Abstract

WAHYUDI, Didik; AUFA, Ihda Ummu  and  HAPSARI, Lia. Análisis filogenético y caracterización molecular de BBTV DNA-R de aislados de banano silvestre y cultivado de Java Oriental, Indonesia. Rev. Fac. Nac. Agron. Medellín [online]. 2023, vol.76, n.3, pp.10437-10444.  Epub Sep 01, 2023. ISSN 0304-2847.  https://doi.org/10.15446/rfnam.v76n3.104708.

La detección molecular virus del cogollo racimoso del banano y la comprensión de su origen son temas importantes para mitigar la propagación futura. El objetivo de este estudio fue detectar molecularmente la infección por BBTV y analizar las características filogenéticas de los aislamientos de banano de Java Oriental, Indonesia. Se examinaron dos cultivares de banano silvestre asintomáticos BBTV y dos cultivares de banano sintomáticos BBTV. Las amplificaciones por PCR se realizaron utilizando cebadores BBTV DNA-R para la proteína maestra de iniciación de la replicación. La evaluación e identificación de las secuencias se realizó en SeqScanner y un análisis nucleótido BLAST, respectivamente. La traducción de los ORF se determinó utilizando la herramienta de servidor ORF Finder. La identificación de proteínas se realizó empleando el programa BLAST. Los polimorfismos de las secuencias se analizaron utilizando DnaSP6. El análisis filogenético se empleó utilizando el algoritmo Neighbor-Joining con el modelo de sustitución Kimura de dos parámetros (K2P) en MEGA7. Los resultados mostraron que los componentes de BBTV DNA-R se detectaron en todos los aislamientos y se confirmaron como proteína Rep. La longitud de las secuencias varió de 616 a 1.074 pb, bajo contenido de GC (42,90%) y baja conservación (56,47%). Los bananos silvestres asintomáticos generaron secuencias más cortas y variables, presumiblemente relacionadas con el mecanismo de resistencia. El análisis filogenético de BBTV DNA-R East Java con otras 38 secuencias homólogas en todo el mundo se encontró agrupado en el Grupo Asiático, estrechamente relacionado con Vietnam, Tailandia y China. Por lo tanto, presumiblemente se originó en China continental a través de la ruta de la Península Malaya.

Keywords : Bananos; Variación genética; Identificación; Proteína Rep; Virus.

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