<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?><article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance">
<front>
<journal-meta>
<journal-id>0120-8705</journal-id>
<journal-title><![CDATA[CES Medicina]]></journal-title>
<abbrev-journal-title><![CDATA[CES Med.]]></abbrev-journal-title>
<issn>0120-8705</issn>
<publisher>
<publisher-name><![CDATA[Universidad CES]]></publisher-name>
</publisher>
</journal-meta>
<article-meta>
<article-id>S0120-87052014000100008</article-id>
<title-group>
<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Resistencia a antirretrovirales: bases moleculares e implicaciones farmacológicas]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Resistance to antiretrovirals: molecular bases and pharmacological implications]]></article-title>
</title-group>
<contrib-group>
<contrib contrib-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[VANEGAS-OTÁLVARO]]></surname>
<given-names><![CDATA[DANIELA]]></given-names>
</name>
<xref ref-type="aff" rid="A01"/>
</contrib>
<contrib contrib-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[ACEVEDO-SÁENZ]]></surname>
<given-names><![CDATA[LILIANA]]></given-names>
</name>
<xref ref-type="aff" rid="A02"/>
</contrib>
<contrib contrib-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[DÍAZ-CASTRILLÓN]]></surname>
<given-names><![CDATA[FRANCISCO JAVIER]]></given-names>
</name>
<xref ref-type="aff" rid="A03"/>
</contrib>
<contrib contrib-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[VELILLA-HERNÁNDEZ]]></surname>
<given-names><![CDATA[PAULA ANDREA]]></given-names>
</name>
<xref ref-type="aff" rid="A04"/>
</contrib>
</contrib-group>
<aff id="A01">
<institution><![CDATA[,Universidad de Antioquia  ]]></institution>
<addr-line><![CDATA[ ]]></addr-line>
</aff>
<aff id="A02">
<institution><![CDATA[,Universidad de Antioquia  ]]></institution>
<addr-line><![CDATA[ ]]></addr-line>
</aff>
<aff id="A03">
<institution><![CDATA[,Universidad de Antioquia  ]]></institution>
<addr-line><![CDATA[ ]]></addr-line>
</aff>
<aff id="A04">
<institution><![CDATA[,Universidad de Antioquia  ]]></institution>
<addr-line><![CDATA[ ]]></addr-line>
</aff>
<pub-date pub-type="pub">
<day>00</day>
<month>01</month>
<year>2014</year>
</pub-date>
<pub-date pub-type="epub">
<day>00</day>
<month>01</month>
<year>2014</year>
</pub-date>
<volume>28</volume>
<numero>1</numero>
<fpage>91</fpage>
<lpage>106</lpage>
<copyright-statement/>
<copyright-year/>
<self-uri xlink:href="http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&amp;pid=S0120-87052014000100008&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><self-uri xlink:href="http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_abstract&amp;pid=S0120-87052014000100008&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><self-uri xlink:href="http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_pdf&amp;pid=S0120-87052014000100008&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><abstract abstract-type="short" xml:lang="es"><p><![CDATA[Una de las principales características del virus de la inmunodeficiencia humana es la alta diversidad genética, dada, en parte, por la baja fidelidad de la transcriptasa reversa, lo cual lleva a la generación de variantes virales con mutaciones asociadas a evasión de la respuesta inmune, cambio del tropismo celular o resistencia a medicamentos antirretrovirales. La terapia antirretroviral altamente activa es un esquema farmacológico contra el virus que utiliza dos o más familias de antirretrovirales, que pretende llevar la replicación viral a niveles indetectables, reduciendo entonces la morbimortalidad y aumentando la calidad y expectativa de vida de los individuos infectados. Las mutaciones que confieren resistencia a estos fármacos pueden ser fijadas en el genoma viral y ser transmitidas a nuevos hospederos, aportando así a la circulación de una población viral resistente a estos medicamentos que resulta en falla virológica. En esta revisión se describen los mecanismos más comunes asociados con resistencia a antirretrovirales y las mutaciones reportadas en la literatura]]></p></abstract>
<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[One of the main characteristics of HIV is its high genetic diversity given in part by the low fidelity of the reverse transcriptase, which leads to the generation of viral variants bearing mutations associated with the evasion of the immune response, changes in the cellular tropism and/or antiretroviral resistance. Highly active antiretroviral therapy (HAART) is a pharmacologic scheme against HIV, which comprises two or more antiretroviral drug families, HAART aims to suppress viral replication which in turn decrease the morbidity and mortality of infected individuals, and increase their life expectancy and improve their quality of life. Mutations that confer resistance to antiretrovirals can be fixed in the viral genome and be transmitted to new hosts contributing to the movement of a viral population resistant to these drugs that results in virologic failure. In this review we describe the most common mechanisms associated with antiretroviral resistance, mutations reported in the literature and bioinformatics tools used for their determination]]></p></abstract>
<kwd-group>
<kwd lng="es"><![CDATA[VIH]]></kwd>
<kwd lng="es"><![CDATA[Terapia antirretroviral altamente activa]]></kwd>
<kwd lng="es"><![CDATA[Resistencia a medicamentos]]></kwd>
<kwd lng="es"><![CDATA[Mutación]]></kwd>
<kwd lng="es"><![CDATA[Biología computacional]]></kwd>
<kwd lng="en"><![CDATA[HIV]]></kwd>
<kwd lng="en"><![CDATA[Highly active antiretroviral therapy]]></kwd>
<kwd lng="en"><![CDATA[Drug resistance]]></kwd>
<kwd lng="en"><![CDATA[Mutation]]></kwd>
<kwd lng="en"><![CDATA[Computational biology]]></kwd>
</kwd-group>
</article-meta>
</front><body><![CDATA[ <p align="right"><font size="2" face="Verdana"><b>Art&iacute;culos de revisi&oacute;n</b></font></font></p> <font size="2" face="Verdana">     <p align="center">&nbsp;</p></font>     <p align="center"><font size="4"><b>Resistencia a antirretrovirales: bases moleculares e implicaciones farmacol&oacute;gicas</b></font></font></p>     <p align="center"><font size="3"><b>Resistance to antiretrovirals: molecular bases and pharmacological implications</b></font></font></p>     <p align="center"><font size="2" face="Verdana">DANIELA VANEGAS-OT&Aacute;LVARO<sup>1</sup>, LILIANA ACEVEDO-S&Aacute;ENZ<sup>2</sup>, FRANCISCO JAVIER D&Iacute;AZ-CASTRILL&Oacute;N<sup>3</sup>, PAULA ANDREA VELILLA-HERN&Aacute;NDEZ<sup>4</sup></font></font></p> </font>     <p><font size="2" face="Verdana"><sup>1</sup>Bi&oacute;loga, Estudiante de Maestr&iacute;a. Grupo Inmunovirolog&iacute;a, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia.    <br>   <sup>2</sup>Microbi&oacute;loga, DSci (c). Grupo Inmunovirolog&iacute;a, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia.    <br>   <sup>3</sup>M&eacute;dico, PhD. Profesor. Grupo Inmunovirolog&iacute;a, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia    <br>   <sup>4</sup>Bacteri&oacute;loga, MSc, DSci. Profesora. Grupo Inmunovirolog&iacute;a, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia. <a href="mailto:pvelilla@gmail.com">pvelilla@gmail.com</a>    <br> </font></font></p> <font size="2" face="Verdana"> <hr>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>RESUMEN</b> </font>     <p><font size="2" face="Verdana">  <i>Una de las principales caracter&iacute;sticas del virus de la inmunodeficiencia humana es la alta diversidad gen&eacute;tica, dada, en parte, por la baja fidelidad de la transcriptasa reversa, lo cual lleva a la generaci&oacute;n de variantes virales con mutaciones asociadas a evasi&oacute;n de la respuesta inmune, cambio del tropismo celular o resistencia a medicamentos antirretrovirales. La terapia antirretroviral altamente activa es un esquema farmacol&oacute;gico contra el virus que utiliza dos o m&aacute;s familias de antirretrovirales, que pretende llevar la replicaci&oacute;n viral a niveles indetectables, reduciendo entonces la morbimortalidad y aumentando la calidad y expectativa de vida de los individuos infectados. Las mutaciones que confieren resistencia a estos f&aacute;rmacos pueden ser fijadas en el genoma viral y ser transmitidas a nuevos hospederos, aportando as&iacute; a la circulaci&oacute;n de una poblaci&oacute;n viral resistente a estos medicamentos que resulta en falla virol&oacute;gica. </i></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><i>En esta revisi&oacute;n se describen los mecanismos m&aacute;s comunes asociados con   resistencia a antirretrovirales y las mutaciones reportadas   en la literatura. </i></font></font></p>     <p>&nbsp;</font><font size="2" face="Verdana"><b>PALABRAS CLAVE</b></font></font></p>     <p><i><b></b>VIH, Terapia antirretroviral altamente activa, Resistencia a medicamentos, Mutaci&oacute;n, Biolog&iacute;a computacional</i>.</font></p> <font size="2" face="Verdana"> <hr>     <p><b>ABSTRACT</b>     <p>One of the main characteristics of HIV is its high genetic diversity given in part by the low fidelity of the reverse transcriptase, which leads to the generation of viral variants bearing mutations associated with the evasion of the immune response, changes in the cellular tropism and/or antiretroviral resistance. Highly active antiretroviral therapy (HAART) is a pharmacologic scheme against HIV, which comprises two or more antiretroviral drug families, HAART aims to suppress viral replication which in turn decrease the morbidity and mortality of infected individuals, and increase their life expectancy and improve their quality of life. Mutations that confer resistance to antiretrovirals can be fixed in the viral genome and be transmitted to new hosts contributing to the movement of a viral population resistant to these drugs that results in virologic failure. In this review we describe the most common mechanisms associated with antiretroviral resistance, mutations reported in the literature and bioinformatics tools used for their determination.</font>     <p><b>KEY WORDS</b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">HIV, Highly active antiretroviral therapy, Drug resistance,Mutation, Computational biology. </font>&nbsp;</font></p> </font> <hr>     <p>&nbsp;</font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="3" face="Verdana"><b>INTRODUCCI&Oacute;N</b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La infecci&oacute;n por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH)  contin&uacute;a siendo uno de los principales problemas de la salud p&uacute;blica en el mundo.  A finales del 2011 se reportaron 34 millones (31,4-35,9 millones) de personas  infectadas con VIH, present&aacute;ndose variaciones considerables entre pa&iacute;ses y  regiones (1). En el caso espec&iacute;fico de Colombia, desde 1985 hasta el 31 de  diciembre de 2011, se han notificado un total de 75 620 casos de infecci&oacute;n por  VIH, siendo la poblaci&oacute;n entre 15 y 44 a&ntilde;os la m&aacute;s afectada (2). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">En los recientes an&aacute;lisis epidemiol&oacute;gicos se evidencia una  disminuci&oacute;n en las tasas de mortalidad asociada al s&iacute;ndrome de  inmunodeficiencia adquirida (SIDA), al igual que en el n&uacute;mero de infecciones  nuevas. Este comportamiento en la evoluci&oacute;n de la infecci&oacute;n puede ser  explicado, en parte, por la implementaci&oacute;n de la terapia antirretroviral  altamente activa (TARAA) (3). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Aunque esta terapia presenta m&uacute;ltiples beneficios en el  control de la infecci&oacute;n, tambi&eacute;n se han observado algunos efectos adversos como  intolerancia ocasionada por los efectos secundarios, lo que afecta la  adherencia al tratamiento; carencia de reconstituci&oacute;n inmunol&oacute;gica en algunos  individuos, a pesar de tener cargas virales indetectables en plasma y, el  desarrollo de resistencia a las diferentes clases de medicamentos  antirretrovirales (3). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La alta tasa de mutaciones caracter&iacute;stica de este virus,  genera variantes virales con resistencia a diferentes medicamentos  antirretrovirales, que pueden ser seleccionadas por un proceso que involucra la  presencia del medicamento dentro del microambiente celular. Se ha observado que  las mutaciones asociadas a resistencia pueden ser fijadas en el genoma viral y  ser transmitidas a nuevos hospederos, lo cual generar&aacute; una poblaci&oacute;n viral  intr&iacute;nsecamente resistente a uno o varios medicamentos antirretrovirales (ARV),  que posteriormente se traducir&aacute; en falla virol&oacute;gica en este individuo (4). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>OBJETIVO </b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">El objetivo de esta revisi&oacute;n es describir las mutaciones y mecanismos m&aacute;s comunes asociados con la resistencia a medicamentos durante la terapia antirretroviral contra el VIH; adem&aacute;s brindar una breve descripci&oacute;n de las herramientas bioinform&aacute;ticas utilizadas para la detecci&oacute;n temprana de la resistencia. Para el desarrollo de esta revisi&oacute;n, se hizo una b&uacute;squeda sistem&aacute;tica en las siguientes bases de datos: PubMed, Medline, Ovid y Scielo; se utilizaron los siguientes t&eacute;rminos: "HIV-1 infection", "virologic failure", "HAART", "HIV drug resistance mutations", "antiretroviral therapy", entre otros. </font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>TRATAMIENTO ANTIRRETROVIRAL </b></font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana">En los a&ntilde;os 90, el conocimiento de los fen&oacute;menos espec&iacute;ficos  del ciclo replicativo del VIH, la interacci&oacute;n con el hospedero y el  conocimiento de la estructura tridimensional de las prote&iacute;nas virales, permiti&oacute;  el surgimiento de la terapia antirretroviral, como una combinaci&oacute;n de tres o  m&aacute;s f&aacute;rmacos pertenecientes a dos o m&aacute;s familias de f&aacute;rmacos antirretrovirales,  la cual llevaba a una disminuci&oacute;n en los niveles de ARN viral y a un aumento en  el conteo de linfocitos T CD4+ (LT CD4+); a este tipo de tratamiento es lo que  se conoce como TARAA (5). Para 2011 la cobertura de dicha terapia fue de 68 %  en Am&eacute;rica Latina y 67 % en el Caribe, comparado con el 54 % de cobertura  global (6). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Aunque entre 1998 y 2000 las gu&iacute;as de  tratamiento para VIH del <i>Departamento de Salud y Servicios Humanos</i> de  los Estados Unidos (DHHS, por sus siglas en ingl&eacute;s) recomendaron el uso de la  TARAA para la mayor&iacute;a de los pacientes, incluyendo aquellos asintom&aacute;ticos y con  conteos de LT CD4+ mayores a 500 cell/l, la preocupaci&oacute;n por la aparici&oacute;n de  virus resistentes a los medicamentos ARV y la toxicidad de los mismos llev&oacute; a  que, entre 2001 y 2006, muchos programas asistenciales aplazaran el tratamiento  hasta que el conteo de LT CD4+ fuera menor a 350 cell/l (7). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Se ha observado que el inicio temprano de la  TARAA se asocia con un aumento en la expectativa y la calidad de vida,  disminuci&oacute;n en la probabilidad de desarrollar co-infecciones, reducci&oacute;n en la  tasa de hospitalizaci&oacute;n (8) y de la aparici&oacute;n del fen&oacute;meno denominado  discordancia inmunovirol&oacute;gica, que consiste en la poca o nula recuperaci&oacute;n en  los conteos de LT CD4+ a pesar de presentarse una supresi&oacute;n viral completa (9). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">En contraste, diversos ensayos cl&iacute;nicos han  demostrado que el inicio de la terapia antirretroviral altamente activa con  conteos de LT CD4+ inferiores a 200 cell/Âµl se asocia con mayores tasas de  falla virol&oacute;gica y resistencia a los antirretrovirales (10, 11). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Recientemente la carga viral ha sido propuesta  como un factor determinante en la elecci&oacute;n del esquema de tratamiento  antirretroviral, si se tiene en cuenta que pacientes que se encuentran bajo  terapia con rilpivirina y exhiben cargas virales &gt; 100 000 copias/ml, tienen  un mayor riesgo de falla virol&oacute;gica (12). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>RESISTENCIA A LOS MEDICAMENTOS ANTIRRETROVIRALES </b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La diversidad y disponibilidad en f&aacute;rmacos antirretrovirales  han permitido que en muchos individuos infectados y tratados con TARAA, se  logre una supresi&oacute;n viral exitosa; sin embargo, en un n&uacute;mero importante de  pacientes no se logra dicha supresi&oacute;n, dada la aparici&oacute;n de cepas resistentes  al tratamiento antirretroviral, lo cual puede depender de diferentes factores  tanto del hospedero como del virus (17). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La  no adherencia al tratamiento es la principal causa de falla virol&oacute;gica y ha  sido fuertemente asociada con la aparici&oacute;n de mutaciones de resistencia  espec&iacute;ficas para las diferentes clases de medicamentos ARV (13). Una segunda  infecci&oacute;n con otra cepa de VIH, fen&oacute;meno conocido como superinfecci&oacute;n, es otro  de los factores que contribuyen a la generaci&oacute;n de virus recombinantes que  pueden llevar a la aparici&oacute;n de variantes resistentes a medicamentos ARV  (14,15). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">En el caso de los factores virales se han observado  patrones de mutaciones asociados a resistencia propios de algunos tipos y  subtipos virales; este fen&oacute;meno, que podr&iacute;amos denominar resistencia natural,  se debe a que casi todos los f&aacute;rmacos antirretrovirales se desarrollaron para  cepas de VIH-1 subtipo B, a pesar de que s&oacute;lo el 10 % de las infecciones  corresponden a &eacute;ste y que su distribuci&oacute;n geogr&aacute;fica se limita a pa&iacute;ses de  Am&eacute;rica y de Europa Occidental (16). Un ejemplo de lo anterior es la  nevirapina, medicamento al cual se presentan tasas de resistencias previas al  tratamiento de 69 %, 36 %, 19 % y 21 % para los subtipos C, D, A, y CRF02_AG,  respectivamente (17). </font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana">La p&eacute;rdida de susceptibilidad de los virus ante  un agente antirretroviral es causada por una o m&uacute;ltiples mutaciones, ya sea que  disminuyan de forma directa la afinidad del f&aacute;rmaco por su mol&eacute;cula blanco  (mutaci&oacute;n primaria) o que se desarrollen para compensar la p&eacute;rdida de la eficacia  biol&oacute;gica del virus (mutaci&oacute;n secundaria), que se observa com&uacute;nmente despu&eacute;s de  la aparici&oacute;n de mutaciones primarias (18). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La  resistencia a los medicamentos puede estar presente desde antes de iniciar la  TARAA (resistencia primaria) o puede ser adquirida con posterioridad al inicio  del tratamiento (resistencia secundaria); la primaria se da principalmente por  la infecci&oacute;n inicial con una cepa de VIH que ya es resistente a uno o m&aacute;s  antirretrovirales. En Estados Unidos y Europa recientes estudios sugieren que  el riesgo de transmitir un virus resistente a uno o m&aacute;s medicamentos  antirretroviral est&aacute; entre el 6 y 16 %, aunque generalmente menos del 5 % de  los virus transmitidos exhiben resistencia a m&aacute;s una clase de ARV (19). En  Colombia las frecuencias de resistencia primaria reportadas hasta ahora oscilan  entre el 5,8 % y 11,8 % (20, 21). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>CLASES DE ANTIRRETROVIRALES Y MECANISMOS DE RESISTENCIA </b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Los medicamentos antirretrovirales se dividen  en seis clases: inhibidores nucle&oacute;sidos o nucle&oacute;tidos de transcriptasa reversa  (INTR), inhibidores no nucle&oacute;sidos de transcriptasa reversa (INNTR),  inhibidores de proteasa (IP), inhibidores de fusi&oacute;n, bloqueadores del  correceptor CCR5 e inhibidores de integrasa (INI) (22). Para 2013, se encontraban  27 antirretrovirales aprobados por la <i>Agencia de Drogas y Alimentos </i>de  Estados Unidos (FDA, por sus siglas en ingl&eacute;s), los cuales se han utilizado en  el dise&ntilde;o de esquemas de tratamiento contra el VIH (18). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><B>Inhibidores nucle&oacute;sidos/nucle&oacute;tidos de transcriptasa reversa (INTR)</B> </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Son  administrados como pro-medicamentos, es decir, mol&eacute;culas que requieren ser  fosforiladas por quinasas celulares para convertirse en nucle&oacute;tidos trifosfato,  la forma activa del f&aacute;rmaco (23); son an&aacute;logos de los nucle&oacute;sidos modificados en  el carbono 5' de la desoxirribosa. Se incorporan a la cadena de ADN en  formaci&oacute;n y previenen la formaci&oacute;n del enlace con el pr&oacute;ximo nucle&oacute;tido,  resultando en la terminaci&oacute;n de la elongaci&oacute;n del ADN proviral (22). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Se han identificado dos mecanismos de resistencia:  por mutaciones que permiten que la transcriptasa reversa (TR) discrimine entre  un INTR y un dNTP producido naturalmente por la c&eacute;lula, previniendo as&iacute; que los  INTR sean incorporados en la cadena creciente de ADN viral; y por mutaciones  que median la escisi&oacute;n dependiente de ATP del INTR que ya se encuentra  incorporado a la cadena creciente de ADN, permitiendo que la enzima reinicie la  s&iacute;ntesis del ADN proviral. Estas mutaciones se conocen como mutaciones de an&aacute;logos  de timidina (TAM, por su nombre en ingl&eacute;s) pues son seleccionadas por an&aacute;logos  de timidina como zidovudina y estavudina (24). </font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana"><b>Inhibidores  no nucle&oacute;sidos de transcriptasa reversa (INNTR) </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Se unen a la transcriptasa reversa induciendo un cambio  conformacional en algunos residuos importantes y hacen m&aacute;s r&iacute;gida la estructura  de dicha enzima, bloqueando la s&iacute;ntesis del ADN. A diferencia de los primeros,  estos no requieren del metabolismo celular para ejercer su actividad (25).  Regularmente, las mutaciones que se asocian con resistencia a estos  medicamentos afectan de manera espec&iacute;fica las uni&oacute;n entre el inhibidor y la  transcriptasa reversa (26). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><b>Inhibidores de proteasa (IP) </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La inhibici&oacute;n de  la actividad de la proteasa evita que se d&eacute; el procesamiento de las  poliprote&iacute;nas Gag y Gag-Pol, necesario para convertir las nuevas part&iacute;culas  virales nacientes inmaduras no infecciosas, en part&iacute;culas virales maduras e  infecciosas (27). Se dividen en dos grupos: mutaciones primarias o mayores y  mutaciones compensatorias </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">o menores (28). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las <i>primarias</i> son aquellas que afectan directamente el sitio de uni&oacute;n del inhibidor de  proteasa a la enzima; aqu&iacute; se encuentran, tanto las que se dan en el sitio  activo de la proteasa, como las localizadas en regiones cercanas al sitio de  corte, las poliprote&iacute;nas Gag y Gag-Pol. </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las mutaciones <i>menores</i> o <i>compensatorias</i> generalmente  son seleccionadas despu&eacute;s de tratamiento con los inhibidores de proteasa y se  presentan en codones que codifican amino&aacute;cidos fuera del sitio activo de la  enzima, permitiendo que el virus recupere la eficacia biol&oacute;gica que pudo haber  sido comprometida por las mutaciones mayores, contribuyendo indirectamente con  la resistencia a los IP (28). </font></p>     <p><b>Inhibidores de  entrada </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La entrada del VIH a la c&eacute;lula no solo est&aacute; mediada por la  uni&oacute;n de la glicoprote&iacute;na viral gp120 con el receptor celular CD4, es necesario  que se genere una segunda interacci&oacute;n con un correceptor celular bien sea CCR5  o CXCR4. La elecci&oacute;n del correceptor usado por el virus, es decir, el tropismo  viral, est&aacute; estrechamente relacionado con la adquisici&oacute;n y patog&eacute;nesis de la  enfermedad. En general, la mayor&iacute;a de los virus transmitidos utilizan el  correceptor CCR5 para entrar a las c&eacute;lulas, mientras que la aparici&oacute;n de virus  con tropismo CXCR4 se ha asociado a una mayor velocidad de progresi&oacute;n a SIDA  (29). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Los inhibidores de entrada pueden subdividirse en dos clases:  inhibidores de fusi&oacute;n y bloqueadores del correceptor CCR5. <i>Los inhibidores  de fusi&oacute;n </i>se unen al dominio HR1 y HR2 de la glicoprote&iacute;na viral gp41,  generando un impedimento est&eacute;rico, que impide la fusi&oacute;n de la envoltura viral  con la membrana celular. La resistencia a estos f&aacute;rmacos se genera por  mutaciones en HR1 y HR2. </font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana">Los <i>bloqueadores  del correceptor </i>interact&uacute;an con la mol&eacute;cula CCR5, generando un cambio  conformacional que evita la uni&oacute;n con la gp120 viral (18). La resistencia a  los bloqueadores de CCR5 se da a trav&eacute;s del uso de un correceptor alterno CXCR4  debido al desarrollo de mutaciones en gp120 o por mutaciones en gp 41 que permiten  eludir el bloqueo de la interacci&oacute;n entre estas glicoprote&iacute;nas virales y el  CCR5 celular (30). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><b>Inhibidores de integrasa (INI) </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Son mol&eacute;culas estructuralmente diversas que contienen un  motivo de uni&oacute;n a un cati&oacute;n met&aacute;lico divalente como Mg<sup>2+</sup> o Mn<sup>2+</sup> y una regi&oacute;n hidrof&oacute;bica para entrar en la cavidad formada  por la integrasa y el extremo 3' del ADN viral que contiene el dinucle&oacute;tido  terminal CA (31). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La resistencia a inhibidor de integrasa es causada por  mutaciones primarias y secundarias a trav&eacute;s de tres mecanismos diferentes: el  primero es mediado por mutaciones que generan cambios conformacionales dentro  del bolsillo catal&iacute;tico de la integrasa, lo cual lleva a que el inhibidor de  integrasa se una a sitios adyacentes al sitio activo de la integrasa,  disminuyendo su funci&oacute;n significativamente por una inhibici&oacute;n alost&eacute;rica  parcial (32). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">El segundo mecanismo es mediado por mutaciones generadas en  respuesta al tratamiento con raltegravir, donde se da un cambio en dos  amino&aacute;cidos ubicados cerca del sitio catal&iacute;tico de la enzima que forman un  puente de hidr&oacute;geno con un residuo ubicado dentro de &eacute;ste, inhibiendo la uni&oacute;n  del cofactor met&aacute;lico necesario para la acci&oacute;n de la integrasa, lo que  disminuye la eficacia biol&oacute;gica del virus. Finalmente, el tercer mecanismo es  dirigido por mutaciones que disminuyen la uni&oacute;n entre el raltegravir y la  integrasa, interfiriendo directamente con la actividad del inhibidor de  integrasa (31). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>DIN&Aacute;MICA POBLACIONAL DE LA RESISTENCIA </b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Una de las caracter&iacute;sticas m&aacute;s importante del virus es su  alta variabilidad gen&eacute;tica, lo que permite la formaci&oacute;n de variantes virales  con capacidad para evadir el sistema inmune, cambiar el tropismo celular y  desarrollar resistencia a medicamentos antirretrovirales, las cuales pueden  permanecer como poblaciones minoritarias o, de acuerdo al ambiente, expandirse  e influir en el desenlace cl&iacute;nico y en la respuesta al tratamiento. </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La transcriptasa reversa del virus se considera la principal  fuente de mutaciones, mientras que la segunda mayor contribuci&oacute;n a la  diversidad del virus es dada por el intercambio de segmentos o recombinaci&oacute;n  entre dos genomas ARN durante el proceso de duplicaci&oacute;n del genoma (33). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La tasa de mutaci&oacute;n se define como el n&uacute;mero de bases  incorrectas que son incorporadas en el genoma del virus en cada ciclo de  replicaci&oacute;n; esta var&iacute;a entre 3,4 x 10<sup>-5</sup>Â a 2,4 x 10<sup>-5</sup>Â sustituciones/  nucle&oacute;tido/ciclo replicativo (34); teniendo en cuenta que el genoma viral es de  aproximadamente 104 nucle&oacute;tidos, se  puede asumir que aproximadamente una cuarta parte de los viriones nacientes  presentan mutaciones (35). </font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana">Durante la transcripci&oacute;n del genoma, la transcriptasa  reversa debe hacer dos saltos o cambios de molde para generar el ADN proviral  (25). Dado que el genoma del VIH est&aacute; compuesto por dos copias de ARN de cadena  sencilla y que un individuo puede infectarse simult&aacute;neamente con dos subtipos o  dos variantes diferentes, estos saltos durante la transcripci&oacute;n reversa llevan  a la formaci&oacute;n de part&iacute;culas virales con genomas recombinantes que pueden  contener varias mutaciones que conducen a multiresistencia (36). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">La ocurrencia de tales cambios gen&eacute;ticos no necesariamente se  expande a la totalidad de la poblaci&oacute;n viral. En ausencia de un factor de selecci&oacute;n  -como lo puede ser el tratamiento antiviral- dichos mutantes y recombinantes  pueden permanecer como variantes minoritarias. El tratamiento con f&aacute;rmacos  antirretrovirales puede seleccionarlos positivamente y llevarlos a constituirse  en la subpoblaci&oacute;n predominante. A su vez, la suspensi&oacute;n del tratamiento puede  reversar dicho efecto y llevar a los mutantes resistentes de nuevo a una  proporci&oacute;n minoritaria. </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Una sola mutaci&oacute;n o una combinaci&oacute;n particular de mutaciones  pueden conferir resistencia a varios medicamentos de la misma clase, esto es,  resistencia cruzada. El n&uacute;mero de mutaciones requeridas para conferir  resistencia y el costo en la eficacia biol&oacute;gica de estas mutaciones constituyen  la llamada &ldquo;barrera gen&eacute;tica a la resistencia&rdquo;, que, en general, es m&aacute;s alta  para los IP y m&aacute;s baja para los INNTR y algunos INTR como lamivudina y  emtricitabina(18). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>MUTACIONES M&Aacute;S COMUNES ASOCIADAS A RESISTENCIA A MEDICAMENTOS ANTIRRETROVIRALES </b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">El estudio gen&eacute;tico de los diferentes aislados virales  permite identificar las diferentes mutaciones asociadas con resistencia a los  medicamentos antiretrovirales, si se identifican en al menos una de las  siguientes situaciones (37): i) en experimentos in vitro que confirmen la contribuci&oacute;n  a la resistencia usando mutag&eacute;nesis dirigida; ii) por evaluaci&oacute;n de la  disminuci&oacute;n de la susceptibilidad in vitro a los antirretrovirales en aislados  cl&iacute;nicos o cepas de laboratorio; y iii) por correlaciones entre la secuencia  del genoma viral (genotipo) y la respuesta virol&oacute;gica en pacientes que se  expusieron al tratamiento (38). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">As&iacute;, se han  podido catalogar las principales mutaciones que generan resistencia a cada uno  de estos f&aacute;rmacos las cuales pueden ser consultadas en las bases de datos de  resistencia a antirretroviral como la de la Universidad de Standford  (http://hivdb.stanford.edu/), la del Laboratorio Nacional Los Alamos del  Departamento de Salud y Servicios Humanos de los Estados Unidos (LANL) (http://www.hiv.lanl.gov/content/  index) y la del Departamento de Salud Nacional del Reino Unido de Resistencia a  Medicamentos (http://www.hivrdb.org.uk/). </font></p>     <p><b>Resistencia a  inhibidores nucle&oacute;sidos/ nucle&oacute;tidos de transcriptasa reversa (INTR) </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">En el <a href="#c1" target="_new">cuadro 1</a> se muestra las principales mutaciones  reportadas para las INTR y sus patrones de resistencia. Dentro de las  mutaciones discriminatorias, las m&aacute;s comunes son la mutaci&oacute;n K65V, en la cual  se da un remplazo de lisina (K) por una valina (V) en la posici&oacute;n 65 y la M184V  donde se da una cambio de metionina (M) por valina (V) en la posici&oacute;n 184. Sin  embargo, tambi&eacute;n se pueden presentar frecuentemente otras mutaciones como las  TAM, las asociadas a resistencia cruzada y otras no clasificadas en los grupos  anteriores. A continuaci&oacute;n se detallan las caracter&iacute;sticas de cada mutaci&oacute;n: </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">* K65V:  mutaci&oacute;n discriminatoria com&uacute;n ante los inhibidores nucle&oacute;sidos/nucle&oacute;tidos de  la TR, es seleccionada inicialmente por tenofovir (TDF) y en menor medida por  abacavir (ABC), didanosina (ddI), lamivudina (3TC) y emtribicitabina (FTC).  Genera una baja resistencia a estavudina (d4T) pero incrementa la  susceptibilidad a zidovudina (AZT). </font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana">* M184V:  es la mutaci&oacute;n discriminatoria m&aacute;s com&uacute;n de resistencia ante los inhibidores  nucle&oacute;sidos/nucle&oacute;tidos de la TR<b>; </b>in vitro genera resistencia elevada a  3TC y FTC, baja resistencia a ddI y el ABC, y susceptibilidad aumentada a la  AZT, d4T y al TDF (39). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">* Mutaciones  de resistencia cruzada: en respuesta a diferentes inhibidores nucle&oacute;sidos/  nucle&oacute;tidos de la TR, se pueden generar mutaciones que confieren resistencia a  m&aacute;s de un INTR. La inserci&oacute;n en el cod&oacute;n 69 (69i) genera resistencia a todo el  grupo de los INTR, pero s&oacute;lo resistencia intermedia a 3TC y FTC (40). La  mutaci&oacute;n Q151M genera resistencia a TDF, 3TC y FTC (41); adem&aacute;s esta &uacute;ltima  mutaci&oacute;n, se desarrolla en el 5 % de los pacientes que reciben ddI en  combinaci&oacute;n con AZT o d4T (42). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las TAM s&oacute;lo son seleccionadas con terapias que contienen AZT  o d4T pero generan resistencia cruzada a otros INTR y ocurren independientemente  de las mutaciones discriminatorias; adem&aacute;s, se ha observado que la presencia de  TAM predispone al desarrollo de otras mutaciones cuando se administra TDF, ABC  y ddI. </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las TAM se  dividen en dos patrones diferentes denominados TAM-1 y TAM-2, donde para el  TAM-1 se observan las mutaciones M41L, L210W y T215Y que generan una  resistencia alta a an&aacute;logos de timidina y resistencia cruzada a ABC, ddI y  TDF, mientras que el TAM-2 incluye las mutaciones D67N, K70R, T215F, y K219Q/E  (43). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">&bull;  Otras mutaciones: L74V y K65R se generan en ausencia de an&aacute;logos de timidina.  La K65R causa resistencia intermedia a d4T y susceptibilidad incrementada a  AZT. La L74V causa resistencia intermedia a ddI y ABC, y un leve aumento de  susceptibilidad a AZT y TDF (37). </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p align="center"><font size="2" face="Verdana"><img src="img/revistas/cesm/v28n1/v28n1a08c1.jpg"></font></font><a name="c1"></a></p>     <p>&nbsp;</font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Resistencia a inhibidores no nucle&oacute;sidos  de transcriptasa reversa (INNTR) </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las mutaciones  de resistencia m&aacute;s comunes para los INNTR se clasifican en cuatro categor&iacute;as  diferentes (<a href="#c2" target="_new">cuadro 2</a>). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">&bull; Primarias:  aquellas que causan resistencia a uno o m&aacute;s INNTR y son las primeras que se  desarrollan dentro de las terapias con estos medicamentos; entre &eacute;stas se  encuentran las mutaciones K103N/S, V106A/M, Y181C/I/V, Y188L/C/H y G190A/S/E  que generan alta resistencia a la neviparina. Con excepci&oacute;n de las mutaciones V106A and Y181CIV, las dem&aacute;s mutaciones causan alta resistencia o resistencia intermedia al efavirenz (44). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">&bull; Secundarias: usualmente se desarrollan en combinaci&oacute;n con una mutaci&oacute;n primaria y tienen implicaciones en la selecci&oacute;n de medicamentos para su uso; entre &eacute;stas se encuentran L100I, K101P, P225H, F227L, M230L y K238T/N. </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las mutaciones L100I y K101P ocurren en combinaci&oacute;n con K103N y disminuyen la susceptibilidad a NVP y EFV hasta 80 veces en comparaci&oacute;n con solo la presencia de K103N (45); para P225H y K238T/N, las cuales usualmente se presentan en combinaci&oacute;n con K103N, se observa un efecto sin&eacute;rgico en la disminuci&oacute;n de susceptibilidad a NVP y EFV (46)7F. En el caso de F227L, &eacute;sta se presenta en combinaci&oacute;n con V106A y dirigen la reducci&oacute;n sin&eacute;rgica de susceptibilidad a neviparina y, finalmente, M230L puede presentarse sola y generar una disminuci&oacute;n en la susceptibilidad hasta 20 veces m&aacute;s a todos los INNTR incluyendo la etravirina (ETV) (46).</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"> &bull; Mutaciones menores no polim&oacute;rficas: pueden ocurrir solas o en combinaci&oacute;n con otras mutaciones asociadas a resistencia y que causan un reducci&oacute;n baja pero consistente en la susceptibilidad a los inhibidores no nucle&oacute;sidos de la TR. Las mutaciones de este grupo son A98G, K101E, V108I y reducen la susceptibilidad a neviparina y efavirenz. V179D unida a K103R que per se no genera resistencia, disminuye la susceptibilidad a neviparina y efavirenz (47)/. </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">&bull; Mutaciones accesorias polim&oacute;rficas: modulan el efecto de otras mutaciones de resistencia a los inhibidores no nucle&oacute;sidos de la TR; un ejemplo de esto es la mutaci&oacute;n E138K, que parece conferir resistencia cruzada a etravirina, neviparina y efavirenz. Las mutaciones K101P/ H/E, I135T/M y V179D/E/F/T/L disminuyen la susceptibilidad a neviparina y efavirenz (42).</font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p align="center"><font size="2" face="Verdana"><img src="img/revistas/cesm/v28n1/v28n1a08c2.jpg"></font></font><a name="c2"></a></p>     <p>&nbsp;</font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Resistencia a inhibidores de proteasa (IP) </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las mutaciones de resistencia pueden ser (27):</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">&bull; Mutaciones mayores o primarias: por s&iacute; solas   generan una reducci&oacute;n en la susceptibilidad   para uno o m&aacute;s inhibidores de proteasa.   Las m&aacute;s comunes son D30N, V32I,   M46IL, G48V/M, I50V/L, I54V/T/A/L/M, L76V,   V82A/T/F/S, I84V, N88S y L90M (18). D30N   es seleccionada por nelfinavir (NFV) y I50L   por atazanavir (ATV), siendo las &uacute;nicas mutaciones   que generan resistencia a un solo   inhibidor de proteasa (48); adem&aacute;s, se ha   observado que la mutaci&oacute;n D30N ocurre   con mayor frecuencia en virus subtipo B y   L90M en virus subtipo C, F, G y CRF01_AE   (49).  </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Las mutaciones I50V e I54L incrementan la   susceptibilidad a tripanavir (TPV), N88S incrementa   la susceptibilidad a fosamprenavir y   L76V incrementa la susceptibilidad a atazanavir,   saquinavir y tripanavir (42); mientras que   V82A/T/F/S y I84V est&aacute;n asociados a resistencia   a todos los inhibidores de proteasa, resaltando   por ser mutaciones con un alto grado de polimorfismo   (37).</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"> &bull; Mutaciones compensatorias o menores: se   encargan de compensar las alteraciones en   la eficiencia biol&oacute;gica del virus originada por   mutaciones mayores, pueden ser polimorfismos   prexistentes o adquiridos despu&eacute;s   de las mutaciones primarias y se han encontrado   en aislados de pacientes sin tratamiento.   Las mutaciones accesorias que   regulan positivamente la funci&oacute;n de la proteasa   compensan las mutaciones mayores   y se ubican en las posiciones 10, 20, 36 y   71 de esta enzima viral. Las posiciones 10,   20 y 36 son altamente polim&oacute;rficas, present&aacute;ndose   asociaciones de las mutaciones en   la posici&oacute;n 10 con resistencia la mayor&iacute;a de   los IP, excepto para el darunavir. Las mutaciones   en la posici&oacute;n 20 est&aacute;n asociadas a resistencia   a indinavir, lopinavir y atazanavir,   mientras que las mutaciones en la posici&oacute;n   36 generan resistencia a atazanavir, indinavir,   nelfinavir y tripanavir. Adem&aacute;s, se han   reportado otras mutaciones polim&oacute;rficas   como I13V, D60E, I62V, V77I y I93L, y otras   mutaciones no polim&oacute;rficas no comunes   que incluyen V11I, E34Q, E35G, K43T, K45I,   K55R, Q58E, T74P/A/S, V75I, N83D, P79A/S,   I85V, L89V, T91S, Q92K y C95F (<a href="#c3" target="_new">cuadro 3</a>)   (50). </font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">&bull; Combinaci&oacute;n de mutaciones mayores y   accesorias: se han observado en la mayor&iacute;a   de los virus resistentes a los inhibidores de proteasa.</font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><b>Resistencia a los inhibidores de integrasa (INI) </b></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">A la fecha, dos INI han sido aprobados por la FDA: raltegravir y el dolutegravir. Para raltegravir se distinguen tres patrones de mutaciones conformados por una mutaci&oacute;n mayor (N155H, Q148H/R/K y Y143C/R) y una mutaci&oacute;n menor (E92Q, G140A/S y T97A). El primer patr&oacute;n se distingue por la presencia de las mutaciones N155H y E92Q; el segundo por las mutaciones Q148H/R/K y G140S/A y el tercero por las mutaciones Y143C/R y T97A (32), a pesar de la reciente aprobaci&oacute;n del dolutegravir en 2013, las mutaciones Q148H y G140S en combinaci&oacute;n con las mutaciones L74I/M, E92Q, T97A,E138A/K, G140A, o N155H se han asociado con una susceptibilidad reducida entre 5 -20 veces a este medicamento, adem&aacute;s de una reducci&oacute;n en la supresi&oacute;n viral (51).</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><b>Resistencia a inhibidores de entrada</b></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Para el enfuvirtide (ENF), el &uacute;nico inhibidor de fusi&oacute;n aprobado por la FDA, se reconocen las mutaciones desde el residuo 36 hasta el 45 en el gen de la envoltura, siendo las mutaciones G36D/E/V, V38E/A, Q40H, N42T y N43D las m&aacute;s importantes.</font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p align="center"><img src="img/revistas/cesm/v28n1/v28n1a08c3.jpg"></font><a name="c3"></a></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Adem&aacute;s se reconocen tres mutaciones accesorias (N126K, N137K y S138A) que se asocian con una reconstituci&oacute;n de la eficacia biol&oacute;gica (37). En el caso de los bloqueadores del correceptor CCR5, solo se ha aprobado el maraviroc; ya se han identificado mutaciones en el asa V3 de la gp120 en pacientes que incluyen este f&aacute;rmaco en su esquema de tratamiento, pero adem&aacute;s tambi&eacute;n se han reportado la presencia de mutaciones en gp41 sin mutaciones en el asa V3, por lo cual a&uacute;n no se ha establecido el papel de estas mutaciones en la inducci&oacute;n de resistencia ni su significancia cl&iacute;nica, ya que se ha observado que se genera resistencia sin cambiar el tropismo del virus (37). </font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>EVALUACI&Oacute;N DE LA RESISTENCIA A ANTIRRETROVIRALES</b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Actualmente se encuentran disponibles en el mercado varias t&eacute;cnicas para evaluar resistencia a antirretrovirales, las cuales se clasifican en pruebas fenot&iacute;picas y pruebas genot&iacute;picas. Las pruebas fenot&iacute;picas buscan establecer la concentraci&oacute;n necesaria de un f&aacute;rmaco para inhibir en un 50 % (IC50) la replicaci&oacute;n de la cepa viral en estudio (52). </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Aunque este es el m&eacute;todo m&aacute;s directo de detectar   y cuantificar la resistencia a los diferentes   f&aacute;rmacos antirretrovirales, estas pruebas presentan   ciertas desventajas: no pueden realizarse   en individuos que tienen cargas virales bajas, el   an&aacute;lisis se debe hacer independientemente para   cada f&aacute;rmaco, el procedimiento demora varios   d&iacute;as y su ejecuci&oacute;n presenta elevados costos.   Sumado a lo anterior, estos tipo de pruebas   solamente est&aacute;n disponibles en laboratorios especializados   de alta complejidad con capacidad   para cultivar el VIH y no en los laboratorios cl&iacute;nicos generales (53). </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Por su parte, las pruebas genot&iacute;picas emplean   an&aacute;lisis de secuencias del genoma viral para detectar la presencia de las mutaciones asociadas con resistencia a antiretrovirales. Este tipo de pruebas, las m&aacute;s usadas en los laboratorios de diagn&oacute;stico, utilizan diferentes herramientas bioinform&aacute;ticas para el an&aacute;lisis in s&iacute;lico de las secuencias. La t&eacute;cnica permite identificar mutaciones asociadas a resistencia presentes en la cepa infectante. Entre las ventajas de este m&eacute;todo se destaca el corto tiempo entre la toma de muestra y la obtenci&oacute;n de un resultado y la capacidad de predecir la resistencia antes de que aparezca el fenotipo resistente.</font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana"> Entre sus limitaciones se encuentra el que estas   tampoco pueden realizarse en individuos   que tienen cargas virales bajas y es posible que   no sean detectadas las variantes minoritarias   resistentes que representen menos del 20% del   total de la poblaci&oacute;n viral. Adem&aacute;s, en el momento   de la obtenci&oacute;n de la muestra se debe   continuar con los antirretrovirales para mantener   la presi&oacute;n selectiva y as&iacute; evitar que las   variantes minoritarias vuelvan a una peque&ntilde;a   proporci&oacute;n (54). Aunque a&uacute;n no est&aacute; del todo   claro el impacto de estas mutantes minoritarias   frente a la TARAA, se ha encontrado una asociaci&oacute;n   entre su presencia y pobres desenlaces   cl&iacute;nicos (53).</font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"> Se encuentran disponibles programas bioinform&aacute;ticos   gratuitos dise&ntilde;ados espec&iacute;ficamente   para predecir el subtipo o para identificar mutaciones   asociadas a resistencia. Estos permiten   adem&aacute;s una aproximaci&oacute;n cuantitativa al grado   de resistencia asociado a cada combinaci&oacute;n de   mutaciones, mediante la comparaci&oacute;n con cepas   previamente secuenciadas y evaluadas por m&eacute;todos   fenot&iacute;picos; esto constituye el llamado   "fenotipo virtual".   </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Entre estos programas podemos citar Geno2pheno   Resistance (http://www.geno2pheno.org/) el   cual detecta resistencia genot&iacute;pica para 15 diferentes   medicamentos ARV y permite predecir el   subtipo viral (55). </font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>INDICACIONES E IMPLICACIONES CL&Iacute;NICAS DE LA EVALUACI&Oacute;N DE RESISTENCIA A ANTIRRETROVIRALES</b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">En principio la detecci&oacute;n de las diferentes mutaciones es ideal antes del inicio de la terapia antirretroviral altamente activa, ya que permitir&iacute;a personalizar el esquema de tratamiento. Sin embargo, las indicaciones de las pruebas de resistencia a los antirretrovirales han sido objeto de cierto debate. Para el 2013 los lineamientos en la gu&iacute;a de tratamiento propuesta por el Departamento de Salud de los Estados Unidos (DHHS) sugieren realizar una prueba genot&iacute;pica despu&eacute;s de la primera falla virol&oacute;gica con el fin de seleccionar un nuevo r&eacute;gimen; adem&aacute;s se recomienda una evaluaci&oacute;n genot&iacute;pica del tropismo viral por el correceptor, antes de iniciar un esquema de tratamiento que incluya un bloqueador de CCR5 (11). </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Por otra parte, la gu&iacute;a de tratamiento de la   Sociedad Europea Cl&iacute;nica de SIDA (EACS, seg&uacute;n   sus siglas en ingl&eacute;s) de 2013 sugiere realizar la   prueba genot&iacute;pica de resistencia desde antes de   iniciar la terapia antirretroviral altamente activa   o cuando existe el riesgo de una superinfecci&oacute;n   con varias cepas de VIH (56). En Colombia no   existe una gu&iacute;a actualizada para el manejo de   pacientes infectados con VIH; la gu&iacute;a para el   manejo del VIH/SIDA basada en la evidencia de   2006, suger&iacute;a realizar la evaluaci&oacute;n genot&iacute;pica   despu&eacute;s del segundo o tercer fracaso terap&eacute;utico   y no realizarla en pacientes con problemas de   adherencia o intolerancia a los antirretrovirales (57). </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Teniendo en cuenta las sugerencias previamente   mencionadas, es previsible que las nuevas   gu&iacute;as colombianas -actualmente en proceso   de revisi&oacute;n- recomienden la realizaci&oacute;n de las pruebas genot&iacute;picas de resistencia previamente al inicio de la TARAA, o al menos despu&eacute;s de la primera falla, con lo cual probablemente se podr&iacute;a aumentar la probabilidad del &eacute;xito terap&eacute;utico as&iacute; como la expectativa y la calidad de vida de los pacientes.</font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>CONCLUSIONES</b></font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="2" face="Verdana">Una de las principales caracter&iacute;sticas del VIH es su diversidad gen&eacute;tica, que se genera, en parte, por la acumulaci&oacute;n de mutaciones insertadas al azar por la transcriptasa reversa, las cuales pueden inducir no solo escape inmunol&oacute;gico sino tambi&eacute;n resistencia a los f&aacute;rmacos antirretrovirales, lo que se traduce en falla virol&oacute;gica. </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Teniendo en cuenta que diferentes estudios han demostrado que la progresi&oacute;n de la enfermedad puede ser modulada por el inicio temprano de la terapia antirretroviral altamente activa, se hace necesario dise&ntilde;ar tanto pol&iacute;ticas p&uacute;blicas como gu&iacute;as cl&iacute;nicas que eval&uacute;en detalladamente las caracter&iacute;sticas cl&iacute;nicas de cada individuo infectado, con el fin de establecer el esquema m&aacute;s adecuado y reducir al m&aacute;ximo la aparici&oacute;n y/o selecci&oacute;n de variantes virales resistentes al tratamiento.</font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"> En Colombia existe una gu&iacute;a desde el a&ntilde;o 2006,   donde se describe el protocolo de clasificaci&oacute;n   y manejo de los pacientes VIH; sin embargo,   desde esa fecha no se han realizado actualizaciones,   por lo que se contin&uacute;a evaluando el perfil   de resistencia por pruebas genot&iacute;picas s&oacute;lo   despu&eacute;s de la segunda o tercera falla virol&oacute;gica,   paradigma que debe ser re-evaluado, dado que   este comportamiento afecta la respuesta a la   TARAA y promueve la aparici&oacute;n de mutaciones asociadas a resistencia. </font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Es importante realizar estudios descriptivos   que identifiquen los medicamentos y esquemas   de mayor uso para la terapia antirretroviral altamente   activa en Colombia y la frecuencia de   fallas virol&oacute;gicas por paciente; esta informaci&oacute;n   ayudar&iacute;a a monitorear el perfil de resistencia a   antirretrovirales en nuestra poblaci&oacute;n.   </font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><b>CONFLICTOS DE INTERESES</b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Los autores del presente trabajo declaran no presentar conflicto de intereses. </font></font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana"><b>AGRADECIMIENTOS</b></font></font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">A Colciencias por la financiaci&oacute;n del proyecto N&ordm;. 111556933380.</font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>&nbsp;</font></p> <hr>     <p><font size="3" face="Verdana"><b>REFERENCIAS</b></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">1. UNAIDS. Global Report United States: United Nations Programme on HIV/AIDS (UNAIDS); 2012 (cited 2013 January).    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000145&pid=S0120-8705201400010000800001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 2. Social MdSPyP. Informe UNGASS - 2012   Seguimiento de la Declaraci&oacute;n de compromiso   sobre el VIH/Sida. 2012.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000147&pid=S0120-8705201400010000800002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">3. Namme Luma H, Doualla MS, Choukem SP,   Temfack E, Ashuntantang G, Achu Joko H, et   al. Adverse drug reactions of Highly Active   Antiretroviral Therapy (HAART) in HIV infected   patients at the General Hospital, Douala,   Cameroon: a cross sectional study. Pan Afr   Med J. 2012; 12:87.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000149&pid=S0120-8705201400010000800003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 4. Swanstrom R, Coffin J. HIV-1 pathogenesis:   the virus. Cold Spring Harb Perspect Med.   2012; 2(12):a007443.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000151&pid=S0120-8705201400010000800004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">5. Lederman MM, Connick E, Landay A, Kuritzkes   DR, Spritzler J, St Clair M, et al. Immunologic   responses associated with 12   weeks of combination antiretroviral therapy   consisting of zidovudine, lamivudine, and ritonavir:   results of AIDS Clinical Trials Group   Protocol 315. J Infect Dis. 1998; 178(1):70-9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000153&pid=S0120-8705201400010000800005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">6. UNAIDS. Regional Fact Sheet 2012 - Latin   America And The Caribbean United States   2012 (cited 2013).    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000155&pid=S0120-8705201400010000800006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->  </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">7. Kitahata MM. When to start antiretroviral   therapy. Top HIV Med. 2010; 18(3):121-6.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000157&pid=S0120-8705201400010000800007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 8. Mills FP, Ford N, Nachega JB, Bansback N,   Nosyk B, Yaya S, et al. Earlier initialization of   highly active antiretroviral therapy is associated   with long-term survival and is costeffective:   findings from a deterministic model   of a 10-year Ugandan cohort. J Acquir   Immune Defic Syndr. 2012; 61(3):364-9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000159&pid=S0120-8705201400010000800008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 9. Ghaffari G, Passalacqua DJ, Caicedo JL,   Goodenow MM, Sleasman JW. Two-year   clinical and immune outcomes in human   immunodeficiency virus-infected children   who reconstitute CD4 T cells without control   of viral replication after combination   antiretroviral therapy. Pediatrics. 2004;   114(5):e604-11.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000161&pid=S0120-8705201400010000800009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">10. Kuller LH, Tracy R, Belloso W, De Wit S,   Drummond F, Lane HC, et al. Inflammatory   and coagulation biomarkers and mortality   in patients with HIV infection. PLoS Med. 2008; 5(10):e203.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000163&pid=S0120-8705201400010000800010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 11. Antiretroviral DoHaHSPo. Panel on Antiretroviral   Guidelines for Adults and Adolescents.   Guidelines for the use of antiretroviral   agents in HIV-1-infected adults and adolescents.   2013. p. 3:4.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000165&pid=S0120-8705201400010000800011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">12. Wainberg MA. Combination therapies, effectiveness,   and adherence in patients with HIV   infection: clinical utility of a single tablet of   emtricitabine, rilpivirine, and tenofovir. HIV   AIDS (Auckl). 2013;5:41-9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000167&pid=S0120-8705201400010000800012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 13. von Wyl V, Klimkait T, Yerly S, Nicca D, Furrer   H, Cavassini M, et al. Adherence as a predictor   of the development of class-specific   resistance mutations: the Swiss HIV Cohort   Study. PLoS One. 2013;8(10):e77691.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000169&pid=S0120-8705201400010000800013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">14. van der Kuyl AC, Cornelissen M. Identifying   HIV-1 dual infections. Retrovirology.   2007;4:67.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000171&pid=S0120-8705201400010000800014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">15. Gottlieb GS, Nickle DC, Jensen MA, Wong   KG, Grobler J, Li F, et al. Dual HIV-1 infection   associated with rapid disease progression.   Lancet. 2004;363(9409):619-22.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000173&pid=S0120-8705201400010000800015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">16. Wainberg MA, Brenner BG. Role of HIV Subtype   Diversity in the development of resistance   to antiviral drugs. Viruses. 2010;   2(11):2493-508.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000175&pid=S0120-8705201400010000800016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 17. Eshleman SH, Hoover DR, Chen S, Hudelson   SE, Guay LA, Mwatha A, et al. Nevirapine   (NVP) resistance in women with HIV-1 subtype   C, compared with subtypes A and D,   after the administration of single-dose NVP.   J Infect Dis. 2005; 192(1):30-6.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000177&pid=S0120-8705201400010000800017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">18. Tang MW, Shafer RW. HIV-1 antiretroviral resistance:   scientific principles and clinical   applications. Drugs. 2012; 72(9):e1-25.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000179&pid=S0120-8705201400010000800018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">19. Cohen MS, Chen YQ, McCauley M, Gamble T,   Hosseinipour MC, Kumarasamy N, et al. Prevention   of HIV-1 infection with early antiretroviral   therapy. N Engl J Med. 2011; 365(6):493-505.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000181&pid=S0120-8705201400010000800019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">20. Galindo-Orrego P, Mueses-Mar&iacute;n HF, Galindo-   Quintero J, Mart&iacute;nez-Cajas JL. Resistencia   transmitida del virus de la inmunodeficiencia   humana en pacientes sin exposici&oacute;n   previa a tratamiento antirretroviral, Cali, Colombia,   2010. Infectio. 2014; 17:19-27.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000183&pid=S0120-8705201400010000800020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 21. DiazGranados CA, Mantilla M, Lenis W. Antiretroviral   drug resistance in HIV-infected   patients in Colombia. Int J Infect Dis. 2010;   14(4):e298-303.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000185&pid=S0120-8705201400010000800021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 22. Arts EJ, Hazuda DJ. HIV-1 Antiretroviral Drug   Therapy. Cold Spring Harb Perspect Med.   2012; 2(4):a007161.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000187&pid=S0120-8705201400010000800022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">23. Nakashima H, Matsui T, Harada S, Kobayashi   N, Matsuda A, Ueda T, et al. Inhibition of   replication and cytopathic effect of human   T cell lymphotropic virus type III/lymphadenopathy-   associated virus by 3'-azido-3'- deoxythymidine in vitro. Antimicrob Agents   Chemother. 1986;30(6):933-7.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000189&pid=S0120-8705201400010000800023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 24. Clavel F, Hance AJ. HIV drug resistance. N   Engl J Med. 2004; 350(10):1023-35.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000191&pid=S0120-8705201400010000800024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 25. Esposito F, Corona A, Tramontano E. HIV-   1 Reverse transcriptase still remains a new   drug target: structure, function, classical inhibitors,   and new inhibitors with innovative   mechanisms of actions. Mol Biol Int. 2012;   2012:586401.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000193&pid=S0120-8705201400010000800025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">26. Maga G, Amacker M, Ruel N, H&uuml;bscher U,   Spadari S. Resistance to nevirapine of HIV-1   reverse transcriptase mutants: loss of stabilizing   interactions and thermodynamic or   steric barriers are induced by different single   amino acid substitutions. J Mol Biol. 1997;   274(5):738-47.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000195&pid=S0120-8705201400010000800026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">27. Adamson CS. Protease-Mediated Maturation   of HIV: Inhibitors of protease and the maturation   process. Mol Biol Int. 2012;2012:604261.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000197&pid=S0120-8705201400010000800027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">28. Henderson GJ, Lee SK, Irlbeck DM, Harris J,   Kline M, Pollom E, et al. Interplay between   single resistance-associated mutations in the   HIV-1 protease and viral infectivity, protease   activity, and inhibitor sensitivity. Antimicrob   Agents Chemother. 2012; 56(2):623-33.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000199&pid=S0120-8705201400010000800028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 29. Didigu CA, Doms RW. Novel approaches to   inhibit HIV entry. Viruses. 2012; 4(2):309-24.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000201&pid=S0120-8705201400010000800029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">30. Gilliam BL, Riedel DJ, Redfield RR. Clinical   use of CCR5 inhibitors in HIV and beyond. J   Transl Med. 2011; 9 Suppl 1:S9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000203&pid=S0120-8705201400010000800030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">31. Blanco JL, Varghese V, Rhee SY, Gatell JM,   Shafer RW. HIV-1 integrase inhibitor resistance   and its clinical implications. J Infect Dis.   2011; 203(9):1204-14.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000205&pid=S0120-8705201400010000800031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">32. Quashie PK, Mesplede T, Wainberg MA. HIV   Drug resistance and the advent of integrase   inhibitors. Curr Infect Dis Rep. 2013;   15(1):85-100.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000207&pid=S0120-8705201400010000800032&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">33. Chen J, Powell D, Hu WS. High frequency of   genetic recombination is a common feature   of primate lentivirus replication. J Virol.   2006; 80(19):9651-8.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000209&pid=S0120-8705201400010000800033&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">34. Mansky LM, Temin HM. Lower in vivo mutation   rate of human immunodeficiency virus   type 1 than that predicted from the fidelity   of purified reverse transcriptase. J Virol.   1995; 69(8):5087-94.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000211&pid=S0120-8705201400010000800034&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 35. Simon V, Ho DD. HIV-1 dynamics in vivo:   implications for therapy. Nat Rev Microbiol.   2003; 1(3):181-90.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000213&pid=S0120-8705201400010000800035&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">36. Mougel M, Houzet L, Darlix JL. When is it   time for reverse transcription to start and   go? Retrovirology. 2009; 6:24.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000215&pid=S0120-8705201400010000800036&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">37. Johnson VA, Calvez V, G&uuml;nthard HF, Paredes   R, Pillay D, Shafer R, et al. 2011 update of   the drug resistance mutations in HIV-1. Top   Antivir Med. 2011;19(4):156-64.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000217&pid=S0120-8705201400010000800037&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">38. Database SHDR. Release Notes for HIVdb, HIVsew,   HIValg 2012 (cited 2013). Available from:   <A href="http://hivdb.stanford.edu/DR/asi/releaseNotes/index.html#hivdb_mutationcategories" target="_blank">http://hivdb.stanford.edu/DR/asi/releaseNotes/index.html#hivdb_mutationcategories</A>.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000219&pid=S0120-8705201400010000800038&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">39. Whitcomb JM, Parkin NT, Chappey C, Hellmann   NS, Petropoulos CJ. Broad nucleoside reversetranscriptase   inhibitor cross-resistance in human   immunodeficiency virus type 1 clinical   isolates. J Infect Dis. 2003; 188(7):992-1000.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000221&pid=S0120-8705201400010000800039&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">40. Prado JG, Franco S, Matamoros T, Ruiz L, Clotet   B, Men&eacute;ndez-Arias L, et al. Relative replication   fitness of multi-nucleoside analogueresistant   HIV-1 strains bearing a dipeptide   insertion in the fingers subdomain of the reverse   transcriptase and mutations at codons   67 and 215. Virology. 2004; 326(1):103-12.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000223&pid=S0120-8705201400010000800040&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">41. Shirasaka T, Kavlick MF, Ueno T, Gao WY, Kojima   E, Alcaide ML, et al. Emergence of human   immunodeficiency virus type 1 variants with   resistance to multiple dideoxynucleosides inpatients receiving therapy with dideoxynucleosides.   Proc Natl Acad Sci U S A. 1995;   92(6):2398-402.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000225&pid=S0120-8705201400010000800041&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">42. Shafer RW, Schapiro JM. HIV-1 drug resistance   mutations: an updated framework for the   second decade of HAART. AIDS Rev. 2008;   10(2):67-84.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000227&pid=S0120-8705201400010000800042&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 43. De Luca A, Giambenedetto SD, Trotta MP,   Colafigli M, Prosperi M, Ruiz L, et al. Improved   interpretation of genotypic changes in   the HIV-1 reverse transcriptase coding region   that determine the virological response to didanosine.   J Infect Dis. 2007; 196(11):1645-53.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000229&pid=S0120-8705201400010000800043&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">44. Rhee SY, Taylor J, Wadhera G, Ben-Hur A,   Brutlag DL, Shafer RW. Genotypic predictors   of human immunodeficiency virus type 1   drug resistance. Proc Natl Acad Sci U S A.   2006; 103(46):17355-60.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000231&pid=S0120-8705201400010000800044&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">45. Bacheler L, Jeffrey S, Hanna G, D'Aquila R,   Wallace L, Logue K, et al. Genotypic correlates   of phenotypic resistance to efavirenz   in virus isolates from patients failing nonnucleoside   reverse transcriptase inhibitor therapy.   J Virol. 2001; 75(11):4999-5008.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000233&pid=S0120-8705201400010000800045&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 46. Vingerhoets J, Azijn H, Fransen E, De Baere   I, Smeulders L, Jochmans D, et al. TMC125   displays a high genetic barrier to the development   of resistance: evidence from in   vitro selection experiments. J Virol. 2005;   79(20):12773-82.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000235&pid=S0120-8705201400010000800046&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">47. Rhee SY, Gonzales MJ, Kantor R, Betts BJ, Ravela   J, Shafer RW. Human immunodeficiency   virus reverse transcriptase and protease sequence   database. Nucleic Acids Res. 2003;   31(1):298-303.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000237&pid=S0120-8705201400010000800047&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">48. Rhee SY, Taylor J, Fessel WJ, Kaufman D,   Towner W, Troia P, et al. HIV-1 protease mutations   and protease inhibitor cross-resistance.   Antimicrob Agents Chemother. 2010;   54(10):4253-61.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000239&pid=S0120-8705201400010000800048&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">49. Calazans A, Brindeiro R, Brindeiro P, Verli H,   Arruda MB, Gonzalez LM, et al. Low accumulation   of L90M in protease from subtype   F HIV-1 with resistance to protease inhibitors   is caused by the L89M polymorphism. J   Infect Dis. 2005; 191(11):1961-70.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000241&pid=S0120-8705201400010000800049&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">50. Rhee SY, Fessel WJ, Zolopa AR, Hurley L, Liu   T, Taylor J, et al. HIV-1 Protease and reversetranscriptase   mutations: correlations with   antiretroviral therapy in subtype B isolates   and implications for drug-resistance surveillance.   J Infect Dis. 2005; 192(3):456-65.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000243&pid=S0120-8705201400010000800050&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">51. Johnson VA, Calvez V, Gunthard HF, Paredes   R, Pillay D, Shafer RW, et al. Update of the   drug resistance mutations in HIV-1: March   2013. Top Antivir Med. 2013; 21(1):6-14.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000245&pid=S0120-8705201400010000800051&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana"> 52. Pillay D, Zambon M. Antiviral drug resistance.   BMJ. 1998; 317(7159):660-2.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000247&pid=S0120-8705201400010000800052&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">53. Garc&iacute;a F, &aacute;lvarez M, Bernal C, Chueca N, Guillot   V. Laboratory diagnosis of HIV infection, viral   tropism and resistance to antiretrovirals. Enferm   Infecc Microbiol Clin. 2011; 29(4):297-307.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000249&pid=S0120-8705201400010000800053&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">54. Li JZ, Paredes R, Ribaudo HJ, Kozal MJ, Svarovskaia   ES, Johnson JA, et al. Impact of minority   nonnucleoside reverse transcriptase   inhibitor resistance mutations on resistance   genotype after virologic failure. J Infect Dis.   2013;207(6):893-7.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000251&pid=S0120-8705201400010000800054&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">55. Beerenwinkel N, D&auml;umer M, Oette M, Korn   K, Hoffmann D, Kaiser R, et al. Geno2pheno:   Estimating phenotypic drug resistance from   HIV-1 genotypes. Nucleic Acids Res. 2003;   31(13):3850-5.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000253&pid=S0120-8705201400010000800055&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref -->   </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">56. Society EAC. European Guidelines for   treatment of HIV-infected adults in Europe.   7.0 ed2013.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000255&pid=S0120-8705201400010000800056&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></font></p>     <!-- ref --><p><font size="2" face="Verdana">57. D&iacute;azGranados C, &aacute;lvarez C, Prada G, Mart&iacute;nez   F, Sarmiento C. Gu&iacute;a para el manejo de vih/   sida basada en la evidencia Colombia. 2006.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000257&pid=S0120-8705201400010000800057&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font> </font></p>     <p>&nbsp;</font></p>     <p><font size="2" face="Verdana">Recibido en: agosto 26 de 2013. Revisado en: marzo 6 de 2014. Aceptado en: marzo 13 de 2014.</font></font></p>      ]]></body><back>
<ref-list>
<ref id="B1">
<label>1</label><nlm-citation citation-type="">
<collab>UNAIDS</collab>
<source><![CDATA[Global Report United States: United Nations Programme on HIV/AIDS (UNAIDS)]]></source>
<year>2012</year>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B2">
<label>2</label><nlm-citation citation-type="">
<collab>Social MdSPyP</collab>
<source><![CDATA[Informe UNGASS - 2012 Seguimiento de la Declaración de compromiso sobre el VIH/Sida]]></source>
<year>2012</year>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B3">
<label>3</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Namme Luma]]></surname>
<given-names><![CDATA[H]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Doualla]]></surname>
<given-names><![CDATA[MS]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Choukem]]></surname>
<given-names><![CDATA[SP]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Temfack]]></surname>
<given-names><![CDATA[E]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ashuntantang]]></surname>
<given-names><![CDATA[G]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Achu Joko]]></surname>
<given-names><![CDATA[H]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Adverse drug reactions of Highly Active Antiretroviral Therapy (HAART) in HIV infected patients at the General Hospital, Douala, Cameroon: a cross sectional study]]></article-title>
<source><![CDATA[Pan Afr Med J]]></source>
<year>2012</year>
<volume>12</volume>
<page-range>87</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B4">
<label>4</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Swanstrom]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Coffin]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 pathogenesis: the virus]]></article-title>
<source><![CDATA[Cold Spring Harb Perspect Med]]></source>
<year>2012</year>
<volume>2</volume>
<numero>12</numero>
<issue>12</issue>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B5">
<label>5</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Lederman]]></surname>
<given-names><![CDATA[MM]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Connick]]></surname>
<given-names><![CDATA[E]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Landay]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kuritzkes]]></surname>
<given-names><![CDATA[DR]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Spritzler]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[St Clair]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Immunologic responses associated with 12 weeks of combination antiretroviral therapy consisting of zidovudine, lamivudine, and ritonavir: results of AIDS Clinical Trials Group Protocol 315]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>1998</year>
<volume>178</volume>
<numero>1</numero>
<issue>1</issue>
<page-range>70-9</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B6">
<label>6</label><nlm-citation citation-type="">
<collab>UNAIDS</collab>
<source><![CDATA[Regional Fact Sheet 2012 - Latin America And The Caribbean United States 2012]]></source>
<year></year>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B7">
<label>7</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Kitahata]]></surname>
<given-names><![CDATA[MM]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[When to start antiretroviral therapy]]></article-title>
<source><![CDATA[Top HIV Med]]></source>
<year>2010</year>
<volume>18</volume>
<numero>3</numero>
<issue>3</issue>
<page-range>121-6</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B8">
<label>8</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Mills]]></surname>
<given-names><![CDATA[FP]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ford]]></surname>
<given-names><![CDATA[N]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Nachega]]></surname>
<given-names><![CDATA[JB]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Bansback]]></surname>
<given-names><![CDATA[N]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Nosyk]]></surname>
<given-names><![CDATA[B]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Yaya]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Earlier initialization of highly active antiretroviral therapy is associated with long-term survival and is costeffective: findings from a deterministic model of a 10-year Ugandan cohort]]></article-title>
<source><![CDATA[J Acquir Immune Defic Syndr]]></source>
<year>2012</year>
<volume>61</volume>
<numero>3</numero>
<issue>3</issue>
<page-range>364-9</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B9">
<label>9</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Ghaffari]]></surname>
<given-names><![CDATA[G]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Passalacqua]]></surname>
<given-names><![CDATA[DJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Caicedo]]></surname>
<given-names><![CDATA[JL]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Goodenow]]></surname>
<given-names><![CDATA[MM]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Sleasman]]></surname>
<given-names><![CDATA[JW]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Two-year clinical and immune outcomes in human immunodeficiency virus-infected children who reconstitute CD4 T cells without control of viral replication after combination antiretroviral therapy]]></article-title>
<source><![CDATA[Pediatrics]]></source>
<year>2004</year>
<volume>114</volume>
<numero>5</numero>
<issue>5</issue>
<page-range>604-11</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B10">
<label>10</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Kuller]]></surname>
<given-names><![CDATA[LH]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Tracy]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Belloso]]></surname>
<given-names><![CDATA[W]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[De Wit]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Drummond]]></surname>
<given-names><![CDATA[F]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Lane]]></surname>
<given-names><![CDATA[HC]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Inflammatory and coagulation biomarkers and mortality in patients with HIV infection]]></article-title>
<source><![CDATA[PLoS Med]]></source>
<year>2008</year>
<volume>5</volume>
<numero>10</numero>
<issue>10</issue>
<page-range>203</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B11">
<label>11</label><nlm-citation citation-type="">
<collab>Antiretroviral DoHaHSPo</collab>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Panel on Antiretroviral Guidelines for Adults and Adolescents. Guidelines for the use of antiretroviral agents]]></article-title>
<source><![CDATA[HIV-1-infected adults and adolescents]]></source>
<year>2013</year>
<page-range>3:4</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B12">
<label>12</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Wainberg]]></surname>
<given-names><![CDATA[MA]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Combination therapies, effectiveness, and adherence in patients with HIV infection: clinical utility of a single tablet of emtricitabine, rilpivirine, and tenofovir]]></article-title>
<source><![CDATA[HIV AIDS]]></source>
<year>2013</year>
<volume>5</volume>
<page-range>41-9</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B13">
<label>13</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[von Wyl]]></surname>
<given-names><![CDATA[V]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Klimkait]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Yerly]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Nicca]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Furrer]]></surname>
<given-names><![CDATA[H]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Cavassini]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Adherence as a predictor of the development of class-specific resistance mutations: the Swiss HIV Cohort Study]]></article-title>
<source><![CDATA[PLoS One]]></source>
<year>2013</year>
<volume>8</volume>
<numero>10</numero>
<issue>10</issue>
<page-range>77691</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B14">
<label>14</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[van der Kuyl]]></surname>
<given-names><![CDATA[AC]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Cornelissen]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Identifying HIV-1 dual infections]]></article-title>
<source><![CDATA[Retrovirology]]></source>
<year>2007</year>
<volume>4</volume>
<page-range>67</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B15">
<label>15</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Gottlieb]]></surname>
<given-names><![CDATA[GS]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Nickle]]></surname>
<given-names><![CDATA[DC]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Jensen]]></surname>
<given-names><![CDATA[MA]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Wong]]></surname>
<given-names><![CDATA[KG]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Grobler]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Li]]></surname>
<given-names><![CDATA[F]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Dual HIV-1 infection associated with rapid disease progression]]></article-title>
<source><![CDATA[Lancet]]></source>
<year>2004</year>
<volume>363</volume>
<numero>9409</numero>
<issue>9409</issue>
<page-range>619-22</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B16">
<label>16</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Wainberg]]></surname>
<given-names><![CDATA[MA]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Brenner]]></surname>
<given-names><![CDATA[BG]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Role of HIV Subtype Diversity in the development of resistance to antiviral drugs]]></article-title>
<source><![CDATA[Viruses]]></source>
<year>2010</year>
<volume>2</volume>
<numero>11</numero>
<issue>11</issue>
<page-range>2493-508</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B17">
<label>17</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Eshleman]]></surname>
<given-names><![CDATA[SH]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hoover]]></surname>
<given-names><![CDATA[DR]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Chen]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hudelson]]></surname>
<given-names><![CDATA[SE]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Guay]]></surname>
<given-names><![CDATA[LA]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Mwatha]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Nevirapine (NVP) resistance in women with HIV-1 subtype C, compared with subtypes A and D, after the administration of single-dose NVP]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>2005</year>
<volume>192</volume>
<numero>1</numero>
<issue>1</issue>
<page-range>30-6</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B18">
<label>18</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Tang]]></surname>
<given-names><![CDATA[MW]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Shafer]]></surname>
<given-names><![CDATA[RW]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 antiretroviral resistance: scientific principles and clinical applications]]></article-title>
<source><![CDATA[Drugs]]></source>
<year>2012</year>
<volume>72</volume>
<numero>9</numero>
<issue>9</issue>
<page-range>1-25</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B19">
<label>19</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Cohen]]></surname>
<given-names><![CDATA[MS]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Chen]]></surname>
<given-names><![CDATA[YQ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[McCauley]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Gamble]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hosseinipour]]></surname>
<given-names><![CDATA[MC]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kumarasamy]]></surname>
<given-names><![CDATA[N]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Prevention of HIV-1 infection with early antiretroviral therapy]]></article-title>
<source><![CDATA[N Engl J Med]]></source>
<year>2011</year>
<volume>365</volume>
<numero>6</numero>
<issue>6</issue>
<page-range>493-505</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B20">
<label>20</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Galindo-Orrego]]></surname>
<given-names><![CDATA[P]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Mueses-Marín]]></surname>
<given-names><![CDATA[HF]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Galindo- Quintero]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Martínez-Cajas]]></surname>
<given-names><![CDATA[JL]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Resistencia transmitida del virus de la inmunodeficiencia humana en pacientes sin exposición previa a tratamiento antirretroviral, Cali, Colombia, 2010]]></article-title>
<source><![CDATA[Infectio]]></source>
<year>2014</year>
<volume>17</volume>
<page-range>19-27</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B21">
<label>21</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[DiazGranados]]></surname>
<given-names><![CDATA[CA]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Mantilla]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Lenis]]></surname>
<given-names><![CDATA[W]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Antiretroviral drug resistance in HIV-infected patients in Colombia]]></article-title>
<source><![CDATA[Int J Infect Dis]]></source>
<year>2010</year>
<volume>14</volume>
<numero>4</numero>
<issue>4</issue>
<page-range>298-303</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B22">
<label>22</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Arts]]></surname>
<given-names><![CDATA[EJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hazuda]]></surname>
<given-names><![CDATA[DJ]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 Antiretroviral Drug Therapy]]></article-title>
<source><![CDATA[Cold Spring Harb Perspect Med]]></source>
<year>2012</year>
<volume>2</volume>
<numero>4</numero>
<issue>4</issue>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B23">
<label>23</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Nakashima]]></surname>
<given-names><![CDATA[H]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Matsui]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Harada]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kobayashi]]></surname>
<given-names><![CDATA[N]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Matsuda]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ueda]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Inhibition of replication and cytopathic effect of human T cell lymphotropic virus type III/lymphadenopathy- associated virus by 3'-azido-3'- deoxythymidine in vitro]]></article-title>
<source><![CDATA[Antimicrob Agents Chemother]]></source>
<year>1986</year>
<volume>30</volume>
<numero>6</numero>
<issue>6</issue>
<page-range>933-7</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B24">
<label>24</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Clavel]]></surname>
<given-names><![CDATA[F]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hance]]></surname>
<given-names><![CDATA[AJ]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV drug resistance]]></article-title>
<source><![CDATA[N Engl J Med]]></source>
<year>2004</year>
<volume>350</volume>
<numero>10</numero>
<issue>10</issue>
<page-range>1023-35</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B25">
<label>25</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Esposito]]></surname>
<given-names><![CDATA[F]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Corona]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Tramontano]]></surname>
<given-names><![CDATA[E]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV- 1 Reverse transcriptase still remains a new drug target: structure, function, classical inhibitors, and new inhibitors with innovative mechanisms of actions]]></article-title>
<source><![CDATA[Mol Biol Int]]></source>
<year>2012</year>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B26">
<label>26</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Maga]]></surname>
<given-names><![CDATA[G]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Amacker]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ruel]]></surname>
<given-names><![CDATA[N]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hübscher]]></surname>
<given-names><![CDATA[U]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Spadari]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Resistance to nevirapine of HIV-1 reverse transcriptase mutants: loss of stabilizing interactions and thermodynamic or steric barriers are induced by different single amino acid substitutions]]></article-title>
<source><![CDATA[J Mol Biol]]></source>
<year>1997</year>
<volume>274</volume>
<numero>5</numero>
<issue>5</issue>
<page-range>738-47</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B27">
<label>27</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Adamson]]></surname>
<given-names><![CDATA[CS]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Protease-Mediated Maturation of HIV: Inhibitors of protease and the maturation process]]></article-title>
<source><![CDATA[Mol Biol Int]]></source>
<year>2012</year>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B28">
<label>28</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Henderson]]></surname>
<given-names><![CDATA[GJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Lee]]></surname>
<given-names><![CDATA[SK]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Irlbeck]]></surname>
<given-names><![CDATA[DM]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Harris]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kline]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Pollom]]></surname>
<given-names><![CDATA[E]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Interplay between single resistance-associated mutations in the HIV-1 protease and viral infectivity, protease activity, and inhibitor sensitivity]]></article-title>
<source><![CDATA[Antimicrob Agents Chemother]]></source>
<year>2012</year>
<volume>56</volume>
<numero>2</numero>
<issue>2</issue>
<page-range>623-33</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B29">
<label>29</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Didigu]]></surname>
<given-names><![CDATA[CA]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Doms]]></surname>
<given-names><![CDATA[RW]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Novel approaches to inhibit HIV entry]]></article-title>
<source><![CDATA[Viruses]]></source>
<year>2012</year>
<volume>4</volume>
<numero>2</numero>
<issue>2</issue>
<page-range>309-24</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B30">
<label>30</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Gilliam]]></surname>
<given-names><![CDATA[BL]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Riedel]]></surname>
<given-names><![CDATA[DJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Redfield]]></surname>
<given-names><![CDATA[RR]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Clinical use of CCR5 inhibitors in HIV and beyond]]></article-title>
<source><![CDATA[J Transl Med]]></source>
<year>2011</year>
<volume>9</volume>
<numero>1</numero>
<issue>1</issue>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B31">
<label>31</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Blanco]]></surname>
<given-names><![CDATA[JL]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Varghese]]></surname>
<given-names><![CDATA[V]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Rhee]]></surname>
<given-names><![CDATA[SY]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Gatell]]></surname>
<given-names><![CDATA[JM]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Shafer]]></surname>
<given-names><![CDATA[RW]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 integrase inhibitor resistance and its clinical implications]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>2011</year>
<volume>203</volume>
<numero>9</numero>
<issue>9</issue>
<page-range>1204-14</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B32">
<label>32</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Quashie]]></surname>
<given-names><![CDATA[PK]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Mesplede]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Wainberg]]></surname>
<given-names><![CDATA[MA]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV Drug resistance and the advent of integrase inhibitors]]></article-title>
<source><![CDATA[Curr Infect Dis Rep]]></source>
<year>2013</year>
<volume>15</volume>
<numero>1</numero>
<issue>1</issue>
<page-range>85-100</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B33">
<label>33</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Chen]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Powell]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hu]]></surname>
<given-names><![CDATA[WS]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[High frequency of genetic recombination is a common feature of primate lentivirus replication]]></article-title>
<source><![CDATA[J Virol]]></source>
<year>2006</year>
<volume>80</volume>
<numero>19</numero>
<issue>19</issue>
<page-range>9651-8</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B34">
<label>34</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Mansky]]></surname>
<given-names><![CDATA[LM]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Temin]]></surname>
<given-names><![CDATA[HM]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Lower in vivo mutation rate of human immunodeficiency virus type 1 than that predicted from the fidelity of purified reverse transcriptase]]></article-title>
<source><![CDATA[J Virol]]></source>
<year>1995</year>
<volume>69</volume>
<numero>8</numero>
<issue>8</issue>
<page-range>5087-94</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B35">
<label>35</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Simon]]></surname>
<given-names><![CDATA[V]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ho]]></surname>
<given-names><![CDATA[DD]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 dynamics in vivo: implications for therapy]]></article-title>
<source><![CDATA[Nat Rev Microbiol]]></source>
<year>2003</year>
<volume>1</volume>
<numero>3</numero>
<issue>3</issue>
<page-range>181-90</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B36">
<label>36</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Mougel]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Houzet]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Darlix]]></surname>
<given-names><![CDATA[JL]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[When is it time for reverse transcription to start and go?]]></article-title>
<source><![CDATA[Retrovirology]]></source>
<year>2009</year>
<volume>6</volume>
<page-range>24</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B37">
<label>37</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Johnson]]></surname>
<given-names><![CDATA[VA]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Calvez]]></surname>
<given-names><![CDATA[V]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Günthard]]></surname>
<given-names><![CDATA[HF]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Paredes]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Pillay]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Shafer]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[2011 update of the drug resistance mutations in HIV-1]]></article-title>
<source><![CDATA[Top Antivir Med]]></source>
<year>2011</year>
<volume>19</volume>
<numero>4</numero>
<issue>4</issue>
<page-range>156-64</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B38">
<label>38</label><nlm-citation citation-type="">
<collab>Database SHDR</collab>
<source><![CDATA[Release Notes for HIVdb, HIVsew, HIValg 2012]]></source>
<year></year>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B39">
<label>39</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Whitcomb]]></surname>
<given-names><![CDATA[JM]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Parkin]]></surname>
<given-names><![CDATA[NT]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Chappey]]></surname>
<given-names><![CDATA[C]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hellmann]]></surname>
<given-names><![CDATA[NS]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Petropoulos]]></surname>
<given-names><![CDATA[CJ]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Broad nucleoside reversetranscriptase inhibitor cross-resistance in human immunodeficiency virus type 1 clinical isolates]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>2003</year>
<volume>188</volume>
<numero>7</numero>
<issue>7</issue>
<page-range>992-1000</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B40">
<label>40</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Prado]]></surname>
<given-names><![CDATA[JG]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Franco]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Matamoros]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ruiz]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Clotet]]></surname>
<given-names><![CDATA[B]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Menéndez-Arias]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Relative replication fitness of multi-nucleoside analogueresistant HIV-1 strains bearing a dipeptide insertion in the fingers subdomain of the reverse transcriptase and mutations at codons 67 and 215]]></article-title>
<source><![CDATA[Virology]]></source>
<year>2004</year>
<volume>326</volume>
<numero>1</numero>
<issue>1</issue>
<page-range>103-12</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B41">
<label>41</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Shirasaka]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kavlick]]></surname>
<given-names><![CDATA[MF]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ueno]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Gao]]></surname>
<given-names><![CDATA[WY]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kojima]]></surname>
<given-names><![CDATA[E]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Alcaide]]></surname>
<given-names><![CDATA[ML]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Emergence of human immunodeficiency virus type 1 variants with resistance to multiple dideoxynucleosides inpatients receiving therapy with dideoxynucleosides]]></article-title>
<source><![CDATA[Proc Natl Acad Sci U S A]]></source>
<year>1995</year>
<volume>92</volume>
<numero>6</numero>
<issue>6</issue>
<page-range>2398-402</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B42">
<label>42</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Shafer]]></surname>
<given-names><![CDATA[RW]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Schapiro]]></surname>
<given-names><![CDATA[JM]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 drug resistance mutations: an updated framework for the second decade of HAART]]></article-title>
<source><![CDATA[AIDS Rev]]></source>
<year>2008</year>
<volume>10</volume>
<numero>2</numero>
<issue>2</issue>
<page-range>67-84</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B43">
<label>43</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[De Luca]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Giambenedetto]]></surname>
<given-names><![CDATA[SD]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Trotta]]></surname>
<given-names><![CDATA[MP]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Colafigli]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Prosperi]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ruiz]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Improved interpretation of genotypic changes in the HIV-1 reverse transcriptase coding region that determine the virological response to didanosine]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>2007</year>
<volume>196</volume>
<numero>11</numero>
<issue>11</issue>
<page-range>1645-53</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B44">
<label>44</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Rhee]]></surname>
<given-names><![CDATA[SY]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Taylor]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Wadhera]]></surname>
<given-names><![CDATA[G]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ben-Hur]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Brutlag]]></surname>
<given-names><![CDATA[DL]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Shafer]]></surname>
<given-names><![CDATA[RW]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Genotypic predictors of human immunodeficiency virus type 1 drug resistance]]></article-title>
<source><![CDATA[Proc Natl Acad Sci U S A]]></source>
<year>2006</year>
<volume>103</volume>
<numero>46)</numero>
<issue>46)</issue>
<page-range>17355-60</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B45">
<label>45</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Bacheler]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Jeffrey]]></surname>
<given-names><![CDATA[S]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hanna]]></surname>
<given-names><![CDATA[G]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[D'Aquila]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Wallace]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Logue]]></surname>
<given-names><![CDATA[K]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Genotypic correlates of phenotypic resistance to efavirenz in virus isolates from patients failing nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor therapy]]></article-title>
<source><![CDATA[J Virol]]></source>
<year>2001</year>
<volume>75</volume>
<numero>11</numero>
<issue>11</issue>
<page-range>4999-5008</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B46">
<label>46</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Vingerhoets]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Azijn]]></surname>
<given-names><![CDATA[H]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Fransen]]></surname>
<given-names><![CDATA[E]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[De Baere]]></surname>
<given-names><![CDATA[I]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Smeulders]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Jochmans]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[TMC125 displays a high genetic barrier to the development of resistance: evidence from in vitro selection experiments]]></article-title>
<source><![CDATA[J Virol]]></source>
<year>2005</year>
<volume>79</volume>
<numero>20</numero>
<issue>20</issue>
<page-range>12773-82</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B47">
<label>47</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Rhee]]></surname>
<given-names><![CDATA[SY]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Gonzales]]></surname>
<given-names><![CDATA[MJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kantor]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Betts]]></surname>
<given-names><![CDATA[BJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ravela]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Shafer]]></surname>
<given-names><![CDATA[RW]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Human immunodeficiency virus reverse transcriptase and protease sequence database]]></article-title>
<source><![CDATA[Nucleic Acids Res]]></source>
<year>2003</year>
<volume>31</volume>
<numero>1</numero>
<issue>1</issue>
<page-range>298-303</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B48">
<label>48</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Rhee]]></surname>
<given-names><![CDATA[SY]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Taylor]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Fessel]]></surname>
<given-names><![CDATA[WJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kaufman]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Towner]]></surname>
<given-names><![CDATA[W]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Troia]]></surname>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 protease mutations and protease inhibitor cross-resistance]]></article-title>
<source><![CDATA[Antimicrob Agents Chemother]]></source>
<year>2010</year>
<volume>54</volume>
<numero>10</numero>
<issue>10</issue>
<page-range>4253-61</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B49">
<label>49</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Calazans]]></surname>
<given-names><![CDATA[A]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Brindeiro]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Brindeiro]]></surname>
<given-names><![CDATA[P]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Verli]]></surname>
<given-names><![CDATA[H]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Arruda]]></surname>
<given-names><![CDATA[MB]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Gonzalez]]></surname>
<given-names><![CDATA[LM]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Low accumulation of L90M in protease from subtype F HIV-1 with resistance to protease inhibitors is caused by the L89M polymorphism]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>2005</year>
<volume>191</volume>
<numero>11</numero>
<issue>11</issue>
<page-range>1961-70</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B50">
<label>50</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Rhee]]></surname>
<given-names><![CDATA[SY]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Fessel]]></surname>
<given-names><![CDATA[WJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Zolopa]]></surname>
<given-names><![CDATA[AR]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hurley]]></surname>
<given-names><![CDATA[L]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Liu]]></surname>
<given-names><![CDATA[T]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Taylor]]></surname>
<given-names><![CDATA[J]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[HIV-1 Protease and reversetranscriptase mutations: correlations with antiretroviral therapy in subtype B isolates and implications for drug-resistance surveillance]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>2005</year>
<volume>192</volume>
<numero>3</numero>
<issue>3</issue>
<page-range>456-65</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B51">
<label>51</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Johnson]]></surname>
<given-names><![CDATA[VA]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Calvez]]></surname>
<given-names><![CDATA[V]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Gunthard]]></surname>
<given-names><![CDATA[HF]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Paredes]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Pillay]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Shafer]]></surname>
<given-names><![CDATA[RW]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Update of the drug resistance mutations in HIV-1]]></article-title>
<source><![CDATA[Top Antivir Med]]></source>
<year>2013</year>
<volume>21</volume>
<numero>1</numero>
<issue>1</issue>
<page-range>6-14</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B52">
<label>52</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Pillay]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Zambon]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Antiviral drug resistance]]></article-title>
<source><![CDATA[BMJ]]></source>
<year>1998</year>
<volume>317</volume>
<numero>7159</numero>
<issue>7159</issue>
<page-range>660-2</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B53">
<label>53</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[García]]></surname>
<given-names><![CDATA[F]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[álvarez]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Bernal]]></surname>
<given-names><![CDATA[C]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Chueca]]></surname>
<given-names><![CDATA[N]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Guillot]]></surname>
<given-names><![CDATA[V]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Laboratory diagnosis of HIV infection, viral tropism and resistance to antiretrovirals]]></article-title>
<source><![CDATA[Enferm Infecc Microbiol Clin]]></source>
<year>2011</year>
<volume>29</volume>
<numero>4</numero>
<issue>4</issue>
<page-range>297-307</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B54">
<label>54</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Li]]></surname>
<given-names><![CDATA[JZ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Paredes]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Ribaudo]]></surname>
<given-names><![CDATA[HJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kozal]]></surname>
<given-names><![CDATA[MJ]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Svarovskaia]]></surname>
<given-names><![CDATA[ES]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Johnson]]></surname>
<given-names><![CDATA[JA]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Impact of minority nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutations on resistance genotype after virologic failure]]></article-title>
<source><![CDATA[J Infect Dis]]></source>
<year>2013</year>
<volume>207</volume>
<numero>6</numero>
<issue>6</issue>
<page-range>893-7</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B55">
<label>55</label><nlm-citation citation-type="journal">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[Beerenwinkel]]></surname>
<given-names><![CDATA[N]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Däumer]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Oette]]></surname>
<given-names><![CDATA[M]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Korn]]></surname>
<given-names><![CDATA[K]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Hoffmann]]></surname>
<given-names><![CDATA[D]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Kaiser]]></surname>
<given-names><![CDATA[R]]></given-names>
</name>
</person-group>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Geno2pheno: Estimating phenotypic drug resistance from HIV-1 genotypes]]></article-title>
<source><![CDATA[Nucleic Acids Res]]></source>
<year>2003</year>
<volume>31</volume>
<numero>13</numero>
<issue>13</issue>
<page-range>3850-5</page-range></nlm-citation>
</ref>
<ref id="B56">
<label>56</label><nlm-citation citation-type="">
<collab>Society EAC</collab>
<source><![CDATA[European Guidelines for treatment of HIV-infected adults in Europe]]></source>
<year></year>
</nlm-citation>
</ref>
<ref id="B57">
<label>57</label><nlm-citation citation-type="">
<person-group person-group-type="author">
<name>
<surname><![CDATA[DíazGranados]]></surname>
<given-names><![CDATA[C]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[álvarez]]></surname>
<given-names><![CDATA[C]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Prada]]></surname>
<given-names><![CDATA[G]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Martínez]]></surname>
<given-names><![CDATA[F]]></given-names>
</name>
<name>
<surname><![CDATA[Sarmiento]]></surname>
<given-names><![CDATA[C]]></given-names>
</name>
</person-group>
<source><![CDATA[Guía para el manejo de vih/ sida basada en la evidencia Colombia]]></source>
<year>2006</year>
</nlm-citation>
</ref>
</ref-list>
</back>
</article>
