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Revista de Salud Pública

Print version ISSN 0124-0064

Abstract

GAVIRIA-RIVERA, Adelaida; GIRALDO-LOPEZ, Alejandra; SANTA-CARDONA, Carolina  and  CANO-RESTREPO, Luz. Identificación molecular de aislamientos clínicos de Fusarium en Colombia. Rev. salud pública [online]. 2018, vol.20, n.1, pp.94-102. ISSN 0124-0064.  http://dx.doi.org/10.15446/rsap.v20n1.51923.

Objetivo

Identificar aislamientos de Fusarium en pacientes con micosis por medio de las técnicas moleculares de PCR y secuenciación.

Métodos

Se tomaron 101 muestras de pacientes con micosis sintomática, entre los años 2004 y 2006. Para la detección de aislamientos como pertenecientes al género Fusarium, se amplificó parcialmente por PCR la región 28S del DNAr; y posteriormente -para la detección de la especie de Fusarium- se utilizaron cebadores específicos para F. oxysporum y F. solani. La verificación de la identidad de la especie de los aislamientos se hizo por secuenciación parcial de los genes 28S DNAr y TEF1-α

Resultados

El total de 101 aislamientos fueron detectados como pertenecientes al género Fusarium utilizando un cebador universal de la region 28S DNAr; 52 y 29 aislamientos se detectaron como F. oxysporum o F. salani, respectivamente con los cebadores específicos, y la secuenciación parcial de los genes 28S rDNA o TEF1-α confirmó la identidad de las especies.

Conclusión

La secuenciación parcial del gen TEF1-α es aún el mejor marcador molecular para identificar aislamientos de Fusarium a nivel de especie. Sin embargo, en la mayoría de los casos es posible discriminar entre aislamientos de F. oxysporum y F. solani por PCR con cebadores específicos, lo que proporciona una ventaja importante considerando la simplicidad de la técnica y el rápido diagnóstico.

Keywords : ADN ribosómico; PCR; secuenciación; elongación (fuente: DeCS, BIREME).

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