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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Identificación de algunos genes asociados al proceso de germinación de la conidia al micelio en Paracoccidioides brasiliensis]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Introduction. Paracoccidioides brasiliensis is a thermo-dimorphic fungus. At room temperature it grows as a mold that produces conidia, whereas in the vertebrate host it grows as a multiple-budding yeast. The molecular mechanisms involved in the germination from the conidia to the mycelia process remain unknown. Objective. The kinetics of conidia to mycelia germination process were studied in the dimorphic fungus P. brasiliensis. Gene expression during this process was evaluated by construction and analysis of an EST library. Materials and methods. For the germination kinetics study, P. brasiliensis conidia were isolated as single cell units. Then, they were cultured at 18° C in BHI (brain-heart infusion) broth for 24, 48, 72 and 96 hr. After each perion, they were examined by light microscopy. From conidia harvested at 96 hr, an EST library was constructed; at this stage the gene expression was presumed to be maximal for the germination process. Results. During the conidia to the mycelia developmental process, the following germination rates were observed: at 24 hr, 11.7±1.2%; at 48 hr, 30±0.6%; at 72 hr, 43±1.3%; and at 96 hr, 66±2.4%. At the 96 hour stage, an EST library was constructed. It consisted of 129 sequences grouped in 4 contigs and 7 singlets for a total of 11 possible genes. Eight of the sequences had not been described previously in other EST libraries of this fungus. Conclusions. New genes were identified that were expressed during the conidia to the mycelia germination process and may represent genes specific to the germination process.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  ART&Iacute;CULO ORIGINAL <font face="verdana" size="2">     <p><font size="4">    <center><b>Identificaci&oacute;n de algunos genes asociados al proceso de germinaci&oacute;n de la conidia al micelio en <i>Paracoccidioides brasiliensis</i></b></center></font></p>     <p>    <center>Ana Mar&iacute;a Garc&iacute;a<sup>1,2</sup>, Orville Hern&aacute;ndez<sup>1,3</sup>, Beatriz H. Aristiz&aacute;bal<sup>4</sup>, Luz Elena Cano<sup>3,5</sup>, &Aacute;ngela Restrepo<sup>3</sup>, Juan G. McEwen<sup>1,6</sup></center></p>      <p><sup>1   </sup>Unidad de Biolog&iacute;a Celular y Molecular, Corporaci&oacute;n para Investigaciones Biol&oacute;gicas, Medell&iacute;n, Colombia</p>      <p><sup>2  </sup>Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Pontificia Bolivariana, Medell&iacute;n, Colombia </p>      <p><sup>3   </sup>Unidad de Micolog&iacute;a M&eacute;dica y Experimental, Corporaci&oacute;n para Investigaciones Biol&oacute;gicas, Medell&iacute;n, Colombia</p>      <p><sup>4  </sup>Laboratorio de Biolog&iacute;a Molecular, Hospital Pablo Tob&oacute;n Uribe, Medell&iacute;n, Colombia</p>      <p><sup>5   </sup>Escuela de Microbiolog&iacute;a, Universidad de Antioquia, Medell&iacute;n, Colombia</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><sup>6  </sup>Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia, Medell&iacute;n, Colombia </p>      <p>Recibido: 07/11/08; aceptado:26/03/09</p> <hr size="1">     <p><b>Introducci&oacute;n.</b> <i>Paracoccidioides brasiliensis </i>es un hongo dim&oacute;rfico t&eacute;rmico, que a temperatura ambiente se presenta como un moho productor de conidias, mientras que en el hu&eacute;sped se comporta como una levadura de gemaci&oacute;n m&uacute;ltiple. Los mecanismos moleculares que rigen la germinaci&oacute;n de conidia a micelio a&uacute;n se desconocen.</p>      <p><b>Objetivo.</b> Estudiar en<i> P. brasiliensis</i> la cin&eacute;tica del proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio y determinar los genes expresados durante este proceso mediante la construcci&oacute;n y el an&aacute;lisis de una librer&iacute;a EST (<i>Expressed Sequence Tag</i>).</p>      <p><b>Materiales y m&eacute;todos.</b> Para el estudio de la cin&eacute;tica de germinaci&oacute;n, se produjeron y aislaron conidias de <i>P. brasiliensis</i>. Estas fueron incubadas en cultivos l&iacute;quidos a 18&ordm;C por 24, 48, 72 y 96 horas, y se examinaron por microscop&iacute;a de luz. A partir de conidias cultivadas por 96 horas, se construy&oacute; y caracteriz&oacute; una librer&iacute;a EST, la cual representar&iacute;a los genes expresados durante el proceso de germinaci&oacute;n.</p>      <p><b>Resultados.</b> Durante el proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio, se observ&oacute; 11,7&plusmn;1,2%, 30&plusmn;0,6%, 43&plusmn;1,3% y 66&plusmn;2,4% de germinaci&oacute;n a las 24, 48, 72 y 96 horas de incubaci&oacute;n, respectivamente. Adem&aacute;s, se obtuvo una librer&iacute;a del proceso de germinaci&oacute;n consistente en 129 secuencias agrupadas en cuatro secuencias contiguas y siete secuencias &uacute;nicas, para un total de 11 posibles genes. Ocho secuencias (72,7%) no hab&iacute;an sido descritas anteriormente en otras librer&iacute;as informadas para este hongo y podr&iacute;an representar genes espec&iacute;ficos de la germinaci&oacute;n de conidia a micelio.</p>      <p><b>Conclusiones.</b> &Eacute;ste es el primer reporte en el que se identifican genes no descritos anteriormente, que son expresados durante la germinaci&oacute;n de conidia a micelio, proceso de gran importancia en la biolog&iacute;a de <i>P. brasiliensis.</i> </p>      <p><b>Palabras clave:</b> <i>Paracoccidioides</i>, esporas f&uacute;ngicas, micelio, germinaci&oacute;n.</p> <hr size="1">     <p><font size="3"><b>Identification of genes associated with germination of conidia to form mycelia in the fungus <i>Paracoccidioides brasiliensis</i></b></font></p>      <p><b>Introduction.</b> <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> is a thermo-dimorphic fungus. At room temperature it grows as a mold that produces conidia, whereas in the vertebrate host it grows as a multiple-budding yeast. The molecular mechanisms involved in the germination from the conidia to the mycelia process remain unknown. </p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Objective.</b> The kinetics of conidia to mycelia germination process were studied in the dimorphic fungus <i>P. </i>brasiliensis. Gene expression during this process was evaluated by construction and analysis of an EST library.</p>      <p><b>Materials and methods.</b> For the germination kinetics study, <i>P. brasiliensis</i> conidia were isolated as single cell units. Then, they were cultured at 18&ordm; C in BHI (brain-heart infusion) broth for 24, 48, 72 and 96 hr. After each perion, they were examined by light microscopy. From conidia harvested at 96 hr, an EST library was constructed; at this stage the gene expression was presumed to be maximal for the germination process.  </p>      <p><b>Results.</b> During the conidia to the mycelia developmental process, the following germination rates were observed:  at 24 hr, 11.7&plusmn;1.2%; at 48 hr, 30&plusmn;0.6%; at 72 hr, 43&plusmn;1.3%; and at 96 hr, 66&plusmn;2.4%. At the 96 hour stage, an EST library was constructed. It consisted of 129 sequences grouped in 4 contigs and 7 singlets for a total of 11 possible genes.  Eight of the sequences had not been described previously in other EST libraries of this fungus.  </p>      <p><b>Conclusions.</b> New genes were identified that were expressed during the conidia to the mycelia germination process and may represent genes specific to the germination process. </p>      <p><b>Key words: </b><i>Paracoccidioides;</i> spores; fungal; mycelium, germination.</p> <hr size="1">     <p>La paracoccidioidomicosis, enfermedad infecciosa end&eacute;mica de &aacute;reas tropicales y subtropicales de Centroam&eacute;rica y Suram&eacute;rica, es causada por el hongo dim&oacute;rfico t&eacute;rmico <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> (1,2). La paracoccidioidomicosis es una enfermedad cr&oacute;nica que afecta especialmente a hombres adultos, trabajadores del campo. La enfermedad se desarrolla cuando las part&iacute;culas infecciosas (conidias o fragmentos de micelio) que se alojan en los alv&eacute;olos pulmonares del hu&eacute;sped, realizan el proceso de transici&oacute;n hacia levadura, como respuesta para la supervivencia en los tejidos (3,4).</p>      <p>En cultivos a 37&ordm;C y en los tejidos mismos,<i> P. brasiliensis</i> se encuentra en forma de levadura, estructura que se reproduce por gemaci&oacute;n m&uacute;ltiple que le confiere el aspecto t&iacute;pico de un tim&oacute;n de barco (2). A temperaturas entre 18&ordm;C y 24&ordm;C, el hongo se desarrolla como un moho provisto de micelios delgados, ramificados y tabicados que, en medios de cultivo pobres en carbohidratos, producen diversos tipos de microconidias (2 a 5 &micro;m), que se consideran las part&iacute;culas infecciosas (4). La conidia es una estructura en reposo que, cuando encuentra un medio propicio, comienza su proceso de germinaci&oacute;n a micelio, si se encuentra en el medio ambiente o a temperaturas menores de 26&ordm;C, o inicia la transici&oacute;n a levadura, si entra en contacto con un hospedero mam&iacute;fero o si es cultivada a 36&ordm;C (2).</p>      <p>La transici&oacute;n de micelio a levadura ha sido estudiada por diversos investigadores, y se ha logrado establecer una escala de estadios morfol&oacute;gicos de esta transici&oacute;n y permitir su cuantificaci&oacute;n (5-8). De esta manera, el desarrollo de levaduras a partir del micelio se da desde el primer d&iacute;a del cambio t&eacute;rmico y el desarrollo de levaduras de gemaci&oacute;n m&uacute;ltiple se presenta despu&eacute;s de 5 d&iacute;as (8) y se alcanza el 50% de la transici&oacute;n a las 48 horas de iniciado el proceso (5). De igual manera, se ha estudiado la transici&oacute;n de levadura a micelio (5-7) y se han evaluado los cambios morfol&oacute;gicos que ocurren durante este proceso, los que muestran elongaci&oacute;n de las c&eacute;lulas en gemaci&oacute;n con muerte y desintegraci&oacute;n de las c&eacute;lulas madre y conversi&oacute;n a micelio de 50% a 60% de las c&eacute;lulas, a las 48 horas del cambio t&eacute;rmico.</p>      <p>De igual manera, la transici&oacute;n de conidia a levadura ha sido ampliamente estudiada por diversos autores,<i> </i>tanto en ensayos <i>in vivo </i>(9-11) como <i>ex vivo</i> (12-15); &eacute;stos han demostrado que, en promedio, el 50% de esta transici&oacute;n se logra despu&eacute;s de 48 horas de incubaci&oacute;n a 36&ordm;C y llega hasta el 80% a las 72 horas. Sin embargo, es poco lo que se conoce sobre el proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio. Restrepo <i>et al</i>. (16) reportaron por primera vez el proceso de germinaci&oacute;n <i>in vitro</i> y demostraron que la elongaci&oacute;n de las hifas ocurr&iacute;a despu&eacute;s de 60 horas de incubaci&oacute;n a 25&ordm;C. Posteriormente, Restrepo <i>et al</i>. (Restrepo BI, McEwen JG, Salazar ME, Restrepo A. The mycelial form of<i> Paracoccidioides brasiliensis</i>. In: X Congress of the International Society for Human and Animal Mycology-ISHAM; 1988. p. 143-8) confirmaron el desarrollo del proceso de germinaci&oacute;n, indicando que a 25&ordm;C y en 96 horas, se produc&iacute;an los tubos germinales, los que posteriormente progresaban hasta llegar a elementos de micelios.</p>      <p>Con respecto a la evaluaci&oacute;n de los mecanismos moleculares y de la expresi&oacute;n de genes en los di-ferentes estadios morfol&oacute;gicos, se han realizado varios estudios utilizando estrategias, tales como la construcci&oacute;n de librer&iacute;as EST (<i>Expressed Sequence Tag</i>) y los microarreglos, con los que se ha logrado recopilar un gran n&uacute;mero de genes que se expresan durante los estadios de micelio y levadura (5,17,18), as&iacute; como genes que presentan expresi&oacute;n diferencial durante la transici&oacute;n de micelio a levadura (6,19). Estos estudios han abierto las puertas al conocimiento de los mecanismos gen&eacute;ticos que rigen la diferenciaci&oacute;n morfol&oacute;gica de <i>P. brasiliensis</i>; sin embargo, los procesos moleculares involucrados en los cambios morfol&oacute;gicos de las conidias y los genes involucrados en su transici&oacute;n a levadura y germinaci&oacute;n a micelio, han sido muy poco estudiados. No obstante, a partir de ARNm obtenido a las 48 horas del proceso de transici&oacute;n, fue posible construir una peque&ntilde;a librer&iacute;a EST, compuesta por 79 posibles secuencias, de las cuales, 39 no fueron encontradas en otras librer&iacute;as de <i>P. brasiliensis</i> y que, por lo tanto, parecen ser espec&iacute;ficas de la transici&oacute;n de conidia a levadura, ya que no hab&iacute;an sido descritas previamente en otras librer&iacute;as obtenidas a partir de este hongo (Garc&iacute;a AM, <i>et al</i>. En prensa, Medical Mycology).</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>De esta manera, en este trabajo se describe la cin&eacute;tica de la germinaci&oacute;n de conidia a micelio, as&iacute; como la construcci&oacute;n y an&aacute;lisis de una librer&iacute;a EST obtenida a partir del ARNm extra&iacute;do a las 96 horas de tal proceso de germinaci&oacute;n.</p>      <p><b>Materiales y m&eacute;todos</b></p>      <p><b><i>Aislamiento de P. brasiliensis y mantenimiento del hongo</i></b></p>      <p>Se utiliz&oacute; la cepa de <i>P. brasiliensis</i> ATCC N&ordm;60855, depositada en la <i>American Type Culture Collection</i>, provenientes de la colecci&oacute;n de la Corporaci&oacute;n para Investigaciones Biol&oacute;gicas, la cual es productora de conidias (20). La cepa fue mantenida en su fase micelial en medio s&oacute;lido Mycosel&reg; (BD, Sparks, MD USA) y en medio sint&eacute;tico McVeight Morton modificado (SMVM) (21) a 18&ordm;C por dos a tres semanas.</p>      <p><b><i>Producci&oacute;n y purificaci&oacute;n de conidias de P. brasiliensis</i></b></p>      <p>Para la producci&oacute;n de las conidias se utiliz&oacute; el protocolo previamente descrito por Restrepo <i>et al</i>. (20) en el cual la cepa es mantenida en su fase de micelio en medio s&oacute;lido para hongos SMVM (21) a 18&ordm;C durante dos a tres semanas para, posteriormente, transferir el correspondiente crecimiento de micelios a medio SMVM l&iacute;quido e incubarlo a 18&ordm;C en agitaci&oacute;n constante (150 rpm) por dos semanas. El crecimiento obtenido era homogenizado por licuado (<i>Waring blendor</i>) y transferido a medios de cultivo pobres en carbohidratos (agar agua), con incubaci&oacute;n a 18&ordm;C por un per&iacute;odo m&iacute;nimo de tres meses, tiempo necesario para la esporulaci&oacute;n del hongo (20).</p>      <p>Para la obtenci&oacute;n de las conidias, se us&oacute; la estrategia de purificaci&oacute;n con lana de vidrio, la cual fue utilizada, tanto para realizar la cin&eacute;tica de la germinaci&oacute;n como para obtener el ARNm destinado a la construcci&oacute;n de las librer&iacute;as.</p>      <p>Para la purificaci&oacute;n con lana de vidrio, se lavaron las cajas con soluci&oacute;n salina 0,85% m&aacute;s Tween 20 al 0,01%; la suspensi&oacute;n se transfiri&oacute; a un Erlenmeyer con perlas de vidrio y se puso en agitaci&oacute;n a 250 rpm por 45 minutos a temperatura ambiente (18&ordm;C), con el fin de fragmentar el micelio y liberar las conidias. Posteriormente, la purificaci&oacute;n se realiz&oacute; pasando la suspensi&oacute;n de conidias por jeringas rellenas con lana de vidrio, en la cual los rastros de micelios quedaban atrapados, obteni&eacute;ndose s&oacute;lo las part&iacute;culas m&aacute;s peque&ntilde;as correspondiente a las conidias (20).</p>      <p>Los sedimentos obtenidos con este protocolo, se lavaron dos veces con PBS y se centrifugaron a 1.500<i>g</i> a 4&ordm;C por 30 minutos para, finalmente, resuspenderlos en 1 ml de PBS del correspondiente lavado con conidias. Con ellas se prepar&oacute; una diluci&oacute;n 1:10, con la cual se hizo recuento del n&uacute;mero de conidias en hemocit&oacute;metro y la prueba de viabilidad por la t&eacute;cnica de bromuro de etidiodiacetato de fluoresce&iacute;na (BE-DF) (22).</p>      <p><b><i>Determinaci&oacute;n de la cin&eacute;tica de germinaci&oacute;n de conidia a micelio de P. brasiliensis</i></b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Esta cin&eacute;tica se realiz&oacute; en microplatos de cultivo celular (Linbro&reg; <i>Tissue culture multi-well plate</i> ICN: 7636405) con medio BHI (<i>Brain Heart Infusion</i> BD, USA), l&iacute;quido con suplemento de glucosa al 1% y asparagina al 0,2%, platos que se inocularon con 25.000 conidias por pozo, con incubaci&oacute;n a 18&ordm;C y agitaci&oacute;n constante por 24, 48, 72 y 96 horas. En cada uno de los tiempos se&ntilde;alados, se realiz&oacute; observaci&oacute;n microsc&oacute;pica directa de los platos y se determin&oacute; la tasa de germinaci&oacute;n basada en los cambios morfol&oacute;gicos descritos previamente, para evaluar la geminaci&oacute;n con base en: i) la producci&oacute;n de tubo germinal, ii) la elongaci&oacute;n de las hifas y iii) la producci&oacute;n de micelio (Restrepo BI, McEwen JG, Salazar ME, Restrepo A. The mycelial form of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i>. In: X Congress of the International Society for Human and Animal Mycology - ISHAM; 1988. p.143-8) (6).</p>      <p><b><i>Obtenci&oacute;n de ARN total</i></b></p>      <p>El ARN total se obtuvo despu&eacute;s de exponer las conidias a inducci&oacute;n t&eacute;rmica de 18&ordm;C por 96 horas, rompiendo las c&eacute;lulas por maceraci&oacute;n con nitr&oacute;geno l&iacute;quido y con posterior extracci&oacute;n mediante la t&eacute;cnica del Trizol&reg;, de acuerdo con las indicaciones del fabricante (Invitrogen Life Technologies, Pasley, CA., U.S.A, Cat: 15596-026).</p>      <p><b><i>Amplificaci&oacute;n de los &aacute;cidos nucleicos y obtenci&oacute;n de ADNc</i></b></p>      <p>El ARN obtenido de las conidias se purific&oacute; utilizando el juego de reactivos PicoPure&reg; (Aracturus Mountain View, CA. USA. Cat. Kit 0202). Posteriormente, a partir de este ARN total purificado, se amplific&oacute; el ARNm utilizando el juego de reactivos RiboAmp&reg; (Aracturus, Mountain View CA, USA. Cat. Kit 0201). El ARNm as&iacute; amplificado fue transcrito a ADNc utilizando Superscript&reg; (juego de reactivos Superscript&reg; cloning Kit-Invitrogen Life Technologies, Pasley, CA., USA, Cat. 18248-013) y siguiendo las indicaciones del fabricante.</p>      <p><b><i>Construcci&oacute;n de la librer&iacute;a EST</i></b></p>      <p>Una vez obtenido el ADNc, &eacute;ste se clon&oacute; utilizando el juego de reactivos TOPO TA (Cloning&reg; kit for sequencing, Invitrogen, Life Technologies, Pasley, CA., USA, Cat. K450030) y siguiendo las indicaciones del fabricante. Posteriormente, el material se transform&oacute; en la cepa de <i>Escherichia coli </i>DH5 a por electroporaci&oacute;n. Las c&eacute;lulas  transformadas<b> </b>se cultivaron en caldo de Luria s&oacute;lido con 100 &micro;g/ml de ampicilina, IPTG (20 &micro;g/ml) y Xgal (100 &micro;g/ml), para confirmar la p&eacute;rdida de la acomplementaci&oacute;n. Las colonias blancas as&iacute; obtenidas se aislaron individualmente y se cultivaron a 37&ordm;C toda la noche en placas de 96 pozos con caldo de Luria l&iacute;quido m&aacute;s 15% de glicerol y 100 &micro;g/ml de ampicilina para, posteriormente, ser almacenadas a -80<sup>o</sup>C.</p>      <p><b><i>Secuenciaci&oacute;n de pl&aacute;smidos</i></b></p>      <p>Para obtener el material destinado a secuenciaci&oacute;n, se realiz&oacute; una<i> miniprep </i>en placa de 96 pozos, seg&uacute;n el protocolo descrito por Marra <i>et al</i>. (23). La secuenciaci&oacute;n de los fragmentos insertados en los pl&aacute;smidos as&iacute; obtenidos, se realiz&oacute; utilizando Big Dye&reg;, versi&oacute;n 3.0 (Applied Biosystems Foster City, California USA), con el iniciador M13R, el que se utiliz&oacute; como plantilla para los pl&aacute;smidos ya extra&iacute;dos, llev&aacute;ndolos a un secuenciador autom&aacute;tico de fluorescencia ABI 3100 (ABI PRISM&reg;), por el Grupo de Biolog&iacute;a Molecular de la Facultad de Ciencias Farmac&eacute;uticas de la Universidad de S&atilde;o P&atilde;ulo, Ribeir&atilde;o Preto, Brasil.</p>      <p><b><i>An&aacute;lisis de las librer&iacute;as</i></b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>El an&aacute;lisis y ensamblaje de la secuencias de la librer&iacute;a EST se realiz&oacute; mediante un <i>pipeline</i> programado por el Grupo de Biolog&iacute;a Molecular de la Facultad de Ciencias Farmac&eacute;uticas de la Universidad de S&atilde;o P&atilde;ulo, Ribeir&atilde;o Preto, Brasil, mediante el cual se editaban las secuencias autom&aacute;ticamente, limpi&aacute;ndolas de las secuencias no deseadas, como son las secuencias del vector, ARNr de hongos y secuencias correspondientes a bacterias. Posteriormente, el programa agrup&oacute; las secuencias (<i>clustering</i>) para obtener las secuencias contiguas (<i>contigs</i>) y las secuencias &uacute;nicas (<i>singlets</i>). El <i>pipeline</i> se construy&oacute; por medio de los programas Phrap (24) and Cap3 (25). Una vez depurada la informaci&oacute;n de las secuencias obtenidas a partir de la librer&iacute;a, aqu&eacute;llas se evaluaron contra diferentes bases de datos, buscando la similitud con secuencias de genes y prote&iacute;nas previamente reportadas. Para este an&aacute;lisis se utilizaron los programas BlastN y BlastX con las bases de datos de GenBank (<a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/" target="_blank">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/</a>), EMB -Fungal EST (<a href="http://www.ebi.ac.uk/blast2/nucleotide.html" target="_blank">http://www.ebi.ac.uk/blast2/nucleotide.html</a>) y la base de los EST de levaduras publicados por Goldman <i>et al</i>. (http://143.107.203.68/pbver2/default.html) (5).</p>      <p>La validez de la identidad de las secuencias se categoriz&oacute; con base en el valor de E (probabilidad de error) obtenido en los resultados del Blast. Se obtuvo, tambi&eacute;n, el porcentaje de secuencias seg&uacute;n su categor&iacute;a funcional. Las categor&iacute;as funcionales establecidas fueron: respuesta al estr&eacute;s, se&ntilde;alizaci&oacute;n intracelular, metabolismo, estructura, prote&iacute;na hipot&eacute;tica conservada y prote&iacute;na hipot&eacute;tica. Se evalu&oacute;, adem&aacute;s, el porcentaje de secuencias presentes en las librer&iacute;as EST de Goldman y Felipe en 2003, mediante la la base de datos Fungi-EST del EMBL, con el fin de determinar aqu&eacute;llas que, por no estar presentes en estas librer&iacute;as, pod&iacute;an considerarse secuencias espec&iacute;ficas del proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio (5,17,26).</p>      <p><b>Resultados</b></p>      <p><b><i>Cin&eacute;tica de la germinaci&oacute;n</i></b></p>      <p>Durante el seguimiento de la cin&eacute;tica de la germinaci&oacute;n, se observ&oacute; que 11,7&plusmn;1,2% de las conidias hab&iacute;an producido tubos germinales o hifas cortas a las 24 horas de incubaci&oacute;n a 18&ordm;C. Posteriormente, despu&eacute;s de las 48 horas, la proporci&oacute;n de c&eacute;lulas germinadas aumentaba a 30&plusmn;0,6%, anot&aacute;ndose un crecimiento paralelo en la longitud de las hifas; fue, entonces, que las primeras hifas ramificadas se hicieron evidentes, aunque en baja proporci&oacute;n. A las 72 horas, el 43&plusmn;1,3% de las conidias presentaban ya germinaci&oacute;n, con un aumento en la presencia de hifas ramificadas. Finalmente, a las 96 horas, el 66&plusmn;2,4 de las conidias hab&iacute;a germinado y se observaban hifas largas ramificadas (<a href="#figura1">figura 1</a>).</p>     <p>    <center><a name="figura1"><img src="img/revistas/bio/v29n3/3a09i1.jpg"></a></center></p>     <p><b><i>Construcci&oacute;n y an&aacute;lisis de la librer&iacute;a</i></b></p>      <p>A partir del ARNm de conidias cultivadas a 18&ordm;C por 96 horas, se obtuvo una librer&iacute;a compuesta por 198 colonias, las que se conservaron a -80ºC. Despu&eacute;s de la extracci&oacute;n de pl&aacute;smidos, la secuenciaci&oacute;n de los insertos y del paso de las secuencias obtenidas por el <i>pipeline</i>, se obtuvieron 129 secuencias, las cuales se agruparon en siete secuencias contiguas y siete secuencias &uacute;nicas, para un total de 14 posibles secuencias codificantes para prote&iacute;nas relacionadas con la germinaci&oacute;n de conidia a micelio. Durante el an&aacute;lisis Blast, se descartaron cuatro secuencias adicionales, dada su alta similitud con secuencias ribos&oacute;micas y mitocondriales (secuencias contiguas 1, 3 y 4), dejando 11 posibles genes, 4 secuencias contiguas y 5 secuencias &uacute;nicas que correspondieron a prote&iacute;na hipot&eacute;tica o prote&iacute;na hipot&eacute;tica conservada (c&oacute;digos de acceso en GenBank, <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov" target="_blank">http://www.ncbi.nlm.nih.gov</a>). Las caracter&iacute;sticas m&aacute;s importantes de las secuencias contiguas y las secuencias &uacute;nicas se describen en el <a href="#cuadro1">cuadro 1</a>.</p>     <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center><a name="cuadro1"><img src="img/revistas/bio/v29n3/3a09t1.gif"></a></center></p>     <p>Al comparar la librer&iacute;a de germinaci&oacute;n de conidia a micelio con las librer&iacute;as EST obtenidas por Goldman <i>et al</i>. (5) y Felipe <i>et al</i>. (17), se encontr&oacute; que 4 de las 11 posibles secuencias estaban presentes en estas librer&iacute;as, 3 de ellas en la descrita por Goldman <i>et al</i>. y una en ambas (<a href="#cuadro2">cuadro 2</a>). Adem&aacute;s, al comparar nuestros resultados con los obtenidos por otros investigadores, como Nunes <i>et al</i>. (6), Tavares <i>et al</i>. (27), Bailao <i>et al</i>. (28) y Bastos <i>et al</i>. (19), no fue posible encontrar similitudes en las secuencias descritas por ellos y las nuestras.</p>     <p>    <center><a name="cuadro2"><img src="img/revistas/bio/v29n3/3a09t2.gif"></a></center></p>     <p>Se evidenci&oacute;, asimismo, nueva informaci&oacute;n al analizar las secuencias completas reportadas en GenBank halladas por el an&aacute;lisis BLAST, que pose&iacute;an homolog&iacute;a con los clones de la librer&iacute;a. Este an&aacute;lisis se hizo nuevamente por BLAST en el NCBI. De esta manera, la prote&iacute;na hipot&eacute;tica de <i>Podospora anserina</i> correspondiente al <i>contig</i> 02, present&oacute; similitud con una prote&iacute;na RcaA de respuesta al da&ntilde;o del ADN (<i>DNA damage response protein RcaA</i>), la prote&iacute;na hipot&eacute;tica de <i>Aspergillus nidulans</i> correspondiente al <i>contig </i>06 present&oacute; una similitud significativa con una prote&iacute;na putativa formadora de filamentos, Tpr/p270 (<i>Filament-forming protein putative</i>, Tpr/p270) y la prote&iacute;na hipot&eacute;tica conservada de <i>Aspergillus fumigatus</i> correpondiente al <i>singlet</i> 02 present&oacute; gran similitud con la prote&iacute;na ribos&oacute;mica S15 (<a href="#cuadro3">cuadro 3</a>)</p>     <p>    <center><a name="cuadro3"><img src="img/revistas/bio/v29n3/3a09t3.gif"></a></center></p>     <p><b>Discusi&oacute;n</b></p>      <p>La transici&oacute;n de conidia a levadura ha sido bien documentada por diversos autores; no as&iacute; el proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio que s&oacute;lo fue estudiado por Restrepo <i>et al</i>. (Restrepo BI, McEwen JG, Salazar ME, Restrepo A. The mycelial form of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i>. In: X Congress of the International Society for Human and Animal Mycology - ISHAM; 1988. p. 143-8) al describirlo por primera vez. Los resultados de este primer estudio se correlacionan adecuadamente con los obtenidos en este documento, en el cual se presentaron tiempos similares de evoluci&oacute;n a los descritos previamente.</p>      <p>El fen&oacute;meno de transici&oacute;n de levadura a micelio tambi&eacute;n se ha estudiado pero, al igual que en el caso de la germinaci&oacute;n de conidia a micelio, no tan exhaustivamente. Se han descrito algunas caracter&iacute;sticas de este proceso en el cual, a las 48 horas, 50% a 60% de las levaduras han producido ya tubos germinales o primordios de hifas, se&ntilde;al clara del cambio morfol&oacute;gico (5-7,29). Esta transici&oacute;n ocurre de una manera m&aacute;s r&aacute;pida a lo observado en la de conidia a micelio, en donde s&oacute;lo se logra un 66% de germinaci&oacute;n a las 96 horas.</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Con respecto a los genes que estuvieran relacionados con el proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio, nada se ha descrito hasta el momento, ya que el inter&eacute;s siempre se ha centrado en la expresi&oacute;n de genes durante la transici&oacute;n de conidia a levadura, dada su importancia en el proceso patog&eacute;nico, mientras que los mecanismos relacionados con la permanencia del hongo en la naturaleza se encuentran sin estudiar. &Eacute;sta es la primera vez que se describen secuencias g&eacute;nicas posiblemente relacionadas con el proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio en <i>P. brasiliensis</i>.</p>      <p>De las secuencias descritas en esta librer&iacute;a, tres se encontraban presentes en la de levaduras descrita por Goldman <i>et al</i>. (5) y una estaba presente en las de Felipe <i>et al</i>. (17) y Goldman <i>et al</i>. (5), lo que demuestra su participaci&oacute;n en los estadios morfol&oacute;gicos de micelio, de levadura o de ambos. Las siete secuencias restantes no hab&iacute;an sido descritas anteriormente, por lo cual pueden considerarse como secuencias espec&iacute;ficas del proceso de germinaci&oacute;n de conidia a micelio. Sin embargo, debe tenerse en cuenta que estas secuencias podr&iacute;an corresponder a regiones g&eacute;nicas diferentes ya descritas, pero que no detectan secuencias similares dentro las librer&iacute;as EST dada su naturaleza, ya que las EST corresponden, usualmente, s&oacute;lo a secuencias parciales de los genes, hecho que debe ser verificado con an&aacute;lisis adicionales.</p>      <p>Adem&aacute;s, cuatro secuencias se clasificaron como prote&iacute;nas hipot&eacute;ticas conservadas (posibles prote&iacute;nas descritas en otros organismos, pero de funci&oacute;n desconocida) y siete fueron prote&iacute;nas hipot&eacute;ticas (no descritas previamente en otros organismos). Asimismo, no se encontr&oacute; ninguna similitud entre estos resultados y los obtenidos en otros estudios (6, 19,27,28).</p>      <p>Un an&aacute;lisis posterior de estos genes mostr&oacute; algunos dominios que confieren funci&oacute;n conocida a tres de las secuencias halladas. El <i>contig </i>02 present&oacute; dominios con homolog&iacute;a con una prote&iacute;na RcaA, de respuesta al da&ntilde;o del ADN (<i>DNA damage response protein-RcaA</i>). Esta prote&iacute;na ha sido descrita en <i>A. fumigatus</i>, <i>A. clavatus</i>, <i>Neosartorya fischeri</i> (30) y <i>Pyrenophora triticirepentis</i> (http://kr.expasy.org/uniprot/B2WAW4). En levaduras, las prote&iacute;nas que regulan la respuesta al da&ntilde;o del ADN, tal como lo hace RcaA, tambi&eacute;n se necesitan para mantener la longitud de los tel&oacute;meros, cumpliendo as&iacute; funciones protectoras para la integridad del ADN (31). Su implicaci&oacute;n en el proceso de germinaci&oacute;n no es claro, por lo que ser&iacute;an necesarios nuevos estudios para definir su importancia.</p>      <p>El <i>contig</i> 06 present&oacute; importante similitud con una prote&iacute;na putativa formadora de filamentos, Tpr/p270 (<i>filament-forming protein putative, Tpr/p270</i>). Esta prote&iacute;na ha sido descrita en <i>A. clavatus, A. fumigatus</i> y <i>N. fischeri </i>(http://kr.expasy.org/cgi-bin/sprot-search-de?%22Filamentforming%20protein%20putative%20Tpr%2Fp270 %22).<i> </i>&Eacute;sta hace parte de los poros de la membrana nuclear y parece estar involucrada de diversas maneras con el ensamblaje nuclear, la importaci&oacute;n y el transporte de prote&iacute;nas del citoplasma al n&uacute;cleo (32). Su funci&oacute;n como transportadora de prote&iacute;nas del citoplasma al n&uacute;cleo puede reflejar la fase final de los procesos de transduci&oacute;n de se&ntilde;ales, en los que los factores de trascripci&oacute;n se encargan de llevar a la expresi&oacute;n de nuevas prote&iacute;nas necesarias para el cambio morfol&oacute;gico que representa la germinaci&oacute;n.</p>      <p>El <i>singlet</i> 02, adem&aacute;s de haber sido descrito por Goldman <i>et al</i>. (5) en su librer&iacute;a de levaduras, present&oacute; gran similitud con la prote&iacute;na ribos&oacute;mica S15. La prote&iacute;na S15 es un componente caracter&iacute;stico de los ribosomas de eucariotas 80S y se ubica en la subunidad 40, muy cerca del sitio donde se posiciona el cod&oacute;n del ARNm durante la traducci&oacute;n, lo que se&ntilde;ala una interacci&oacute;n directa en este proceso (33). Esta prote&iacute;na se ha descrito en <i>Ajellomyces capsulata, Botryotinia fuckeliana, Chaetomium globosum </i>y<i> Magnaporthe grisea</i> (http://kr.expasy.org/cgi-bin/sprot-search-de?ribosomal%20S15%20fungus), y tiene una funci&oacute;n b&aacute;sica, ya que est&aacute; presente en todos los estadios de desarrollo durante la s&iacute;ntesis proteica. Sin embargo, puede tener una mayor expresi&oacute;n durante la geminaci&oacute;n, al ser inducida por la presi&oacute;n del cambio morfol&oacute;gico que lleva a la creaci&oacute;n de nuevas estructuras.</p>      <p>Aunque &eacute;ste es el primer estudio que reporta genes relacionados con la germinaci&oacute;n de conidia a micelio, la informaci&oacute;n obtenida es limitada por diversas causas. Una de ellas es el tiempo requerido para la producci&oacute;n de las conidias del hongo, proceso que toma un m&iacute;nimo de tres meses; adem&aacute;s, el n&uacute;mero de conidias obtenidas durante este proceso es limitado y, en el mejor de los casos, no supera los cuatro a cinco millones por caja. Otra es el gran n&uacute;mero de conidias que se necesitan para obtener cantidades adecuadas del ARN destinado a la construcci&oacute;n de las librer&iacute;as (no menos de 250 millones de conidias). Adem&aacute;s, debe tenerse en cuenta que las conidias son prop&aacute;gulas en estado de reposo, con un metabolismo basal caracterizado por m&iacute;nima expresi&oacute;n g&eacute;nica, posible causa de la poca obtenci&oacute;n de ARN. Adem&aacute;s, el bajo n&uacute;mero de clones y posibles genes, bien pudieran representar aquellos genes que son espec&iacute;ficos y est&aacute;n involucrados en el proceso de germinaci&oacute;n. Sin embargo, es muy posible que esta librer&iacute;a no represente todas las funciones celulares involucradas en tal proceso, siendo mucho lo que falta por conocer de &eacute;l.</p>      <p>De esta manera, se hace necesario el desarrollo de nuevos estudios en busca de otros genes relacionados con tal proceso, tales como la construcci&oacute;n de nuevas librer&iacute;as y la continuaci&oacute;n del estudio de los genes hallados en este trabajo, incluyendo la valoraci&oacute;n de la expresi&oacute;n de dichos genes en los diferentes estadios morfol&oacute;gicos, as&iacute; como la evaluaci&oacute;n de su funci&oacute;n utilizando sistemas de ARN de interferencia (ARNi) o ARN antisentido que regulen en el hongo la expresi&oacute;n de estos genes.</p>      <p>    <center><b>Agradecimientos</b></center></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>A todos en la Corporaci&oacute;n para Investigaciones Biol&oacute;gicas que, de alguna manera, colaboraron en este trabajo. A Gustavo Goldman y a su grupo de trabajo del Laboratorio de Biolog&iacute;a Molecular de la Facultad de Ciencias Farmac&eacute;uticas de la Universidad de S&atilde;o P&atilde;ulo, Ribeir&atilde;o Preto, Brasil, por su colaboraci&oacute;n en la secuenciaci&oacute;n y an&aacute;lisis de la librer&iacute;a.</p>      <p>    <center><b>Conflictos de intereses</b></center></p>      <p>Los autores declaran no tener ning&uacute;n conflicto de intereses.</p>      <p>    <center><b>Financiaci&oacute;n</b></center></p>      <p>Este trabajo fue financiado por Colciencias, proyecto aprobado No. 415 22130412669 con contrato No. 476-2002, y por el Centro para Investigaci&oacute;n y Desarrollo-CIDI de la Universidad Pontificia Bolivariana, Medell&iacute;n, registro 7918. Ana Mar&iacute;a Garc&iacute;a recibi&oacute; apoyo del Programa de Apoyo a Doctorados Nacionales de Colciencias y de la Asociaci&oacute;n Colombiana de Infectolog&iacute;a, Cap&iacute;tulo de Antioquia.</p>     <p><b></b>Correspondencia:</p>     <p>Ana Mar&iacute;a Garc&iacute;a, Unidad de Biolog&iacute;a Celular y Molecular, Corporaci&oacute;n para Investigaciones Biol&oacute;gicas, Carrera 72A Nº. 78B-141, Medell&iacute;n, Colombia. Fax: (574) 4415514. <a href="mailto:agarcia@cib.org.co">agarcia@cib.org.co</a></p>     <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center><b>Referencias</b></center></p>      <!-- ref --><p>1. <b>Brummer E, Castaneda E, Restrepo A.</b> Paracoccidioidomycosis: an update. Clin Microbiol Rev.<i> </i>1993;6:89-117.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000094&pid=S0120-4157200900030000900001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>2. <b>Restrepo A, Tobon AM. </b>Chapter 266.<i> Paracoccidioides brasiliensis</i>. In: Mandell GL, Bennetts JE, Dollin, R, editors. Principles and practice of infectious diseases. 6th edition. Philadelphia, P.A: Elsevier; 2005. p. 3062-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000095&pid=S0120-4157200900030000900002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>3. <b>Camilo J, Tabares AM, G&oacute;mez BL, Aristiz&aacute;bal BE, Cock AM, Restrepo A.</b> The oral route in the pathogenesis of paracoccidioidomycosis: an experimental study in BALB/c mice infected with <i>P. brasiliensis</i> conidia. Mycopathologia.<i> </i>2001;151:57-62.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000096&pid=S0120-4157200900030000900003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>4. <b>McEwen JG, Brummer E, Stevens DA, Restrepo A.</b> Effect of murine polymorphonuclear leukocytes on the yeast form of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i>. Am J Trop Med Hyg.<i> </i>1987;36:603-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000097&pid=S0120-4157200900030000900004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>5. <b>Goldman GH, dos Reis E, Duarte DC, de Souza LA, Quiapin AC, Vitorelli PM,<i> et al</i>.</b> Expressed sequence tag analysis of the human pathogen <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> yeast phase: identification of putative homologues of <i>Candida albicans</i> virulence and pathogenicity genes. Eukaryot Cell.<i> </i>2003;2:34-48.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000098&pid=S0120-4157200900030000900005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>6. <b>Nunes LR, Costa de Oliveira R, Leite DB, da Silva VS, dos Reis E, da Silva ME,<i> et al</i>.</b> Transcriptome analysis of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> cells undergoing mycelium-to-yeast transition. Eukaryot Cell.<i> </i>2005;4:2115-28.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000099&pid=S0120-4157200900030000900006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>7. <b>Queiroz-Telles F.</b> <i>Paracoccidioides brasiliensis: Ultra-structural findings</i>. In: Franco LC, Restrepo A, Del Negro G, editors. Paracoccidioidomycosis. Boca Raton, FL: CRC Press; 1994. p. 27-48.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000100&pid=S0120-4157200900030000900007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>8. <b>Salazar ME, Restrepo A.</b> Morphogenesis of the mycelium-to-yeast transformation in <i>Paracoccidioides brasiliensis</i>. Sabouraudia.<i> </i>1985;23:7-11.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000101&pid=S0120-4157200900030000900008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>9. <b>Aristiz&aacute;bal BH, Clemons KV, Stevens DA, Restrepo A.</b> Morphological transition of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> conidia to yeast cells: <i>in vivo</i> inhibition in females. Infect Immun.<i> </i>1998;66:5587-91.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000102&pid=S0120-4157200900030000900009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>10. <b>Cock AM, Cano LE, V&eacute;lez D, Aristiz&aacute;bal BH, Trujillo J, Restrepo A.</b> Fibrotic sequelae in pulmonary paracoccidioidomycosis: histopathological aspects in BALB/c mice infected with viable and non-viable <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> propagules. Rev Inst Med Trop Sao Paulo.<i> </i>2000;42:59-66.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000103&pid=S0120-4157200900030000900010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>11. <b>McEwen JG, Bedoya V, Patino MM, Salazar ME, Restrepo A.</b> Experimental murine paracoccidiodomycosis induced by the inhalation of conidia. J Med Vet Mycol. 1987;25:165-75.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000104&pid=S0120-4157200900030000900011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>12. <b>Cano LE, Brummer E, Stevens DA, Restrepo A.</b> An evaluation of the enzyme-linked immunoabsorbent assay (ELISA) for quantitation of antibodies to <i>Paracoccidioides brasiliensis</i>. J Med Vet Mycol.<i> </i>1986;24:467-75.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000105&pid=S0120-4157200900030000900012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>13. <b>Cano LE, G&oacute;mez B, Brummer E, Restrepo A, Stevens DA.</b> Inhibitory effect of deferoxamine or macrophage activation on transformation of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> conidia ingested by macrophages: reversal by holotransferrin. Infect Immun.<i> </i>1994;62:1494-6.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000106&pid=S0120-4157200900030000900013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>14. <b>Gonz&aacute;lez A, Aristiz&aacute;bal BH, G&oacute;mez EC, Restrepo A, Cano LE.</b> Short report: Inhibition by tumor necrosis factor-alpha-activated macrophages of the transition of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> conidia to yeast cells through a mechanism independent of nitric oxide. Am J Trop Med Hyg.<i> </i>2004;71:828-30.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000107&pid=S0120-4157200900030000900014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>15. <b>Gonz&aacute;lez A, de Gregori W, V&eacute;lez D, Restrepo A, Cano LE.</b> Nitric oxide participation in the fungicidal mechanism of gamma interferon-activated murine macrophages against <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> conidia. Infect Immun.<i> </i>2000;68:2546-52.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000108&pid=S0120-4157200900030000900015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>16. <b>Restrepo BI, McEwen JG, Salazar ME, Restrepo A.</b> Morphological development of the conidia produced by <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> mycelial form. J Med Vet Mycol.<i> </i>1986;24:337-9.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000109&pid=S0120-4157200900030000900016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>17. <b>Felipe MS, Andrade RV, Petrofeza SS, Maranhao AQ, Torres FA, Albuquerque P,<i> et al</i></b><i>.</i> Transcriptome characterization of the dimorphic and pathogenic fungus <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> by EST analysis. Yeast.<i> </i>2003;20:263-71.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000110&pid=S0120-4157200900030000900017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>18. <b>Felipe MS, Torres FA, Maranhao AQ, Silva-Pereira I, Pocas-Fonseca MJ, Campos EG,<i> et al</i>.</b> Functional genome of the human pathogenic fungus <i>Paracoccidioides brasiliensis</i>. FEMS Immunol Med Microbiol.<i> </i>2005;45:369-81.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000111&pid=S0120-4157200900030000900018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>19. <b>Bastos KP, Bailao AM, Borges CL, Faria FP, Felipe MS, Silva MG,<i> et al</i>.</b> The transcriptome analysis of early morphogenesis in <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> mycelium reveals novel and induced genes potentially associated to the dimorphic process. BMC Microbiol. 2007;7:29.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000112&pid=S0120-4157200900030000900019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>20. <b>Restrepo A, Salazar ME, Cano LE, Pati&ntilde;o MM.</b> A technique to collect and dislodge conidia produced by <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> mycelial form. J Med Vet Mycol.1986;24:247-50.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000113&pid=S0120-4157200900030000900020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>21. <b>Restrepo A, Jim&eacute;nez BE.</b> Growth of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> yeast phase in a chemically defined culture medium. J Clin Microbiol.1980;12:279-81.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000114&pid=S0120-4157200900030000900021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>22. <b>Calich VL, Purchio A, Paula CR.</b> A new fluorescent viability test for fungi cells. Mycopathologia.1979;66:175-7.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000115&pid=S0120-4157200900030000900022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>23. <b>Marra MA, Kucaba TA, Hillier LW, Waterston RH.</b> High-throughput plasmid DNA purification for 3 cents per sample. Nucleic Acids Res.1999;27:e37.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000116&pid=S0120-4157200900030000900023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>24. <b>Ewing B, Green P.</b> Base-calling of automated sequencer traces using phred. II. Error probabilities. Genome Res.1998;8:186-94.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000117&pid=S0120-4157200900030000900024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>25. <b>Huang X, Madan A.</b> CAP3: A DNA sequence assembly program. Genome Res.1999;9:868-77.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000118&pid=S0120-4157200900030000900025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>26. <b>White O, Kerlavage AR.</b> TDB: new databases for biological discovery. Methods Enzymol.1996;266:27-40.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000119&pid=S0120-4157200900030000900026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>27. <b>Tavares AH, Silva SS, Dantas A, Campos EG, Andrade RV, Maranhao AQ<i>, et al.</i></b> Early transcriptional response of P<i>aracoccidioides brasiliensis</i> upon internalization by murine macrophages. Microbes Infect.2007;9:583-90.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000120&pid=S0120-4157200900030000900027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>28. <b>Bailao AM, Shrank A, Borges CL, Parente JA, Dutra V, Felipe MS, <i>et al.</i></b> The transcriptional profile of <i>Paracoccidioides brasiliensis</i> yeast cells is influenced by human plasma. FEMS Immunol Med Microbiol. 2007;51:43-57.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000121&pid=S0120-4157200900030000900028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>29. <b>Ram&iacute;rez JR.</b> <i>Paracoccidioides brasiliensis</i>: conversion of yeastlike forms into mycelia in submerged culture. J Bacteriol.<i> </i>1971;105:523-6.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000122&pid=S0120-4157200900030000900029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>30. <b>Fedorova ND, Khaldi N, Joardar VS, Maiti R, Amedeo P, Anderson MJ,<i> et al</i>.</b> Genomic islands in the pathogenic filamentous fungus <i>Aspergillus fumigatus</i>. PLoS Genet.<i> </i>2008;4:e1000046.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000123&pid=S0120-4157200900030000900030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>31. <b>Hand RA, Jia N, Bard M, Craven RJ.</b> Saccharomyces cerevisiae Dap1p, a novel DNA damage response protein related to the mammalian membrane-associated progesterone receptor. Eukaryot Cell.<i> </i>2003;2:306-17.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000124&pid=S0120-4157200900030000900031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>32. <b>Gant TM, Wilson KL.</b> Nuclear assembly. Annu Rev Cell Dev Biol.<i> </i>1997;13:669-95.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000125&pid=S0120-4157200900030000900032&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>33. <b>Tranque P, Hu MC, Edelman GM, Mauro VP.</b> rRNA complementarity within mRNAs: a possible basis for mRNA-ribosome interactions and translational control. Proc Natl Acad Sci USA.<i> </i>1998;95:12238-43.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000126&pid=S0120-4157200900030000900033&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> ]]></body><back>
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<label>1</label><nlm-citation citation-type="journal">
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<surname><![CDATA[Brummer]]></surname>
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<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Paracoccidioidomycosis: an update]]></article-title>
<source><![CDATA[Clin Microbiol Rev]]></source>
<year>1993</year>
<volume>6</volume>
<page-range>89-117</page-range></nlm-citation>
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<label>2</label><nlm-citation citation-type="book">
<person-group person-group-type="author">
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<surname><![CDATA[Restrepo]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
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<surname><![CDATA[Tobon]]></surname>
<given-names><![CDATA[AM]]></given-names>
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<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Chapter 266. Paracoccidioides brasiliensis]]></article-title>
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<surname><![CDATA[Mandell]]></surname>
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<surname><![CDATA[Bennetts]]></surname>
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<surname><![CDATA[Dollin]]></surname>
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