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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[EXPRESIÓN DE DOS GENES CANDIDATOS A RESISTENCIA CONTRA LA BACTERIOSIS VASCULAR EN YUCA]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Cassava (Manihot esculenta Crantz, Euphorbiaceae) is the fourth food crop used as an important energy source for human population worldwide. Cassava Bacterial Blight (CBB) is the most important disease of this crop. CBB is caused by the pathogenic bacterium Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Plants have developed sophisticated mechanisms to detect and respond to infection by pathogens. These mechanisms depend on the presence of resistance (R) genes, which recognize proteins produced by pathogens. Although efforts have been conducted to identify R genes in cassava, the first R gene in this crop has not been cloned. The present work studied the expression profile of two resistance gene candidates (RGCs) which are linked to QTL associated with resistance to CBB. Gene expression of RXam1 and RXam2 was evaluated by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) in stems and leaves of SG107-35 and MBRA685, two cassava resistant cultivars, which were challenged with Xam CIO151. We observed that the expression of RXam1 is induced starting five days post-inoculation in the two cultivars studied and in both tissues while the gene RXam2 was constitutively expressed in MBRA685 cultivar.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font face="verdana" size="2">     <p align="center"><font size="4"><b>EXPRESI&Oacute;N DE DOS GENES CANDIDATOS A RESISTENCIA CONTRA LA BACTERIOSIS VASCULAR EN YUCA </b></font></p>     <p align="center"><font size="3"><b>Expression Of Two Resistance Gene Candidates Against Cassava Bacterial Blight In Cassava </b></font></p>     <P >EL&Iacute;ZABETH CONTRERAS NIETO<Sup>1</Sup>, Bi&oacute;loga; CAMILO E. L&Oacute;PEZ   CARRASCAL<Sup>2</Sup>, Ph. D.  </P>     <P >Departamento de Biolog&iacute;a, Facultad de Ciencias,    Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogot&aacute;, AA 14490,   Bogot&aacute;, Colombia. <Sup>1 </Sup><a href="mailto:econtrerasn@unal.edu.co">econtrerasn@unal.edu.co</a> - <Sup>2 </Sup><a href="mailto:celopezc@unal.edu.co">celopezc@unal.edu.co</a></P>     <P>Presentado 22 de octubre de 2007, aceptado 6 de mayo de 2008, correcciones 6 de junio de 2008. </P><hr size="1">     <p align="left"><b>RESUMEN </b></b></p>     <P>La yuca (<I>Manihot esculenta </I>Crantz, Euphorbiaceae) es el cuarto cultivo en importancia a nivel mundial como fuente de calor&iacute;as para la poblaci&oacute;n humana y cuya producci&oacute;n se ve afectada por la bacteriosis vascular, enfermedad ocasionada por <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis </I>(<I>Xam</I>). La resistencia a enfermedades en plantas depende de la presencia de genes de resistencia (<I>R</I>), los cuales reconocen a los pat&oacute;genos y simult&aacute;neamente permiten desencadenar la respuesta de defensa. A pesar de recientes esfuerzos encaminados a la identificaci&oacute;n de genes <I>R </I>en yuca, a&uacute;n no se ha logrado clonar el primer gen <I>R </I>en este cultivo. En el presente trabajo se estudi&oacute; el perfil de expresi&oacute;n de dos Genes Candidatos a Resistencia (RGCs) asociados a QTLs de defensa contra la bacteriosis vascular en yuca. A partir de la t&eacute;cnica transcripci&oacute;n reversa y reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa (RT-PCR) se evalu&oacute; la expresi&oacute;n de los genes <I>RXam1 </I>y <I>RXam2 </I>en tallos y hojas de las variedades resistentes SG107-35 y MBRA685 de yuca, despu&eacute;s de ser inoculadas con la cepa CIO151 de <I>Xam</I>. Se observ&oacute; que <I>RXam1 </I>es inducido a partir de los cinco d&iacute;as post-inoculaci&oacute;n tanto en tallos como hojas de las dos variedades, mientras que <I>RXam2 </I>es expresado de manera constitutiva en la variedad MBRA685. </P>     <P><b>Palabras clave:</b> <I>Manihot esculenta; Xam; </I>RGC; RT-PCR.</P> <hr size="1">     <p align="left"><b>ABSTRACT </b></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P >Cassava (<I>Manihot esculenta </I>Crantz, Euphorbiaceae) is the fourth food crop used as an important energy source for human population worldwide. Cassava Bacterial Blight (CBB) is the most important disease of this crop. CBB is caused by the pathogenic bacterium <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis </I>(<I>Xam</I>). Plants have developed sophisticated mechanisms to detect and respond to infection by pathogens. These mechanisms depend on the presence of resistance (<I>R</I>) genes, which recognize proteins produced by pathogens. Although efforts have been conducted to identify R genes in cassava, the first <I>R </I>gene in this crop has not been cloned. The present work studied the expression profile of two resistance gene candidates (RGCs) which are linked to QTL associated with resistance to CBB. Gene expression of <I>RXam1 </I>and <I>RXam2 </I>was evaluated by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) in stems and leaves of SG107-35 and MBRA685, two cassava resistant cultivars, which were challenged with <I>Xam </I>CIO151. We observed that the expression of <I>RXam1 </I>is induced starting five days post-inoculation in the two cultivars studied and in both tissues while the gene <I>RXam2 </I>was constitutively expressed in MBRA685 cultivar. </P>     <P ><b>Key words:</b><B> </B><I>Manihot esculenta; Xam; </I>RGC; RT-PCR. </P> <hr size="1">     <p align="left"><b>INTRODUCCI&Oacute;N </b></p>     <P >Las plantas frente al ataque de los pat&oacute;genos han desarrollado un &ldquo;sistema inmune&rdquo; que de acuerdo al reconocimiento molecular del pat&oacute;geno y evoluci&oacute;n del mismo se ha diferenciado en dos ramas (Jones y Dangl, 2006). La primera rama reconoce mol&eacute;culas comunes de diversas clases de microorganismos, los MAMPs (del ingl&eacute;s, <I>Microbe-Associated Molecular Patterns</I>) los cuales son percibidos por receptores PRRs (del ingl&eacute;s, <I>Pattern Recognition Receptors</I>). Este tipo de resistencia se ha denominado defensa basal (Chisholm <I>et al.</I>, 2006). Los pat&oacute;genos a su vez han desarrollado mecanismos para bloquear este primer nivel de defensa a trav&eacute;s de la introducci&oacute;n de factores proteicos denominados efectores. En el caso de bacterias, los efectores son liberados por el Sistema de Secreci&oacute;n Tipo Tres -T3SS- (del ingl&eacute;s, <I>Type Three Secretion System</I>). Las plantas han desarrollado una segunda rama de defensa conocida como resistencia raza-especifica, en la cual las prote&iacute;nas de resistencia (R) permiten el reconocimiento de los efectores. Cuando los efectores son reconocidos reciben el nombre de prote&iacute;nas de avirulencia (Avr) (Jones y Dangl, 2006). Las variedades de plantas que posean la prote&iacute;na R que reconozca la prote&iacute;na Avr correspondiente de una raza de un pat&oacute;geno determinado presentar&aacute;n este tipo de resistencia (resistencia monog&eacute;nica o cualitativa). El car&aacute;cter monog&eacute;nico de la resistencia raza-espec&iacute;fica ha hecho que esta sea la m&aacute;s estudiada. Sin embargo la resistencia gobernada por varios genes (polig&eacute;nica o cuantitativa) es quiz&aacute;s la resistencia que se presenta con mayor frecuencia en la naturaleza. Esta resistencia presenta la ventaja de ser m&aacute;s durable y de amplio espectro. La manera de identificar las regiones gen&oacute;micas implicadas en este tipo de resistencia se hace a trav&eacute;s del estudio e identificaci&oacute;n de loci de caracteres cuantitativos -QTLs- (del ingl&eacute;s, <I>Quantitative Trait Loci</I>). Las prote&iacute;nas R a pesar de conferir resistencia a diversos pat&oacute;genos presentan un grupo limitado de dominios estructurales conservados. La mayor&iacute;a de genes <I>R </I>codifican para prote&iacute;nas que presentan un dominio NBS (del ingl&eacute;s, <I>Nucleotide Binding Sites</I>) en su extremo N-terminal y un dominio LRR (del ingl&eacute;s, <I>Leucine Rich Repeats</I>) en el extremo C-terminal. Otro grupo importante de genes <I>R </I>es el que codifica prote&iacute;nas que presentan un dominio LRR extracelular y pueden contener adem&aacute;s un dominio transmembranal y un dominio kinasa intracelular (RLK del ingl&eacute;s, <I>Receptor Like Kinase</I>). De manera interesante se ha observado que las prote&iacute;nas que controlan la defensa basal y la resistencia raza-espec&iacute;fica poseen un dominio RLK similar. Las prote&iacute;nas FLS2, EFR y Xa21 presentan esta estructura. La dos primeras son PRRs que reconocen los PAMPs flagelina y EF-Tu, mientras que Xa21 es una prote&iacute;na R de arroz que reconoce cepas de <I>Xanthomonas oryzae </I>pv. <I>oryzae </I>(<I>Xoo</I>) que portan el efector AvrXa21. La presencia de dominios conservados en las prote&iacute;nas R ha permitido desarrollar estrategias encaminadas a identificar genes de resistencia candidatos o RGCs (del ingl&eacute;s, <I>Resistance Gene Candidates</I>), que pueden ser aislados mediante PCR empleando primers degenerados dise&ntilde;ados a partir dichos dominios. Algunos RGCs se han mapeado y han co-localizado con loci de genes R o con QTLs asociados a resistencia (Ramalingam <I>et al.</I>, 2003). La yuca (<I>Manihot esculenta, </I>Crantz) se constituye como uno de los productos agr&iacute;colas de vital importancia para la seguridad alimentar&iacute;a siendo el componente b&aacute;sico de la dieta de m&aacute;s de 1.000 millones de personas al d&iacute;a en el mundo (DANE, 2004; Nicaragua <I>et al.</I>, 2004). Recientemente, el cultivo de la yuca ha despertado un gran inter&eacute;s por ser un cultivo promisorio en la producci&oacute;n de biocombustibles (Ceballos, 2002). Una de las enfermedades de mayor importancia es la Bacteriosis Vascular tambi&eacute;n conocida como A&ntilde;ublo Vascular. Esta enfermedad est&aacute; presente tanto en &Aacute;frica como en Am&eacute;rica Latina y es causada por la bacteria gram-negativa <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis -Xam, </I>(Vauterin, 1995)-. Las p&eacute;rdidas ocasionadas por la bacteriosis han llegado hasta el 100% en dos o tres ciclos de cultivo (Verdier, 2002). Los estudios citoqu&iacute;micos de la interacci&oacute;n yuca-<I>Xam </I>han revelado que la defensa se da a nivel de tejidos vasculares mediante respuestas de refuerzo de las paredes celulares, lo cual se presenta tanto en plantas resistentes como susceptibles y cuya diferencia est&aacute; dada por el grado de intensidad y velocidad en las cuales ocurren estas respuestas (Kp&eacute;moua <I>et al.</I>, 1996; Boher <I>et al.</I>, 1997). La ausencia de respuesta hipersensible (Verdier, 2002) y la diferencia en la intensidad de reacci&oacute;n entre cultivares resistentes y susceptibles en yuca muestran que la resistencia es de tipo cuantitativo (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2005). Los an&aacute;lisis de segregaci&oacute;n de la resistencia a la bacteriosis han permitido identificar 12 QTLs asociados a cinco cepas de <I>Xam, </I>los cuales explican entre el 8 al 30% de la variaci&oacute;n fenot&iacute;pica (Jorge <I>et al.</I>, 2000, 2001). Recientemente en yuca ha sido posible la identificaci&oacute;n de varios RGCs, algunos de los cuales se han asociado con QTLs de resistencia a <I>Xam. </I>Empleando primers dise&ntilde;ados a partir del gen Xa21 de arroz se logr&oacute; amplificar un fragmento en yuca, el cual co-localiz&oacute; con un QTL que explica el 13% de la resistencia a la cepa CIO136. Hace poco se identific&oacute; la secuencia completa de dicho gen demostrando que codifica una prote&iacute;na tipo RLK y ha sido denominado <I>RXam1 </I>(Resistencia a <I>Xam </I>y ser el posible primer gen <I>R </I>en yuca). Estudios recientes han mostrado que <I>RXam1 </I>es inducido en plantas MBRA685 resistentes a la cepa CIO136 presentando un pico de expresi&oacute;n a cinco d&iacute;as post-inoculaci&oacute;n (dpi) (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2007a). Otro RGC de tipo NBS asociado a un QTL que explica el 62% de la resistencia a la cepa CIO151 (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2007b) se identific&oacute; mediante el empleo de primers degenerados (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2003) y fue en consecuencia denominado <I>RXam2 </I>(Resistencia a <I>Xam </I>y ser el posible segundo gen <I>R </I>en yuca). El objetivo del presente trabajo fue evaluar la expresi&oacute;n e inducci&oacute;n de los genes <I>RXam1 </I>y <I>RXam2 </I>en respuesta a la infecci&oacute;n co    n la cepa CIO151 de <I>Xam. </I></P>     <p><b>MATERIALES Y M&Eacute;TODOS </b></p>      <p ><b>MATERIAL VEGETAL E INOCULACI&Oacute;N </b></p>     <P>Las variedades de yuca empleadas fueron MBRA685 y SG107-35 reportadas como resistentes a la cepa CIO151 de <I>Xam </I>(Restrepo <I>et al.</I>, 2000). Las plantas propagadas <I>in vitro </I>se obtuvieron de la colecci&oacute;n de germoplasma del Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT) de las variedades mencionadas se transfirieron a suelo est&eacute;ril, dej&aacute;ndolas crecer por tres meses en un invernadero de CIAT para el caso de MBRA685 (temperatura de 28 &ordm;C/19 &deg;C d&iacute;a/noche; humedad relativa de 80%; altitud de 965 msnm (Segovia <I>et al.</I>, 2000) y en el invernadero de la finca Los Buganvilles del municipio de La Vega, Colombia, para las plantas de la variedad SG107-35 (temperatura 24-31/19-20 &deg;C d&iacute;a/noche; humedad relativa de 95%; altitud de 1.230 msnm). Las plantas de tres meses de edad fueron inoculadas en tallos y hojas con la cepa CIO151 de <I>Xam</I>. La cepa CIO151 pertenece al haplotipo C20, y fue colectada en la ecozona 2, correspondiente a los Llanos Orientales (Restrepo <I>et al.</I>, 2000). La cepa de <I>Xam </I>CIO151 se creci&oacute; en medio LPGA a 28 &deg;C con dos d&iacute;as de anterioridad a la inoculaci&oacute;n la cual se emple&oacute; en la preparaci&oacute;n de una suspensi&oacute;n de 10<Sup>8 </Sup>unidades formadoras de colonia (CFU) aproximadamente. Hojas cercanas al tercer nudo se perforaron con un sacabocados, alrededor de seis orificios se abrieron por fol&iacute;olo, en donde se deposit&oacute; una gota de la suspensi&oacute;n de <I>Xam</I>. El tallo situado entre las terceras y cuartas hojas se inocul&oacute; por punci&oacute;n con un palillo de madera con bacteria <I>Xam </I>crecida directamente del medio LPGA (Restrepo <I>et al.</I>, 2000). Se colectaron cinco tiempos post-inoculaci&oacute;n: 0, 24, 48 horas y cinco y siete d&iacute;as. Se emplearon tres plantas por cada tiempo post-inoculaci&oacute;n, y de cada una de &eacute;stas se colectaron dos hojas. Para tallos, se colectaron 2 cm arriba y abajo del punto de inoculaci&oacute;n de cada planta. </P> <b>DISE&Ntilde;O DE PRIMERS </b>     <P>Las secuencias del RGC7 y del BAC 39P22 reportadas para el gen <I>RXam2 </I>(L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2003a) se alinearon en BLAST resultando un fragmento de 1084 pb (<a href="#fig1">Fig. 1</a> ) utilizado para el dise&ntilde;o de los primers <I>RXam2</I>-IF -IR y -IVF -IVR los cuales amplifican fragmentos de 564 pb y 135 pb, respectivamente (<a href="#fig1">Fig. 1</a> ). El dise&ntilde;o de los primers se hizo con el pro-grama Primer3 (Rozen y Skaletsky, 2000). Los primers empleados para el gen <I>RXam1 </I>(Cassav-Cassa) fueron descritos previamente (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2007a) y amplifican un fragmento de 700 pb cuando se emplea ADN gen&oacute;mico y de 600 pb al utilizar ADN complementario (ADNc), ya que estos primers est&aacute;n dise&ntilde;ados de tal forma que amplifican una regi&oacute;n de <I>RXam1 </I>que incluye un intr&oacute;n de 100 pb lo que permite identificar si en las muestras de ADNc existe contaminaci&oacute;n con ADN gen&oacute;mico. Se utilizaron primers para el gen G3PDH que amplifican aproximadamente 230 pb, empleado como control para evaluar la integridad y existencia de ADNc. Adem&aacute;s, el gen G3PDH es un gen constitutivo no implicado en las respuestas de defensa y por tanto su nivel de expresi&oacute;n se mantiene constante durante los tiempos post-inoculaci&oacute;n (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2004) (<a href="#tabla1">Tabla.1</a>). </P>     <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center><a name="fig1"></a><img src="img/revistas/abc/v13n2/v13n2a12f1.jpg"></center></p>     <p >    <center><a name="tabla1"></a><img src="img/revistas/abc/v13n2/v13n2a12t1.jpg"></center></p>     <p ><b>EXTRACCI&Oacute;N DE ADN </b></p>     <P>Se maceraron 3 g de tejido de cada variedad en nitr&oacute;geno l&iacute;quido y se procedi&oacute; a extraer su ADN gen&oacute;mico de acuerdo al protocolo descrito por Dellaporta <I>et al. </I>(1983). El ADN genómico se empleó para estandarizar la temperatura de alineamiento de los primersque se utilizaron. </P>     <P><b>EXTRACCIÓN DEARN</b></P>     <P>El tejido de cada tiempo post-inoculaci&oacute;n y de cada variedad de yuca se macer&oacute; ennitr&oacute;geno l&iacute;quido y se utiliz&oacute; para extraer el ARN empleando el kit SV Total RNAIsolation System&reg; el cual incluye un tratamiento con DNAsa (Promega, Madison, WI,USA). Para eliminar cualquier traza de ADN gen&oacute;mico, las muestras fueron nueva-mente tratadas con DNAsa&reg; (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). El ARN se cuantific&oacute;en el espectofot&oacute;metro Smart-Spec 3000 BIO-RAD. Para visualizar la calidad y con-centraci&oacute;n del ARN se corrieron 0,5 &micro;l de ARN en un gel de agarosa al 1,2%. </P> <b>S&Iacute;NTESIS DE ADN COMPLEMENTARIO (ADNC) Y AMPLIFICACI&Oacute;N DE LOS RGCS </b>     <P>0,5 &micro;g de ARN se emplearon para sintetizar ADNc de una cadena utilizando la transcriptasa reversa SuperScript III&reg; (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) y una mezcla de oligo dT y primers aleatorios. La reacci&oacute;n de PCR se hizo en un volumen final de 50 &micro;l que conten&iacute;a: 1X de buffer de PCR (50 mM de KCl, 100 mM de Tris-HCl, 0,1% de Trit&oacute;nX-100), 2,5 mM de MgCl2, 0,2 mM de dNTPs, 0,1 &micro;M de cada primer y 2,5 U de Taq polimerasa (Promega, Biotech, Madison Wis.), (CIAT, Cali, Colombia) y 6 &micro;l de ADNc. Las reacciones de PCR se llevaron a cabo bajo las siguiente condiciones de temperatura: denaturaci&oacute;n inicial a 94 &deg;C por 2 min seguido de 35 ciclos de amplificaci&oacute;n que inclu&iacute;a una denaturaci&oacute;n por 30 s a 94 &deg;C, un annealing por 30 s a la temperatura correspondiente a cada primer (<a href="#tabla1">Tabla.1</a>) y una extensi&oacute;n por 1 min a 72 &deg;C. Los productos de PCR de 300-600 pb y 100-300 pb se corrieron en geles de agarosa al 1,2% y 2,0%, respectivamente en buffer TAE 0,5%. Los geles se observaron en un transiluminador con luz ultravioleta y el tama&ntilde;o de los fragmentos amplificados se determinaron con el marcador de peso molecular 1 Kb Plus Ladder &reg; (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). Para el gen <I>RXam2 </I>se hizo un PCR anidado par-tiendo del primer producto de PCR obtenido con los primers <I>RXam2</I>-I.R <I>RXam2</I>-I.F. Este producto se diluy&oacute; 1:20 y se tomaron 5 ul para realizar un segundo PCR con los primers internos <I>RXam2</I>-IV.R <I>RXam2</I>-IV.F.</P>     <p><b>RESULTADOS </b></p>      <p ><b>INOCULACI&Oacute;N, EXTRACCI&Oacute;N DE ARN Y S&Iacute;NTESIS DE ADNC CONTROL </b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<P>Como se observa en la <a href="#fig2">Figura. 2</a> , se obtuvo un ARN de buena calidad para todos los tiempos post-inoculaci&oacute;n. A partir de este ARN se procedi&oacute; con la s&iacute;ntesis de ADNc. La existencia e integridad del ADNc se verific&oacute; amplificando el gen constitutivo G3PDH. El gen G3PDH fue amplificado de manera positiva en todos los ADNc ensayados (<a href="#fig3">Fig. 3</a> , <a href="#fig4">Fig. 4</a>  y <a href="#fig5">Fig. 5</a> ). La intensidad de la banda observada en el gel de agarosa del producto de amplificaci&oacute;n correspondiente al gen G3PDH fue similar entre los diferentes tiempos post-inoculaci&oacute;n, tanto para el caso de tallos y de hojas en la variedad MBRA685. Para la variedad SG107-35 se observ&oacute; una intensidad un poco mayor a 48 horas post-inoculaci&oacute;n (hpi) y siete d&iacute;as post-inoculaci&oacute;n (dpi). Esta leve diferencia solo puede ser explicada producto de una eficiencia diferencial en la s&iacute;ntesis de ADNc en cada tiempo dado que el G3PDH es un gen constitutivo cuya expresi&oacute;n no varia. A pesar de estas sutiles diferencias, y considerando que el principal objetivo de este trabajo era evaluar si existe o no expresi&oacute;n, se puede indicar que las cantidades de ADNc para las diferentes muestras fueron homog&eacute;neas y de observarse diferencias en la intensidad en el producto de amplificaci&oacute;n para los genes <I>RXam1 </I>y <I>RXam2</I>, &eacute;stas podr&iacute;an explicarse como una respuesta diferencial frente a la infecci&oacute;n. Por esta raz&oacute;n se emple&oacute; la misma cantidad de ADNc (6 &micro;l) para las evaluaciones del perfil de expresi&oacute;n de los genes <I>RXam1 </I>y <I>RXam2</I>. </P>     <p>    <center><a name="fig2"></a><img src="img/revistas/abc/v13n2/v13n2a12f2.jpg"></center></p>     <p >    <center><a name="fig3"></a><img src="img/revistas/abc/v13n2/v13n2a12f3.jpg"></center></p>     <p >    <center><a name="fig4"></a><img src="img/revistas/abc/v13n2/v13n2a12f4.jpg"></center></p>     <p >    <center><a name="fig5"></a><img src="img/revistas/abc/v13n2/v13n2a12f5.jpg"></center></p>     <p ><b>PERFIL DE EXPRESI&Oacute;N DE <I>RXam1</I></b></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P >El gen <I>RXam1 </I>co-localiza con un QTL que explica el 13% de la resistencia a la cepa CIO136 y es inducido en plantas MBRA685 resistentes a esta cepa presentando un pico de expresi&oacute;n a 5 dpi (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2007a). En este trabajo se evalu&oacute; si <I>RXam1 </I>es igualmente inducido por otra cepa de <I>Xam</I>, la CIO151, en variedades resistentes. El ADNc obtenido como se describi&oacute; anteriormente se emple&oacute; para evaluar la expresi&oacute;n del gen <I>RXam1</I>. Para amplificar un fragmento correspondiente al gen <I>RXam1 </I>se emplearon los primers cassav-cassa (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2007a), los cuales amplifican dos tipos de fragmentos dependiendo de la muestra que se emplee. A partir de ADNc se amplifica un fragmento de 600 pb, y empleando ADN gen&oacute;mico uno de 700 pb, ya que los primers est&aacute;n dise&ntilde;ados sobre una regi&oacute;n que incluye un intr&oacute;n de 100 pb. Este hecho permite evaluar simult&aacute;neamente si existe contaminaci&oacute;n de ADN gen&oacute;mico en la preparaci&oacute;n de ARN. Como se observa en la <a href="#fig3">Fig. 3</a>  y <a href="#fig4">Fig. 4</a>  se obtuvo una amplificaci&oacute;n de un fragmento esperado de 600 pb correspondiente al gen <I>RXam1 </I>en las dos variedades resistentes de yuca. En la variedad MBRA685 la expresi&oacute;n de <I>RXam1 </I>se present&oacute; en los dos tipos de tejidos evaluados. En hojas se observ&oacute; una expresi&oacute;n a los 5 dpi, la cual desapareci&oacute; a los siete d&iacute;as post-inoculaci&oacute;n, mientras que en tallos la expresi&oacute;n a 5 dpi fue m&aacute;s leve comparada con la de hojas pero se mantuvo y se increment&oacute; a los 7 dpi (<a href="#fig3">Fig. 3</a> ). En tallos de la variedad SG107-35 <I>RXam1 </I>se present&oacute; una expresi&oacute;n a los 5 dpi con un incremento a los 7 dpi. </P>     <p><b>PERFIL DE EXPRESI&Oacute;N DE <I>RXam2</I></b></p>     <P >Los ensayos previos de amplificaci&oacute;n del gen <I>RXam2 </I>empleando ADN gen&oacute;mico como molde se realizaron con los primers <I>RXam2</I>-I.R- <I>RXam2</I>-I.F (<a href="#tabla1">Tabla.1</a>), los cuales amplificaron un fragmento de 564 pb (datos no mostrados). Estos primers fueron empleados en los primeros estudios de expresi&oacute;n g&eacute;nica del gen <I>RXam2</I>, sin embargo no se observ&oacute; amplificaci&oacute;n del gen en ninguna variedad (MBRA685 o SG107-35) ni en ning&uacute;n tipo de tejido (tallos y hojas) (datos no mostrados). Se decidi&oacute; evaluar la expresi&oacute;n de <I>RXam2 </I>efectuando un PCR anidado. Para esto, el producto de amplificaci&oacute;n obtenido con los primers <I>RXam2</I>-I.R-I.F fue empleado como molde en un segundo PCR con los primers <I>RXam2</I>-IV.R-IV.F (<a href="#fig1">Fig. 1</a>  y <a href="#tabla1">Tabla. 1</a> ) en cuyo caso se esperaba un fragmento de 135 pb. En la variedad MBRA685 se observ&oacute; una leve amplificaci&oacute;n del fragmento esperado en todos los tiempos evaluados, indicando una baja expresi&oacute;n del gen <I>RXam2 </I>tanto en hojas como en tallos (<a href="#fig5">Fig. 5</a> ). </P>      <p align="left"><b>DISCUSI&Oacute;N </b></p>     <P >En yuca, recientemente, se han identificado dos genes de resistencia candidatos: <I>RXam1 </I>y <I>RXam2</I>. Estos genes codifican prote&iacute;nas putativas con dominios LRR-STK y NBS-LRR, respectivamente, propios de la mayor&iacute;a de prote&iacute;nas de resistencia. <I>RXam1 </I>y <I>RXam2 </I>colocalizan con QTLs que explican el 13% y el 62% de la resistencia a las cepas CIO136 y CIO151, respectivamente. En este estudio hemos demostrado que el gen <I>RXam1 </I>es inducido en respuesta a la infecci&oacute;n por <I>Xam </I>en dos variedades resistentes de yuca. </P>     <P >Previamente se ha establecido que <I>RXam1 </I>es inducido en respuesta a la infecci&oacute;n con la cepa CIO136 de <I>Xam </I>(L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2007a). La cepa CIO136 pertenece al haplotipo C17 y fue colectada en la Ecozona 2 (Llanos Orientales). En el presente estudio se demostr&oacute; que este gen tambi&eacute;n se induce en respuesta a la infecci&oacute;n con la cepa CIO151, la cual a pesar de ser colectada en la misma regi&oacute;n geogr&aacute;fica que la cepa CIO136, corresponde a un haplotipo diferente. La inducci&oacute;n de la expresi&oacute;n de <I>RXam1 </I>en plantas de yuca inoculadas con estas dos cepas, sugiere que este gen puede tener un rol de amplio espectro en la resistencia a diferentes cepas. El gen <I>Xa21 </I>de arroz, que presenta dominios de tipo LRR-STK como <I>RXam1</I>, es un gen de amplio espectro en resistencia a diferentes cepas de <I>Xoo </I>que contienen la prote&iacute;na de avirulencia AvrXa21 (Wang <I>et al.</I>, 1996). La contribuci&oacute;n de <I>RXam1 </I>a la resistencia a la cepa CIO151 puede no ser tan importante, raz&oacute;n que explicar&iacute;a la falta de asociaci&oacute;n de este gen en los an&aacute;lisis de QTLs (L&oacute;pez, <I>et al.</I>, 2007b).</P>     <P > La prote&iacute;na FLS2 de defensa basal en Arabidopsis, que reconoce el PAMP flagelina, presenta los dominios LRR-STK (G&oacute;mez-G&oacute;mez y Boller, 2000). Este tipo de dominios est&aacute;n presentes tambi&eacute;n en la prote&iacute;na de resistencia raza-espec&iacute;fica Xa21 de arroz. La prote&iacute;na putativa codificada por el gen <I>RXam1</I>, tambi&eacute;n presenta los dominios LRR-STK. De demostrarse que <I>RXam1 </I>es el gen de resistencia asociado al QTL se podr&iacute;a establecer que las prote&iacute;nas implicadas en defensa basal, resistencia razaespec&iacute;fica y resistencia cuantitativa comparten dominios conservados. Esta similitud, muy posiblemente determine elementos comunes entre s&iacute; en las v&iacute;as de transducci&oacute;n de se&ntilde;ales que dichas prote&iacute;nas desencadenan. Sin embargo, las diferencias entre los tipos de resistencia estar&iacute;an determinadas por la intensidad y velocidad a la cual las respuestas de defensa se desencadenan, como se ha propuesto para explicar las diferencias entre las interacciones compatible e incompatible y la resistencia no hospedero (defensa basal) (Tao <I>et al.</I>, 2003).</P>     <P > El gen <I>RXam2 </I>se encuentra asociado a un QTL que explica el 62% de resistencia a la cepa CIO151, consider&aacute;ndose como un gen mayor (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2007b). En este trabajo se observ&oacute; una expresi&oacute;n constitutiva <I>RXam2</I>, lo que no permiti&oacute; corroborar su expresi&oacute;n exclusivamente ante la infecci&oacute;n con <I>Xam</I>. Sin embargo, la evaluaci&oacute;n de expresi&oacute;n realizada solo fue de tipo cualitativo, lo que no permite determinar realmente si se presentan variaciones en la expresi&oacute;n en los diferentes tiempos post-inoculaci&oacute;n. Por esta raz&oacute;n, estudios de expresi&oacute;n cuantitativa empleando por ejemplo qRT-PCR (del ingl&eacute;s; <I>quantitative Real Time-Polymerase Chain Reaction</I>) permitir&aacute;n evaluar si existen diferencias durante la cin&eacute;tica de infecci&oacute;n. Adicionalmente, un aspecto interesante a estudiar es la inducci&oacute;n de <I>RXam2 </I>en variedades de yuca diferentes inoculadas con diversas cepas de <I>Xam </I>y observar si este gen presenta un amplio espectro en resistencia. </P>     <P >En yuca se ha reportado 199 transcritos inducidos por inoculaci&oacute;n con CIO151 en la variedad MBRA685, de los cuales el 57% se expresan diferencialmente a 7 dpi y menos del 20% antes de las 48 hpi (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2005). <I>RXam1 </I>se expresa a partir de los 5 y 7 dpi, lo que implica un reconocimiento tard&iacute;o de <I>Xam </I>por parte de <I>RXam1 </I>y corresponde a uno de los picos m&aacute;s importantes en la inducci&oacute;n de genes en respuesta a la infecci&oacute;n con <I>Xam </I>(L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2005). El gen <I>RXam1 </I>presenta una expresi&oacute;n diferencial seg&uacute;n el tipo de tejido (<a href="#fig3">Fig. 3</a>  y <a href="#fig4">Fig. 4</a>), lo cual se explicar&iacute;a por la forma como la bacteria coloniza los tejidos vegetales. La bacteria presenta una fase preliminar de desarrollo intercelular en el mes&oacute;filo antes de pasar a los haces vasculares del tallo principalmente (Verdier, 2002). En este caso, se establecer&iacute;a primero un reconocimiento en los haces de las hojas, que corresponder&iacute;a a la expresi&oacute;n de <I>RXam1 </I>a los 5 dpi para posteriormente mantenerse e incrementarse a los 7 dpi en el tallo.</P>     <P > La mayor&iacute;a de estudios sugieren que los genes R se expresan de manera constitutiva a niveles muy bajos (Radwan <I>et al.</I>, 2005). Sin embargo, se ha reportado tambi&eacute;n algunos casos de inducci&oacute;n de genes <I>R</I>, como el caso de <I>Xa1, </I>(Yoshimura <I>et al.</I>, 1998) y <I>Xa27 </I>(Gu <I>et al.</I>, 2005). En nuestro caso pudimos observar que <I>RXam1 </I>es inducido mientras que nuestros resultados preliminares sugieren que la expresi&oacute;n de <I>RXam2 </I>es constitutiva. Se cree que muchos de los mecanismos de se&ntilde;alizaci&oacute;n que involucra la resistencia son adoptados de los procesos habituales de desarrollo de la planta, lo cual supone una reducci&oacute;n en los costos de producci&oacute;n y mantenimiento de estos sistemas de se&ntilde;alizaci&oacute;n sugiriendo una redirecci&oacute;n de recursos energ&eacute;ticos para defenderse de los pat&oacute;genos (Cipollini <I>et al.</I>, 2003). Varios estudios han mostrado, que en respuesta a pat&oacute;genos, las plantas reprimen la expresi&oacute;n de genes implicados en fotos&iacute;ntesis (L&oacute;pez <I>et al.</I>, 2005, Swarbrick <I>et al.</I>, 2006) de tal forma que en plantas la expresi&oacute;n constitutiva de genes <I>R </I>desencadenar&iacute;a una resistencia constitutiva que en ausencia del pat&oacute;geno implica ciertos costos en la adaptaci&oacute;n de las plantas. El hecho de que algunos genes <I>R </I>s&oacute;lo se activen cuando la planta est&aacute; siendo atacada (expresi&oacute;n inducida) implica menores costos en la adaptaci&oacute;n de la planta, resaltando la importancia de una expresi&oacute;n inducida sobre una expresi&oacute;n constitutiva.</P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P >Adicionalmente, es necesaria la validaci&oacute;n funcional de estos genes que puede llevarse a cabo mediante transformaci&oacute;n gen&eacute;tica, la cual en el caso de yuca puede tardar varios a&ntilde;os. Recientemente, se han desarrollado alternativas basadas en silenciamiento g&eacute;nico, lo cual se puede realizar mediante ARN de interferencia (ARNi) (Graham <I>et al.</I>, 2007; Kumar <I>et al.</I>, 2006) o mediante VIGS (Fofana <I>et al.</I>, 2004). </P>     <P >La posibilidad de contar con genes de resistencia cuantitativa y de amplio espectro contra la bacteriosis ser&aacute;n aspectos importantes para el entendimiento de la interacci&oacute;n yuca-<I>Xam </I>lo que permitir&aacute; el desarrollo de mejores estrategias de mejoramiento. </P>     <p align="left"><b>AGRADECIMIENTOS </b></p>     <P>Este trabajo est&aacute; enmarcado dentro del proyecto: &ldquo;Clonaci&oacute;n y secuenciaci&oacute;n de un gen de resistencia asociado a un QTL de defensa a la bacteriosis vascular en yuca&rdquo; financiado por la DIB de la Universidad Nacional de Colombia. A Valerie Verdier, Paul Chavarriaga y Jes&uacute;s Beltr&aacute;n por su asesor&iacute;a cient&iacute;fica en los experimentos de inoculaci&oacute;n y de s&iacute;ntesis de ADNc. </P>     <p align="left"><b>BIBLIOGRAF&Iacute;A </b></p>     <!-- ref --><P>BOHER B, NICOLE M, POTIN M, GEIGER JP. Extracellular Polysaccharides from <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis </I>Interact with Cassava Cell Walls During Pathogenesis. Mol. Plant Microbe Interact. 1997;10(7):803-811. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000058&pid=S0120-548X200800020001200001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>CEBALLOS H. La yuca en Colombia y el mundo: nuevas perspectivas para un cultivo milenario. En: Ospina B. y Cebalos H, editores. La yuca en el tercer milenio. Sistemas modernos de producci&oacute;n, procesamiento, utilizaci&oacute;n y comercializaci&oacute;n. Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT) y Consorcio Latinoamericano y del Caribe de Apoyo a la Investigaci&oacute;n y Desarrollo de la Yuca (CLAYUCA). Proyecto IP-3. Mejoramiento de yuca. Cali, Colombia. 2002. p.1-13. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000059&pid=S0120-548X200800020001200002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>CIPOLLINI MBAGWU J, BARTO K, HILLSTROM C, ENRIGHT S. Expression of constitutive and inducible chemical defenses in native and invasive populations of <I>Alliaria petiolata</I>. J. Chem. Ecol. 2005;31:1255-67. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000060&pid=S0120-548X200800020001200003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>CHISHOLM ST, COAKER G, DAY B, STASKAWICZ. Host-Microbe Interactions: Shaping the Evolution of the Plant Immune Response. Cell. 2006;124:803-814. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000061&pid=S0120-548X200800020001200004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>DANE. ENA-Encuesta Nacional Agropecuaria-. Estudios Especiales. 2004 Censo de producci&oacute;n de yuca para uso industrial. Separata de resultados disponible en: <a href="http://www.dane.gov.co/files/investigaciones/agropecuario/ena/censo_yuca_ industrial.pdf" target="_blank">http://www.dane.gov.co/files/investigaciones/agropecuario/ena/censo_yuca_ industrial.pdf</a>. Consultada el 22 de abril de 2007. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000062&pid=S0120-548X200800020001200005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>DELLAPORTA SL, WOOD JB, HICKS. A Plant DNA Minipreparation: Version II. Plant Molecular Biology Reporter 1983;1:19-21. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000063&pid=S0120-548X200800020001200006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>FOFANA IBF, SANGAR&Eacute; A, COLLIER R, TAYLOR C, FAUQUET CM. A geminivirus-induced gene silencing system for gene function validation in cassava. Plant Mol. Biol. 2004;56:613-624. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000064&pid=S0120-548X200800020001200007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>GOMEZ-GOMEZ L, BOLLER T. FLS2: An LRR Receptor-like Kinase Involved in the Perception of the Bacterial Elicitor Flagellin in Arabidopsis. Mol. Cell 2000;5:1003-1011. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000065&pid=S0120-548X200800020001200008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>GRAHAM TL, GRAHAM MY, SUBRAMANIAN S, YU O. RNAi Silencing of Genes for Elicitation or Biosynthesis of 5-Deoxyisoflavonoids Suppresses Race-Specific Resistance and Hypersensitive Cell Death in <I>Phytophthora sojae </I>Infected Tissues. Plant physiol. 2007;144:728-740. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000066&pid=S0120-548X200800020001200009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>GU K, YANG B, TIAN D, WU L, WANG D, SREEKALA C, <I>et al. </I>R Gene Expression Induced by a Type-III Effector Triggers Disease Resistance in Rice. Nature. 2005;435:1122-1125. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000067&pid=S0120-548X200800020001200010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>JORGE V, FREGENE MA, DUQUE MC, BONIERBALE MW, TOHME J, VERDIER V. Genetic Mapping of Resistance to Bacterial Blight Disease in Cassava (<I>Manihot esculenta </I>Crantz). Theor. Appl. Genet. 2000;101:865-872. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000068&pid=S0120-548X200800020001200011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>JORGE V, FREGENE M, VELEZ CM, DUQUE MC, TOHME J, VERDIER V. QTL Analysis of Field Resistance to <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis </I>in Cassava. Theor. Appl. Genet. 2001;102:564-571. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000069&pid=S0120-548X200800020001200012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>JONES JDG, DANGL JL. The Plant Immune System. Nature 2006;444:323-329. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000070&pid=S0120-548X200800020001200013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>KP&Eacute;MOUA K, BOHER B, NICOLE M, CALATAYUD P, GEIGER JP. Cytochemistry of Defense Responses in Cassava Infected by <I>Xanthomonas campestris </I>pv. <I>manihotis</I>. Can. J. Microbiol. 1996;42:1131-1143. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000071&pid=S0120-548X200800020001200014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>KUMAR, D, GUSTAFSSON, C, AND KLESSIG, DF. Validation of RNAi Silencing Specificity using Synthetic Genes: Salicylic Acid-binding Protein 2 is Required for Innate Immunity in Plants. Plant J. 2006;45:863-868. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000072&pid=S0120-548X200800020001200015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>L&Oacute;PEZ CE, ZULUAGA EAP, COOKE ER, DELSENY EM, TOHME J, VERDIER VJ. Isolation of Resistance Gene Candidates (RGCs) and Characterization of an RGC Cluster in Cassava. Mol. Gen. Genomics. 2003;269:658-671. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000073&pid=S0120-548X200800020001200016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>L&Oacute;PEZ C, JORGE V, PI&Eacute;GU B, MBA C, CORTES D, RESTREPO S, <I>et al. </I>A Unigene Catalogue of 5700 Expressed Genes in Cassava. Plant Mol. Biol. 2004;56:541-554. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000074&pid=S0120-548X200800020001200017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>L&Oacute;PEZ C, SOTO, M, RESTREPO S, PI&Eacute;GU B, COOKE R, DELSENY, <I>et al. </I>A Gene Expression Profile in Response to <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis </I>Infection in Cassava Using a cDNA Microarray. Plant Mol. Biol. 2005;57:393-410. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000075&pid=S0120-548X200800020001200018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>L&Oacute;PEZ CE, BELTR&Aacute;N J, CONTRERAS E, CHAVARRIAGA P, TOHME J, VERDIER V. A <I>Xa21</I>-like Resistance Gene in Cassava: Implications for Cassava Resistance to <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis. </I>XIII FS-MPMI Congreso Jul. 22-26. 2007a. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000076&pid=S0120-548X200800020001200019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>L&Oacute;PEZ CE, QUESADA-OCAMPO LM, BOHORQUEZ A, DUQUE MC, VARGAS J, TOHME J, <I>et al. </I>Mapping EST-derived SSRs and ESTs Involved in Resistance to Bacterial Blight in <I>Manihot esculenta </I>Crantz. Genome. 2007b;50:1078-1088. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000077&pid=S0120-548X200800020001200020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>NICARAGUA K, PAV&Oacute;N F, CHAVARR&Iacute;A E. Gu&iacute;a MIP del Cultivo de la Yuca. Impresi&oacute;n Comercial La Prensa. 2004. 48pp. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000078&pid=S0120-548X200800020001200021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>RADWAN O, MOUZEYAR S, NICOLAS P, BOUZIDI MF. Induction of a Sunflower CC-NBS-LRR Resistance Gene Analogue during Incompatible Interaction with <I>Plasmopora halstedii</I>. J. Exp. Bot. 2005;56:567-575. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000079&pid=S0120-548X200800020001200022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>RAMALINGAM J, VERA CRUZ CM, KUKREJA K, CHITTOOR JM, WU JL, LEE SW, <I>et al. </I>Candidate Defense Genes From Rice, Barley, And Maize And Their Association With Qualitative And Quantitative Resistance In Rice. Mol. Plant Microbe Interact. 2003;16:14-24. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000080&pid=S0120-548X200800020001200023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>RESTREPO S, DUQUE MC, VERDIER V. Characterization of Pathotypes Among Isolates of <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis </I>in Colombia. Plant Pathol. 2000;49:680-687. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000081&pid=S0120-548X200800020001200024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>ROZEN S, SKALETSKY H. Primer3 on the WWW for General Users and for Biologist Programmers. En: Krawetz, S., Misener, S. (eds) Bioinformatics Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology. Humana Press, Totowa, NJ. 2000 p-365-386. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000082&pid=S0120-548X200800020001200025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>SEGOVIA RJ, SEDANO R, REINA G, L&Oacute;PEZ G, van SCHOONHOVEN, A. &Aacute;rboles, arbustos y aves en el agrosistema del CIAT. Centro Internacional de Agricultura Tropical. 2000. 55pg. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000083&pid=S0120-548X200800020001200026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>SWARBRICK PJ, SCHULZE-LEFERT P, SCHOLES JD. Metabolic Consequences of Susceptibility and Resistance (Race-specific and Broad-spectrum) in Barley Leaves Challenged with <I>Powdery Mildew</I>. Plant Cell Environ. 2006;29:1061-1076. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000084&pid=S0120-548X200800020001200027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>TAO Y, XIE Z, CHEN W, GLAZEBROOK J, CHANG HS, HAN B, <I>et al. </I>Quantitative Nature of <I>Arabidopsis </I>Responses during Compatible and Incompatible Interactions with the Bacterial <I>Pathogen Pseudomonas </I>syringae. Plant Cell. 2003;15:317-330. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000085&pid=S0120-548X200800020001200028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>VERDIER V. Bacteriosis Vascular (o A&ntilde;ublo Bacteriano de la Yuca Causada por <I>Xanthomonas axonopodis </I>pv. <I>manihotis. </I>En: Ospina B., Ceballos H., editores. La Yuca en el Tercer Milenio. CIAT, CLAYUCA eds. 2002. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000086&pid=S0120-548X200800020001200029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>WANG GL, SONG WY, RUAN DL, SIDERIS S, RONALD PC. The Cloned Gene, Xa21, Confers Resistance to Multiple <I>Xanthomonas oryzae </I>pv. <I>oryzae </I>Isolates in Transgenic Plants. Mol. Plant Microbe Interact. 1996;9:850-855. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000087&pid=S0120-548X200800020001200030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>YOSHIMURA S, YAMANOUCHI U, KATAYOSE Y, TOKI S, WANG ZX, KONO I, <I>et al. </I>Expression of <I>Xa1, </I>a Bacterial Blight-Resistance Gene in Rice, is Induced by Bacterial Inoculation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998;95:1663-1668. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000088&pid=S0120-548X200800020001200031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> ]]></body><back>
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