SciELO - Scientific Electronic Library Online

 
vol.24 issue3ISOLATION OF THE HUMAN CYTOMEGALOVIRUS FROM BODILY FLUIDSMeta-analyses of the validity and performance of screening tests for Hepatitis C Virus in the blood banks, 2000-2018 author indexsubject indexarticles search
Home Pagealphabetic serial listing  

Services on Demand

Journal

Article

Indicators

Related links

  • On index processCited by Google
  • Have no similar articlesSimilars in SciELO
  • On index processSimilars in Google

Share


Acta Biológica Colombiana

Print version ISSN 0120-548X

Abstract

LOPEZ-LOPEZ, Karina; JARA-TEJADA, Frenyiline  and  VACA-VACA, Juan Carlos. CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE UN NUEVO BEGOMOVIRUS AISLADO DE CINCO ESPECIES DE ARVENSES COLECTADAS EN CULTIVOS DE TOMATE EN VALLE DEL CAUCA. Acta biol.Colomb. [online]. 2019, vol.24, n.3, pp.528-537. ISSN 0120-548X.  https://doi.org/10.15446/abc.v24n3.79366.

Las arvenses son hospederos alternos de begomovirus (Geminiviridae), los cuales facilitan su persistencia y propagación a cultivos de interés agronómico, como el tomate. El objetivo de esta investigación fue obtener el genoma completo de un begomovirus bipartita encontrado en Amaranthus dubius, Rivina humilis, Rhynchosia minima, Desmodium sp. y Caesalpinia sp., las cuales fueron colectadas en cultivos de tomate en Ginebra y Cerrito, Valle del Cauca. El genoma del begomovirus fue obtenido utilizando amplificación por círculo rodante y digestión con las enzimas EcoRI y EcoRV, las cuáles cortan el componente genómico A y B, respectivamente. Estos fragmentos fueron clonados, secuenciados y analizados. Finalmente, se verificó la presencia de este begomovirus en todas las arvenses mediante PCR específico. Se obtuvieron tres clonas EcoRI y cinco clonas EcoRV. Los fragmentos que portan los componentes A y B presentan un tamaño de 2 584 y 2 543 nt, respectivamente. El análisis de secuencia de nucleótidos del genoma begomoviral A con otros begomovirus previamente reportados, mostró la mayor identidad (90,9 %) con el virus del mosaico dorado de Rhynchosia de Yucatán. Tomando como base el criterio de demarcación actual para las especies de Begomovirus establecido por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus, el geminivirus aislado de las arvenses A. dubius, R. humilis, R. minima, Desmodium sp. y Caesalpinia sp., constituye una nueva especie begomoviral. Con base en la sintomatología observada en campo, se propone el nombre de Virus del mosaico dorado de Rhynchosia de Colombia para designar a esta nueva especie.

Keywords : Geminivirus; mosca blanca; reacción en cadena de la polimerasa; Solanaceae.

        · abstract in English     · text in Spanish     · Spanish ( pdf )