Abstract

BEDOYA, Óscar  and  BUSTAMANTE, Santiago. CNN-PROMOTER, NUEVO PROGRAMA PARA LA PREDICCIÓN DE PROMOTORES BASADO EN REDES NEURONALES. Rev.EIA.Esc.Ing.Antioq [online]. 2011, n.15, pp.153-164. ISSN 1794-1237.

En este artículo se presenta un programa nuevo para la predicción de promotores llamado CNN-Promoter, que toma como entrada secuencias de ADN y las clasifica como promotor o no promotor. Se han desarrollado diversos métodos para predecir las regiones promotoras en organismos eucariotas, muchos de los cuales se basan en modelos de Markov, árboles de decisión y métodos estadísticos. A pesar de la variedad de programas existentes para la predicción de promotores, se necesita aún mejorar los valores de sensibilidad y especificidad. Se propone un nuevo programa que se basa en la estrategia de mezcla de expertos usando redes neuronales. Los resultados obtenidos en las pruebas alcanzan valores de sensibilidad y especificidad de 100 % en el entrenamiento y de 74,5 % de sensibilidad y 82,7 % de especificidad en los conjuntos de validación y prueba.

Keywords : Predicción de promotores; redes neuronales; estrategia de consenso.

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