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Biomédica

Print version ISSN 0120-4157On-line version ISSN 2590-7379

Biomed. vol.44 no.4 Bogotá Oct./Dec. 2024  Epub Nov 06, 2024

https://doi.org/10.7705/biomedica.7286 

Presentación de casos

Haploinsuficiencia de la proteína PUR-a por la mutación de novo de cambio de sentido c.692T>C (p-Phe231Ser) del gen PURA: primer reporte en Colombia

First report of PURA syndrome in a Colombian patient with de novo missense variant c.692T>C (p.Phe231Ser)

Sandra Milena Cerón1  * 
http://orcid.org/0009-0004-0055-7164

Daniel Alejandro Pérez1 
http://orcid.org/0000-0002-6646-441X

Julio Herberth Montaño1 
http://orcid.org/0009-0009-0766-0662

María Amparo Acosta2  3 
http://orcid.org/0000-0002-0513-8127

1 Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad del Cauca, Popayán, Colombia

2 Departamento de Pediatría, Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad del Cauca, Popayán, Colombia

3 Hospital Universitario San José, Popayán, Cauca, Colombia


Resumen

Se presenta el primer caso documentado en Colombia del síndrome PURA, una enfermedad neurológica rara. Esta afección resulta de mutaciones del gen PURA, localizado en el cromosoma 5, que producen haploinsuficiencia de la proteína PUR-a. Esta proteína es esencial para el desarrollo temprano del cerebro y la función neuronal. El paciente, un niño de siete años, comenzó a presentar movimientos distónicos de las manos a los 14 días de vida. A los seis años, se le diagnosticó retraso en el neurodesarrollo, hipotonía generalizada, episodios frecuentes de apnea y dificultad para la deglución. Aunque inicialmente se consideraron otras condiciones, como la distrofia muscular de Duchenne y la lipofuscinosis ceroidea neuronal, la secuenciación completa del exoma reveló la variante patógena c.692T>C (p.Phe231Ser) en el exón 1 del gen PURA, no registrada previamente en otros pacientes. Este hallazgo permitió un enfoque de manejo integral, con el cual se abordaron las características y alteraciones clínicas del paciente. Dado que el síndrome PURA no figura en la lista de enfermedades huérfanas o raras reconocidas por el Ministerio de Salud y Protección Social de Colombia, este reporte podría influir en su reconocimiento oficial.

El caso demuestra la importancia de considerar diagnósticos raros en pacientes con síntomas neurológicos poco comunes y subraya la utilidad de la secuenciación genómica para el diagnóstico. Además, enfatiza la necesidad de colaboración en el área de la salud para optimizar el cuidado de los pacientes con síndrome PURA y otras enfermedades semejantes.

Palabras clave: enfermedades del sistema nervioso; trastornos del neurodesarrollo; niño

Abstract

We present the first documented case of PURA syndrome in Colombia. This rare neurological disease results from mutations in the PURA gene located on chromosome 5, leading to haploinsufficiency of the PUR-a protein. This protein is essential for early brain development and neuronal function.

The patient, a seven-years-old boy, started showing dystonic hand movements at 14 days of age; at six, he had neurodevelopmental delay, generalized hypotonia, frequent episodes of apnea, and swallowing difficulties.

Although other conditions were initially considered, such as Duchenne muscular dystrophy and neuronal ceroid lipofuscinosis, a whole exome sequencing revealed the pathogenic variant c.692T>C (p.Phe231Ser) in the exon 1 of the PURA gene, not previously reported in other patients. With this finding, we adopted a comprehensive management approach addressing the patient's characteristics and alterations.

Since the PURA syndrome is not on the list of orphan/rare diseases recognized by the Colombian Ministerio de Salud y Protección Social, we hope our report will contribute to its official recognition.

The case shows the importance of considering rare diagnoses in patients with uncommon neurological symptoms, underlining the usefulness of genomic sequencing in diagnosis and the need for collaboration to optimize healthcare for patients with PURA syndrome and similar diseases.

Key words: Nervous system diseases; neurodevelopmental disorders; child

Existe una gran cantidad de enfermedades denominadas huérfanas o raras, con muy baja prevalencia y tan pocos casos reportados, que su diagnóstico, seguimiento y tratamiento son complejos. En este grupo de enfermedades se encuentra el síndrome PURA (OMIM_616158), una afección de origen genético, con herencia autosómica dominante y alteraciones de predominio neurológico. Recibe su nombre por la alteración de la proteína de unión a elementos ricos en purina a en las personas que la padecen. Esta proteína es codificada por el gen que recibe el mismo nombre, PURA, ubicado en el brazo largo del cromosoma 5 a nivel de q31.2-q31.3 1. Dicho síndrome se puede presentar con limitación leve a moderada en el desarrollo intelectual, convulsiones, hipotonía, movimientos anormales, dificultad para respirar, deglutir o controlar la temperatura corporal, sueño excesivo y alteraciones cardiacas, gastrointestinales y visuales, entre otras 2,3. La función normal de dicha proteína está relacionada con el crecimiento y la división de las células nerviosas, la formación y la maduración de la mielina, y la replicación del ADN. Sus alteraciones pueden deberse a mutaciones puntuales, deleciones o inserciones en el gen 4.

En Colombia, el Ministerio de Salud y Protección Social publicó la última actualización del listado de enfermedades huérfanas en el 2023. A pesar de que el síndrome PURA está claramente clasificado como enfermedad huérfana en otros países, en Colombia aún no se cataloga como tal 5. Además, el Instituto Nacional de Salud en su informe anual del 2022 sobre enfermedades huérfanas-raras 6, no registró información respecto a esta condición, por lo que este se trataría del primer caso reportado en el país.

Descripción del caso

Se trata de un paciente de siete años y sexo masculino, natural y procedente de Popayán (Cauca). Los padres negaron consanguinidad y exposición a teratógenos. El padre era un hombre sano de 32 años y, la madre, una mujer sana de 23 años, con antecedente de dos gestaciones y dos partos; su primera hija nació sana.

El paciente fue producto del segundo embarazo, no planeado, sin historial de atención anterior a la concepción. Recibió atención prenatal temprana desde la cuarta semana, seis controles en total; su ingestión de micronutrientes fue adecuada. Se le practicaron cuatro ecografías obstétricas, sin hallazgos anormales.

El paciente nació a las 38 semanas de gestación por parto vaginal atendido en una institución de salud; su peso al nacer fue de 3.340 g, su talla fue de 51 cm y el puntaje de Apgar fue adecuado. Presentó ictericia neonatal no hemolítica con duración de 45 días, con valores de bilirrubinas entre 5,4 y 12,8 mg/dl, por lo cual recibió fototerapia. Sin embargo, presentó hipoglucemia neonatal, cianosis e hipotonía; y, además, dificultad respiratoria por neumonía y sepsis neonatal temprana.

Por otra parte, a los 14 días de vida presentó movimientos distónicos en ambas manos, de cuatro a cinco veces al día, sin pérdida del conocimiento, que se diagnosticaron como episodios convulsivos. Al inicio de la lactancia, se observaron episodios graves y frecuentes de apnea del sueño; también, hubo persistencia de la hipotonía generalizada, varios episodios de neumonía por aspiración y trastornos de la deglución.

Hallazgos clínicos

Durante el examen físico a los 6 años de edad, las medidas antropométricas fueron: peso, 21 kg; talla, 116 cm; relación talla/edad, entre 0 y -1 DE (desviación estándar); relación IMC/edad, 0 + 1 DE; envergadura, 108 cm; puntaje esperado menos total (E-T) = -8; segmento pubis-cabeza, 58 cm; segmento pubis-pie, 59 cm; SS/SI, 0,98; y perímetro cefálico, 52 cm.

Como características morfológicas, se observó: braquicefalia, plagiocefalia occipital derecha, pabellones auriculares de implantación baja, cara ovalada, endoforia bilateral, pseudoestrabismo, epicanto bilateral, hipertelorismo ocular, distancia intercántica interna de 40 mm, distancia intercántica externa de 140 mm, pupilas isocóricas fotorreactivas, nariz sin desviación del tabique nasal, puente nasal normal, filtro o surco nasolabial de 20 mm, lengua y úvula sin alteraciones, paladar alto, diastemas dentales y esmalte dental de regular calidad (figura 1). Además, presentaba: pectus excavatum, abdomen normal y escoliosis lumbar derecha; prepucio redundante y testículos descendidos; extremidades móviles, simétricas e hipotónicas; mano derecha con pliegue único de flexión, y pie plano bilateral.

Figura 1 A) Fenotipo general, vista frontal. B) Hipertelorismo, endoforia bilateral y, orejas de implantación baja. C) Pie plano. D) Pliegue único de flexión en la mano derecha. E) Mano izquierda normal 

En el examen neurológico se encontró un paciente alerta, con afasia motora (emitía sonidos incomprensibles); no tenía señales de trastornos auditivos y la mayoría de los pares craneales eran normales, a excepción del VI par craneal bilateral. Además, había pseudoestrabismo convergente e hipotonía de predominio axial, con reflejos presentes (++); requería ayuda para la marcha, fuerza de 3/5 en todas las extremidades, sensibilidad conservada y falta de control de esfínteres.

En el cuadro 1 se presenta el enfoque utilizado para abordar el caso, destacando los posibles diagnósticos diferenciales.

Cuadro 1 Diagnósticos diferenciales que permiten enfocar el caso clínico. 

Diagnósticos diferenciales Presencia Estudio Fecha Resultado e interpretación
Distrofia muscular de No - Detección de deleciones y duplicaciones del gen de la distrofina por la técnica de amplificación por ligación de sondas múltiples 4 de agosto de 2015 Sin evidencia de variantes patogénicas
Duchenne/Becker
- Secuenciación del gen de la distrofia muscular de Duchenne
Disfagia Videofluoroscopia de deglución 21 de octubre de 2016 Disfagia orofaríngea, microaspiraciones y trazos de aspiración durante la deglución de líquidos claros, por ascenso laríngeo disminuido, sin respuesta de tos
Reflujo gastroesofágico de grado I Radiografía de vías digestivas altas con tránsito intestinal 11 de noviembre de 2016 Algunos pequeños eventos de reflujo gastroesofágico de grado I y marco duodenal de posición normal
Enfermedad de Niemann-Pick A/B No Determinación estructural de lisosfingomielina-509 por cromatografía líquida de alta resolución y espectrometría de masas 8 de marzo de 2017 Resultado: 0,4 ng/ml Poca probabilidad de padecer enfermedad de Niemann-Pick
Trastorno deglutorio (disfagia) Faringografía y esofagograma con cine o video (estudio de la deglución) 15 de septiembre de 2017 - Disfagia orofaríngea caracterizada por déficit en los procesos de masticación
- Penetraciones al vestíbulo laríngeo con líquidos espesos (presentación menor del 10 % de las degluciones realizadas con esta consistencia) y microaspiraciones durante la deglución con líquidos claros por ascenso laríngeo disminuido, sin reacción de protección
Distrofia muscular avanzada y fibrosis Biopsia muscular con tinciones de rutina 15 de diciembre de 2017 - Músculo estriado con variación en el tamaño de las miofibras sin internalización de los núcleos
- Áreas de fibrosis en el endomisio en las que hay algunas fibras necróticas
- Hay varias áreas donde las fibras pierden sus estrías y se homogenizan formando fibrosis.
Síndrome de apnea obstructiva del sueño severo Polisomnografías 26 de septiembre de 2017 - Síndrome grave de hipopnea
- Deficiencia de sueño del 94 %
- Neumología recomienda a los padres el uso continuo de presión positiva continua en las vías respiratorias durante el sueño
29 de junio de 2018
Lipofuscinosis ceroidea neuronal infantil (CLN1), No Medición de:Palmitoil tioesterasa (CLN1) y tripeptidil peptidasa (CLN2) 2 de febrero de 2018 Resultado: CLN1: 11 mmol/hora/ml (valores de referencia: 5,6-15)
Lipofuscinosis ceroidea neuronal tipo 2 (CLN2) Tomografía computada de tórax 14 de marzo de 2018 CLN2: 6,1 mmol/hora/ml (valores de referencia: 4,0-23)
Microinspiraciones y episodios de neumonía a repetición El parénquima pulmonar presenta opacidades en vidrio esmerilado, parcheadas, peribroncovasculares distales y atelectasias subsegmentarias en el segmento anterior del lóbulo superior izquierdo y el segmento posterior del lóbulo superior derecho. Se observan atelectasias gravitacionales bilaterales.
Neuropatía No Electromiografía de miembros superiores e inferiores 9 de marzo de 2018 Estudio normal, no hay signos electrofisiológicos de neuropatía.
Alteraciones estructurales o funcionales del corazón No Ecocardiograma 21 de mayo de 2019 - No se observa conducto arterioso persistente.
- Presenta patrón coronario, pericardio y función ventricular normales.
- No hay signos de hipertensión pulmonar.
Aneuploidías en células individuales No Hibridación genómica comparativa basada en microarreglos (aCGH) 180 K, posnatal, a partir de muestra sangre periférica 15 de noviembre de 2019 Sin variaciones en el número de copias relacionadas con la enfermedad
Síndrome PURA por mutación de novo Exoma trío 30 de junio de 2020 Síndrome PURA: c.692T>C (p.Phe231Ser), variante patogénica, de herencia autosómica dominante
Alteraciones estructurales y/o funcionales del riñón No Ecografía renal y de vías urinarias 15 de febrero de 2021 - Riñones de forma y volumen normales, con ecogenicidad homogénea
- No hay evidencia de dilatación del sistema pielocalicial pélvico ureteral
- La relación corticomedular se encuentra conservada.
- Vejiga sin alteraciones
Epilepsia Informe de electroencefalografía (telemetría para epilepsia) 22 de abril de 2021 Actividad epileptogénica interictal temporal bilateral
Enfermedad de Pompe No Actividad enzimática de la α-glucosidasa Normal

Diagnóstico molecular

A la edad de cinco años se hizo la secuenciación completa del exoma y se identificó una variante heterocigota, probablemente patógena, en el exón 1 del gen PURA: c.692T>C (p.Phe231Ser).

Consideraciones éticas

Mediante firma del consentimiento informado, el padre autorizó la revisión de la historia clínica, la toma de registros audiovisuales, y la realización y publicación del reporte de caso.

Discusión

El síndrome PURA es una enfermedad neurológica de origen genético, producto de la mutación del gen PURA, ubicado en el cromosoma 5, locus q31.2-q31.3, cuya secuencia codifica para una proteína activadora de la transcripción: la proteína a de unión a elementos ricos en purinas 7. Esta proteína participa en el crecimiento y la división neuronal, la maduración de las dendritas y la transmisión de sinapsis 8.

Los primeros reportes del síndrome PURA aparecieron en la literatura médica en el año 2011, con el nombre de síndrome de microdeleción en 5q31.3. Esta enfermedad está clasificada dentro del grupo de las raras o huérfanas debido a su escasa prevalencia, ya que en el mundo afecta aproximadamente a 500 personas entre adultos y niños 9,10. Los defectos asociados con este síndrome son causados por mutaciones del gen del exón único PURA que, como se mencionó, codifica para PUR-α, una proteína multifuncional muy conservada y expresada de manera ubicua, conformada por 322 aminoácidos. Estructuralmente, tiene un dominio N-terminal rico en glicina (6-57 aminoácidos), tres repeticiones centrales conservadas Pur I-II-III (60-279 aa) y un dominio C-terminal rico en glutamina y glutamato (282-303aa) (figura 2) 11.

Figura 2 A) Localización del gen PURA en el cromosoma 5, locus q31.2-q31.3. B) Proteína Pur-a y ubicación de la variante patógena del paciente. 

La proteína pur a es miembro de la familia proteica PUR y, al actuar como factor de transcripción, puede combinarse directa e indirectamente con el ADN, promoviendo o inhibiendo la transcripción génica. Esta transcripción es esencial para llevar a cabo los procesos relacionados con el desarrollo posnatal normal de las células de la médula ósea, los músculos y el cerebro, ya que la PURA participa en la proliferación neuronal, la maduración de las dendritas, el transporte de ARNm a los sitios de traducción en las neuronas del hipocampo, y la formación y maduración de la mielina. Por lo tanto, las mutaciones relacionadas con el gen PURA son responsables de retrasos moderados a graves del neurodesarrollo 12-14.

Los trastornos del desarrollo neurológico relacionados con alteraciones en el gen PURA incluyen el síndrome PURA, causado por una variante de secuencia patogénica heterocigota del gen en 90 % de los casos, y el síndrome de deleción 5q31.3, causado por una deleción del locus 5q31.3 que abarca todo o parte del gen PURA en 10 % de los casos. A la fecha, se conocen 61 variantes diferentes de novo de la secuencia intragénica del gen PURA, que incluyen mutaciones puntuales, cambio de sentido, sin sentido, desplazamiento del marco de lectura e inserciones o deleciones (indels) (figura 3). Estas variantes llevan a la haploinsuficiencia de PUR-a y a las manifestaciones clínicas descritas 15.

Figura 3 Ubicación y ejemplos de variantes patogénicas de novo

El síndrome PURA como tal es un trastorno monogénico esporádico y se identificó por primera vez mediante la secuenciación completa del exoma, que permitió el diagnóstico de variantes patogénicas heterocigotas de novo en 15 pacientes en el 2014 16.

Las características de los individuos con síndrome de deleción 5q31.3 se superponen con las de aquellos con una variante patogénica en el gen PURA e incluyen: hipotonía neonatal, trastornos de la deglución y respiratorios, así como discapacidad intelectual grave y episodios convulsivos 7,17,18 (figura 4).

Figura 4 Manifestaciones clínicas del síndrome PURA [Body vectors by Vecteezy (https://www.vecteezy.com/free-vector/body)] 

Cabe destacar que los individuos con deleciones que también incluyen el gen contiguo NRG2 o más grandes (que abarcan múltiples genes además de PURA y NRG2), presentan un fenotipo más grave con distintos dimorfismos faciales que los individuos con una variante patógena intragénica 18.

Mediante el análisis de secuenciación de última generación, se identificó en este caso una variante heterocigota de tipo cambio de sentido, que ocurrió de novo y que consiste en la sustitución de la base nitrogenada timina por citosina en la posición 692, lo cual genera un cambio del aminoácido fenilalanina por serina en la posición 231 de la secuencia proteica de PUR-a (cuadro 2), una posición muy conservada a nivel evolutivo.

Cuadro 2 Reporte de hallazgos obtenidos mediante secuenciación masiva y Sanger a partir del ADN del paciente y sus progenitores 

Gen Mutación Id SNV Clasificación de variante Cigosidad Enfermedad asociada Tipo de herencia
Paciente Padre Madre
PURA (NM_005859.5 c.692T>C (p.Phe231Ser) rs1554129113 Probablemente patogénica Heterocigoto No presente No presente Síndrome PURA (OMIM_616158) Autosómica dominante

Fuente: SYNLAB, exámenes y valoraciones, 13 de julio de 2020, conservado en el Servicio de Pediatría del Hospital Universitario San José, Popayán, Colombia

Id SNV: identificación de variante de nucleótido único

Esta variante aparece descrita como patógena en la base de datos de variantes ClinVar, pero no se menciona en otras bases de datos ni en la literatura científica consultada hasta la fecha. Se sugiere la aparición de novo de esta variante, probablemente patógena, ya que en el análisis completo del exoma en trío de los progenitores no se detectó dicha variante (SYNLAB, Exámenes y valoraciones, 13 de julio de 2020. Los resultados se conservan en el Servicio de Pediatría del Hospital Universitario San José en Popayán, Colombia).

Casi todas las variantes patógenas de la secuencia de PURA reportadas hasta la fecha han sido de novo, el riesgo de que los hermanos la hereden parece ser poco (estimado empíricamente en mayor del 1 %), pero mayor que en la población general, debido a la posibilidad de mosaicismo de la línea germinal de los padres. Se han identificado muy pocos adultos con trastornos del desarrollo neurológico relacionado con PURA y ninguno ha tenido hijos. Sin embargo, el riesgo teórico para la descendencia de un individuo afectado es del 50 %, ya que esta enfermedad se hereda de forma autosómica dominante 15.

Las manifestaciones clínicas en el presente caso se iniciaron en el periodo neonatal y se caracterizaron por hipotonía acentuada de predominio axial, hipoactividad, movimientos distónicos, dificultad respiratoria con episodios de apneas y trastornos de la succión y la deglución.

En la mayoría de los reportes, se asegura que la hipotonía, la dificultad para la deglución y la apnea o hipoventilación primaria son los trastornos más comunes en el síndrome PURA, y los principales motivos por los cuales se hospitalizan estos pacientes 11,15. En una serie de 32 casos, se presentó hipotonía en el 97 %, dificultades para la deglución en el 81 % y dificultad para respirar en el 48 %. Se destaca el hecho de que la hipotonía es una de las manifestaciones más comunes en el síndrome PURA; por lo tanto, el abordaje del recién nacido hipotónico debe contemplar un amplio espectro de enfermedades posiblemente asociadas con trastornos genéticos 19.

Durante la edad escolar, se observó retraso en el desarrollo neurológico del paciente que se manifestaba con dificultades en el lenguaje. En la mayoría de los casos (alrededor del 91 %), los niños con el síndrome PURA sufren afasia, aunque tienen un buen lenguaje receptivo y pueden seguir instrucciones simples, pero presentan una falta notable de lenguaje expresivo. Otras manifestaciones que se deben tener en cuenta son epilepsia, estrabismo bilateral y un deterioro neurológico progresivo que eventualmente empeora el cuadro clínico 8,20.

Conclusiones

La mayoría de las enfermedades huérfanas o raras son de origen genético. El avance y la implementación de los métodos de diagnóstico molecular han permitido que los pacientes afectados puedan tener un enfoque terapéutico más claro abren camino para continuar investigando estas enfermedades de tan baja prevalencia.

Gracias a métodos como la secuenciación completa del exoma, se han podido caracterizar pacientes con el síndrome PURA en todo el mundo y se han encontrado más variantes de secuencia patogénica de novo. Esto último ha permitido definir la importancia de aminoácidos muy conservados en la proteína alterada, lo cual ha establecido la importancia de las posiciones muy conservadas de los aminoácidos en la proteína afectada.

En el enfoque clínico de un paciente pediátrico hipotónico, y para la consideración de diagnósticos diferenciales, es importante elaborar una historia clínica completa con indagación de variables familiares, ambientales y demás, así como un oportuno estudio interdisciplinario. En este informe, el paciente presentaba síntomas asociados con haploinsuficiencia de la proteína PUR-a, causada por una variante heterocigota, de secuencia patogénica de novo, de tipo cambio de sentido. Mediante el enfoque adecuado de los hallazgos clínicos y el reporte molecular, se llegó al diagnóstico del paciente.

A nivel mundial, los sistemas de salud han puesto en marcha estrategias para que los escasos pacientes reportados con este síndrome mejoren su calidad de vida, ya que el tratamiento tiene un enfoque de manejo integral para evitar complicaciones causadas por las alteraciones de base descritas. En Colombia, es fundamental que esta enfermedad haga parte del listado de enfermedades huérfanas o raras del Ministerio de Salud y Protección Social.

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Citación: Cerón SM, Pérez DA, Montaño JH, Acosta MA. Haploinsuficiencia de la proteína PUR-a por la mutación de novo de cambio de sentido c.692T>C (p-Phe231Ser) del gen PURA: primer reporte en Colombia. Biomédica. 2024;44:441-50. https://doi.org/10.7705/biomedica.7286

Contribución de los autores: Todos los autores participaron en todas las etapas del reporte de caso.

Financiación:

No se requirió financiación para el desarrollo de la investigación, por tratarse de la descripción de un caso clínico.

Recibido: 23 de Noviembre de 2023; Aprobado: 13 de Agosto de 2024; Publicado: 13 de Agosto de 2024

*Correspondencia: Sandra Milena Cerón, carrera 22 N°53N-155, casa 272, Conjunto Bosque Encantado, Popayán, Colombia sandraceron@unicauca.edu.co

Conflicto de intereses:

Los autores declaran ausencia de conflictos de intereses.

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