Revista de Salud Pública

Impact of the COVID-19 pandemic on the Colombian population according to mitigation measures. Preliminary data from epidemiological models for the period March 18 to April 18, 2020

RESUMEN Objetivo Este estudio tiene como primer objetivo: realizar predicciones del curso de la infección en el horizonte temporal desde marzo 18 a abril 18 del 2020, según diferentes medidas de aislamiento aplicadas. Las predicciones incluyen, población total contagiada, mortalidad y necesidad de recursos hospitalarios. Segundo objetivo: modelar la mortalidad y la necesidad de recursos hospitalarios, estratificando por edad el escenario de contagio del 70% de la población. Métodos Para el primer objetivo, nos basamos en el número de casos confirmados en el país hasta marzo 18, 2020 (n=93). Como suposiciones para el modelo, incluimos un índice de contagio R0=2,5 y el índice de casos reales por cada caso confirmado. Para la proporción de pacientes que necesitarían cuidados intensivos u otros cuidados intrahospitalarios, nos basamos en datos aportados por el Imperial College of London. Para el segundo objetivo usamos como tasa de mortalidad por edad, datos aportados por el Instituto Superiore di Sanità en Italia. Resultados Basándonos en los 93 casos reportados al 18 de marzo, si no se aplicase ninguna medida de mitigación, para el 18 de abril el país tendría un total de 613 037 casos. Medidas de mitigación que reduzcan el R0 en un 10%, generan una reducción del 50% del número de casos. Sin embargo, a pesar de reducirse los casos a la mitad, todavía habría un déficit en el número de camas requeridas y sólo uno de cada dos pacientes tendría acceso a dicho recurso. Conclusión En nuestro modelo encontramos que las medidas de mitigación que han sido implementadas hasta la fecha por el gobierno colombiano, se fundamentan en evidencia suficiente para pensar que es posible reducir significativamente el número de casos contagiados y con esto, el número de pacientes que requerirán manejo hospitalario.

ABSTRACT Introduction First case of COVID-19 in Colombia was diagnosed on March 6th. Two weeks later, cases have rapidly increased, leading the government to establish some mitigation measures. Objectives The first objective is to estimate and model the number of cases, use of hospital resources and mortality by using different R0 scenarios in a 1-month scenario (from March 18 to April 18, 2020), based on the different isolation measures applied. This work also aims to model, without establishing a time horizon, the same outcomes given the assumption that eventually 70% of the population will be infected. Materials and Methods Data on the number of confirmed cases in the country as of March 18, 2020 (n=93) were taken as the basis for the achievement of the first objective. An initial transmission rate of R0= 2.5 and a factor of 27 for undetected infections per each confirmed case were taken as assumptions for the model. The proportion of patients who may need intensive care or other in-hospital care was based on data from the Imperial College of London. On the other hand, an age-specific mortality rate provided by the Instituto Superiore di Sanità in Italy was used for the second objective. Results Based on the 93 cases reported as of March 18, if no mitigation measures were applied, by April 18, the country would have 613 037 cases. Mitigation measures that reduce R0 by 10% generate a 50% reduction in the number of cases. However, despite halving the number of cases, there would still be a shortfall in the number of beds required and only one in two patients would have access to this resource. Conclusion This model found that the mitigation measures implemented to date by the Colombian government and analyzed in this article are based on sufficient evidence and will help to slow the spread of SARS-CoV-2 in Colombia. Although a time horizon of one month was used for this model, it is plausible to believe that, if the current measures are sustained, the mitigation effect will also be sustained over time.

SIR model of the COVID-19 pandemic in Colombia

RESUMEN Objetivo Desarrollar un modelo SIR pronóstico de la pandemia de COVID-19 en el territorio colombiano. Métodos Se utilizó un modelo SIR con enfoque determinístico para pronosticar el desarrollo de la pandemia de COVID-19 en Colombia. Los estados considerados fueron susceptibles (S), infecciosos (i) y recuperados o fallecidos (R). Los datos poblacionales se obtuvieron del Departamento Administrativo Nacional de estadística (Proyecciones de Población 2018-2020, difundida en enero de 2020) y los datos sobre casos diarios confirmados de COVID-19 del Instituto Nacional de Salud. Se plantearon diferentes modelos variando el número básico de reproducción (R0). Resultados A partir de los casos reportados por el Ministerio de Salud se crearon cuatro ambientes o escenarios simulados en un modelo SIR epidemiológico, se extendieron las series de tiempo hasta el 30 de mayo, fecha probable del 99% de infección poblacional. Un R0 de 2 es la aproximación más cercana al comportamiento de la pandemia durante los primeros 15 días desde el reporte del caso 0, el peor escenario se daría en la primera semana de abril con un R0 igual a 3. Conclusiones Se hacen necesarias nuevas medidas de mitigación y supresión en las fases de contención y transmisión sostenida, como aumento de la capacidad diagnostica por pruebas y desinfección de zonas pobladas y hogares de aislamiento.

ABSTRACT Objective To develop a prognostic SIR model of the COVID-19 pandemic in Colombia. Materials and Methods A SIR model with a deterministic approach was used to forecast the development of the COVID-19 pandemic in Colombia. The states considered were susceptible (S), infectious (i) and recovered or deceased (R). Population data were obtained from the National Administrative Department of Statistics (DANE) - Population Projections 2018-2020, released in January 2020-, and data on daily confirmed cases of COVID-19 from the National Institute of Health. Different models were proposed varying the basic reproduction number (R0). Results Based on the cases reported by the Ministry of Health, 4 simulated environments were created in an epidemiological SIR model. The time series was extended until May 30, the probable date when 99% of the population will be infected. R0=2 is the basic reproduction number and the closest approximation to the behavior of the pandemic during the first 15 days since the first case report; the worst scenario would occur in the first week of April with R0=3. Conclusions Further mitigation and suppression measures are necessary in the containment and sustained transmission phases, such as increased diagnostic capacity through testing and disinfection of populated areas and homes in isolation.

Predictions of a SEIR model for COVID-19 cases in Cali-Colombia

RESUMEN Objetivo Predecir el número de casos de COVID-19 en la ciudad de Cali-Colombia mediante el desarrollo de un modelo SEIR. Métodos Se utilizó un modelo determinista compartimental SEIR considerando los estados: susceptibles (S), expuestos (E), infectados (I) y recuperados (R). Los parámetros del modelo fueron seleccionados de acuerdo a la revisión de literatura. En el caso de la tasa de letalidad, se usaron los datos de la Secretaría de Salud Municipal de Cali. Se plantearon varios escenarios teniendo en cuenta variaciones en el número básico de reproducción (R0) y en la tasa de letalidad; además, se comparó la predicción hasta el 9 de abril con los datos observados. Resultados A través del modelo SEIR se encontró que, con el número básico de reproducción más alto (2,6) y utilizando la letalidad calculada para la ciudad de 2,0%, el número máximo de casos se alcanzaría el primero de junio con 195 666 (prevalencia); sin embargo, al comparar los casos observados con los esperados, al inicio la ocurrencia observada estaba por encima de la proyectada; pero luego cambia la tendencia con una disminución marcada de la pendiente. Conclusiones Los modelos epidemiológicos SEIR son métodos muy utilizados para la proyección de casos en enfermedades infecciosas; sin embargo, se debe tener en cuenta que son modelos deterministas que pueden utilizar parámetros supuestos y podrían generar resultados imprecisos.

ABSTRACT Objective To predict the number of cases of COVID-19 in the city of Cali-Colombia through the development of a SEIR model. Methods A SEIR compartmental deterministic model was used considering the states: susceptible (S), exposed (E), infected (I) and recovered (R). The model parameters were selected according to the literature review, in the case of the case fatality rate data from the Municipal Secretary of Health were used. Several scenarios were considered taking into account variations in the basic number of reproduction (R0), and the prediction until april 9 was compared with the observed data. Results Through the SEIR model it was found that with the highest basic number of reproduction [2,6] and using the case fatality rate for the city of 2,0%, the maximum number of cases would be reached on June 1 with 195 666 (prevalence). However, when comparing the observed with the expected cases, at the beginning the observed occurrence was above the projected, but then the trend changes decreasing the slope. Conclusions SEIR epidemiological models are widely used methods for projecting cases in infectious diseases, however it must be taken into account that they are deterministic models that can use assumed parameters and could generate imprecise results.

SARS-coV-2 spatio - temporal analysis in Cali, Colombia

RESUMEN Objetivo Describir la distribución espacio-temporal del COVID-19 en la ciudad de Cali durante el primer mes de epidemia. Métodos Se realizó un análisis exploratorio de datos espaciales, compuesto por un análisis de densidad de Kernel y se verificó la presencia de patrones espaciales por medio de la función K de Ripley. Resultados La distribución espacial de los casos tiende a concentrarse inicialmente en el norte y sur de la ciudad, con una dinámica cambiante hacia el oriente y occidente. Conclusiones El patrón espacial identificado puede estar influenciado por las medidas de aislamiento tomadas a nivel local y nivel nacional, además no se puede descartar el efecto del poco acceso que tiene la población general a las pruebas diagnósticas, los retrasos y represamientos para conocer los resultados de las mismas y aun los posibles sesgos por dificultades en la técnica de toma de la muestra o su conservación.

ABSTRACT Objective To describe the spatio-temporal distribution of the COVID-19 in the city of Cali during the first month of the epidemic. Methods An exploratory analysis of spatial data was carried out, consisting of a kernel density analysis and the presence of spatial patterns was verified by the K-Ripley function. Results The spatial distribution of the cases tends to initially concentrate in the north and south of the city, with a changing dynamic towards the east and west. Conclusions The identified spatial pattern may be influenced by the isolation measures taken at the local and national level, but the effect of the low access of the general population to diagnostic tests, delays and restraints to know the results cannot be ruled out and even possible biases due to difficulties in the technique of taking the sample or its conservation.

Impact of mitigation measures on the COVID-19 pandemic in Chile: preliminary data for the period April 14 to May 14

RESUMEN Objetivo Modelar el curso de la pandemia COVID-19 en Chile y proyectar la demanda de recursos hospitalarios y letalidad en escenarios simulados: primero, recurriendo a distintas medidas de mitigación para contener la propagación en un mes -desde el 14 de abril hasta el 14 de mayo del 2020- y, segundo, en el supuesto contagio del 70% de la población, según edad, sin límite de tiempo. Métodos Utilizamos como base el número de contagios confirmados con SARS-CoV-2 en Chile hasta el 14 de abril del 2020 (8 273 casos, 94 muertes). Para los distintos escenarios, asumimos un número reproductivo básico que va desde R0=2,5 hasta R0=1,5. La proyección de la demanda hospitalaria y letalidad por edad se fundamentaron en reportes italianos y británicos. Resultados Estimamos que para el 14 de mayo del 2020 habría en Chile 2 019 775 contagiados y 15 068 fallecidos en ausencia de medidas de mitigación (R0=2,5). Al implementar medidas que reduzcan R0 a 1,5 (detección temprana y aislamiento de casos, cuarentena y distanciamiento social de mayores de 70 años), el número de contagios y letalidad disminuirían a 94 235 y 703 respectivamente. Sin embargo, la demanda hospitalaria aún sobrepasaría la capacidad de respuesta. La población de mayor riesgo la componen los mayores de 60 años. Conclusión Encontramos evidencia a favor de las medidas de mitigación implementadas por el Gobierno chileno. Sin embargo, medidas más estrictas son necesarias para no colapsar el sistema sanitario, que cuenta con menos recursos hospitalarios que los proyectados. Es esencial aumentar la capacidad hospitalaria en términos de equipamiento y entrenamiento del personal de salud.

ABSTRACT Objetive To model disease progression, healthcare demand and case fatality rate attributed to COVID-19 pandemic that may occur in Chile in 1-month time, by simulating different scenarios according to diverse mitigation measures hypothetically implemented. Furthermore, we aimed to estimate the same outcomes assuming that 70% of the population will be infected by SARS-CoV-2, with no time limit assumption. Methods We based on the number of confirmed COVID-19 cases in Chile up to April 14th 2020 (8 273 cases and 94 deaths). For the simulated scenarios we assumed basic reproduction numbers ranging from R0=2.5 to R0=1.5. The estimation of the number of patients that would require intensive care and the age-specific case fatality rate were based on data provided by the Imperial College of London and the Instituto Superiore di Sanità en Italia. Results If no mitigation measures were applied (R0=2.5), by May 25, Chile would have 2 019 775 cases and 15 068 deaths. If mitigations measures were implemented to decrease R0 to 1.5 (early detection of cases, quarantine, social distancing of elderly), the number of cases and deaths would importantly decrease. Nonetheless, the demand for in-hospital care including intensive care would exceed the available resources. Our age-specific analysis showed that population over 60 years are at higher risk of needing intensive care and death. Conclusion Our evidence supports the mitigation measures implemented by the Chilean government. Nevertheless, more stringent measures are needed to prevent the health care system's collapse due to shortfall of resources to confront the COVID-19 pandemic.

Assessment of the implementation of preventive measures by Iraqis people to reduce the spread of coviD-19 pandemic

ABSTRACT Background and aim The new outbreak "Coronavirus disease 2019 (COVID-19)" happened in china is caused by severe acute respiratory distress syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Consequently, it spreads across the globe and is affecting wellbeing frameworks and the global economy. This pandemic disease places a heavy burden on governments in general, so individuals must adhere to WHO's instructions to limit its spread. The current study was applied to find out the extent of commitment among the Iraqi people to the standards of prevention measures against the coronavirus. Materials and Methods A cross sectional study was conducted with 1153 respondents widely in all governorates of Iraq to identify the commitment of the Iraqis to the preventive measures against COVID-19 in Iraq. This study covered the Iraqis in three main regions (Southern, middle, and Northern) for data collection. It was conducted between the 17th and 25th of March 2020, and Iraqis were administered with a structured questionnaire comprising of three domains. Results The results showed that the majority of the respondents (52%) were female, and most of them (42.3%) were observed between the age group of 31-40 years. About 82% of the respondents were residents of urban areas. Conclusion This study reveals the excellent implementation of preventive measures by the population. It is observed that the application of prevention standards in the countryside is less than in the city.

RESUMEN Antecedentes y objetivo El nuevo brote "Enfermedad del coronavirus 2019 (COVID-19)" que sufrió en China es el problema del coronavirus 2 del síndrome de dificultad respiratoria aguda grave (SARS-CoV-2). En consecuencia, se extiende por todo el mundo y está afectando los marcos de bienestar y la economía global. Esta enfermedad pandémica supone una gran carga para los gobiernos en general, por lo que las personas deben cumplir con las instrucciones de la OMS para limitar su propagación. El estudio actual se aplicó para determinar el grado de compromiso entre el pueblo iraquí con los parámetros de medidas de prevención contra el coronavirus. Materiales y Métodos Se realizó un estudio transversal con 1153 encuestados en todas las provincias de Iraq para identificar el compromiso de los iraquíes con las medidas preventivas contra COVID-19 en Iraq. Este estudio cubrió a los iraquíes en tres regiones principales (sur, medio y norte) para la recopilación de datos. Se realizó entre el 17 y el 25 de marzo de 2020, y los iraquíes fueron administrados con un cuestionario estructurado que consta de tres dominios. Resultados los resultados mostraron que la mayoría de los encuestados (52%) eran mujeres, y la mayoría de ellos (42,3%) se observaron entre el grupo de edad de 31-40 años. Alrededor del 82% de los encuestados eran residentes de áreas urbanas. Conclusión Este estudio revela la excelente implementación de medidas preventivas por parte de la población. Se observa que la aplicación de normas de prevención en el campo es menor que en la ciudad.

COVID-19 pandemic and Public Health Policies in Peru: March-May 2020

RESUMEN Objetivo El trabajo tiene como objetivo analizar la dinámica del comportamiento de la COVID-19 en el Perú, estimar y evaluar el impacto de la política pública de supresión (cuarentena). Métodos El modelo epidemiológico SIR y la estimación con el método de Mínimos Cuadrados Ordinarios (MCO). Resultados Se encontró que el número básico de propagación (Ro) cayó de 6,0 a 3,2 habiéndose reducido en 54% por efecto de la estrategia de supresión, y dos meses después cayó a 1,7. Sin embargo, sigue siendo alto y evidencia que aún continúa en expansión el nivel de infectados, con los efectos sociales y económicos adversos que esta medida implica. Conclusión La COVID-19 es una enfermedad que crece exponencialmente, por lo cual, la política de salud basada en la estrategia de supresión ha permitido aplanar la curva de contagio, evitando el colapso del Sistema de Salud.

ABSTRACT Objective The objective of the study is to analyze the behavior dynamics of COVID-19 in Peru, estimate and evaluate the impact of the suppression public policy (quarantine). Methods The SIR epidemiological model and the estimation with the ordinary Least Squares (OLS) method. Results It was found that the basic number of propagation (Ro) fell from 6,0 to 3,2 having been reduced by 54% due to the suppression strategy; and two months later it falls to 1,7. However, it remains high and evidence that the level of those infected continues to expand with its adverse social and economic effects. Conclusion: COVID-19 is a disease that grows exponentially, and that the health policy based on the suppression strategy has allowed to flatten the contagion curve, thus avoiding the collapse of the Health System.

Quarantine by COVID-19 in a health professional: psychological, social and family dimensions

RESUMEN Objetivo Analizar las dimensiones psicológica, social y familiar de una profesional de la salud en cuarentena por COVID-19. Método Reporte de caso. Se utilizó una matriz como bitácora diaria para recolección de información de las tres dimensiones analizadas. Se respetó el anonimato de la persona en todo momento. Resultados Se presenta un estudio de caso con los principales hitos de la vida diaria de una profesional de la salud durante los 14 días de cuarentena. En la dimensión psicológica se destacan sentimientos de miedo e incertidumbre ante el riesgo; en la social, sobresale la importancia del acompañamiento de familiares y amigos que fortalecieron la adaptabilidad al proceso, y en la familiar, la relevancia de los vínculos afectivos y la comunicación permanente. Conclusión Los aspectos desarrollados en las diferentes dimensiones deben ser considerados por quienes participan en el manejo y seguimiento de casos en el cuidado primario, en tanto son la posibilidad de fortalecer el mecanismo neuronal y hormonal a través del soporte familiar y social. El ser profesional de la salud y el conocimiento sobre el tema puede generar una mayor afectación (por el aislamiento involuntario relacionado con el riesgo de COVID-19), no solo clínica, sino también psicológica, social y familiar. En este este sentido, quienes manejan los casos deben considerar la integralidad en las condiciones de salud.

ABSTRACT Objective To analyze the psychological, social and family dimensions of a health professional quarantined by COVID-19. Method Case report. A matrix was used as a daily log to collect information from the three dimensions analyzed. The anonymity of the person was respected at all times. Results A case study is presented with the main milestones in the daily life of a health professional during the 14 days of quarantine. In the psychological dimension, feelings of fear and uncertainty in the face of risk are highlighted, in the social dimension the importance of the accompaniment of family and friends who strengthened the adaptability to the process stands out, and in the family dimension the relevance of affective bonds and permanent communication. Conclusion The aspects developed in the different dimensions should be considered by those who participate in the management and follow-up of cases in primary care, as they are the possibility of strengthening the neuronal and hormonal mechanism through family and social support. Being a health professional and having knowledge on the subject can generate a greater effect of involuntary isolation related to the risk of COVID-19. This is not only clinical, but also psychological, social and family. In this sense those who manage the cases should consider the integrality in health conditions.

SARS-C0V.2/COVID-I9 in Colombia: tendencies, predictions, and tensions about health system

RESUMEN Objetivo Analizar la evolución temporal de la primera etapa del COVID-19 en Colombia a través del modelo SIRD. Métodos Se analizó la evolución temporal del COVID-19 según los individuos infectados en Colombia del 6 de marzo al 15 de abril de 2020. Se realizó el modelo SIRD modificando la tasa de transmisión (b) bajo tres escenarios: 1) cuarentena hasta el 1 de julio, 2) cuarentena flexible., hasta el 11 de mayo con un b del 4%, y 3) cuarentena flexible2 hasta el 11 de mayo con b del 8%, con el fin de predecir el número de casos totales y el 5% de infectados en UCI para contrastarlo con el número de camas y personal UCI. Resultados Los escenarios mostraron que levantar la cuarentena el 11 de mayo significará un aumento en el número de infectados, entre 54 105 a 116 081 individuos con COVID-19. Así mismo, la rápida aceleración en la tasa de contagios se traduce en una mayor demanda de camas y personal en UCI: en el escenario de cuarentena flexible2 se colapsarían las 2 650 camas disponibles y se necesitaría de 5 intensivitas y 4 enfermeras por paciente al 1 julio. Conclusión Las medidas de distanciamiento social obligatorias contribuyen al retraso de la saturación del sistema de salud; sin embargo, son difíciles de sostener en el tiempo desde una perspectiva económica. Por lo tanto, para tener una distensión de la cuarentena es necesario adoptar medidas para ampliar la capacidad del sistema de salud y así evitar su colapso.

ABSTRACT Objective To analyze the temporal progress in the early stage of COVID-19 in Colombia using the SIRD model. Methods We analyzed the temporal progress of COVID-19 based on the number of infected persons between March 6th and April 15th, 2020. The SIRD model was implemented with variation in the rate of transmission (b) in three ways. A. Quarantine until July 11. 2. B. Flexible quarantine, [b=4%]. C. Flexible quarantine2 [b=8%]. Consecutively, we aimed to predict the number of total cases and 5% of infected persons in ICU to match them with the hospital beds and ICU staff. Results The results show that the number of COVID-19 cases will increase from 54 105 to 116 081 approximately, if the quarantine is lifted on May 11. If the infection rate increase, more hospital beds and a bigger ICU staff will be mandatory. The currently 2 650 beds won't be enough in the flexible quarantine2, and five intensive care specialist and four nurses per patient will be needed. Conclusion Measures like mandatory social distancing help delay the saturation of the health care system. However, it's impracticable to maintain them due to a possible economic crisis. Therefore, it's necessary to take action to enhance the ability of the health care system to avoid a collapse.

Severity, susceptibility and social norms perceived as antecedents of the intention to be vaccinated against COVID-19

RESUMEN Objetivo Evaluar el efecto del riesgo y las normas sociales percibidos sobre la COVID-19 y sobre la intención de vacunarse si se contara con una vacuna para prevenir la infección. Métodos Se desarrolló una investigación cuantitativa, explicativa y con diseño transversal. Los datos se recopilaron mediante un cuestionario estructurado aplicado de manera electrónica a habitantes de más de 18 años de edad en el estado de Puebla, en México. Se utilizó un análisis con ecuaciones estructurales para identificar los efectos entre las variables estudiadas. Resultados Tanto la severidad como la susceptibilidad percibidas al contraer COVID-19 tuvieron un efecto positivo sobre las normas sociales percibidas sobre el virus. Mientras la severidad percibida tuvo un efecto positivo sobre la intención de vacunarse, la susceptibilidad percibida resultó no significativa sobre la intención de vacunarse contra COVID-19. Conclusiones La intención de vacunarse contra COVID-19 es afectada por la severidad y las normas sociales percibidas por contraer la infección. Sin embargo, la susceptibilidad percibida ante el virus no tiene un efecto sobre la intención de vacunarse.

ABSTRACT Objective To evaluate the effect of perceived risk and social norms on COVID-19 and on the intention to be vaccinated if a vaccine were available to prevent infection. Methods A quantitative, explanatory and cross-sectional research was developed. The data was collected through a structured questionnaire applied electronically to inhabitants over 18 years of age in the state of Puebla in Mexico. An analysis with structural equations was used to identify the effects among the constructs studied. Results The results showed that both the perceived severity and susceptibility of contracting COVID-19 had a positive effect on the perceived social norms about the virus. Also, while the perceived severity had a positive effect on the intention to vaccinate, the perceived susceptibility was not significant on the intention to vaccinate against COVID-19. Conclusion Intention to be vaccinated against COVID-19 is affected by the severity and perceived social norms of contracting the infection. However, the perceived susceptibility to the virus does not have an effect on the intention to be vaccinated.

Underlying conditions on the southern border between Colombia and Venezuela to face the COVID-19 pandemic

RESUMEN Objetivos Dimensionar la migración humana en la frontera sur entre Colombia y Venezuela (Departamento de Guainía), y caracterizar las condiciones sociales, de acceso y de atención en salud frente a la pandemia de COVID-19. Métodos Estudio mixto, epidemiológico y etnográfico. Se calcularon: tasa de migrantes venezolanos (según Migración Colombia al 31 de diciembre de 2019), acceso efectivo a atención médica y dotación en puestos de salud (según datos recolectados entre junio de 2017 y julio de 2019, en todos los puestos de salud de Guainía, mediante entrevistas semiestructuradas, observación participante y el uso de Google Earth™ y Wikiloc™). Los tiempos medianos se calcularon y graficaron en Stata™. Se describieron dinámicas culturales y de atención en salud a partir del trabajo de campo y de una permanente revisión documental. Resultados Guainía ocupa el puesto 23 en número total de venezolanos, pero es el cuarto departamento en densidad de venezolanos (14,4%). En ausencia del centro de salud de San José, en el río Guainía los tiempos medianos hasta la institución de referencia real son de 8,7 horas en invierno y 12,3 en verano y los casos complejos requieren remisión aérea. En el río Inírida, sin el centro de Chorro Bocón, los tiempos reales son de 11,9 horas en invierno y 16,1 en verano. Solo el 57% de los puestos de salud tenía insumos para manejar infección respiratoria aguda. Conclusiones Ante la llegada de COVID-19 a territorios sur-fronterizos, es necesario fortalecer inmediatamente servicios médicos y de salud pública para evitar elevadas tasas de letalidad.

ABSTRACT Objectives To size human migration on the southern border between Colombia and Venezuela (Guainía department), and characterize the social, access and health care conditions relevant to the COVID-19 pandemic. Methods Mixed epidemiological and ethnographic study. Rate of Venezuelan migrants was calculated according to Migration Colombia data until December 31st, 2019, also effective access to medical care, and provision of health posts were calculated, with information from each Guainía health post collected from June 2017 to June 2019, through semi-structured interviews, participant observations, Google Earth™ and Wikiloc™. Stata™ was used to calculate and graph median times of effective access. Cultural dynamics and health care conditions were described by the field work information and a permanent documentary review. Results Guainía is the 23rd department, according to the total number of Venezuelans, but the fourth in Venezuelans density (14,4%). In the Guainía river, the median times to the real reference health institution were 8,7 hours in winter and 12,3 in summer, and complex cases require air referrals. In the Inírida river, the median times to the real reference health institution were 11,9 hours in winter and 16,1 in summer. Only 57% of the health posts had supplies for acute respiratory infections. Conclusions Facing COVID-19 in south border territories, it is necessary to immediately strengthen medical and public health services to avoid high fatality rates.

Estimation of serial interval and basic reproductive number for imported cases of COVID-19

RESUMEN Objetivo Estimar el intervalo serial y el número básico de reproducción de COVID-19 entre casos importados durante la fase de contención en Pereira, Colombia, 2020. Método Se realizó un estudio cuantitativo para determinar algunos aspectos de la dinámica de transmisión de la COVID-19. Se utilizaron las entrevistas epidemiológicas de campo en los que se incluyeron 12 casos confirmados por laboratorio con PCR-RT para SARS-CoV-2 importados y sus correspondientes casos secundarios confirmados, entre los que estaban contactos familiares y sociales. Resultados Los intervalos seriales en la COVID-19 se ajustan a una distribución Gamma, con una media del intervalo serial de 3,8 días (± 2,7) y un R0 de 1,7 (IC 95% 1,06-2,7) inferior a lo encontrado en otras poblaciones con inicio del brote. Conclusiones Un intervalo serial inferior al periodo de incubación como el que se estimó en este estudio sugiere un periodo de transmisión presintomático que, según otras investigaciones, alcanza un pico promedio a los 3,8 días, hecho que sugiere que durante la investigación epidemiológica de campo la búsqueda de contactos estrechos se realice desde al menos 2 días antes del inicio de síntomas del caso inicial.

ABSTRACT Objective To estimate the serial interval and the basic reproduction number of COVID-19 between imported cases during the containment phase in Pereira-Colombia, 2020. Method A quantitative study was carried out to determine the transmission dynamics for COVID-19. Field epidemiological data were used, which included 12 laboratory-confirmed cases with RT-PCR for imported SARS-CoV-2 and their corresponding confirmed secondary cases, including family and social contacts. Results The serial intervals in COVID-19 fit a Gamma distribution, with a mean of the serial interval of 3.8 days (2.7) and an R0 of 1.7 (95% CI 1.06-2.7) lower than that found in other populations with onset of the outbreak. Conclusions A serial interval lower than the incubation period such as that estimated in this study, suggests a presymptomatic transmission period that according to other investigations reaches an average peak at 3.8 days, suggesting that during the field epidemiological investigation the search for contacts Narrowing is performed from at least 2 days before the onset of symptoms of the initial case.

Morbidity and mortality due to COVID-19 in latin america: study of three countries - february to july 2020

RESUMEN El 11 de marzo de 2020 la OMS declara el estado de pandemia por COVID-19. Para el 31 de julio de 2020, se han reportado 17 106 007 casos y 668 910 muertes a nivel global. La región de las Américas ha reportado 9 152 173 casos (53%) y 351 121 muertes (52,2%), por lo que resulta de interés el análisis de los datos en países de esta región. Argentina, Chile y Colombia, debido a sus características culturales, políticas y económicas, presentan similitudes que favorecen su estudio y comparación. Objetivo Realizar un análisis exploratorio de variables relacionadas con los sistemas de salud y datos epidemiológicos de COVID-19 en Argentina, Chile y Colombia. Metodología Estudio descriptivo de variables reportadas por los organismos oficiales de cada Estado. Resultados Se presentaron diferencias importantes en los casos activos, el número de pruebas realizadas y la mortalidad entre los tres países. La Ciudad Autónoma de Buenos Aires presenta la mayor tasa de casos activos a julio de 2020. De estos tres países, Colombia presenta las mayores cifras de fallecimientos confirmados por COVID-19 con cierre a 31 de julio de 2020. Se sugiere la unificación de un sistema de información para América Latina que permita hacer un monitoreo integral de variables de interés, que favorezca la calidad de los datos y que unifique el lenguaje técnico.

ABSTRACT On March 11, 2020 the WHO declared the state of pandemic by COVID-19. As of July 29, 2020, 17 106 007 cases and 668 910 deaths have been reported globally. The region of the Americas has reported 9 152 173 cases (53%) and 351 121 deaths (52,2%), so the aggregate analysis of the data in countries in this region is of interest. Argentina, Chile and Colombia, due to their demographic and economic characteristics, are countries that can be studied. Objetive Analyze variables related to health systems and epidemiological data of SARS-CoV-2 virus disease in Argentina, Chile and Colombia. Methods A descriptive study of variables reported by the official organisms of each state was used. Results There is an important difference in active cases and mortality among the three countries; the Autonomous City of Buenos Aires has the highest number of active cases as of July 2020. Colombia has the highest numbers of deaths confirmed by COVID-19 in the months of February to July 2020. We suggest the unification of an information system for Latin America that allows a comprehensive monitoring of variables, improves the qua-lity of data and unifies the technical language.

Risk of transmission of SARS-CoV-2: multi-criteria spatial evaluation in a municipality of Colombia, 2020

RESUMEN Objetivo Zonificar el riesgo de transmisión de SARS-CoV-2 en Villavicencio, Colombia, mediante una evaluación espacial multicriterio. Materiales y Métodos Se implementó un modelo de evaluación multicriterio, a través de un proceso de análisis jerárquico integrado a un sistema de información geográfica. Como criterios fueron incluidos atributos descriptores de las amenazas y vulnerabilidades de transmisión viral identificados mediante un modelo epidemiológico en una misma escala numérica adimensional y proporcional a la probabilidad de contagio. Las alternativas evaluadas corresponden a entidades espaciales representadas por pixeles. Los criterios fueron ponderados de acuerdo con el juicio experto de los evaluadores, con los cuales se realizó el cálculo de una matriz de prioridades relativas normalizada, que permitió la estimación de un vector de pesos, cuyo grado de inconsistencia fue admisible. La magnitud del riesgo se calculó con una sumatoria ponderada de la valoración de los criterios, de acuerdo con un geoproceso de álgebra de mapas. Resultados La heterogeneidad espacial del riesgo de transmisión de SARS-CoV-2 fue descrita en Villavicencio, lo que permitió identificar las áreas con mayor probabilidad de transmisión localizadas en barrios caracterizados por una alta vulnerabilidad socioeconómica. Conclusiones La representación cartográfica derivada de la implementación de un modelo multicriterio, integrado a un Sistema de Información Geográfica, en el análisis de riesgo de transmisión de SARS-CoV-2 constituye un aporte metodológico relevante para la toma de decisiones que definan estrategias de mitigación a escala local y que faciliten la localización y optimización de recursos por parte de las autoridades sanitarias.

ABSTRACT Objective To zoning the risk of SARS-CoV-2 transmission in Villavicencio, Colombia, through a multi-criteria spatial evaluation. Materials and Methods A multi-criteria evaluation model was implemented, through a hierarchical analysis process, integrated into a Geographic Information System. As criteria, descriptive attributes of the threats and vulnerabilities of viral transmission identified by means of an epidemiological model were included, on the same dimensionless numerical scale and proportional to the probability of contagion; the alternatives evaluated correspond to spatial entities represented by pixels. The criteria were weighted according to the expert judgment of the evaluators, with whom the calculation of a normalized matrix of relative priorities was performed, which allowed the estimation of a vector of weights, the degree of inconsistency of which was admissible. The magnitude of the risk was calculated with a weighted summation of the evaluation of the criteria, according to a map algebra geoprocessing. Results The spatial heterogeneity of the risk of SARS-CoV-2 transmission was described in Villavicencio, allowing the identification of the areas with the highest probability of transmission, located in neighborhoods characterized by high socioeconomic vulnerability. Conclusions The cartographic representation derived from the implementation of a multicriteria model, integrated to a Geographical Information System, in the SARS-CoV-2 transmission risk analysis, constitutes a relevant methodological contribution for decision-making defining strategies of mitigation at the local level, facilitating the location and optimization of resources by the health authorities.

An interactive web-based dashboard to track COVID-19 in Colombia. Case study: five main cities

ABSTRACT Objective Design and implement an interactive web-based dashboard to track COVID-19 in Colombia Methods A tool was designed and implemented to analyze the data of Covid-19 positive cases in Colombia and published by the Instituto Nacional de Salud. The tool is based on the implementation of business intelligence methods with which you can understand the behavior of the pandemic in Colombia and generate structured data for decision-making by government levels. The tool displays, on a single screen, information on the number of cases, patient status, age ranges, city, location department, and gender. This information can be dynamically filtered and focus analyzes on the national, departmental, or municipal order. Additionally, methods are implemented for trend analysis, both on a linear and semi-log scale, as well as for calculating the case fatality rate in each of the municipalities. Results A web-based data analysis dashboard is implemented for semi-continuous monitoring of the COVID-19 pandemic in Colombia. With the use of the tool, a situational analysis is carried out for five of the most important cities in Colombia. Conclusions The application is effective, flexible, and easy to use. The situational analysis reflects that public policies for the control of the disease have been favorable for Medellín, but for Cartagena, Bogotá, Barranquilla, and Cali, complementary measures are required.

RESUMEN Objetivo Diseñar e implementar una herramienta dinámica web para el seguimiento de la COVID-19 en Colombia. Métodos Se diseña e implementa una herramienta para el análisis de los datos de los casos positivos de COVID-19 en Colombia y publicados por el Instituto Nacional de Salud. La herramienta se basa en la implementación de métodos de inteligencia empresarial con los que se pueda entender el comportamiento de la pandemia en Colombia y generar datos estructurados para la toma de decisiones por parte de los estamentos gubernamentales. La herramienta despliega, en una sola pantalla, información sobre número de casos, estado de los pacientes, rangos de edad, ciudad y departamento de ubicación y género. Esta información puede ser filtrada de forma dinámica y enfocar los análisis en el orden nacional, departamental o municipal. Adicionalmente, se implementan métodos para el análisis de tendencia, tanto en escala lineal como en escala semilogarítmica, así como para el cálculo de la tasa de letalidad en cada uno de los municipios. Resultados Se implementó una herramienta de análisis de datos basado en la web para el seguimiento semicontinuo de la pandemia de la COVID-19 en Colombia. A partir de la herramienta se realiza un análisis situacional para cinco de las ciudades más importantes de Colombia. Conclusiones El aplicativo es eficaz, flexible y de fácil manejo. El análisis situacional refleja que las políticas públicas para el control de la enfermedad han sido efectivas para Medellín, pero, para Cartagena, Bogotá, Barranquilla y Cali, se requieren medidas complementarias.

Social inequalities in under-five mortality: a systematic review

RESUMEN Objetivo Identificar las características de los estudios sobre desigualdades sociales, en la mortalidad de niños menores de cinco años; sus perspectivas teóricas, ejes de desigualdad, métodos y resultados. Método Revisión sistemática de la literatura. Se consultaron cuatro bases de datos electrónicas y Google Scholar; se incluyeron estudios entre 2010 y 2018. Resultados Se analizaron 126 artículos. En el 62,7%, se estudió el territorio como eje de desigualdad, seguido por los determinantes socioeconómicos (27,8%). La mortalidad neonatal, infantil y en la niñez fue analizada en el 19,0%, 49,2% y 32,3%, respectivamente. Predominaron los estudios ecológicos (62,7%) y longitudinales (50,0%). Se encontró una disminución considerable en las tasas de mortalidad; sin embargo, el descenso no fue homogéneo entre subpoblaciones. Conclusiones La literatura reporta una marcada disminución de la mortalidad en niños menores de cinco años; no obstante, las brechas entre distintos ejes de desigualdad continúan y en algunos lugares se han incrementado. Las brechas entre los estratificadores variaron de acuerdo con el tiempo, lugar, eje de desigualdad y tipo de mortalidad analizada.

ABSTRACT Objective To identify the characteristics of the published studies on social inequalities in under-five mortality, their theoretical perspectives, axes of inequality, methods and results. Method We carried out a systematic literature review. We consulted four electronic databases and Google Scholar, for studies published between 2010 and 2018. Results We analyzed 126 articles. In 62.7%, territory was studied as the axis of inequality, followed by socioeconomic determinants (27.8%). Neonatal, infant and under-five mortality was analyzed as an output in health in 19.0%, 49.2% and 32.3%, respectively. It predominated ecological (62.7%) and longitudinal (50.0%) studies. Significant reductions in mortality rates were found, however, the decline was not homogeneous among subpopulations. Conclusions The literature reports a marked decrease in under-five mortality; however, the gaps between different axes of inequality continue and in some cases they have increased. Gaps varied according to time, place, axis of inequality and type of mortality analyzed.

Public health responses for the management of COVID-19 in detention centers. Literature review

RESUMEN Objetivo Identificar en la literatura las recomendaciones para la prevención y control de la COVID-19 en prisiones y centros de detención preventiva, con el fin de caracterizar las líneas de respuesta. Materiales y Métodos Se identificaron 88 publicaciones en bases datos y repositorios digitales usando términos clave. Luego de aplicar la metodología PRISMA, se seleccionaron 18 publicaciones para realizar el análisis cualitativo. Las publicaciones elegidas refieren a recomendaciones de académicos, investigadores y expertos. Para ilustrar el enfoque de la respuesta gubernamental, se analizan seis publicaciones emitidas por autoridades gubernamentales de Canadá, Bélgica, Francia y Estados Unidos. Se excluyeron publicaciones relacionadas con centros de detención para menores o pacientes psiquiátricos. Resultados Si bien hay poca literatura, se logró caracterizar las recomendaciones disponibles, agrupándolas en seis líneas de respuesta. En su caracterización resulta primordial el establecimiento de medidas físicas, administrativas, jurídicas, higiénicas y de salubridad. Asimismo, se plantea la necesidad de garantizar el manejo epidemiológico y la adecuación de los servicios de salud en concordancia con la carga de enfermedad y las vulnerabilidades de los detenidos. Conclusiones La respuesta a la COVID-19 en centros de reclusión es compleja y desafiante. Por ende, las medidas convencionales del orden higiénico, sanitario, médico y epidemiológico no son suficientes. Estas deben ir acompañadas por un ajuste de las políticas criminal y penitenciaria, con el fin de reducir y controlar la densidad poblacional, además de la adaptación permanente de la administración de justicia en función de las medidas de contención, mitigación o supresión de la pandemia.

ABSTRACT Objective To identify in the literature the recommendations for the prevention and control of COVID-19 in prisons and other preventive detention centers, in order to characterize the response lines. Materials and Methods 88 publications were identified in databases and digital repositories using key terms. After applying the PRISMA methodology, 18 publications were selected to carry out the qualitative analysis. The chosen publications refer to recommendations from academics, researchers and experts. 6 publications issued by the Governments of Canada, Belgium, France and United States of America were analyzed to make clear the government perspectives. Publications related to underage and psychiatric patients were not considered. Results Although there isn't enough literature, it was possible to characterize the available recommendations, grouping them into 6 lines of action. Within these lines, the establishment of physical, administrative, legal, hygienic and health measures is considered essential. In addition, it is necessary to ensure the epidemiological management and adaptation of health services based on the burden of disease and susceptibility of the persons under arrest. Conclusions The response to COVID-19 in detention centers is complex and challenging. Therefore, the conventional steps like hygienic, sanitary, medical and epidemiological care aren't enough. In fact, the adjustment of criminal and penitentiary policies and the transformation of the justice system are considered essential to reduce and control the residential density.

COVID-19 in Latin America: a systematic review and bibliometric analysis

RESUMEN Objetivo Describir y analizar la actividad científica sobre la COVID-19 en Latinoamérica. Materiales y Métodos Mediante una revisión sistemática de la literatura en PubMed, LILACS y los repositorios preimpresos BioRxiv y medRxiv, se recuperaron todos los documentos disponibles sobre la COVID-19 en Latinoamérica desde el primero de enero hasta el 24 de abril de 2020, para su análisis bibliométrico. Resultados Un total de 29 publicaciones fueron incluidas en el análisis. El país con más producción científica fue Brasil (10/29; 34,4%), seguido de Colombia (6/29; 20,6%) y México (6/29; 20,6%). La universidad con más artículos fue la Universidad Tecnológica de Pereira, Colombia (5/29; 17,24%). El 41,3% de las publicaciones fueron documentos preimpresos. La mayoría de los estudios excluidos fueron comentarios editoriales u opiniones de expertos. Tres de cada cuatro investigaciones tenían un enfoque epidemiológico (21/29; 72,4%); limitados estudios sobre el diagnóstico (5/29; 17,2%), la fisiopatogenia (2/29; 2,8%) y los aspectos terapéuticos (1/29; 3,4%) fueron encontrados. Conclusión Pese al crecimiento exponencial de publicaciones en el mundo, existe una limitada cantidad de información sobre el comportamiento de esta infección en Latinoamérica. Se requiere la publicación de estudios con alta calidad metodológica, que aporten conocimiento sobre el impacto de la pandemia en la región.

ABSTRACT Objective Describe and analyze scientific activity on COVID-19 in Latin America. Materials and Methods Through a systematic review of the literature in PubMed, LILACS, and the preprinted repositories BioRxiv and medRxiv, all available documents on COVID-19 in Latin America from January 1 to April 24, 2020, were retrieved for review and bibliometric analysis. Results A total of 29 publications were included in the analysis. The country with the most scientific production was Brazil (10/29; 34,4%) followed by Colombia (6/29; 20,6%) and Mexico (6/29; 20,6%). The university with the most articles was the Technological University of Pereira, Colombia (5/29; 17,2%). 41,3% of the publications were preprinted documents. Most of the excluded studies were editorial comments or expert opinions. Three out of four investigations had an epidemiological focus (21/29; 72,4%); Limited studies on diagnosis (5/29; 17,24%), pathophysiology (2/29, 2,8%) and therapeutic Conclusion Despite the exponential growth of publications in the world, there is a limited amount of information on the behavior of this infection in Latin America. The publication of studies with high methodological quality is required, which provide knowledge of the impact of the pandemic in the region.

Health workers as hate crimes targets during COVID-19 outbreak in the Americas

ABSTRACT Many health workers in the Americas, especially women, have been victims of discrimination and different types of grievances during the COVID-19 pandemic. These brief reflections aim to make the problem visible, offer theoretical explanations and some recommendations. The pandemic constitutes a massive crisis that triggers fears and reassuring of diffuse anxieties, which often includes someone to blame. Healthcare workers have become circumstantial scapegoating targets. The inflicted attacks can be understood as reactive hate crimes since they are originated from an allegedly healthy person to an allegedly contaminated person. People seems to incur in a sanitary profiling process based on the health worker's uniform. However, these expressions of hatred are fueled by pre-pandemic circumstances such as the precariousness of health systems and deficient medical equipment, misogyny, or the pervasiveness of authoritarian tendencies. Understanding this situation as a human rights issue, it is suggested to consider measures in order to discourage these attacks, such as: guaranteeing the appropriate conditions of hospitals and the personal protective equipment of workers; development of recognition campaigns of the healthcare staff and the work they carry out (in particular female nurses); and implementing transitory regulations that sanction any hate crime type attack to health workers or the scientific community. Furthermore, educational advocacy efforts should reiterate basic hygiene measures for the people, but also focus on refuting false and pseudoscientific beliefs that contribute to the fear-induced construction of the health worker as a threat of contagion.

RESUMEN Muchos trabajadores sanitarios de las Américas, especialmente mujeres, han sido víctimas de discriminación y diferentes tipos de agravios durante la pandemia de COVID-19. Estas breves reflexiones tienen por objetivo visibilizar el problema, ofrecer algunas explicaciones teóricas y algunas recomendaciones. La pandemia constituye una situación de crisis generalizada que detona miedos y necesidad de calmar ansiedades difusas, lo que incluye buscar culpables. Los trabajadores de la salud se han convertido en chivos expiatorios circunstanciales. Los ataques sufridos pueden ser comprendidos como crímenes de odio reactivos en cuanto que se dirigen de una persona supuestamente sana a otra supuestamente contaminada. Las personas parecen incurrir en un proceso de perfilamiento sanitario basado en el uniforme del personal de salud. No obstante, estas expresiones de odio se alimentan de circunstancias previas a la pandemia como la precariedad de los sistemas de salud y del equipamiento de los trabajadores, la misoginia o la existencia de tendencias autoritarias. Comprendiendo la situación como un asunto de derechos humanos, para contrarrestar estos ataques se sugiere considerar medidas como: garantizar condiciones hospitalarias apropiadas y de equipamiento protector de los trabajadores; campañas de reconocimiento de la labor que desempeñan (en particular las enfermeras); y el establecimiento de normativas transitorias que sancionen cualquier ataque de odio contra trabajadores sanitarios o la comunidad científica. Adicionalmente, se sugiere implementar campañas educativas que, además de reiterar las medias higiénicas básicas, se enfoquen en desmentir creencias falsas o pseudocientíficas que contribuyen a la construcción, inducida por el miedo, del trabajador de la salud como una amenaza de contagio.

Clinical practice, work and risks of physical therapy in the face of COVID-19

RESUMEN En este artículo reflexivo se analiza el papel que juega la fisioterapia frente al COVID-19 en la fisioterapia respiratoria y la seguridad y salud en el trabajo, campos importantes y a su vez álgidos porque, ante la situación actual de pandemia, los profesionales de salud en general son sometidos a inadecuadas condiciones laborales que impactan su alta posibilidad de contagio en su ámbito social y económico. De igual forma, se especifica la relación del quehacer profesional de la fisioterapia con cada fase de intervención según la manifestación de los signos y síntomas que presenta el paciente, basados en procesos y procedimientos sustentados en experiencias de otros países, en especial de China. Finalmente se discuten las medidas seguras y la descripción del proceso acelerado para desarrollar la telerehabilitación como consecuencia del COVID-19.

This paper discusses the function of the physiotherapy against COVID-19: how does it work in the chest physiotherapy and workplace health and safety. These fields are considered leading and decisive to take care of health professionals. In general, they work under unsuitable conditions that raise the likelihood of virus transmission in the social and economic context. Likewise, it specifies the relationship between the function of the physiotherapy and every intervention phase, according to exhibiting signs and symptoms on the patient. It is based on processes and procedures that are underpinned by experiences from other countries, specifically China. Finally, there is a discussion about safety measures and a description of the accelerated process to promote remote physical therapy due to COVID-19.