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<journal-title><![CDATA[Acta Agronómica]]></journal-title>
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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Detección de una mutación puntual en el gen receptor Ryanodina (Ryr 1) en cerdos criollos colombianos]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Detection of a single mutation point in Ryanodine receptor gene (Ryr 1) in colombian creole pigs]]></article-title>
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<institution><![CDATA[,Universidad Nacional de Colombia Facultad de Ciencias Agropecuarias ]]></institution>
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<country>Colombia</country>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The Porcine Stress Syndrome is a hereditary monogenic recessive disease related with Ryanodine Receptor gen (Ryr1). Using PCR-SSCP and PCR-RFLP 14 animals of commercial breed with Mule foot characteristic (CM), 21 San Pedreño breed (SP) and 100 Zungo breed (ZN) were genotipificated. Allelic frequency for CM and SP was the same (F(H) = 0.79 y F(h) = 0.21), while in ZN there was no evidence of recessive allele (h). Heterocigosity (He) was 0.28% for CM and 0.23% for SP. He value for population sample was 0.066.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font face="verdana" size="2">     <p><b>    <center><font face="verdana" size="4">Detecci&oacute;n de una mutaci&oacute;n puntual en el gen receptor Ryanodina (Ryr 1) en cerdos criollos colombianos</font></center></b></p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">Detection of a single mutation point in Ryanodine receptor gene (Ryr 1) in colombian creole pigs</font></center></b></p>     <p><b>    <center>Darwin Y. Hern&aacute;ndez, Andr&eacute;s Mauricio Posso Terranova, Jaime Eduardo Muñoz Fl&oacute;rez</center></b></p>     <p>Facultad de Ciencias Agropecuarias, Universidad Nacional de Colombia, AA 237, Palmira, Valle del Cauca, Colombia.Autor para correspondencia: <a href="mailto:jemunozf@palmira.unal.edu.co.">jemunozf@palmira.unal.edu.co.</a> </p>     <p>    <center>REC.:23-04-08 ACEPT.:11-11-08</center></p> <hr size="1">     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>RESUMEN</b></p>     <p><b>El s&iacute;ndrome de estr&eacute;s porcino (PSS) es una enfermedad hereditaria monog&eacute;nica recesiva relacionada con el gen receptor ryanodina (Ryr1). Utilizando PCR-SSCP y PCR-RFLP se tipificaron gen&eacute;ticamente 14 individuos de cerdos comerciales con el rasgo sindactilia (Casco de Mula-CM), 21 San Pedreños -SP y 100 Zungos- ZN. Las razas CM y SP tuvieron las mismas frecuencias al&eacute;licas (F(H) = 0.79 y F(h) = 0.21), mientras que en los cerdos ZN no se encontr&oacute; el alelo recesivo (h). La heterocigosidad (He) fue de 0.28% para los cerdos CM y 0.23% para los SP. La He para la muestra poblacional fue de 0.066.</b></p>     <p><b>Palabras clave</b>: Estr&eacute;s porcino; cerdos criollos; PCR-RFLP PCR-SSCP.</p> <hr size="1">     <p><b>ABSTRACT</b></p>     <p><b>The Porcine Stress Syndrome is a hereditary monogenic recessive disease related with Ryanodine Receptor gen (Ryr1). Using PCR-SSCP and PCR-RFLP 14 animals of commercial breed with Mule foot characteristic (CM), 21 San Pedreño breed (SP) and 100 Zungo breed (ZN) were genotipificated. Allelic frequency for CM and SP was the same (F(H) = 0.79 y F(h) = 0.21), while in ZN there was no evidence of recessive allele (h). Heterocigosity (He) was 0.28% for CM and 0.23% for SP. He value for population sample was 0.066.</b></p>     <p><b>Key words</b>: Creole pigs; porcine stress; PCR-SSCP, PCR-RFLP.</p> <hr size="1">     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">INTRODUCCI&Oacute;N</font></center></b></p>     <p>En los &uacute;ltimos treinta y cinco años el objetivo del mejoramiento ha sido la selecci&oacute;n de cerdos magros. A partir de la d&eacute;cada de los años sesenta este progreso se asoci&oacute; en las razas Landrace, Pietran y Poland China, inicialmente en B&eacute;lgica y Alemania, con desorden neuromuscular, alta mortalidad, canales con carne p&aacute;lida, blanda y exudativa (PSE) o carne oscura, dura y seca (DFD) por el s&iacute;ndrome de estr&eacute;s porcino (PSS) o hipertermia maligna (HM) (Shen <i>et al</i>., 1992; O´Brien, 1995; Calvo <i>et al</i>., 1997).</p>     <p>La enfermedad est&aacute; controlada por un gen recesivo del cromosoma 6, llamado inicialmente halotano y en la actualidad receptor de la ryanodina (Ryr1) (Fujii <i>et al</i>., 1991; Dekkers, 1999), constituido por 15.105 nucle&oacute;tidos y con dominancia del alelo normal, por lo cual los individuos pueden presentar genotipos sanos (homocigotos dominantes), portadores (heterocigotos) o enfermos (homocigotos recesivos) (Minkena <i>et al</i>., 1977; Calvo <i>et al</i>., 1997). El gen hace parte de un tr&iacute;o que codifica el canal liberador de calcio (CRC) y que se expresa en el m&uacute;sculo esquel&eacute;tico y en las c&eacute;lulas cerebrales de Purkinje (Harrison, 1981; O&#39; Brien, 1995).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Las pruebas para la detecci&oacute;n van desde no invasivas (halotano, electromiograf&iacute;a) hasta las de car&aacute;cter invasivo (contractura con cafe&iacute;na-halotano, medici&oacute;n de calcio libre en sarcoplasma y test de la contractura <i>in vitro</i> con rianodina) (Barranco <i>et al</i>., 2005).</p>     <p>La gen&eacute;tica molecular puso en evidencia en seis razas la relaci&oacute;n entre PSS y la sustituci&oacute;n de una timina por citosina en el nucle&oacute;tido 1843 (Fujii <i>et al</i>., 1991), que lleva al cambio de una arginina por ciste&iacute;na en la posici&oacute;n 615 del CRC. Otsu <i>et al</i>. (1992) y Calvo <i>et al</i>. (1997) establecieron el diagn&oacute;stico basado en PCR-RFLP. Orita <i>et al</i>. (1989) y Nakajima <i>et al</i>. (1996) desarrollaron el m&eacute;todo PCR-SSCP como t&eacute;cnica sensible y de menor costo para la detecci&oacute;n de la mutaci&oacute;n.</p>     <p>El objetivo de la investigaci&oacute;n fue contribuir al conocimiento de la diversidad gen&eacute;tica de los cerdos criollos colombianos al evaluar la variabilidad de los genes implicados en el control del PSS.</p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">MATERIALES Y M&Eacute;TODOS</font></center></b></p>     <p>Como material gen&eacute;tico se utiliz&oacute; el banco de ADN de cerdos criollos de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira (100 individuos Zungo, 21 San Pedreño y 14 cerdos comerciales con el rasgo sindactilia o Casco de Mula). Las muestras de ADN se diluyeron a un volumen total de 100 <font face="symbol" size="2">m</font>l a 10 ng.ul<sup>-1</sup> de concentraci&oacute;n.</p>     <p>Para estandarizar las condiciones de PCR se evaluaron diez individuos. La amplificaci&oacute;n se realiz&oacute; siguiendo la metodolog&iacute;a descrita por Nakajima <i>et al</i>. (1996) con las siguientes modificaciones: 0.2 mM de cada DNTP, 1.25 mM de cada cebador (<i>Forward</i> 5&#34;-TCC AGT TTG CCA CAG GTC CTA CCA-3&#39; y <i>Reverse</i> 5&#39;-ATT CAC CGG AGT GGA GTC TCT GAG -3&#39;), 2.5 mM de MgCl2, 1X <i>Buffer Taq</i>, 1U de Taq DNA polimerasa a un volumen final de 25 <font face="symbol" size="2">m</font>l, aumento en la concentraci&oacute;n del gel de poliacrilamida al 12% (100:1 acrilamida – bisacrilamida) y el uso de glicerol (5%) para mejorar la separaci&oacute;n de las bandas. Las muestras se sometieron a un perfil t&eacute;rmico de 95 &degC durante 5 min, seguido de 35 ciclos de 95&degC por 1 min, 62&degC por 1 min, 72 &degC por 1 min y una extensi&oacute;n final a 72 &degC por 7 min. La amplificaci&oacute;n se llev&oacute; a cabo en un termociclador PTC 100 Programmable Termal Controller (MJ. Research, Inc). Los fragmentos amplificados se visualizaron en un gel de agarosa al 1.2% y el tamaño se compar&oacute; con un marcador de peso molecular de 100 pb Fermetas &reg;</p>     <p>Para la <i>PCR-SSCP</i> los productos amplificados se separaron mediante electroforesis usando una c&aacute;mara Whatman Biometra de 93 x 147 mm y geles de poliacrilamida al 12% (100:1 acrilamida – bisacrilamida) con 5% de glicerol. Cada muestra (10 <font face="symbol" size="2">m</font>l) se mezcl&oacute; con 3 <font face="symbol" size="2">m</font>l de buffer desnaturante (95% formamida, 0.25% azul de bromofenol, 0.25% xylene cyanol), se sometieron a 95&deg;C durante 5 min y se pusieron en hielo inmediatamente. Se cargaron 8 <font face="symbol" size="2">m</font>l de la mezcla y se corri&oacute; el gel a 150 voltios durante 12 h a 4&degC aproximadamente, en <i>buffer</i> TBE 0.5X. La tinci&oacute;n se realiz&oacute; usando sales de plata (Sambroock <i>et al</i>., 1989).</p>     <p>Para la PCR-RFLP 10 <font face="symbol" size="2">m</font>l producto de amplificados por PCR se incubaron con 5U de la enzima de restricci&oacute;n Alw21I (Hgi AI) (sitio de reconocimiento; -5&#39;GT (A) GCT (A) <font face="symbol" size="2">&#175;</font>C3&#39;-) durante 6 h a 37&deg;C y luego se sometieron a 65&deg;C durante 20 min para inactivar la enzima. Luego 5 ul de cada muestra digerida se mezcl&oacute; con 1 ul de proteinasa K (10ug/ul) e incub&oacute; durante 1 h a 37&deg;C para desnaturalizar la enzima de restricci&oacute;n. La muestras se mezclaron con 1 ul de buffer de carga (0.25% de azul de bromofenol, 0.25% de xylene cyanol, 60% de glicerol) y se separaron mediante electroforesis en geles de poliacrilamida a 6% (37:1 acrilamida – bisacrilamida). Se cargaron 5 ul de la mezcla y se corri&oacute; el gel a 150 voltios durante 45 minutos en buffer TBE 0.5X. La tinci&oacute;n se realiz&oacute; usando sales de plata (Sambroock <i>et al</i>., 1989).</p>     <p>Una vez tipificados gen&eacute;ticamente todos los individuos se calcularon las frecuencias de los alelos y se estim&oacute; la heterocigosidad mediante el programa TFPGA&reg; (Tools for population genetic analyses) versi&oacute;n 1.3 de 1997.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>    <center><font face="verdana" size="3">RESULTADOS Y DISCUSI&Oacute;N</font></center></b></p>     <p>Se amplific&oacute; el fragmento de inter&eacute;s de 659 pb (<a href="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a10f01.jpg" target="blank">Figura 1</a>) correspondiente a la zona con la mutaci&oacute;n puntual en el gen R<ub>yr</sub> 1. Los patrones de migraci&oacute;n de las bandas permitieron identificar los alelos del gen en PCR-SSCP. Las bandas del genotipo homocigoto dominante (HH) migraron a mayor distancia. La primera banda para el genotipo HH migr&oacute; la misma distancia que la segunda banda para el genotipo hh; la condici&oacute;n heterocigota (Hh) mostr&oacute; patr&oacute;n de movilidad intermedio (<a href="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a10f02.jpg" target="blank">Figura 2</a>).</p>     <p>La PCR-RFLP del fragmento de 659 bp digerido con la enzima Alw21I gener&oacute; fragmentos de 524 y 135-bp para el genotipo HH; de 524, 358, 166 y 135-bp para el genotipo Hh y para el genotipo hh fragmentos de 358, 166 y 135-bp (<a href="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a10f03.jpg" target="blank">Figura 3</a>).</p>     <p>La identificaci&oacute;n de la mutaci&oacute;n puntual en el gen Ryr1 se mostr&oacute; por el cambio en el patr&oacute;n de digesti&oacute;n de la enzima en la banda de mayor tamaño (524 bp genotipo HH) que se cort&oacute; en dos fragmentos, uno de 358 y otro de 166 bp.</p>     <p>Los individuos de raza Zungo presentaron genotipo HH (<a href="#Tabla 1">Tabla 1</a>), lo que indica que no se han cruzado con razas que presentan el alelo h y puede explicar la cr&iacute;a en explotaciones campesinas en condiciones clim&aacute;ticas contrastantes como las costas atl&aacute;ntica y pac&iacute;fica. Esta caracter&iacute;stica, unida a la rusticidad y adaptabilidad, ratifican la importancia de la conservaci&oacute;n de las razas criollas. En los cerdos &#34;Casco de Mula&#34; cruzados con h&iacute;bridos comerciales la frecuencia para el alelo h se atribuy&oacute; al cruzamiento.</p>     <p>    <center><a name="Tabla 1"><img src="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a10t01.gif"></a></center></p>     <p>Los valores de heterocigosidad (<a href="#Tabla 2">Tabla 2 </a>) fueron de 0.28 para CM, 0.23 para SP y 0.0 para ZN. La heterocigosidad para toda la muestra poblacional fue de 0.066. Nakajima <i>et al</i>. (1996) encontraron una heterocigosidad m&aacute;s alta (0.12), lo cual puede deberse a una muestra poblacional m&aacute;s grande (606) y heterog&eacute;nea de razas comerciales (Pietran, Landrace, Large White, Duroc y otras).</p>     <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center><a name="Tabla 2"><img src="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a10t02.gif"></a></center></p>     <p>Si se mantienen baja la frecuencia del alelo h y la heterocigosidad dentro de cada raza se evitar&aacute;n descendencias portadoras (Hh) y positivas a la enfermedad (hh).</p>     <p>Como las t&eacute;cnicas PCR-SSCP y PCR-RFLP son codominantes y detectaron heterocigotos y homocigotos para el gen h, la genotipificaci&oacute;n de reproductores (machos y hembras) permitir&aacute; seleccionar individuos que no presenten el alelo y en una generaci&oacute;n se eliminar&aacute; el s&iacute;ndrome de estr&eacute;s porcino en la poblaci&oacute;n.</p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">CONCLUSIONES</font></center></b></p>     <p>Se estandarizaron las t&eacute;cnicas moleculares PCR-SSCP y PCR-RFLP para la detecci&oacute;n del s&iacute;ndrome del estr&eacute;s porcino.</p>     <p>Los cerdos de la raza Zungo no presentaron el alelo recesivo, en cerdos comerciales la frecuencia fue 0.29.</p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">AGRADECIMIENTOS</font></center></b></p>     <p>A la Direcci&oacute;n de Investigaci&oacute;n de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira (DIPAL) por la financiaci&oacute;n del experimento.</p> <b>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center><font face="verdana" size="3">BIBLIOGRAF&Iacute;A</font></center></b></p>     <!-- ref --><p>1. Barranco, F.; Blasco, J.; Morales, M.; Muñoz, S.; Jareño, C.; Cozar, J.; <i>et al</i>. 2005. S&iacute;ndromes hipert&eacute;rmicos; hipertemia maligna. Disponible en:<a href=http://tratado.uninet.edu/c090305.html. target="blank">http://tratado.uninet.edu/c090305.html. </a> Acceso: 11-20-2006.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000054&pid=S0120-2812200800040001000001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>2. Calvo, J. H.; Osta, R.; Garc&iacute;a-Muro, E.; Zaragoza, P. 1997. S&iacute;ndrome de estr&eacute;s porcino: aplicaci&oacute;n y ventajas de la PCR para su diagn&oacute;stico. <i>Med Vet</i> 14(2): 110-113.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000055&pid=S0120-2812200800040001000002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>3. Dekkers, J. C. M. 1999. Optimizing strategies for selection on major genes. p1-16. <i>In</i>: Plant Animal Genome, 7, St. Diego, CA.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000056&pid=S0120-2812200800040001000003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>4. Fujii, J.; Otsu, K.; Zorzato, F.; De Le&oacute;n, S.; Khanna, V.K.; Weiler, J.E.; <i>et al</i>. 1991. Identification of mutation in porcine ryanodine receptor associated with malignant hiperthermia. <i>Science</i>. 253: 448-451.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000057&pid=S0120-2812200800040001000004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>5. Harrison, G. 1981. The malignant hiperthermia porcine. <i>Int Anesthesiol Clin</i> 17 (4): 19-47.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000058&pid=S0120-2812200800040001000005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>6. Minkena, D.; Eikelemboom, G.; VAN Eldik, P. 1977. Inheritance of MHS- susceptibility in pigs. p 203-220. <i>In</i>: International Conference on Production Disease in Farm Animals, 3 rd, Wageningen, Netherlands. Pudoc Proceding.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000059&pid=S0120-2812200800040001000006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>7. Nakajima, E.; Matsumoto, T.; Yamada, R.; Kawakami, K.; Takeda, K.; Ohnishi, A.; <i>et al</i>. 1996. Technical note : Use of a PCR-single conformation polymorphism (PCR-SSCP) for detection of a point mutation in the swin Ryanodine Receptor (RYR1) <i>gene. J Anim Sci</i>. 74: 2904-2906.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000060&pid=S0120-2812200800040001000007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>8. O&#39; Brien, P. J. 1995. The causative mutation for porcine stress syndrome. <i>Food Animal</i>. 257-269.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000061&pid=S0120-2812200800040001000008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>9. Orita, M.; Suzuki, Y.; Sekiya, Y.; Hayashi K. 1989. Rapid and sensitive detection of point mutations and DNA polymorphisms using the polymerase chain reaction. <i>Genomics</i> 5: 874.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000062&pid=S0120-2812200800040001000009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>10. Otsu, K.; Phillips, M. S.; Khanna, V. K.; Leon, S.; Mac Lennan, D. H. 1992. Refinement of diagnostic assays for a probable causal mutation of porcine and human malignant hyperthermia. <i>Genomics</i> 13: 835.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000063&pid=S0120-2812200800040001000010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>11. Sambrook, J.; Fritsch, E.F.; Maniatis, T. 1989. Molecular Cloning: A laboratory manual. 2<sup>nd</sup> ed. New York: Cold Spring Harbor. 3v.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000064&pid=S0120-2812200800040001000011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>12. Shen, H.; Lahucky, R.; Kovac, L.; O&#39; Brien, J. P. 1992. 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