Resumo

PALACIOS ERAZO, Yineth Alexandra et al. Estudios de asociación en genoma completo para caracteres de crecimiento en Ovinos de Pelo Colombiano. Rev. Fac. Nac. Agron. Medellín [online]. 2024, vol.77, n.1, pp.10625-10635.  Epub 31-Jan-2024. ISSN 0304-2847.  https://doi.org/10.15446/rfnam.v77n1.105408.

Los Ovinos de Pelo Colombiano tienen características de gran interés, entre ellas se resaltan: alta capacidad de adaptación, buena fertilidad, alta prolificidad y baja presencia de enfermedades que han sido poco estudiadas. Actualmente, los estudios de asociación de genoma completo (GWAS) han sido ampliamente usados para detectar y localizar genes candidatos. Sin embargo, en ovinos se cuenta con un bajo número de investigaciones al respecto, debido a que la información disponible se encuentra limitada, en comparación con la de otras especies. El objetivo de esta investigación fue realizar un análisis genómico asociado a caracteres de crecimiento muscular, mediante el uso del microarreglo OvineSNP50 BeadChip de Illumina. Se realizó un GWAS empleando 54,241 polimorfismos de nucleótido simple (SNPs), en ovinos de pelo criollo, en el cual se evaluaron las variedades raciales Etíope (44), Sudán (63) y Pelibuey (60), para ocho caracteres de crecimiento. Se llevó a cabo un control de calidad a través del programa PLINK, por medio de un modelo de regresión lineal. Posteriormente se hizo un análisis funcional, empleando el genoma ovino Ovis aries v.3.1, en la base de datos de KEGG. Después de haber realizado el control de calidad, se analizaron 44,396 SNP. Se identificaron los 10 SNPs más significativos para cada carácter. A través del análisis funcional se logró anotar cuatro posibles genes candidatos (CEP135, EMCN, PAM y PIAS2), como los más importantes en los caracteres evaluados. Adicionalmente, se encontraron 27 genes asociados a los caracteres fenotípicos, los cuales pueden ser prometedores y podrían estar influyendo en los caracteres de crecimiento. Este trabajo es el primer GWAS en ovinos de pelo colombiano en el país, que ha asociado caracteres fenotípicos de crecimiento muscular con caracteres genómicos. El GWAS permitió identificar cuatro posibles genes candidatos (CEP135, EMCN, PAM y PIAS2), asociados a ocho caracteres de crecimiento.

Palavras-chave : Ovino criollo; GWAS; Peso vivo; Microarreglo; SNPs; Ganancia de peso.

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