Scielo RSS http://www.scielo.org.co/rss.php?pid=0304-358420200002&lang=en vol. 42 num. 113 lang. en http://www.scielo.org.co/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.co http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-35842020000200001&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen Para Brycon moorei, los datos sobre morfometría, en estados iniciales del desarrollo, son inexistentes. El objetivo de este estudio fue establecer las principales relaciones alométricas en los estadios tempranos de B. moorei. Se analizaron 12 variables merísticas en un tiempo experimental que transcurrió desde la eclosión hasta los 15 días post-eclosión. En el estadio larval vitelino (LV) se registró, en promedio: longitud total (LT) de 4,74 ± 0,05 mm; longitud estándar (LE) de 4,21 ± 0,07 mm; longitud del hocico (SnL) 0,3 ± 0,01; diámetro del ojo (ED) 0,37 ± 0,007 mm; longitud de la cabeza (HL) 1,02 ± 0,04 mm; altura de la cabeza (HH) 0,88 ± 0,069 mm; altura del cuerpo (-BH) 1,26 ± 0,01 mm; longitud hocico-aleta pectoral (SnPF) 1,35 ± 0,034; ausencia de aletas pélvicas, anales y dorsal y el peso fue de 1,8 ± 0,2 mg. En la etapa juvenil (J), las medidas fueron: LT de 25,66 ± 0,64 mm; LE de 21,49 ± 0,63 mm; SnL de 1,69 ± 0,059 mm; ED de 1,71 ± 0,048 mm; HL de 6,33 ± 0,21 mm; HH de 4,89 ± 0,47 mm; BH de 6,13 ± 0,17 mm; SnPF de 6,48 ± 0,19 mm; SnPeF de 10,83 ± 0,28 mm; SnDF de 11,16 ± 0,33 mm; Sn-AF de 3,68 ± 0,34 mm; el peso fue de 221,6 ± 15,84 mg. Para LV, el número de miómeros pre-anales fue 28,65 ± 4,7; los post-anales fueron 23,85 ± 4,27, con un total de 52,47 ± 8,34; para J los miómeros no fueron visibles. Esta información es fundamental para fines ecológicos y productivos en B. moorei.<hr/>Abstract For Brycon Moorei, morphometry data in early stages of development is non-existent. The objective was to establish the main allometric relationships in the early stages of B. moorei. 12 meristic variables were analyzed in an experimental time ranging from hatching to 15 days post-hatching. In the larval vitelline stage (LV), it was recorded on average: total length (TL) of 4.74 ± 0.05 mm; standard length (EL) of 4.21 ± 0.07 mm; snout length (SnL) 0.3 ± 0.01; eye diameter (ED) 0.37 ± 0.007 mm; head length (HL) 1.02 ± 0.04 mm; head height (HH) 0.88 ± 0.069 mm; body height (BH) 1.26 ± 0.01 mm; snout-pectoral fin length (SnPF) 1.35 ± 0.034; absence of pelvic, anal and dorsal fins and the weight was 1.8 ± 0.2 mg. In juvenile stage (J), the measures were: LT of 25.66 ± 0.64 mm; LE of 21.49 ± 0.63 mm; SnL of 1.69 ± 0.059 mm; 1.71 ± 0.048 mm ED; HL 6.33 ± 0.21 mm; HH of 4.89 ± 0.47 mm; BH of 6.13 ± 0.17 mm; SnPF of 6.48 ± 0.19 mm; SnPeF of 10.83 ± 0.28 mm; SnDF of 11.16 ± 0.33 mm; Sn-AF of 3.68 ± 0.34 mm; the weight was 221.6 ± 15.84 mg. For the LV, the number of pre-anal myomers was 28.65 ± 4.7; the post-anal was 23.85 ± 4.27, with a total of 52.47 ± 8.34; for J the myomers were not visible. This information is essential for ecological and productive purposes in B. moorei. http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-35842020000200002&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen El proceso de fragmentación, a consecuencia de las actividades humanas, ha modificado la diversidad de los ecosistemas acuáticos y riparios, especialmente en áreas como bosques secos tropicales que, en Colombia, son zonas en peligro de desaparecer dentro de pocos años. Ante esta situación, la diversidad y la composición de los insectos Odonata, que están influenciadas por factores abióticos, podrían ser excelentes herramientas para comprender el estado ambiental actual. Por lo anterior, el objetivo de este estudio fue observar los cambios en la diversidad y la composición de Odonata, en diferentes condiciones de la vegetación riparia, a lo largo de un arroyo, en un remanente de bosque seco. Al mismo tiempo, se plantea la hipótesis de que existen diferencias, en la diversidad y composición de Odonata, a lo largo del sistema. Para esto, se muestrearon larvas y adultos de odonatos y se determinaron las variables ambientales a lo largo de cuatro estaciones de muestreo dentro de un mismo arroyo, con diferente vegetación ribereña, en cuatro periodos durante un año. Se recolectó un total de 272 especímenes correspondientes a 16 especies. Se observaron variaciones en la composición de Odonata, señaladas en los registros de especies y en el índice de similitud. Sin embargo, no se observaron diferencias significativas en la diversidad de odonatos. En cuanto a la fisicoquímica del arroyo, se notó una variación espacial en la conductividad y la concentración de nutrientes y una variación temporal en el pH y la temperatura. A manera de conclusión, se exponen cambios en la composición de Odonata, en concordancia con la vegetación riparia, durante el año de muestreo.<hr/>Abstract The fragmentation of aquatic and riparian environments has damaged diversity into ecosystems. These injuries are pronounced in areas as tropical dry forests in Colombia, which are endangered zones that could be disappear in few years. In this situation, diversity and composition in Odonata insects, which are influenced by abiotic factors, could be excellent tools for understanding environmental status. Thus, we aim to observe changes in Odonata diversity and composition in different riparian vegetation during a year, along a stream from a remnant of dry forest. At the same time, we hypothesize that there are differences in Odonata diversity and composition. To take this, we sampled Odonata, larvae and adults, and environmental variables in four sampling stations, with different riparian vegetation during a year. We collected a total of 272 specimens corresponding to 16 species. In one hand, we noted variations in Odonata composition, showed in species records and similarity index. In other hand, we do not observe differences in Odonata diversity. Lastly, we approve in part our hypothesis exposing only Odonata composition changes with riparian vegetation, during sampling year. http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-35842020000200003&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen La gran diversidad de especies en centros urbanos de Colombia contrasta con la rápida e intensa degradación de los hábitats donde se concentra dicha diversidad. Dada la importancia de estos entornos para la conservación biológica urbana y la creciente presión que sobre ellos existe, se estudió la composición de la comunidad de mamíferos en la cuenca de la quebrada La Gómez, en la densamente poblada ciudad de Medellín, y se presentaron recomendaciones para su conservación. Esta cuenca sobresale por la presencia del mono tití gris (Saguinus leucopus), uno de los pocos primates urbanos de Colombia. Se logró identificar cuatro especies de murciélago, una ardilla, una zarigüeya, una comadreja y el mono tití gris. Resalta la gran abundancia de zarigüeyas, posiblemente asociada con la alta disponibilidad de recursos de comida. Esto contrasta con una pobre diversidad de roedores nativos, quizá como consecuencia de la depredación por los numerosos gatos de la zona. Estas especies presentan dietas generalistas, aprovechan recursos antropogénicos de comida o tienen alta capacidad de dispersión, propiedades que les pueden facilitar su adaptación a hábitats aislados en parches urbanos de bosque. Todas estas especies tienen importantes roles ecológicos como la polinización, control poblacional de artrópodos y vertebrados y dispersión de especies vegetales. Sugerimos 1) mejorar las técnicas de disposición de residuos y compostaje para evitar conflictos con zarigüeyas, 2) realizar control poblacional de gatos ferales y concientizar sobre la tenencia responsable de gatos y otras mascotas, 3) sembrar especies vegetales nativas que sirvan de sostén a la fauna de la zona, y 4) emprender campañas de limpieza de la quebrada y disposición responsable de residuos domésticos.<hr/>Abstract The great diversity of species in urban centers in Colombia contrasts with the rapid and intense degradation of the habitats where this diversity occurs. Given the importance of these environments for urban biological conservation and the increasing pressure on them, we studied the composition of the mammal community in the basin of La Gómez creek, located in the densely populated city of Medellin, and provided recommendations for its conservation. This basin stands out for the presence of the white-footed tamarin (Saguinus leucopus), one of the few urban primates in Colombia. We identified four species of bats, a squirrel, an opossum, a weasel, and the white-footed tamarin. Particularly striking is the great abundance of opossums, possibly associated with high availability of food resources. This contrasts with a poor diversity of native rodents, perhaps as a result of predation by the many domestic cats in this area. These species have generalist diets, take advantage of anthropogenic food resources or have high dispersal capacity, properties that can facilitate their adaptation to geographically isolated habitats in urban forest patches. All these species have important ecological roles such as pollination, population control of arthropods and vertebrates, and dispersal of plant species. We suggest to 1) improve waste disposal and composting techniques to avoid conflicts with possums, 2) carry out population control of feral cats and raise awareness about the responsible possession of cats and other pets, 3) sow native plant species that support local wildlife, and 4) undertake cleaning campaigns on the creek and responsible disposal of household waste. http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-35842020000200004&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se emplea en investigación y como prueba diagnóstica para confirmar la infección malárica en muestras clínicas. Por ser un método con una sensibilidad cercana a 100%, es susceptible a la contaminación por amplicones, cuando se procesa un gran volumen de muestras, aumentando el riesgo de falsos positivos. Este estudio evaluó la incorporación del sistema uracilo ADN glicosilasa (UDG)-dUTPs en la reacción de PCR anidada (nPCR) para Plasmodium falciparum y Plasmodium vivax, como estrategia para prevenir la contaminación por amplicones en nuevas reacciones. Se empleó ADN de la cepa 3D7 de P. falciparum y una muestra clínica con infección confirmada por P. vivax. Se evaluó el efecto de reemplazar dTTPs por dUTPs en la reacción de nPCR y se verificó su efecto en el límite de detección. Se evaluó la acción degradante de la enzima UDG en reacciones de PCR contaminadas artificialmente con amplicones. Se cuantificó el ADN contaminante que fue capaz de degradar una unidad de UDG en este sistema. La sustitución de dTTPs por dUTPs no afectó la función de la Taq polimerasa, sin embargo, se observó una ligera disminución en la sensibilidad analítica de la nPCR cuando se incorporaron dUTPs. En reacciones contaminadas, la UDG fue capaz de degradar exclusivamente los amplicones contaminantes, sin afectar la amplificación del ADN nativo. Una unidad de UDG logró degradar completamente hasta 6 pg/µl de ADN contaminante. El sistema UDG-dUTPs puede prevenir la contaminación para mejorar el diagnóstico molecular en malaria.<hr/>Abstract Polymerase chain reaction (PCR) has been used in research and diagnostics as method to confirm malaria infections. Due to its high sensitivity, this method is susceptible to amplicon contamination, when high number of samples are processed, increasing the risk of false positives. This study aimed at evaluating the incorporation of Uracil DNA glycosylase-dUTPs (UDG-dUTPs) system to nested PCR reaction (nPCR) for Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax, as a strategy to prevent contamination in new reactions. The DNA of P. falciparum 3D7 strain and a clinical sample confirmed with P. vivax were used in all reactions. The effect of replacing dTTPs by dUTPs in nPCR reaction was evaluated, and the effect of this modification on the limit of detection was verified. The degradative action of the UDG was evaluated in artificially contaminated reactions with amplicons. The amount of contaminating DNA that was degraded by a unit of UDG was quantified. Replacement of dTTPs by dUTPs did not affect Taq polymerase performance, however, a slight decrease in the analytical sensitivity of nPCR when using dUTPs was observed. UDG was able to exclusively degrade the contaminants without affecting the amplification of the native DNA. One unit of UDG was able to completely degrade contaminating DNA up to approximately 6 pg/μL. UDG-dUTPs system can prevent contamination to improve molecular malaria diagnosis. http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-35842020000200005&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract The macro fungi of the genus Agaricus have so far recorded many bioactive compounds with antibacterial properties as a product of their metabolism. However, in Ecuador, A. pampeanus or “Kallamba de finados'' is a species studied for its ethnomycological uses and as part of the fungal biodiversity of the country. In this study, the antibacterial activity of the ethanolic extract of A. pampeanus was evaluated on four ATCC strains and the bioactive compounds present in the extract were identified. Initially, an ethanol extract of A. pampeanus was performed with the use of a Soxhlet extractor. To identify the extracted compounds, a gas chromatograph coupled to a mass spectrophotometer was used. With the mother extract, four solutions of the A. pampeanus ethanol extract (APE) were made at different concentrations, classified in APE1 (50.32 mg/mL), APE2 (40.24 mg/mL), EPA3 (30.16 mg/mL), APE4 (20.12 mg/mL), which were subsequently used in the analysis of antibacterial activity, using the Kirby-Bauer technique. Six chemical compounds were identified; among them Eugenol was found as one of the main compounds. Out of the four concentrations, the A. pampeanus ethanol extract (APE1) was the most effective against Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa and categorized as sensitive, while Escherichia coli did not present any activity and was cataloged as resistant. The APE4 was not effective in any case. The antibacterial effect of APE was verified. Furthermore, A. pampeanus is more effective against Gram positive bacteria.<hr/>Resumen Los macrohongos del género Agaricus registran, hasta el momento, gran cantidad de compuestos bioactivos con propiedades antibacterianas como producto de su metabolismo. Sin embargo, en Ecuador, A. pampeanus o “Kallamba de finados” es una especie estudiada por sus usos etnomicológicos y como parte de la biodiversidad fúngica del país. En este estudio se evaluó la actividad antibacteriana del extracto etanólico de A. pampeanus sobre cuatro cepas ATCC y se identificaron los compuestos bioactivos presentes en el extracto. Inicialmente, se realizó un extracto etanólico de A. pampeanus con la utilización de un equipo Soxhlet. Para la identificación de los compuestos extraídos se empleó un cromatógrafo de gases acoplado a un espectrofotómetro de masas. A partir del extracto madre se realizaron cuatro soluciones a diferentes concentraciones del extracto etanólico de A. pampeanus (EAP), clasificados en EAP1 (50,32 mg/mL), EAP2 (40,24 mg/mL), EAP3 (30,16 mg/mL), EAP4 (20,12 mg/mL), que posteriormente fueron empleadas en el análisis de actividad antibacteriana, mediante la técnica de Kirby-Bauer. Se identificó un total de seis compuestos químicos; entre estos se encontró al Eugenol como uno de los compuestos principales. De las cuatro concentraciones, el extracto etanólico de A. pampeanus (EAP1) fue el más efectivo frente a Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus y Pseudomonas aeruginosa, siendo categorizadas como sensibles, mientras que Escherichia coli no presentó ninguna actividad y se catalogó como resistente. Por su parte, el EAP4 no fue efectivo en ningún caso. Se comprobó el efecto antibacteriano del EAP. Además, A. pampeanus presentó mayor efectividad frente a bacterias Gram positivas. http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-35842020000200006&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen En la presente investigación se analizaron los hábitos alimentarios, la variación alimentaria y las relaciones tróficas de los peces presentes en el tramo bajo del río Gaira, Sierra Nevada de Santa Marta, Caribe Colombiano. Los muestreos se llevaron a cabo en época de lluvias y en época seca, empleando dos atarrayas de diferentes ojos de malla. Se utilizaron métodos cuantitativos como coeficiente de vacuidad (CV%) e índice de importancia relativa (IIR%) para establecer los ítems alimentarios importantes en el contenido estomacal. Se utilizaron 231 estómagos en total, identificándose siete grupos alimentarios. Según sus hábitos tróficos, los peces se clasificaron, en época seca como omnívoros, con tendencia a la insectivoría, carnívoros y herbívoros. En época de lluvias, el ítem que presentó mayor importancia fueron los peces, apareciendo larvas de Sicydium salvani en el 95% del total de los estómagos analizados y, con el 78% de la oferta, fueron las que más contribuyeron con alimento, siendo devoradas tanto por peces carnívoros como omnívoros. En época seca, la oferta alimentaria fue suministrada por material vegetal en un 100% (algas, tallos y limo) y 74% detritus. Estos resultados evidencian que este sistema fluvial es capaz de mantener una comunidad diversa con suficientes recursos alimentarios disponibles.<hr/>Abstract In this research, the eating habits, food variation and trophic relationships of the fish in the lower reaches of the Gaira River, Sierra Nevada de Santa Marta, Colombian Caribbean were analyzed. Sampling was carried out during the rainy and dry season, using two launch nets with different mesh sizes. To establish the important foods, in the stomach content, quantitative methods such as the void index (CV%) and the relative importance index (IIR%) were used. A total of 231 stomachs were studied and seven food groups were identified. According to their trophic habits, the fish were classified, in the dry season as omnivores (with a tendency towards insectivores), carnivores and herbivores. During the rainy season, fish was the most important food considering that it constituted 78% of the food supply; Sicydium salvani larvae appeared in 95% of the stomachs analyzed, being eaten by both carnivorous and omnivorous fish. During the dry season, the food supply was provided 100% by plant material (algae, stems and silt) and 74% by debris. These results show that this river system is capable of maintaining a diverse community with sufficient food resources available.