Infectio

Challenges and Visions for Infectious Diseases in Colombia during the COVID-19 Peripandemic Transition 2021-2023

Environmental surveillance of the circulation of poliovirus in municipalities considered as transitory point of migrants in Colombia 2017-2019

Resumen Objetivo: Determinar la circulación de poliovirus en tres municipios considerados como punto transitorio de migrantes en Colombia. Material y método: Se colectaron muestras de aguas residuales (n=36) de municipios fronterizos, seleccionados por mayor tránsito de migrantes regulares como irregulares, en el periodo comprendido entre el 2017-2019. Las muestras fueron concentradas y cultivadas siguiendo el algoritmo de vigilancia ambiental para la circulación de poliovirus de la Organización Mundial de la Salud (OMS). La identificación molecular se realizo mediante reacción en cadena de la polimerasa empleando cebadores específicos de grupo, de serotipo y de cepa vacunal sabin. Resultados y Discusión: Se detectó la presencia de Enterovirus no polio (EVNP) en las muestras ambientales obtenidas y no se hallo circulación de poliovirus deriva dos de la vacuna ni de poliovirus salvaje en los tres municipos evaluados; sin embargo en dos estudios previos publicados por Gonzalez y col con una metodologia similar en el año 2005 y 2015 evaluando las aguas residuales de la ciudad de Armenia-Quindio; se logró identificar la presencia de virus derivado de vacuna, con resultados negativos para la identificación de poliovirus salvaje. Conclusiones: Los hallazgos indican que el sistema de monitoreo de aguas residuales con el fin de determinar la presencia de virus es una herramienta util para realizar vigilancia ambiental.

Abstract Objective: To determine the circulation of poliovirus in three municipalities considered as transitory points for migrants in Colombia. Material and Method: Wastewater samples (n = 36) were collected from border municipalities, selected for greater transit of regular and irregular migrants, in the period between 2017-2019. The samples were concentrated and cultured following the World Health Organization (WHO) environmental surveillance algorithm for poliovirus circulation. Molecular identification was performed by polymerase chain reaction using group-specific, serotype and sabin vaccine strain primers. Results: The presence of non-polio Enterovirus (NPV) was detected in the environmental samples obtained and no circulation of poliovirus derived from the vaccine or wild poliovirus was found in the three evaluated municipalities; However, in two previous studies published by Gonzales et al with a similar methodology in 2005 and 2015 evaluating the wastewater of the city of Armenia-Quindío; It was possible to identify the presence of virus derived from vaccine, with negative results for the identification of wild poliovirus. Conclusions: The findings indicate that the wastewater monitoring system in order to determine the presence of viruses is a useful tool to carry out environmental surveillance.

Colombian HIV/AIDS registry and health risk management

Abstract HIV/AIDS information systems are a critical tool for keeping track of the HIV pandemic in any country, leading to the AIDS elimination to 2030 and achievement of the 95-95-95 goals set by 2025. In this article, we describe the data management process of the Colombian National HIV/AIDS registry, its epidemiological results and contributions to research and health risk management. This registry is a longitudinal database. Variables and periodicity are defined by The Ministry of Health and Social Protection. Reporting is done by health insurers and their healthcare providers on annual bases. The information is uploaded through a web platform run by the High-Cost Diseases Fund, in charge of the validation, auditing process, consolidation, analysis and publication of the data. Security and confidentiality of the information is also taken care of by the High-Cost Disease Fund. Main results include epidemiological follow up of the epidemic, periodic evaluation of 25 risk management indicators, publication of research studies and the calculation of an economic incentive for insurers to improve health risk management. The registry has shown to be useful not only for the management of clinical information but also for administrative purposes.

Resumen Los sistemas de información sobre el VIH/SIDA son una herramienta fundamental para realizar el seguimiento de la pandemia del VIH en cualquier país, con miras a la eliminación del SIDA hasta el 2030 y al logro de las metas 95-95-95 establecidas para el 2025. En este artículo se describe el proceso de gestión de datos del Registro Nacional de VIH/SIDA de Colombia, sus resultados epidemiológicos, sus aportes a la investigación y a la gestión del riesgo en salud. Este registro es una base de datos longitudinal. Las variables y la periodicidad son definidas por el Ministerio de Salud y Protección Social. Los reportes son realizados por las aseguradoras de salud y sus prestadores de servicios de salud sobre bases anuales. La información se carga a través de una plataforma web gestionada por el Fondo de Enfermedades de Alto Costo, encargado del proceso de validación, auditoría, consolidación, análisis y publicación de los datos. El Fondo de Enfermedades de Alto Coste también se encarga de la seguridad y la confidencialidad de la información. Los principales resultados son el seguimiento epidemiológico de la epidemia, la evaluación periódica de 25 indicadores de gestión del riesgo, la publicación de estudios de investigación y el cálculo de un incentivo económico para que las aseguradoras mejoren la gestión del riesgo sanitario. El registro ha demostrado ser útil no sólo para la gestión de la información clínica, sino también para fines administrativos.

Contribution of the use of xpert MTB/RIF and its cost-effectiveness in the diagnosis of pulmonary tuberculosis and resistance to rifampicin: a comparison with non molecular diagnostic methods

Resumen Introducción: La tuberculosis es un problema de salud pública; su control requiere diagnóstico temprano y tratamiento oportuno. Xpert MTB/RIF® es una tecno logía diagnóstica basada en PCR en tiempo real, detecta el Complejo Mycobacterium tuberculosis y la susceptibilidad a rifampicina. Objetivo: Determinar la contribución del Xpert MTB/RIF y su costo-efectividad en la detección de tuberculosis y la resistencia a rifampicina en muestras respirato rias al compararlo con métodos de diagnóstico no moleculares Materiales y Métodos: Se analizaron 1.574 muestras de pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar que fueron procesadas para microscopía con coloración fluorescente de auramina-rodamina, Xpert MTB/RIF y cultivo en BACTEC MGIT 960. Los resultados obtenidos se compararon entre los métodos no moleculares y los moleculares para la detección de M. tuberculosis y susceptibilidad a rifampicina y se realizó un análisis comparativo de costos y costo efectividad. Resultados: 19,2% de las muestras fueron positivas por alguna de las técnicas usadas. Xpert MTB/RIF detectó M. tuberculosis en 90,4% del total de muestras positivas con un índice Kappa de 0,77 (IC95%: 0,74-0,82) comparado con el cultivo. La resistencia a rifampicina por Xpert fue 8,1%, sensibilidad 94,1% (IC95%: 73,0-99,0%), especificidad 98,4% (IC95%: 95,5-99,5%) y Kappa de 0,88 (IC95%: 0,76-1,00). La razón incremental de costo efectividad (RICE) fue menor en Xpert MTB/RIF comparada con el cultivo. Conclusión: Xpert MTB/RIF es una prueba eficiente y costo efectiva en la detección de casos de M. tuberculosis en muestras pulmonares comparado con los mé todos de diagnóstico basados en cultivo, sin embargo y a diferencia del Xpert MTB/RIF, estos pueden aportar en el diagnóstico con el aislamiento de especies de micobacterias no tuberculosas y la susceptibilidad a isoniazida y otros medicamentos.

Abstract Introduction: Tuberculosis is a public health problem its control requires early diagnosis and timely treatment. Xpert MTB/RIF is a real-time PCR based diagnostic technology, detects the Mycobacterium tuberculosis complex and rifampicin resistance. Objective: To determine the contribution of Xpert MTB/RIF and its cost-effectiveness in the detection of potential positive cases for tuberculosis and resistance to rifampicin in respiratory samples comparatively with diagnostic non molecular methods Materials and Methods: From 2013 to 2015, 1.574 clinical samples of patients with suspected pulmonary tuberculosis were evaluated by smear microscopy using auramina-rodamina stain, Xpert and culture in liquid medium BACTEC MGIT 960®. Results: 19,2% of the samples were positive for any of the methods used, Xpert detected M. tuberculosis in 90,4% of the positive samples and the concordance between Xpert and cultures had a Kappa index of 0,71 (IC95%: 0,62-0,72). Xpert identified resistance to rifampicin in 8,1% of the clinical samples studied with a sensitivity 94.1% (IC95%: 73,0-99,0%), specificity 98,4% (IC95%: 95,5-99,5%) and Kappa index 0,88 (IC95%: 0,76-1,00). Xpert had an incremental cost effectiveness ratio lower than culture (RICE). Conclusion: Xpert MTB/Rif is efficient diagnostic technique and comparable with culture in cost effectiveness for pulmonary tuberculosis diagnosis. However, culture based methods, in contrast to Xpert, may allow the isolation and identification of non tuberculosis mycobacterial species and the possibility to perform susceptibility for other antituberculous drugs.

Usefulness of the 5MPB-Toledo model to predict bacteremia in the elderly patient

Resumen Objetivo: Analizar la utilidad del modelo predictivo de bacteriemia (5MPB-Toledo) en los mayores de 65 años atendidos por infección en el servicio de urgencias (SU). Material y Método: Estudio observacional prospectivo y multicéntrico de los hemocultivos (HC) obtenidos en pacientes mayores de 65 años atendidos por infección en 66 SU españoles desde el 1 de diciembre de 2019 hasta el 30 de abril de 2020. Se analizó la capacidad predictiva del modelo con el área bajo la curva (ABC) de la característica operativa del receptor (COR) y se calculó el rendimiento diagnóstico de los puntos de corte (PC) del modelo elegido con los cálculos de la sensibilidad, la especificidad, el valor predictivo positivo y el valor predictivo negativo. Resultados: Se incluyeron 2.401 episodios de HC extraídos. De ellos, se consideró como bacteriemia verdadera a 579 (24,11%) y como HC negativo a 1.822 (75,89%). Entre los negativos, 138 (5,74%) se consideraron contaminados. Se categorizó a los pacientes en bajo (0-2 puntos), moderado (3-5 puntos) y alto (6-8 puntos) riesgo, con una probabilidad de bacteriemia de 1,2%, 18,1% y 80,7%, respectivamente. El ABC-COR del modelo tras remuestreo fue de 0,908 (IC 95%: 0,897-0,924). El rendimiento diagnóstico del modelo, considerando un PC ≥ 5 puntos, obtiene una sensibilidad de 94% (IC 95%:92-96), especificidad de 77% (IC 95%:76-79) y un valor predictivo negativo de 97% (IC 95%:96-98). Conclusión: El modelo 5MPB-Toledo es de utilidad para predecir bacteriemia en los mayores de 65 años atendidos en el SU por un episodio de infección.

Abstract Objective: To analyse a risk score to predict bacteremia (MPB5-Toledo) in the patients aged older 65 years seen in the emergency departments (ED) due to infections. Patients and Methods: Prospective and multicenter observational cohort study of the blood cultures (BC) ordered in 66 Spanish ED for patients aged older 65 years seen from December 1, 2019, to April 30, 2020. The predictive ability of the model was analyzed with the area under the Receiver Operating Characteristic curve (AUC-ROC). The prognostic performance for true bacteremia was calculated with the cut-off values chosen for getting the sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value. Results: A total of 2.401 blood samples wered cultured. True cases of bacteremia were confirmed in 579 (24.11%). The remaining 1.822 cultures (75.89%) wered negative. And, 138 (5.74%) were judged to be contaminated. Low risk for bacteremia was indicated by a score of 0 to 2 points, intermediate risk by 3 to 5 points, and high risk by 6 to 8 points. Bacteremia in these 3 risk groups was predicted for 1.2%, 18.1%, and 80.7%, respectively. The model´s area under the receiver ope rating characteristic curve was 0.908 (95% CI, 0.897-0.924). The prognostic performance with a model´s cut-off value of ≥ 5 points achieved 94% (95% CI: 92-96) sensitivity, 77% (95% CI: 76-79) specificity, and negative predictive value of 97% (95% CI: 96-98). Conclusion: The 5MPB-Toledo score is useful for predicting bacteremia in the patients aged older 65 years seen in the emergency departments due to infections.

Kawasaki disease, Kawasaki-like disease, and MIS-C associated with COVID-19 in children: systematic review

Resumen Objetivo: Sintetizar las características epidemiológicas y clínicas de los niños de COVID-19 con EK, KLD y MIS-C. Métodos: Se realizó una búsqueda en 4 bases de datos y preprints hasta el 31 de Mayo del 2021. Se incluyeron reportes/series de caso que evaluaron las caracte rísticas clínicas del EK, KLD o MIS-C en pacientes pediátricos con COVID-19. Resultados: Se incluyeron 16 estudios (seis informes de casos y diez series de casos, 367 pacientes en total, 58 pacientes con EK, 87 con KLD y 290 pacientes con MIS-C); con edades entre los 6 meses y los 10 años, y el 62% eran mujeres. Se observó COVID-19 positivo en 75,2%. Respecto a EK, KLD y MIS-C, las características clínicas repor tadas fueron compatibles con los cuadros diagnósticos estandarizados en el contexto de COVID-19. La duración de la hospitalización fue de 5 a 14 días para EK y de 4,3 a 13 para MIS-C. Once pacientes con MIS-C (2,8%) necesitaron ECMO. Seis pacientes con MIS-C fueron reportados muertos. Ocho estudios reportaron pacientes en la UCI. Conclusiones: EK o KLD puede asociarse a COVID-19 en niños, y pueden complicarse con MIS-C. El tiempo de hospitalización es prolongado si se presenta EK o KLD asociado a COVID-19 en niños.

Abstract Objective: To synthesize the epidemiological and clinical characteristics of COVID-19 children with MIS-C, KLD and EK. Methods: Databases and preprints were searched until May 31, 2021. Reports/case series that evaluated the clinical features of EK, KLD, or MIS-C in pediatric patients with COVID-19 were included. Results: Sixteen studies were included (six case reports and ten case series, 367 patients total, 58 patients with EK, 87 with KLD, and 290 patients with MIS-C); with ages ranging from 6 months to 10 years, and 62% were female. Positive COVID-19 was observed in 75.2%. Regarding EK, KLD and MIS-C, the reported clinical characteristics were compatible with the standardized diagnostic pictures in the context of COVID-19. The duration of hospitalization was 5 to 14 days for EK and 4.3 to 13 for MIS-C. Eleven patients with MIS-C (2.8%) needed ECMO. Eleven patients with MIS-C (2.8%) needed ECMO. Six patients with MIS-C were reported dead. Eight studies reported patients in the ICU. Conclusions: Children with COVID-19 develop EK or KLD, and can be complicated by MIS-C. Prevention, diagnosis, and treatment measures are needed.

Blastocystis prevalence in school age children from Reynosa, Mexico

Resumen Objetivo: Determinar la prevalencia de Blastocystis sp. en niños residentes de la ciudad de Reynosa, Tamaulipas, México. Material y Método: Estudio transversal que incluyó 238 muestras de heces de niños con edad de 5 a 12 años de escuelas primarias de la ciudad de Reynosa, Tamaulipas, México. Resultados: Del total de muestras, el 13,8% tuvo presencia de Blastocystis sp.; siendo este el más prevalente dentro de los parásitos encontrados; también se re porta la presencia de Entamoeba histolytica/dispar, Giardia intestinalis y Enterobius vermicularis. Conclusiones: La prevalencia de Blastocystis en zonas de México es poco conocida; sin embargo, los estudios en diversas partes del mundo sugieren un aumento, por lo que es importante determinar la presencia y su relación como patógeno u oportunista humano.

Abstract Objective: To determine the prevalence of Blastocystis spp. in children living in the city of Reynosa, Tamaulipas, Mexico. Material y Method: Cross-sectional study that included 238 stool samples from children aged 5 to 12 years from elementary schools in the city of Reynosa, Tamaulipas, Mexico. Results: Of the total number of samples, 13.8% showed the presence of Blastocystis spp., being the most prevalent among the parasites found; the presence of Entamoeba histolytica/dispar, Giardia intestinalis and Enterobius vermicularis was also reported. Conclusions: The prevalence of Blastocystis in areas of Mexico is poorly known; however, studies in various parts of the world suggest an increase, so it is important to determine the presence and its relationship as a human pathogen or opportunist.

Intestinal parasitosis in children from a rural Caribbean area in Colombia

Abstract In Colombia, the prevalence of intestinal parasitosis varies throughout its regions, social classes, and living conditions. We performed a cohort study (2017-2018) on children from 1-10 years old in El Cedro, Ayapel, Colombia. We tested a convenience sampling of those who accepted and signed the consent form. The National Intestinal Parasite Survey was applied; feces and water source sampling were tested for coprological and microbiology analysis, respectively. Education and pharmacologic treatment to the minor and co-inhabitants were performed. After the recruiting, we followed up at 7 and 12 months. Statistical analysis was performed using IBM® SPSS22. Participants 47, 61,7% male, average age 5,7 years. The caretakers had a low educational background. The monthly income of 72,3% of households was < USD 87. The coprological test showed 61,7% with at least one type of parasite; 32,2% with two or more. Trichuris trichiura was the most frequent. Water sources were positive for Escherichia coli. The population tested showed a high frequency of parasitic infection. We did not find a reduction of intestinal parasitosis with educa tion and pharmacologic treatment at the end of the follow-up. It must be necessary to impact social determinants of public health to achieve intestinal parasitosis control.

Resumen En Colombia, la prevalencia de parasitosis intestinal varía por regiones, clases sociales, condiciones de vida. Realizamos estudio de cohorte (2017-2018) en niños de 1-10 años en El Cedro, Ayapel, Colombia. Muestra por conveniencia, se incluyeron aquellos que aceptaron y firmaron el consentimiento. Se aplicó la Encuesta Nacional de Parásitos Intestinales; se analizaron muestras de heces y fuentes de agua para análisis coprológico y microbiológico, respectivamente. Se realizó educación y tratamiento farmacológico al menor y cohabitantes. Después del reclutamiento, seguimiento a los 7 y 12 meses. El análisis estadístico se realizó con IBM® SPSS22. Participantes 47, 61,7% hombres, promedio de edad 5,7 años. Cuidadores con bajo nivel educativo, ingreso mensual del 72,3% de los hogares fue <USD 87. La población analizada mostró una alta frecuencia de infección parasitaria, un 61,7% con al menos un tipo de parásito; 32,2% con dos o más. Trichuris trichiura fue el más frecuente. Las fuentes de agua fueron positivas para Escherichia coli. Al final del seguimiento, no se redujo la frecuencia de la parasitosis intestinal a pesar de educación y tratamiento farmacológico. Se requiere incidir en los determinantes sociales y de salud pública para lograr el control de las parasitosis intestinales.

Change of in-hospital mortality during the first SARS-COV-2 surge in Bogotá, Colombia.

Resumen Introducción: La mortalidad por SARS-COV-2 ha disminuido en diferentes países, pero no se ha evaluado si es igual en Colombia, o si se relaciona con las carac terísticas de los pacientes y tratamientos utilizados. Objetivo: Comparar la mortalidad por SARS-COV-2, en dos periodos de tiempo controlando por factores de riesgo asociados con mortalidad. Metodología: Estudio observacional, basado en una cohorte retrospectiva de pacientes con SARS-COV-2 atendidos en el Hospital Universitario San Ignacio, Bogotá (Colombia), desde el 19 de marzo al 12 de noviembre, 2020. Se comparó la tasa de mortalidad intrahospitalaria de los pacientes egresados antes y después del 21 de agosto de 2020 (primer pico de mortalidad en Colombia) y se analizó el impacto del momento de atención controlando por comorbilidades, severidad al ingreso y tratamiento recibido, usando un modelo de regresión logística. Resultados: 1399 pacientes (944 antes y 455 después del primer pico de mortalidad) fueron analizados. La tasa de mortalidad intrahospitalaria global fue similar en ambos periodos (17.6% vs 16.3%, p=0.539). En el análisis multivariado se encontró que la atención en el segundo periodo de tiempo se asoció a menor mortalidad (OR 0.66 IC95% 0.47; 0.93, p=0.018), a diferencia del aumento de la misma asociado a la edad (OR 1.06 IC95% 1.05; 1.07, p<0.001), sexo masculino (OR 1.84 IC95% 1.33; 2.54 p<0.001), cirrosis (OR 1.89 IC95% 1.24; 2.88, p=0.003), enfermedad renal (OR 1.36 IC95% 1.00; 1.83, p=0.043) y el uso de dexametasona (OR 1.53 IC95% 1.03; 2.28, p=0.031). Conclusiones: La tasa de mortalidad intrahospitalaria se redujo después del 21 de agosto durante la primera ola de la pandemia en Bogotá, posiblemente asociado a la mejoría en la capacidad de respuesta del sistema de salud en ese momento, o a un menor inoculo viral de los pacientes infectados. Estos hallazgos pueden cambiar con la saturación del sistema de salud.

Abstract Introduction: Mortality secondary to SARS-COV 2 has decreases around the world, however this has not been evaluated in Colombia neither has the correlation between patient characteristics or treatments. Objective: To compare the mortality due to SARS-COV-2, in two periods of time, controlling risk factors associated with mortality. Methodology: Observational retrospective cohort study of patients with SARS- COV-2 treated at the San Ignacio University Hospital in Bogotá (Colombia), from March 19 to November 12, 2020. The in-hospital mortality rate of patients discharged before and after August 21, 2020 (surge mortality in Colombia) was com pared. The impact of the moment of attention was analyzed controlled by comorbidities, severity at admission and treatment received using a bivariate and multivariate logistic regression model. Results: 1399 patients (944 before and 455 after August 21) were analyzed. The overall in-hospital mortality rate was similar at both times (17.6%vs16.3percentage, p=0.539). In the multivariate analysis, it was found that the moment of attention was associated with lower mortality (OR 0.66 95% CI0.47;0.93,p=0.018), in contrast to its increase associated with age (OR 1.06 95% CI 1.05;1.07,p=<0.001), male sex (OR 1.84 95%CI 1.33;2.54,p=<0.001), cirrhosis (OR1.89 95%CI 1.24;2.88, p=0.003), kidney disease (OR 1.36 95% CI1.00;1.83,p=0.043) and the use of dexamethasone (OR1.53 95%CI 1.03;2.28,p=0.031). Conclusions: The in-hospital mortality rate fell after August 21 during the first wave of the pandemic in Bogotá-Colombia, possibly associated with an improvement in response capacity, or a lower viral inoculum of infected patients. These findings may change with the saturation of the health system

Associated factors clinical and microbiological characteristics and resistance profiles in catheter-associated urinary tract infections in two highly complex hospitals

Resumen Objetivo: Determinar los factores asociados, las características clínicas, microbiológicas y perfiles de resistencia en las infecciones sintomáticas de tracto urinario asociado a catéter (ISTU-AC) en los dos Instituciones de alto nivel de complejidad. Materiales y métodos: Se llevó a cabo un estudio de casos y controles. Se incluyeron todos los pacientes con más de 48 horas de hospitalización con inserción de catéter urinario y se recolectaron todas las variables clínicas y microbiológicas de cada paciente. Se incluyeron 446 pacientes, 223 con infección sintomática del tracto urinario asociado a catéter. El análisis multivariado se realizó por medio de regresión logística. Resultados: Se evidenció una mayor proporción de hombres en los controles (60,5%) en comparación con los casos (51,1%), la mediana de la edad fue muy similar para los dos grupos de estudio. Se evidenció por el análisis de regresión logística multivariado que la estancia en UCI (OR 2,176; IC de 95% 1,332 - 3,555), más de 10 días de catéter urinario (OR 2,907; IC de 95% 1,744 - 4,846) y la terapia antibiótica previa (OR 0,060; IC de 95% 0,037 - 0,103) fueron los principales factores asociados con la ocurrencia de ISTU-AC. No se encontró asociación entre presentar el evento de interés y la edad, esta variable no está relacionada con la pre sencia de infecciones intrahospitalarias. Es probable que las comorbilidades, presentes con más frecuencia en el adulto mayor, hayan sobrepasado el efecto de la edad en esos estudios. La asociación con género no fue identificada como un factor de riesgo, lo cual podría esperarse, dado que el uso de la sonda vesical hace equiparable el riesgo entre los hombres y las mujeres. Conclusiones: Este estudio mostró que la infecciones sintomáticas de tracto urinario asociado a catéter sigue siendo la entidad más frecuente) en el ámbito hospi talario, poniendo en riesgo la seguridad de los pacientes y aumentando tanto las tasas de morbi-mortalidad

Summary Objective: To determine the associated factors, clinical and microbiological characteristics, and resistance profiles in symptomatic urinary tract infections associated with catheters in the two institutions with a high level of complexity. Materials and methods: A case-control study was carried out. All patients with more than 48 hours of hospitalization with urinary catheter insertion were included and all the clinical and microbiological variables of each patient were collected. 446 patients were included, 223 with symptomatic urinary tract infection associated with a catheter. The multivariate analysis was carried out by means of logistic regression. Results: A greater proportion of men was evidenced in the controls (60.5%) compared to the cases (51.1%), the median age was very similar for the two study groups. It was evidenced by the multivariate logistic regression analysis that the stay in the ICU (OR 2.176; 95% CI 1.322 - 3.555), more than 10 days of urinary catheter (OR 2.907; 95% CI 1.744 - 4.846) and antibiotic therapy previous (OR 0.060; 95% CI 0.037 - 0.103) were the main factors associated with the occurrence of CA-UTI. No association was found between presenting the event of interest and age, this variable is not related to the presence of intrahospital infections. Co morbidities, which are more frequently present in the elderly, are likely to have outweighed the effect of age in these studies. The association with gender was not identified as a risk factor, which could be expected, since the use of the urinary catheter makes the risk comparable between men and women. Conclusions: This study showed that symptomatic urinary tract infections associated with catheters are still a frequent entity in the hospital setting, putting the safety of patients at risk and increasing both morbidity and mortality rates

Statistical analysis of 484 Mycobacterium tuberculosis genomes reveals an association between single nucleotide polymorphisms on ponA1 gene and LAM and Haarlem lineages

Abstract Objectives: Evaluate the association between rifampicin resistance and the presence of at least one SNP in the rpoB and ponA1 genes and the spoligotype defined lineages. Material and Methods: This study analyzed two databases of 484 genomes of M. tuberculosis from strains isolated from patients in the cities of Lima and Callao, for which the odds ratio (OR) was calculated considering belonging to a certain spoligotype defined lineages as an exposure factor. Results: No statistically significant association (ρ value> 0.05) was found between the presence of at least one SNP in the rpoB gene and the lineages included in the study (LAM, Haarlem, T and Beijing). However, a statistically significant association was found between the presence of at least one SNP in the ponA1 gene and the LAM and Haarlem lineages (ρ value <0.05). An association was found between the P631S SNP in the ponA1 gene and the LAM and Haarlem lineages; and the A516T SNP, of this same gene, presented an association with the LAM lineage. Likewise, an association was found between rifampicin resistance and the LAM lineage. Conclusions: The presence of SNPs in the ponA1 gene is associated with the LAM and Haarlem lineages.

Resumen Objetivos: Evaluar la asociación entre la resistencia a rifampicina y la presencia de al menos un SNP en los genes rpoB y ponA1 y los linajes definidos por espoli gotipos. Material y Métodos: Este estudio analizó dos bases de datos de 484 genomas de M. tuberculosis de cepas aisladas de pacientes de las ciudades de Lima y Callao, para lo cual se calculó el odds ratio (OR) considerando la pertenencia a determinado linaje definido por espoligotipos como un factor de exposición. Resultados: No se encontró una asociación estadísticamente significativa (valor de ρ >0.05) entre la presencia de al menos un SNP en el gen rpoB y los linajes incluidos en el estudio (LAM, Haarlem, T y Beijing). No obstante, se halló una asociación estadísticamente significativa entre la presencia de al menos un SNP en el gen ponA1 y los linajes LAM y Haarlem (valor de ρ <0.05). Se encontró una asociación entre el SNP P631S del gen ponA1 y los linajes LAM y Haarlem; y el SNP A516T, de este mismo gen, presentó una asociación con el linaje LAM. Asimismo, se halló una asociación entre la resistencia a rifampicina y el linaje LAM. Conclusiones: La presencia de SNPs en el gen ponA1 está asociada con los linajes LAM y Haarlem.

Scorpion envenomation in Brazil: an update

Abstract Accidents caused by scorpions represent a major health problem on planet, both in individual terms and in the public health sphere. Morbid events can occur in different manifestations, and different clinical conditions must be differentiated for adequate treatment. In addition to the potential injury to human hosts, scorpion venom has been investigated for the therapy of several illnesses. Based on these aspects, the present article aims to present the clinical, diagnostic, therapeutic and prophylactic aspects of scorpionism.

Resumen Los accidentes causados por escorpiones representan un problema mayor de salud pública tanto en términos de daños individuales como en la esfera de la salud pública. Los eventos mórbidos pueden ocurrir con diferentes manifestaciones y condiciones clínicas que deben ser diferenciadas para un manejo adecuado. Ade más del daño potencial que ocasionan a los humanos, el veneno del escorpión ha sido estudiado con el fin de analizar su potencia aplicación para le tratamiento de algunas enfermedades. Este articulo presenta una actualización sobre los aspectos clínicos, terapéuticos y profilácticos del escorpionismo.

Hepatitis E Virus: A review of the current status and perspectives

Abstract Hepatitis E virus produces approximately 20-million infections per year; symptomatic cases are over 3-million and deaths are approximately 60,000. Generally, it is self-limited; however, it can cause up to 30% mortality in pregnant women and can be chronic in immunosuppressed people. The transmission path of the Hepatitis E virus is principally fecal-oral, especially in developing countries; in industrialized countries, it is transmitted as a zoonosis, through organ transplants or blood transfusions. The vaccine developed is only licensed in China. Currently, no treatment is available for the HEV infection and work is underway in identifying the viral cycle and the immune response. This article sought to offer a review of the theme on the hepatitis E virus, from the last six years, to describe current general aspects of the Hepatitis E virus, genome, ways of transmission and contribute to its visibility for its prevention and control.

Resumen El virus de la hepatitis E produce aproximadamente 20 millones de infecciones por año; los casos sintomáticos superan los 3 millones y las muertes son apro ximadamente 60.000. Generalmente es autolimitada; sin embargo, puede causar hasta un 30% de mortalidad en mujeres embarazadas y puede ser crónica en personas inmunodeprimidas. La vía de transmisión del virus de la hepatitis E, es principalmente fecal-oral; especialmente en los países en desarrollo. En los países industrializados, se transmite como zoonosis, a través de trasplantes de órganos o transfusiones sanguíneas. La vacuna desarrollada solo tiene licencia en China. Actualmente, no hay tratamiento disponible para la infección por HEV y se está trabajando para identificar el ciclo viral y la respuesta inmune. Este artículo buscó ofrecer una revisión del tema sobre el virus de la hepatitis E, de los últimos seis años, para describir aspectos del virus de la Hepatitis E, genoma, vías de transmisión y contribuir a su visibilidad para su prevención y control.

Eyelid molluscum contagiosum: Cutaneous manifestation of immunosuppression

Resumen El molusco contagioso es una infección viral cutánea, usualmente benigna y autolimitada, causada por un virus del género Molluscipoxvirus. Es más frecuente en niños, adultos jóvenes sexualmente activos e inmunosuprimidos. La lesión clínica característica es una pápula umbilicada eucrómica o de tono perlado, que se disemina rápidamente y puede afectar cualquier superficie muco-cutánea, aunque la localización en los párpados es atípica. Se presentan dos casos de pacientes jóvenes inmunosuprimidos, con moluscos contagiosos palpebrales, en quienes el diagnóstico clínico inicial fue incorrecto. Se enfatiza la importancia de diagnosti car oportunamente las lesiones papulares que afectan la piel del párpado ya que la presencia de molusco contagioso en esta zona se considera una manifestación cutánea de inmunosupresión.

Abstract Molluscum contagiosum is a cutaneous viral infection, usually benign and self-limited, caused by the molluscum contagiosum virus, of the genus Molluscipoxvirus. It is more common in pediatric population, sexually active young people and immunosuppressed patients. Clinical presentation is characterized by umbilicated white to flesh-colored or pearly papules, which rapidly spread and can affect any muco-cutaneous membrane. Although the eyelid presentation is atypical, we herein present two young, immunosuppressed patients, with diagnosis of palpebral molluscum contagiosum, in which the initial clinical diagnosis was wrong. We emphasize the importance in making a timely diagnosis of papular lesions localized on the eyelids and the correlation of these lesions as a cutaneous manifestation of immunosuppression.

Anophthalmic socket infection caused by Scedosporium sp. in immunocompetent patient: Case Report

Resumen Scedosporium sp. es un género de hongos filamentosos que de forma infrecuente se relaciona a infecciones localizadas o diseminadas en pacientes inmunocom prometidos, o inmunocompetentes con trauma penetrante contaminado. Reportamos el caso de un paciente masculino de 31 años con antecedente de trauma penetrante por arma de fuego requiriendo enucleación de su ojo izquierdo, quien 12 años posterior al trauma inicial presenta necrosis de la cavidad anoftálmica con extrusión del implante y lisis del párpado inferior, finalmente identificando Scedosporium sp. como germen causal, y un mucocele en el seno frontal como reservorio. El paciente recibió tratamiento médico con voriconazol sistémico, desbridamiento quirúrgico amplio, y resección endoscópica del quiste de retención mucoso, con una evolución satisfactoria. Las infecciones micóticas de la cavidad anoftálmica son infrecuentes, requiriendo una alta sospecha diagnóstica y trata miento agresivo para evitar consecuencias potencialmente devastadoras.

Abstract Scedosporium sp. is a genus of filamentous fungi that is infrequently related to localized or disseminated infections in either immunocompromised patients, or immunocompetent patients with penetrating contaminated trauma. We report the case of a 31-year-old patient with a history of penetrating gunshot wound that required enucleation of his left eye, who 12 years after initial trauma presents necrosis of the anophthalmic socket with implant extrusion and lysis of inferior eyelid, finally identifying the causal agent to be Scedosporium sp. The patient received medical treatment with systemic voriconazole, and wide surgical debridement, with a satisfactory evolution. Fungal infections of anophthalmic sockets are infrequent, requiring a high diagnostic suspicion and aggressive treatment to avoid potentially devastating consequences.