Abstract

PENA, Ángela et al. Influência dos íons Mg²⁺ sobre a interação entre o ácido 3,5-dicafeoilquínico e a integrase do HTLV-I. Univ. Sci. [online]. 2012, vol.17, n.1, pp.5-15. ISSN 0122-7483.

Objetivo. Usando simulação molecular, estudamos a influência dos íons Mg²⁺ na interação do domínio catalítico da integrase HTLV-I (IN) (modelado por homologia) com o ácido 3,5-dicafeoilquínico (3,5-diCQA). Materiais e métodos. O modelo de homologia da HTLV-I IN foi construído utilizando como fôrma a estrutura cristalina da IN de vírus do sarcoma aviário (VSA, pdb: 1VSD). Para analisar o papel dos íons Mg²⁺ na interação com o 3,5-diCQA e a integrase, três modelos foram criados: i) na ausência de íons Mg²⁺, ii) com um íon Mg²⁺ coordenado com Asp15 e Asp72 e, iii) com dois íons Mg²⁺ coordenados com Asp15-Asp72 e Asp72-Glu108. As forças de interação e a energia livre de ligação entre o 3,5-diCQA e a HTLV-I IN foram calculadas nos três modelos. Resultados. A pontuação mais baixa no docking e a menor energia livre foram obtidas para o modelo com um único íon de Mg²⁺. O Mg²⁺ afeta fortemente o acoplamento do inibidor 3,5-diCQA com o domínio catalítico da HTLV-I IN, revelando uma forte interação entre o complexo ligando-proteína que é independente do sítio catalítico dos três modelos utilizados. Conclusão. Os resultados sugerem que a presença de um íon Mg²⁺ poderia aumentar a interação no complexo devido à diminuição da energia livre, aumentando assim a afinidade. Assim, propomos ao 3,5-diCQA como farmacóforo para a fabricação de medicamentos antirretrovirais.

Keywords : ácido 3,5-dicafeoilquínico (3,5-diCQA); Integrase linfotropica-T humana Tipo I (HTLV-1); integrase (IN); Modelo por homologia; Molecular Docking; Energia livre de ligação; íons Mg²⁺.

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