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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Presencia de rotavirus durante un proceso de compostaje. Abonos como vectores de contaminación viral]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Rotavirus presence in a waste composting process. Organic fertilizers as vehicles for viral contamination]]></article-title>
<article-title xml:lang="pt"><![CDATA[Presença de rotavírus durante um processo de compostagem. Adubos como vetores de contaminação viral]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Objective. To show the presence of rotavirus in different stages of a composting process: matrices used as raw material, mixture to be composted and the final product. Materials and methods. Immunochromatography, ELISA and RT-PCR were used for viral detection. Results. Rotavirus was found in the first composting step, no virus was found in the second step, and some inhibitory substances were found in the third step that posed difficulties in interpreting the PCR results and therefore providing a concluding result on rotavirus presence in the final product. Conclusions. Organic fertilizers can be vectors of human pathogenic viruses; therefore quality control tests must be implemented to avoid further viral dissemination. There are inhibitory substances present in organic fertilizers capable of interfering with the detection tests.]]></p></abstract>
<abstract abstract-type="short" xml:lang="pt"><p><![CDATA[Objetivo. Demonstrar a presença de Rotavírus nas diferentes fases de um processo de compostagem: matrizes utilizadas como matéria-prima, mistura de composto e produto final. Materiais e métodos: A determinação do Rotavírus foi realizada nos três processos de compostagem. A detecção viral foi realizada por imunocromatografia, ELISA e RT-PCR. Resultados. Evidenciou-se a presença viral no primeiro processo de compostagem, ausência de vírus no segundo, e no terceiro processo de compostagem, apresentaram-se interferências que dificultaram a interpre tação dos resultados da PCR, tornando impossível chegar a um resultado conclusivo de sua presença no adubo. Conclusões. Os adubos orgânicos podem abrigar o vírus é por isso que se devem implementar provas de qualidade para evitar que esse material contribuía com a disseminação viral. Dentro desses fertilizantes existem substâncias capazes de interferir nas provas de detecção.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[   <font size="2" face="verdana">      <p align="center"><font size="4"><b>Presencia de rotavirus durante un proceso de compostaje. Abonos como vectores de contaminaci&oacute;n viral</b></font></p>      <p align="center"><font size="3"><b>Rotavirus presence in a waste composting process. Organic fertilizers as vehicles for viral contamination</font></p>      <p align="center"><font size="3">Presen&ccedil;a de rotav&iacute;rus durante um processo de compostagem. Adubos como vetores de contamina&ccedil;&atilde;o viral</b></font></p>      <p>    <center>Mar&iacute;a Fernanda Guti&eacute;rrez<sup>1*</sup>, Mar&iacute;a del Pilar Bonilla<sup>2</sup>, Adriana Espinosa<sup>2</sup>,    <br> Mariela Mosquera<sup>2</sup>, Sandra Solano<sup>2</sup>, Mar&iacute;a Mercedes Mart&iacute;nez<sup>2</sup></center></p>      <br>      <p>    <center> <i><sup>1</sup>Grupo de Enfermedades Infecciosas,    ]]></body>
<body><![CDATA[<br> <sup>2</sup>Grupo de Biotecnolog&iacute;a Ambiental e Industrial, Departamento de Microbiolog&iacute;a, Facultad de Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana. Cra 7 # 43-82, Bogot&aacute;, D.C., Colombia</i></p>      <p>*<a href="mfgutier@javeriana.edu.co">mfgutier@javeriana.edu.co</a>      <p>Recibido: 17-03-2009; Aceptado: 13-11-2009</center></p>  <hr>      <p><font size="3"><b>Resumen</b></font></p>      <p><b>Objetivo:</b> Demostrar la presencia de Rotavirus en las diferentes fases de un proceso de compostaje: matrices utilizadas como materia prima, mezcla a compostar y producto terminado. <b>Materiales y m&eacute;todos.</b> El Rotavirus se determin&oacute; durante los tres procesos de compostaje. La detecci&oacute;n viral se realiz&oacute; por inmunocromatograf&iacute;a, ELISA y RT- PCR. <b>Resultados.</b> Se evidenci&oacute; presencia viral en el primer proceso de compostaje, ausencia viral en el segundo y en el tercer proceso de compostaje, se presentaron interferencias que dificultaron interpretar los resultados de la PCR, lo cual impidi&oacute; llegar a un resultado concluyente de su presencia en el abono. <b>Conclusiones.</b> Los abonos org&aacute;nicos pueden ser portadores de virus motivo por el cual se deben implementar pruebas de calidad para evitar que este material contribuya con la diseminaci&oacute;n viral. Dentro de estos abonos existen sustancias capaces de interferir en las pruebas de detecci&oacute;n.</p>      <p><b>Palabras clave</b>: Abonos, compostaje, inhibidores de la PCR, Rotavirus.    <p>  <hr>      <p><font size="3"><b>Abstract</b></font></p>      <p><b>Objective.</b> To show the presence of rotavirus in different stages of a composting process: matrices used as raw material, mixture to be composted and the final product. <b>Materials and methods.</b> Immunochromatography, ELISA and RT-PCR were used for viral detection. <b>Results.</b> Rotavirus was found in the first composting step, no virus was found in the second step, and some inhibitory substances were found in the third step that posed difficulties in interpreting the PCR results and therefore providing a concluding result on rotavirus presence in the final product. <b>Conclusions.</b> Organic fertilizers can be vectors of human pathogenic viruses; therefore quality control tests must be implemented to avoid further viral dissemination. There are inhibitory substances present in organic fertilizers capable of interfering with the detection tests.</p>      <p><b>Key words</b>: composting, organic fertilizers, PCR inhibitors, rotavirus.</p>  <hr>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="3"><b>Resumo</b></font></p>      <p><b>Objetivo.</b> Demonstrar a presen&ccedil;a de Rotav&iacute;rus nas diferentes fases de um processo de compostagem: matrizes utilizadas como mat&eacute;ria-prima, mistura de composto e produto final. <b>Materiais e m&eacute;todos:</b> A determina&ccedil;&atilde;o do Rotav&iacute;rus foi realizada nos tr&ecirc;s processos de compostagem. A detec&ccedil;&atilde;o viral foi realizada por imunocromatografia, ELISA e RT-PCR. <b>Resultados.</b> Evidenciou-se a presen&ccedil;a viral no primeiro processo de compostagem, aus&ecirc;ncia de v&iacute;rus no segundo, e no terceiro processo de compostagem, apresentaram-se interfer&ecirc;ncias que dificultaram a interpre ta&ccedil;&atilde;o dos resultados da PCR, tornando imposs&iacute;vel chegar a um resultado conclusivo de sua presen&ccedil;a no adubo. <b>Conclus&otilde;es.</b> Os adubos org&acirc;nicos podem abrigar o v&iacute;rus &eacute; por isso que se devem implementar provas de qualidade para evitar que esse material contribu&iacute;a com a dissemina&ccedil;&atilde;o viral. Dentro desses fertilizantes existem subst&acirc;ncias capazes de interferir nas provas de detec&ccedil;&atilde;o.</p>      <p><b>Palavras-Chave</b>: fertilizantes, compostagem, os inibidores da PCR, rotav&iacute;rus.</p>  <hr>      <p><font size="3"><b>Introducci&oacute;n</b></font></p>      <p>El hombre y los animales excretan diariamente por materia fecal un gran n&uacute;mero de virus los cuales se depositan directamente en el suelo, el agua, servicios de alcantarillado, contaminando el medio ambiente, aguas, lodos, pastos, suelo, e inclusive, los vegetales que crecen en terrenos expuestos a abonos o agua contaminada. Brotes de enfermedades asociadas con pat&oacute;genos presentes en aguas, frutas, verduras y jugos no pasteurizados han sido descritos en varios pa&iacute;ses, lo cual ha generado una voz de alerta a las autoridades sanitarias para el control principalmente de aguas o alimentos que podr&iacute;an servir como vectores y contribuir con la diseminaci&oacute;n y la llegada de virus a sus hu&eacute;spedes naturales, en este caso, el hombre (1).</p>      <p>Los abonos, en especial los de origen animal y los bios&oacute;lidos provenientes del proceso de tratamiento de aguas residuales poseen un alto contenido de materia org&aacute;nica que puede ser utilizado en agricultura para aportar macro y micronutrientes; a la vez contiene numerosos microorganismos pat&oacute;genos como virus ent&eacute;ricos que al estar presentes en la materia prima, pueden asociarse con diarrea, meningitis, y hepatitis en individuos susceptibles (2). La presencia viral en matrices s&oacute;lidas tipo lodo o bios&oacute;lido se facilita por la adsorci&oacute;n preferencial de estos en la material org&aacute;nica, donde los virus forman agregados, lo que les permite prolongar su actividad infecciosa y convierte estas matrices en fuente de contaminaci&oacute;n viral para el agua, el suelo y alimentos (3).</p>      <p>El Rotavirus (RV) es considerado el principal agente etiol&oacute;gico de diarreas, asociado con 114 millones de episodios de diarrea por a&ntilde;o lo que lleva a cerca de 24 millones de consultas m&eacute;dicas, 2,4 millones de hospitalizaciones y cerca de 500.000 muertes en ni&ntilde;os menores de 5 a&ntilde;os (4). Este virus es excretado en personas infectadas en cantidades de aproximadamente 10<sup>10</sup> part&iacute;culas por gramo de materia fecal (5, 6). Dentro de sus caracter&iacute;sticas se ha reportado que resiste rango de pH entre 3 a 9 &plusmn; 0,2, temperatura de 40&deg;C por varios d&iacute;as y de 20&deg;C por varias semanas, cuando se mantiene en 1,5 mM de calcio y que la part&iacute;cula completa mantiene su integridad e infectividad cuando es tratada con solventes org&aacute;nicos tales como &eacute;ter, cloroformo o fre&oacute;n, lo que permite inferir la ausencia de l&iacute;pidos en su estructura. No es claro c&oacute;mo la dureza del agua (iones calcio y magnesio) contribuye con la capacidad del virus para penetrar en las c&eacute;lulas del hospedero, aunque se sabe que ayudan a mantener la integridad viral, estabilizando la c&aacute;pside externa y manteniendo la capacidad infecciosa (7). Por otra parte, los cationes bivalentes y trivalentes favorecen la agregaci&oacute;n viral contribuyendo con su estabilidad (2, 8).</p>      <p>Sin embargo, hay varios factores ambientales que logran disminuir la infectividad viral como por ejemplo altas concentraciones de formalina, cloro, betapropiolactona y etanol al 95%. El cloro en el agua potable altera las prote&iacute;nas de la c&aacute;pside externa del RV y su incremento favorece la dispersi&oacute;n de agregados virales (7-9). Asi mismo, cuando el pH natural del medio aumenta, la capacidad de infecci&oacute;n se reduce, al permitir que las part&iacute;culas que conforman el agregado viral queden expuestas a otros factores presentes en el medio (7). Sustancias tales como la cal, alcalinizan el medio lo que permite que los iones NH<sub>4</sub><sup>+</sup> pierdan un prot&oacute;n produci&eacute;ndose gas amoniaco y la combinaci&oacute;n entre el alto pH y el amonio logra reducir el t&iacute;tulo viral debido a que fragmenta el RNA. Igualmente, otro de los factores ambientales que bajan el t&iacute;tulo viral dentro de un soporte org&aacute;nico como compost o bios&oacute;lidos es la desecaci&oacute;n, pues la ausencia de agua disminuye la estabilidad a las mol&eacute;culas constitutivas virales (2).</p>      <p>Dentro de las cadenas productivas de frutas (10) y verduras, los abonos org&aacute;nicos, sean de origen animal, vegetal o mixto han tomado gran inter&eacute;s debido a su aporte de materia org&aacute;nica, concentraci&oacute;n de microflora ben&eacute;fica y en algunos casos, la baja toxicidad y poca capacidad de contaminar el medio ambiente. Estos materiales que se producen por procesos como lombricultura o compostaje tienen como valor agregado el aprovechamiento de residuos agroindustriales, vegetales, animales o provenientes de plantas depuradoras, pero por otro lado, pueden contener microorganismos y virus que podr&iacute;an llegar a los consumidores en caso de no ser degradados durante el proceso de producci&oacute;n del compost (11).</p>      <p>Por la ausencia de envoltura y la presencia de tres capas proteicas dentro de la estructura del RV, se podr&iacute;a suponer que este es parcialmente resistente a efectos del medio ambiente, sin embargo su t&iacute;tulo deber&iacute;a disminuir al estar expuesto a las condiciones de temperatura y pH alcanzadas durante un proceso de compostaje. Durante este trabajo se quiso demostrar el comportamiento viral a lo largo del proceso de compostaje para determinar el papel que tiene el abono como posible vehiculo de transporte viral.</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><font size="3"><b>Materiales y m&eacute;todos</b></font></p>      <p><b>Preparaci&oacute;n del material org&aacute;nico y proceso de compostaje</b></p>      <p>La determinaci&oacute;n de RV se llev&oacute; a cabo durante tres procesos de compostaje realizados en diferentes a&ntilde;os y &eacute;pocas del a&ntilde;o, dos de ellos con residuos del relleno sanitario "Don Juanito" en la ciudad de Villavicencio manejado por la empresa Bioagr&iacute;cola del Llano S.A. y el tercero con residuos de la planta de tratamiento de agua de El Salitre (PTAR "El Salitre"), en Bogot&aacute;. Cada uno de estos procesos, ser&aacute; llamado "ensayo" y para cada ensayo se realizaron distintos procedimientos que ser&aacute;n llamados "tratamientos". El primer ensayo se realiz&oacute; en los meses de noviembre-diciembre de 2006, con el que se buscaba determinar la proporci&oacute;n en la que se deb&iacute;a preparar la mezcla a compostar, el segundo ensayo se realiz&oacute; en los meses de junio-julio de 2007, para el cual se utiliz&oacute; la mezcla seleccionada en el primer ensayo. El tercer ensayo utiliz&oacute; materias primas diferentes y se realiz&oacute; en los meses de agosto y septiembre del 2007. Los tratamientos realizados a cada ensayo se repitieron tres veces, en tres pilas y de manera simultanea.</p>      <p>Para los dos primeros ensayos, el material a compostar se prepar&oacute; con cuatro materias primas: cascarilla de arroz, cortes de pasto y material vegetal, residuos de la plaza de mercado y contenido ruminal.</p>      <p>Para el primer ensayo se prepararon dos tratamientos, uno con una mezcla que conten&iacute;a 50% de residuos de plaza y 20% cortes de pasto, en el segundo tratamiento la mezcla conten&iacute;a 60% de residuos de la plaza y 10% de cortes de pasto. Ambos tratamientos ten&iacute;an 20% contenido ruminal y 10% de cascarilla de arroz. El segundo ensayo se corri&oacute; con la mezcla que en el primer ensayo, present&oacute; mejor resultado respecto a la temperatura m&aacute;xima alcanzada en el proceso y caracter&iacute;sticas fisicoqu&iacute;micas durante el compostaje. Para el tercer ensayo se utilizaron cuatro tratamientos. Las materias primas utilizadas fueron cortes de pasto kikuyo, cascarilla, bios&oacute;lido y un in&oacute;culo termof&iacute;lico acelerador del proceso de compostaje.</p>      <p>Los cuatro tratamientos del tercer ensayo fueron elaborados con distintas mezclas: en el primero tratamiento se utiliz&oacute; pasto, cascarilla, bios&oacute;lido e in&oacute;culo PUJ (preparado en la Universidad Javeriana en Bogot&aacute;). En el segundo tratamiento, se utiliz&oacute; pasto, cascarilla, bios&oacute;lido e in&oacute;culo nativo, en el tercer tratamiento bios&oacute;lido, cascarilla y pasto y el cuarto tratamiento s&oacute;lo conten&iacute;a bios&oacute;lido.</p>      <p>El proceso de compostaje dur&oacute; 8 semanas tanto para los residuos de plaza como para el bios&oacute;lido. El muestreo se realiz&oacute; semanalmente recogiendo en bolsa pl&aacute;stica 500 g de muestra a partir de cinco diferentes secciones de cada pila el cual fue almacenado a -20&deg;C hasta su procesamiento. De estos 500 g, 5 g del material fue utilizado para la determinaci&oacute;n viral. En cada pila de compostaje se determin&oacute; la temperatura aleatoriamente en 5 puntos diferentes utilizando un term&oacute;metro de punz&oacute;n de 70cm de largo con receptor digital de datos. &Eacute;sta se midi&oacute; internamente enterrando el term&oacute;metro completamente en la pila de compost. La medici&oacute;n fue realizada semanalmente por ocho semanas. El pH fue determinado mediante el m&eacute;todo de pasta de saturaci&oacute;n, de acuerdo a la norma ICONTEC 2004, que consiste en tomar cinco submuestras de cada pila, completando 500g. Posteriormente se agregan 500mL de agua destilada, se homogeniza y sedimentada por 5 min. tomando el valor de pH sobre el extracto l&iacute;quido superficial.</p>      <p><b>Extracci&oacute;n y concentraci&oacute;n del virus a partir de las muestras</b></p>      <p>La t&eacute;cnica utilizada para la extracci&oacute;n del agente viral, fue la t&eacute;cnica de elusi&oacute;n descrita por Ahmed y Sorensen 1995 y modificada para este trabajo. Para tal fin se diluyeron 5 gr. de compost y de cada materia prima en 30 ml de extracto de carne al 10% (pH 9 &plusmn; 0,2)) los cuales fueron sometidos a agitaci&oacute;n en v&oacute;rtex, diez veces por 1 minuto. La mezcla se llev&oacute; a sonicaci&oacute;n en hielo a 37 Hz por 5 minutos con intervalos de un minuto, seguido de una agitaci&oacute;n por 5 minutos a 500 rpm. La suspensi&oacute;n resultante fue centrifugada a 5000 g por 1 hora a 4&deg;C. El pH del sobrenadante fue ajustado a 7,2 &plusmn; 0,2 con HCl 1M.</p>      <p>La t&eacute;cnica utilizada para la concentraci&oacute;n de la part&iacute;cula viral fue la descrita por Lewis y Metcalf 1988 y modificada por Mignotte y colaboradores (12). Al sobrenadante obtenido de la extracci&oacute;n se le adicion&oacute; polietilenglicol 6000 (PEG 6000) en tamp&oacute;n fosfato pH 7,2 &plusmn; 0,2 hasta una concentraci&oacute;n de 8% (p/v). La mezcla fue llevada a agitaci&oacute;n por 1,5 – 2 horas a 4&deg;C a 150 – 200 rpm y conservada a 4&deg;C durante toda la noche para posteriormente centrifugarla a 5000 g por 90 minutos a 4&deg;C. El precipitado fue suspendido en 2,5 ml de PBS pH 7,2 &plusmn; 0,2 (13).</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Control de proceso de extracci&oacute;n, purificaci&oacute;n y determinaci&oacute;n de virus</b></p>      <p>Teniendo en cuenta que el procedimiento de extracci&oacute;n, purificaci&oacute;n y detecci&oacute;n de virus a partir de compost no ha sido ampliamente reportado, la estandarizaci&oacute;n exigi&oacute; verificar los procedimientos. Para tal fin 5 g de compost se mezclaron con 1 ml de materia fecal positiva para RV (gentilmente donada por el Instituto Nacional de Salud), la mezcla se dej&oacute; a temperatura ambiente por 24 horas y se procedi&oacute; a realizar el proceso completo de extracci&oacute;n, purificaci&oacute;n y detecci&oacute;n de virus, tal y como se procesaron las muestras estudiadas. La determinaci&oacute;n de la presencia viral se realiz&oacute; por diferentes t&eacute;cnicas a los distintos ensayos. A los primeros dos ensayos se les aplicaron las pruebas de Inmunocromatograf&iacute;a y ELISA que son pruebas que detectan presencia de ant&iacute;genos virales. Al tercer ensayo se le determin&oacute; la presencia viral con la prueba de RT-PCR que determina la presencia de segmentos g&eacute;nicos virales. El motivo de cambio de t&eacute;cnica fue la b&uacute;squeda de una mayor sensibilidad en la detecci&oacute;n de la presencia viral.</p>      <p><b>Detecci&oacute;n de Rotavirus por Inmunocromatograf&iacute;a (ICF)</b></p>      <p>Para los dos primeros ensayos y para los controles de estos, la presencia viral se determin&oacute; mediante una prueba de Inmunocromatografìa (ICF) (VIKIA&reg; Rota-Adeno) que detecta de manera simult&aacute;nea la presencia de RV y Adenovirus. La prueba se realiz&oacute; siguiendo las instrucciones del fabricante. La presencia de una l&iacute;nea azul en el estuche fue interpretada como prueba positiva para la presencia viral. Los controles positivos y negativos de esta prueba ven&iacute;an incluidos desde la casa comercial.</p>      <p><b>Detecci&oacute;n del Rotavirus por prueba de ELISA</b></p>      <p>Esta prueba de ELISA s&oacute;lo fue aplicada a los 9 controles y 36 muestras seleccionadas por conveniencia dentro de muestras recolectadas en el primer ensayo. Para esta detecci&oacute;n se utiliz&oacute; el kit de ELISA PATHFINDER ROTAVIRUS (BIORAD&reg;, 2006) empleado usualmente para detectar este virus en heces humanas (14) y el procesamiento se realiz&oacute; siguiendo las instrucciones del fabricante. La lectura se hizo a 450 nm. El punto de corte se defini&oacute; como el valor de absorbancia del control negativo al que se le adicion&oacute; 0,075. Las absorbancia que sobrepasaron este valor fueron consideradas positivas. Los controles positivos de esta prueba ven&iacute;an incluidos dentro del estuche.</p>      <p><b>Detecci&oacute;n de Rotavirus por prueba de RT-PCR</b></p>      <p>Para determinar la presencia de RV en el tercer ensayo y en sus controles, se realiz&oacute; la amplificaci&oacute;n de un segmento del gen de VP6 (prote&iacute;na de c&aacute;pside interna). La amplificaci&oacute;n de este segmento se realiz&oacute; en dos pasos, el paso de retrotanscripci&oacute;n donde se utiliz&oacute; la enzima MML-V y random primer, para esto se llev&oacute; a incubar por 5 minutos a 97&deg;C, 42&deg;C 1 hora y 95&deg;C por 5 minutos. Los cebadores que se usaron amplifican una regi&oacute;n de 379-bp desde el nucle&oacute;tido 747 al 1126 y son el VP6-F en sentido positivo, (nt 747-766, 5' GACGGVGCRACTACATGGT 3') y VP6-R en sentido negativo, (nt 1126-1106, 5' GTCCAATTCATNCCT GGTGG 3'). El proceso de amplificaci&oacute;n se realiz&oacute; a 94&deg;C por 2 minutos, 94 &deg;C por 30 segundos, 58 &deg;C por 30 segundos, 72&deg;C por 1 minuto, 40 ciclos y una extensi&oacute;n final a 72&deg;C por 7 minutos (10).</p>      <p>La detecci&oacute;n de RV se realiz&oacute; tambi&eacute;n al pasto, a la cascarilla, a la cascarilla a la cual se le hab&iacute;a mezclado materia fecal positiva para RV, a la cascarilla esterilizada, al biosolido mezclado con materia fecal positiva para RV y al bios&oacute;lido esterilizado.</p>      <p><b>Detecci&oacute;n de inhibidores de la prueba de PCR</b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Con el objeto de descartar posibles falsos negativos en la prueba de PCR, 5 g de muestras de compost est&eacute;ril y de muestra de uno de los tratamientos del tercer ensayo se disolvieron en 30 ml de extracto de carne al 10% y se mezclaron con 10 ml de materia fecal de origen humano, positiva para RV. Igualmente se tomaron muestras est&eacute;riles a las que no se les a&ntilde;adi&oacute; RV. Estas muestras fueron procesadas de igual forma que todas las anteriores para buscar la amplificaci&oacute;n de segmentos virales.</p>      <p><font size="3"><b>Resultados</b></font></p>      <p><b>Presencia del Rotavirus en el material estudiado</b></p>      <p>En el primer ensayo, la prueba se ICF se realiz&oacute; a 47 de las 48 muestras tomadas y se encontraron 7 muestras positivas para presencia viral (<a href="#tab1">Tabla 1</a>). A este mismo ensayo se le realiz&oacute; prueba de ELISA a 36 de las 48 muestras tomadas, encontrando 11 muestras positivas (<a href="#tab2">Tabla 2</a>). En el segundo ensayo todas las muestras fueron negativas para RV, tanto las materias primas como los productos finales. De las cuatro matrices utilizadas en los primeros dos ensayos, la presencia viral se hizo evidente &uacute;nicamente en el contenido ruminal (<a href="#tab3">Tabla 3</a>).</p>      <p>    <center><a name="tab1"><img src="img/revistas/unsc/v14n3/v14n3a04t1.jpg"></center></p>     <p>    <center><a name="tab2"><img src="img/revistas/unsc/v14n3/v14n3a04t2.jpg"></center></p>     <p>    <center><a name="tab3"><img src="img/revistas/unsc/v14n3/v14n3a04t3.jpg"></center></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Curvas de temperatura y pH durante los dos primeros ensayos</b></p>      <p>La temperatura durante el proceso de los dos primeros ensayos se comport&oacute; siguiendo el modelo de los procesos de compostaje donde se diferencian claramente tres fases correspondientes a mesof&iacute;lica durante los primeros d&iacute;as, con temperaturas entre 35 y 60&deg;C, termof&iacute;lica con rango de temperatura entre 50 y 70&deg;C a partir del d&iacute;a 5 de proceso hasta la semana 6 y posteriormente una mesof&iacute;lica nuevamente que se evidenci&oacute; hasta el final del proceso. Respecto al pH igualmente el comportamiento respondi&oacute; con una etapa inicial de acidificaci&oacute;n leve, con descenso del pH hasta 6,0 &plusmn; 0,2 y posterior alcalinizaci&oacute;n hasta 8,0 &plusmn; 0,2, manteni&eacute;ndose as&iacute;hasta el final del proceso.</p>      <p><b>Verificaci&oacute;n del proceso de extracci&oacute;n, purificaci&oacute;n y determinaci&oacute;n de virus</b></p>      <p>Con el objeto de verificar que realmente se estaba logrando extraer y purificar virus a partir del compost y verificar tambi&eacute;n la ausencia de inhibidores que generaran resultados falsos negativos en las pruebas de ELISA e ICF, una muestra de materia fecal positiva se mezcl&oacute; con compost est&eacute;ril. Como control negativo se utiliz&oacute; compost el cual fue llevado a autoclave por 20 minutos. La detecci&oacute;n viral que se realiz&oacute; directamente con pruebas de ELISA, y los resultados se presentan en la <a href="#tab4">tabla 4</a>.</p>      <p>    <center><a name="tab4"><img src="img/revistas/unsc/v14n3/v14n3a04t4.jpg"></center></p>      <p><b>Determinaci&oacute;n de RV en el tercer ensayo por PCR</b></p>      <p>En este tercer ensayo se utiliz&oacute; la prueba de RT-PCR para detectar un segmento de 376 pb del gen que codifica para la prote&iacute;na VP6 del RV. En el gel de agarosa se pudo observar que las muestras positivas fueron el control positivo, la muestra de pasto (<a href="#fig1">Figura 1</a> pozo 2) y la muestra de cascarilla a la cual se le adicion&oacute; materia fecal positiva para RV, (<a href="#fig1">Figura 1</a> pozo 4). En la cascarilla est&eacute;ril (<a href="#fig1">Figura 1</a> pozo 6) se evidencian bandas inespec&iacute;ficas en el gel de agarosa, lo cual fue repetido buscando contaminaci&oacute;n durante la fase de laboratorio. Dentro de las muestras negativas est&aacute;n el control negativo, la cascarilla (<a href="#fig1">Figura 1</a> pozo 1), una muestra del cuarto tratamiento a la cual se le agreg&oacute; materia fecal positiva para RV (<a href="#fig1">Figura 1</a> pozo 3), una muestra del cuarto tratamiento pero que hab&iacute;a sido esterilizada en autoclave (<a href="#fig1">Figura 1</a> pozo 5) y dos muestras m&aacute;s de los tratamientos uno y dos (<a href="#fig1">Figura 1</a> pozos 7 y 8). La totalidad de las muestras de los dos ensayos fueron negativas para la presencia de RV (<a href="#fig2">Figura 2</a>).</p>      <p>    <center><a name="fig1"><img src="img/revistas/unsc/v14n3/v14n3a04f1.jpg"></center></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>    <center><a name="fig1"><img src="img/revistas/unsc/v14n3/v14n3a04f2.jpg"></center></p>      <p><font size="3"><b>Discusi&oacute;n</b></font></p>      <p>En el mundo se reportan anualmente billones de casos de diarrea con un aproximado de 1,8 millones de muertes cada a&ntilde;o (14). De la totalidad de casos, el 88% se asocian con aguas contaminadas o problemas de higiene de la poblaci&oacute;n. Dentro de los agentes virales que predominan en los casos de diarrea est&aacute;n el Rotavirus y los Norovirus cuya principal v&iacute;a de transmisi&oacute;n es fecal-oral. Por poseer resistencia a factores medio ambientales, permanecen en el suelo, el agua y los alimentos, lo que facilita su diseminaci&oacute;n (6). Aunque existen pocos reportes donde se demuestra la presencia de virus en abonos org&aacute;nicos, es sencillo presumir que los materiales con los que estos est&aacute;n elaborados son f&aacute;cilmente portadores de este tipo de pat&oacute;genos.</p>      <p>Para determinar la presencia de virus en muestras biol&oacute;gicas existen diversas t&eacute;cnicas que difieren en su sensibilidad y su fundamento. En la actualidad la prueba de PCR podr&iacute;a considerarse como prueba de "oro para detectar el &aacute;cido nucleico viral", reportando una sensibilidad mayor a 103 part&iacute;culas/ml (15), sin embargo, su alto costo dificulta su implementaci&oacute;n (6). La prueba de ELISA ha sido por muchos a&ntilde;os otra alternativa para detectar virus. Esta posee una sensibilidad entre 10<sup>4</sup> y 10<sup>6</sup> part&iacute;culas/ml por lo cual, un resultado positivo significa que en la muestra deben existir cantidades iguales o mayores a esa cantidad de virus para ser detectados y un resultado negativo implica cantidades menores a 10<sup>4</sup> part&iacute;culas/ml (15).</p>      <p>La prueba de ICF para determinar virus en muestras biol&oacute;gicas ha surgido recientemente y si bien no existen datos por parte de la casa comercial de su nivel de detecci&oacute;n, con los resultados de este ensayo se logr&oacute; percibir que posee una sensibilidad menor que una prueba de ELISA, lo que supondr&iacute;a que detecta a partir de 10<sup>6</sup> part&iacute;culas/ml.</p>      <p>Las pruebas de ELISA y de ICF son pruebas cualitativas, sin embargo, los datos de absorbancia de la prueba de ELISA fueron utilizados por los autores como un &iacute;ndice del n&uacute;mero de part&iacute;culas virales. Al observar el comportamiento el RV durante el primer ensayo, se evidenci&oacute; que los controles positivos sobrepasan las 1,5 unidades. En la primera semana los valores est&aacute;n entre 1 y 1,5 unidades y para la semana 2 los valores ya est&aacute;n cercanos al punto de corte, lo cual hace sospechar de una disminuci&oacute;n progresiva de la cantidad de part&iacute;culas virales. En el segundo ensayo, no se observ&oacute; presencia viral en el contenido ruminal ni en otra de las matrices a compostar, lo que hace suponer que durante el proceso de compostaje, no se encontrar&iacute;an resultados positivos (datos no mostrados)</p>      <p>Por las caracter&iacute;sticas de resistencia del virus a los factores medioambientales, durante la primera semana del proceso, las muestras se mantuvieron positivas pues a&uacute;n no se alcanza la temperatura ni el cambio de pH suficiente para la destrucci&oacute;n viral. En la segunda semana, solo una muestra dio positiva, lo cual demuestra que los proceso qu&iacute;micos y f&iacute;sicos activos, estaban afectando la viabilidad viral, para las semanas 3 y 4, la totalidad de las muestras fueron negativas, lo cual indica que ya el proceso hab&iacute;a logrado la inactivaci&oacute;n viral y la desaparici&oacute;n la prote&iacute;na VP6. La reaparici&oacute;n viral en la semana 5 y 8 puede ser interpretado de dos formas, la primera podr&iacute;a ser la contaminaci&oacute;n del compost por herramientas de trabajo, la segunda que realmente haya existido virus durante todo el proceso de compostaje pero que por cuestiones del azar en la recolecci&oacute;n de los 5 g recogidos para el tratamiento y detecci&oacute;n viral, no se haya seleccionado un lugar en el que estuviera el virus. (distribuci&oacute;n desigual del virus en la muestra).</p>      <p>En el tercer ensayo, la presencia de RV en el pasto puede considerarse como la fuente de contaminaci&oacute;n del compost. Sin embargo la presencia de inhibidores de la PCR se hizo evidente al mezclar el RV con una muestra de compost est&eacute;ril. As&iacute; pues, no se pudo saber si la ausencia de RV en los diferentes tratamientos del tercer ensayo se debi&oacute; a inactivaci&oacute;n viral por el proceso de compostaje o que realmente el virus se encuentra aun en la mezcla pero que no fue permitida la amplificaci&oacute;n del segmento g&eacute;nico debido a las sustancias qu&iacute;micas que impidieron su amplificaci&oacute;n. El mecanismo de acci&oacute;n de los inhibidores act&uacute;a en varios niveles: interfieren en la extracci&oacute;n del &aacute;cido nucleico, degradan las cadenas de &aacute;cido nucleico extra&iacute;do, inhiben la acci&oacute;n de las polimerasas durante la amplificaci&oacute;n o interaccionan con los dNTPs y el Mg del tamp&oacute;n de PCR impidiendo la polimerizaci&oacute;n (3, 16).</p>      <p>Con los resultados encontrados, se pueden presentar varias discusiones, la primera es que los estuches comerciales utilizados, no son exclusivos para determinar RV humano en materia fecal, estos tambi&eacute;n detectan RV de grupo A de origen bovino, sin embargo, para lograr comprobar el origen viral y poder determinar que el RV encontrado durante las primeras semanas es el mismo RV encontrado al final del mismo, se deben implementar pruebas de PCR, o PCR en tiempo real, que adem&aacute;s de determinar la cantidad de virus presente en la muestra, dar&aacute;n como resultado secuencias g&eacute;nicas que deben ser analizadas para evidenciar similitudes de las cepas encontradas a lo largo del proceso (16).</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Actualmente la norma colombiana de abonos org&aacute;nicos NTC 5167, no incluye sino bacterias pat&oacute;genas en el control de calidad de los mismos, sin embargo, la decisi&oacute;n del gobierno franc&eacute;s es la de incluir en su legislaci&oacute;n un n&uacute;mero m&aacute;ximo de enterovirus en abonos org&aacute;nicos (2,11), norma que ya empieza a ser estudiada por otros pa&iacute;ses de la Comunidad Econ&oacute;mica Europea, en especial para aquellos abonos que sean aplicados para producci&oacute;n de hortalizas org&aacute;nicas. Con base en los resultados presentados en este art&iacute;culo en donde se sugiere la presencia de virus durante un proceso de compostaje, se podr&iacute;a aceptar la norma francesa y para esto se deber&aacute;n implementar t&eacute;cnicas de extracci&oacute;n y detecci&oacute;n viral y estandarizar metodolog&iacute;as que detecten y eliminen sustancias inhibidoras para evitar resultados falsos negativos de virus en muestras como estas o muestras obtenidas del ambiente tales como agua, alimentos, entre otras (5). Otra de las herramientas que se debe implementar es el de las BPMs (Buenas pr&aacute;cticas de manejo de cultivo) en donde los utensilios de trabajo que se utilicen, sean diferentes durante cada etapa del proceso para evitar que utensilios contaminados, contaminen material limpio, que pudo ser la causa de la aparici&oacute;n de muestras positivas despu&eacute;s de varias semanas en las que el RV aparentemente hab&iacute;a desaparecido del fertilizante.</p>      <p><font size="3"><b>Conclusiones</b></font></p>      <p>Los abonos org&aacute;nicos como el compost, en especial los de origen animal o mixto, puede contribuir con la diseminaci&oacute;n viral y que si bien el aumento de la temperatura y la presencia de productos metab&oacute;licos de los microorganismos degradadores de materia org&aacute;nica durante el proceso de compostaje deber&iacute;an inactivar el virus y disminuir su t&iacute;tulo, existe la posibilidad de que estos permanezca atrapados en part&iacute;culas org&aacute;nicas estables como las sustancias h&uacute;micas y lleguen luego a los cultivos, contaminado sus productos finales. Por este motivo se debe incluir la detecci&oacute;n de virus dentro del control de calidad de los abonos y se deben implementar normas de buenas pr&aacute;cticas agr&iacute;colas que disminuyan la posibilidad de contaminaci&oacute;n.</p>      <p><b>Agradecimientos</b></p>      <p>A los directivos de FIUC as&iacute; como a los investigadores de las Universidades cat&oacute;licas de Pernambuco y Pelotas en Brasil y Universidad del Oriente en Colombia por su contribuci&oacute;n durante el desarrollo del proyecto. Al Dr. Miguel Gassiot por ser la gu&iacute;a cient&iacute;fica durante el proyecto. A los Microbi&oacute;logos Juan Ulloa, M&oacute;nica Alvarado y otros colaboradores de los laboratorios de virolog&iacute;a y microbiolog&iacute;a ambiental por sus aportes durante su realizaci&oacute;n.</p>      <p><b>Financiaci&oacute;n</b></p>      <p>Este trabajo fue financiado con el proyecto FIUC, coordinado por el Centro Coordinador de la Investigaci&oacute;n de la Federaci&oacute;n Internacional de Universidades Cat&oacute;licas (CCIFIUC), dentro del proyecto titulado "Formaci&oacute;n de T&eacute;cnicos para Mejorar la Fertilidad del Suelo en Pa&iacute;ses en V&iacute;as de Desarrollo".</p>      <p><b>Conflicto de intereses</b></p>      <p>Los autores del este art&iacute;culo manifiestan que el trabajo realizado y los resultados presentados no generan conflicto de intereses.</p>  <hr>      <p><font size="3"><b>Referencias</b></font></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p>1. Beuchat L. Vectors and conditions for preharvest contamination of fruits and vegetables with pathogens capable of causing enteric diseases, <i>British Food Journal</i> 2006; 108 (1): 38-53.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000093&pid=S0122-7483200900030000400001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>2. Monpoeho S, Maul A, Bonnin C, Patria L, Ranarijaona S, Billaudel S, Ferr&eacute; V. Clearance of human pathogenic viruses from sludge: Study of four stabilization processes by RT-PCR and cell culture, <i>Applied and Environmental Microbiology</i> 2004; 70 (9): 5434-5440.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000094&pid=S0122-7483200900030000400002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>3. Sano D, Fukushi K, Yoshida Y, Omura T. Detection of enteric viruses in municipal sewage sludge by a combination of the enzimatic virus elution method and RT-PCR, <i>Water Reserach</i> 2003; 37: 3490-3498.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000095&pid=S0122-7483200900030000400003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>4. Greenberg H, Estes M. Rotavirus: From Pathogenesis to Vaccination, <i>Gastroenterology</i> 2009; 136: 1939-1951.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000096&pid=S0122-7483200900030000400004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>5. Griffin DW, Donaldson, K.A., Paul J.H., Rose J.B. Pathogenic human viruses in coastal waters, <i>Clinical Microbiology Reviews</i> 2003; 16 (1): 129-143.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000097&pid=S0122-7483200900030000400005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>6. Bosch A, Guix S, Sano D, Pint&oacute; R. New tools for the study and direct surveillance of viral pathogens in water, <i>Current Opinion in Biotechnology</i> 2008; 19: 295-301.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000098&pid=S0122-7483200900030000400006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>7. Pancorbo O, Evanshen B., Campbell W., Lambert S., Curtis S., Woolley T. Infectivity and antigenicity reduction rates of human Rotavirus strain WA in fresh waters, <i>Applied and Enviromental Mircobiology</i> 1987; 53 (8): 1803-1811.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000099&pid=S0122-7483200900030000400007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>8. Abad F, Pinto R., Diez J., Bosch A. Desinfection of human enteric viruses in water by copper and silver in combination of low levels of chlorine, <i>Applied and Enviromental Mircobiology</i> 1994; 60 (7): 2377-2383.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000100&pid=S0122-7483200900030000400008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>9. Vaughn J, Chan, Y., Thomas, M. Inactivation of human and simian Rotaviruses by chlorine, <i>Applied and Enviromental Mircobiology</i> 1986; 51 (2): 391-394.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000101&pid=S0122-7483200900030000400009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>10. Schwarz B, Bange R, Vahlenkamp T, Johne R, M&uuml;ller H. Detection and quantitation of group A Rotaviruses by competitive and real-time reverse transcriptionpolymerase chain reaction, <i>Journal of Virological Methods</i> 2002; 105: 277-285.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000102&pid=S0122-7483200900030000400010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>11. Anne-Marie P, Picard-Bonnaud F, Ferr&eacute; V, Agnieszka G, Vasilica S, G&eacute;rard M. Survive of faecal indicators and enteroviruses in soil after land-spreading of municipal sewage sludge, <i>Applied Soil Ecology</i> 2007; 35: 473-479.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000103&pid=S0122-7483200900030000400011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>12. Mignotte B, Maul A, L S. Comparative study of techniques used to recover viruses from residual urban sludge, <i>Journal of Virological Methods</i> 1999; 78: 71-80.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000104&pid=S0122-7483200900030000400012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>13. Lewis G, Metcalf T. 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