Abstract

VARGAS GARCIA, César Augusto; ARGUELLO FUENTES, Henry  and  TORRES SAEZ, Rodrigo Gonzalo. Predicción a escala genómica de Componentes de Saccharomyces cerevisiae mediante Análisis de Balance de Flujos. Rev. colomb. biotecnol [online]. 2012, vol.14, n.1, pp.93-107. ISSN 0123-3475.

El microorganismo Saccharomyces cerevisiae cuenta con gran número de modelos biológicos conocidos como reconstrucciones, las cuales pueden ser a escala genómica. De estas reconstrucciones a escala genómica provienen los modelos matemáticos, también llamados modelos estequiométricos. Una de las técnicas más usadas para estudiar estos modelos es el Análisis de Balance de Flujos (FBA). El proposito del FBA es predecir el crecimiento del microorganismo bajo estudio, y la producción y consumo de componentes como el etanol, CO₂ glicerol, sucinato, acetato y piruvato. Para determinar si las predicciones obtenidas mediante FBA son únicas se utiliza la técnica de Análisis de Variabilidad Flujos (FVA). El presente trabajo muestra los resultados de aplicar el FBA a la reconstrucción reciente del microorganismo S. cerevisiae, la denominada iMM904 y los compara con un conjunto de datos experimentales presente en la literatura. Este trabajo también estudia la existencia de múltiples predicciones FBA utilizando la técnica FVA. Los resultados ilustran que es posible predecir el crecimiento del microorganimo S. cerevisiae, con errores entre el 11% y 28%; la producción de CO₂, con errores entre el 0.3% y 4.5% y la producción de etanol, con errores entre el 11% y 13%.

Keywords : analisis de balance de flujos; reconstrucción a escala genómica; iMM904, S; cerevisiae.

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