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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[INDUCCIÓN DE LA ACTIVIDAD DE LA ENZIMA FENILALANINA AMONIO LIASA EN CLAVEL (Dianthus caryophyllus L) POR ELICITORES DEL HONGO Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi raza 2]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[PHENYLALANINE AMMONIUM LIASE INDUCTION ON CARNATION (Dianthus caryophyllus L) BY ELICITORS FROM Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi race 2]]></article-title>
<article-title xml:lang="pt"><![CDATA[INDUÇÃO DA ACTIVIDADE FENILALANINA AMONIO LIASA EM CRAVO (Dianthus caryophyllus L) POR ELICITORES DO FUNGO Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi raça 2]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The conditions of extraction and quantification of activity during interaction of carnation and Fusarium oxysporum f. sp. dianthi race 2 were selected to evaluate the dynamics of the enzyme Phenylalanine Ammonium Lyase (PAL) at the carnations steam. For the extraction from roots and stems a previous treatment with acetone and extraction with borate pH 8.8, EDTA 2 mMand mercaptoethanol 18 mM buffer were selected. For the quantification at steam level a discontinous assay for 10 min at 37 °C, pH 8.0 and substrate concentration 35mMshould be done. In addition an in vivo assay shows the effect that the applications of a raw extract of the pathogen as inductor of this enzyme. The results show that the enzyme is significantly induced in carnations stems of the tolerant variety “Kiss” during the treatment by aspersion with raw extract of the pathogen while the induction was non existing for direct infection with the pathogen. The induction in this variety shows that in the pathogen extract are present elicitors for the induction of this enzyme and thus the phenylpropanoid path.]]></p></abstract>
<abstract abstract-type="short" xml:lang="pt"><p><![CDATA[Para avaliar o comportamento da enzima fenilalanina amonio liasa (PAL, pelo seu nome em inglês phenylalanine ammonia liase) no caule durante a interação cravo- Fusarium oxysporum f. sp. dianthi raça 2, foram seleccionadas as condiçes ideais para a sua extração e quantificação na atividade. Para a extração a partir de caules e raízes foi seleccionado um tratamento prévio do material vegetal com acetona e posterior extração com borato pH 8,8 com EDTA 2 mMe ß-mercaptoetanol 18 mM. Para a quantificação da enzima no caule, deve-se realizar um ensaio descontínuo por 10 min., a 37 °C, pH 8,0 e a uma concentração de substrato de 35 mM. Além do mais, mostra-se mediante um ensaio in vivo, o efeito que tem como inductor desta enzima a aplicação de um extracto cru do patógeno. Os resultados observados indicam que esta enzima é induzida significativamente en caules de cravos da variedade tolerante “Kiss” durante o tratamento por aspersão com o extrato cru do patógeno, enquanto que esta indução foi inexistente para a infecção directa com o patógeno. A indução apresentada nesta variedade indica que neste extrato do patógeno estão presentes potencias elicitores para a indução desta enzima e portanto da rota fenilpropanoide.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font size="2" face="verdana">     <p align="CENTER"><b><font size="4">INDUCCI&Oacute;N DE LA ACTIVIDAD DE LA ENZIMA FENILALANINA AMONIO   LIASA EN CLAVEL (Dianthus caryophyllus L) POR ELICITORES   DEL HONGO Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi raza 2</font></b></p>     <p align="CENTER"><b><font size="3">PHENYLALANINE AMMONIUM LIASE INDUCTION ON CARNATION   (Dianthus caryophyllus L) BY ELICITORS FROM Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi race 2</font></b></p>     <p align="CENTER"><b><font size="3">INDU&Ccedil;&Atilde;O DA ACTIVIDADE FENILALANINA AMONIO LIASA EM CRAVO   (Dianthus caryophyllus L) POR ELICITORES DO FUNGO Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi ra&ccedil;a 2</font></b></p>     <p>Harold Ardila<sup>1</sup>, Beatriz Baquero y Sixta Mart&iacute;nez<sup>1,2</sup></p>     <p><sup>1</sup> Departamento de Qu&iacute;mica, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia, sede Bogot&aacute;, Bogot&aacute;, Colombia.   <a href="mailto:hdardilab@unal.edu.co">hdardilab@unal.edu.co</a>    <br> <sup>2</sup> <a href="mailto:stmartinezp@unal.edu.co">stmartinezp@unal.edu.co</a></p>     <p>Recibido: 15/12/06 &ndash; Aceptado: 23/08/07</p> <hr size="1">     <p><b>RESUMEN</b></p>     <p>Con el fin de evaluar el comportamiento a   nivel del tallo de la enzima fenilalanina   amonio liasa (PAL, por su nombre en ingl&eacute;s   phenylalanine ammonia liase), durante   la interacci&oacute;n clavel-Fusarium oxysporum   f. sp. dianthi raza 2, se seleccionaron   las condiciones para su extracci&oacute;n   y cuantificaci&oacute;n de la actividad. Para la   extracci&oacute;n a partir de tallos y ra&iacute;ces se seleccion&oacute;   un tratamiento previo del material   vegetal con acetona y posterior extracci&oacute;n   con buffer borato pH 8,8 con   EDTA 2mMy &beta;-mercaptoetanol 18 mM.   Para su cuantificaci&oacute;n a nivel del tallo se   debe realizar un ensayo discontinuo por   10 min, a 37 oC, pH 8,0 y a una concentraci&oacute;n   de sustrato de 35 mM. Adicionalmente   se muestra mediante un ensayo in   vivo el efecto que tiene, como inductor de   esta enzima, la aplicaci&oacute;n de un extracto   crudo del pat&oacute;geno. Los resultados observados   indican que esta enzima se induce   significativamente en tallos de claveles   de la variedad tolerante &ldquo;Kiss&rdquo; durante el   tratamiento por aspersi&oacute;n con el extracto   crudo del pat&oacute;geno, mientras que dicha   inducci&oacute;n fue inexistente para la infecci&oacute;n   directamente con el pat&oacute;geno. La inducci&oacute;n   en esta variedad indica que en   este extracto del pat&oacute;geno se presentan   elicitores potenciales para la inducci&oacute;n de esta enzima y por ende de la ruta fenilpropanoide.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Palabras clave:</b> enzimas, fenilalanina   amonio liasa, elicitor, clavel, Fusarium oxysporum f. sp. dianthi.</p> <hr size="1">     <p><b>ABSTRACT</b></p>     <p>The conditions of extraction and quantification   of activity during interaction of carnation   and Fusarium oxysporum f. sp.   dianthi race 2 were selected to evaluate the   dynamics of the enzyme Phenylalanine   Ammonium Lyase (PAL) at the carnations   steam. For the extraction from roots and   stems a previous treatment with acetone   and extraction with borate pH 8.8, EDTA   2 mMand mercaptoethanol 18 mM buffer   were selected. For the quantification at   steam level a discontinous assay for 10   min at 37 &deg;C, pH 8.0 and substrate concentration   35mMshould be done. In addition   an in vivo assay shows the effect that   the applications of a raw extract of the pathogen   as inductor of this enzyme. The results   show that the enzyme is significantly   induced in carnations stems of the tolerant   variety &ldquo;Kiss&rdquo; during the treatment by aspersion   with raw extract of the pathogen   while the induction was non existing for   direct infection with the pathogen. The induction   in this variety shows that in the   pathogen extract are present elicitors for   the induction of this enzyme and thus the phenylpropanoid path.</p>     <p><b>Key words:</b> phenylalanine ammonium   liase, carnation, Fusarium oxysporum f. sp. dianthi.</p> <hr size="1">     <p><b>RESUMO</b></p>     <p>Para avaliar o comportamento da enzima   fenilalanina amonio liasa (PAL, pelo seu nome em ingl&ecirc;s phenylalanine ammonia liase) no caule durante a intera&ccedil;&atilde;o cravo- Fusarium oxysporum f. sp. dianthi ra&ccedil;a 2, foram seleccionadas as condi&ccedil;es ideais para a sua extra&ccedil;&atilde;o e quantifica&ccedil;&atilde;o na atividade. Para a extra&ccedil;&atilde;o a partir de caules e ra&iacute;zes foi seleccionado um tratamento pr&eacute;vio do material vegetal com acetona e posterior extra&ccedil;&atilde;o com borato pH 8,8 com EDTA 2 mMe &beta;-mercaptoetanol 18 mM. Para a quantifica&ccedil;&atilde;o da enzima no caule, deve-se realizar um ensaio descont&iacute;nuo por 10 min., a 37 &deg;C, pH 8,0 e a uma concentra&ccedil;&atilde;o de substrato de 35 mM. Al&eacute;m do mais, mostra-se mediante um ensaio in vivo, o efeito que tem como inductor desta enzima a aplica&ccedil;&atilde;o de um extracto cru do pat&oacute;geno. Os resultados observados indicam que esta enzima &eacute; induzida significativamente en caules de cravos da variedade tolerante &ldquo;Kiss&rdquo; durante o tratamento por aspers&atilde;o com o extrato cru do pat&oacute;geno, enquanto que esta indu&ccedil;&atilde;o foi inexistente para a infec&ccedil;&atilde;o directa com o pat&oacute;geno. A indu&ccedil;&atilde;o apresentada nesta variedade indica que neste extrato do pat&oacute;geno est&atilde;o presentes potencias elicitores para a indu&ccedil;&atilde;o desta enzima e portanto da rota fenilpropanoide.</p>     <p><b>Palavras-chave:</b> enzimas, fenilalanina   amonio liasa, elicitor, cravo, Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi.</p> <hr size="1">     <p><b>INTRODUCCI&Oacute;N</b></p>     <p>El cultivo del clavel constituye actualmente   una de las actividades de mayor relevancia   en el sector floricultor nacional,   aunque su producci&oacute;n haya disminuido en   los &uacute;ltimos a&ntilde;os por factores que inciden   en la producci&oacute;n y el mercado. Uno de los   principales factores que afectan su producci&oacute;n   es el marchitamiento vascular causado por el hongo Fusarium oxysporum f. sp. dianthi raza 2, pat&oacute;geno ampliamente distribuido en las zonas donde se cultivan claveles en nuestro pa&iacute;s. Aunque diversos grupos de investigaci&oacute;n en el mundo han enfocado sus estudios para comprender cu&aacute;les son los fen&oacute;menos histol&oacute;gicos y bioqu&iacute;micos involucrados en la interacci&oacute;n entre estos dos organismos, dichos fen&oacute;menos no han sido totalmente dilucidados y tanto las bases bioqu&iacute;micas como moleculares en que se fundamenta la defensa del clavel contra este pat&oacute;geno son a&uacute;n desconocidas. De acuerdo con diversos estudios en otros modelos planta-pat&oacute;geno, enzimas involucradas en la v&iacute;a fenilpropanoide, como la fenilalanina amonio liasa (PAL), participan de manera determinante en la generaci&oacute;n de compuestos fen&oacute;licos (1) y estructuras de defensa (2), y es probable que su regulaci&oacute;n coordinada durante el evento de la interacci&oacute;n contra microorganismos pat&oacute;genos sea clave en la activaci&oacute;n de los mecanismos de defensa vegetales. La PAL es la enzima que, al catalizar la primera reacci&oacute;n de la ruta fenilpropanoide, se ha encontrado que puede regular la generaci&oacute;n de los diferentes metabolitos obtenidos por esta v&iacute;a biosint&eacute;tica y ha sido relacionada, por ello, con mecanismos de defensa que se activan en otros modelos (3, 4 y 5). El inter&eacute;s por el estudio de esta enzima en este modelo particular se basa en que, de acuerdo con estudios previos realizados en nuestro grupo de investigaci&oacute;n, la s&iacute;ntesis de compuestos fen&oacute;licos as&iacute; como la formaci&oacute;n de estructuras de defensa hacen parte de la respuesta al ataque del pat&oacute;geno (6 y 7) y por ende estas enzimas podr&iacute;an ser determinantes para la activaci&oacute;n adecuada de dichos mecanismos. En el presente estudio se seleccionaron inicialmente las mejores condiciones para realizar la extracci&oacute;n y cuantificaci&oacute;n de esta enzima en tallos y ra&iacute;ces de clavel. La evaluaci&oacute;n en estos dos &oacute;rganos de la planta se llev&oacute; a cabo con fines comparativos, considerando que, tal y como se ha reportado en otras especies vegetales, es probable que se presenten diferentes isoformas en funci&oacute;n del &oacute;rgano de la planta involucrado (8). Seleccionadas estas condiciones, se evalu&oacute; en tallos de la variedad de clavel Kiss, tolerante al marchitamiento vascular, el efecto que sobre la actividad enzim&aacute;tica ten&iacute;a el tratamiento por aspersi&oacute;n y por inmersi&oacute;n con una fracci&oacute;n cruda proveniente del pat&oacute;geno. Con los resultados obtenidos en el presente estudio se propone que la activaci&oacute;n de esta enzima podr&iacute;a ser un mecanismo de defensa potencial considerando su inducci&oacute;n significativa al realizar el tratamiento con una fracci&oacute;n cruda proveniente del pat&oacute;geno.</p>     <p><b>MATERIALES Y M&Eacute;TODOS</b></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Material vegetal y aislamiento del pat&oacute;geno</b></p>     <p>Se usaron para el ensayo in vivo esquejes   de clavel con 3 semanas de enraizamiento   suministrados por la empresa   Am&eacute;rica Flor S. A., pertenecientes a las   variedades Uconn (susceptible) y Kiss   (tolerante al marchitamiento vascular   causado por Fusarium oxysporum f. sp.   dianthi raza 2). El aislamiento del pat&oacute;geno   usado para este estudio fue suministrado   por la misma empresa y se   mantuvo en medio Czapek Dox-Brot durante su propagaci&oacute;n.</p>     <p>Para la preparaci&oacute;n del in&oacute;culo, el micelio   del aislamiento de Fusarium oxysporum f. sp. dianthi raza 2 se propag&oacute; directamente a medio l&iacute;quido Czapek Dox- Broth y se mantuvo por 4 d&iacute;as a 25 oC con agitaci&oacute;n constante de 100 rpm. Cumplido este periodo, el cultivo se filtr&oacute; en condiciones as&eacute;pticas para retirar el micelio sobrenadante y el medio l&iacute;quido se llev&oacute; a una concentraci&oacute;n de 1 X 106 conidias / mL (por conteo con el hemocit&oacute;metro).</p>     <p><b>Obtenci&oacute;n del extracto crudo del hongo</b></p>     <p>Para la obtenci&oacute;n de la fracci&oacute;n cruda del   hongo, micelio obtenido de la propagaci&oacute;n   en medio liquido de Fusarium oxysporum   f. sp. dianthi raza 2, se lav&oacute; exhaustivamente   con agua luego de   separarlo del medio por filtraci&oacute;n. Despu&eacute;s   de homogenizar y esterilizar por 15   min en autoclave, se centrifug&oacute; a 12000   rpm por 20 min y 8 oC. Se retir&oacute; el sobrenadante   y se cuantific&oacute; en este la cantidad   de az&uacute;cares totales, con el m&eacute;todo de Dubois   (9) usando glucosa como patr&oacute;n. La   concentraci&oacute;n final de 1 mg/mL se obtuvo   con la adici&oacute;n de agua est&eacute;ril y esta   fracci&oacute;n se guard&oacute; a &ndash;20 oC para llevar a cabo los ensayos de elicitaci&oacute;n.</p>     <p><b>Ensayos preliminares para   la extracci&oacute;n y cuantificaci&oacute;n de la PAL a partir de tallos de clavel</b></p>     <p>La cuantificaci&oacute;n preliminar de la actividad   se realiz&oacute; usando extractos de tallos   y/o ra&iacute;ces obtenidos bajo condiciones de   extracci&oacute;n reportadas para matrices similares   a la de estudio (7). La extracci&oacute;n se   realiz&oacute; utilizando de 0,3 a 0,4 g de material   vegetal previamente lavado y secado,   el cual se macer&oacute; con aire l&iacute;quido y se le   adicion&oacute; acetona en una relaci&oacute;n 1:2 con el material vegetal. En este punto fue necesario realizar dos lavados adicionales con este solvente, para eliminar compuestos fen&oacute;licos que pueden ser potenciales inhibidores de esta enzima (10). Una vez eliminados los compuestos interferentes, se adicion&oacute; amortiguador Na2HPO4-NaH2PO4 100 mM, pH 6,5; posteriormente se centrifug&oacute; a 11000 xg durante 30 min., el sobrenadante se retir&oacute; cuidadosamente y se guard&oacute; a &ndash;15 oC para someterlo a los an&aacute;lisis posteriores de actividad enzim&aacute;tica, y de cuantificaci&oacute;n de prote&iacute;na por el m&eacute;todo de Bradford (11) y la linealizaci&oacute;n reportada por Zor y Sellinger (12). La actividad se determin&oacute; en los extractos crudos obtenidos, mediante cuantificaci&oacute;n del &aacute;cido cin&aacute;mico generado por la enzima a una longitud de onda de 270 nm en la que absorbe el doble enlace generado.</p>     <p>    <center><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02img1.gif"></center></p>     <p>Para realizar la cuantificaci&oacute;n espectrofotom&eacute;trica   del &aacute;cido cin&aacute;mico generado,   se realiz&oacute; una curva de calibraci&oacute;n   (270 nm) en el rango de concentraciones   en las que se presenta linealidad. Los resultados   en esta parte se expresaron como   actividad espec&iacute;fica (nmoles &aacute;cido cin&aacute;mico/   min*mg prote&iacute;na) y como actividad   por gramo de material vegetal (nmoles &aacute;cido cin&aacute;mico/g material vegetal).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Selecci&oacute;n de condiciones para   la extracci&oacute;n de la PAL a partir de tallos y ra&iacute;ces de clavel</p>     <p>Bajo estas condiciones preliminares de cuantificaci&oacute;n se llev&oacute; a cabo la selecci&oacute;n de los par&aacute;metros para la extracci&oacute;n de esta enzima en tallos y ra&iacute;ces de clavel, usando esquejes de tres semanas de enraizamiento de la variedad Carolina, tolerante al marchitamiento vascular causado por Fusarium oxysporum f. sp. dianthi raza 2. Cada tratamiento se realiz&oacute; por triplicado y la evaluaci&oacute;n de actividad por duplicado. Los tratamientos iniciales utilizados para extraer la enzima se muestran en la <a href="#tab1">Tabla 1</a>.</p>     <p>    <center><a name="tab1"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02tab1.gif"></center></p>     <p>Los tratamientos 2 y 3 se basaron en la   metodolog&iacute;a reportada previamente para   la extracci&oacute;n de enzimas similares en esta   especie vegetal (7). En el tratamiento 3 se   utiliz&oacute; un amortiguador frecuentemente   reportado para la extracci&oacute;n de esta enzima   en diferentes fuentes vegetales (13).   As&iacute; mismo, teniendo en cuenta que en   esta evaluaci&oacute;n realizada en ra&iacute;ces la relaci&oacute;n   material vegetal: amortiguador de   extracci&oacute;n que generaba los mejores resultados   en cuanto a la actividad extra&iacute;da   era la 1:3 (<a href="#fig1">Figura 1</a>), esta fue la que se us&oacute;   para el caso de la selecci&oacute;n en tallo. En la   <a href="#tab2">Tabla 2</a> se presentan los tratamientos ensayados para este &uacute;ltimo &oacute;rgano.</p>     <p>    <center><a name="tab2"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02tab2.gif"></center></p>     <p>    <center><a name="fig1"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02fig1.gif"></center></p>     <p>Seleccionadas las condiciones de extracci&oacute;n   m&aacute;s favorables para esta enzima,   se evalu&oacute; el efecto que presentaba el pH del amortiguador de extracci&oacute;n (<a href="#tab3">Tabla 3</a>).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>    <center><a name="tab3"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02tab3.gif"></center></p>     <p>Considerando lo reportado por varios   autores, se ensayaron los amortiguadores fosfato de sodio 100 mM pH 7,0 (13 y 14) y borato 100 mM pH 8,8 (15). Para este experimento se mantuvieron constantes algunos de los aditivos reportados por (13) de acuerdo con los resultados obtenidos previamente. Los ensayos a partir de este punto se hicieron de manera conjunta en tallos y raíces de clavel con el fin de evaluar la posible presencia de diferentes isoformas en las partes de la planta y considerando también el efecto que podía tener la composición de la matriz de extracción.</p>     <p>Algunos procedimientos sugieren el   uso adicional de PVPP (polivinil polipirrolidona)   durante la extracci&oacute;n de esta   enzima, con el fin de eliminar completamente   los compuestos fen&oacute;licos que pueden   actuar como inhibidores de la misma   (7 y 10). Para evaluar el efecto que presentaba   este pol&iacute;mero en la extracci&oacute;n de   la PAL, bajo las condiciones ya seleccionadas   hasta este punto, se compararon los   niveles de actividad con y sin la adici&oacute;n   de este compuesto. Los tratamientos ensayados   se encuentran resumidos en la <a href="#tab4">Tabla 4</a>.</p>     <p>    <center><a name="tab4"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02tab4.gif"></center></p>     <p><b>Selecci&oacute;n de condiciones para   determinar la actividad de la PAL   en extractos obtenidos a partir de tallos y ra&iacute;ces de clavel </b></p>     <p>Una vez escogida la metodolog&iacute;a para la   extracci&oacute;n de la enzima a partir de tallos y   ra&iacute;ces de clavel, se evaluaron las condiciones   adecuadas para la determinaci&oacute;n   de su actividad. Para ello, con extractos   obtenidos bajo las condiciones seleccionadas   previamente, se determin&oacute; el efecto   que presentaban par&aacute;metros como la   concentraci&oacute;n de sustrato, pH, temperatura   y tiempo de reacci&oacute;n. Dichos ensayos   se realizaron para extractos obtenidos   tanto de tallos como de ra&iacute;ces de manera   independiente. Para cada par&aacute;metro evaluado,   cada una de las determinaciones de   actividad se realiz&oacute; por duplicado. Se contaba en este punto con un ensayo discontinuo usando fenilalanina como sustrato, a una concentraci&oacute;n final de 5 mM en un amortiguador borato 60 mM a pH 8,8. Tanto la mezcla de reacci&oacute;n como los blancos correspondientes se manten&iacute;an a 37 &ordm;C por 1 hora, para posteriormente detener la reacci&oacute;n con un calentamiento por 10 min a 80 &ordm;C. De acuerdo con ensayos previos, se seleccion&oacute; que la relaci&oacute;n enzima-sustrato m&aacute;s conveniente para la cuantificaci&oacute;n de esta enzima tanto en tallos como en ra&iacute;ces era de 50 &micro;L de extracto en una mezcla de reacci&oacute;n (15 &micro;g de prote&iacute;na aproximadamente) con un volumen final de 450 &micro;L. Posteriormente, bajo las condiciones experimentales anteriormente descritas, se determin&oacute; la concentraci&oacute;n de sustrato que generaba los mejores resultados en cuanto a actividad espec&iacute;fica. Para ello se mantuvieron constantes los dem&aacute;s par&aacute;metros y la concentraci&oacute;n de fenilalanina se vari&oacute; en el rango de 5 mM a 50 mM.</p>     <p>Determinada la mejor relaci&oacute;n enzima-   sustrato, y manteniendo los dem&aacute;s   par&aacute;metros constantes, se evalu&oacute; el efecto   del pH en la reacci&oacute;n. Con este fin, se   utilizaron los amortiguadores acetato de   sodio-&aacute;cido ac&eacute;tico a pH 4,0, citrato de   sodio &ndash; &aacute;cido c&iacute;trico en el rango de 4 a 6;   el amortiguador Na2HPO4- NaH2PO4 en   el rango de 6,0 a 8,0, el amortiguador borato   pH 9, glicina &ndash; NaOH a pH 10 y Na2HPO4- Na3PO4 a pH 11.</p>     <p>Con el pH y la relaci&oacute;n enzima-sustrato   seleccionados, se evalu&oacute; el efecto de la   temperatura en la actividad enzim&aacute;tica.   Para tal fin se determinaron las actividades   enzim&aacute;ticas a 0, 21, 37, 45, 55, 64,   81 y 90 &ordm;C, y se escogi&oacute; la que present&oacute; los mayores niveles. Por &uacute;ltimo, se evalu&oacute; el tiempo &oacute;ptimo de reacci&oacute;n determinando, con los par&aacute;metros previamente seleccionados (relaci&oacute;n enzima-sustrato, pH y temperatura), la actividad para los tiempos 0, 10, 20, 30, 45 y 60 min.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Evaluaci&oacute;n de la inducci&oacute;n de la PAL   en el ensayo in vivo, usando como elicitor extracto crudo del hongo</b></p>     <p>Con el fin de evaluar el efecto del tratamiento   con elicitores obtenidos de Fusarium   oxysporum f. sp. dianthi raza 2 en la   actividad de la enzima en estudio a nivel   del tallo, se dispuso de un dise&ntilde;o experimental   totalmente aleatorizado con 4 tratamientos   (T1 variedad tolerante control,   T2 variedad tolerante inoculada, T3 variedad   tolerante aspersi&oacute;n y T4 variedad   tolerante inmersi&oacute;n), con muestreos a las   0, 6, 12, 24, 48, 96 y 192 horas posinoculaci&oacute;n.   El tratamiento con la fracci&oacute;n cruda   del hongo, se realiz&oacute; por aspersi&oacute;n sobre   los tallos de los esquejes y por   inmersi&oacute;n de las ra&iacute;ces. Con el tratamiento   de inmersi&oacute;n (T3) se buscaba simular   las condiciones de inoculaci&oacute;n que son   propias del pat&oacute;geno en su interacci&oacute;n natural   con la planta. A su vez, el tratamiento   con aspersi&oacute;n (T4) pretend&iacute;a evaluar la   factibilidad de una inducci&oacute;n mediante un   tratamiento externo que asemejara las   condiciones usadas en campo para la aplicaci&oacute;n   de productos usados como parte   del control de plagas. Los esquejes sometidos   a los diferentes tratamientos se mantuvieron   bajo las mismas condiciones de   temperatura, iluminaci&oacute;n y humedad. La   extracci&oacute;n se realiz&oacute; con triplicado para   cada tratamiento. La cuantificaci&oacute;n de la   actividad se hizo por duplicado en cada   uno de los extractos obtenidos usando las condiciones previamente seleccionadas.</p>     <p>El an&aacute;lisis estad&iacute;stico de los resultados se   llev&oacute; a cabo mediante un an&aacute;lisis sencillo   de varianza (Anova) usando la prueba de   Tuckey para asignar grupos estad&iacute;sticamente similares.</p>     <p><b>RESULTADOS Y DISCUSI&Oacute;N</b></p>     <p><b>Selecci&oacute;n de condiciones para   la extracci&oacute;n de PAL a partir de tallos y ra&iacute;ces de clavel</b></p>     <p>Para evaluar la actividad enzim&aacute;tica de   PAL durante el ensayo in vivo, se requer&iacute;an   unas condiciones favorables y confiables   tanto para su extracci&oacute;n como   para su cuantificaci&oacute;n en extracto crudo.   Es por ello que los primeros ensayos realizados   en el presente estudio pretend&iacute;an   evaluar cu&aacute;l era el efecto de la utilizaci&oacute;n   de los polvos de acetona y cu&aacute;l procedimiento   general era el adecuado para la extracci&oacute;n   de la enzima de inter&eacute;s a partir de   tallos y ra&iacute;ces de clavel. En este punto es   importante citar que, aunque el ensayo   evalu&oacute; la inducci&oacute;n solo a nivel del tallo,   la evaluaci&oacute;n de condiciones de extracci&oacute;n   y cuantificaci&oacute;n en ra&iacute;ces pretend&iacute;a   comparar con lo encontrado en tallo y de   esta manera indagar acerca de la posible   presencia de diferentes isoformas en estos   dos &oacute;rganos. La utilizaci&oacute;n de los polvos   de acetona es determinante para poder   llevar a cabo una adecuada extracci&oacute;n   de esta enzima a nivel de la ra&iacute;z (Figura   1). Dicho tratamiento elimina de manera   eficiente los fen&oacute;licos y pigmentos que   interfieren durante la cuantificaci&oacute;n espectrofotom&eacute;trica   del &aacute;cido cin&aacute;mico generado   durante el ensayo de actividad. Se   puede observar, adem&aacute;s, que con los tratamientos   4 y 5 se presentan mejores resultados   en cuanto a la selectividad de la extracci&oacute;n, pues la actividad por mg de prote&iacute;na es mayor al compararla con los dem&aacute;s tratamientos, al nivel de significancia trabajado (=0,05). No existen diferencias en cuanto a la relaci&oacute;n material vegetal: amortiguador de extracci&oacute;n; la relaci&oacute;n 1:3 fue la seleccionada para realizar los ensayos en el tallo.</p>     <p>Los resultados obtenidos en el tallo   (<a href="#fig2">figura 2</a>) coinciden con lo encontrado   previamente en la ra&iacute;z e indican que la extracci&oacute;n   de esta enzima en clavel se ve favorecida   al usar aditivos que com&uacute;nmente   se utilizan para la extracci&oacute;n de algunas enzimas en diferentes fuentes vegetales.</p>     <p>    <center><a name="fig2"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02fig2.gif"></center></p>     <p>Por ejemplo, se reporta frecuentemente el   uso de beta mercaptoetanol para la extracci&oacute;n   de enzimas que presenten grupos   sulfidrilo libres. Estos aditivos, a su vez,   adem&aacute;s de dar mayor estabilidad a la enzima   en soluci&oacute;n, hacen que la extracci&oacute;n pueda llevarse a cabo de manera m&aacute;s selectiva.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Una vez se seleccionaron estas condiciones,   se dispuso evaluar, tanto en tallos   como en ra&iacute;ces, el efecto del pH del amortiguador   usado durante la extracci&oacute;n (<a href="#fig3">Figura   3</a>). La evaluaci&oacute;n se llev&oacute; a cabo tanto en   tallos como en ra&iacute;ces de manera conjunta   con fines comparativos. En este ensayo se   mantienen constantes los aditivos previamente   seleccionados y las condiciones de extracci&oacute;n previamente descritas.</p>     <p>    <center><a name="fig3"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02fig3.gif"></center></p>     <p>Los resultados indican que el pH de   mayor extracci&oacute;n fue de 8,8 tanto para tallos   como para ra&iacute;ces, el cual coincide   con los pH de extracci&oacute;n usados para este   tipo de enzimas (13) e indica, adem&aacute;s,   que es probable que las isoenzimas de la   PAL en clavel presenten pI &aacute;cidos. Afirmaci&oacute;n   sustentada por la tendencia de   prote&iacute;nas con puntos isoel&eacute;ctricos menores   de 7 a presentar una alta carga y por   ende importante solubilidad a pH b&aacute;sico.   Por otro lado, tal y como se describe en la   parte experimental, tambi&eacute;n se evalu&oacute; el   efecto que tiene el PVPP en el proceso de extracci&oacute;n (<a href="#fig4">Figura 4</a>).</p>     <p>    <center><a name="fig4"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02fig4.gif"></center></p>     <p>El PVPP se utiliza frecuentemente   para la extracci&oacute;n de prote&iacute;nas que presentan   interferencia con compuestos fen&oacute;licos,   teniendo en cuenta la capacidad   que presenta para retener este tipo de   compuestos. Como se puede observar en   la <a href="#fig4">Figura 4</a>, en ra&iacute;ces la utilizaci&oacute;n de   PVPP en el amortiguador de extracci&oacute;n   disminuye la actividad. Esta disminuci&oacute;n   indica que es probable que los residuos de   tipo arom&aacute;tico que se presentan en las enzimas   PAL de clavel generen una retenci&oacute;n   de la prote&iacute;na en este pol&iacute;mero insoluble y una posterior disminuci&oacute;n en los niveles finales de actividad en el extracto. Dichos residuos arom&aacute;ticos que, de acuerdo con el an&aacute;lisis de amino&aacute;cidos de la secuencia de PAL1 en clavel (BAB19128.1) con la herramienta bioinform&aacute;tica pepstat de EMBOSS, son el 9% de la secuencia primaria, se encuentran principalmente en dominios altamente conservados para este tipo de enzimas, que son caracter&iacute;sticos de la familia de PAL presentes en diferentes plantas y microorganismos (Conserved Domain 00332 en la base de datos del NCBI). De acuerdo con los alineamientos realizados con las secuencias que presentan este dominio y la secuencia de la enzima PAL1 de clavel (BAB19128.1), estos a.a. se mantienen en esta &uacute;ltima y es probable que cumplan un papel funcional en este tipo de enzimas, justificando aun m&aacute;s el efecto inactivador de la PVPP. Por otro lado, al menos con los ensayos realizados a este punto, es evidente que no existen muchas diferencias entre las enzimas presentes en tallos y ra&iacute;ces. Es por ello que las condiciones finales seleccionadas y recomendadas para la extracci&oacute;n de esta enzima a partir de tallos y ra&iacute;ces de clavel consisten en un tratamiento con acetona a &ndash;15 &ordm;C al material vegetal macerado con nitr&oacute;geno l&iacute;quido y una posterior extracci&oacute;n en una relaci&oacute;n 1:3 con el amortigudor borato pH 8,8 que contiene EDTA 2 mM y beta mercaptoetanol 18 mM.</p>     <p><b>Selecci&oacute;n de condiciones para   la cuantificaci&oacute;n de PAL en extractos   obtenidos a partir de tallos y ra&iacute;ces de clavel</b></p>     <p>Una vez determinadas las condiciones de   extracci&oacute;n de esta enzima, se seleccionaron   las mejores para su cuantificaci&oacute;n.   Tal y como se describe en la metodolog&iacute;a,   se eval&uacute;an diferentes par&aacute;metros con el   fin de optimizar el ensayo enzim&aacute;tico.   Los resultados obtenidos para la enzima PAL de los diferentes par&aacute;metros evaluados en tallos y ra&iacute;ces de clavel se resumen en la <a href="#fig5">Figura 5</a>.</p>     <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center><a name="fig5"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02fig5.gif"></center></p>     <p>Como se puede observar en la <a href="#fig5">Figura   5</a>, el comportamiento de la actividad con   respecto a los valores de temperatura de   reacci&oacute;n es similar para extractos obtenidos   de los dos &oacute;rganos de la planta en estudio,   siendo mayores en un valor de 37   &ordm;C, temperatura frecuentemente reportada   como &oacute;ptima para este tipo de enzimas   (5 y 16). Sin embargo, para los otros par&aacute;metros   evaluados, se presentan diferencias   importantes entre tallos y ra&iacute;z lo que   indica que es probable, tal y como ha sido   reportado en otras fuentes vegetales (8 y   17), que en clavel se presenten diferencias   en cuanto a las isoenzimas en estos   dos &oacute;rganos. Los valores seleccionados   con estos ensayos para la cuantificaci&oacute;n   de la actividad en extractos obtenidos a   partir de tallo son: concentraci&oacute;n de sustrato   35 mM, pH 8,0, temperatura 37 &ordm;C   y tiempo de reacci&oacute;n de 10 min. Estos resultados   son similares a los encontrados   en otras fuentes vegetales, como es el   caso del pH, en donde 8,8 es el valor m&aacute;s   frecuentemente encontrado como &oacute;ptimo   para PAL de plantas (13, 14 y 15). A su vez, para ra&iacute;z esta evaluaci&oacute;n gener&oacute; los siguientes resultados: concentraci&oacute;n de sustrato 20 mM, pH 6,0, temperatura 37 &ordm;C y tiempo de reacci&oacute;n de 20 min. Este conjunto de resultados permite evidenciar que es probable que exista una expresi&oacute;n diferencial de isoformas de la PAL en tallos y ra&iacute;ces de clavel, lo cual estar&iacute;a de acuerdo con reportes generados por el grupo del japon&eacute;s Yoshimoto (18), quienes realizando ensayos de Southern Blot encontraron al menos 5 isoformas para esta enzima en clavel. Con el fin de confirmarlo se requieren an&aacute;lisis electrofor&eacute;ticos de las diferentes isoformas en los extractos obtenidos de estos dos &oacute;rganos. Por otro lado, estos resultados confirman tambi&eacute;n que es necesario realizar este tipo de estudios para llevar a cabo evaluaciones confiables de la actividad enzim&aacute;tica en diferentes &oacute;rganos, a pesar de que se trate de un mismo genotipo vegetal.</p>     <p><b>Evaluaci&oacute;n de la inducci&oacute;n de la PAL   durante el tratamiento con el extracto del pat&oacute;geno</b></p>     <p>En este punto se cuenta con un conjunto   de condiciones que permiten no solo realizar   la mayor extracci&oacute;n de la enzima,   sino cuantificar la actividad de esta enzima   de manera confiable. Con las condiciones   seleccionadas, los resultados de la   evaluaci&oacute;n de la actividad enzim&aacute;tica de   la PAL en los diferentes tratamientos de   inducci&oacute;n propuestos para los diferentes   tiempos de muestreo, se presentan resumidos   en la <a href="#fig6">Figura 6</a>. En estos se puede   observar que los niveles de la enzima   PAL se mantienen con cambios moderados   la mayor parte del tiempo de estudio   para el tratamiento control (T1, a excepci&oacute;n   de las 96 horas), lo cual indica que las condiciones ambientales del ensayo no afectaron los procesos en los que se encuentra involucrada esta enzima. Este hecho permite evidenciar que la utilizaci&oacute;n de estos controles se hace necesaria con el fin de asegurar que los resultados encontrados se presenten debido exclusivamente al fen&oacute;meno que se quiere evaluar y no debido a las condiciones externas del ensayo.</p>     <p>    <center><a name="fig6"></a><img src="img/revistas/rcq/v36n2/v36n2a02fig6.gif"></center></p>     <p>Con respecto a los resultados obtenidos   en este ensayo, se puede evidenciar   que los niveles de actividad en el tallo   para esquejes de la variedad tolerante permanecen   constantes a lo largo del estudio,   en todos los tiempos de muestreo, tanto   para controles &ldquo;T1&rdquo; como para plantas   inoculadas con el pat&oacute;geno &ldquo;T2&rdquo;. Estos   resultados indican que la activaci&oacute;n de la   ruta fenilpropanoide como parte de la respuesta   ante el ataque del pat&oacute;geno a nivel   del tallo es inexistente, al menos en los   tiempos evaluados y con la variedad tolerante   usada. Este ensayo muestra que   cuando la acumulaci&oacute;n de compuestos fen&oacute;licos   se presenta a nivel del tallo durante   el ataque del pat&oacute;geno (19), puede deberse   a la activaci&oacute;n de otras rutas   metab&oacute;licas de bios&iacute;ntesis diferentes a la   fenilpropanoide, fen&oacute;meno que se ha propuesto   recientemente en otras especies   vegetales (20). Por otro lado, como se   puede observar en los tratamientos T3 y   T4, mientras que el tratamiento con aspersi&oacute;n   no gener&oacute; cambios en la actividad   de la PAL, a ninguno de los tiempos evaluados,   el tratamiento de inmersi&oacute;n de las   ra&iacute;ces en el extracto del hongo (T4) present&oacute;   una inducci&oacute;n estad&iacute;sticamente mayor   a las 12 h posinoculaci&oacute;n. Este efecto   se present&oacute; de manera exclusiva con esta   t&eacute;cnica de elicitaci&oacute;n, e indica que con la   otra t&eacute;cnica (aspersi&oacute;n) no se tiene ning&uacute;n efecto sobre la actividad de la enzima. La inmersi&oacute;n de las ra&iacute;ces en el extracto crudo del hongo, que se asemeja a la t&eacute;cnica de inoculaci&oacute;n usada para evaluar los efectos relacionados con la infecci&oacute;n (21), permite que en el punto natural de contacto del pat&oacute;geno, la ra&iacute;z, se perciban el conjunto de elicitores que se encuentran en el extracto crudo del pat&oacute;geno. Resultados similares en otros modelos que involucran pat&oacute;genos del g&eacute;nero Fusarium han mostrado tambi&eacute;n inducci&oacute;n de la ruta fenilpropanoide ante tratamientos similares con fracciones crudas del pat&oacute;geno (5). En estos estudios tambi&eacute;n se ha encontrado que, a pesar de que la naturaleza qu&iacute;mica de las mol&eacute;culas con actividad elicitora puede ser muy variada, los carbohidratos podr&iacute;an ser determinantes para que se presente esta actividad en extractos crudos de este tipo de pat&oacute;genos (5). Es importante destacar que, de acuerdo con este estudio, en el modelo clavel-Fod estos elicitores generan una inducci&oacute;n que se presenta &uacute;nicamente durante el tratamiento con el extracto crudo, mas no con el pat&oacute;geno directamente, lo cual indica que existen mecanismos particulares de regulaci&oacute;n de la planta o supresi&oacute;n por parte del pat&oacute;geno, que pueden en un momento dado determinar la expresi&oacute;n final de la inducci&oacute;n de la respuesta de defensa y que son regulados negativamente ante la presencia del pat&oacute;geno. Fen&oacute;menos como la acci&oacute;n de supresores de mecanismos de defensa han sido involucrados en este tipo de comportamientos (22).</p>     <p><b>CONCLUSI&Oacute;N</b></p>     <p>En este estudio se evidencia la complejidad   de los procesos de reconocimiento   del pat&oacute;geno Fusarium oxysporum f. sp.   dianthi, agente causal del marchitamiento   vascular en el clavel. Dichos procesos a   su vez determinan que se presente en un   momento dado la expresi&oacute;n final de la   respuesta de defensa que tiene como objetivo   localizar el pat&oacute;geno y detener su   avance a trav&eacute;s de los tejidos de la planta.   Con estos resultados se evidenci&oacute; adem&aacute;s   la capacidad que tiene el clavel para reconocer   elicitores del pat&oacute;geno y el papel de   estos &uacute;ltimos para inducir en la planta una   respuesta relacionada con defensa. La   complejidad de estos procesos confirma   que estudios encaminados a su elucidaci&oacute;n   son fundamentales en la b&uacute;squeda de   los fen&oacute;menos bioqu&iacute;micos de defensa   que presentan algunas variedades de clavel ante el ataque por este pat&oacute;geno.</p>     <p><b>REFERENCIAS BIBLIOGR&Aacute;FICAS</b></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>1. Dixon, R. A.; Pavia, N. L. Stress- induced   phenylpropanoid metabolism. Plant Cell. 1995. 7: 1085- 1097.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000083&pid=S0120-2804200700020000200001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  2. Alain-M., B. Lignins and lignification:   Selected issues. Plant Physiol.   Biochem. 2000. 38: 81-96.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000084&pid=S0120-2804200700020000200002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  3. Mohammadi, M.; Kamesi, H. Changes   in peroxidase and polyphenol   oxidase activities in susceptible and   resistant wheat heads inoculated whit   Fusarium graminearum and induced   resistance. Plant Science. 2002. 162:   491-498.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000085&pid=S0120-2804200700020000200003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  4. Heather M. Way, Kemal Kazan,   Neena Mitter, Kenneth C. Goulter,   Robert G. Birch and John M. Manners.   Constitutive expression of a   phenylalanine ammonia-lyase gene   from Stylosanthes humilis in transgenic   tobacco leads to enhanced disease   resistance but impaired plant   growth. Physiological and Molecular   Plant Pathology. 2002. 60:   275-282.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000086&pid=S0120-2804200700020000200004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  5. Modafar, El; Tantaoui, A.; Boustani,   El. Differential induction of   Phenylalanine ammonia-liase activity   in date palm roots in response to   inoculation with Fusarium oxysporum   f. sp. albedinis and to elicitation   with fungal wall elicitor. Journal of   Plant Physiology. 2001. 158:   715-722.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000087&pid=S0120-2804200700020000200005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  6. Higuera, B. L. Contribuci&oacute;n al estudio   de la participaci&oacute;n de los compuestos   fen&oacute;licos en los mecanismos   de la interacci&oacute;n clavel Dianthus   caryophyllus L-Fusarium oxysporum   f. sp. dianthi. 2001. Tesis de doctorado   en Qu&iacute;mica. Universidad Nacional   de Colombia. Bogot&aacute;.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000088&pid=S0120-2804200700020000200006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  7. Ardila, H. D.; Higuera, B. L. Inducci&oacute;n   diferencial de Polifenol oxidasa   y -1,3-glucanasa en clavel (Dianthus   caryophyllus L.) durante la infecci&oacute;n   por Fusarium oxysporum f. sp.   dianthi raza 2. Acta Biol&oacute;gica Colombiana.   2005. 10: 65-78.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000089&pid=S0120-2804200700020000200007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  8. Cochrane, F. C.; Davin, L. B.; Lewis,   N. G. The Arabidopsis phenylalanine   ammonia liase gene family:   Kinetic characterization of the four   PAL isoformas. Phytochemistry.   2004. 65: 1557-1564.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000090&pid=S0120-2804200700020000200008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  9. Dubois, M.; Gilles, K. A.; Hamilton,   J. K.; Rebers, P. A.; Smith, F. Colorimetric method for determination   of sugars and related substances.   Anal. Chem. 1956. 28: 350-355.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000091&pid=S0120-2804200700020000200009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>10. Alunni, S.,; Cipiciani, A.; Fiorini,   G.; Ottavi, L. Mechanisms of inhibition   of phenylalanine ammonia-lyase   by phenol inhibitors and phenol/   glycine synergistic inhibitors.   Archives of Biochemistry and Biophysics. 2003. 412: 170-175.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000092&pid=S0120-2804200700020000200010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  11. Bradford, M. A. A rapid and sensitivity   method for detection of binding-   dye proteins. Anal. Biochem.   1976. 72: 248-254.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000093&pid=S0120-2804200700020000200011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  12. Zor and Sellinger. Linearization of   the Bradford protein assay increases   its sensitivity: Theorical and experimental   studies. Anal. Biochem.   1996. 236: 302.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000094&pid=S0120-2804200700020000200012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  13. Camacho, J. J.; Anzelloti, D.;   Gonz&aacute;lez-Fontes, A. Changes in   phenolic metabolism of tobacco   plants during short-term boron deficiency.   Plant Physiol. Biochem.   2002. 40: 997-1002.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000095&pid=S0120-2804200700020000200013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  14. Yuan, Y. J.; Li, C.; Hu, Z. D.; Wu,   J. C.; Zeng, A. P. Fungal elicitor-   induced cell apoptosis in suspension   cultures of Taxus chinensis var.   mairei for Taxol production. Process   Biochemistry. 2002. 38: 193-198.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000096&pid=S0120-2804200700020000200014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  15. De Ascensao, A. R. C. F.; Dubery, I.   A. Panama disease: cell wall reinfoncement   in Banana roots in response to   elicitor from Fusarium oxysporum f.   sp. cubense race four. Phytopathology.   2000. 90: 1173-1180.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000097&pid=S0120-2804200700020000200015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  16. Silva, M. C.; Nicol, M.; Guerra-   Guimaraes, L.; Rodr&iacute;guez, C. J.   Hypersensitive cell death and   post-haustorial defence responses   arrest the orange rust (Hemileia vastatrix)   growth in resistant coffee leaves.   Physiological and Molecular   Plant Pathology. 2002. 60: 169-183.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000098&pid=S0120-2804200700020000200016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  17. Kumar, A.; Ellis, B. E. The Phenylalanine   Ammoinia-Lyase Family in   raspberry. Structure expression and   evolution. Plant Physiology. 2001.   127: 230-239.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000099&pid=S0120-2804200700020000200017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  18. Yoshimoto, Y.; Higeta, D.; Ito, Y.;   Yoshida, H.; Hasebe, M.; Oseki, Y.   Isolation and characterization of a   c-DNA for Phenylalanine Ammonium   Liase (PAL) from carnation   (Dianthus caryophyllus L.). Plant   Biotechnology. 2000. 17: 325-329.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000100&pid=S0120-2804200700020000200018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  19. Niemann, G. J.; Boon, J. J.; Pureveen,   J. B. M.; Eijkel, G. B.; Van   der Heijden, E. A microanalytical   approach to plant tissue characterization:   a comparative study of healthy   and fungus- infected carnation by   pyrolysis- mass spectrometry. J.   Anal. and Appl. Pyrolysis. 1991. 19:   213-236.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000101&pid=S0120-2804200700020000200019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  20. Quiong, Y.; Shi, M.; Ng, J.; Wu, Y.   Elicitor-induced rosmarinic acid accumulation   and secondary metabolism   enzyme activities in Salvia miltiorrhiza   hairy roots. Plant Science.   2006. 170: 853-858.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000102&pid=S0120-2804200700020000200020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>  21. Higuera, B. L.; Montes de, G. V.   Contribution of HPLC to the study of   the defence mechanisms acting in   carnation (Dianthus caryophyllus   L.) roots on infection with Fusarium   oxysporum f. sp. dianthi. Journal of High Resolution Chromatography.   1996. 19: 706-708.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000103&pid=S0120-2804200700020000200021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>22. Ballester, A. R.; Lafuente, M. T.;   Gonz&aacute;lez-Candelas, L. Spatial study   of antioxidant enzymes, peroxidase   and phenylalanine ammonia-lyase in   the citrus fruit - Penicillium digitatum   interaction. 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