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Evaluación y uso de un péptido sintético para la detección de anticuerpos específicos contra Plasmodium falciparum

Resumen Introducción. La malaria continúa siendo una de las enfermedades que causa mayor morbi-mortalidad a nivel mundial. Por esta razón es importante desarrollar herramientas diagnósticas eficaces que se implementen como estrategias para el control de la enfermedad. Objetivos. Estandarizar las condiciones del inmunoensayo enzimático (ELISA), para la detección de IgG específica contra Plasmodium falciparum en sueros de pacientes diagnosticados por gota gruesa con malaria no complicada por P. falciparum, empleando como antígeno un extracto proteico obtenido a partir de cultivo de P. falciparum o un péptido sintético derivado de la proteína de superficie de merozoito GLURP (del inglés: glutamate rich protein). Materiales y métodos. Para la estandarización de la técnica, se utilizaron 22 sueros de pacientes positivos para malaria por P. falciparum y 11 diagnosticados positivos para malaria por P. vivax utilizando la técnica de gota gruesa. Como controles negativos se utilizaron 44 sueros de individuos sanos. Los sueros fueron probados contra extracto de proteínas del parásito y el péptido sintético IMT 94 derivado de la proteína GLURP, para evaluar las concentraciones y las diluciones óptimas de cada componente del sistema. Para la validación de la técnica se utilizaron 251 sueros de pacientes positivos para P. falciparum y 44 sueros de individuos sanos, diagnosticados utilizando la técnica de gota gruesa. Resultados. La técnica estandarizada con el péptido sintético permitió observar diferencia significativa en el reconocimiento de sueros de pacientes, controles positivos y negativos por los antígenos (extracto de proteínas y péptidos sintéticos). Conclusiones. La metodología usada permite identificar la respuestas inmune específica contra P. falciparum.

Abstract Introduction. Malaria continues being one of the diseases causing the greatest morbi-mortality around the world. For that reason, effective diagnostic tools must thus be developed which can be used in strategies for controlling the disease. Objectives. To standardise enzyme- linked immunosorbent assay (ELISA) conditions for detecting Plasmodium falciparum specific IgG in sera from patients diagnosed by thick smear as suffering non-complicated malaria caused by P. falciparum. A protein extract obtained from P. falciparum culture or a synthetic peptide derived from glutamate rich protein (GLURP) merozoite surface protein would be used as antigen. Materials and Methods. 22 serum samples from patients diagnosed as suffering from P. falciparum malaria, 11 serum samples from patients diagnosed as suffering from P. vivax and 44 from healthy donors, diagnosed by using the thick smear tecnique were used for standarising the technique. Serum samples were tested against parasite protein extract and GLURP- derived IMT 94 synthetic peptide for standardisign optimum dilutions and concentrations for each component in the system. 251 serum samples from patients diagnosed as suffering from P. falciparum malaria and 44 from healthy donors diagnosed by using the thick smear tecnique were used to validate the technique. Results. The technique led to significant differences being observed in antigens (protein extract and synthetic peptides) recognising serum from positive and negative patients and controls. Conclusions. The methodology used led to identifying specific immune response against P. falciparum.

Análisis de los programas de evaluación del desempeño de malaria de los laboratorios de salud pública y privados de Colombia 2015-2016

Resumen Introducción. Para el fortalecimiento de la calidad del diagnóstico de malaria en Colombia, se desarrollan los Programas de Evaluación del Desempeño (PED) en los que participan laboratorios privados y públicos del país. Objetivo. Analizar los resultados obtenidos en los programas de evaluación del desempeño de malaria de los laboratorios de salud pública y privados de Colombia en el lapso 2015-2016. Materiales y métodos. Se realizó un estudio de tipo retrospectivo mediante la revisión de los resultados obtenidos por los LSP y laboratorios privados participantes en los programas de evaluación directa e indirecta del desempeño (PEDD, PEID) de malaria durante los años 2015 y 2016 en términos de participación, concordancia de positividad y negatividad (Índice Kappa de Cohen), concordancia de especie, de formas parasitarias y de recuento (Z score). Resultados. La participación en el PEID se incrementó de 15% en 2015 a 51% en 2016, así como el total de láminas enviadas que en su mayoría cumplían con los criterios establecidos por el Laboratorio Nacional de referencia (LNR). La participación en el PEDD se incrementó de 88% en 2015 a 94% en 2016, con un Índice Kappa de Cohen de 0,97, una media de concordancia de especie parasitaria de 83,3% y de formas parasitarias de 62,5% y una concordancia del recuento parasitario más frecuente entre -0,9 y 0,9, evidenciándose un mejor desempeño en 2016. Conclusión. Basados en los resultados obtenidos es necesario promover una mayor participación de los LSP en los PED de malaria, especialmente en el PEID y aumentar la participación de los laboratorio privados.

Abstract Introduction. In order to strengthen the quality of malaria diagnosis in Colombia, Performance Evaluation Programs (PED) are developed in which private and public laboratories of the country participate. Objective. To analyze the results obtained in the malaria evaluation programs of the public and private health laboratories of Colombia from 2015 to 2016. Materials and methods. A retrospective study was carried out by reviewing the results obtained by the LSPs and private laboratories participating in the direct and indirect evaluation programs of malaria during the years 2015 and 2016 in terms of participation, concordance of positivity and negativity (Cohen’s Kappa Index), species concordance, parasitic and counting agreement (Z score). Results. Participation in PEID increased from 15% in 2015 to 51% in 2016, as well as the total number of sheets sent, which mostly met the criteria established by the National Reference Laboratory (NRL). Participation in the PEDD increased from 88% in 2015 to 94% in 2016, with a Cohen’s Kappa Index of 0.97, an average of parasitic species concordance of 83.3% and parasitic forms of 62.5% and a more frequent parasitic count concordance between -0.9 and 0.9, showing a better performance in 2016. Conclusion. Based on the results obtained, it is necessary to promote greater participation of LSPs in malaria PEDs, especially in SIDS, and to increase the participation of private laboratories.

Indagación exploratoria in vitro de la capacidad degradadora de la cepa comercial Pleurotus ostreatus sobre dos concentraciones de petróleo crudo

Resumen Objetivo. Evaluar la potencial actividad degradadora de la cepa comercial Pleurotus ostreatus sobre petróleo crudo como única fuente de carbono. Método. Se empleó un inóculo de 10mg del hongo en medio mínimo líquido de sales con volúmenes de 0,5% y 1% de petróleo en agitación constante durante 21 días a temperatura ambiente, registrando peso seco a los 0, 8,15 y 21 días. Resultados. Se obtuvo un máximo de biomasa 45mg para 0,5% de 39mg para 1%. Esto sugiere que el hongo sufre una adaptación fisiológica para utilizar el petróleo crudo para su crecimiento.

Abstract Objectives. To evaluate the potential crude oil-degrading activity of Pleurotus ostreatus using it as the sole source of carbon and energy for growth. Methods. An inoculum of 10 mg of the fungus in the minimal liquid of salt with 0.5% or 1% crude oil in constant agitation for 21 days was used. Dry weight at 0, 8, 15 and 21 days was obtained. Results. The maximum biomass with a value of 45mg of 0.5% oil treatment registered while the 1% oil treatment reached a value of 39mg. These values suggest physiological adaptation of the fungus to crude oil as its sole carbon source for growth.

Evaluación in vitro de la capacidad biorremediadora de hongos filamentosos sobre petróleo crudo

Resumen Objetivo. Evaluar la capacidad biorremediadora de algunas especies de hongos filamentosos en suelos contaminados con petróleo crudo. Métodos. Se aislaron 138 cepas a partir de 90 cultivos primarios en muestras de suelos obtenidas en los municipios de Yondó (Antioquia), Acacías (Meta) y Tumaco (Nariño), se identificaron las especies por medio de claves taxonómicas y la amplificación por PCR de la región ITS ubicándose en siete géneros de hongos filamentosos. Del total de las especies se escogieron tres para el experimento que fueron: Neosartorya sp. Cepa A/N -1, Aspergillus sp. Cepa Y/As-3 y Rhizomucor sp. Cepa 1A/R-1; se realizó la micorremediación con la técnica de Landfarming modificado al diseñarse un microcosmos con 50g de suelo contaminado con petróleo crudo °API de 21.6 a concentraciones de 20.000 ppm y 30.000ppm para cada una de las especies en un inóculo de 300 conidios/ml en agua destilada, ajustado en cámara de Neubauer y las tres especies en consorcio en suelo contaminado con petróleo crudo °API de 21.6 a concentraciones de 40.000ppm, 60.000ppm, 80.000ppm y 100.000ppm con un inóculo de 300 conidios/ml. Se valoró el proceso por espectofotometría. Además se estableció las enzimas empleadas en la micorremediación y la citotoxicidad de las cepas empleadas. Resultado. La micorremediación realizada por las especies individuales fue en promedio entre 2 y 6 días y cuando se aplicaron las tres especies en consorcio se realizó en un promedio entre 6 y 10 días, la enzima empleada es peroxidasa y la citotoxicidad es negativa.

Abstract Objective. Evaluate the bioremediation capacity of some species of filamentous fungi in soils contaminated with crude oil. Methods. 138 strains were isolated from 90 primary culture in soil samples obtained in the municipalities of Yondó (Antioquia), Acacías (Meta) and Tumaco (Nariño), species were identified by means of taxonomic keys and PCR amplification of the ITS region located in seven genera of filamentous fungi. Of the total of the species, three were chosen for the experiment, which were: Neosartorya sp. Cepa A/N- 1, Aspergillus sp. Cepa Y/As -3 and Rhizomucor sp. Cepa 1A/R-1; Micoremediation was performed with the modified Landfarming technique when designing a microcosm with 50g of soil contaminated with crude oil API 21.6 at concentrations of 20,000 ppm and 30,000ppm for each of the species in an inoculum of 300 conidia / ml in water distilled, adjusted in Neubauer chamber and the three species in consortium in soil contaminated with crude oil API 21.6 at concentrations of 40,000ppm, 60,000ppm, 80,000ppm and 100,000ppm with an inoculum of 300 conidia / ml. The process was evaluated by spectrophotometry. In addition, the enzymes used in the micoremediation and cytotoxicity of the strains used were established. Result. The micoremediation performed by the individual species was on average between 2 and 6 days and when the three species were applied in a consortium it was carried out on average between 6 and 10 days, the enzyme used is peroxidase and the cytotoxicity is negative.

Calidad del agua de una clínica odontológica universitaria de Bogotá

Resumen Objetivo. Determinar la calidad microbiológica del agua usada en las unidades odontológicas de una clínica universitaria en Bogotá, mediante los indicadores microbiológicos coliformes totales, Escherichia coli, Enterococcus y Pseudomonas. Métodos. Se tomaron muestras de agua de la pieza de mano y de la jeringa triple en 9 unidades odontológicas y tres muestras de los tanques de suministro de agua para un total de 21 muestras. El recuento de microorganismos se realizó mediante la técnica de filtración por membrana. Se aislaron algunos microorganismos presentes en las diferentes muestras a través del kit de pruebas rápidas BBL CRYSTAL. Resultados. El agua no cumple con la Resolución 2115 de 2007 que reglamenta las normas del agua apta para consumo humano. Se aislaron bacterias importantes como Shigella sp. (microorganismo productor de la disentería e indicador de contaminación fecal), Klebsiella y Pseudomonas. Se sugiere implementar medidas correctivas y/o preventivas para minimizar la contaminación y mejorar la calidad del agua usada en estas unidades odontológicas.

Abstract Objectives. To determine the microbiological quality of the water used in dental units of a University Clinic in Bogotá, through the microbiological indicators like total coliforms, Escherichia coli, Enterococcus and Pseudomonas. Methods. Water samples from hand piece and the triple syringe 9 dental units and three samples of tanks for water supply for a total of 21 samples were taken. The microorganism counting was performed by membrane filtration method according to the Standard Methods. Some microorganisms present in different samples were isolated through the BBL CRYSTAL rapid test kit. Results. The water does not comply with the Resolution 2115 2007, which regulates the water suitable for human consumption standards. Important bacteria such as Shigella sp. (producer of dysentery and a fecal pollution indicator organism), Klebsiella and Pseudomonas were isolated. It is suggested to implement corrective or preventive measures to minimize the pollution and improve the quality of the water used in these dental units.

Tratamientos alternativos de medicina tradicional para Chlamydia trachomatis , agente causal de una infección asintomática

Resumen En la actualidad, Chlamydia trachomatis (CT) es una de las causas más frecuentes de infecciones de transmisión sexual (ITS) y morbilidad reproductiva en el mundo, Incluye tanto países desarrollados como en vía de desarrollo, con un reporte alrededor de 92 millones de casos anuales. CT es una bacteria intracelular obligada cuyo inicio de la infección es asintomático, causa infección crónica, puede generar infección persistente y complicaciones como cáncer de ovario. Las infecciones por CT son asintomáticas en el 70% de las mujeres y el 40% de los hombres, lo que dificulta el diagnóstico en las fases tempranas de la infección y el tratamiento oportuno, lo que conlleva a un aumento en los contagios en la población. De acuerdo con la Organización Mundial de la Salud (OMS), el tratamiento para CT incluye la utilización de antibióticos tipo tetraciclinas, macrólidos y fluoroquinolonas. Sin embargo, a pesar de su alta tasa de eficacia, cada vez son más recurrentes las infecciones. Reportes recientes han demostrado resistencia por parte de los cuerpos elementales y se ha podido determinar que los antibióticos disminuyen la población de lactobacillus vaginales beneficiosos, causando mayores complicaciones en los pacientes. Basados en estos hallazgos, las investigaciones actuales se han centrado en terapias alternativas que reduzcan la actividad antichlamydial y que sean de libre acceso, generando el menor daño posible en los pacientes.

Abstract Currently, Chlamydia trachomatis (CT) is one of the most frequent causes of sexually transmitted infections (STIs) and reproductive morbidity in the world, including both developed and developing countries, with a report of around 92 million annual cases. CT is an obligate intracellular bacterium whose onset’s infection is asymptomatic, causes chronic infection, can generate persistent infection and complications such as ovarian cancer. CT infections are asymptomatic in 70% of women and 40% of men, which makes diagnosis difficult in the early stages of infection and timely treatment, which leads to an increase in infections in the population. According to the World Health Organization (WHO), treatment for TC includes the use of antibiotics such as tetracyclines, macrolides and fluoroquinolones. However, despite their high efficacy rate, infections are becoming more frequent. Recent reports have shown resistance on the part of elementary bodies and it has been determined that antibiotics decrease the beneficial vaginal lactobacillus population, causing greater complications in patients. Based on these findings, current research has focused on alternative therapies that reduce antichlamydial activity and that are freely accessible, generating the least possible harm to patients.

Diagnóstico prenatal de inversión pericéntrica del cromosoma cinco de novo en una paciente con gestación a término sin complicaciones posteriores

Resumen Los avances en las técnicas de citogenética han permitido detectar con mayor precisión alteraciones cromosómicas tanto estructurales como de número. La amniocentesis genética es una prueba invasiva que se realiza entre la semana 16 y 20 de gestación que nos permite detectar distintas alteraciones cromosómicas. Presentamos un caso de una paciente que se le realizó a las 18 semanas de gestación la amniocentesis por edad materna avanzada (39 años), evidenciándose en el cariotipo una inversión pericéntrica del cromosoma 5. Se procedió a realizar cariotipos a los padres, ambos normales. De acuerdo con este resultado a la paciente se le realizó ecosonogramas para detectar si el feto presentaba malformaciones y se realizó asesoramiento genético. A continuación, se hizo evaluación del recién nacido y seguimiento durante 4 años para evaluar fenotipo y desarrollo neurológico. Como se comentará, el cromosoma 5 codifica para muchos genes y es responsable de muchas patologías, de las cuales este paciente no presentó ninguna.

Abstract Advances in cytogenetic techniques have made it possible to, more accurately, detect both structural and number chromosomal alterations. Genetic amniocentesis is an invasive test that is performed between week 16 and 20 of gestation that allows us to detect chromosomal alterations. We present a case of a patient who underwent amniocentesis by advanced maternal age (39 years) at 18 weeks of gestation, showing a pericentric inversion of chromosome 5 in the karyotype and proceeded to perform karyotypes of the parents, both normal. According to this result, the patient was screened for fetal malformations and genetic counseling. Newborn evaluation and 4-year follow-up to assess phenotype and neurological development. As discussed, chromosome 5 codes for many genes and is responsible for many pathologies that this patient did not present.

Descripción de pruebas moleculares en el diagnóstico del virus Zika en el periodo 2008-Febrero 2018. Revisión sistemática

Resumen Objetivo. Describir las pruebas moleculares usadas desde 2008 para la detección del virus Zika reportadas en artículos indexados en 3 bases de datos. Métodos. Se realizó la búsqueda de literatura científica utilizando el método PRISMA durante el periodo 2008 - febrero de 2018, en las bases de datos Pubmed, Science Direct y Embase, usando como criterios de inclusión artículos originales publicados entre los años 2008 a 2018 que realicen investigación en humanos con sospecha de infección por ZIKV y que describan la prueba molecular utilizada. Resultados. A partir de una búsqueda inicial de 2617 artículos recolectados con las palabras clave y aplicar los criterios de inclusión y exclusión, se seleccionan 18 artículos, de los cuales 8 son de Science Direct, 4 de Embase y 6 de Pubmed. Se describe la RT-PCR como la técnica más utilizada, se hallaron 9 blancos moleculares diferentes utilizados en las pruebas y 7 muestras biológicas de las cuales se pudo amplificar el genoma viral. Conclusiones. Hasta el momento la RT-PCR es la técnica más utilizada para el diagnóstico de la infección por el virus Zika al ser la más estandarizada y presentar una alta sensibilidad y especificidad, sin embargo se sigue trabajando sobre otras técnicas que garanticen la detección oportuna del virus, usando diferentes genes como el gen E, NS5, NS1, NS2B NS3, NS4B y CPREM principalmente en suero y orina.

Abstract Objective. To describe the molecular tests used since 2008 for detection of Zika virus reported in indexed articles in 3 databases. Methods. A search of scientific literature was made using the PRISMA method during 2008 period - February 2018, in the databases Pubmed, Science Direct and Embase, using as inclusion criteria original articles published between 2008 to 2018 that make researches in humans with suspicion of ZIKV infection and that describes the use of molecular test. Results. From an initial search of 2617 articles recollected with the keywords and after applying inclusion and exclusion criteria, 18 articles were selected, of which 8 are from Science Direct, 4 from Embase and 6 from Pubmed. The RT- PCR was described as the most used technique, it was found 9 different molecular targets used in the tests and 7 biological samples of which the viral genome can be amplified. Conclusions. Until now the RT-PCR test is the most used technique for the diagnosis of infection for Zika virus, being the most standardized test and due it presents a high sensi-tivity and specificity, however there is still working about other techniques that guarantee opportune detection of the virus, using different genes like E, NS5, NS1, NS2B, NS3, NS4B y CPREM mainly in serum and urine.