Abstract

MALAGON BERNAL, Rafael Eduardo; FERNANDEZ NAVAS, Manuel Alejandro  and  ACEVEDO SARMIENTO, Orlando Emilio. Modelo molecular teórico do receptor serotoninérgico 5-HT_2A acoplado à proteína G. Univ. Sci. [online]. 2012, vol.17, n.2, pp.119-139. ISSN 0122-7483.

Objetivo Construir um modelo molecular teórico da estrutura terciária do receptor 5HT_2A de Homo Sapiens, com estruturas obtidas experimentalmente como moldes. Materiais e métodos. Para a elaboração do modelo teórico se utilizou o protocolo estabelecido por Ballesteros e Weinstein para a construção do receptor acoplado à proteína G, por intermédio de alinhamento da seqiiência de aminoácidos, perfis de hidrofobicidade, refinamento de bucles por restrições espaciais e minimização da energia com o campo de força OPLS_2005. Resultados. O modelo obtido foi validado pelo gráfico de Ramachandran com 91,7% dos aminoácidos dentro dos limites estabelecidos para os ângulos phi e psi, e um RMSD de 0,95 A com respeito à rodopsina de bovino. Conclusões. Obteve-se um modelo teórico validado, útil para a realização de estudos de acoplamento ligante-receptor.

Keywords : receptor proteína G; perfil de hidrofobicidade; gráfico Ramachandran; união ortoestérica; modelo molecular.

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