observational-descriptive study. Results: 41 cases were registered (4%, 41 / 1,029). The incidence was 2.96 / 100,000 (2016), 6.31 / 100,000 (2017) and 4.34 / 100,000 (2018). The median age was 10 years (IR 2-16). The female sex contributed 53.66%, the low socioeconomic status predominated (90.24%, 37/41). Manizales contributed the highest case load (43.9%, 18/41). Pulmonary TB occurred in 39.02% of childhood TB cases. 68.29% (28/41) reported having symptoms around 15 days of evolution. 70.73% (29/41) presented cough with expectoration and 65.85% (27/41) reported asthenia or dyspnea. PPD was measured in 65.85% of the population (27/41), being positive (> 10 mm) in 62.96% (17/27). The radiological diagnosis was made in 56.1% (23/41). 10 cases of extrapulmonary TB were reported, the most frequent presentation was lymph node TB (7/10). Two fatal cases occurred. Discussion: Childhood tuberculosis in Caldas reflects the nature of the disease, mainly affecting girls with social vulnerabilities. The most common symptom is wet cough with expectoration, similar to other studies developed in Colombia. There is not a diagnostic tool with sufficient performance, so this remains a clinical challenge.

Estimación de la frecuencia de infección por Helicobacter pylori en pacientes con lesiones potencialmente malignas gástricas del municipio de Pasto-Nariño, 2016-2019

Resumen Objetivo: Estimar la frecuencia de infección por Helicobacter pylori en lesiones potencialmente malignas gástricas de pacientes de la ciudad de Pasto, Nariño. Materiales y métodos: Estudio retrospectivo con análisis secundario de información sociodemográfica e histopatológica obtenida de reportes de patología para biopsias gástricas de pacientes del departamento de Nariño, Colombia del año 2016-2019. Resultados: Los pacientes de la ciudad de Pasto (n=359) presentaron una frecuencia de infección por Helicobacter pylori de 35.6%, siendo significativamente mayor en hombres que en mujeres (p=0.037). La edad promedio de los hombres positivos para Helicobacter pylori fue de 44 años y de las mujeres de 47 años (p<0.001). La edad promedio de los casos de gastritis crónica atrófica en hombres y mujeres fue de 49 y 54 años respectivamente (p<0.001) y de metaplasia intestinal fue de 59 años en hombres y 61 años en mujeres (p<0.001). Conclusiones: En el presente estudio, la detección de Helicobacter pylori fue mayor en el grupo de hombres en comparación al de las mujeres (43.2% vs 31.6% respectivamente). La frecuencia de gastritis crónica atrófica y metaplasia intestinal en hombres fue de 37.9% y 23.1% respectivamente; mientras que en mujeres fue de 35.2% y 15.1% respectivamente.

Abstract Aim: To estimate the frequency of Helicobacter pylori infection in potentially malignant stomach lesions in patients of the city of Pasto- Nariño. Materials and methods: Retrospective study with secondary analysis of sociodemographic and histopathological information derived from pathology reports for gastric biopsies of patients from the department of Nariño, Colombia from year 2016-2019. Results: Patients from the city of Pasto (n=359) presented a percentage of detection for Helicobacter pylori of 35.6% and the infection was significantly higher in men than in women (p=0.037). The average age of men positive for Helicobacter pylori was 44 years and women 47 years (p<0.001). The average age of the cases of chronic atrophic gastritis in men and women was 49 and 54 years respectively (p<0.001) and for intestinal metaplasia cases, the average age was 59 years in men and 61 years in women (p<0.001). Conclusions: In the present study, the detection of Helicobacter pylori was higher in the male group compared to the female group (43.2% vs 31.6% respectively). The frequency of atrophic chronic gastritis and intestinal metaplasia in men was 37.9% and 23.1% respectively; in women was 35.2% and 15.1% respectively.

Similitudes en la Microbiota de Tracto Biliar en Adenocarcinoma Ductal de Páncreas

Abstract Objective: to analyze microbiota profiles in the biliary tract, of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) patients and gallstones patients, in order to identify dif ferences, which may contribute to a better understanding of PDAC carcinogenesis. Methods: using microbiota analysis, a total of 25 samples from 14 patients were collected during surgery and compared. Samples were divided into three groups; one GS group (N = 3), and two PDAC groups; PDAC gallbladder group (N = 11) and PDAC brush group (N = 11). Results: upon comparison of bacterial communities’ alpha and beta diversity indices and relative abundances by group (anatomic site) and condition (GS vs PDAC), we found no statistically significant results. However, we can highlight the high similarity of the compared parameters among the two different anatomic locations over the biliary tract in PDAC patients. Conclusion: to the best of our knowledge, this is the first study comparing two different anatomic locations over the biliary tract in PDAC patients. Among PDAC groups microbiota along the semi-closed duct system of the biliary tract showed substantial similarity, reflected in the alpha and beta diversity indices and relative abundances.

Resumen Objetivo: analizar los perfiles de microbiota en el tracto biliar de pacientes con adenocarcinoma ductal pancreático (PDAC) y pacientes con cálculos biliares (GS), con el fin de identificar diferencias, lo que puede contribuir a una mejor comprensión de la carcinogénesis de PDAC. Métodos: mediante análisis de microbiota, se recolectaron durante la cirugía un total de 25 muestras de 14 pacientes y se compararon. Las muestras se dividieron en tres grupos; Grupo GS (N = 3) y dos grupos PDAC; Grupo de vesícula biliar PDAC (N = 11) y grupo de cepillado PDAC (N = 11). Resultados: al comparar los índices de diversidad alfa y beta de las comunidades bacterianas y las abundancias relativas por grupo (sitio anatómico) y condición (GS vs PDAC), no encontramos diferencias estadísticamente significativas. Sin embargo, podemos destacar la gran similitud de los parámetros comparados entre las dos ubicaciones anatómicas diferentes en el tracto biliar en pacientes con PDAC. Conclusión: hasta donde sabemos, este es el primer estudio que compara dos ubicaciones anatómicas diferentes sobre el tracto biliar en pacientes con PDAC. Entre los dos grupos de PDAC, la microbiota del sistema de conductos semicerrados del tracto biliar, se encontró una similitud sustancial, reflejada en los índices de diversidad alfa y beta y en abundancias.

Nutritional status in children with HIV

Abstract Background: Undernutrition is frequent among children living with HIV in developing countries. An interaction between malnutrition and HIV pediatric infection remains incompletely characterized in Colombia. Methodology: Retrospective longitudinal study, descriptive in nature, in 28 patients with a diagnosis of HIV infection, less than 18 years of age and receiving anti retroviral therapy. Variables were retrieved from clinical records at start of antiretroviral therapy and after 12 months. Statistical analysis was exploratory. Results: 4 out of 28 patients were stunted (14,3%; 95%CI: 1,3 - 27,2), 2 out of 7 patients were wasted (28,6%; 95%CI: 0 - 62), 5 out of 17 patients were underweight (27,8%; 95%CI: 7,1 - 48,5) and 4 out of 28 patients had thinness (29,6%; 95%CI: 12,4 - 46,8). No clinically relevant anthropometric change was detected during follow-up. Anemia prevalence was 52% and 82% of patients had some degree of dyslipidemia. Both viral load (p=0,001) and CD4 count (p=0,01), significantly increased and the proportion of patients with therapeutic failure remained invariable during follow-up. Conclusion: Malnutrition is frequent and its prevalence might have decreased. HIV program improved medical control of the disease, with stable therapeutic failure rates that were comparable with previous reports. Nonetheless, anemia and dyslipidemia remain to be a paramount therapeutic challenge.

Resumen Introducción: La desnutrición es frecuente en niños con VIH en países en desarrollo. En Colombia, la interacción entre la desnutrición y la infección pediátrica por VIH se encuentra insuficientemente caracterizada. Metodología: Estudio longitudinal retrospectivo de carácter descriptivo, en 28 pacientes con diagnóstico de infección por VIH, edad menor a 18 años y con terapia antirretroviral en curso. Se extrajeron variables mediante revisión de historias clínicas en el momento de inicio de la terapia antirretroviral y 12 meses después. El análisis estadístico fue exploratorio. Resultados: 4 de 28 pacientes sufrían retraso del crecimiento (14,3%; IC95%: 1,3 - 27,2), 2 de 7 pacientes sufrían emaciación (28,6%; IC95%: 0 - 62), 5 de 17 pacientes sufrían insuficiencia ponderal (27,8%; IC95%: 7,1 - 48,5) y 4 de 28 pacientes se encontraban en delgadez (29,6%; IC95%: 12,4 - 46,8). No hubo cambios antropométricos clínicamente relevantes con el seguimiento. La prevalencia de anemia fue del 52% y 82% de los pacientes tenían algún grado de dislipidemia. Tanto la carga viral (p=0,001) como el conteo de CD4 (p=0,01), mejoraron significativamente y la proporción de pacientes con fallo terapéutico no cambió durante el seguimiento. Conclusión: La desnutrición es frecuente y su prevalencia podría haber disminuido. El programa de VIH mejoró el control médico de la enfermedad, con tasas de fallo terapéutico estables y comparables con reportes previos. No obstante, la anemia y la dislipidemia continúan siendo un gran reto terapéutico.

Aislamiento microbiológico de superficies inanimadas en contacto con pacientes en un hospital peruano

Resumen Objetivo: describir el perfil microbiológico de las superficies inanimadas en contacto con el paciente en un hospital nivel III de la seguridad social de Chiclayo, Perú. Material y métodos: Se realizó un estudio transversal, con los datos de los informes del Control microbiológico cualitativo de ambientes físicos de 5 servicios de un Hospital de Chiclayo nivel III del Perú. El método para la identificación de microorganismos fue el sistema automatizado VITEK MS. Se presentan análisis des criptivos como frecuencias y porcentajes. Resultados: Se reportaron un total de 177 aislamientos, de los cuales 97,74% (173) fueron positivos, de estos, el 50,87% (88) estuvo conformado por bacilos gram negativos, siendo el microorganismo más aislado Acinetobacter baumannii (17 muestras) seguido de Rhizobium radiobacter (16) y Sphingomonas paucimobilis 13. Conclusiones: El ambiente hospitalario se encuentra altamente contaminado, siendo la mayoría microorganismos patógenos. Estos resultados guardarían relación con el prolongado tiempo de vida de los microorganismos en las superficies inertes y el proceso de limpieza y desinfección del ambiente hospitalario, por lo que la evaluación de su eficacia y el posible desarrollo de nuevas y mejores técnicas de limpieza deben ser motivo de investigación.

Abstract Objective: to describe the microbiological profile of inanimate surfaces in contact with the patient in a social security level III hospital in Chiclayo, Peru. Material and methods: An observational, descriptive, transversal study was carried out with the data from the reports of the Microbiological Qualitative Control of Physical Environments of 5 services of a Chiclayo Hospital level III in Peru. The method for the identification of microorganisms was the automated system VITEK MS. Descriptive analyses such as frequencies and percentages are presented. Results: A total of 177 isolations were reported, from which 97.74% (173) were positive, of these, 50.87% (88) were composed by gram-negative bacilli, being the most isolated microorganism Acinetobacter baumannii (17 samples) followed by Rhizobium radiobacter (16) and Sphingomonas paucimobilis 13. Conclusions: The hospital environment is highly contaminated, being most of them pathogenic microorganisms. These results would be related to the long life of microorganisms on inert surfaces and the process of cleaning and disinfection of the hospital environment, so the evaluation of its effectiveness and the possible development of new and better cleaning techniques should be investigated.

Virus respiratorios detectados a través de biología molecular en niños hospitalizados por Infección respiratoria aguda en tiempos de SARS-CoV-2/COVID-19

Resumen Introducción: las infecciones respiratorias agudas virales se consideran una de las principales causas de mortalidad y morbilidad en pediatría, El Síndrome Respira torio Agudo Severo o Grave 2 (SARS-CoV-2), se ha convertido en un importante problema para la salud pública mundial por su alta transmisibilidad, el objetivo del estudio es describir el comportamiento de los virus respiratorios detectados por RT-PCR en niños hospitalizados por infección respiratoria aguda (IRA) en tiempos de SARS-CoV-2/COVID-19 en un centro de atención pediátrica de Cali-Colombia. Metodología: Estudio observacional de corte transversal retrospectivo, donde se evaluaron 113 pacientes mayores de 28 días y menores de 18 años entre marzo y noviembre del 2020, hospitalizados con diagnostico confirmado IRA y con Reacción en cadena de la polimerasa en tiempo Real (RT-PCR) positiva para virus respiratorios. Resultados: Predominio del género masculino (64.6%). en 74.3% se diagnosticó con IRA baja, los principales síntomas fueron tos en 92% y fiebre 74.3% Se identificó SARS-CoV-2 en 53%, Human Rhinovirus/Enterovirus en 27.41% y Virus Respiratorio Sincitial en 15%. El 34.5% de los pacientes requirieron unidad de cuidados intensivos y 15.9% ventilación mecánica Conclusiones: La infección por SARS-CoV-2 fue más común en los pacientes hospitalizados tanto en salas generales como en la unidad de cuidados intensivos pediátricos

Abstract Introduction: viral acute respiratory infections have been considered of the main causes of mortality and morbidity in pediatrics, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), which has become an important problem for global public health for its high transmissibility. The objective of the study is to describe the behavior of respiratory viruses detected by RT-PCR in children hospitalized for acute respiratory infection (ARI) in times of SARS-CoV-2 / COVID19 in pediatric care center in Cali Colombia Methodology: observational with a retrospective cross-sectional study. 113 patients older than 28 days and under 18 years in March to November 2020, hospita lized with a confirmed diagnosis of ARI and Real Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) positive for respiratory viruses. Results: Predominance of gender male 64.6%. 74.3% with a diagnosis of low ARI, main symptoms presented were cough 92% and fever 74.3%, SARS-CoV-2 identified 53%, Human Rhinovirus / Enterovirus 27.41% and Respiratory Syncytial Virus 15%. 34.5% of the patients required an intensive care unit with mechanical ventilation requirement 15.9% Conclusions: infection by SARS-CoV-2 was more common in hospitalized patients in both general wards as in the pediatric intensive care unit.

La boca, la salud oral y la infección con SARS.CoV-2: Un tema desestimado

Abstract With the present review, we propose recognizing and analyzing some fundamental aspects recently reported in the literature, which relate the oral cavity to SARS CoV-2 infection. A literature search was performed in Pubmed, Scopus, Scielo and the medRivx preprint server. There, articles published during 2019 and 2020 were selected from research associated with oral cavity, COVID 19, SARS-CoV-2, viral diagnosis in saliva and the use of mouth rinses as a possible mechanism to reduce viral load. A total of 33 articles related to oral cavity; SARS-CoV-2 infection; oral manifestations of COVID 19; symptomatology, saliva diagnosis, and the use of mouth rinses to minimize the risk of infection were selected. The oral manifestations of COVID 19 were recognized among the findings; also, the potential of the oral cavity as a site of infection and viral dissemination to other organs was evidenced and the role of saliva as a diagnostic tool for SARS-CoV-2. Knowledge about the oral cavity and the relationship with SARS-CoV-2 is limited, making necessary a better understanding the oral manifestations during CO VID-19, symptoms and possible complications in the mouth. The need for the establishment of infection prevention strategies during dental practice is identified.

Resumen La presente revisión se propuso reconocer y analizar algunos aspectos fundamentales reportados recientemente en la literatura, que relacionan la cavidad bucal con la infección por SARS-CoV-2. Se realizó una búsqueda bibliográfica en Pubmed, Scopus, Scielo y el servidor de preimpresión medRivx. Posteriormente, los artículos publicados durante 2019 y 2020 fueron seleccionados de una búsqueda asociada a la cavidad oral, COVID 19, SARS-CoV-2, diagnóstico viral en saliva y uso de enjuagues bucales como posible mecanismo para reducir la carga viral. Se seleccionó un total de 33 artículos relacionados con la cavidad bucal; infección por SARS-CoV-2; manifestaciones orales de COVID 19; sintomatología, diagnós tico en saliva y uso de enjuagues bucales para minimizar el riesgo de infección. Las manifestaciones orales de COVID 19 fueron reconocidas entre los hallazgos; además, se evidenció el potencial de la cavidad bucal como sitio de infección y diseminación viral a otros órganos y el papel de la saliva como herramienta de diagnóstico para el SARS-CoV-2. El conocimiento sobre la cavidad bucal y la relación con el SARS-CoV-2 es limitado, por lo que es necesario profundizar en las manifestaciones bucales durante la CO VID-19, síntomas y posibles complicaciones en la boca. Se identificó la necesidad de establecer estrategias de prevención de la infección durante la práctica odontológica.

Tigeciclina intraventricular como tratamiento de ventriculitis por Chryseobacterium indologenes multirresistente. A propósito de un caso pediátrico

Resumen La ventriculitis por Chryseobacterium indologenes puede ser un reto terapéutico importante, sobre todo cuando el germen adquiere resistencia intra tratamiento a los antimicrobianos habituales. La tigeciclina intraventricular podría ser una excelente opción en estos casos. Se presenta el caso de una escolar que recibió tratamiento intraventricular con tigeciclina, ante la ausencia de alternativas terapéuticas, con suceso exitoso.

Summary Ventriculitis due to Chryseobacterium indologenes can be a major therapeutic challenge, especially when the germ acquires intra-treatment resistance to common antimicrobials. Intraventricular tigecycline could be an excellent option in these cases. We present a schoolgirl`s case who received successfully intraventricular treatment with tigecycline.

Varicela en un hombre de 33 años

Resumen Presentamos el caso de un hombre campesino de 33 años de edad, inmunocompetente, quien presentó cuadro clínico agudo con máculas, pápulas y vesículas simultáneas, generalizadas, de 10 dias de evolución, con fiebre y conjuntivitis. Se sospechó varicela, la cual se confirmó con frotis directo y biopsia de piel con inmunohistoquímica. El paciente mejoró y curó sin complicaciones y sin tratamiento antiviral. Es un caso interesante al tratarse de un hombre adulto, sin inmuno supresión ni enfermedad de base predisponente, con manifestaciones floridas e importante compromiso cutáneo, con evolución satisfactoria. Revisamos aspectos generales de la varicela, de su incidencia en Colombia y de los programas de vacunación.

Abstract We describe a case of varicella in one immunocompetent man of 33 years, who consulted by cutaneous lesions consistent in maculopapular and vesicles generali zed after 10 days of evolution, accompanied by fever and conjunctivitis. Diagnosis of varicella was confirmed by direct stain and biopsy with immunohistochemistry analysis. The patient improved without antiviral treatment and no complications. We consider this caes of interest because its inusual presentation in one man without immunodeficiency nor subjacent disease. We reviewed the situation of varicella in Colombia and of the vaccination programs.

Mediastinitis de diseminación hematogena: Reporte de un caso

Abstract Background: Acute mediastinitis is the inflammation of the connective tissue and fat surrounding the mediastinal structures. It is a high-mortality entity and its most frequent causes include sternotomy infections from cardiovascular surgery, esophageal perforation and extension of head and neck infections. Isolated cases of acute mediastinitis from hematogenous spread are described in the literature. Case presentation: 58 year-old man, with history of gouty arthritis managed with steroids, diagnosed with acute mediastinitis by S. aureus, secondary to septic arthritis of the ankle, managed with drainage of mediastinal collections by thoracoscopy and antibiotic therapy, with satisfactory evolution. Conclusions: In patients with acute mediastinitis, hematogenous dissemination should be considered when the etiologies most frequently associated with the entity are ruled out. Early surgical treatment derived from a multidisciplinary diagnostic approach improves the prognosis of these patients.

Resumen Antecedentes: la mediastinitis aguda es la inflamación del tejido conectivo y la grasa que rodea las estructuras mediastínicas. Es una entidad de alta mortalidad y sus causas más frecuentes incluyen infecciones de la esternotomia de la cirugía cardiovascular, perforación esofágica y extensión de infecciones de cabeza y cuello. Casos aislados de mediastinitis aguda por diseminación hematógena se describen en la literatura. Caso: Hombre de 58 años, con antecedente de artritis gotosa manejado con esteroides, diagnosticado de mediastinitis aguda por S. aureus, secundaria a artritis séptica de tobillo, manejada con drenaje de colecciones mediastínicas por toracoscopia y antibioterapia, con evolución satisfactoria. Conclusiones: En pacientes con mediastinitis aguda, se puede considerar la diseminación hematógena cuando las etiologías más frecuentemente asociadas a la entidad están descartados. El tratamiento quirúrgico precoz derivado de un abordaje diagnóstico multidisciplinar mejora el pronóstico de estos pacientes.

Paracoccidioidomicosis diseminada en paciente inmunocompetente: reporte de caso

Resumen La Paracoccidioidomicosis (PCM) es una infección micótica endémica en Latinoamérica que se caracteriza por compromiso multiorgánico. El diagnóstico tardío y la diseminación sistémica favorecen complicaciones como falla respiratoria e insuficiencia suprarrenal que condicionan el desenlace del paciente. Se presenta el caso de un paciente de 51 años de edad, procedente de la costa pacífica colombiana, inmunocompetente con PCM diseminada a sistema nervioso central (SNC), pulmones y glándulas suprarrenales con debut clínico de síndrome neurológico. Durante estancia hospitalaria presenta pico febril, colapso hemodinámico, aci dosis metabólica severa e hiperlactatemia. Se hemocultivó e inició tratamiento antimicrobiano de amplio espectro con piperacilina-tazobactam (4.5 gr/IV cada 8 horas), vancomicina (15 mg/kg) más anfotericina B desoxicolato (1 mg/kg/dia) y se trasladó a unidad de cuidado intensivo. En la muestras de tejido suprarrenal se identificaron levaduras multigemantes de Paracoccidioides spp e inflamacion crónica granulomatosa. A los seis días posteriores a su ingreso, el paciente continuó con deterioro hemodinámico, desequilibrio electrolítico, shock séptico e insuficiencia suprarrenal que conllevó a su deceso a pesar de las medidas terapéuticas establecidas. Se intenta exponer el desafío que representa el diagnóstico de PCM sistémica y promover su sospecha clínica para poder identificar la enfermedad de forma oportuna y evitar complicaciones que conduzcan a un desenlace fulminante.

Abstract Paracoccidioidomycosis (PCM) is an endemic fungal infection in Latin America characterized by multi-organ involvement. Late diagnosis and systemic dissemina tion favor complications such as respiratory failure and adrenal insufficiency, which determine the outcome of the patient. We present the case of a 51-year-old patient from the Colombian Pacific coast, immunocompetent with PCM spread to the central nervous system (CNS), lungs, and adrenal glands with a clinical debut of the neurological syndrome. During a hospital stay, he presented fever peak, hemodynamic collapse, severe metabolic acidosis, and hyperlactatemia. Blood culture and began broad-spectrum antimicrobial treatment with piperacillin-tazobactam (4.5 gr / IV every 8 hours), vancomycin (15 mg/kg) plus amphotericin B deoxycholate (1 mg/kg/day) and was transferred to the intensive care unit. Paracoccidioides spp multigene yeasts and chronic granulomatous inflammation were identified in adrenal tissue samples. Six days after admission, the patient continued with hemodynamic deterioration, electrolyte imbalance, septic shock, and adrenal insufficiency that led to death despite the established therapeutic measures. The aim is to expose the challenge posed by the diagnosis of systemic PCM and promote its clinical suspicion to identify the disease promptly and avoid complications that lead to a fulminant outcome.

La estimación de la evidencia de la prueba A/B bayesiana en el contrate de eventos clínicos por COVID-19

Reply to the letter: The evidence of Bayesian A/B testing in the contrast of clinical events by COVID-