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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas del sistema HLA clase I y II en donantes de una población del suroccidente colombiano]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Introduction: the determination of the alleles expressed more often in a population allows to know the probability of a person to find a matched unrelated donor in that population and serves as reference for the HLA association studies with different diseases and applications in anthropogenetic studies. Objective: to determine the allelic frequencies HLA-A*, B* and DRB1* in the Colombia southwestern population. Design: retrospective descriptive study. Methods: in this study we included 1230 donors (living and deceased) evaluated witin our renal transplantation or bone marrow transplant protocol following at the Fundación Valle del Lili in Cali, Colombia. The typing was made by molecular methods and the statistical analysis of allele, genotype and haplotype frequencies was performed with the genetic programs GENEPOP and Arlequin. Results: we identified 20, 29 and 13 alleles for the HLA-A*, HLA-B* and HLA-DRB1* locus respectively and the most frequent alleles were A* 02 (25%), B* 35 (17.7% ) and DRB1* 04 (23%). The haplotypes for the two more frequent loci were A* 24B* 35 (8.9%), B* 35DRB* 04 (8.1%) and A* 24DRB* 04 (10.9%) and for three loci A* 24B * 35DRB1* 04 (5.4%) and A* 24B* 40DRB1* 04 (3.2%). Conclusion: the alleles expressed more frequently in the Colombia southwestern population are represented by the most common alleles in the colombian population. (Acta Med Colomb 2013; 38: 16-21).]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font size="2" face="Verdana">      <p><b>Trabajos Originales</b></p>     <p align="center"><font size="4"><b>Frecuencias al&eacute;licas, genot&iacute;picas y haplot&iacute;picas del sistema HLA clase I y II en donantes de una poblaci&oacute;n del suroccidente colombiano</b></font></p>     <p align="center"><font size="4"><b>Allele, genotype and haplotype frequencies of HLA system class I and II in donors in a population in southwestern Colombia</b></font></p>     <p align="center">Ana Mar&iacute;a Arrunategui<sup>1</sup>, Adriana Villegas<sup>2</sup>, Luz &Aacute;ngela Ocampo<sup>3</sup> &bull; Cali (Colombia).    <br> Libia Mar&iacute;a Rodr&iacute;guez<sup>4</sup> &bull; Medell&iacute;n (Colombia) &bull; Abdelmounim Badih<sup>5</sup> &bull; Granada (Espa&ntilde;a)</p>     <br>     <p><sup>1</sup>Especialista en Patolog&iacute;a y Laboratorio Cl&iacute;nico. MSc en Biotecnolog&iacute;a. Coordinadora M&eacute;dica del Laboratorio de Inmunolog&iacute;a de Trasplantes, Fundaci&oacute;n Valle del Lili;    <br> <sup>2</sup>BSc., MSc. en Inmunolog&iacute;a. Laboratorio de Inmunolog&iacute;a de Trasplantes Fundaci&oacute;n Valle del Lili.;    <br> <sup>3</sup>Bsc. Laboratorio de Inmunolog&iacute;a de Trasplantes Fundaci&oacute;n Valle del Lili. Cali (Colombia);    ]]></body>
<body><![CDATA[<br> <sup>4</sup>Dra. Libia Mar&iacute;a Rodr&iacute;guez: BSc, MSc. en Epidemiolog&iacute;a. Docente de la Facultad de Medicina, Universidad Pontificia Bolivariana. Grupo de Inmunolog&iacute;a Celular e Inmunogen&eacute;tica, Facultad de Medicina Universidad de Antioquia. Medell&iacute;n (Colombia);    <br> <sup>5</sup>Dr. Abdelmounim Badih: Doctor en Biolog&iacute;a, Coordinador Acad&eacute;mico del M&aacute;ster de Biotecnolog&iacute;a de la Escuela Superior de Ense&ntilde;anza Abierta. Granada (Espa&ntilde;a).</p>     <p>Correspondencia. Dra. Ana Mar&iacute;a Arru-nategui. E-mail: <a href="mailto:aarrunategui@fcvl.org">aarrunategui@ficvl.org</a> </p>     <p>Recibido: 20/VIII/2012 Aceptado: 24/I/2013</p>  <hr>     <p><font size="3"><b>Resumen</b></font></p>    <p><b>Introducci&oacute;n</b><i>: </i>la determinaci&oacute;n de los alelos que se expresan con mayor frecuencia en una poblaci&oacute;n permite conocer la probabilidad que tiene una persona de encontrar un donante no relacionado compatible en esa poblaci&oacute;n y sirve de referencia para estudios de asociaci&oacute;n del HLA con diferentes enfermedades y aplicaciones en estudios antropogen&eacute;ticos.</p>     <p><b>Objetivo general: </b>determinar las frecuencias al&eacute;licas HLA-A*, B* y DRB1* en una poblaci&oacute;n del suroccidente colombiano.</p>     <p><b>Dise&ntilde;o: </b>estudio descriptivo retrospectivo.</p>     <p><b>Material y m&eacute;todos: </b>estudio descriptivo y retrospectivo en el cual se incluyeron 1230 donantes (vivos y fallecidos) evaluados en el protocolo para trasplante renal y/o de m&eacute;dula &oacute;sea de la Fundaci&oacute;n Valle del Lili.    <br> La tipificaci&oacute;n se hizo por m&eacute;todos moleculares y el an&aacute;lisis estad&iacute;stico de las frecuencias al&eacute;licas, genot&iacute;picas y haplot&iacute;picas se realiz&oacute; con los programa gen&eacute;ticos GENEPOP y Arlequ&iacute;n.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Resultados: </b>se identificaron 20, 29 y 13 alelos para los locus HLA-A*, HLA-B* y HLA-DRB1* respectivamente y los alelos m&aacute;s frecuentes fueron A*02 (25%), B*35 (17,7%) y DRB1*04 (23%).    <br> Los haplotipos m&aacute;s frecuentes para dos loci fueron A*24B*35(8,9%), B*35DRB*04 (8,1%) y A*24DRB*04 (10,9%) y para tres loci A*24B*35DRB1*04 (5.4%) y A*24B*40DRB1*04 (3,2%).</p>     <p><b>Conclusi&oacute;n: </b>los alelos que se expresan con mayor frecuencia en la poblaci&oacute;n del suroccidente colombiano est&aacute;n representados por los alelos m&aacute;s comunes en la poblaci&oacute;n colombiana. (<b>Acta Med Colomb 2013; 38: 16-21</b>)</p>     <p><b>Palabras clave: </b><i>HLA, genotipo, haplotipo, alelos, prueba de histocompatibilidad, frecuencias, suroccidente colombiano</i></p> <hr>     <p><font size="3"><b>Abstract</b></font></p>    <p><b>Introduction: </b>the determination of the alleles expressed more often in a population allows to know the probability of a person to find a matched unrelated donor in that population and serves as reference for the HLA association studies with different diseases and applications in anthropogenetic studies.</p>     <p><b>Objective: </b>to determine the allelic frequencies HLA-A*, B* and DRB1* in the Colombia southwestern population.</p>     <p><b>Design: </b>retrospective descriptive study.</p>     <p><b>Methods: </b>in this study we included 1230 donors (living and deceased) evaluated witin our renal transplantation or bone marrow transplant protocol following at the Fundaci&oacute;n Valle del Lili in Cali, Colombia.    <br> The typing was made by molecular methods and the statistical analysis of allele, genotype and haplotype frequencies was performed with the genetic programs GENEPOP and Arlequin.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Results: </b>we identified 20, 29 and 13 alleles for the HLA-A*, HLA-B* and HLA-DRB1* locus respectively and the most frequent alleles were A* 02 (25%), B* 35 (17.7% ) and DRB1* 04 (23%).</p>     <p>The haplotypes for the two more frequent loci were A* 24B* 35 (8.9%), B* 35DRB* 04 (8.1%) and A* 24DRB* 04 (10.9%) and for three loci A* 24B * 35DRB1* 04 (5.4%) and A* 24B* 40DRB1* 04 (3.2%).</p>     <p><b>Conclusion: </b>the alleles expressed more frequently in the Colombia southwestern population are represented by the most common alleles in the colombian population. (<b>Acta Med Colomb 2013; 38: 16-21</b>).</p>     <p><b>Keywords: </b><i>HLA, genotype, haplotype, Alleles, histocompatibility testing, frequencies, southwestern Colombia.</i></p> <hr>     <p>El sistema HLA, de la sigla en ingl&eacute;s (Human Leukocyte Antigen) comprende un grupo de genes funcionalmente relacionados, que se expresan principalmente en las c&eacute;lulas nucleadas. Estos genes se encuentran en una regi&oacute;n gen&eacute;ricamente llamada Complejo Mayor de Histocompatibilidad (CMH), localizado en el brazo corto del cromosoma 6, que contiene m&aacute;s de 220 genes con diversas funciones muchas de las cuales est&aacute;n relacionadas con prote&iacute;nas del sistema inmune que intervienen en la respuesta del hu&eacute;sped a infecciones y en el reconocimiento de las c&eacute;lulas propias. La funci&oacute;n de las prote&iacute;nas codificadas por estos genes es la inducci&oacute;n y regulaci&oacute;n de la respuesta inmunol&oacute;gica contra los ant&iacute;genos extra&ntilde;os mediante la presentaci&oacute;n de p&eacute;ptidos antig&eacute;nicos al receptor del linfocito T (TCR). Dicha interacci&oacute;n HLA-TCR es relevante en la respuesta a trasplantes y en aquellas enfermedades con un notable componente inmunol&oacute;gico.</p>     <p>Por encontrarse f&iacute;sicamente en bloque y heredarse ligados, este conjunto de genes, o haplotipos, constituye la combinaci&oacute;n de genes transmitidos en un solo cromosoma proveniente de cada uno de los padres, que se heredan en forma codominante y la frecuencia de recombinaci&oacute;n es alrededor de 1%.</p>     <p>El sistema HLA se encuentra en equilibrio gen&eacute;tico siguiendo la ley de Hardy Weinberg que dice que las frecuencias genot&iacute;picas est&aacute;n determinadas por las frecuencias al&eacute;licas de la poblaci&oacute;n y permanecen estables de generaci&oacute;n en generaci&oacute;n, siempre que la poblaci&oacute;n sea grande, aislada y que los emparejamientos entre individuos se produzca al azar; sin embargo, existen algunas combinaciones de genes en los haplotipos que se presentan con mayor frecuencia de lo que uno se esperar&iacute;a, bas&aacute;ndose solamente en las frecuencias g&eacute;nicas de la poblaci&oacute;n. Este fen&oacute;meno recibe el nombre de desequilibrio de ligamento y tiene implicaciones biol&oacute;gicas y cl&iacute;nicas muy importantes, especialmente en la selecci&oacute;n de donantes para un trasplante, ya que hay algunos haplotipos en desequilibrio y muchos de ellos son particulares de cada grupo &eacute;tnico (1, 2). El conocimiento del sistema HLA se ha incrementado enormemente gracias a las t&eacute;cnicas de biolog&iacute;a molecular disponibles actualmente (3) llegando a alcanzar m&aacute;s de 7000 alelos (IMGT/HLA).</p>     <p>Aunque existen reportes que incluyen algunas poblaciones de la regi&oacute;n, se desconocen las frecuencias HLA en la poblaci&oacute;n del suroccidente colombiano y dada la alta variaci&oacute;n interpoblacional de estas frecuencias es muy importante el conocimiento del perfil gen&eacute;tico local.</p>     <p>En el presente estudio, se describen las frecuencias al&eacute;licas genot&iacute;picas y haplot&iacute;picas HLA Clase I (A y B) y Clase II (DRB1) en una poblaci&oacute;n del suroccidente colombiano con el prop&oacute;sito de aportar al conocimiento de la variabilidad gen&eacute;tica en la poblaci&oacute;n colombiana (4) y servir de referencia para posteriores estudios de asociaci&oacute;n de enfermedades con el sistema HLA (5, 6).</p>     <p><font size="3"><b>Material y m&eacute;todos</b></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Poblaci&oacute;n de estudio</b></p>     <p>Se incluyeron 1230 individuos, donantes (vivos y fallecidos) de ambos sexos del suroccidente colombiano, tipificados por t&eacute;cnicas moleculares para HLA Clase I (HLA-A*, B*) y II (DRB1*). La recolecci&oacute;n de muestras se llev&oacute; a cabo por la Fundaci&oacute;n Valle del Lili entre los a&ntilde;os 2000 al 2010.</p>     <p>Todos los donantes vivos han firmado un consentimiento informado como parte del ingreso al protocolo de trasplante, as&iacute; como los familiares de todos los donantes fallecidos de acuerdo con la legislaci&oacute;n vigente en Colombia.</p>     <p>Se realiz&oacute; inicialmente una depuraci&oacute;n de los datos provenientes de nuestra base, incluyendo los que cumpl&iacute;an con los criterios descritos, posteriormente se procedi&oacute; a la organizaci&oacute;n de los datos ajustando la tipificaci&oacute;n HLA a dos d&iacute;gitos de acuerdo con la metodolog&iacute;a empleada (3), se excluyeron los donantes provenientes de un mismo grupo familiar, ya que tendr&iacute;amos frecuencias m&aacute;s altas que las esperadas en una poblaci&oacute;n al azar.</p>     <p><b>Criterios de inclusi&oacute;n</b></p>     <p>Se incluyeron todos los donantes de la base de datos con informaci&oacute;n completa, tipificados por t&eacute;cnicas moleculares y procedentes de los departamentos del Valle del Cauca, Cauca, Choc&oacute; y Nari&ntilde;o.</p>     <p><b>Tipificaci&oacute;n HLA</b></p>     <p>El ADN se extrajo a partir de sangre perif&eacute;rica, usando las t&eacute;cnicas de precipitaci&oacute;n salina (Salting- Out) y el kit UltraClean DNA Blood Isolation Kit.</p>     <p>La tipificaci&oacute;n se realiz&oacute; por t&eacute;cnicas moleculares, PCR-SSP (Sequence Specific Primers) usando el reactivo ABDR SSPTray de Biotest (Dreieich, Germany) y PCR-SSOP (Sequence Specific Oligonucleotide Probes) INNO-LiPA HLA-A, B, DRB1 Innogenetics (7).</p>     <p>Los resultados se obtuvieron con ayuda de los software Biotest HLA-SSP Typing v1.1 y LiRAS for LiPA HLA v5.0 respectivamente.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>An&aacute;lisis estad&iacute;stico</b></p>     <p>Las frecuencias al&eacute;licas y genot&iacute;picas fueron determinadas por estimaci&oacute;n de m&aacute;xima verosimilitud y el &iacute;ndice de fijaci&oacute;n de Fisher se calcul&oacute; empleando el paquete de an&aacute;lisis gen&eacute;tico Genepop (<a href="http://genepop.curtin.edu.au" target="_blank">http://genepop.curtin.edu.au</a>) (8, 9). Se evalu&oacute; equilibrio de Hardy-Weinberg para cada locus as&iacute; como el desequilibrio de ligamiento entre loci. Las frecuencias haplot&iacute;picas fueron estimadas mediante el algoritmo ELB (Excoffer-Laval-Balding), y para los haplotipos m&aacute;s frecuentes se calcul&oacute; el desequilibrio de ligamiento para cada par de alelos utilizando el paquete Arlequ&iacute;n versi&oacute;n 3.0. Un valor de p&lt;0.05 se consider&oacute; estad&iacute;sticamente significativo.</p>     <p><font size="3"><b>Resultados</b></font></p>     <p><b>Caracter&iacute;sticas demogr&aacute;ficas</b></p>     <p>La poblaci&oacute;n estudiada ten&iacute;a un promedio de edad de 36.6 a&ntilde;os (rango de 3.9 a 74.8), 59.3 % fueron hombres y 40.7 % mujeres.</p>     <p><b>Frecuencias al&eacute;licas</b></p>     <p>Se identificaron 20, 29 y 13 grupos al&eacute;licos para los loci A*, B* y DRB1* respectivamente, distribuidos de la siguiente manera:</p>     <p>En el locus HLA-A* los alelos A*02 y A*24 presentaron las mayores frecuencias del 25.3% y 19.7 % respectivamente. Los alelos menos frecuentes fueron el A*69 y A*80 con una frecuencia de 0.2 %; el resto de alelos presentaron una frecuencia entre 0.5 y 5.1%.</p>     <p>En el locus HLA-B*, la especificidad con mayor frecuencia fue el alelo B*35 con un porcentaje del 17.7% le siguieron en frecuencia el B*40 (10.5%) y el B*44 (9.5%). Las frecuencias m&aacute;s bajas fueron para los alelos B*56, B*78 y B*81 (0.1%). No se encontraron los alelos B*46, B*54, B*59, B*67, B*73, B*82 y B*83.</p>     <p>Para el locus HLA-DRB1* se identificaron 13 que constituyen la totalidad de polimorfismos para este locus a nivel mundial. El alelo m&aacute;s frecuente fue el DRB1*04 (23%), seguido por los alelos DRB1*01, 07, 13 y 15 con frecuencias alrededor del 10%. Los alelos HLA-DRB1*10 y 12 presentaron las frecuencias m&aacute;s bajas en la poblaci&oacute;n estudiada (1.6% y 0.3%); los otros alelos se encontraron con frecuencias entre 3.3% al 7%. <a href="#tab1">Tabla 1</a>.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P align="center"><a name="tab1"><img src="img/revistas/amc/v38n1/v38n1a06t1.jpg"></a></P>      <p><b>Frecuencias genot&iacute;picas</b></p>     <p>Para el locus HLA-A* se observaron 210 genotipos, 435 para el locus HLA-B* y 91 para el locus HLA-DRB1*. Los genotipos m&aacute;s frecuentes para el locus HLA- A* fueron: A* 02,24 (11,1%), A*02,02 (7,8%), A*24,24 (4,5%) los m&aacute;s frecuentes para el locus HLA-B* fueron: B*35,40 (4,7%), B*35,35 (3,0), B*35,44 (2,9%) y los m&aacute;s frecuentes para el locus HLA-DRB1* fueron: DRB1*04,04 (6,0%), DRB1*04,07(5,1%) y DRB1*04,13 (4,8%), como se puede observar en la <a href="#tab2">Tabla 2</a> donde se representan las frecuencias mayores a 1,0% para los alelos HLA-A y -B y mayores al 1.6 para HLA-DRB1.</p>     <P align="center"><a name="tab2"><img src="img/revistas/amc/v38n1/v38n1a06t2.jpg"></a></P>       <p>Con respecto al equilibrio de Hardy-Weinberg (H-W), (HLA-A*, HLA-B* y HLA-DRB1*) en los tres loci se observaron desviaciones estad&iacute;sticamente significativas entre las frecuencias genot&iacute;picas observadas y las esperadas (<a href="#tab3">Tabla 3</a>).</p>     <P align="center"><a name="tab3"><img src="img/revistas/amc/v38n1/v38n1a06t3.jpg"></a></P>      <p>El valor de desequilibrio de ligamiento entre los haplotipos analizados fue entre los loci HLA-A* y HLA-B* (p=0.04), entre los loci HLA-B* y HLA-DRB1* (p=0.02), as&iacute; como entre los loci HLA-A* y HLA-DRB1* (p=0.07), de modo que cada uno de los pares de loci, se encontraban en desequilibrio, siendo el m&aacute;s significativo entre los loci HLA-A* y DRB1*.</p>     <p><b>Frecuencias haplotipicas</b></p>     <p>Los haplotipos m&aacute;s comunes en la poblaci&oacute;n del sur occidente colombiano fueron para HLA A, B: A*24B*35 (8.9%), A*24B*40 (5.2%), para HLA B,DRB :B*35DRB*04 (8.1%), B*40DRB*04 (4.9%) y para HLA A,DRB: A*24DRB*04 (10.9%), A*02DRB*04 (5.9%), los cuales est&aacute;n representados en la <a href="#fig1">Figura 1</a> (1a HLA-A, -B, 1b HLA-B, -DRB1 y 1c HLA-A, -DRB1).</p>     <P align="center"><a name="fig1"><img src="img/revistas/amc/v38n1/v38n1a06f1.jpg"></a></P>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Haplotipos A*/B*/DRB1*</b></p>     <p>En la <a href="#fig2">Figura 2</a>, encontramos los 20 haplotipos m&aacute;s comunes, siendo el A*24B*35DRB1*04 el m&aacute;s frecuente con un porcentaje de 5.4%, le sigue en frecuencia el A*24B*40DBR1*04 con un 3.25%.</p>     <P align="center"><a name="fig2"><img src="img/revistas/amc/v38n1/v38n1a06f2.jpg"></a></P>      <p><font size="3"><b>Discusi&oacute;n</b></font></p>     <p>Este estudio proporciona por primera vez, informaci&oacute;n sobre la distribuci&oacute;n de los alelos HLA clase I y II en la poblaci&oacute;n del suroccidente colombiano que se encuentra muy acorde a lo publicado en otras regiones del pa&iacute;s (10-12).</p>     <p>Se encontraron 62 de los 69 grupos al&eacute;licos descritos para HLA A*, B* y DRB1* reportados a nivel mundial (13).</p>     <p>Los alelos m&aacute;s comunes para el locus HLA-A* fueron A*02 y A*24 donde se observ&oacute; una distribuci&oacute;n desproporcionada de las frecuencias al&eacute;licas, donde estos dos alelos representan el 45% del polimorfismo para este locus, porcentajes similares a lo observado en otras poblaciones colombianas (10-15), latinoamericanas (16-18) y cauc&aacute;sicas (19).</p>     <p>Se ha encontrado una alta frecuencia del alelo A*02 en estudios de grupos de hispanos en Estados Unidos (20, 21), como en poblaciones europeas (22), grupos raciales de los cinco continentes (23) y en afroamericanos colombianos (San Basilio de Palenque) (24).</p>     <p>El alelo A*24 (19.7%) ha sido reportado en un porcentaje alto en la poblaci&oacute;n ind&iacute;gena Kogui de la Sierra Nevada de Santa Marta (23).</p>     <p>Los alelos A*30 (7.2%) y el A*03 (6.2%) encontrados en nuestra poblaci&oacute;n se han descrito en frecuencias un poco m&aacute;s altas de 10% y 9.2% respectivamente, en diferentes estudios en afroamericanos (24).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Al igual que lo reportado por Arias-Murillo Y, <i>et al</i>. (14) el alelo A*43 no se encontr&oacute; en este estudio.</p>     <p>El locus HLA-B* es el m&aacute;s polim&oacute;rfico del sistema HLA y fue donde se encontr&oacute; la m&aacute;s alta variabilidad gen&eacute;tica. Los alelos m&aacute;s frecuentes fueron B*35(17.7%), B*40 (10.5%) y B*44 (9.5%), lo que representa 37.7% del polimorfismo para este locus. El alelo m&aacute;s frecuente fue el B*35 con un porcentaje del 17.7% que coincide con lo encontrado en otras poblaciones colombianas (10-15) como Bogot&aacute;, Medell&iacute;n y el Huila, as&iacute; como en estudios en poblaciones de Latinoam&eacute;rica (16-18) y en poblaciones hispanas en los Estados Unidos (25, 26).</p>     <p>La frecuencia del alelo B*40 (10.5%) es similar a la reportada en el estudio de Fleischhauer <i>et al</i>. en una poblaci&oacute;n mestiza de Cali (27). Los alelos HLA-B*07, 15, 18, 39 y 51 representan el 29.3 % de la variaci&oacute;n, y junto con los antes mencionados alelos B*35, B*40 y B*44 dan un 67% de variaci&oacute;n total para este locus en la poblaci&oacute;n estudiada.</p>     <p>No se encontraron los alelos B*59, B*67, B*73, B*82 y B*83 como tampoco el B*46 y 54 reportados en poblaci&oacute;n japonesa.</p>     <p>Con respecto al locus HLA -DRB1* los alelos DRB1* 01, 04, 07, 13 y 15 fueron los m&aacute;s comunes y son los que predominan en la poblaci&oacute;n hisp&aacute;nica y sus frecuencias fueron muy parecidas a las reportadas por Arias-Murillo Y, <i>et al. </i>(14) y Rodr&iacute;guez L, <i>et al. </i>(10). <sup>.</sup>El DRB1* 04 fue el alelo con la frecuencia m&aacute;s alta (23%), similar a la reportada por Ossa H <i>et al </i>(11), en la poblaci&oacute;n de Bogot&aacute;, tambi&eacute;n es el alelo con la frecuencia m&aacute;s alta en poblaci&oacute;n de Uruguay (16) y junto con los antes mencionados representan el 64.2% del polimorfismo de este locus.</p>     <p>El genotipo HLA- A*02,24 con una frecuencia de 11.1% en nuestro estudio, es tambi&eacute;n el genotipo m&aacute;s frecuente en otras poblaciones colombianas (10-12), al igual que en la poblaci&oacute;n hisp&aacute;nica de USA (12.1%) y en nativos norteamericanos (23.7%) (25). Le sigue el A*02,02 (7.8%,) que es muy frecuente en afroamericanos seg&uacute;n el estudio en cinco poblaciones de Estados Unidos (25) y el HLA-B*35.40 (4.7%) es tambi&eacute;n el m&aacute;s frecuente en el grupo de Huila (12)</p>     <p>El no cumplimiento de Hardy-Weinberg y el Desequilibrio de ligamento encontrado en la poblaci&oacute;n analizada, donde hay menos heterocigotos de lo esperado probablemente pueda deberse al efecto de endogamia, presencia de alelos no detectados con la t&eacute;cnica utilizada, donde se asigna un solo alelo, y si no hay un estudio completo que incluya los padres no se puede determinar si es homocigoto.</p>     <p>Los haplotipos (de dos loci) A*24B*35 (8.9%), B*35DRB*04 (8.1%) y A*24DRB*04 (10.9%), son los de mayor frecuencia y coincide con los reportados por otros grupos en el pa&iacute;s (10, 12)aunque las frecuencias de nuestro estudio son un poco m&aacute;s altas con respecto a las de Medell&iacute;n (10), quienes reportan 7.7%, 6.4% y 8.9% respectivamente, para cada haplotipo.</p>     <p>El haplotipo (de tres loci) A*24B*35DRB1*04 es el m&aacute;s frecuente con un porcentaje de 5.4%, lo cual coincide tambi&eacute;n con el reportado por el grupo de Medell&iacute;n (10).</p>     <p><font size="3"><b>Conclusiones</b></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Los alelos que se expresan con mayor frecuencia (A*02, A*24, B*35, DRB1*04) en la poblaci&oacute;n del suroccidente colombiano est&aacute;n representados por los alelos m&aacute;s comunes en la poblaci&oacute;n colombiana como tambi&eacute;n en la latinoamericana, europea y cauc&aacute;sica.</p>     <p>Por &uacute;ltimo y lo m&aacute;s importante es que este estudio nos permiti&oacute; conocer las frecuencias g&eacute;nicas de nuestra poblaci&oacute;n, lo que ayudar&aacute; a calcular la probabilidad que tiene un receptor altamente sensibilizado-hipersensibilizado, que se encuentre en lista de espera para trasplante renal, de encontrar un donante compatible en el suroccidente colombiano.</p>     <p>Nuestro estudio junto con los otros realizados en diferentes regiones del pa&iacute;s ser&aacute; un aporte muy importante para ayudar a consolidar el perfil genot&iacute;pico en la poblaci&oacute;n colombiana.</p>     <p><font size="3"><b>Agradecimientos</b></font></p>     <p>Queremos agradecerle al doctor Luis Fernando Garc&iacute;a de la Universidad de Antioquia por impulsarnos a realizar este trabajo y a todas las personas que con su apoyo nos permitieron culminarlo con &eacute;xito.</p> <hr>     <p><font size="3"><b>Referencias</b></font></p>     <!-- ref --><p>1.</b>  </b>Robinson</b> </b>J.,</b> </b>et</b> </b>al. The IMGT/HLA database. <i>Nucleic</i><i> </i><i>Acids</i><i> </i><i>Research</i><i> </i>2011; 39: D1171-D1176.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000099&pid=S0120-2448201300010000600001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>2.  Alper CA, Larsen CE, Dubey DP, Awdeh ZL, Fici DA, Yunis EJ. The haplotype structure of the human major histocompatibility complex. <i>Hum Immunol </i>2006; 67: 73-84.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000101&pid=S0120-2448201300010000600002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>3.  Bonett-Rosello L, Mart&iacute;nez-C&oacute;rdova Z. Los m&eacute;todos serol&oacute;gicos y moleculares en la tipificaci&oacute;n de los ant&iacute;genos de leucocitos humanos. Asociaci&oacute;n Mexicana de Bioqu&iacute;mica Cl&iacute;nica. Distrito Federal, M&eacute;xico. <i>Bioqu&iacute;mica </i>2004; 29(4): 126-130.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000103&pid=S0120-2448201300010000600003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>4.  &Aacute;vila-Portillo LM, Carmona A., Franco L, Briceno I, Casas MC, Gomez A. Bajo polimorfismo en el sistema de ant&iacute;genos de leucocitos humanos en poblaci&oacute;n mestiza colombiana. <i>Univ Med </i>2010; 51(4): 359-370.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000105&pid=S0120-2448201300010000600004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>5.  Garavito G, Malag&oacute;n C, Ram&iacute;rez L, et al. Polimorfismo de los alelos de los ant&iacute;genos de leucocitos humanos HLA DRB1 y su asociaci&oacute;n con la artritis reumatoidea juvenil en una muestra de ni&ntilde;os mestizos colombianos. <i>Biom&eacute;dica </i>2003; 23: 254-262.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000107&pid=S0120-2448201300010000600005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>6.  Mart&iacute;nez J, Navarrete A, Arrazola A, Su&aacute;rez A, Zonana-Nacach A, Camargo A, et al. Subtipos de HLA-B27 en familias de pacientes mestizos mexicanos con espondilitis anquilosante. <i>Revista Mexicana de Medicina Transfusional </i>2008; 1: 18-22.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000109&pid=S0120-2448201300010000600006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>7.  SGE Marsh, ED Albert, WF Bodmer, RE Bontrop, B Dupont, HA Erlich, M Fernandez-Vi&ntilde;a, DE Geraghty, R Holdsworth, CK Hurley, M Lau, KW Lee, B Mach, M Maiers, WR Mayr, CR Mu&uml;ller, P Parham, E W Petersdorf, T Sasazuki, J L Strominger, A Svejgaard, PI Terasaki, JM Tiercy &amp; J Trowsdale. Nomenclature for factors of the HLA system. <i>Tissue Antigens </i>2010; 76: 161-164.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000111&pid=S0120-2448201300010000600007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>8.  Raymond M, Rousset F. GENEPOP (version 1.2): population genetics software for exact tests and Ecumenicims. <i>The Journal of Heredity </i>1995; 86: 248-9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000113&pid=S0120-2448201300010000600008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>9.  Excoffer L, Laval G, Schneider S. Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population Genetics data analysis. <i>Evol Bioinform </i>2005; 1: 47-50.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000115&pid=S0120-2448201300010000600009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>10. Rodr&iacute;guez L, Giraldo M, Garc&iacute;a N, Vel&aacute;squez L, Paris S, &Aacute;lvarez C, M; Garc&iacute;a Luis F. Frecuencias al&eacute;licas, genot&iacute;picas y haplot&iacute;picas HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 en donantes fallecidos, Medell&iacute;n, Colombia. <i>Biom&eacute;dica </i>2007; 27: 537-47.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000117&pid=S0120-2448201300010000600010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>11. Ossa H, Manrique A, Quintanilla S, Pe&ntilde;a A. Polimorfismos del sistema HLA (loci A*, B* y DRB1*) en poblaci&oacute;n colombiana. <i>NOVA </i>2007; 5(7): 1-100&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000119&pid=S0120-2448201300010000600011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><p>12. Bermeo S, Guerra Mar&iacute;a T, Ostos H. Frecuencias de HLA-A-B Y DRB1 en una poblaci&oacute;n de Huila- Colombia. Revista Facultad de Salud Universidad Sur-colomiana <i>RFS </i>2010; 2(1): 9-19.</p>     <!-- ref --><p>13. Weir BS. Genetic Data Analisis II. 2da. Sunderland (MA): Sinauer Associates; 1996.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000121&pid=S0120-2448201300010000600013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>14. Arias-Murillo Y, Castro-Jimenez M, Rios-Espinosa M, Lopez-Rivera J, Echeverry-Coral S, Martinez-Nieto O. Analysis of HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 allelic, genotypic, and haplotypic frecuencies in Colombian population. <i>Colombia M&eacute;dica </i>2010; 41: 4.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000123&pid=S0120-2448201300010000600014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>15. Fuentes A, Gil P, Potou R, Ossa H. Frecuencias g&eacute;nicas del sistema HLA clase I y II en una poblaci&oacute;n de la ciudad de Bogot&aacute;, D.C. En: <a href="http://www.monografas.com/trabajos12/arthla/arthla.shtml?" target="_blank">http://www.monografas.com/trabajos12/arthla/arthla.shtml?</a>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000125&pid=S0120-2448201300010000600015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>16. Bengochea M, &Aacute;lvarez I, Hidalgo PC, Cabrera A, Senatore O, Toledo R, et al. HLA A, -B, -DR en receptores de trasplante de medula &oacute;sea en Uruguay. <i>Rev Med Uruguay </i>2003; 19: 149-58.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000126&pid=S0120-2448201300010000600016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>17. Alfaro Emma L, Dipierri Jose E, Gutierrez Nestor, Vullo Carlos M. Frecuencias g&eacute;nicas y haploticas del sistema HLA en el Noroeste argentino. <i>Antropo </i>2004; 6: 15-23.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000128&pid=S0120-2448201300010000600017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>18. De Pablo R, Beraun Y, Nieto A, Calzada J, Rementeria M, Sanz L, Lopez-Nevot M, Martin J. 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Cao K, Hollenbach J, Shi X, Shi W, Chopek M, Fernandez M. Analysis of the frequencies oh HLA-A,B and C Alleles and Haplotypes in the Five Mayor Ethnic Groups of the United states Reveals High Levels of Diversity in These Loci and contrasting distribution Patterns in These Populations. <i>Human Inmunology </i>2000; 62: 1009-30.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000134&pid=S0120-2448201300010000600020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>21. K Cao, JA Hollenbach, XJ Shi, WX Shi, M Chopek, MA Fernandez-Vina. 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Fleischhauer K, Zino E. HLA-A, B and -Cw allele frecuencies in two populations from Colombia. <i>Human Immunology </i>2004; 65: 906-8.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000148&pid=S0120-2448201300010000600027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p> </font>      ]]></body><back>
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