Colombia Médica

Human intelligence for authors, reviewers and editors using artificial intelligence

Chatbots, generative AI, and scholarly manuscripts: WAME recommendations on chatbots and generative artificial intelligence in relation to scholarly publications

Abstract This statement revises our earlier “WAME Recommendations on ChatGPT and Chatbots in Relation to Scholarly Publications” (January 20, 2023). The revision reflects the proliferation of chatbots and their expanding use in scholarly publishing over the last few months, as well as emerging concerns regarding lack of authenticity of content when using chatbots. These recommendations are intended to inform editors and help them develop policies for the use of chatbots in papers published in their journals. They aim to help authors and reviewers understand how best to attribute the use of chatbots in their work and to address the need for all journal editors to have access to manuscript screening tools. In this rapidly evolving field, we will continue to modify these recommendations as the software and its applications develop.

Resumen Esta declaración revisa las anteriores "Recomendaciones de WAME sobre ChatGPT y Chatbots en Relation to Scholarly Publications" (20 de enero de 2023). La revisión refleja la proliferación de chatbots y su creciente uso en las publicaciones académicas en los últimos meses, así como la preocupación por la falta de autenticidad de los contenidos cuando se utilizan chatbots. Estas recomendaciones pretenden informar a los editores y ayudarles a desarrollar políticas para el uso de chatbots en los artículos sometidos en sus revistas. Su objetivo es ayudar a autores y revisores a entender cuál es la mejor manera de atribuir el uso de chatbots en su trabajo y a la necesidad de que todos los editores de revistas tengan acceso a herramientas de selección de manuscritos. En este campo en rápida evolución, seguiremos modificando estas recomendaciones a medida que se desarrollen el software y sus aplicaciones.

Survival of patients living with HIV and cancer in Cali, Colombia

Abstract Background: People living with HIV have an increased risk of cancer compared to the general population. However, with the increase in life expectancy and advances in antiretroviral therapy, the survival of patients with cancer and HIV has changed. Objective: To determine the survival of patients living with HIV and cancer in Cali, Colombia Methods: A retrospective cohort study was conducted at the Fundación Valle del Lili, Cali, Colombia. Data from the HIV database was crossed with data from the hospital and population-based cancer registries between 2011-2019. Patients <18 years, limited available clinical information on the diagnosis and treatment of HIV and cancer, and non-oncological tumor diagnosis were excluded. Results: A total of 173 patients were included. The frequencies of AIDS-defining neoplasms were: Non-Hodgkin lymphoma (42.8%), Kaposi sarcoma (27.8%), and cervical cancer (4.6%). Overall survival was 76.4% (95% CI 68.9-82.3) at five years. Poorer survival was found in patients with AIDS-defining infections (56.9% vs. 77.8%, p=0.027) and non-AIDS-defining infections (57.8% vs. 84.2%, p=0.013), while there was better survival in patients who received antiretroviral therapy (65.9% vs. 17.9%, p=0.021) and oncological treatment (66.7% vs. 35.4%, p<0.001). The presence of non-AIDS-defining infections increases the risk of dying (HR = 2.39, 95% CI 1.05-5.46, p=0.038), while oncological treatment decreases it (HR = 0.33, 95% CI 0.14-0.80, p=0.014). Conclusions: In people living with HIV, Non-Hodgkin lymphoma and Kaposi sarcoma are the most common neoplasms. Factors such as AIDS-associated and non-AIDS-associated infections have been identified as determinants of survival. Cancer treatment seems to improve survival.

Resumen Antecedentes: Las personas que viven con VIH tienen un riesgo mayor de cáncer en comparación con la población general. Sin embargo, con el aumento de la esperanza de vida y los avances en la terapia antirretroviral, la supervivencia de los pacientes con cáncer y VIH ha cambiado. Objetivo: Determinar la supervivencia de los pacientes que viven con VIH y cáncer en Cali, Colombia. Métodos: Se realizó un estudio de cohorte retrospectivo en la Fundación Valle del Lili, Cali, Colombia. Los datos de la base de datos de VIH se cruzaron con los datos de los registros de cáncer de base hospitalaria y poblacional entre 2011-2019. Se excluyeron los pacientes <18 años, con información clínica limitada disponible sobre el diagnóstico y tratamiento del VIH y el cáncer y los casos con diagnóstico de tumor no oncológico. Resultados: Se incluyeron un total de 173 pacientes. Las frecuencias de neoplasias definitorias de SIDA fueron: linfoma no Hodgkin (42.8%), sarcoma de Kaposi (27.8%) y cáncer cervical (4.6%). La supervivencia global fue del 76.4% (IC 95% 68.9-82.3) a los cinco años. Se encontró una peor supervivencia en pacientes con infecciones definitorias de SIDA (56.9% vs. 77.8%, p=0.027) e infecciones no definitorias de SIDA (57.8% vs. 84.2%, p=0.013), mientras que hubo una mejor supervivencia en pacientes que recibieron terapia antirretroviral (65.9% vs. 17.9%, p=0.021) y tratamiento oncológico (66.7% vs. 35.4%, p<0.001). La presencia de infecciones no definitorias de SIDA aumentó el riesgo de morir (HR = 2.39, IC 95% 1.05-5.46, p=0.038), mientras que el tratamiento oncológico lo disminuyó (HR = 0.33, IC 95% 0.14-0.80, p=0.014). Conclusiones: En las personas que viven con VIH, el linfoma no Hodgkin y el sarcoma de Kaposi son las neoplasias más comunes. Se han identificado factores como las infecciones asociadas al SIDA y las infecciones no asociadas al SIDA como determinantes de la supervivencia. El tratamiento del cáncer parece mejorar la supervivencia.

Clinimetric properties of the Perme Intensive Care Unit Mobility Score -a multicenter study for minimum important difference and responsiveness analysis

Abstract Background: The use of instruments in clinical practice with measurement properties tested is highly recommended, in order to provide adequate assessment and measurement of outcomes. Objective: To calculate the minimum clinically important difference (MCID) and responsiveness of the Perme Intensive Care Unit Mobility Score (Perme Score). Methods: This retrospective, multicentric study investigated the clinimetric properties of MCID, estimated by constructing the Receiver Operating Characteristic (ROC). Maximizing sensitivity and specificity by Youden's, the ROC curve calibration was performed by the Hosmer and Lemeshow goodness-of-fit test. Additionally, we established the responsiveness, floor and ceiling effects, internal consistency, and predictive validity of the Perme Score. Results: A total of 1.200 adult patients records from four mixed general intensive care units (ICUs) were included. To analyze which difference clinically reflects a relevant evolution we calculated the area under the curve (AUC) of 0.96 (95% CI: 0.95-0.98), and the optimal cut-off value of 7.0 points was established. No substantial floor (8.8%) or ceiling effects (4.9%) were observed at ICU discharge. However, a moderate floor effect was observed at ICU admission (19.3%), in contrast to a very low incidence of ceiling effect (0.6%). The Perme Score at ICU admission was associated with hospital mortality, OR 0.86 (95% CI: 0.82-0.91), and the predictive validity for ICU stay presented a mean ratio of 0.97 (95% CI: 0.96-0.98). Conclusion: Our findings support the establishment of the minimum clinically important difference and responsiveness of the Perme Score as a measure of mobility status in the ICU.

Resumen Antecedentes: Se recomienda encarecidamente el uso de instrumentos en la práctica clínica con propiedades de medición probadas, con el fin de proporcionar una evaluación y medición adecuada de los resultados. Objetivo: Calcular la diferencia mínima clínicamente importante (MCID) y la capacidad de respuesta de la puntuación de movilidad de la unidad de cuidados intensivos de Perme (Perme Score). Métodos: Este estudio multicéntrico retrospectivo investigó las propiedades clinimétricas de MCID, estimadas mediante la construcción de la característica operativa del receptor (ROC). Maximizando la sensibilidad y especificidad mediante la prueba de Youden, la calibración de la curva ROC se realizó mediante la prueba de bondad de ajuste de Hosmer y Lemeshow. Además, establecimos la capacidad de respuesta, los efectos suelo y techo, la consistencia interna y la validez predictiva del Perme Score. Resultados: Se incluyeron un total de 1,200 registros de pacientes adultos de cuatro unidades de cuidados intensivos (UCI) generales mixtas. Para analizar qué diferencia refleja clínicamente una evolución relevante calculamos el área bajo la curva (AUC) de 0.96 (95% CI: 0.95-0.98); y se estableció el valor de corte óptimo de 7.0 puntos. No se observaron efectos suelo (8.8%) o techo (4.9%) sustanciales al alta de la UCI. Sin embargo, se observó un efecto suelo moderado al ingreso en la UCI (19.3%), en contraste con una incidencia muy baja del efecto techo (0.6%). El Perme Score al ingreso en UCI se asoció con la mortalidad hospitalaria, OR 0.86 (95% CI: 0.82-0.91), y la validez predictiva de estancia en UCI presentó una relación media de 0.97 (95% CI: 0.96-0.98). Conclusiones: Nuestros hallazgos respaldan el establecimiento de la diferencia mínima clínicamente importante y la capacidad de respuesta de el Perme Score como medida del estado de movilidad en la UCI.

Clinical characterization and outcomes of a cohort of colombian patients with AL Amyloidosis

Abstract Background: Amyloid light chain (AL) amyloidosis is characterized by amyloid fibril deposition derived from monoclonal immunoglobulin light chains, resulting in multiorgan dysfunction. Limited data exist on the clinical features of AL amyloidosis. Objective: This study aims to describe the clinical characteristics, treatments, and outcomes in Colombian patients with AL amyloidosis. Methods: A retrospective descriptive study was conducted at three high-complexity centers in Medellín, Colombia. Adults with AL amyloidosis diagnosed between 2012 and 2022 were included. Clinical, laboratory, histological, treatment, and survival data were analyzed. Results: The study included 63 patients. Renal involvement was most prevalent (66%), followed by cardiac involvement (61%). Multiorgan involvement occurred in 61% of patients. Amyloid deposition was most commonly detected in renal biopsy (40%). Bortezomib-based therapy was used in 68%, and 23.8% received high-dose chemotherapy with autologous hematopoietic stem cell transplantation (HDCT-ASCT). Hematological response was observed in 95% of patients with available data. Cardiac and renal organ responses were 15% and 14%, respectively. Median overall survival was 45.1 months (95% CI: 22.2-63.8). In multivariate analysis, cardiac involvement was significantly associated with inferior overall survival (HR 3.27; 95% CI: 1.23-8.73; p=0.018), HDCT-ASCT had a non-significant trend towards improved overall survival (HR 0.25; 95% CI: 0.06-1.09; p=0.065). Conclusions: In this study of Colombian patients with AL amyloidosis, renal involvement was more frequent than cardiac involvement. Overall survival and multiorgan involvement were consistent with data from other regions of the world. Multivariate analysis identified cardiac involvement and HDCT-AHCT as possible prognostic factors.

Resumen Antecedentes: La amiloidosis por amiloide de cadenas ligeras (AL) se caracteriza por el depósito de fibrillas amiloides derivadas de cadenas ligeras de inmunoglobulinas monoclonales, lo que resulta en disfunción multiorgánica. Existen datos limitados sobre las características clínicas de la amiloidosis AL. Objetivo: Este estudio tiene como objetivo describir las características clínicas, tratamientos y desenlaces en pacientes colombianos con amiloidosis AL. Métodos: Se llevó a cabo un estudio descriptivo retrospectivo en tres centros de alta complejidad en Medellín, Colombia. Se incluyeron adultos con diagnóstico de amiloidosis AL entre 2012 y 2022. Se analizaron datos clínicos, de laboratorio, histológicos, de tratamiento y de supervivencia. Resultados: El estudio incluyó 63 pacientes. La afectación renal fue más prevalente (66%), seguida de la afectación cardíaca (61%). El 61% de los pacientes presentaron afectación multiorgánica. El depósito amiloide se detectó con mayor frecuencia en la biopsia renal (40%). El tratamiento basado en bortezomib se utilizó en el 68%, y el 23.8% recibió altas dosis de quimioterapia con trasplante autólogo de progenitores hematopoyéticos (ADQT-TAPH). Se observó respuesta hematológica en el 95% de los pacientes con datos disponibles. La respuesta de órgano cardíaca y renal fue del 15% y 14%, respectivamente. La mediana de la supervivencia global fue de 45.1 meses (IC del 95%: 22.2-63.8). En el análisis multivariado, la afectación cardíaca se asoció significativamente con una supervivencia global inferior (HR 3.27; IC del 95%: 1.23-8.73; p=0.018), ADQT-TAPH mostró una tendencia no significativa hacia una mejora en la supervivencia global (HR 0.25; IC 95%: 0.06-1.09; p=0.065). Conclusiones: En este estudio de pacientes colombianos con amiloidosis AL, la afectación renal fue más frecuente que la afectación cardíaca. La supervivencia global y la afectación multiorgánica fueron consistentes con datos de otras regiones del mundo. El análisis multivariado identificó la afectación cardíaca y ADQT-TAPH como posibles factores pronósticos.

JAK2, CALR, and MPL Mutation Profiles in Colombian patients with BCR-ABL Negative Myeloproliferative Neoplasms

Abstract Background: Among the chronic myeloproliferative neoplasms (MPNs) not associated with BCR-ABL mutations are polycythemia vera, primary myelofibrosis, and essential thrombocythemia. These diseases are caused by mutations in genes, such as the JAK2, MPL, and CALR genes, which participate in regulating the JAK-STAT signaling pathway. Objective: This study aimed to establish the frequencies of mutations in the JAK2, MPL, and CALR genes in a group of Colombian patients with a negative clinical diagnosis of BCR-ABL chronic myeloproliferative neoplasms. Methods: The JAK2 V617F and MPL W515K mutations and deletions or insertions in exon 9 of the CALR gene were analyzed in 52 Colombian patients with polycythemia vera, primary myelofibrosis, and essential thrombocythemia. Results: The JAK2V617F mutation was carried by 51.9% of the patients, the CALR mutation by 23%, and the MPL mutation by 3.8%; 23% were triple-negative for the mutations analyzed. In these neoplasms, 6 mutation types in CALR were identified, one of which has not been previously reported. Additionally, one patient presented a double mutation in both the CALR and JAK2 genes. Regarding the hematological results for the mutations, significant differences were found in the hemoglobin level, hematocrit level, and platelet count among the three neoplasms. Conclusion: Thus, this study demonstrates the importance of the molecular characterization of the JAK2, CALR and MPL mutations in Colombian patients (the genetic context of which remains unclear in the abovementioned neoplasms) to achieve an accurate diagnosis, a good prognosis, adequate management, and patient survival.

Resumen Antecedentes: Entre las neoplasias mieloproliferativas crónicas no asociadas con mutaciones BCR-ABL se encuentran la policitemia vera, la mielofibrosis primaria y la trombocitemia esencial. Estas enfermedades están causadas por mutaciones en genes, como los genes JAK2, MPL y CALR, que participan en la regulación de la vía de señalización JAK-STAT. Objetivo: Establecer las frecuencias de mutaciones en los genes JAK2, MPL y CALR en un grupo de pacientes colombianos con diagnóstico clínico negativo de NMP BCR-ABL. Metodos: Se analizaron las mutaciones y deleciones o inserciones JAK2 V617F y MPL W515K en el exón 9 del gen CALR en 52 pacientes colombianos con policitemia vera, mielofibrosis primaria y trombocitemia esencial. Resultados: La mutación JAK2V617F la portaban el 51.9% de los pacientes, la mutación CALR el 23.0% y la mutación MPL el 3.8%; El 23.0% fueron triple negativos para las mutaciones analizadas. En estas neoplasias se identificaron seis tipos de mutación en CALR, uno de los cuales no ha sido reportado previamente. Además, un paciente presentó una doble mutación tanto en el gen CALR como en el JAK2. En cuanto a los resultados hematológicos para las mutaciones, se encontraron diferencias significativas en el nivel de hemoglobina, el nivel de hematocrito y el recuento de plaquetas entre las tres neoplasias. Conclusiones: Así, este estudio demuestra la importancia de la caracterización molecular de las mutaciones JAK2, CALR y MPL en pacientes colombianos (cuyo contexto genético aún no está claro en las neoplasias antes mencionadas) para lograr un diagnóstico certero, un buen pronóstico, un manejo adecuado y una mejoría del paciente. supervivencia.