Abstract

VIVAS-REYES, Ricardo; RUIZ, José Luis  and  CARABALLO, Roger. ESTUDO TEÓRICO DO VÍRUS DA SÍNDROME RESPIRATÓRIA AGUDA SEVERA (SARS) A TRAVES DO USO DE MÉTODOS DE ACOPLAMENTO MOLECULAR. Rev.Colomb.Quim. [online]. 2009, vol.38, n.3, pp.327-339. ISSN 0120-2804.

Neste estudo avaliou-se através da metodologia do acoplamento molecular uma serie de 5 ligandos contendo boro, que são variantes da molécula FL-078, estas moléculas têm atividade inibitória à protease M^pro responsável da replicação do SARS-CoV. Usando o programa SYBYL7.0 se otimizou o homodímero da M^pro (código 1Q2W), e através do software FlexX se realizou o acoplamento molecular com a finalidade de escolher o confórmero mais estável dos ligandos aril borados frente à macromolécula M^pro. Encontrando-se que a estrutura FL-166 foi a de melhor conformação. Os 5 ligandos aril borados têm a propriedade de interagir com o grupo hidro-xila (OH) presente nos resíduos tais como serinas, treoninas e tirosinas. Os resultados de acoplamento molecular mostraram que a melhor aproximação sobre a cavidade ocorre sobre o conjunto de treoninas 21, 24, 25 y 26 e não como se afirma na literatura que se da sobre o conjunto de serinas 139, 144 y 147.

Keywords : Síndrome respiratória aguda severa; acoplamento molecular; FlexX; inibição.

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