Abstract

MALAGON BERNAL, Rafael Eduardo; FERNANDEZ NAVAS, Manuel Alejandro  and  ACEVEDO SARMIENTO, Orlando Emilio. Modelo molecular teórico dei receptor serotoninérgico 5HT_2A acoplado a proteína G. Univ. Sci. [online]. 2012, vol.17, n.2, pp.119-139. ISSN 0122-7483.

Objetivo. Construir un modelo molecular teórico de la estructura terciara del receptor 5HT_2A de Homo sapiens a partir de estructuras obtenidas experimentalmente como plantillas. Materiales y métodos. Para la realización del modelo teórico se contempló el protocolo establecido por Ballesteros y Weinstein para la construcción del receptor acoplado proteína G, por medio de alineamiento de la secuencia de aminoácidos, perfiles de hidrofobicidad, refinamiento de bucles por restricciones espaciales, y minimización de energía con el campo de fuerza OPLS_2005. Resultados. El modelo obtenido fue validado por el gráfico de Ramachandran con un 91,7% de aminoácidos dentro de los límites establecidos para ángulos phi y psi, y un RMSD de 0,95 A con respecto a rodopsina de bovino. Conclusiones. Se obtuvo un modelo teórico validado, útil para realización de estudios de acoplamiento ligando-receptor.

Keywords : receptor proteína G.

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