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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The composition of bacteria associated with refuse dumps of Atta cephalotes ants living in captivity was investigated using molecular microbiology methods. Eight different bacterial strains were isolated using culturedependent methods; these belonged to the Firmicutes, Proteobacteria and Actinobacteria phyla. According to molecular analysis using polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE), there were differences in the bacterial communities present in the total fraction (TF, DNA extracted directly from the waste disposal area) and the cultivable fraction (CF, DNA obtained after culturing) of the three A. cephalotes waste disposal areas. However, similarities greater than 60 &#37; were observed between the profiles for the total fraction at the sampling times (0 and 15 days) in two of the waste disposal areas (1H and 3H). The analysis of the DNA sequences obtained from the DGGE bands revealed the predominance of the Proteobacteria, Firmicutes and Bacteroidetes phyla, including five genera (Ralstonia, Burkholderia, Bacillus sp., Enterobacter sp., Myroides sp.) and one group of uncultured bacteria. Bacillus was the most dominant bacterial group in all of the samples analyzed. Some of the genera found have been studied for their potential role in degrading organic matter, promoting plant growth, and acting as antimicrobial agents. This paper provides the first molecular analysis of the bacterial communities associated with refuse dumps of A. cephalotes lab colonies. Our research revealed the presence of consistently associated microbes in refuse dumps; this suggests that resident communities are shaped by the degradation of plant residues and ants. Further research is needed in order to demonstrate function and possible applications.]]></p></abstract>
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<kwd lng="es"><![CDATA[Hormigas cortadoras de hojas]]></kwd>
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</front><body><![CDATA[  <font size="2" face="Verdana">      <p><font face="Verdana" size="4"><b>An&aacute;lisis molecular de las  bacterias asociadas a los dep&oacute;sitos de desechos</b> <b>de <i>Atta  cephalotes </i>(Hymenoptera:  Formicidae)</b></font></p>     <p>&nbsp;</p>     <p><font face="Verdana" size="3"><b>Molecular  analysis of bacteria associated with refuse dumps of <i>Atta cephalotes </i>(Hymenoptera:  Formicidae)</b></font></p>     <p>&nbsp;</p>     <p><b>ADRIANA  ORTIZ-REYES<sup>1,2</sup>, TATIANA M. GIRALDO-JARAMILLO<sup>1,3</sup> y CLAUDIA XIMENA MORENO-HERRERA<sup>1,4</sup></b></p>     <p><sup>1</sup> Universidad Nacional de Colombia, Sede  Medell&iacute;n, Facultad de Ciencias, Escuela de Biociencias, Calle 59 A No. 63 - 20  Autopista Norte, Medell&iacute;n, C&oacute;digo  Postal  050034, Medell&iacute;n, Colombia. Tel.: 4309822.     <br><sup>2</sup> Ph. D. Laboratorio de Insectos y  Biotecnolog&iacute;a, Facultad de Ciencias. Grupo Sustancias Activas y  Biotecnolog&iacute;a.      <br><sup>3</sup> M.  Sc. Laboratorio Biolog&iacute;a Molecular y Celular, Grupo de Microbiodiversidad y  Bioprospecci&oacute;n.    <br> <sup>4</sup> Ph.  D Laboratorio Biolog&iacute;a Molecular y Celular,  Grupo de Microbiodiversidad y Bioprospecci&oacute;n. <i><a href="mailto:cxmoreno@unal.edu.co">cxmoreno@unal.edu.co</a>, </i>autor para correspondencia.</p> <hr noshade size="1"> <font face="Verdana" size="2"><b>RESUMEN</b></font>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>La  composici&oacute;n bacteriana asociada a dep&oacute;sitos de desechos de las hormigas <i>Atta cephalotes </i>en cautiverio, se  analiz&oacute; empleando m&eacute;todos de microbiolog&iacute;a molecular. Ocho cepas bacterianas se  aislaron utilizando m&eacute;todos dependientes  de cultivo, pertenecientes a los fila Firmicutes, Proteobacterias y  Actinobacterias<i>. </i>De acuerdo con el an&aacute;lisis  molecular de los perfiles de electroforesis en gel de gradiente  desnaturalizante (PCR-DGGE) de las tres &aacute;reas de desecho  de <i>A</i>. <i>cephalotes</i>, se encontraron diferencias en las comunidades bacterianas  presentes en la fracci&oacute;n total (FT, ADN  extra&iacute;do directamente del &aacute;rea de desecho) y en la fracci&oacute;n cultivable (FC, ADN  obtenido despu&eacute;s del cultivo). En la  fracci&oacute;n total se encontr&oacute; similitudes superiores al 60 &#37; entre los perfiles de  los tiempos (0 y 15 d&iacute;as) para dos de las &aacute;reas  de desecho (1H y 3H). El an&aacute;lisis de las secuencias del ADN obtenido de las  bandas del DGGE revel&oacute; el predominio de  los fila Proteobacteria, Firmicutes y Bacteroidetes, incluyendo cinco g&eacute;neros (<i>Ralstonia</i>, <i>Burkholderia</i>, <i>Bacillus </i>sp<i>.,Enterobacter </i>sp. y <i>Myroides </i>sp.) y un grupo de bacterias no  cultivadas hasta el momento, siendo <i>Bacillus </i>el grupo dominante  en todas las muestras analizadas. Los g&eacute;neros encontrados se destacan por su  potencial en la degradaci&oacute;n de  materia org&aacute;nica, como promotores de crecimiento de plantas y por su actividad  antimicrobiana. En este estudio mostramos  el primer an&aacute;lisis molecular de la comunidad bacteriana asociada a las &aacute;reas de  desecho de las hormigas<i>A. cephalotes </i>en nidos artificiales. Nuestro trabajo revela la presencia  de microbios asociados consistentemente en los dep&oacute;sitos  y sugiere que las comunidades residentes est&aacute;n determinadas por la degradaci&oacute;n  de residuos de la planta y de las hormigas. Se requiere mayor investigaci&oacute;n para  evidenciar su funci&oacute;n y su posible aplicaci&oacute;n.</p>     <p><font face="Verdana" size="2"><b>Palabras clave</b>:    </font>Hormigas  cortadoras de hojas. Diversidad bacteriana. PCR&#150;DGGE. ADNr 16S. Microbiota.</p> <hr noshade size="1">     <p><font face="Verdana" size="2"><b>ABSTRACT</b></font></p>     <p>The composition of bacteria associated with refuse dumps of <i>Atta cephalotes </i>ants living in captivity was investigated using molecular  microbiology methods. Eight different bacterial strains were isolated using  culturedependent  methods;  these belonged to the Firmicutes, Proteobacteria and Actinobacteria phyla.  According to molecular   analysis  using polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis  (PCR-DGGE), there were differences   in  the bacterial communities present in the total fraction (TF, DNA extracted  directly from the waste disposal area) and   the  cultivable fraction (CF, DNA obtained after culturing) of the three <i>A. cephalotes </i>waste disposal areas. However,   similarities  greater than 60 &#37; were observed between the profiles for the total fraction at  the sampling times (0 and 15   days)  in two of the waste disposal areas (1H and 3H). The analysis of the DNA  sequences obtained from the DGGE   bands  revealed the predominance of the Proteobacteria, Firmicutes and Bacteroidetes  phyla, including five genera   (<i>Ralstonia</i>, <i>Burkholderia</i>, <i>Bacillus </i>sp., <i>Enterobacter </i>sp., <i>Myroides </i>sp.) and one group of uncultured  bacteria. <i>Bacillus</i>   was  the most dominant bacterial group in all of the samples analyzed. Some of the  genera found have been studied for   their  potential role in degrading organic matter, promoting plant growth, and acting  as antimicrobial agents. This paper   provides  the first molecular analysis of the bacterial communities associated with  refuse dumps of <i>A. cephalotes </i>lab   colonies.  Our research revealed the presence of consistently associated microbes in  refuse dumps; this suggests that   resident  communities are shaped by the degradation of plant residues and ants. Further  research is needed in order to demonstrate  function and possible applications.</p>     <p><font face="Verdana" size="2"><b>Key words</b></font><b>: </b>Leafcutter ants. Bacterial diversity.  PCR &#150;DGGE, 16S rDNA. Microbiota.</p> <hr noshade size="1">     <p>&nbsp;</p>     <p><font face="Verdana" size="3"><b>Introduction</b></font></p>     <p>Las  hormigas cortadoras de hojas son dominantes herb&iacute;voros   en  los ecosistemas que habitan, utilizan una amplia variedad   de  plantas para el sostenimiento de cultivos del hongo <i>Leucoagaricus</i>   <i>gongylophorus</i>, fuente de alimento de las hormigas   (Mueller <i>et al</i>. 2001). Esta estrategia evolutiva les ha   permitido  optimizar el recurso vegetal a tal punto que pueden   llegar  a forrajear hasta el 17 &#37; de la biomasa foliar en algunos   ecosistemas  (Costa <i>et al</i>. 2009). Las hormigas cortadoras   <i>Atta cephalotes </i>(L.) viven en nidos subterr&aacute;neos donde   albergan  a millones de obreras, la arquitectura de los nidos   ha  sido estudiada por Moreira <i>et  al. </i>(2004), los autores han   encontrado  que los nidos pueden llegar a contener miles de   c&aacute;maras  donde se cultiva el hongo, se encuentra la reina, las   cr&iacute;a  y las destinadas como dep&oacute;sitos de basura, llegando a remover hasta  40.000 Kg de suelo (H&ouml;lldobler y Wilson 2010).</p>     <p>  El  &eacute;xito de las hormigas cortadoras de hojas ha sido atribuido   en  parte a la eficiencia que presenta los cultivos de <i>L</i>.   <i>gongylophorus </i>como un sistema integrado de manejo. Currie   y  Stuart (2001) se&ntilde;alan como el comportamiento que   despliegan  las hormigas jardineras, juega un papel fundamental   en  la remoci&oacute;n mec&aacute;nica de contaminantes de los   cultivos.  Igualmente se ha estudiado el papel que juega el   hongo  en los procesos bioqu&iacute;micos durante el proceso de   degradaci&oacute;n  de la biomasa del material vegetal, encontrando   que <i>L</i>. <i>gongylophorus </i>cuenta con enzimas de la familia   de  las hemicelulasas, pectinasas, almilasa y lacasas (Silva <i>et</i> <i>al</i>., 2006 a y b; Aylward <i>et al</i>.,  2013a; Lange y Grell 2014).</p>     <p>  Adicionalmente,  Aylward <i>et al</i>. (2015) dan evidencia del papel que estar&iacute;a cumpliendo las  gongylidias, estructuras   que  son caracter&iacute;sticas de las hifas del hongo, donde se concentran   las  enzimas producidas y al ser ingeridas por las   hormigas  no sufren ninguna alteraci&oacute;n cuando pasan por el   tracto  digestivo, pero al ser expulsadas en forma de gotas   fecales  en las diferentes &aacute;reas de los jardines facilitan la degradaci&oacute;n  de la biomasa.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>  No  obstante, no todos los procesos bioqu&iacute;micos dependen   del  hongo, diferentes trabajos han puesto en evidencia que   existe  un consorcio de microrganismos representado principalmente   por  los g&eacute;neros <i>Klebsiella</i>, <i>Pantoea</i>, <i>Escherichia </i>y   <i>Citrobacter</i>, asociados con los procesos de degradaci&oacute;n de la   pared  celular y la bios&iacute;ntesis de amino&aacute;cidos, vitamina B y   otros  nutrientes que posiblemente potencializan el crecimiento   de  la biomasa en los cultivos (Scott <i>et  al</i>. 2010; Suen <i>et al</i>.   2010;  Aylward <i>et al</i>. 2012a ; Huang <i>et  al</i>. 2014). Los estudios   se  han enfocado en general a bacterias cultivables, generando   hip&oacute;tesis  que abordan relaciones coevolutivas entre los microoganismos  asociados a las hormigas y sus microhabitas.   Se  han reportado bacterias filamentosas (actinomicetos)   productoras  de antibi&oacute;ticos que suprimen el crecimiento de   pat&oacute;genos  como <i>Escovopsis, </i>hallazgos que indican que los   microorganismo  pueden ser componentes claves en la regulaci&oacute;n   de  otras asociaciones simbi&oacute;ticas con organismos superiores   (Haeder <i>et al</i>. 2009; Currie 2001). No obstante, trabajos   por  Riesenfeld <i>et al. </i>(2004) y Scott <i>et  al</i>. (2010) ponen en   evidencia  c&oacute;mo la riqueza y diversidad de microorganismos,   supera  en un alto porcentaje a lo evaluado mediante t&eacute;cnicas convencionales.</p>     <p>  A  pesar de los avances que se han dado en el estudio de   los  jardines del hongo, las &aacute;reas de desecho no han recibido   la  misma atenci&oacute;n sin embargo, es importante entender que   estas  c&aacute;maras donde se acumula, material del jard&iacute;n que es   descartado  y de hormigas muertas, podr&iacute;an ser una fuente de   contaminantes  o de pat&oacute;genos para el hormiguero. Las especies   que  construyen las c&aacute;maras de desecho dentro de los nidos   como  es el caso <i>A</i>. <i>cephalotes </i>se protegen de una posible   fuente  de infecci&oacute;n para la colonia con el manejo adecuado   de  residuos. Algunos de los trabajos que se han desarrollado,   muestran  propiedades antibacterianas de microorganismos   presentes  en el material de desecho (Lacerda <i>et  al</i>. 2010) adem&aacute;s,   para  la casta que trasporta los desechos en <i>A</i>. <i>cephalotes</i>   se  han asociado especies de la familia <i>Enterobacteriaceae</i>,   especialmente  a <i>P</i>. <i>aeruginosa </i>(Giraldo 2009). En el &aacute;rea de   desechos  de nidos artificiales de <i>A</i>. <i>cephalotes </i>el trabajo de   V&eacute;lez  (2008) reporta los asilados de especies <i>Serratia  marcenses,</i> <i>Eschericha coli, </i>y <i>Klebsiella </i>sp. como dominantes.  Scott <i>et al</i>. (2010) reportan diferencias entre las comunidades   bacterianas  de jardines comparados con &aacute;reas de desecho, las   primeras  se caracterizan por bacterias Gram negativas principalmente   Proteobacterias  y Bacteroidetes, mientras que en   las  segundas las bacterias dominantes son Grampositivas y bacterias  anaerobias.</p>     <p>  El  objetivo de este estudio fue analizar la comunidad bacteriana   asociada  a tres &aacute;reas de desecho de las hormigas cortadoras   de  hojas <i>A. cephalotes </i>en nidos artificiales<i>, </i>usando m&eacute;todos   dependientes  e independientes de cultivo incluyendo la   amplificaci&oacute;n  del gen ADNr 16S, los perfiles de electroforesis   en  gel de gradiente desnaturalizante (DGGE), que permite   la  detecci&oacute;n de las comunidades bacterianas predominantes   y  el an&aacute;lisis filogen&eacute;tico de las secuencias encontradas. El   presente  art&iacute;culo es el primer an&aacute;lisis molecular de la comunidad   microbiana  asociada a los dep&oacute;sitos de las hormigas,   un  mejor conocimiento de las poblaciones bacterianas podr&iacute;a   ayudar  para la formulaci&oacute;n y uso de los desechos como abonos   naturales,  siendo necesaria mayor investigaci&oacute;n para evidenciar su  funci&oacute;n y su posible aplicaci&oacute;n.</p>     <p> <b>Materiales y m&eacute;todos</b></p>     <p><b>Dise&ntilde;o experimental. </b>Las muestras del &aacute;rea de desecho se   procesaron  usando t&eacute;cnicas de cultivo-independiente y dependiente.   Las  t&eacute;cnicas de cultivo-independiente (an&aacute;lisis   molecular)  est&aacute;n basadas en el gen 16S rRNA y se utilizan   para  el an&aacute;lisis de la estructura microbiana, proporcionando   informaci&oacute;n  de los grupos microbianos dominantes, las t&eacute;cnicas   cultivo  dependiente (an&aacute;lisis microbiol&oacute;gico) se utilizaron   como  estrategia para el aislamiento y la identificaci&oacute;n de las  bacterias presentes.</p>     <p><b>Colecci&oacute;n de muestras. </b>Se colectaron ocho muestras del   &aacute;rea  de desecho de tres hormigueros en nidos artificiales, provenientes   del  Municipio de Barbosa, Antioquia. Las colonias   se  establecieron y mantuvieron en el terrario del Laboratorio   de  Insectos y Biotecnolog&iacute;a en la Universidad Nacional   de  Colombia, sede Medell&iacute;n. Los muestreos se realizaron en   condiciones  del laboratorio entre 23 &deg;C y 50 &#37; de humedad y   cuando  hab&iacute;a una acumulaci&oacute;n en el &aacute;rea de desecho de ocho   d&iacute;as  siendo esta la muestra cero (d&iacute;a 0) y la segunda muestra   a  los 15 d&iacute;as posteriores a la primer toma (d&iacute;a 15). Seis   muestras  individuales se colectaron de los tres hormigueros   (1H0-1H15,  2H0-2H15 y 3H0-3H15) y dos muestras adicionales   de  la mezcla para cada d&iacute;a de muestreo (M0 y M15)   como  se describen en la figura 1. Las mezclas (M0 y M15) se  realizaron para permitir un procesamiento homog&eacute;neo de la  fracci&oacute;n cultivable en cada tiempo y medio analizado. Las   muestras  se guardaron en bolsas con cierre herm&eacute;tico a 4 &deg;C y  se procesaron en el laboratorio.</p>     <p>   <b>An&aacute;lisis molecular</b></p>     <p><b>Extracci&oacute;n de ADN. </b>Fue extra&iacute;do del &aacute;rea de desecho (0,25   g)  utilizando el kit comercial Power Soil (Laboratorios MOBIO   California,  EEUU) siguiendo las instrucciones del fabricante.   Las  muestras se maceraron previamente con nitr&oacute;geno   l&iacute;quido  y el ADN total extra&iacute;do directamente del &aacute;rea de desecho   de  cada hormiguero fue nombrado como fracci&oacute;n total   (FT).</p>     <p><b>Amplificaci&oacute;n por PCR-DGGE. </b>La regi&oacute;n variable V3-V5   del  gen RNAr 16S, fue amplificada para obtener los perfiles   de  las comunidades bacterianas presentes en las diferentes   &aacute;reas  de desechos de los hormigueros. El ADN gen&oacute;mico obtenido   de  la fracci&oacute;n total (FT) fue amplificado por PCR para   obtener  un fragmento de 566 pb usando los cebadores universales   341F  (5&#39; -CCT ACG GGA GGC AGC AG-3&#39; con una   terminaci&oacute;n  extra de G-C en el extremo 5&#39;) y 907R (5&#39;- CCC   CGT  CAA TTC ATT TGA GTT Y- 3&#39;) como lo describen   Muyzer <i>et al. </i>(1993) y Romero y Navarrete (2006). La reacci&oacute;n   de  PCR fue hecha como lo detalla Romero y Navarrete,   (2006)  con una mezcla de reacci&oacute;n 30 ul que conten&iacute;a 0,2   mM  de cada deoxinucleotido trifosfato, 0,05 U/ml de ADN   polimerasa  Taq (Fermentas, USA), buffer de reacci&oacute;n 1X,   MgCl2 2 mM, y de cada cebador 0,25 pmol/ml.  Los amplicones   obtenidos  se evaluaron en geles de poliacrilamida al   6  &#37; con gradiente qu&iacute;mico 30-60 &#37; urea y formamida. Las condiciones de corrido  (60 &deg;C y 85 V) se mantuvieron constantes   durante  15 h (Romero y Navarrete 2006). Luego de la   electroforesis  el gel fue te&ntilde;ido con nitrato de plata (AgNO3)   (Espejo  y Escanilla 1993) las bandas dominantes se escindieron   para  reamplificar el ADN y enviarlo a secuenciar.</p>     <p><b>An&aacute;lisis de perfiles  electrofor&eacute;ticos. </b>Los patrones de bandeo   se  analizaron por medio del software Gel Compare II   (Applied  Maths Biosystem, B&eacute;lgica) (Rademaker y De Bruijn,   2004)  usando las correlaciones de Pearson y Complete   Linkage  (Koeppel <i>et al. </i>2008) para establecer las diferencias   en  la diversidad y abundancia de los perfiles de las poblaciones   bacterianas  entre las muestras analizadas.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Secuenciaci&oacute;n. </b>Las bandas de inter&eacute;s de los geles del PCRDGGE   se  cortaron y eluyeron mediante el protocolo descrito   por  Sambrook (2001). Posteriormente la soluci&oacute;n del ADN (5   Î¼l)  se reamplific&oacute; con los cebadores 341F y 907R, sin el extremo   de  GC. Los amplicones seleccionados se secuenciaron   en  ambas direcciones usando el analizador de ADN PRISM   3700  (Applied Biosystems) y los resultados obtenidos se editaron   con  en el software Bioedit (Hall 1999) y se compararon   con  secuencias de referencias identificadas previamente   usando  la herramienta del BLAST (Altschul <i>et  al. </i>1997) y de las  bases de datos del GenBank y Ribosoma Database Project   II  (RDP II) (Cole <i>et al. </i>2005)</p>     <p>   <b>An&aacute;lisis filogen&eacute;ticos. </b>Las secuencias editadas se utilizaron   para  construir las matrices de distancia y se corrigieron por   el  an&aacute;lisis de sustituci&oacute;n nucleotidica Jukes Cantor incluidos   en  el programa del Software MEGA 5 version 5.05 (Tamura   <i>et al</i>. 2011). Usando, el mismo programa fue construido   un  &aacute;rbol filogen&eacute;tico, con el m&eacute;todo de &quot;neighbor-joining&quot;.   El  &quot;boostrapping&quot;   fue  realizado con 1.000 r&eacute;plicas y son reportados   los  valores superiores al 40 &#37;. Las secuencias se   depositaron  en el GenBank (n&uacute;meros de acceso: KC800898-   KC800913).</p>     <p><b>An&aacute;lisis microbiol&oacute;gico</b></p>     <p><b>Medios de cultivo. </b>Los an&aacute;lisis microbiol&oacute;gicos de las seis   muestras  de los d&iacute;as 0 y 15 se procesaron inmediatamente   mientras,  las mezclas (M0 y M15) del &aacute;rea de desecho de los   hormigueros  se conservaron a -20 &deg;C hasta su procesamiento   luego  de los 15 d&iacute;as. Las muestras se inocularon al 0,01 &#37;   (w/v)  en el medio LB (Luria Bertani), realizando diluciones   seriadas  hasta una concentraci&oacute;n de 1010 veces. Las siembras   se  hicieron en dos medios de cultivo diferentes, medio SEGYEA   (MS)  preparado como lo indica (Atlas y Philip 2005)   y  el medio Luria Bertani (M3), suplementado al 1 &#37; con el   extracto  del &aacute;rea de desecho de los hormigueros de <i>A. cephalotes</i>.</p>     <p><b>Aislamiento y caracterizaci&oacute;n. </b>Las muestras inoculadas por   duplicado  en los medios anteriormente descritos se incubaron   a  33 &plusmn; 1 &deg;C durante 4 d&iacute;as. Luego de la incubaci&oacute;n se registr&oacute;   el  n&uacute;mero de unidades formadoras de colonias por gramo   (UFC/g).  El total de las UFC crecidas en el medio de cultivo   se  homogeniz&oacute; en soluci&oacute;n salina y fue usado como la fracci&oacute;n   cultivable  (FC), correspondiente al total de colonias crecidas   en  los medios empleados (M3 y MS), este homogenado   fue  empleado para aislamiento de ADN y an&aacute;lisis molecular.   Adem&aacute;s,  se seleccionaron las colonias m&aacute;s predominantes   para  ser purificadas por agotamiento en el medio M3. Los   aislados  seleccionados se caracterizaron macrosc&oacute;picamente   por  morfolog&iacute;a de la colonia y microsc&oacute;picamente por coloraci&oacute;n   de  Gram. Las colonias purificadas se conservaron por   duplicado  en glicerol al 20 &#37; y se almacenaron a -80 ÂºC hasta   su  identificaci&oacute;n molecular.</p>     <p><b>Extracci&oacute;n de ADN de colonia. </b>El ADN de los aislados y el   ADN  obtenido de los homogenizados de las colonias crecidas   sobre  los medios M3 y MS, correspondiente a la fracci&oacute;n cultivable   (FC),  se logr&oacute; obtener empleando el kit UltraClean&reg;   Microbial  ADN Isolation (laboratorios MOBIO) siguiendo   las  instrucciones del fabricante. Las al&iacute;cuotas finales de ADN   se  cuantificaron usando el NanoDrop 2000/2000c (Thermo   Scientific).</p>     <p><b>Amplificaci&oacute;n por PCR. </b>Para la amplificaci&oacute;n del gen ARNr  16S de los aislados, se emplearon los cebadores universales   27F  (5&#39; -AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG- 3&#39;) y   1492R  (5&#39;-GGT TAC CTT GTT ACG ACT T- 3&#39;) (Garcia <i>et</i>   <i>al. </i>2016). Adem&aacute;s, para evaluar las poblaciones bacterianas   predominantes  de la fracci&oacute;n cultivable (FC) se us&oacute; la reacci&oacute;n   de  PCR-DGGE, en las condiciones de amplificaci&oacute;n,   corrida,  tinci&oacute;n y an&aacute;lisis de perfiles previamente descritas para  el an&aacute;lisis molecular de la fracci&oacute;n total (FT).</p>     <p><b>Secuenciaci&oacute;n. </b>Las bandas de inter&eacute;s de los perfiles de las   muestras  MS y M3 generados por los barridos bacterianos   o  fracci&oacute;n cultivable (FC), se escindieron y eluyeron del gel   mediante  el protocolo descrito por Sambrook (2001). Posteriormente   los  fragmentos se reamplificaron con los cebadores   341F  y 907R con el fin de verificar los productos de   PCR  obtenidos. Los amplicones se secuenciaron usando el   analizador  de ADN ABI PRISM 3700 (Applied Biosystems)   y  las secuencias obtenidas se editaron y analizaron como se describe  para la fracci&oacute;n total (FT).</p>     <p><b>Resultados</b></p>     <p>  Los  resultados describen el an&aacute;lisis de los perfiles de DGGE   de  los fragmentos amplificados del ADNr 16S bacteriano y   de  los aislados obtenidos de las muestras de la fracci&oacute;n del   ADN  total (FT) de las &aacute;reas de desecho de los hormigueros   analizados  (1H, 2H, 3H, M0 y M15) para los tiempos 0 y 15 d&iacute;as  y de la fracci&oacute;n cultivable (FC) (M3 y MS).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Composici&oacute;n de la comunidad  bacteriana por PCRDGGE</b>   <b>de la fracci&oacute;n del ADN total (FT). </b>Los perfiles de   las  bandas del DGGE mostraron la presencia de varios posibles   filotipos  bacterianos de las diferentes &aacute;reas de desecho   de  los hormigueros examinados <a href="#fig1">(Fig. 1)</a> Los patrones   de  bandeo analizados por medio del software Gel Compare   II  revelaron la formaci&oacute;n de dos &quot;cl&uacute;steres&quot; (agrupamientos)   para  las muestras de la FT <a href="#fig2">(Fig. 2A)</a>; en el I se agrupan con un   porcentaje  de similitud superior del 50 &#37; los perfiles de las   muestras  del hormiguero tres (3H0-3H15), las mezclas M0   y  M15 en el II se agrupan las muestras de los otros dos hormigueros   (1H0,  1H15 y 2H0) la muestra del 2H15 presenta   diferencias  superiores al 70 &#37; con respecto a los dos grupos   anteriores;  sugiriendo la presencia de diferentes poblaciones bacterianas  en cada grupo.</p>      <p align="center"><a name="fig1"></a> <img src="img/revistas/rcen/v42n2/v42n2a09fig1.jpg"></p>     <p align="center"><a name="fig2"></a> <img src="img/revistas/rcen/v42n2/v42n2a09fig2.jpg"></p>      <p>  Las  bandas m&aacute;s intensas detectadas en los geles del   DGGE,  las cuales indicaban las poblaciones m&aacute;s abundantes en cada muestra se escindieron  y la secuencia parcial   del  ADNr 16S de aproximadamente 500 bases se obtuvo   directamente  del reamplificado de las bandas. Estas secuencias   se  compararon con las secuencias disponibles en los   bancos  de secuencias <a href="#tab1">(Tabla 1)</a> y las afiliaciones filogen&eacute;ticas   se  muestran en la  <a href="#fig3">figura 3.</a> Nuestros resultados identificaron   a <i>Ralstonia </i>sp. KC800898 - KC800899 (bandas 1-2),   <i>Burkholderia </i>sp. KC800900 - KC800902 (bandas 3-5) y a   <i>Bacillus </i>sp. KC800906 y KC800904 (bandas 9 y 11). Adem&aacute;s,   las  muestras de las mezclas de los hormigueros (M0 y   M15)  mostraron la presencia de bandas d&eacute;biles (banda 7-8)   con  una secuencia relacionada con bacterias que no se han cultivado  hasta el momento KC800914- KC800915, respectivamente.</p>       <p align="center"><a name="tab1"></a> <img src="img/revistas/rcen/v42n2/v42n2a09tab1.jpg"></p>      <p align="center"><a name="fig3"></a> <img src="img/revistas/rcen/v42n2/v42n2a09fig3.jpg"></p>       <p><b>Composici&oacute;n de la comunidad de  bacterias por an&aacute;lisis</b>   <b>dependiente de cultivo. </b>Bajo las condiciones empleadas   y  transcurrido cada tiempo de maduraci&oacute;n de cultivo, se   procesaron  las muestras con el fin de obtener recuento de   poblaciones  de microorganismos presentes en los desechos,   obteniendo  un promedio de 9x106 UFC/g  (unidades formadoras   de  colonia por gramo, en el medio M3). Los perfiles   de  las bandas del DGGE de las muestras procedentes de la   fracci&oacute;n  cultivable (FC), mostraron la presencia de varios   filotipos  <a href="#fig1">(Fig. 1)</a> Los patrones de bandeo se compararon   con  algunos aislados predominantes en los cultivos (C1-C8)   y  con las muestras procedentes de las mezclas de la fracci&oacute;n   total  (M0 y M15), los resultados indicaron diferencias entre   los  grupos presentes en el dendograma de la fracci&oacute;n total   (FT)  y la fracci&oacute;n cultivable (FC) luego del an&aacute;lisis con el   software  Gel Compare II <a href="#fig2">(Fig. 2B)</a> Las bandas (6,10, 12,   13,  y 14) obtenidas de los geles del PCR- DGGE de las   muestras  de la FC de las &aacute;reas de desecho de los hormigueros   (MS  y M3) <a href="#fig1">(Fig. 1)</a>, se seleccionaron para ser identificadas   por  secuenciaci&oacute;n, los resultados de la identidad de las   bandas  y de los aislados seleccionados y caracterizados se muestran  en la <a href="#tab1">Tabla 1</a>.</p>     <p>  Las  bacterias aerobias predominantes pertenecen a <i>Bacillus</i>   (bandas  10-12), aunque tambi&eacute;n se identificaron otros   dos  g&eacute;neros bacterianos <i>Myroides </i>KC800897 (banda 6) y   <i>Enterobacter </i>KC800907- KC800908 (bandas 13-14). Adem&aacute;s,   los  aislados a partir del cultivo identificados por secuenciaci&oacute;n   del  ADNr 16S se agruparon con las especies   de <i>Alcaligenes faecalis </i>con un porcentaje de identidad del   99 &#37;  (CP2HTA-KC800910), <i>Staphylococcus </i>sp. (95 &#37;)   (CP3HTA-KC800909), <i>Brevibacterium </i>sp. (97 &#37;) (CP6HTAKC800911)   y <i>Serratia </i>sp. (98 &#37;) (CP8HTA-KC800913 y   CP7HTA-KC800912).  Las afiliaciones filogen&eacute;ticas de las secuencias  analizadas se muestran en la <a href="#fig3">figura 3</a>.</p>     <p><b>Discusi&oacute;n</b></p>     <p>  El  presente estudio es uno de los primeros en evaluar la composici&oacute;n   microbiana  asociada a la c&aacute;mara de desechos de   colonias  de hormigas <i>A. cephalotes </i>en condiciones de laboratorio,   utilizando  el an&aacute;lisis del DGGE y de las secuencias   del  ADNr 16S para identificar filotipos bacterianos. Las secuencias   de  los fragmentos del gen ribosomal 16S se compararon   con  la base de datos del GenBank y el an&aacute;lisis mostr&oacute; homolog&iacute;a  con las secuencias de especies que pertenecen a los  fila Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes y Actinobacteria   dentro  de los cuales se encuentran <i>Burkholderia </i>sp.,   <i>Ralstonia </i>sp., <i>Serratia </i>sp., <i>Enterobacter </i>sp., <i>Alcaligenes faecalis,</i>   <i>Bacillus </i>sp., <i>Staphylococcus </i>sp., <i>Myroides </i>sp.  y <i>Brevibacterium</i> sp.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>  De  acuerdo con el an&aacute;lisis molecular de los perfiles de   electroforesis  en gel de gradiente desnaturalizante (PCRDGGE)   de  las tres &aacute;reas de desecho de <i>A.  cephalotes</i>, se encontraron   diferencias  en las comunidades bacterianas presentes   en  la fracci&oacute;n cultivable (FC, ADN obtenido despu&eacute;s del   cultivo)  y en la fracci&oacute;n total (FT, ADN extra&iacute;do directamen-   <a href="#tab1">Tabla 1</a>. An&aacute;lisis  de las secuencias del ADNr 16S obtenidas de las bandas del DGGE y de los aislados  bacterianos de las muestras de las &aacute;reas de   desechos  de los hormigueros, con la secuencia conocida de la base de datos del RDP II y  Genbank<b>.</b>   te  del &aacute;rea de desecho). El enfoque de cultivar las bacterias   antes  de la identificaci&oacute;n, puede haber introducido un sesgo   desconocido  en el muestreo al no considerar las bacterias que   no  se han cultivado. Sin embargo, en la fracci&oacute;n total se encontraron   similitudes  superiores al 60 &#37; entre los perfiles de   los  tiempos (0 y 15 d&iacute;as) para dos de las &aacute;reas de desecho (1H   y  3H), que representa una comunidad muy relacionada al ser   las  muestras de los nidos artificiales. Es importante destacar   que  el material de la c&aacute;mara de desecho est&aacute; sometido a procesos   de  descomposici&oacute;n de hormigas muertas y del suelo   presente  y donde la comunidad microbiana est&aacute; involucrada en  estos procesos.</p>     <p>  Los  filotipos encontrados en este estudio han sido reportados   en  diferentes &oacute;rdenes de insectos, entre los que se encuentran   <i>Periplaneta americana </i>L., 1758 (Fang <i>et  al. </i>2013),   <i>Solenopsis invicta </i>Buren, 1972 (hormiga roja) (Lee <i>et al.</i>   2008),  escarabajos xil&oacute;fagos (Cardoza <i>et  al. </i>2009) y en <i>Atta</i>   <i>sexdens </i>L., 1758 (Van Borm <i>et  al. </i>2002). Lo que sugiere una   microbiota  facultativa que se encuentra en el entorno local   de  los insectos y que podr&iacute;a estar relacionada con procesos   de  nutrici&oacute;n (Stoll <i>et al. </i>2007; Lam <i>et  al. </i>2009; Chavshin <i>et</i>   <i>al. </i>2012; Colman <i>et  al. </i>2012; Aylward <i>et al. </i>2013b), sistema   inmune  del insecto (Jaffe <i>et al. </i>2001; Cardoza <i>et  al. </i>2009),   protecci&oacute;n  de los jardines (Little <i>et  al. </i>2006) o comunicaci&oacute;n   mediada  por compuestos vol&aacute;tiles emitidos por las bacterias   y  utilizados como se&ntilde;alizaci&oacute;n por parte de los insectos (Lam<i>et al. </i>2009, Davis <i>et  al. </i>2013). A nivel de las &aacute;reas de desecho   los  resultados concuerda con el trabajo reportado por Scott   <i>et al</i>. (2010), donde predominan bacterias que pertenecen a   los  fila Proteobacterias y Firmicutes y destaca en los dep&oacute;sitos   la  presencia de bacterias Gram-positiva y anaerobias. La   funci&oacute;n  de la microbiota asociada posiblemente est&eacute; relacionada   con  procesos de degradaci&oacute;n de compuestos complejos,   como  la lignina que no son utilizados en los jardines. Adem&aacute;s,   podr&iacute;a  estar relacionada con procesos de detoxificaci&oacute;n   del  material org&aacute;nico y convertir este sustrato en elementos   ricos  en nutrientes aprovechables por otros organismos y de esta  forma ser reutilizados.</p>     <p>  Los  g&eacute;neros encontrados en las &aacute;reas de desecho, coinciden   con  reportes realizados por diferentes investigadores que   buscan  consorcios bacterianos para biorremediaci&oacute;n de suelos   o  aceleraci&oacute;n de los procesos de compostaje. Chaudhary <i>et al.</i>   (2015)  reportan un consorcio bacteriano (conformado por <i>Acinetobacter</i>,   <i>Brevibacterium</i>, <i>Serratia </i>y <i>Streptomyces</i>) efectivo   en  la degradaci&oacute;n de hidrocarburo arom&aacute;tico polic&iacute;clico (HAP)   este  compuesto es un contaminante del suelo y se origina del   petr&oacute;leo  y del carb&oacute;n. En procesos de compostaje a partir de   residuos  de caf&eacute;, V&aacute;squez de D&iacute;az <i>et  al. </i>(2010) citan ocho cepas   que  estar&iacute;an participando en el proceso de degradaci&oacute;n del   material  vegetal <i>Pseudomonas aeruginosa,  Citrobacter koseri,</i>   <i>Bacillus </i>spp<i>., Escherichia coli,  Stenotrophomona maltophilia,</i> <i>Cromobacterium </i>spp<i>. </i>y <i>Pseudomonas </i>spp.</p>     <p>  El  trabajo realizado por Anderson <i>et  al. </i>(1993), se&ntilde;ala a   <i>Alcaligenes faecalis </i>como un microorganismo heterotr&oacute;fico   encontrado  com&uacute;nmente en suelos y aguas, responsable de la   mayor  emisi&oacute;n de gases de nitr&oacute;geno en suelos anaerobios,   se  ha reportado participando significativamente en procesos   de  nitrificaci&oacute;n, desnitrificaci&oacute;n y en la fijaci&oacute;n de nitr&oacute;geno,   procesos  importantes para la descomposici&oacute;n de materia org&aacute;nica   y  fertilidad del suelo. Por otra parte, esta especie (<i>A</i>.   <i>faecalis </i>JBW4) ha sido reportada con actividad para degradar   residuos  de endosulf&aacute;n (organoclorado) utilizado en la agricultura   y  prohibido en muchos pa&iacute;ses por su alta toxicidad   y  su alto potencial de bioacumulaci&oacute;n y contaminaci&oacute;n ambiental (Kong <i>et al. </i>2013)</p>     <p>  La  identificaci&oacute;n de las secuencias con similitud al g&eacute;nero   <i>Bacillus </i>en las muestras de la fracci&oacute;n total y la fracci&oacute;n   cultivable  <a href="#tab1">(Tabla 1)</a> es notable. Estas bacterias intervienen en   los  ciclos del carbono y nitr&oacute;geno, adem&aacute;s, poseen la capacidad   de  degradar polisac&aacute;ridos como almid&oacute;n, pectina, celulosa,   hemicelulosa  y lignina componentes principales del   material  vegetal recolectado por las hormigas cortadoras de   hojas  (Scott <i>et al. </i>2010; Cariello <i>et  al. </i>2007). La presencia de   <i>Enterobacter </i>sp. coincide con el trabajo de Giraldo (2009)   donde  reporta la presencia de forma persistente y dominante   asociada  a diferentes castas, como aquella que realiza las labores   en  la c&aacute;mara de desechos, esta bacteria junto a <i>Klebsiella</i>   y <i>Pantoea </i>como simbiontes de las hormigas cultivadoras   de  hongos, podr&iacute;an participar en la conversi&oacute;n de la biomasa   de  origen vegetal a energ&iacute;a utilizable (Aylward <i>et al</i>.  2012b),   pero  la alta presencia de <i>Enterobacter </i>en las &aacute;reas de desecho   no  ha sido estudiada. <i>E</i>. <i>cloacae </i>y <i>Burkholderia </i>sp. han sido   reportadas  por su capacidad de degradar herbicidas (Ngigi <i>et</i>   <i>al</i>. 2012), lo que podr&iacute;a sugerir que en las &aacute;reas de desecho   no  solo se genera un ambiente que propicia que el material org&aacute;nico  que no es utilizado por las hormigas se convierta en abono,  sino que posiblemente algunas de las bacterias asociadas   ayuden  a la descontaminaci&oacute;n del material de desecho que  podr&iacute;a estar contaminados con productos agroqu&iacute;micos.</p>     <p>   Dentro  de la gran familia de bacterias asociadas a los desechos   de <i>A. cephalotes, </i>se encuentra el g&eacute;nero <i>Myroides </i>sp.   (KC800897)  perteneciente al filum Bacteroidetes<i>, </i>se conoce   que  los miembros de este filum est&aacute;n presentes en la naturaleza   y  que com&uacute;nmente son aislados del suelo, desempe&ntilde;ando   labores  de oxigenaci&oacute;n. No obstante, son tambi&eacute;n encontrados   en  sedimentos, aguas dulces y ecosistemas marinos   (Yoon <i>et al. </i>2006). Esta investigaci&oacute;n identific&oacute; este g&eacute;nero   predominante  en la fracci&oacute;n cultivable y muy relacionada con   las  secuencias encontradas en la FT del filum Bacteroidetes   (KC800914-KC800915),  los cuales pueden estar relacionado   con  procesos de nutrici&oacute;n en las hormigas, con acci&oacute;n antibacteriana   y  de resistencia a m&uacute;ltiples f&aacute;rmacos en los nidos   y  en las &aacute;reas de desecho. En el trabajo realizados por Jaffe <i>et</i>   <i>al. </i>(2001) aislaron del intestino de <i>S</i>. <i>invicta </i>varias especies   de  bacterias representadas en los g&eacute;neros <i>Myroides</i>, <i>Brevibacterium,</i>   <i>Sphingobacterium, Alcaligenes,  Stenotrophomonas,</i>   entre  otras y las relacionaron con la posible funci&oacute;n de   proporcionar  nutrientes a las hormigas al estar implicadas en   la  s&iacute;ntesis de amino&aacute;cidos a partir de fuentes ricas en carbohidratos   y  nitratos. Adem&aacute;s, <i>Myroides odoratimimus </i>aislado de   moscas  adultas se ha reportado con actividad antibacteriana e   inhibiendo  el crecimiento de bacterias procedentes de muestras   cl&iacute;nicas,  del ambientales y de otros insectos (Dharne <i>et</i> <i>al. </i>2008)</p>     <p>   Una  observaci&oacute;n notable fue la aparente abundancia de   <i>Burkholderia </i>sp. en las muestra evaluadas en el tiempo cero   (1H0,  2H0 y M0) <a href="#tab1">(Tabla 1)</a>. La asociaci&oacute;n de <i>Burkholderia</i>   sp.  tambi&eacute;n se ha encontrado en un an&aacute;lisis del jard&iacute;n del hongo   cultivado  por <i>Atta sexdens rubropilosa</i>, mostrando una alta   actividad  antimic&oacute;tica contra los hongos entomopat&oacute;genos   <i>Beauveria bassiana</i>, <i>Metarhizium anisoplae</i>, al hongo sapr&oacute;fito   <i>Verticillium lecanii </i>y al par&aacute;sito y principal enemigo del   hongo  simbionte <i>Escovopsis weberi </i>(Santos <i>et  al. </i>2004). No   es  extra&ntilde;o encontrar en la c&aacute;mara de desecho algunas especies   pertenecientes  a este g&eacute;nero, teniendo en cuenta que los niveles   de  contaminaci&oacute;n deben ser altos, especialmente hongos   par&aacute;sitos  y entomopat&oacute;genos; las hormigas encargadas de realizar   labores  de descarte posiblemente est&eacute;n asociadas a bacterias   con  actividad antimic&oacute;tica para su protecci&oacute;n. Otras de las   especies  aisladas que podr&iacute;a estar relacionada con la protecci&oacute;n   de  la colonia, pertenece al g&eacute;nero <i>Serratia </i>(KC800912-   KC800913)  diferentes autores han reportado especies de este   g&eacute;nero  con actividad antibi&oacute;tica y antimic&oacute;tica (O&rsquo;Callaghan   <i>et al. </i>1996; McNeill <i>et  al. </i>2000; Osborn <i>et al. </i>2002; Li <i>et  al.</i>   2005;  Ince <i>et al. </i>2008; Lee <i>et  al. </i>2008; Giraldo 2009; Cardoza   <i>et al. </i>2009), aunque tambi&eacute;n se ha reportado algunas especies como  entomopat&oacute;genas (O&rsquo;Callaghan <i>et  al. </i>1996).</p>     <p>  El  enfoque de la ecolog&iacute;a microbiana molecular se ha   traducido  en un aumento de la comprensi&oacute;n de las relaciones   de  los insectos con los microorganismos y su asociaci&oacute;n   en  diversos ambientes est&aacute; ganando mayor reconocimiento   (Dillon  y Dillon 2004). De particular relevancia es la hip&oacute;tesis   sobre  las bacterias residentes en el &aacute;rea de desecho de las   hormigas  que podr&iacute;an prevenir el desarrollo de pat&oacute;genos   por  su actividad antimicrobiana, participar en la degradaci&oacute;n   de  materia org&aacute;nica o como promotores de crecimiento   de  plantas ya sea directa o indirectamente. Farji-Brener   y  Medina (2000) y Farji-Brener y Werenkraut (2014) han   revelado  la importancia de estas &aacute;reas de desechos frente   a  la composici&oacute;n de semillas y ra&iacute;ces finas en suelos cerca   de  nidos de hormigas de las especie <i>A</i>. <i>cephalotes </i>y <i>A</i>.   <i>colombica</i>. Esto debido a que el suelo de los nidos y especialmente  las &aacute;reas de desecho son una fuente de nutrientes   que  favorece el crecimiento de las plantas. Tambi&eacute;n, se ha   demostrado  que las plantas adquieren macronutrientes acumulados   en  los nidos de hormigas cortadoras, como el calcio,   que  es un macronutriente limitado en bosques tropicales   y  sabanas, as&iacute; que las &aacute;reas de desechos no solo permiten   concentrar  nutrientes para las plantas sino que favorecen la   distribuci&oacute;n  de macronutrientes a trav&eacute;s de extensas &aacute;reas (Sternberg <i>et al</i>. 2007).</p>     <p>  Nuestro  trabajo revela la composici&oacute;n bacterina asociada   a  la c&aacute;mara de desechos de colonias de hormigas <i>A. cephalotes</i>   en  condiciones de laboratorio y sugiere que las comunidades   residentes  est&aacute;n determinadas por la degradaci&oacute;n de   residuos  de la planta y de las hormigas, se podr&iacute;a recomendar   de  acuerdo a la presencia de los g&eacute;neros encontrados, su   potencial  para ser usado como abono para las plantas, sin   embargo  es necesario mayor investigaci&oacute;n para dilucidar la funci&oacute;n  que pueden estar desempe&ntilde;ando. </p>      <p>   <b>Agradecimientos</b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>   Universidad  Nacional de Colombia, proyecto DIME    20101008797.</p>     <p><b>Literatura citada</b></p>     <!-- ref --><p>  ALTSCHUL,  S. F.; MADDEN, T. L.; SCH&Auml;FFER, A. A.; ZHANG,   J.;  ZHANG, Z.; MILLER, W.; LIPMAN, D. J. 1997. Gapped   BLAST  and PSI-BLAST: a new generation of protein database search  programs. Nucleic Acids Research 25: 3389-3402.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614471&pid=S0120-0488201600020000900001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>   ATLAS,  R. M. 2005. Handbook of Media for Environmental Microbiology. Second  Edition. 510 p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614473&pid=S0120-0488201600020000900002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  ANDERSON,  I. C.; POTH, M.; HOMSTEAD, J.; BURDIGE, D.   1993.  A comparison of NO and N2O  production by the autotrophic   nitrifier <i>Nitrosomonas europaea </i>and the heterotrophic   nitrifier <i>Alcaligenes faecalis</i>. Applied and Environmental Microbiology 59:  3525-33.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614475&pid=S0120-0488201600020000900003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>   AYLWARD,  F. O.; BURNUM, K. E.; SCOTT, J. J.; SUEN, G.;   TRINGE,  S. G.; ADAMS, S. M.; BARRY, K. W.; NICORA, C.   D.;  PIEHOWSKI, P. D.; PURVINE, S. O.; STARRETT, G. J.;   GOODWIN,  L. A.; SMITH R. D.; LIPTON, M. S.; CURRIE, C.   R.  2012(a). Metagenomic and metaproteomic insights into bacterial   communities  in leaf-cutter ant fungus gardens. The ISME Journal  6 (9): 1688-701.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614477&pid=S0120-0488201600020000900004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  AYLWARD,  F. O.; CURRIE, C. R.; SUEN, G. 2012(b). The evolutionary   innovation  of nutritional symbioses in leaf-cutter ants. Insects  3 (1): 41-61.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614479&pid=S0120-0488201600020000900005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  AYLWARD,  F. O.; BURNUM-JOHNSON, K. E.; TRINGE, S. G.;   TEILING,  C.; TREMMEL, D. M.; MOELLER, J. A.; SCOTT,   J.  J.; BARRY, K. W.; PIEHOWSKI, P. D.; NICORA, C.   D.;  MALFATTI, S. A.; MONROE, M. E.; PURVINE, S. O.;   GOODWIN,  L. A.; SMITH, R. D.; WEINSTOCK, G. M.; GERARDO,   N.  M.; SUEN, G.; LIPTON, M. S.; CURRIE, C. R.   2013(a). <i>Leucoagaricus gongylophorus </i>produces diverse enzymes   for  the degradation of recalcitrant plant polymers in leafcutter   ant  fungus gardens. Applied Environmental Microbiology 79:  3770-3778.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614481&pid=S0120-0488201600020000900006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  AYLWARD,  F. O.; TREMMEL, D. M.; BRUCE, D. C.; CHAIN, P.;   CHEN,  A.; WALSTON DAVENPORT, K.; DETTER, C.; HAN,   C.  S.; HAN, J.; HUNTEMANN, M.; IVANOVA, N. N.; KYRPIDES,   N.  C.; MARKOWITZ, V.; MAVROMMATIS, K.; NOLAN,   M.;  PAGANI, I.; PATI, A.; PITLUCK, S.; DESHPANDE,   S.;  GOODWIN, L.; WOYKE, T.; CURRIE, C. R.; 2013(b).   Complete  genome of Enterobacteriaceae bacterium strain FGI   57,  a strain associated with leaf-cutter ant fungus gardens. Genome Annoucements  1 (1): e00238-12.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614483&pid=S0120-0488201600020000900007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  AYLWARD,  F. O.; KHADEMPOUR, L.; TREMMEL, D. M.;   MCDONALD,  B. R.; NICORA, C. D.; WU, S.; MOORE,   R.  J.; ORTON, D. J.; MONROE, M. E.; PIEHOWSKI, P. D.;   PURVINE,  S. O.; SMITH, R. D.; LIPTON, M. S.; BURNUMJOHNSON,   K.  E.; CURRIE, C. R. 2015. Enrichment and   broad  representation of plant biomass-degrading enzymes in   the  specialized hyphal swellings of <i>Leucoagaricus  gongylophorus</i>,   the  fungal symbiont of leaf-cutter ants. PLoS ONE 10 (9):  e0139151.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614485&pid=S0120-0488201600020000900008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  CARDOZA,  Y.; VASANTHAKUMAR, A.; SUAZO, A.; RAFFA,   K.  2009. Survey and phylogenetic analysis of culturable microbes   in  the oral secretions of three bark beetle species. Entomologia Experimentalis  et Applicata 131: 138-147.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614487&pid=S0120-0488201600020000900009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  CARIELLO,  M. E.; CASTA&Ntilde;EDA, L.; RIOBO, I.; GONZ&Aacute;LEZ,   J.  2007. Endogenous microorganisms inoculant to speed up the   composting  process of urban swage sludge. Revista de la Ciencia del  Suelo y Nutrici&oacute;n Vegetal 7: 26-35.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614489&pid=S0120-0488201600020000900010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  CHAUDHARY,  P.; SAHAY, H.; SHARMA, R.; PANDEY, A. K.;   SINGH,  S. B.; SAXENA, A. K.; NAIN, L. 2015. Identification   and  analysis of polyaromatic hydrocarbons (PAHs)--biodegrading   bacterial  strains from refinery soil of India. Environmental Monitoring  and Assessment 187 (6): 391.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614491&pid=S0120-0488201600020000900011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  CHAVSHIN,  A. R.; OSHAGHI MA FAU - VATANDOOST,   H.;  VATANDOOST H FAU - POURMAND, M. R.; POURMAND   MR  FAU - RAEISI, A.; RAEISI A FAU - ENAYATI,   A.  A.; ENAYATI AA FAU - MARDANI, N.; MARDANI N   FAU  - GHOORCHIAN, S.; GHOORCHIAN, S. 2012. Identification   of  bacterial microflora in the midgut of the larvae   and  adult of wild caught <i>Anopheles stephensi</i>: a step toward   finding  suitable paratransgenesis candidates. Acta Tropica 121:  129-134.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614493&pid=S0120-0488201600020000900012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  COLE,  J. R.; CHAI, B.; FARRIS, R. J.; WANG, Q.; KULAM, S. A.;   MCGARRELL,  D. M.; GARRITY, G. M.; TIEDJE, J. M. 2005.   The  ribosomal database project (RDP-II): sequences and tools   for  high-throughoput rRNA analysis. Nucleic Acids Research 33:  D294-D296.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614495&pid=S0120-0488201600020000900013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  COLMAN,  D. R.; TOOLSON, E. C.; TAKACS-VESBACH, C. D.   2012.  Do diet and taxonomy influence insect gut bacterial communities? Molecular  Ecology 21: 5124-37.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614497&pid=S0120-0488201600020000900014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  COSTA,  A. N.; VASCONCELOS, H. L.; VIEIRA-NETO, E.   H.  M.; BRUNA, E. M. 2009. Do herbivores exert top-down   effects  in Neotropical savannas? Estimates of biomass consumption   by  leaf-cutter ants. Journal of Vegetation Science 19: 849-854.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614499&pid=S0120-0488201600020000900015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  CURRIE,  C. R. 2001. A community of ants, fungi, and bacteria: a   multilateral  approach to studying symbiosis. Annual Review of Microbiology  55: 357-80.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614501&pid=S0120-0488201600020000900016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  CURRIE,  C. R.; STUART, A. E. 2001. Weeding and grooming of   pathogens  in agriculture by ants. Proceedings of the Royal Society B:  Biological Sciences 268:1033-1039.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614503&pid=S0120-0488201600020000900017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  DAVIS,  T. S.; CRIPPEN, T. L.; HOFSTETTER, R. W.; TOMBERLIN,   J.  K. 2013. Microbial volatile emissions as insect semiochemicals. Journal  of Chemical Ecology 39: 840-59.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614505&pid=S0120-0488201600020000900018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  DHARNE,  M. S.; GUPTA, A. K.; RANGREZ, A. Y.; GHATE, H.   V.;  PATOLE, M. S.; SHOUCHE, Y.S. 2008. Antibacterial activities   of  multi drug resistant <i>Myroides odoratimimus </i>bacteria   isolated  from adult flesh flies (Diptera: Sarcophagidae) are independent   of  metallo beta-lactamase gene. Brazilian Journal of Microbiology  39: 397-404.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614507&pid=S0120-0488201600020000900019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  DILLON,  R. J.; DILLON, V. M. 2004. The gut bacteria of insects:   Nonpathogenic  interactions. Annual Review of Entomology 49: 71-92.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614509&pid=S0120-0488201600020000900020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  ESPEJO,  R. T.; ESCANILLA, D. 1993. Detection of HIV1 DNA   by  a simple procedure of polymerase chain reaction, using &quot;primer-   dimer&quot;  formation as an internal control of amplification. Research  in Virology 144: 1611-1617.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614511&pid=S0120-0488201600020000900021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  FANG,  W.; FANG, Z.; LIU, Z.; YUAN, J.; ZHANG, X.; PENG, H.; HONG,  Y.; XIAO, Y. 2013. Phylogenetic analysis of bacterial community in the gut of  American cockroach (<i>Periplaneta americana</i>).  Wei  Sheng Wu Xue Bao 53: 984-94.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614513&pid=S0120-0488201600020000900022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>   FARJI-BRENER,  A. G.; MEDINA, C. A. 2000. The importance of   where  to dump the refuse: seed banks and fine roots in nests of   the  leaf-cutting ants <i>Atta cephalotes </i>and <i>A. colombica</i>. Biotropica 32  (1): 120-126.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614515&pid=S0120-0488201600020000900023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  FARJI-BRENER,  A. G.; WERENKRAUT, V. 2014. A meta-analysis   of  leaf-cutting ant nest effects on soil fertility and plant performance. Ecological  Entomology 40 (2): 150-158.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614517&pid=S0120-0488201600020000900024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  GARC&Iacute;A,  M. G.; M&Aacute;RQUEZ, M. A. G.; MORENO, C. X. H.   2016.  Characterization of bacterial diversity associated with   calcareous  deposits and drip-waters, and isolation of calcifying   bacteria  from two Colombian mines. Microbiological Research 182:  21-30. http://dx.doi.org/10.1016/j.micres.2015.09.006.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614519&pid=S0120-0488201600020000900025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  GIRALDO,  C. 2009. Microbiota asociada a la casta obrera de la   hormiga  arriera <i>Atta cephalotes </i>(Hymenoptera: Myrmicinae).   Magister  Scientiae. Departamento de Biolog&iacute;a Facultad de Ciencias  Universidad del Valle Cali. 81 p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614521&pid=S0120-0488201600020000900026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  HAEDER,  S.; WIRTH, R.; HERZ, H.; SPITELLER, D. 2009.   Candicidin-producing <i>Streptomyces </i>support leaf-cutting ants to   protect  their fungus garden against the pathogenic fungus <i>Escovopsis</i>. Proceedings  of the National Academy of Sciences of   United  States of America 106: 4742-4746.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614523&pid=S0120-0488201600020000900027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>HALL  T., A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence   alignment  editor and analysis program for Windows 95/98/ NT. Nucleic  Acids Symposium Series 41: 95-98.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614525&pid=S0120-0488201600020000900028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  H&Ouml;LLDOBLER,  B.; WILSON, E. O. 2010. The Leafcutter   Ants:  Civilization by Instinct; W. W. Norton and Company,  Inc.: New York, NY, EEUU.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614527&pid=S0120-0488201600020000900029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  HUANG,  E. L.; AYLWARD, F. O.; KIM, Y. M.; WEBB-ROBERTSON,   B.  J.; NICORA, C. D.; HU, Z.; METZ, T. O.; LIPTON,   M.  S.; SMITH, R. D.; CURRIE, C. R.; BURNUM-JOHNSON,   K.  E. 2014. The fungus gardens of leaf-cutter ants undergo a   distinct  physiological transition during biomass degradation. Environmental  Microbiology Reports 6: 389-395.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614529&pid=S0120-0488201600020000900030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  INCE,  I.; KATI, H.; YILMAZ, H.; DEMIR, I.; DEMIRBAG, Z.   2008.  Isolation and identification of bacteria from <i>Thaumetopoea</i>   <i>pityocampa </i>Den. and Schiff. (Lep., Thaumetopoeidae) and   determination  of their biocontrol potential. World Journal of Microbiology &amp;  Biotechnology 24: 3005-3015.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614531&pid=S0120-0488201600020000900031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  JAFFE,  K.; CAETANO, F.; S&Aacute;NCHEZ, P.; HERN&Aacute;NDEZ, J.;   CARABALLO,  L.; VITELLI-FLORES, J.; MONSALVE, W.;   DORTA,  B.; LEMOINE, V. 2001. Sensitivity of ant (<i>Cephalotes</i>)   colonies  and individuals to antibiotics implies feeding symbiosis   with  gut microorganisms. Canadian Journal of Zoology 79:  1120-1124.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614533&pid=S0120-0488201600020000900032&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  KOEPPEL,  A.; PERRY, E. B.; SIKORSKI, J.; KRIZANC, D.;   WARNER,  A.; WARD, D. M.; ROONEY, A. P.; BRAMBILLA,   E.;  CONNOR, N.; RATCLIFF, R. M.; NEVO, E.; COHAN, F.   M.  2008. Identifying the fundamental units of bacterial diversity:   A  paradigm shift to incorporate ecology into bacterial systematics.   Proceedings  of the National Academy of Sciences of USA  105: 2504-2509.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614535&pid=S0120-0488201600020000900033&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  KONG,  L.; ZHU, S.; ZHU, L.; XIE, H.; SU, K.; YAN, T.; WANG,   J.;  WANG, J.; WANG, F.; SUN, F. 2013. Biodegradation of organochlorine   pesticide  endosulfan by bacterial strain <i>Alcaligenes</i>   <i>faecalis </i>JBW4. Journal of Environmental Sciences (China) 25  (11): 2257-2264.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614537&pid=S0120-0488201600020000900034&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  LAM,  K.; GEISREITER, C.; GRIES, G. 2009. Ovipositing female   house  flies provision offspring larvae with bacterial food. Entomologia Experimentalis  et Applicata 133: 292-295.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614539&pid=S0120-0488201600020000900035&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  LANGE,  L.; GRELL, M. N. 2014. The prominent role of fungi and   fungal  enzymes in the ant-fungus biomass conversion symbiosis. Applied  Microbiology and Biotechnology 98 (11): 4839-4851.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614541&pid=S0120-0488201600020000900036&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  LACERDA,  F. G.; DELLA, T.; PEREIRA O. L.; PETERNELLI, L.   A.;  T&Oacute;TOLA, M. R. 2010. Mortality of <i>Atta  sexdens rubropilosa</i>   (Hymenoptera:  Formicidae) workers in contact with colony   waste  from different plant sources. Bulletin of Entomological Research  100: 99-103.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614543&pid=S0120-0488201600020000900037&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  LEE,  A. H.; HUSSENEDER, C.; HOOPER-BÃ™I, L. 2008. Culture independent identification  of gut bacteria in fourth-instar red   imported  fire ant, <i>Solenopsis invicta </i>Buren, larvae. Journal of Invertebrate  Pathology 98: 20-33.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614545&pid=S0120-0488201600020000900038&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  LEONEL,  D. A.; STERNBERG, S. L.; PINZON M. C.; MOREIRA,   M.  Z.; MOUTINHO, P.; ROJAS, E. I.; HERRE, E. A. 2007.   Plants  use macronutrients accumulated in leaf-cutting ant nests.   Proceedings  of the Royal Society B: Biological Sciences 274: 315-321.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614547&pid=S0120-0488201600020000900039&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  LI,  H., MEDINA, F.; VINSON, S. B.; COATES, C. J. 2005. Isolation,   characterization,  and molecular identification of bacteria   from  the red imported fire ant (<i>Solenopsis  invicta</i>) midgut. Journal of  Invertebrate Pathology 89: 203-209.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614549&pid=S0120-0488201600020000900040&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  LITTLE,  A. E.; MURAKAMI, T.; MUELLER, U. G.; CURRIE,   C.  R. 2006. Defending against parasites: fungus-growing ants   combine  specialized behaviours and microbial symbionts to protect  their fungus gardens. Biology Letters 2: 12-16.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614551&pid=S0120-0488201600020000900041&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  McNEILL,  M. R.; VITTUM, P. J.; JACKSON, T. A. 2000. <i>Serratia</i>   <i>marcescens </i>as a rapid indicator of <i>Microctonus  hyperodae </i>oviposition   activity  in <i>Listronotus maculicollis </i>and potential application   of  the technique to host-specificity testing. Entomologia Experimentalis  et Applicata 95: 193-200.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614553&pid=S0120-0488201600020000900042&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  MOREIRA,  A. A.; FORTI, L. C.; ANDRADE, A. P. P.;   BOARETTO,  M. A. C.; LOPES, J. F. S. 2004. Nest architecture   of <i>Atta laevigata </i>(F. Smith, 1858) (Hymenoptera: Formicidae).   Studies  on Neotropical Fauna and Environment Journal 39:  109-116.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614555&pid=S0120-0488201600020000900043&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  MUELLER,  U. G.; SCHULTZ, T. R.; CURRIE, C. R.; ADAMS, R.   M.;  MALLOCH, D. 2001. The origin of the attine ant&#150;fungus mutualism.  The Quarterly Review of Biology 169-197.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614557&pid=S0120-0488201600020000900044&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  MUYZER,  G.; DE WAAL, E. C.; UITTERLINDEN, A. G. 1993.   Profiling  of complex microbial populations by denaturing gradient   gel  electrophoresis analysis of polymerase chain reactionamplified   genes  coding for 16S rRNA. Applied and Environmental Microbiology  59: 695-700.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614559&pid=S0120-0488201600020000900045&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  NGIGI,  A. N.; GETENGA, Z. M.; BOGA, H. I.; NDALUT, P. K.;   2012.  Biodegradation of s-triazine herbicide atrazine by <i>Enterobacter</i>   <i>cloacae </i>and <i>Burkholderia cepacia </i>sp. from long-term   treated  sugarcane-cultivated soils in Kenya. Journal of Environmental Science  and Health 47 (8): 769-778.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614561&pid=S0120-0488201600020000900046&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  O&rsquo;CALLAGHAN,  M.; GARNHAM, M. L.; NELSON, T. L.;   BAIRD,  D.; JACKSON, T. A. 1996. The pathogenicity of <i>Serratia</i>   strains  to <i>Lucilia sericata </i>(Diptera: Calliphoridae). Journal of  Invertebrate Pathology 68: 22-27.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614563&pid=S0120-0488201600020000900047&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  OSBORN,  F.; BERLIOZ, L.; VITELLI-FLORES, J.; MONSALVE,   W.;  DORTA, B.; RODR&Iacute;GUEZ LEMOINE, V. 2002. Pathogenic   effects  of bacteria isolated from larvae of <i>Hylesia  metabus</i>   Crammer  (Lepidoptera: Saturniidae). Journal of Invertebrate Pathology  80: 7-12.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614565&pid=S0120-0488201600020000900048&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  RADEMAKER,  J. W.; DE BRUIJN, F. 2004. Section 7 update:   Computer-assisted  analysis of molecular fingerprint profiles and   database  construction. pp. 3299-3347. In: Kowalchuk, G. A.; De   Bruijn,  F. J.; Head, I. M.; Akkermans, A. D.; Van Elsas, J. D.   (Eds.).  Molecular Microbial Ecology Manual. Springer Pa&iacute;ses Bajos.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614567&pid=S0120-0488201600020000900049&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
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<body><![CDATA[<!-- ref --><p>  TAMURA,  K.; PETERSON, D.; PETERSON, N.; STECHER, G.;   NEI,  M.; KUMAR, S. 2011. MEGA5: Molecular evolucionary   genetics  analysis using maximum likelihood, evolutionary distance,   and  maximum parsimony methods. Molecular Biology and  Evolution 28: 2731-2739.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614589&pid=S0120-0488201600020000900060&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  VAN  BORM, S.; BILLEN, J.; BOOMSMA, J. 2002. The diversity   of  microorganisms associated with <i>Acromyrmex </i>leafcutter ants. BMC  Evolutionary Biology 2: 9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614591&pid=S0120-0488201600020000900061&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  V&Eacute;LEZ  A., C. A. 2008. Microbiota asociada a los productos de desecho   de  colonias artificiales de hormiga arriera, <i>Atta  cephalotes</i>   (Myrmycinae,  Attini). Trabajo de grado, Instituto de Biolog&iacute;a,   Facultad  de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Antioquia. 88  p.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614593&pid=S0120-0488201600020000900062&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  V&Aacute;SQUEZ  DE D&Iacute;AZ, M. C.; PRADA, P. A.; MONDRAG&Oacute;N, M.   A.  2010. Optimizaci&oacute;n del proceso de compostaje de productos   post-cosecha  (cereza) del caf&eacute; con la aplicaci&oacute;n de microorganismos nativos.  Ciencias Biom&eacute;dicas 8 (14): 121-240.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614595&pid=S0120-0488201600020000900063&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>  YOON,  J.; MANEERAT, S.; KAWAI, F.; YOKOTA, A. 2006.   <i>Myroides pelagicus </i>sp. nov., isolated from seawater in Thailand.   International  Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56:  1917-1920.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=2614597&pid=S0120-0488201600020000900064&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>&nbsp;</p>     <p><b>Recibido</b>:  23-oct-2014       <br><b>Aceptado</b>: 18-sep-2016</p> </font>      ]]></body><back>
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