Biota colombiana

Functional characterization of plants and their utility in the selection of species for the ecological restoration of high-Andean ecosystems

Resumen Para iniciar un proceso de restauración en áreas disturbadas, es importante seleccionar especies vegetales nativas que aporten diversidad funcional al ecosistema en recuperación y permitan el establecimiento de nuevos individuos hacia etapas sucesionales más avanzadas. Evaluamos 14 rasgos de historia de vida en 20 especies de una zona de transición entre bosque altoandino y páramo en la reserva Aguas Vivas, Soacha, Colombia. Registramos información de tipos de polinización y dispersión, hábito de crecimiento, altura máxima, tipo y tamaño del fruto, número de semillas por fruto, textura de la hoja, tipo de indumento, área foliar, área foliar específica, nitrógeno foliar, contenido foliar de materia seca y dureza foliar. El análisis de componentes principales mostró que el nitrógeno foliar, la dureza foliar y el área foliar específica fueron los rasgos más informativos para definir asociaciones entre especies. Encontramos tres tipos funcionales que comprenden plantas con diferentes estrategias de adaptación, que se considerarán a la hora de seleccionar grupos de especies vegetales a reintroducir en ambientes modificados. Sin embargo, esta selección también se debe realizar teniendo en cuenta el conocimiento local, la disponibilidad de propágulos, y el estado sucesional de las áreas en recuperación.

Abstract To start a restoration process in disturbed areas, it is important to select plant species that provide functional diversity to the recovering ecosystem and allow the establishment of new individuals towards more advanced stages of succession. We evaluated 14 life history traits in 20 species in a transition zone between high Andean forest and paramo in the Aguas Vivas reserve, Soacha, Colombia. We record information on pollination and dispersal types, growth habit, maximum height, fruit type and size, number of seeds per fruit, leaf texture, leaf area, specific leaf area, leaf nitrogen, leaf dry matter content and leaf hardness. The principal components analysis showed that leaf nitrogen, leaf hardness and specific leaf area were the most informative features to define associations between species. We found three functional types that include plants with different adaptation strategies, which will be considered when selecting plant species to be introduced in modified environments. However, this selection should also be made taking into account local knowledge, availability of propagules, and the successional status of the recovering areas.

Records of Streblidae (Diptera: Hippoboscoidea) in a tropical dry forest fragment in Colombia

Abstract Streblidae is a highly specialized fly family, which feeds exclusively on bats. Here we present information about the species of streblids occurring in two fragments of tropical dry forest in Cauca, Colombia. Between April and November 2012, we conducted 16 capture events of bats using mist nets, which were open from 18:00 until 06:00. Each captured bat was identified and the ectoparasites found were preserved in 90% alcohol solution. A total of 85 ectoparasites were collected and 10 species of streblids were identified in seven bat species. Our analysis showed that these parasites are locally specialized, which strongly contrasts with the high number of host species that have been reported for them. We hypothesize that this discrepancy is due to local constraints that filter the fundamental niche of these flies. This work enriches the inventories of the entomofauna in remnants of tropical dry forest, an ecosystem in a critical state of conservation.

Resumen Streblidae es una familia de moscas altamente especializada, la cual se alimenta exclusivamente de murciélagos. Aquí se presenta información sobre las especies de Streblidae presentes en dos fragmentos de bosque seco tropical en Cauca, Colombia. Entre abril y noviembre de 2012 se realizaron 16 jornadas de captura de murciélagos, utilizando redes de niebla, las cuales estuvieron abiertas desde las 18:00 hasta las 06:00. Cada murciélago capturado se revisó y los ectoparásitos encontrados se conservaron en alcohol al 90%. Se recolectaron 85 ectoparásitos y se identificaron 10 especies de estréblidos en siete especies de murciélagos. El análisis mostró que estos parásitos son localmente especializados, lo cual contrasta fuertemente con el alto número de especies hospederas que han sido reportadas para ellos. Se hipotetiza que esta diferencia se debe a restricciones locales que filtran el nicho fundamental de estas moscas. Este trabajo enriquece los inventarios de la entomofauna en remanentes de bosque seco tropical, un ecosistema en estado crítico de conservación.

Ichthyofauna of the Manso River (Caldas, Colombia)

Resumen Se presenta un listado de los peces de la cuenca media y baja del río Manso (Caldas, Colombia), el cual consolida los resultados de 33 campañas de muestreo que se realizaron en ocho estaciones distribuidas en la zona media y baja del río y una quebrada tributaria, además de la información previamente existente. En total se han registrado para el río Manso 68 especies de peces. En el periodo 2012-2014 se registraron 55 especies, de las cuales 15 están incluidas en el Libro Rojo de Peces de Agua Dulce de Colombia, 12 son especies de importancia para consumo humano y las demás representan interés biológico y ecológico.

Abstract This paper presents a list of the fishes of the middle and lower part of the Manso River basin, in the department of Caldas, Colombia. It consolidates the results of 33 sampling events at 8 stations distributed in the middle and lower Manso river zone and a tributary stream, in addition to previously available information. A total of 68 species of fish have been recorded for the Manso River. In the period 2012-2014, 55 species were registered, of which 15 are included in the Red Book of Freshwater Fish of Colombia, 12 are species of importance for human consumption and the others that represent biological and ecological interest.

Herpetofauna from two municipalities of southwestern Colombia

Abstract We present a preliminary list of the herpetofauna of Tumaco and Francisco Pizarro municipalities, department of Nariño, Colombia, located in the south of the Chocó biogeographic region, based on field data and on museum collection databases and literature. We recorded 25 species of amphibians and 55 reptiles. The most species-rich families were Hylidae and Craugastoridae for amphibians, and Colubridae and Dactyloidae for reptiles, a pattern similar to that observed on a global scale. Two new species records for Colombia are presented -Pristimantis walkeri and Scinax tsachila, as well as range extensions for Allobates talamancae, Anolis auratus, Dendropsophus ebraccatus, Gonatodes albogularis and Scinax sugillatus. Species accumulation curves and sampling coverage reveal that more field studies are needed for complementing this list, especially studies using methodologies focused on aquatic and fossorial species, and that there could be an effect of deforestation on the diversity of the herpetofauna, which concurs with the lack of canopy amphibians and the exclusive presence of species associated with leaf litter or forest interior in the locations with best plant coverage.

Resumen Se presenta un listado preliminar de la herpetofauna de los municipios de Tumaco y Francisco Pizarro, departamento de Nariño, Colombia, ubicados al sur del Chocó biogeográfico, basado en datos de campo y búsquedas en base de datos y literatura. Registramos 25 especies de anfibios y 55 de reptiles, siendo las familias Hylidae y Craugastoridae (anfibios) y las familias Colubridae y Dactyloidae (reptiles) las de mayor riqueza, patrón similar al observado a escala global. Se reportan dos nuevos registros de especies para Colombia (Pristimantis walkeri y Scinax tsachila), así como extensiones de distribución geográfica (Allobates talamancae, Anolis auratus, Dendropsophus ebraccatus, Gonatodes albogularis y Scinax sugillatus). Las curvas de acumulación de especies y la cobertura de muestreo revelan que se necesitan más estudios de campo para complementar esta lista, especialmente los estudios que utilizan metodologías enfocadas en especies acuáticas y fosoriales, y que podría haber un efecto de la deforestación en la diversidad de la herpetofauna, lo cual concuerda con la falta de anfibios de dosel y la presencia exclusiva de especies asociadas a la hojarasca o al interior del bosque en las localidades con mejor cobertura vegetal.

Birds of the Chicamocha Canyon, Colombia: a call for conservation

Resumen Presentamos el listado de la avifauna actual del Cañón del Chicamocha ubicado entre los departamentos de Boyacá y Santander, Colombia. La región tiene una extensión de 3342 km2 y un gradiente altitudinal entre 300 y 2300 m s. n. m. Los datos para el desarrollo de este listado fueron recolectados de investigaciones en campo, de la revisión de información secundaria y de registros en bases de datos. Se presenta un total de 291 especies de aves, entre las que se encuentran 239 residentes y 53 migratorias neárticas, de las cuales 8 se encuentran en alguna categoría de amenaza a nivel global y nacional, 7 son endémicas y 12 casi endémicas, destacándose el colibrí amazilia ventricastaño (Amazilia castaneiventris) y el cucarachero de Nicéforo (Thryophilus nicefori). Con esta información se aporta al desarrollo de iniciativas para la creación de áreas protegidas, fomento del aviturismo comunitario y proyectos de restauración ecológica.

Abstract We present a list of birds of the Chicamocha Canyon, located between the departments of Boyacá and Santander, Colombia. The region has an extension of 3342 km2 and an altitudinal gradient between 300 and 2300 m a. s. l. The dataset used in the development of this list was compiled from research carried out in the area, review of secondary sources, and review of databases. A total of 291 species of birds are presented, among which 239 are residents and 53 are Nearctic migrants; 8 of the species are in some threat category at a global and national level, 7 are endemic and 12 are almost endemic. The chestnut-bellied hummingbird (Amazilia castaneiventris) and Niceforo's wren (Thryophilus nicefori) are highlighted. This information contributes to the development of initiatives for the creation of protected areas, promotion of community birdwatching and ecological restoration projects.

Demographic analysis for the reproductive management of captive jaguars (Panthera onca) in Colombian zoos

Abstract A demographic and reproductive analysis of the population of jaguars (Panthera onca) (n = 38) held in Colombian zoos. Records were analyzed (1970-2010), where paternity and maternity data were completed by DNA’s microsatelite analysis. The SPARKS program was used for the construction of the Regional Studbook for Jaguars and the Population Management 2000 (PM 2000) program for its analysis. The main results obtained were: the census, distribution by sex and age, fertility rate, survival rate, mortality rate, average life expectancy, reproductive value, reproductive projections for 5, 10, 15, 20 and 100 years while preserving the 90% of genetic diversity. The most relevant findings were: the population analyzed in 2010 was decreasing (λ = 0.9876), the generational time (T) was longer for females (T = 18.21 years) than for males (T = 17.46 years), the genetic diversity was on the rise from 1994 to 2002 and remained stable from 2002 to 2009 (GD = 0.78). The genetic analysis allowed to structure the captive population, optimizing the analysis and the reliability of the results, opening the possibility of applying these methods as a conservation model in other threatened species.

Resumen Se caracterizó demográfica y reproductivamente la población cautiva del jaguar (Panthera onca) (n=38) en zoológicos colombianos. Se analizaron registros (1970-2010), en los que se completaron datos de paternidad y maternidad mediante análisis de microsatélites de ADN. Se obtuvieron el censo, la distribución por sexo y edad, las tasas de fertilidad, supervivencia y mortalidad, la expectativa de vida media, el valor reproductivo y proyecciones reproductivas para 5, 10, 15, 20 y 100 años, conservando el 90 % de la diversidad genética. La población analizada en el 2010 estaba decreciendo (λ= 0.9876), el tiempo generacional (T) fue mayor para las hembras (T=18.21 años) que para los machos (T= 17.46 años) y la diversidad genética estuvo en ascenso entre 1994-2002 y se mantuvo estable entre 2002-2009 (GD=0.78). El análisis genético permitió estructurar la población cautiva, optimizando el análisis y la confiabilidad de los resultados, abriendo la posibilidad de aplicar estos métodos como modelo de conservación en otras especies amenazadas.

Range extension of Micrurus camilae (Serpentes: Elapidae) in the Colombian Caribbean

Resumen Se presenta el primer registro de la especie Micrurus camilae para el departamento de Sucre, Colombia, ampliando su área de distribución y contribuyendo con datos sobre su hábitat. El individuo se encontró en un parche de vegetación en bosque seco tropical, a diferencia de los reportes anteriores donde se localiza en bosque húmedo tropical.

Abstract We present the first record of the snake Micrurus camilae for the department of Sucre, Colombia, extending its known distribution area and contributing with data about its habitat. The specimen was found in a tropical dry forest patch, in contrast with previous records, in which M. camilae was located in tropical rainforests.

Modeling the potential distribution of Corapipo leucorrhoa (Pipridae) in the upper Magdalena Valley, Tolima, Colombia

Resumen En los últimos años, el saltarín gorgiblanco (Corapipo leucorrhoa) ha sido reportado por fuera de su distribución habitual hacia el norte del valle alto del Magdalena (Tolima, Colombia), lo cual supone que su distribución real no es bien conocida. En este estudio se reportan tres registros de C. leucorrhoa en el departamento del Tolima. Con la revisión de varios registros de bases de datos y nuestros reportes, modelamos un mapa de distribución potencial para esta especie, encontrando que hay condiciones propicias para su presencia a lo largo del valle alto del Magdalena y que esta región debe ser incluida como parte de su distribución geográfica para Colombia.

Abstract In recent years, the white-bibbed manakin (Corapipo leucorrhoa) has been reported outside its usual distribution north of the upper Magdalena valley (Tolima, Colombia), which means that its actual distribution is not well known. In this study, three records of C. leucorrhoa in the department of Tolima are reported. With the review of several database records and our reports, we modeled a potential distribution map for this species, finding that there are favorable conditions for its presence along the upper Magdalena valley, and that this region should be included as part of its geographical distribution for Colombia.

Birds of the Chingaza National Park and buffer zone, Eastern Cordillera Colombia

Resumen Describimos la composición de especies de aves del Parque Nacional Natural (PNN) Chingaza y su zona de amortiguación, a partir de la revisión de 10 estudios ornitológicos, trabajo de campo entre 2008-2017 y la expedición Colombia Bio en 2018. Reportarmos para el PNN Chingaza y su zona de amortiguación un total de 531 especies, agrupadas en 339 géneros y 57 familias. Seis especies presentes en el parque son endémicas de Colombia, 14 casi endémicas, 1 en peligro crítico, 6 en peligro, 4 vulnerables, 3 casi amenazadas y 37 migratorias. Esta lista incluye 149 especies adicionales a la información previamente conocida por datos publicados y colecciones ornitológicas. Adicionalmente, generamos códigos de barras genéticos, con base en secuencias del gen mitocondrial COI, para 74 especies y presentamos los primeros registros genéticos de Colombia en la plataforma para códigos de barra genéticos Barcode of Life Datasystems (BOLD) para Dysithamnus leucostictus, Chamaeza turdina, Rupicola peruvianus, Atlapetes semirufus, Euphonia mesochrysa y Chlorospingus flavopectus olsoni. El presente listado es una herramienta para incentivar el estudio y conservación de las aves en este sector de la Cordillera Oriental colombiana.

Abstract We describe the bird species composition in the Chingaza National Park and its buffer zone, based on a revision of 10 published studies, recent fieldwork between 2008-2017, and the Colombia Bio expedition on 2018. We report 531 species for the Chingaza National Park and its buffer zone, grouped in 339 genera and 57 families. Six species are endemic to Colombia, 14 are near-endemic, 1 is critically endangered, 6 are endangered, 4 are vulnerable, 3 are near-threatened and 37 are migratory. This list includes 149 species more than those comprised in previous information from published datasets and ornithological collections. Additionally, we generated genetic barcodes, based sequences of the mtDNA gene COI, for 74 species, and present the first genetic record from Colombia in Barcode of Life Datasystems (BOLD) for Dysithamnus leucostictus, Chamaeza turdina, Rupicola peruvianus, Atlapetes semirufus, Euphonia mesochrysa and Chlorospingus flavopectus olsoni. This list is a tool to promote the study and conservation of birds in this area of the Colombian Eastern Cordillera.