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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Tipificación molecular de aislamientos del complejo Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Molecular typing of the Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii species complex]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The molecular typing of the Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii species complex is an useful tool for the molecular surveillance of this important opportunistic pathogen. The aim of this short communication is to inform physicians and laboratory personnel in Colombia about the importance of PCR fingerprinting in the comprehensive study of the genetic diversity of the C. neoformans/C. gattii species complex in the country. Furthermore, the results obtained from this molecular typing will enable us t complement the information gathered during the National Survey about cryptococcosis lead by the Microbiology Group of the Instituto Nacional de Salud. Isolates of the complex can be classified in 8 molecular patterns according to PCR fingerprinting using universal primers, which allows grouping the members of the complex according to species and, for C. neoformans, according to variety. The molecular surveillance of the C. neoformans/ C. gattii species complex isolates has become an epidemiological tool of great value since cryptococcosis has gained an important relevance in recent years due to the increasing number of immune-suppressed patients.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font face="verdana" size="2">     <p>    <center> COMUNICACI&Oacute;N BREVE</center></p>     <p><font size="4">    <center><b> Tipificaci&oacute;n molecular de aislamientos del complejo <i>Cryptococcus neoformans</i>/<i>Cryptococcus gattii</i></b></center></font></p>      <p><font size="3">    <center>Molecular typing of the <i>Cryptococcus   neoformans</i>/<i>Cryptococcus gattii species complex</i></center></font></p>        <p>    <center>Patricia  Escand&oacute;n<sup>1</sup>,  Andr&eacute;s Montilla<sup>1</sup></center></p>       <p><sup>1</sup> Grupo de Microbiolog&iacute;a, Instituto Nacional de Salud</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Recibido: 29/09/2009;  Aceptado: 10/07/2010</p>  <hr size="1">      <p><b>Resumen</b></p>      <p>La tipificaci&oacute;n molecular de los aislamientos del complejo <i>C. neoformans/C. gattii </i>constituye hoy en d&iacute;a una nueva herramienta para la vigilancia de este importante pat&oacute;geno oportunista.</p>      <p>Por medio de esta comunicaci&oacute;n queremos dar a conocer al cuerpo m&eacute;dico y de laboratorio en Colombia, la importancia de la PCR  huella digital en el estudio de la  diversidad gen&eacute;tica de los aislamientos del complejo <i>C. neoformans/C.</i> <i>gattii </i>obtenidos en el pa&iacute;s. Adicionalmente, los resultados obtenidos a partir de la  tipificaci&oacute;n molecular nos permiten complementar  la informaci&oacute;n recolectada en la encuesta nacional sobre la criptococosis liderada por  el Grupo de Microbiolog&iacute;a del Instituto Nacional de Salud.</p>      <p>Los aislamientos del complejo se  pueden clasificar en ocho patrones moleculares de  acuerdo con la t&eacute;cnica de PCR huella digital con iniciadores universales, que permite agrupar a  los miembros del complejo seg&uacute;n su especie, en el caso de <i>C. neoformans</i>, de acuerdo con su variedad. Realizar la vigilancia  molecular de los aislamientos del complejo <i>C. neoformans/C. gattii</i> es una herramienta epidemiol&oacute;gica de gran valor, teniendo en cuenta que la  criptococosis ha adquirido en los &uacute;ltimos a&ntilde;os un gran inter&eacute;s debido al creciente n&uacute;mero de pacientes inmunosuprimidos.</p>      <p><b>Palabras claves:</b> Criptococosis, <i>Cryptococcus</i> <i>neoformans</i>, vigilancia, Colombia, epidemiolog&iacute;a molecular.</p>  <hr size="1">      <p><b>Abstract</b></p>      <p>The molecular  typing of the <i>Cryptococcus neoformans/Cryptococcus  gattii </i>species complex is an useful  tool for the molecular surveillance of this  important opportunistic pathogen. The aim of this  short communication is to inform physicians  and laboratory personnel in Colombia about the  importance of PCR fingerprinting in the  comprehensive study of the genetic diversity of the <i>C.  neoformans/C. gattii </i>species complex in the  country. Furthermore, the results obtained from this  molecular typing will enable us t complement  the information gathered during the National  Survey about cryptococcosis lead by the  Microbiology Group of the Instituto Nacional de Salud.</p>      <p>Isolates of  the complex can be classified in 8  molecular patterns according to PCR fingerprinting  using universal primers, which allows  grouping the members of the complex according to  species and, for <i>C. neoformans,</i> according to  variety.</p>      <p>The molecular  surveillance of the <i>C. neoformans/</i> <i>C. gattii </i>species complex isolates has become an  epidemiological tool of great value since cryptococcosis  has gained an important relevance in  recent years due to the increasing number of  immune-suppressed patients.</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Key words:</b> Cryptococcosis, <i>Cryptococcus</i> <i>neoformans</i>, surveillance, Colombia, molecular epidemiology</p>  <hr size="1">      <p>La criptococosis es una de las  micosis sist&eacute;micas de gran importancia mundial que  compromete principalmente a la poblaci&oacute;n inmunosuprimida, por ejemplo, los pacientes con leucemias, linfomas, sarcoidosis, lupus eritematoso sist&eacute;mico, s&iacute;ndrome de Cushing's  y los pacientes que consumen altas dosis de corticoesteroides como  los transplantados. Sin embargo, la  poblaci&oacute;n m&aacute;s susceptible es la infectada por el  VIH; y debido a la pandemia VIH/sida el n&uacute;mero de casos por neuroinfecci&oacute;n tambi&eacute;n ha aumentado.</p>      <p>Actualmente, los miembros del  complejo <i>C.</i> <i>neoformans/C. gattii </i>se pueden agrupar en dos especies relacionadas: <i>C. neoformans</i>, conformadas por las variedades <i>grubii </i>(serotipo A) y <i>neoformans </i>(serotipo D) y un h&iacute;brido serotipo AD; y <i>C. gattii</i>, con los serotipos B y C. Recientemente se ha demostrado que se  pueden generar h&iacute;bridos entre los serotipos BD y AB <sup>(1-4)</sup>. Las dos especies presentan variaciones epidemiol&oacute;gicas, ecol&oacute;gicas y moleculares lo suficientemente amplias como para ser  consideradas como especies diferentes. Por  ejemplo, se sabe que <i>C. neoformans </i>afecta principalmente a pacientes inmunosuprimidos,  mientras que <i>C. gattii </i>se ha aislado principalmente de personas inmunocompetentes <sup>(5-9)</sup>.</p>      <p>La criptococosis no es una enfermedad  de notificaci&oacute;n obligatoria en ning&uacute;n lugar del mundo, excepto en la provincia de British  Columbia en Canad&aacute;. En Colombia existe muy poca informaci&oacute;n sobre su incidencia, y principalmente  en los grupos de alto riesgo, no  obstante, el Grupo colombiano de estudio de la  criptococosis ha unido esfuerzos para lograr que esta  importante entidad adquiera la relevancia que  merece en la salud p&uacute;blica del pa&iacute;s. Como resultado de esta iniciativa, en 2007 se public&oacute; el m&aacute;s reciente estudio epidemiol&oacute;gico de la enfermedad en Colombia a partir de los nueve a&ntilde;os de la Encuesta Epidemiol&oacute;gica sobre la Criptococosis (que se puede ser descargar de  <a href="http://www.cib.org.co" target="_blank">http://www.cib.org.co</a>), la cual pretende identificar las  caracter&iacute;sticas demogr&aacute;ficas de la poblaci&oacute;n afectada, conocer los factores de riesgo, la extensi&oacute;n de la diseminaci&oacute;n de la infecci&oacute;n al momento del diagn&oacute;stico y los m&eacute;todos de laboratorio empleados para establecerlo, la especie del  agente causal y el tratamiento inicial de los  pacientes infectados por aislamientos del complejo <sup>(10)</sup>.</p>      <p>Esta encuesta revel&oacute; que para el a&ntilde;o 2005 la incidencia promedio anual de criptococosis fue  de 2,4 casos x 106 en la poblaci&oacute;n general, mientras que en los pacientes con sida era de  3 casos x 103. Se encontr&oacute; que el 95,9% de los aislamientos pertenecieron al serotipo A; 0,3% al  D; 3,3% al B; y 0,5% al C <sup>(10)</sup>.</p>      <p>Para realizar estudios epidemiol&oacute;gicos y gen&eacute;ticos del complejo <i>C. neoformans/C. gattii </i>se han empleado diferentes t&eacute;cnicas de tipificaci&oacute;n molecular, las cuales han demostrado un alto  poder discriminatorio al agrupar los  aislamientos en diferentes patrones moleculares.  Dentro de estas t&eacute;cnicas moleculares predominan la PCR  huella digital con iniciadores universales  como el M13, (GACA)4 y (GTG)5 <sup>(8, 9, 11, 12)</sup>, el an&aacute;lisis del polimorfismo en longitud de fragmentos  amplificados (AFLP) <sup>(13)</sup>, el an&aacute;lisis del polimorfismo en longitud de fragmentos de restricci&oacute;n (RFLP) de los genes <i>URA5 </i>y <i>PLB1 </i><sup>(9, 14)</sup> y la tipificaci&oacute;n de secuencias multilocus (MLST) empleando siete  genes conservados (<i>CAP59, GPD1, LAC1, PLB1, SOD1, URA5</i> y la regi&oacute;n <i>IGS1</i>) <sup>(15, 16)</sup>. En la <a href="#tabla1">tabla 1</a> se muestra la concordancia de especies y  serotipos con los diferentes patrones obtenidos de las  t&eacute;cnicas de tipificaci&oacute;n actual.</p>      <p>    <center><a name="tabla1"><img src="img/revistas/inf/v14s2/2sa05t1.gif"></a></center></p>      <p>La tipificaci&oacute;n molecular de los aislamientos del complejo ofrece ventajas como la  facilidad de que todos los aislamientos sean  caracterizados empleando la misma t&eacute;cnica, la no dependencia de la expresi&oacute;n de las caracter&iacute;sticas fenot&iacute;picas y la facilidad y rapidez de la t&eacute;cnica; sin embargo, tambi&eacute;n se presentan ciertas desventajas como la falta de reproducibilidad  inter e intra laboratorios, y en especial la falta  de un consenso entre los resultados obtenidos con  las diversas t&eacute;cnicas de tipificaci&oacute;n; en la actualidad no hay un m&eacute;todo de tipificaci&oacute;n est&aacute;ndar para el estudio molecular de este pat&oacute;geno, por lo cual se sugiere que los laboratorios  empleen la Multilocus Sequence Typing (MLST)  como t&eacute;cnica universal <sup>(16)</sup>.</p>      <p>La MLST ha sido propuesta por el  grupo de trabajo en Genotipificaci&oacute;n de <i>Cryptococcus</i> <i>neoformans </i>y <i>Cryptococcus  gattii </i>de la <i>International</i> <i>Society for Human and Animal Mycoses</i> <i>(</i>ISHAM) como t&eacute;cnica universal para el estudio molecular de los aislamientos del  complejo (<a href="http://cneoformans.mlst.net" target="_blank">http://cneoformans.mlst.net</a>). Sin  embargo, este mismo organismo reconoce que las t&eacute;cnicas moleculares empleadas por los  diversos grupos de trabajo en el mundo, como las PCR  huella digital, utilizando iniciadores  microsat&eacute;lites (M13) o minisat&eacute;lites (GACA4 y GTG5) y el an&aacute;lisis mediante AFLP, pueden agrupar los  aislamientos en ocho patrones moleculares  principales. Por lo tanto, hoy en d&iacute;a se acepta el uso de la nomenclatura VNI a VNIV y VGI a VGIV debido a que se correlaciona con el concepto  actual acerca de la existencia de dos especies dentro  del complejo con base en el estudio de m&aacute;s de 2000 aislamientos de <i>C. neoformans </i>y <i>C. gattii</i>, entre ellos <i>C. neoformans </i>var. <i>grubii </i>serotipo A, VNI contin&uacute;a siendo el patr&oacute;n molecular prevalente a escala mundial.</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Las t&eacute;cnicas moleculares mencionadas han permitido establecer la relaci&oacute;n entre un genotipo en particular y su origen geogr&aacute;fico, como el caso del brote de criptococosis  originado en la isla de Vancouver, Canad&aacute;, en el cual, con el empleo de la MLST de ocho loci polim&oacute;rficos (<i>SX1a</i> o SX1&alpha;, IGS1, TEF1, GPD1, LAC1, CAP10, PLB1 y <i>MPD1</i>) se logr&oacute; sugerir dos posibles or&iacute;genes geogr&aacute;ficos (Australia o Sudam&eacute;rica) para los aislamientos causantes del brote <sup>(17)</sup>.</p>      <p>El primer estudio de tipificaci&oacute;n molecular hecho con aislamientos colombianos mostr&oacute; que el patr&oacute;n molecular VNI era el prevalente (45,2%) tanto en aislamientos cl&iacute;nicos como ambientales del complejo <sup>(9)</sup>. Estudios posteriores hechos en el Grupo de Microbiolog&iacute;a han indicado que el patr&oacute;n molecular VNI contin&uacute;a siendo el m&aacute;s frecuente entre los aislamientos del  serotipo A <sup>(11)</sup>, lo que concuerda con lo reportado en  la literatura <sup>(12)</sup> como el genotipo que causa en la mayor&iacute;a de casos la criptococosis en pacientes  inmunosuprimidos. Por otra parte, el predominio del  patr&oacute;n molecular VGII entre los aislamientos  de <i>C. gattii</i> serotipo B <sup>(9, 11)</sup> es similar a lo encontrado en  Vancouver, donde se report&oacute; un brote de criptococosis ocasionado por este genotipo <sup>(7)</sup>.</p>      <p>La serotipificaci&oacute;n de los aislamientos del complejo fue usada ampliamente durante muchos a&ntilde;os como instrumento para estudios  epidemiol&oacute;gicos; sin embargo, debido a la falta de  antisueros comerciales, las herramientas  moleculares han entrado a jugar un papel  importante, ya que permiten responder interrogantes que  pueden influenciar el manejo, la terapia y  la vigilancia de este importante pat&oacute;geno.</p>      <p>El estudio del polimorfismo molecular  de los microorganismos infecciosos ha  permitido entender mejor la epidemiolog&iacute;a de estos agentes. Por lo tanto, la vigilancia molecular de los  aislamientos del complejo <i>C. neoformans/C. gattii </i>que est&aacute;n circulando en Colombia, junto con los  datos primordiales obtenidos por la  encuesta nacional, nos permitir&aacute; ampliar nuestro conocimiento acerca de esta micosis, la cual  adquiere d&iacute;a a d&iacute;a una mayor jerarqu&iacute;a en las enfermedades de salud p&uacute;blica que afectan a nuestro pa&iacute;s.</p>      <p>    <p><b>Correspondencia:</b> Patricia Escand&oacute;n. Grupo de Microbiolog&iacute;a, Instituto Nacional de Salud. Direcci&oacute;n electr&oacute;nica: <a href="mailto:pescandon@ins.gov.co">pescandon@ins.gov.co</a></p>        <p><b>Referencias</b></p>      <!-- ref --><p>1. Franzot SP, Salkin IF, Casadevall A. <i>Cryptococcus neoformans </i>var. <i>grubii</i>: separate varietal status for <i>Cryptococcus neoformans </i>serotype A isolates. J Clin Microbiol 1999; 37:  838-840.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000040&pid=S0123-9392201000060000500001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>2. Kwon-Chung  KJ, Varma A. Do major species concept supports one, two or more  species within <i>Cryptococcus neoformans</i>?. FEMS Yeast Res 2006; 6:  574-587.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000041&pid=S0123-9392201000060000500002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>3. Bovers M,  Hagen F, Kuramae EE, Diaz MR, Spanjaard L, Dromer F, <i>et</i> <i>al. </i>Unique hybrids between the fungal pathogens <i>Cryptococcus neoformans</i> and <i>Cryptococcus  gattii. </i>FEMS Yeast Res. 2006; 6: 599-607.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000042&pid=S0123-9392201000060000500003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>4. Bovers M,  Hagen F, Kuramae EE, Hoogveld HL, Dromer F, St-Germain G, <i>et al. </i>AIDS patient death caused by novel <i>Cryptococcus</i> <i>neoformans Ã— C. gattii  hybrid. </i>Emerg Infect Dis. 2008; 14: 1105- 1108.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000043&pid=S0123-9392201000060000500004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>5. Mitchell  TG, Perfect JR. Cryptococcosis in the era of AIDS-100 years after the  discovery of <i>Cryptococcus neoformans</i>. Clin  Microbiol Reviews. 1995; 8:  515-548.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000044&pid=S0123-9392201000060000500005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>6. Laz&eacute;ra MS, Pires  FDA, Camillo-Coura L, Nishikawa MM, Bezera CCF, Trilles L,  Wanke B. Natural habitat of <i>Cryptococcus neoformans </i>var. neoformans in  decaying wood forming hollows in living trees. J Med Vet Mycol  1996; 34: 127-131&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000045&pid=S0123-9392201000060000500006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>7. Kidd SE,  Hagen F, Tscharke RL, Huynh M, Bartlett KH, Fyfe M <i>et al.</i> A rare  genotype of <i>Cryptococcus  gattii </i>caused the cryptococcosis outbreak on  Vancouver Island (British Columbia, Canada). Proc Natl Acad Sci USA 2004; 101: 17258-17263.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000046&pid=S0123-9392201000060000500007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>8. Meyer W, Marszewska K, Amirmostofian M, Igreja RP,  Hardtke C, Methling  K, <i>et al. </i>Molecular typing of global isolates of <i>Cryptococcus neoformans </i>var. <i>neoformans </i>by polymerase chain reaction  fingerprinting and randomly amplified polymorphic DNA- a pilot  study to standardize techniques on which to base a detailed  epidemiological survey. Electrophoresis 1999; 20: 1790- 1799.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000047&pid=S0123-9392201000060000500008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>9. Meyer W,  Casta&ntilde;eda A,  Jackson S, Huynh M, Casta&ntilde;eda E, Iberoamerican Cryptococcal  Study Group. Molecular typing of Ibero- American <i>Cryptococcus  neoformans </i>isolates. Emerg Infect Dis 2003; 9: 189-195.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000048&pid=S0123-9392201000060000500009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>10. Lizarazo J, Linares M, De Bedout C, Restrepo A,  Agudelo C, Casta&ntilde;eda E <i>et al. </i>Estudio cl&iacute;nico y epidemiol&oacute;gico de la criptococosis en Colombia: resultados de nueve a&ntilde;os de la encuesta nacional, 1997-2005. Biomedica 2007; 27: 94-109&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000049&pid=S0123-9392201000060000500010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>11. Escand&oacute;n P, S&aacute;nchez A, Mart&iacute;nez M, Meyer W, Casta&ntilde;eda E. Molecular  epidemiology of clinical and environmental isolates of the <i>Cryptococcus  neoformans species </i>complex reveals a high genetic  diversity and the presence of the molecular type VGII mating type a  in Colombia. 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