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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[ANÁLISIS SISTÉMICO IN SILICO DE LA EXPRESIÓN DIFERENCIAL DE GENES LOCALIZADOS EN LA REGIÓN CRÍTICA DEL SÍNDROME DE DOWN (DSCR) EN EL CEREBRO HUMANO]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[IN SILICO SYSTEMIC ANALYSIS OF THE DIFFERENTIAL EXPRESSION OF GENES LOCALIZED IN THE DOWN SYNDROME CRITICAL REGION (DSCR) IN NORMAL HUMAN BRAIN]]></article-title>
<article-title xml:lang="pt"><![CDATA[ANÁLISE SISTÊMICA IN SILICO DA EXPRESSÃO DIFERENCIAL DE GENES LOCALIZADOS NA REGIÃO CRÍTICA DA SÍNDROME DE DOWN (DSCR) NO CÉREBRO HUMANO]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[One of the most important challenges of the 21st Century Neurology is to build gene expression profiles along the different structures of human brain trying to correlate them with some neuropathologies. The expression profiles of eight HAS21 genes located on the Down syndrome critical region in different structures of the normal human brain was analyzed. From DNA microarray experiments of normal human brains which are available in the free access human brain database of the Brain Atlas project of the Allen Institute for Brain Sciences in Seattle, Washington (http://www.brainmap.org) expression levels data of eight HSA21/DSCR genes along different structures of normal human brain were statistically analyzed. A differential expression of these genes HSA21/DSCR in some anatomic structures located in the frontal lobe, limbic lobe and cerebral central nuclei was registered. Putamen, caudate nucleus, parahipocampal gyro and central areas, showed high levels of transcription for those HSA21/DSCR genes included in the study; these areas of the brain appear to be associated with some processes of learning and memory. This study allowed us to correlate the differential transcription of DSCR genes, their structural localization and functional role in brain function.]]></p></abstract>
<abstract abstract-type="short" xml:lang="pt"><p><![CDATA[Um dos maiores desafio deste século na neurologia genômica é construir mapas de expressão espacial de genes ao longo das diferentes estruturas cerebrais com o fim de correlacionálos com certas neuropatologias. Foram analisados os perfis de transcrição de oito genes HAS21 localizados na região crítica da síndrome de Down em diferentes estruturas do cérebro humano normal. Foram usados como referência os valores de expressão de oito genes HAS21/DSCR provenientes de experimentos de micromatrizes de ADN de cérebros humanos normais e cujos valores estão disponíveis no bando de dados do projeto cérebro humano do Atlas do Cérebro do Allen Institute for Brain Sciences em Seattle, Washington (http://www.brainmap.org). Determinouse uma expressão diferencial destes genes HAS21/DSCR ao longo das estruturas localizadas no lóbulo frontal, o lóbulo límbico e nos núcleos centrais. No putâmen, o núcleo caudado, o giro parahipocampal e nas áreas centrais foram registrados os maiores níveis de transcrição global; estas áreas do cérebro parecem estar associadas com diversos processos de aprendizagem e de memória. Correlacionouse a transcrição diferencial de genes DSCR com a localização cerebral e seu potencial papel funcional.]]></p></abstract>
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<kwd lng="es"><![CDATA[Análisis de micromatrices]]></kwd>
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</front><body><![CDATA[  <font face="verdana" size="2">     <p align="right"><b>ART&Iacute;CULO ORIGINAL</b></p></font>     <p align="center"><font face="verdana" size="4"><b>AN&Aacute;LISIS SIST&Eacute;MICO IN SILICO DE LA EXPRESI&Oacute;N DIFERENCIAL DE GENES LOCALIZADOS EN LA REGI&Oacute;N CR&Iacute;TICA DEL S&Iacute;NDROME DE DOWN (DSCR) EN EL CEREBRO HUMANO</b></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="3"><b>IN SILICO SYSTEMIC ANALYSIS OF THE DIFFERENTIAL EXPRESSION OF GENES LOCALIZED IN THE DOWN SYNDROME CRITICAL REGION (DSCR) IN NORMAL HUMAN BRAIN</b></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="3"><b>AN&Aacute;LISE SIST&Ecirc;MICA IN SILICO DA EXPRESS&Atilde;O DIFERENCIAL DE GENES LOCALIZADOS NA REGI&Atilde;O CR&Iacute;TICA DA S&Iacute;NDROME DE DOWN (DSCR) NO C&Eacute;REBRO HUMANO</b></font></p>     <p align="center"><font size="2" face="verdana">JULIO C&Eacute;SAR MONTOYA VILLEGAS PH.D.<SUP><B>a</B></SUP>, &Aacute;NGELA PE&Ntilde;A GONZ&Aacute;LEZ B.SC.<SUP><B>b</B></SUP>, JOS&Eacute; MAR&Iacute;A SATIZ&Aacute;BAL SOTO MD, M.SC<SUP><B>c</B></SUP>, Y FELIPE GARC&Iacute;AVALLEJO PH.D <SUP><B>d*</B></SUP></font></p> <font face="verdana" size="2">    <P><sup><b>a</b></sup> Profesor asociado Facultad de Ciencias B&aacute;sicas, Universidad Aut&oacute;noma de Occidente y Facultad de Salud, Universidad del Valle. Cali.    <br> <sup><b>b</b></sup> Investigadora asociada a LABIOMOL. Estudiante de Maestr&iacute;a, GeorgiaTech University, USA    <br> <sup><b>c</b></sup> Profesor titular Departamento de Ciencias Fisiol&oacute;gicas. Escuela de Ciencias B&aacute;sicas. Facultad de Salud. Universidad del Valle, Cali.    <br> <sup><b>d</b></sup> Profesor Titular y Director Cient&iacute;fico del Laboratorio de Biolog&iacute;a Molecular y Patog&eacute;nesis, Departamento de Ciencias Fisiol&oacute;gicas. Escuela de Ciencias B&aacute;sicas. Facultad de Salud. Universidad del Valle, Cali.    ]]></body>
<body><![CDATA[<br>     <p>* Correspondencia:  Dr. Felipe Garc&iacute;a Vallejo. Director Cient&iacute;fico del Laboratorio de Biolog&iacute;a Molecular y Patog&eacute;nesis. Profesor Titular. Departamento de Ciencias Fisiol&oacute;gicas. Escuela de Ciencias B&aacute;sicas. Facultad de Salud. Universidad del Valle. Sede de San Fernando. Calle 4B# 3600.Cali. Colombia. Tel&eacute;fono: +25185601. Fax: +25185617. Email: <a href="mailto:labiomol@gmail.com">labiomol@gmail.com</a>.</p> <hr>     <p>Recibido: julio 26 de 2011 Aceptado: octubre 20 de 2011</p>     <p><b>Resumen</b></p>     <p>Uno de los retos m&aacute;s importantes de este siglo en la neurolog&iacute;a gen&oacute;mica es construir mapas de expresi&oacute;n espacial de genes a lo largo de las distintas estructuras cerebrales con el fin de correlacionarlos con ciertas neuropatolog&iacute;as. Se analizaron los perfiles de transcripci&oacute;n de ocho genes HAS21 localizados en la regi&oacute;n cr&iacute;tica del s&iacute;ndrome de Down en diferentes estructuras del cerebro humano normal. Se tomaron como referencia los valores de expresi&oacute;n de ocho genes HAS21/DSCR provenientes de experimentos de micromatrices de ADN de cerebros humanos normales y cuyos valores est&aacute;n disponibles en la base de datos del proyecto cerebro humano del Atlas del Cerebro del Allen Institute for Brain Sciences en Seattle, Washington (<a href="http://www.brain-map.org" target="_blank">http://www.brainmap.org</a>). Se determin&oacute; una expresi&oacute;n diferencial de estos genes HAS21/DSCR a lo largo de las estructuras localizadas en el l&oacute;bulo frontal, el l&oacute;bulo l&iacute;mbico y en los n&uacute;cleos centrales. En el putamen, el n&uacute;cleo caudado, el giro parahipocampal y en las &aacute;reas centrales se registraron los mayores niveles de transcripci&oacute;n global; estas &aacute;reas del cerebro parecen estar asociadas con diversos procesos de aprendizaje y de memoria. Se correlacion&oacute; la transcripci&oacute;n diferencial de genes DSCR con la localizaci&oacute;n cerebral y su potencial papel funcional.</p>     <p><b>Palabras clave</b>: An&aacute;lisis de micromatrices, perfilaci&oacute;n de la expresi&oacute;n g&eacute;nica, biolog&iacute;a computacional, cerebro, s&iacute;ndrome de Down.</p> <hr>     <p><b>Abstract</b></p>     <p>One of the most important challenges of the 21st Century Neurology is to build gene expression profiles along the different structures of human brain trying to correlate them with some neuropathologies. The expression profiles of eight HAS21 genes located on the Down syndrome critical region in different structures of the normal human brain was analyzed. From DNA microarray experiments of normal human brains which are available in the free access human brain database of the Brain Atlas project of the Allen Institute for Brain Sciences in Seattle, Washington (<a href="http://www.brainmap.org" target="_blank">http://www.brainmap.org</a>) expression levels data of eight HSA21/DSCR genes along different structures of normal human brain were statistically analyzed. A differential expression of these genes HSA21/DSCR in some anatomic structures located in the frontal lobe, limbic lobe and cerebral central nuclei was registered. Putamen, caudate nucleus, parahipocampal gyro and central areas, showed high levels of transcription for those HSA21/DSCR genes included in the study; these areas of the brain appear to be associated with some processes of learning and memory. This study allowed us to correlate the differential transcription of DSCR genes, their structural localization and functional role in brain function.</p>     <p><b>Key words</b>: DNA microarray analysis, gene expression profiling, computational biology, brain, Down Syndrome.</p> <hr>     <p><b>Resumo</b></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Um dos maiores desafio deste s&eacute;culo na neurologia gen&ocirc;mica &eacute; construir mapas de express&atilde;o espacial de genes ao longo das diferentes estruturas cerebrais com o fim de correlacion&aacute;los com certas neuropatologias. Foram analisados os perfis de transcri&ccedil;&atilde;o de oito genes HAS21 localizados na regi&atilde;o cr&iacute;tica da s&iacute;ndrome de Down em diferentes estruturas do c&eacute;rebro humano normal. Foram usados como refer&ecirc;ncia os valores de express&atilde;o de oito genes HAS21/DSCR provenientes de experimentos de micromatrizes de ADN de c&eacute;rebros humanos normais e cujos valores est&atilde;o dispon&iacute;veis no bando de dados do projeto c&eacute;rebro humano do Atlas do C&eacute;rebro do Allen Institute for Brain Sciences em Seattle, Washington (<a href="http://www.brain-map.org" target="_blank">http://www.brainmap.org</a>). Determinouse uma express&atilde;o diferencial destes genes HAS21/DSCR ao longo das estruturas localizadas no l&oacute;bulo frontal, o l&oacute;bulo l&iacute;mbico e nos n&uacute;cleos centrais. No put&acirc;men, o n&uacute;cleo caudado, o giro parahipocampal e nas &aacute;reas centrais foram registrados os maiores n&iacute;veis de transcri&ccedil;&atilde;o global; estas &aacute;reas do c&eacute;rebro parecem estar associadas com diversos processos de aprendizagem e de mem&oacute;ria. Correlacionouse a transcri&ccedil;&atilde;o diferencial de genes DSCR com a localiza&ccedil;&atilde;o cerebral e seu potencial papel funcional.</p>     <p><b>Palavraschave</b>: An&aacute;lise de micromatrizes, perfil da express&atilde;o g&ecirc;nica, biologia computacional, c&eacute;rebro, s&iacute;ndrome de Down.</p> <hr>     <p><b>Introducci&oacute;n</b></p>     <p>El cerebro de los mam&iacute;feros y en especial el humano, es el &oacute;rgano m&aacute;s complejo, pues est&aacute; compuesto por cientos de subtipos diferentes de neuronas que se entremezclan con varios tipos de c&eacute;lulas gliales y de c&eacute;lulas no neuronales, en el que todas ellas difieren en la expresi&oacute;n de genes y en la respuesta a est&iacute;mulos particulares (1,2). Adem&aacute;s, el cerebro es &quot;pl&aacute;stico&quot;, en el sentido que muestra una gran capacidad de cambio a lo largo de la vida (3).</p>     <p>Se ha determinado que la complejidad de la transcripci&oacute;n de ARNm excede a la de otros tejidos (4), lo cual se pone en evidencia en la sensibilidad de los an&aacute;lisis de micromatrices de ADN que muestran una sobreexpresi&oacute;n de genes en el cerebelo en comparaci&oacute;n con la de transcritos neocorticales (5,6). As&iacute; pues, los resultados de los an&aacute;lisis de expresi&oacute;n global de genes, son dif&iacute;ciles de interpretar sin la localizaci&oacute;n, por hibridaci&oacute;n in situ, de transcritos individuales a nivel celular (7,8). A este hecho se le suman los cambios funcionales y cl&iacute;nicos que se producen en la expresi&oacute;n de genes individuales en el cerebro adulto y los efectos de diluci&oacute;n que se ponen de manifiesto debido a su elevada complejidad tisular (9,10). </p>     <p>Una forma de enfocar esta problem&aacute;tica, es el uso de herramientas computacionales, que permitan extraer informaci&oacute;n de niveles de expresi&oacute;n de genes a lo largo de las distintas estructuras cerebrales, a partir de bases de datos que contienen informaci&oacute;n integrada sobre la expresi&oacute;n de miles de genes humanos que se han obtenido del tratamiento experimental y computacional de experimentos de micromatrices de ADN de cerebros humanos postm&oacute;rten. A pesar de que existen varias de estas bases de datos transcript&oacute;micos, tal vez la m&aacute;s completa es la del cerebro humano consignada en Instituto Allen para la Ciencia del Cerebro y que est&aacute; disponible de forma gratuita para su utilizaci&oacute;n (<a href="http://www.alleninstitute.org" target="_blank">http://www.alleninstitute.org</a>). En &eacute;sta se consignan los datos de expresi&oacute;n de genes a partir de ARNm obtenido de preparaciones histol&oacute;gicas de diferentes porciones de cerebro humano cuyo tama&ntilde;o es de aproximadamente 700 &mu;m catalogadas por estructura. La informaci&oacute;n se ha obtenido de experimentos de hibridaci&oacute;n en micromatrices dise&ntilde;adas que incluyen m&aacute;s de 62.000 sondas entre las que al menos dos diferentes est&aacute;n disponibles para el 93% de los 21.245 genes referenciados con c&oacute;digos Entrez Gene.</p>     <p>El primer resultado concreto del Proyecto Genoma Humano, fue el haber secuenciado completamentelos 33,5 Mb del brazo q del cromosoma 21 (11). Este resultado abri&oacute; las puertas para poder enfocar de manera gen&oacute;mica ciertas neuropatolog&iacute;as incluyendo el s&iacute;ndrome de Down (SD) y la enfermedad de Alzheimer (EA) asociada. Actualmente se estima que en el cromosoma 21 se localizan unos 400 genes de los cuales se han asignado aproximadamente 160 prote&iacute;nas y cinco microARNs (12). En el extremo distal del brazo largo del cromosoma 21 (21q22) se identific&oacute; una regi&oacute;n com&uacute;n de 4,3 a 5 Mb referida como &quot;Regi&oacute;n Cr&iacute;tica del S&iacute;ndrome de Down&quot; (DSCR) que contiene algunos de los genes candidatos que podr&iacute;an explicar las patolog&iacute;as asociadas con el SD e indirectamente con la EA (1314) (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f01.jpg" target="_blank">figura 1</a>A). Recientemente en un an&aacute;lisis in silico, utilizando la informaci&oacute;n contenida en varias bases de datos gen&oacute;micos, se demostr&oacute; que la frecuencia de islas CpG y de genes referenciados increment&oacute; en los &uacute;ltimos 1,2 Mb de la regi&oacute;n distal de la DSCR, en contraste con su distribuci&oacute;n pericentrom&eacute;rica. En esta regi&oacute;n, la mayor tasa de recombinaci&oacute;n calculada para mujeres, se registr&oacute; en las bandas 21q22.13 y 21q22.3, donde los genes DSCR 6 y 9 presentaron un elevado grado de metilaci&oacute;n en islas CpG (tanto en fibroblastos normales como en tris&oacute;micos). Adem&aacute;s, en el gen DSCR2 se observ&oacute; un alto grado de descondensaci&oacute;n cromat&iacute;nica, asociada con demetilaci&oacute;n de diferentes residuos de lisina de la histona H3. La existencia de un ambiente gen&oacute;mico caracterizado por tener elevadas tasas de recombinaci&oacute;n y de metilaci&oacute;n de genes DSCR 6 y 9, sugiri&oacute; que esta regi&oacute;n desempe&ntilde;a un papel importante no solo en la no disyunci&oacute;n asociada con el SD, sino en las complejas interacciones gen&oacute;micas, epigen&eacute;ticas y ambientales que actuar&iacute;an en la patog&eacute;nesis del SD (15). A nivel funcional, se ha observado que algunos genes localizados en la DSCR, no se sobreexpresan en el cerebro fetal tris&oacute;mico, indicando que el fenotipo SD no se puede explicar simplemente por el efecto en el desbalance de la dosis g&eacute;nica. Existen otros factores epigen&eacute;ticos y ambientales adem&aacute;s de eventos estoc&aacute;sticos que desregulan el transcriptoma tris&oacute;mico, generando una serie de alteraciones metab&oacute;licas. En la <a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02t01.jpg" target="_blank">tabla 1</a> se describen las principales caracter&iacute;sticas de los ocho genes DSCR que se incluyeron en este trabajo.</p>     <p>En este trabajo, se construy&oacute; un modelo in silico de la expresi&oacute;n en 14 subestructuras espec&iacute;ficas del ganglio basal y 19 del l&oacute;bulo l&iacute;mbico en el cerebro humano normal, de ocho genes localizados en la regi&oacute;n cr&iacute;tica del s&iacute;ndrome de Down, a partir de datos de expresi&oacute;n de genes cerebrales provenientes de experimentos de micromatrices de ADN que est&aacute;n disponibles en la base de datos de acceso libre del proyecto cerebro humano del Atlas del Cerebro del Allen Institute for Brain Sciences en Seattle, Washington (<a href="http://www.brain-map.org" target="_blank">http://www.brainmap.org</a>). Adem&aacute;s, se construy&oacute; una red de expresi&oacute;n e interacci&oacute;n de estos ocho genes con otros cuya expresi&oacute;n se ha documentado en experimentos previos con micromatrices de ADN. Los resultados permitieron tener un modelo sist&eacute;mico de expresi&oacute;n, el cual puede ser modificado bioinform&aacute;ticamente para extrapolarlo a lo que ocurre en otras patolog&iacute;as cerebrales, brindando una herramienta poderosa para su entendimiento.</p>     <p><b>Metodolog&iacute;a</b></p>     <p>En el trabajo se presentan los niveles de expresi&oacute;n g&eacute;nica calculados a partir de los valores z score de ocho genes DSCR en distintas subestructuras de los n&uacute;cleos cerebrales y el l&oacute;bulo l&iacute;mbico. Estos se obtuvieron del visor gr&aacute;fico de la base de datos del cerebro humano del Instituto Allen para las Ciencias del Cerebro. Los distintos procedimientos empleados para la obtenci&oacute;n de los datos empleados en este estudio, se consignan de manera extensa en el informe t&eacute;cnico del &quot;Instituto Allen para las Ciencias del Cerebro&quot; disponible en la direcci&oacute;n electr&oacute;nica (<a href="http://human.brain-map.org/microarray/search" target="_blank">http://human.brain-map.org/microarray/search</a>).</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Los valores de z score se calcularon sustrayendo la intensidad promedio total de todos los genes localizados en la micromatriz de la intensidad de cada gen individual dentro de un solo experimento y dividiendo el resultado por la desviaci&oacute;n est&aacute;ndar (DS) de la medida de todas las intensidades de acuerdo con la siguiente f&oacute;rmula: z score= (intensidad G  intensidad promedio de G1... Gn)/DSG1...Gn; en donde G es un gen dentro de la micromatriz y G1... Gn representa la medida agregada de todos los genes de la micromatriz (16). </p>     <p><b>Miner&iacute;a de datos</b></p>     <p>A partir de la base de datos de micromatrices de ADN del Allen Brain Atlas (<a href="http://www.brain-map.org" target="_blank">http://www.brainmap.org</a>) obtenidos a partir de ADNc de cerebros humanos adultos normales, se seleccionaron diferentes experimentos en los que se identific&oacute; la expresi&oacute;n de los genes HSA21/DSCR1 (RCNA1), DSCR2 (PSMG1), DSCR3, DSCR4, DSCR5 (PIGP), DSCR6, DSCR8 y DSCR10 localizados en la regi&oacute;n critica del SD (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f01.jpg" target="_blank">figura 1</a>B). De acuerdo con lo descrito anteriormente, los experimentos seleccionados proven&iacute;an de ensayos con plataformas de Agilent Human CNV, (la informaci&oacute;n completa se encuentra en enlace &quot;Documentation&quot; de la p&aacute;gina electr&oacute;nica del Instituto, (<a href="http://human.brain-map.org/microarray/search" target="_blank">http://human.brain-map.org/microarray/search</a>).</p>     <p>En todos los casos se obtuvo la informaci&oacute;n de cada gen de los experimentos disponibles que utilizaban distintas sondas. Se registraron tanto los valores de niveles de expresi&oacute;n como los normalizados (zscore) a lo largo de las distintas subestructuras del L&oacute;bulo L&iacute;mbico y los N&uacute;cleos Centrales (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f01.jpg" target="_blank">figura 1</a>B). Estos valores fueron consignados en hojas electr&oacute;nicas en formato Excel para su posterior an&aacute;lisis. Para cada una de las subestructuras incluidas en el estudio, se tomaron tres valores en tres puntos diferentes de cada una de ellas y se consider&oacute; como dato final el promedio del zscore que ten&iacute;a valores normalizados en rangos de 3 a +3.</p>     <p><b>Construcci&oacute;n de redes de interacci&oacute;n de prote&iacute;nas DSCR </b></p>     <p>Para construir una red de interacci&oacute;n de las prote&iacute;nas codificadas por los distintos genes DSCR incluidos en este trabajo con otras expresadas en la plataforma GSE5281 RNA de cerebro total (n&uacute;mero de acceso: GN233) (17), se utiliz&oacute; como herramienta la plataforma bioinform&aacute;tica de la base de datos GeneMania del Donnelly Centre for Cellular and Molecular Structure de la Universidad de Toronto en Canad&aacute;. A partir de esta informaci&oacute;n se construy&oacute; una red de interacci&oacute;n de seis prote&iacute;nas DSCR con otras 40 prote&iacute;nas humanas consignadas en las diferentes bases de datos, algunas de ellas expresadas en el cerebro humano normal.</p>     <p><b>An&aacute;lisis estad&iacute;sticos</b> </p>     <p>Los an&aacute;lisis estad&iacute;sticos se llevaron a cabo empleando los programas Statgraphics Centurion XVI (<a href="http://www.statgraphics.com" target="_blank">http://www.statgraphics.com</a>) y Systat 13 (<a href="http://www.systat.com" target="_blank">http://www.systat.com</a>). Las diferencias entre los datos de promedios de los distintos experimentos se calcularon mediante un an&aacute;lisis de comparaciones m&uacute;ltiples estimando su significancia con la prueba de Mann y Whitney para m&uacute;ltiples comparaciones. Las diferencias de niveles de expresi&oacute;n por gen por &aacute;rea anat&oacute;mica se modelaron mediante el Scatter Plot usando como medida de comparaci&oacute;n los valores de correlaciones parciales de Pearson con una significancia del 95% (p&lt;0,05). Para jerarquizar la expresi&oacute;n en cada uno de los genes en las distintas subestructuras cerebrales, se realiz&oacute; un an&aacute;lisis de componentes principales (ACP) reduciendo el espacio R de ocho variables colineales a tres componentes principales (R8 &gt;R3).</p>     <p> Para los an&aacute;lisis estad&iacute;sticos se tomaron tanto los valores de promedios de zscore como aquellos de medianas de experimentos con tres tipos de sondas para cada uno de los genes DSCR incluidos en el estudio. Se excluyeron del estudio aquellos valores en los que no se determinaron diferencias estad&iacute;sticas significantes; adem&aacute;s aquellos valores no repetibles estad&iacute;sticamente, no fueron incluidos en el presente an&aacute;lisis. </p>     <p><b>Resultados</b></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p><i>Transcripci&oacute;n global de genes DSCR en el cerebro</i></p>     <p> De la inspecci&oacute;n visual de los patrones de hibridaci&oacute;n de micromatrices de ADN con las diferentes sondas analizadas (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f01.jpg" target="_blank">figura 1</a>B), se observ&oacute; una expresi&oacute;n diferencial de los ocho genes DSCR a lo largo de las distintas estructuras cerebrales. Sin embargo, un an&aacute;lisis cuantitativo de la transcripci&oacute;n global de estos ocho genes DSCR a lo largo de 19 subestructuras de los n&uacute;cleos centrales y de 14 del l&oacute;bulo l&iacute;mbico, revel&oacute; que en los n&uacute;cleos centrales, los valores de zscore promedio m&aacute;s altos se registraron en el putamen izquierdo y derecho y en el globo p&aacute;lido izquierdo y derecho (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f02.jpg" target="_blank">figura 2</a>). En el l&oacute;bulo l&iacute;mbico los valores de expresi&oacute;n m&aacute;s elevados se observaron en el giro parahipocampal y en el &aacute;rea central CA4 (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f02.jpg" target="_blank">figura 2</a>); mientras que los niveles de expresi&oacute;n m&aacute;s bajos se detectaron en el T&aacute;lamo (T), el Tegumento Cerebro Medial (TCM) y el Cerebelo (Cb).</p>     <p><i>Perfiles de transcripci&oacute;n de cada gen en los n&uacute;cleos centrales y el l&oacute;bulo l&iacute;mbico</i> </p>     <p>Los valores m&aacute;s altos de zscore se registraron en el putamen para los genes DSCR1, 6 y 10 junto con el n&uacute;cleo caudado para los genes DSCR 4, 5, 8 y 10 (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f03.jpg" target="_blank">figuras 3</a> a y b). Por otra parte, en el globo p&aacute;lido y el claustro, los niveles de expresi&oacute;n de cada uno de los genes DSCR fueron variables aunque en general m&aacute;s bajos que en las dos zonas anteriores (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f03.jpg" target="_blank">figuras 3</a> c y d). El &aacute;rea central izquierda registr&oacute; los mayores valores de zscore en los genes DSCR1, 2, 3, 4, 5, 6 y 8 junto con el giro parahipocampal en donde la expresi&oacute;n m&aacute;s alta fue para los genes DSCR 4, 5, 8 y 10 (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f04.jpg" target="_blank">figura 4</a> a y c). En el subiculum, el &aacute;rea central derecha y el giro dentado la expresi&oacute;n de cada uno de estos genes fue variable, aunque en general m&aacute;s baja que en las dos anteriores (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f04.jpg" target="_blank">figuras 4</a> b, d y e).</p>     <p>El an&aacute;lisis de componentes principales permiti&oacute; reducir a tres componentes los valores de zscore de los ocho genes DSCR en las dos estructuras cerebrales previamente descritas. Para los n&uacute;cleos cerebrales las tres componentes principales representaron el 78,9% de la varianza total, mientras que para el l&oacute;bulo l&iacute;mbico el 65,9%. Se observ&oacute; que la distribuci&oacute;n de los ocho genes DSCR fue diferencial en las dos estructuras cerebrales (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02t02.jpg" target="_blank">tabla 2</a>). El componente 1 fue el m&aacute;s complejo de los tres e incluy&oacute;, para los n&uacute;cleos cerebrales, a los genes DSCR 1, 3 y 10, en contraste con la del l&oacute;bulo l&iacute;mbico que estuvo conformado por los DSCR 1, 4, 8 y 10. Un an&aacute;lisis comparativo de los gr&aacute;ficos Biplot, permiti&oacute; establecer que para los n&uacute;cleos cerebrales se detectaron dos asociaciones de genes DSCR cuyos resultantes fueron positivas, DSCR 610 y DSCR 84; mientras que en el l&oacute;bulo l&iacute;mbico solamente una DSCR 62. </p>     <p><i>Interacciones de prote&iacute;nas codificadas por los genes DSCR</i></p>     <p>En general se pudo establecer una asociaci&oacute;n mediante interacci&oacute;n de 6 prote&iacute;nas DSCR con 40 humanas, algunas de ellas se expresaban en el cerebro humano normal. De acuerdo con lo que se muestra en la <a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f05.jpg" target="_blank">figura 5</a>, se diferenciaron tres nodos principales, dentro de los cuales un n&uacute;mero variable de prote&iacute;nas humanas interactuaba directamente con algunas de las seis prote&iacute;nas DSCR.</p>     <p>El nodo I incluy&oacute; 22 prote&iacute;nas que interactuaban con la reguladora de la calcineurina o DSCR1 (RCNA1), de las cuales 5 de ellas directamente (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f05.jpg" target="_blank">figura 5</a>). DSCR1 interactu&oacute; directamente con PPP3CA que es la subunidad catal&iacute;tica de la Prote&iacute;na fosfatasa 3 alfa ubicada en el locus 4q24, la cual es una Treonina fosfatasa, &eacute;sta participa en procesos de desfoforilaci&oacute;n de prote&iacute;nas; y con PPP3CB, la subunidad catal&iacute;tica de la Prote&iacute;na fosfatasa 3 beta. De acuerdo con el Brain Atlas de Affymetrix, ambas prote&iacute;nas se expresan en cerebro adulto; sin embargo PPP3CA lo hace especialmente en el n&uacute;cleo caudado y el globo p&aacute;lido.</p>     <p>El nodo II incluy&oacute; la interacci&oacute;n de DSCR3 directamente con la Prefoldina 2 (PFDN2) que participa activamente de los procesos de plegamiento de prote&iacute;nas haciendo parte del complejo de preplegamiento citoplasm&aacute;tico. Indirectamente con DSCR8 y MAP3K3, esta &uacute;ltima una Prote&iacute;na CinasaCinasaCinasa activada por mit&oacute;genos que es componente de la cascada MAPKKK. Adem&aacute;s, con la prote&iacute;na b&aacute;sica rica en tript&oacute;fano WRB expresada en muchos tejidos embrionarios y adultos; se propone que esta prote&iacute;na representar&iacute;a un papel importante en la cardiopat&iacute;a cong&eacute;nita que se presenta muy frecuentemente en pacientes con SD (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f05.jpg" target="_blank">figura 5</a>).</p>     <p>El nodo III estuvo conformado por ocho prote&iacute;nas que interactuaban directamente entre s&iacute;, en el que PIGP (DSCR5) conform&oacute; una red local con otras enzimas que hacen parte de la bios&iacute;ntesis del anclaje a membranas del fosfatidilinositolglicano (GPI) entre las que se incluyeron PIGA, PIGH, PIGQ y PIGC. Otra interacci&oacute;n importante se determin&oacute; entre el grupo de las dolicilfosfato/manosiltransferasas, DPM 1, 2 y 3 que controlan la s&iacute;ntesis de DolicolFosfatoManosa (DolPMan) y son donadoras de residuos manosil al interior de Ret&iacute;culo Endoplasm&aacute;tico (<a href="img/revistas/med/v20n1/v20n1a02f05.jpg" target="_blank">figura 5</a>).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>De las veinte principales categor&iacute;as GO registradas en la red construida, aquellas que participan en el metabolismo del Glicofosfatidil Inositol y su anclaje en las membranas, junto con los diferentes procesos de bios&iacute;ntesis de l&iacute;pidos, fosfol&iacute;pidos y &oacute;rganofosfatos fueron las m&aacute;s significantes. Este resultado sugiere que la interacci&oacute;n de los genes DSCR es fundamental en la regulaci&oacute;n de estas rutas metab&oacute;licas que ocurren en los distintos componentes celulares del cerebro humano. De otra parte los procesos de transducci&oacute;n de se&ntilde;ales que involucran se&ntilde;alizaci&oacute;n por prote&iacute;na G acoplada a cAMP segundo mensajero, la mediada por nucle&oacute;tidos c&iacute;clicos y v&iacute;a prote&iacute;na G, que tambi&eacute;n presentaron valores significantes, sugieren que estas funciones son importantes como parte de los mecanismos de integraci&oacute;n de la informaci&oacute;n que ocurren en el cerebro.</p>     <p><b>Discusi&oacute;n</b></p>     <p>Construimos un modelo in silico de perfiles de transcripci&oacute;n diferencial de ocho genes localizados en la DSCR a lo largo de 19 estructuras de los n&uacute;cleos cerebrales y de 14 del l&oacute;bulo l&iacute;mbico en donde se demostr&oacute; que la transcripci&oacute;n de estos genes fue diferencial y espec&iacute;fica, adem&aacute;s de ser dependiente de la estructura cerebral asociada. As&iacute; pues, se puede concluir que en el cerebro normal, los ocho genes DSCR analizados, estar&iacute;an sometidos a una regulaci&oacute;n muy precisa de su transcripci&oacute;n, siendo &eacute;sta dependiente de la fisiolog&iacute;a de cada una de los componentes estructurales del cerebro. Estad&iacute;sticamente se confirm&oacute; la coexpresi&oacute;n de los genes estudiados agrupados en componentes diferentes en las dos estructuras cerebrales analizadas; siendo una evidencia m&aacute;s de la regulaci&oacute;n estructura espec&iacute;fica de la transcripci&oacute;n de los ocho genes DSCR analizados.</p>     <p>Reportes previos han mostrado una elevada expresi&oacute;n del gen DSCR1o RCAN1 en corteza, cerebro medio y cerebelo de ratones SD (18) y del gen DSCR5 o PIGP en el cerebro en desarrollo (19). En el presente estudio, se determin&oacute; que los niveles de expresi&oacute;n global m&aacute;s elevados se detectaron en el putamen y el n&uacute;cleo caudado; de otra parte en el l&oacute;bulo l&iacute;mbico, las &aacute;reas centrales y el giro hipocampal registraron niveles altos de transcripci&oacute;n. Tomados en su conjunto, los resultados sugieren que la transcripci&oacute;n de estos genes en el cerebro humano es coincidente con aquella obtenida para ratones.</p>     <p>Individuos con SD inevitablemente desarrollan, en alg&uacute;n periodo de su vida, enfermedad de Alzheimer (EA); aunque el mecanismo por el cual se desarrolla la neuropatolog&iacute;a EA no est&aacute; bien definido en los pacientes SD (20). Sin embargo, se sugiere que la fosforilaci&oacute;n de la Presenilina 1 mediada por Dyrk1A establecer&iacute;a un puente funcional entre el SD y la EA (21); la sobreexpresi&oacute;n de RCAN1 en neuronas primarias conlleva a la activaci&oacute;n de la s&iacute;ntesis de caspasa9 y caspasa3 induciendo apoptosis neuronal que complementar&iacute;a el mecanismo de dep&oacute;sito de las placas amiloideas (22). Adem&aacute;s, se ha determinado previamente que la sobreexpresi&oacute;n de PIGP (DSCR5) puede alterar las modificaciones postraduccionales y el subsecuente anclaje de prote&iacute;nas de membrana mediados por la glicosilfosfatidilinositol Nacetilglucosamini transferasa(GPIGnT) (23). PIGP (DSCR5) se sobreexpresa dos veces en la corteza cerebral en contraste con DSCR6 cuya expresi&oacute;n fue normal (24).</p>     <p>Adem&aacute;s, de la concordancia de estos resultados experimentales con los obtenidos a partir de nuestro modelo in silico, se obtuvo una mayor resoluci&oacute;n estructural de la transcripci&oacute;n de los genes DSCR, lo que nos permiti&oacute; construir perfiles transcripcionales que son dependientes de la estructura del cerebro involucrada. Estas evidencias indicar&iacute;an que el fenotipo de algunas de las enfermedades neurol&oacute;gicas que actualmente aquejan a nuestra especie como el SD y EA entre otras, no puede explicarse simplemente por la expresi&oacute;n alterada de un gen, sino por el contrario, ser&iacute;an el producto de la alteraci&oacute;n de las m&uacute;ltiples interacciones g&eacute;nicas que controlan la homeostasis cerebral.</p>     <p>Fue evidente que la expresi&oacute;n de los ocho genes DSCR tuvo su m&aacute;ximo en el putamen, el globo p&aacute;lido y el n&uacute;cleo caudado. El Putamen es la porci&oacute;n de los n&uacute;cleos basales que forma la parte m&aacute;s externa del n&uacute;cleo lenticular y parece desempe&ntilde;ar un importante papel en el condicionamiento operante (aprendizaje a trav&eacute;s de refuerzo). Las cortezas somatosensorial y motora, el n&uacute;cleo intralaminar del t&aacute;lamo y la sustancia negra se proyectan al putamen y &eacute;ste, a su vez, proyecta en &aacute;reas motoras y premotoras de la corteza a trav&eacute;s del globo p&aacute;lido y el t&aacute;lamo (25). Por otra parte, el n&uacute;cleo caudado es uno de los componentes de los ganglios basales localizados junto al cerebelo, participa en la modulaci&oacute;n del movimiento; previamente se ha demostrado que el n&uacute;cleo caudado est&aacute; fuertemente involucrado en el aprendizaje y la memoria (26), en particular en materia de tratamiento de retroalimentaci&oacute;n (27). El l&oacute;bulo l&iacute;mbico, contiene la circunvoluci&oacute;n del cuerpo calloso, la circunvoluci&oacute;n subcallosa y el giro parahipocampal, y es aparentemente el principal responsable de la vida afectiva, influenciando la formaci&oacute;n de memorias, en las que participan el hipot&aacute;lamo, el hipocampo, la am&iacute;gdala y cuatro &aacute;reas relacionadas. Los resultados obtenidos en este estudio permitieron correlacionar elevados niveles de transcripci&oacute;n de los genes DSCR en estas estructuras con su potencial papel en las funciones asociadas (28).</p>     <p>La interacci&oacute;n entre prote&iacute;nas que se obtuvo en la red, mostr&oacute; que varias de ellas se expresan en el cerebro e interact&uacute;an directamente con DSCR1, 2, 6 y 8, adem&aacute;s de otras, conformando una red compleja de interacci&oacute;n de prote&iacute;nas expresadas en el cerebro (29). Este hecho nos da un punto de partida para analizar desde la biolog&iacute;a integrada de sistemas, alteraciones cerebrales como EA, SD y otras no menos importantes que afectan el funcionamiento normal de las actividades cerebrales (30), adem&aacute;s de la comparaci&oacute;n funcional entre especies (31). Este primer acercamiento ya nos mostr&oacute; que en un an&aacute;lisis de baja resoluci&oacute;n, esta interacci&oacute;n ser&iacute;a muy compleja.</p>     <p>Aunque el fenotipo de la trisom&iacute;a 21 es variable y complejo, todos los pacientes con SD tienen deficiencias de aprendizaje que van desde moderadas a severas. Recientes trabajos con el modelo de rat&oacute;n SD transcromos&oacute;mico (Tc1), han permitido examinar en detalle los procesos de aprendizaje que estar&iacute;an afectados por la trisom&iacute;a del par 21 (32). Los an&aacute;lisis en el rat&oacute;n Tc1modelo, mostraron anormalidades en los procesos de aprendizaje de corto plazo, dependientes de la funci&oacute;n hipocampal, pero no en los de largo plazo. Los d&eacute;ficits de aprendizaje se correlacionaron con anormalidades en la potenciaci&oacute;n de largo plazo (PLP) del giro dentado del hipocampo (33). M&aacute;s a&uacute;n, recientes hallazgos han mostrado alteraciones en el n&uacute;mero de componentes sin&aacute;pticas en el hipocampo de ratones transg&eacute;nicos Ts 65DN (34).</p>     <p>Nuevos y excitantes hallazgos han revelado que en el genoma humano opera una considerable plasticidad, la cual de manera directa o indirecta afecta no solo la expresi&oacute;n de genes localizados en el cromosoma 21 sino de otros ubicados en los otros cromosomas. Este hecho nos lleva a considerar que la gran variabilidad del fenotipo SD ser&iacute;a el resultado de la alteraci&oacute;n en el n&uacute;mero de copias de elementos gen&oacute;micos no tradicionales. El estudio del transcriptoma de la trisom&iacute;a 21 (T21) mediante micromatrices de ADN asociado a medidas de PCR cuantitativo tanto en trisom&iacute;as completas como en segmentales, ha confirmado que m&aacute;s del 50 % de los genes localizados en el cromosoma 21, tienen n&uacute;mero de copias variable mayor que el fenotipo normal euploide (35,36).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>En un esfuerzo por correlacionar el efecto del desbalance de la dosis de genes HAS21 con la potencial alteraci&oacute;n en los perfiles de transcripci&oacute;n asociada a diferentes subestructuras cerebrales de los ocho genes DSCR incluidos en este trabajo, se tomaron como punto de partida los resultados obtenidos por Yahya Graison et al.(37). Mediante mediciones obtenidas de micromatrices de ADN construidas con sondas que representaban 145 genes, 58 ORFs, 118 predicciones y 18 transcritos antisentido del cromosoma 21, se calcularon las relaciones de niveles de expresi&oacute;n g&eacute;nica en l&iacute;neas celulares de pacientes con SD y se compararon con los de personas normales. De acuerdo con los resultados obtenidos, los genes HSA21 analizados se clasificaron en cuatro clases cuyos valores de relaciones de expresi&oacute;n SD/control eran caracter&iacute;sticos. En la clase I se incluyeron aquellos cuyos valores de relaci&oacute;n de expresi&oacute;n SD/control, eran mayores a 1,5 y que por lo tanto ser&iacute;an genes con tres copias. En nuestro estudio, el gen PIGP (DSCR5) se incluy&oacute; en esta clase y por lo tanto se infiere que sufre el efecto de desbalance de la dosis. La clase II est&aacute; conformada por genes cuyas relaciones DS/control eran significantemente diferentes de 1 y de 1,5; en este grupo el gene DYRK1A, est&aacute; bajo el efecto de dosis g&eacute;nica. La clase III, la conforman un grupo de genes cuyas relaciones de expresi&oacute;n DS/control, son &lt;1.4; estos genes clase III est&aacute;n compensados en el paciente con SD e incluyeron a DSCR1, 2, 3, 6, 8 y 10 de nuestros an&aacute;lisis. Finalmente, la clase IV est&aacute; representada por genes cuya relaci&oacute;n de expresi&oacute;n es mayor que 1 pero menor que 1,5 y tienen una alta variabilidad entre los pacientes y los normales; de nuestro estudio, el gen DSCR4 se incluy&oacute; dentro de esta clase.</p>     <p>Puesto que el &uacute;nico gen clase I incluido en este trabajo que sufre el desbalance de dosis y se presenta en tres copias fue el DSCR5 (PIGP), es posible interpretar que el mayor efecto sobre la alteraci&oacute;n de los perfiles de transcripci&oacute;n de diferentes estructuras cerebrales en pacientes con SD, se deber&aacute; a este gen. As&iacute; pues, en los n&uacute;cleos caudados, el globo p&aacute;lido, el giro parahipocampal, el giro dentado y el &aacute;rea central 4, los perfiles de transcripci&oacute;n sufrir&iacute;an el efecto del desbalance de la dosis de PIGP (DSCR5). En consecuencia se puede inferir una alteraci&oacute;n de la funci&oacute;n que desempe&ntilde;an estas estructuras, principalmente en el aprendizaje, y la memoria (26), en particular en materia de tratamiento de retroalimentaci&oacute;n, la vida afectiva y la formaci&oacute;n de memorias cuya disfunci&oacute;n es caracter&iacute;stica del s&iacute;ndrome de Down.</p>     <p>Con base en los resultados y la correlaci&oacute;n anat&oacute;mica de la expresi&oacute;n diferencial demostrada en este estudio, es posible postular como hip&oacute;tesis de trabajo que la potencial alteraci&oacute;n de los perfiles transcripcionales, adem&aacute;s del desbalance de la dosis de los genes DSCR en las neuronas del ganglio basal y del l&oacute;bulo l&iacute;mbico, podr&iacute;an ser factores importantes en la desregulaci&oacute;n de sus funciones asociadas, conllevando a una disfunci&oacute;n del aprendizaje y la memoria, rasgos &eacute;stos que se observan en grados variables en los fenotipos SD y EA.</p>     <p>Los recientes resultados, referenciados en los p&aacute;rrafos anteriores, sustentan la hip&oacute;tesis de que existe una elevada variaci&oacute;n en los fenotipos de los pacientes SD, atribuible no tanto a genes espec&iacute;ficos sino m&aacute;s bien a la sobreexpresi&oacute;n o subexpresi&oacute;n de dominios cromos&oacute;micos completos. En este sentido, el SD deber&iacute;a enfocarse como un prototipo de desorden gen&oacute;mico, adem&aacute;s de convertirse en un excelente modelo para la implementaci&oacute;n de una neurociencia sist&eacute;mica (3840).</p>     <p>El modelo desarrollado en nuestro trabajo, sirve de punto de partida para efectuar un an&aacute;lisis sist&eacute;mico de la alteraci&oacute;n de los perfiles de expresi&oacute;n g&eacute;nica de subestructuras del cerebro en otras enfermedades neurol&oacute;gicas cuya patog&eacute;nesis es compleja e involucra numerosas redes de interacci&oacute;n de expresi&oacute;n de genes. De tal manera que el enfoque bioinform&aacute;tico se convierte en una herramienta poderosa para abordar un grupo creciente de enfermedades cr&oacute;nicas que se han convertido en problemas de salud p&uacute;blica a nivel mundial.</p>     <p><b>Agradecimientos</b></p>     <p>A la Universidad Aut&oacute;noma de Occidente y la Universidad del Valle por el apoyo financiero y de infraestructura para la ejecuci&oacute;n de este estudio. </p>     <p>Conflicto de intereses. Los autores declaran no tener ning&uacute;n conflicto de intereses con los resultados de este trabajo.</p> <hr>      <p><b>Referencias bibliogr&aacute;ficas</b></p>     <!-- ref --><p>1. Stevens CF. Neuronal diversity: too many  cell types for comfort? Curr Biol. 1998; 8(20):R708-10.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000072&pid=S0121-5256201200010000200001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>2. Oldham MC, Konopka G, Iwamoto K, Langfelder  P, Kato T, Horvath S, et al. Functional organization of the transcriptome in  human brain. Nat Neurosci. 2008; 11(11):1271-82.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000074&pid=S0121-5256201200010000200002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>3. Loebrich S, Nedivi E. The function of  activity-regulated genes in the nervous systen. Physiol Rev. 2009; 89:1079-103.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000076&pid=S0121-5256201200010000200003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>4. Sutcliffe JG. mRNA in the mammalian central  nervous system. Annu Rev Neurosci. 1988; 11:157-98.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000078&pid=S0121-5256201200010000200004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>5. Sandberg R, Yasuda R, Pankratz DG, Carter  TA, Del Rio JA, Wodicka L, et al. Regional and strain-specific gene expression  mapping in the adult mouse brain. Proc Natl Acad Sci  USA. 2000; 97:11038-43.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000080&pid=S0121-5256201200010000200005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </p>     <!-- ref --><p>6. Geschwind DH. Mice, microarrays, and the  genetic diversity of the brain. Proc Natl Acad Sci USA. 2000; 97:10676-78.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000082&pid=S0121-5256201200010000200006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>7. Zirlinger M, Kreiman G, Anderson DJ. Amygdala-enriched  genes identified by microarray technology are restricted to specific amygdaloid  subnuclei. Proc Natl Acad Sci USA. 2001; 98:5270-75.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000084&pid=S0121-5256201200010000200007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </p>     <!-- ref --><p>8. Lein ES, Zhao X, Gage FH. Defining a molecular atlas of the hippocampus using ADN microarrays and  high-throughput in situ hybridization. J Neurosci. 2004;24:3879-89.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000086&pid=S0121-5256201200010000200008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>9. McClung CA, Nestler E. Regulation of gene  expression and cocaine reward by CREB and Delta Fos B. Nat Neurosci. 2003;  6:1208-15.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000088&pid=S0121-5256201200010000200009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>10. Lewis NE, Schramm G, Bordbar A,  Schellenberger J, Andersen MP, Cheng JK, et al. Large-scale in silico modeling  of metabolic interactions between cell types in the human brain. Nature  Biotechnol. 2010; 28(12):1279-85.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000090&pid=S0121-5256201200010000200010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>11. Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe  H, Yada T, Park HS, et al. Chromosome 21 mapping and sequencing consortium. The  ADN sequence of human chromosome 21. Nature. 2000; 405:311-9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000092&pid=S0121-5256201200010000200011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>12. Gardiner K, Herault Y, Lott IT, Antonarakis  SE, Reeves RH, Dierssen M. Down syndrome: from understanding the neurobiology  to therapy. J Neurosci.2010; 30(45):14943-5.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000094&pid=S0121-5256201200010000200012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>13. Toyoda A, Noguchi H, Taylor TD, Ito T,  Pletcher MT, Sakaki S, et al. Comparative genomic sequence analysis of the  human chromosome 21 Down Syndrome Critical Region. Genome Res. 2002;  12:1323-32.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000096&pid=S0121-5256201200010000200013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>14. Eggermann T, Sch&ouml;nherr N, Spengler S, J&auml;ger  S, Denecke B, Binder G, et al. Identification of a 21q22 duplication in a  Silver-Russell syndrome patient further narrows down the Down syndrome critical  region.Am J Med Genet. 2010; 152A:356-59.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000098&pid=S0121-5256201200010000200014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>15. Montoya JC, Soto J, Satiz&aacute;bal JM, S&aacute;nchez  A, Garc&iacute;a-Vallejo F. Genomic study of the critical region of chromosome 21  associated to Down syndrome. Colombia M&eacute;dica. 2011;  42:26-38.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000100&pid=S0121-5256201200010000200015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>16. Cheadle C, Vawter MP, Freed WJ, Becker KG.  Analysis of microarray data using Z score transformation. J Mol Diagn. 2003;  5:73-81.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000102&pid=S0121-5256201200010000200016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>17. Liang WS, Reiman EN, Valla J, Dunckley T, Beach TG, Grover A, et al. Alzheimer's disease is associated  with reduced expression of energy metabolism genes in posterior cingulated neurons.  Proc Natl Acad Sci USA.  2008;105:4441-46.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000104&pid=S0121-5256201200010000200017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </p>     <!-- ref --><p>18. Amano K, Sago H, Uchikawa C, Suzuki T,  Kotliarova SE, Nukina N, et al. Dosage-dependent over-expression of genes in the trisomic region of  Ts1Cje mouse model for Down syndrome. Hum Mol Genet. 2004; 13:1333-40.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000106&pid=S0121-5256201200010000200018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>19. Shao M, Liu ZZ, Wang CD, Li HY, Carron C,  Zhang HW, et al. Down syndrome critical region protein 5 regulates membrane localization  of Wnt receptors, Dishevelled stability and convergent extension in vertebrate  enbryos. Development. 2009; 136:2121-31.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000108&pid=S0121-5256201200010000200019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>20. Head E, Lott IT, Patterson D, Doran E,  Haier RJ. Possible compensatory events in adult Down syndrome brain prior to  the development of Alzheimer disease neuropathology: targets for  nonpharmacological intervention. J Alzheimers Dis.2007;11:61-76.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000110&pid=S0121-5256201200010000200020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>21. Ryu YS, Park SY, Jung MS, Yoon SH, Kwen MY,  Lee SY, et al. Dyrk1A-mediated phosphorylation of Presenilin 1: a functional link  between Down syndrome and Alzheimer's disease. J Neurochem. 2010;115:574-84.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000112&pid=S0121-5256201200010000200021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>22. Sun X, Wu Y, Chen B, Zhang Z, Zhou W, Tong Y, et al. Regu la tor of calcineurin 1 (RCAN1)  facilitates neuronal apoptosis through caspase-3 activation. J Biol Chem. 2011;  286:9049-62.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000114&pid=S0121-5256201200010000200022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>23. Ferrando-Miguel R, Cheon MS, Lubec G.  Protein levels of genes encoded on chromosome 21 in fetal Down syndrome brain  (Part V): overexpression of phosphatidyl-inositol-glycan class P protein  (DSCR5). Amino Acids. 2004; 26:255-61.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000116&pid=S0121-5256201200010000200023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>24. Shibuya K, Kudoh J, Minoshima S, Kawasaki  K, Asakawa S, Shimizu N. Isolation of two novel genes, DSCR5 and DSCR6, from  Down syndrome critical region on human chromosome 21q22.2. Biochem Biophys Res  Commun2000; 271:693-8.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000118&pid=S0121-5256201200010000200024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>25. Graybiel AM. The basal ganglia: learning  new tricks and loving it. Curr Opin Neurobiol. 2005; 15:638-44.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000120&pid=S0121-5256201200010000200025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>26. Packard MG, Knowlton BJ. Learning and  memory functions of the Basal Ganglia. Annu Rev Neurosci. 2002; 25:563-93.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000122&pid=S0121-5256201200010000200026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>27. Dierssen M, Herault Y, Estivill X.  Aneuploidy: from a physiological mechanism of variance to Down syndrome.  Physiol Rev. 2009;89(3):887-920.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000124&pid=S0121-5256201200010000200027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>28. Osada T, Adachi Y, Kimura HM, Miyashita Y.  Towards understanding of the cortical network underlying associative memory. Philos  Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2008;363:2187-99.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000126&pid=S0121-5256201200010000200028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>29. Potier MC, Rivals I, Mercier G, Ettwiller L, Moldrich RX, Laffaire J,  et al. Transcriptional  disruptions in Down syndrome: a case study in the Ts1Cje mouse cerebellum  during post-natal development. J Neurochen. 2006; 97 Suppl 1:104-9.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000128&pid=S0121-5256201200010000200029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>30. Lee S, Lee E, Lee KH, Lee D. Predicting  disease phenotypes based on the molecular networks with condition-responsive correlation.  Int J Data Min Bioinform.2011; 5:131-42.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000130&pid=S0121-5256201200010000200030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>31. Miller JA, Horvath S, Geschwind DH.  Divergence of human and mouse brain transcriptome highlights Alzheimer disease pathways.  Proc Natl Acad Sci USA.2010; 107:12698-703.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000132&pid=S0121-5256201200010000200031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>32. O'Doherty A, Ruf S, Mulligan C, Hildreth V,  Errington ML, Cooke S, et al. An aneuploid mouse strain carrying human chromosome  21 with Down syndrome phenotypes. Science. 2005;309:2033-7.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000134&pid=S0121-5256201200010000200032&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>33. Morice E, Andreae LC, Cooke SF, Vanes L,  Fisher EM, Tybulewicz VL, et al. Preservation of long-term memory and synaptic plasticity  despite short-term impairments in the Tc1 mouse model of Down syndrome. Learn  Mem.2008; 15(7): 492-500.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000136&pid=S0121-5256201200010000200033&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>34. Belichenko PV, Kleschevnikov AM, Masliah E,  Wu C, Takimoto- Kimura R, Salehi A, et al. Excitatory-inhibitory relationship in  the fascia dentata in the Ts65Dn mouse model of Down syndrome. J Comp  Neurol.2009; 512(4): 453-66.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000138&pid=S0121-5256201200010000200034&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>35. Korbel JO, Tirosh-Wagner T, Urban AE, Chen  XN, Kasowski M, Dai L, et al. The genetic architecture of Down syndrome phenotypes  revealed by high-resolution analysis of human segmental trisomies. Proc Natl Acad Sci USA.2009; 106: 12031-6.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000140&pid=S0121-5256201200010000200035&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>36. Prandini P, Deutsch S, Lyle R, Gagnebin M,  Delucinge Vivier C, Delorenzi M, Natural gene-expression variation in Down syndrome  modulates the outcome of gene-dosage imbalance. Am J Hum Genet. 2007;  81:252-63.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000142&pid=S0121-5256201200010000200036&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>37. Yahya-GraisonA&iuml;t E, Aubert J, Dauphinot L, Rivals I, Prieur M, Golfier  G, et al. Classification  of human chromosome 21 gene-expression variations in Down syndrome: impact on disease  phenotypes. Am J Hum Genet. 2007;  81(3):475-91.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000144&pid=S0121-5256201200010000200037&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>38. Antonarakis SE, Lyle R, Dermitzakis ET,  Reymond A, Deutsch S. Chromosome 21 and Down syndrome: from genomics to pathophysiology.  Nat Rev Genet 2004; 5:725-38.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000146&pid=S0121-5256201200010000200038&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>39. Wiseman FK, Alford KA, Tybulewicz VL,  Fisher EM. Down syndrome--recent progress and future prospects. Hum Mol Genet. 2009;18(R1):R75-83.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000148&pid=S0121-5256201200010000200039&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p>     <!-- ref --><p>40. Vilardell M, Rasche A, Thormann A,  Maschke-Dutz E, P&eacute;rez-Jurado LA, Lehrach H, et al. Meta-analysis of  heterogeneous Down Syndrome data reveals consistent genome-wide dosage effects  related to neurological processes. BMC Genomics. 2011;12:229.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000150&pid=S0121-5256201200010000200040&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></p> </font>      ]]></body><back>
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