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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Genomas virales fragmentados sugieren contaminación para aguas de consumo humano]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Objective: To determine the presence of rotavirus and norovirus in drinking water in a northern neighborhood in Bogotá, Colombia. Materials and methods: Eight weekly samples of water were collected and ultrafiltered in order to detect the viral genome presence. The technique used for detection of genome segments was RT-PCR. VP6 gene from rotavirus and ORF2 segment from norovirus were selected in order to find the virus in the water. This study was performed in a higher education institution located in a periurban zone near Bogotá, 45 km away from the aqueduct that services the area. The zone is surrounded by dairy cattle farms, malls and four cemeteries. Water was collected in clean polypropylene containers. There were a total of 64 samples of 5 liters of water each. Results: Viral segments were found in 12.5% of the samples. We found rotavirus in four samples and norovirus in another 4. Besides discussing the importance of viral contamination in drinking water, we discussed the meaning of finding only viral segments and not complete and infectious viral particles.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font face="verdana" size="2">      <p>    <center>ART&Iacute;CULO ORIGINAL</center></p>     <p><font size="4">    <center><b>Genomas virales fragmentados sugieren contaminaci&oacute;n para aguas de consumo humano </b></center></font></p>     <p><font size="3">    <center>Viral genome fragments suggests contamination of human drinking water</b></center></font></p>      <p>    <center>Cristina Lenis<sup>1</sup>, Jazm&iacute;n L&oacute;pez<sup>2</sup>, Juan Carlos Ulloa<sup>2</sup>, Nury Olaya<sup>2</sup>, Mar&iacute;a Fernanda Guti&eacute;rrez<sup>2</sup></center></p>      <p><sup>1</sup>1 Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales, UDCA, Bogot&aacute;, D.C., Colombia </p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><sup>2</sup>Departamento de Microbiolog&iacute;a, Pontificia Universidad Javeriana, Bogot&aacute;, D.C., Colombia</p>     <p>Recibido: 15/11/2011; Aceptado: 09/05/2012</p> <hr size="1">     <p>Resumen</p>     <p><b>Objetivo. </b>Determinar la presencia de rotavirus y norovirus en agua para consumo humano en una localidad de Bogot&aacute;.</p>      <p><b>Materiales y m&eacute;todos. </b>Se recolectaron ocho muestras de agua por semana en ocho lugares diferentes del predio en estudio. Para determinar la presencia del genoma viral, las muestras se ultrafiltraron y se hizo detecci&oacute;n viral por medio de la t&eacute;cnica RT-PCR, amplificando un segmento del gen <i>VP6 </i>del rotavirus y un segmento del <i>ORF2 </i>del norovirus. Este estudio se llev&oacute; a cabo en una instituci&oacute;n universitaria ubicada en una zona periurbana cercana a Bogot&aacute;, a 45 km del acueducto que surte de agua al predio. La zona se encuentra rodeada por fincas con ganado lechero, centros comerciales y cuatro cementerios. El agua se recolect&oacute; en recipientes de polipropileno. En total, fueron 64 muestras de cinco litros de agua cada una.</p>      <p><b>Resultados. </b>La presencia viral fue de 12,5 %, encontr&aacute;ndose rotavirus en cuatro y norovirus en cuatro de las 64 muestras colectadas. Adem&aacute;s de presentar la importancia de la presencia viral en agua para consumo humano, en este documento se discute el significado que tiene el encontrar solo segmentos virales y no la part&iacute;cula viral completa e infecciosa.</p>      <p><b>Palabras clave: </b>agua potable, rotavirus, norovirus <br /> <hr size="1">     <p>Abstract</p>     <p><b>Objective: </b>To determine the presence of rotavirus and norovirus in drinking water in a northern neighborhood in Bogot&aacute;, Colombia.</p>      <p><b>Materials and methods</b>: Eight weekly samples of water were collected and ultrafiltered in order to detect the viral genome presence. The technique used for detection of genome segments was RT-PCR. VP6 gene from rotavirus and ORF2 segment from norovirus were selected in order to find the virus in the water. This study was performed in a higher education institution located in a periurban zone near Bogot&aacute;, 45 km away from the aqueduct that services the area. The zone is surrounded by dairy cattle farms, malls and four cemeteries. Water was collected in clean polypropylene containers. There were a total of 64 samples of 5 liters of water each.</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>Results: </b>Viral segments were found in 12.5% of the samples. We found rotavirus in four samples and norovirus in another 4. Besides discussing the importance of viral contamination in drinking water, we discussed the meaning of finding only viral segments and not complete and infectious viral particles.</p>      <p><b>Keywords: </b>drinking water, rotavirus, norovirus <br /> <hr size="1">      <p><b>Introducci&oacute;n</b></p>      <p>&quot;Agua potable, no es agua segura&quot;, esta premisa implica que el agua, a pesar de pasar por el proceso de potabilizaci&oacute;n, contin&uacute;a siendo un veh&iacute;culo transmisor de microorganismos, principalmente aquellos cuyo tama&ntilde;o se mide en nan&oacute;metros en vez de micras, como sucede con los virus. Se han reportado epidemias virales asociadas con agua potable, de ba&ntilde;o y de mar y con el consumo de ostras, y asociadas a la presencia de rotavirus, norovirus, astrovirus, adenovirus, virus de la hepatitis A y enterovirus de tipo poliomielitis, Coxsackie y echo, generando enfermedades como la gastroenteritis, lo que hace suponer que, despu&eacute;s de la transmisi&oacute;n persona a persona, el consumo de agua contaminada puede ser un factor importante en su transmisi&oacute;n <sup>(1-3)</sup>.</p>      <p>Se ha propuesto que existen m&aacute;s de 140 tipos de virus que se pueden encontrar en el agua y se ha sugerido que los tratamientos de purificaci&oacute;n masiva no son capaces de eliminarlos. Uno de los principales problemas para verificar la inocuidad del agua despu&eacute;s de pasar por los procesos de potabilizaci&oacute;n, radica en la poca sensibilidad que tienen los laboratorios de control de calidad para concentrar y verificar la presencia de los virus en ella <sup>(4-6)</sup>.</p>      <p>En Colombia, existen pocos reportes en los que se documenta la presencia de virus en aguas, en uno de ellos se reporta la presencia de enterovirus en Armenia <sup>(7)</sup> y, en otros publicados en los a&ntilde;os 2007 y 2008, por Guti&eacute;rrez, <i>et al</i>., describen la presencia de rotavirus, astrovirus y norovirus en aguas de Facatativ&aacute; y de Choc&oacute; <sup>(8,9)</sup>. De manera simult&aacute;nea, se encuentran reportes en los que se determina la prevalencia de estos mismos virus como causantes de diarrea en la poblaci&oacute;n infantil, con presencia promedio de rotavirus del grupo A del 13 %, de astrovirus del 2 % y de norovirus del 10 %, lo cual coincide con los datos reportados para rotavirus y astrovirus alrededor del mundo, mientras que, para norovirus, la prevalencia fue mayor a la reportada en otros lugares del planeta <sup>(10,11)</sup>.</p>      <p>La alta prevalencia de norovirus, el importante impacto de los virus ent&eacute;ricos en la salud p&uacute;blica y un imaginario de que en la poblaci&oacute;n de estudio existe mayor n&uacute;mero de diarreas que en el resto de la regi&oacute;n, generan la necesidad de continuar llevando a cabo estudios tendientes a la b&uacute;squeda de contaminantes virales en el agua, como ser&iacute;an los norovirus y los rotavirus. Otro motivo m&aacute;s para este tipo de estudios es entender que el comportamiento epidemiol&oacute;gico de los norovirus en pa&iacute;ses sin estaciones como el nuestro, donde act&uacute;a de manera end&eacute;mica apareciendo durante todo el a&ntilde;o, dista mucho del comportamiento que tiene en pa&iacute;ses desarrollados donde se ha asociado con epidemias alimentarias. En los reportes colombianos se demuestra que los norovirus se mantienen de manera end&eacute;mica, permanecen todo el a&ntilde;o y su presencia puede ser mayor que la de los rotavirus <sup>(12)</sup>.</p>      <p>Los rotavirus y los norovirus son virus desnudos, caracter&iacute;stica que les confiere resistencia al medio ambiente. Un estudio reportado por Espinoza en 2008, quien trabaj&oacute; con rotavirus y astrovirus, demostr&oacute; que estos virus pueden permanecer infecciosos en el agua por periodos mayores de 60 d&iacute;as y su &aacute;cido nucleico permanece estable por m&aacute;s de 30 d&iacute;as <sup>(3)</sup>. Si bien ese trabajo no incluy&oacute; datos con respecto a los astrovirus, se sabe que este tambi&eacute;n puede ser transmitido por el agua, tanto potable como de r&iacute;o, drenajes y aguas negras <sup>(13)</sup>.</p>      <p>Con el objeto de continuar determinando la presencia viral en el agua para consumo, en este trabajo se buscaron segmentos de material gen&oacute;mico viral de rotavirus y norovirus como indicadores de contaminaci&oacute;n. El uso de t&eacute;cnicas moleculares para la detecci&oacute;n de &aacute;cidos nucleicos virales es m&aacute;s sensible, espec&iacute;fico y r&aacute;pido, en comparaci&oacute;n con aquellas pruebas que buscan la detecci&oacute;n de virus completos. Sin embargo, estas pruebas no brindan suficiente informaci&oacute;n como para saber si las part&iacute;culas presentes son infecciosas o si no lo son <sup>(3)</sup>.</p>      <p><b>Materiales y m&eacute;todos</b></p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b><i>Lugar del muestreo </i></b></p>      <p>Se hizo un muestreo aleatorio estratificado en una instituci&oacute;n universitaria ubicada en una zona periurbana cercana a Bogot&aacute;, que se encuentra, adem&aacute;s, rodeada por fincas con ganado lechero, centros comerciales y cuatro cementerios. La raz&oacute;n por la cual se escogi&oacute; ese predio, fue porque dentro de la instituci&oacute;n se cree que en esa zona hay m&aacute;s diarrea que en el resto de Bogot&aacute;, dato que no se logr&oacute; confirmar. Sin embargo, esta suposici&oacute;n la convierten en un buen lugar de muestreo, adem&aacute;s de las caracter&iacute;sticas de su sistema de acueducto y obtenci&oacute;n de agua potable.</p>      <p>El muestreo se hizo en ocho puntos diferentes de la instituci&oacute;n, para obtener un total de 64 muestras. Los lugares de recolecci&oacute;n fueron dos cafeter&iacute;as, dos ba&ntilde;os, tres laboratorios de pr&aacute;ctica agr&iacute;cola y veterinaria, y un espacio de recreaci&oacute;n y de intercambio social. En estos lugares, las muestras se recolectaron con intervalos de 20 a 30 d&iacute;as, recogiendo cinco litros de agua por punto por semana, en recipientes de polipropileno limpios.</p>      <p>Las muestras se llevaron al Laboratorio de Virolog&iacute;a de la Pontificia Universidad Javeriana, donde se almacenaron a 4 &deg;C hasta el momento de la concentraci&oacute;n viral. A todas las muestras se les determin&oacute; el pH en el momento de su recolecci&oacute;n. Los procesos que se presentan a continuaci&oacute;n, de clarificaci&oacute;n, purificaci&oacute;n y concentraci&oacute;n de virus, utilizados para este trabajo, fueron estandarizados en este mismo laboratorio y se han implementado como herramientas de trabajo desde el a&ntilde;o 2004.</p>      <p><b><i>Clarificaci&oacute;n y purificaci&oacute;n viral </i></b></p>     <p>Para la concentraci&oacute;n viral y purificaci&oacute;n de los virus presentes en el agua, los cinco litros pasaron inicialmente por membranas clarificadoras y esterilizadoras <i>Millipore&trade; </i>de 0,8 y 0,2 &micro;m (<i>Opticatm 4&quot; Capsule Disposable Cartridge</i>&trade;, pore size 0.8 y 0.2 &micro;m, nominal) que es un sistema de filtraci&oacute;n frontal, el cual permite retirar las impurezas presentes en el agua, como part&iacute;culas suspendidas de tama&ntilde;os peque&ntilde;os, residuos org&aacute;nicos, etc., junto con carga microbiana de origen f&uacute;ngico y bacteriano. Este proceso se realiz&oacute; tres veces consecutivas para cada muestra obtenida con la ayuda de una bomba perist&aacute;ltica a velocidad promedio entre tres y cuatro rpm. Para evitar la contaminaci&oacute;n cruzada entre las muestras, se hizo un lavado de los filtros con 500 ml de agua desionizada est&eacute;ril entre muestra y muestra. El volumen final obtenido despu&eacute;s de esta filtraci&oacute;n del agua, fue de un litro para cada muestra, el cual fue almacenado en refrigeraci&oacute;n a una temperatura de 4 <b>&deg;</b>C hasta el momento del proceso de concentraci&oacute;n viral.</p>      <p><b><i>Concentraci&oacute;n viral </i></b></p>     <p>A partir del litro obtenido de cada muestra en la clarificaci&oacute;n, se llev&oacute; a cabo la ultrafiltraci&oacute;n mediante un sistema de filtraci&oacute;n tangencial y recirculante con la ayuda de una bomba perist&aacute;ltica y de un filtro <i>Millipore</i>&trade; Prep/Scale TFF con una membrana de celulosa con capacidad de retenci&oacute;n de peso mayor de 1.000 daltons. El volumen final de este proceso fue, aproximadamente, de 13 a 15 ml para cada muestra <sup>(6)</sup>, que luego se pasaron por un tubo de centrifugaci&oacute;n <i>Centriprep Ultracel YM-50</i>, <i>Millipore</i>&trade;; se centrifugaron entre siete y ocho minutos a 5.000<i>g</i>. El volumen final del concentrado obtenido durante este proceso fue de 300 a 500 &micro;l, los cuales se separaron en al&iacute;cuotas y se almacenaron a -80 &deg;C hasta la detecci&oacute;n viral <sup>(8,9)</sup>.</p>      <p><b><i>Extracci&oacute;n del ARN viral y determinaci&oacute;n de la presencia de virus en las muestras </i></b></p>     <p>Para la extracci&oacute;n del ARN viral se utiliz&oacute; <i>Trizol LS Reagent</i>&trade; (Invitrogen) y se siguieron las instrucciones propias del reactivo. La detecci&oacute;n del genoma viral se inici&oacute; con una retrotranscripci&oacute;n con la enzima <i>SuperScript III</i>&trade; (Invitrogen) y con un iniciador aleatorio. El programa para la retrotranscripci&oacute;n para los dos tipos de virus, se inici&oacute; colocando el tubo en el termociclador a 96 &deg;C por cinco minutos y pas&aacute;ndolo a hielo por cinco minutos para la predesnaturalizaci&oacute;n del ARN, para luego continuar con el proceso de retrotranscripci&oacute;n que incluy&oacute; temperaturas de 25 &deg;C por cinco minutos, de 50 &deg;C por una hora y de 70 &deg;C por 15 minutos, para la elongaci&oacute;n y formaci&oacute;n del ADN complementario (ADNAc). El ADNAc se amplific&oacute; con Taq polimerasa recombinante (Invitrogen, Brasil).</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>Los iniciadores usados para la amplificaci&oacute;n del genoma de norovirus fueron descritos por Frankhouse y se han denominado MON 431 (,TGGACIAGRGGICCYAAYCA)432 (TGGACICGYGGICCYAAYCA), 433 (GAAYCTCATCCAYCTGAACAT)y 434 ( GAASCGCATCCARCGGAACAT) <sup>(14)</sup> los cuales amplifican una regi&oacute;n de aproximadamente 213 pb. Para rotavirus se busc&oacute; un segmento del gen que codifica para la prote&iacute;na estructural VP6, utilizando los iniciadores <i>VP6- Forward </i>(GACGGVGCRACTACATGGT) y <i>VP6- Reverse </i>(GTCCAATTCATNCCTGGTGG), correspondiente a la c&aacute;pside intermedia del virus, que amplifican un segmento de 379 pb <sup>(15)</sup>.</p>      <p>Las bandas se visualizaron en gel de agarosa al 1,5 % con adici&oacute;n de bromuro de etidio. Los controles positivos para la prueba de PCR correspondieron a muestras de materia fecal proveniente de ni&ntilde;os menores de cinco a&ntilde;os, previamente caracterizadas para los dos virus en el Laboratorio de Virolog&iacute;a de la Pontificia Universidad Javeriana. Como control negativo del ensayo, se utiliz&oacute; agua cristal y, como control del procedimiento de clarificaci&oacute;n y concentraci&oacute;n, a 1 litro de agua cristal se le adicion&oacute; una mezcla de los dos virus, el rotavirus cultivado en la l&iacute;nea celular MA104 y el norovirus obtenido directamente a partir de materia fecal de ni&ntilde;os menores de cinco a&ntilde;os. Estos controles se utilizaron tambi&eacute;n para comprobar la ausencia de inhibidores de reacci&oacute;n que pudieran generar resultados falsos negativos en los ensayos.</p>      <p><b><i>Obtenci&oacute;n de datos de los factores ambientales </i></b></p>     <p>Para obtener el registro de los factores ambientales (temperatura, precipitaci&oacute;n y humedad) en cada fecha de muestreo, se solicit&oacute; la informaci&oacute;n al Instituto de Hidrolog&iacute;a, Meteorolog&iacute;a y Estudios Ambientales (IDEAM), y el pH se midi&oacute; en el momento de la toma de las muestras con el uso de un potenci&oacute;metro port&aacute;til.</p>      <p><b><i>An&aacute;lisis estad&iacute;stico y asociaci&oacute;n de la presencia de rotavirus con los diferentes factores ambientales </i></b></p>      <p>Para el an&aacute;lisis de datos se hizo un an&aacute;lisis descriptivo en el que se determinaron las medias para las variables evaluadas, seg&uacute;n cada sitio de muestreo; adem&aacute;s, se determin&oacute; la frecuencia con la cual el virus estuvo presente en cada punto de muestreo para establecer el porcentaje de muestras positivas del total del estudio.</p>      <p><b>Resultados</b></p>      <p><b><i>Detecci&oacute;n de virus en las muestras de agua </i></b></p>      <p>Durante las ocho semanas de muestreo, la presencia viral se evidenci&oacute; entre la cuarta y la s&eacute;ptima semana, encontr&aacute;ndose tanto rotavirus como norovirus. Los rotavirus se encontraron durante tres semanas, desde la quinta hasta la s&eacute;ptima, en cuatro lugares, un laboratorio, un ba&ntilde;o, una cafeter&iacute;a y el lugar de recreaci&oacute;n, a diferencia de lo sucedido con los norovirus, que solo se encontraron en la cuarta semana en dos cafeter&iacute;as y dos laboratorios. En la <a href="#tabla1">tabla 1</a> se muestra la presencia viral por semanas y por lugares.</p>      <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center> <a name="tabla1"><img src="img/revistas/inf/v16n2/v16n2a03t1.gif"></a></center></p>      <p>En la <a href="#figura1">figura 1</a> se puede evidenciar el corrido electrofor&eacute;tico en gel de agarosa al 1,5 % obtenido con las muestras positivas para rotavirus del estudio junto con los controles positivos utilizados, suministrados por el Laboratorio de Virolog&iacute;a.</p>     <p>    <center> <a name="figura1"><img src="img/revistas/inf/v16n2/v16n2a03i1.jpg"></a></center></p>      <p>En la <a href="#figura2">figura 2</a> se puede evidenciar el corrido electrofor&eacute;tico en gel de agarosa al 1,5 % obtenido con las muestras positivas para norovirus del estudio junto con los controles positivos utilizados, suministrados por el Laboratorio de Virolog&iacute;a.</p>      <p>    <center> <a name="figura2"><img src="img/revistas/inf/v16n2/v16n2a03i2.jpg"></a></center></p>      <p><b><i>Reporte de factores ambientales y presencia viral </i></b></p>      <p>El reporte de los datos de los factores clim&aacute;ticos (temperatura media, humedad relativa y precipitaci&oacute;n) suministrado por el IDEAM, fue entregado en la estaci&oacute;n n&uacute;mero 2120626, correspondiente a la zona norte de Bogot&aacute;, donde se desarroll&oacute; el muestreo. A partir de los datos entregados, se determinaron los valores medios obtenidos para las variables temperatura, humedad y precipitaci&oacute;n, que fueron de 14,15 &deg;C, 74,90 % y 70,17 mm3. Los valores semanales se pueden observar en la <a href="#tabla2">tabla 2</a>. El promedio del valor del pH fue de 6,91 y en la <a href="#tabla3">tabla 3</a> se pueden observar los valores para cada sitio de muestreo.</p>        <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center> <a name="tabla2"><img src="img/revistas/inf/v16n2/v16n2a03t2.gif"></a></center></p>      <p>    <center> <a name="tabla3"><img src="img/revistas/inf/v16n2/v16n2a03t3.gif"></a></center></p>      <p><b>Discusi&oacute;n</b></p>      <p>El riesgo intr&iacute;nseco de transmisi&oacute;n viral por medio del agua depende de varios factores, entre los cuales est&aacute;n la cantidad de virus presente y la capacidad que tiene el virus de sobrevivir en ella, por periodos medianos <sup>(3)</sup>.</p>      <p>En un art&iacute;culo publicado por Guti&eacute;rrez, <i>et al</i>., en el 2007, se discute el impacto de encontrar prote&iacute;na viral en el agua y se concluye que la detecci&oacute;n tanto de la prote&iacute;na como del &aacute;cido nucleico son indicadores de presencia viral <sup>(8)</sup>. Si bien ni la reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (<i>Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction</i>, RT-PCR) ni la prueba ELISA suministran informaci&oacute;n suficiente para afirmar la presencia de part&iacute;culas virales infecciosas, la simple presencia de componentes virales implica la presencia de la part&iacute;cula completa en alg&uacute;n momento dentro de la muestra. Esta afirmaci&oacute;n se puede hacer debido a que dentro de los hu&eacute;spedes de virus pat&oacute;genos, como lo son estos virus ent&eacute;ricos, no existen portadores sanos: todo individuo infectado tiene el virus en su interior, aunque este se manifieste con muy poca sintomatolog&iacute;a o, quiz&aacute;, pase de manera asintom&aacute;tica. Estos virus, y en general la gran mayor&iacute;a de virus ARN que infectan al hombre, cuando se encuentran en un hu&eacute;sped, est&aacute;n realizando ciclos virales, multiplic&aacute;ndose y comport&aacute;ndose de manera infecciosa. En el agua, es claro que el virus no lleva a cabo ning&uacute;n ciclo viral, pues el agua no tiene c&eacute;lulas permisivas. Sin embargo, la presencia del virus en el agua implica el contacto de esta con materia fecal de un hu&eacute;sped infectado, que podr&iacute;a ser bovino, porcino, canino o humano, que deposita el virus en el agua, permitiendo su dispersi&oacute;n.</p>      <p>El tiempo que estas part&iacute;culas pueden permanecer en el agua depende de varios factores, como son la temperatura, el pH, la cloraci&oacute;n, la presencia de s&oacute;lidos en suspensi&oacute;n y la presencia de metales pesados. Con respecto a la temperatura, los virus ent&eacute;ricos resisten temperaturas menores de 20 &deg;C por meses y son capaces de permanecer a temperaturas menores de 0 &deg;C por a&ntilde;os. En un estudio en el que recolectaron agua potable tomada del grifo, se demostr&oacute; que los t&iacute;tulos de rotavirus humano no se reducen en un per&iacute;odo de 64 d&iacute;as cuando la temperatura es de 4&deg; C y s&oacute;lo se presenta reducci&oacute;n de 2 logaritmos si la temperatura llega a 20 &deg;C. Esto muestra la resistencia que tienen los virus a bajas temperaturas (16-18). Al comparar esto con los resultados obtenidos en este trabajo, se podr&iacute;a explicar la presencia no solo de segmentos de genoma sino de toda la part&iacute;cula viral, probablemente infecciosa.</p>      <p>En cuanto al pH, estos virus ent&eacute;ricos se caracterizan por ser resistentes a pH extremos, ya que pueden pasar por el est&oacute;mago donde el pH es de 2 o 3 y luego por el intestino donde el pH tiende a la alcalinidad. Los potenciales de hidr&oacute;geno de 6 o 7, como los reportados en este trabajo, no alteran la estructura viral, lo cual lleva a explicar la presencia de genoma viral o inclusive virus completos e infecciosos.</p>      <p>En cuanto al cloro, s&oacute;lidos en suspensi&oacute;n y metales pesados, par&aacute;metros que no se evaluaron en este estudio pero que son indicadores de la calidad del agua, es importante tener en cuenta que su cantidad y concentraci&oacute;n podr&iacute;an afectar la estabilidad viral y su capacidad infecciosa. La presencia de iones met&aacute;licos en el agua puede inactivar el virus por ligaci&oacute;n de grupos donadores de electrones sobre prote&iacute;nas o &aacute;cidos nucleicos, reacci&oacute;n en la cual se producen radicales hidroxilo. En el caso de las prote&iacute;nas de la c&aacute;pside del viri&oacute;n, el p&eacute;ptido estructural es afectado, la prote&iacute;na pierde su estabilidad y se aumenta la vulnerabilidad del virus ante otros factores presentes en el agua <sup>(19)</sup>.</p>      <p>Si bien estos factores contribuyen a desestabilizar la part&iacute;cula viral, existen momentos en que la asociaci&oacute;n de virus a los s&oacute;lidos en suspensi&oacute;n puede contribuir a su supervivencia. Los virus adsorbidos en peque&ntilde;os s&oacute;lidos, incluyendo coloides, tienden a permanecer a flote por largos per&iacute;odos y protegerse de la cloraci&oacute;n durante el proceso de tratamiento del agua. Por esta raz&oacute;n, los virus adsorbidos a material en part&iacute;culas pueden conservar su capacidad infecciosa por m&aacute;s tiempo que el virus libre <sup>(17,20,21)</sup>.</p>      ]]></body>
<body><![CDATA[<p>En el trabajo de esta instituci&oacute;n, el agua que surte el predio llega por el sistema de acueducto desde Bogot&aacute; y recorre, aproximadamente, 45 km desde su salida del acueducto hasta su llegada, donde es almacenada en dos tanques que se lavan dos veces al a&ntilde;o. Hasta el 2011, no se hicieron estudios de control de calidad de este producto cuando llega al predio; sin embargo, desde siempre se ha considerado como apta para el consumo, puesto que en Bogot&aacute; hab&iacute;a pasado por los procesos de potabilizaci&oacute;n, lo que hace suponer una baja cantidad de s&oacute;lidos y de metales, un pH entre 6 y 7 y una concentraci&oacute;n de cloro apta para consumo humano. Todas estas condiciones favorecen la presencia viral. Sin embargo, queda por explicar de d&oacute;nde llega un virus ent&eacute;rico al agua de consumo, para lo cual se proponen dos hip&oacute;tesis: la primera, por filtraci&oacute;n en las tuber&iacute;as porosas, situaci&oacute;n que se facilita con la aparici&oacute;n de viviendas y barrios a lo largo del tubo madre que entrega el agua desde Bogot&aacute; hasta lugares apartados como lo es el predio que se estudi&oacute;, y la segunda, podr&iacute;a ser que estos virus llegaron al agua antes del proceso de potabilizaci&oacute;n y &eacute;ste no logr&oacute; su eliminaci&oacute;n.</p>      <p>En un art&iacute;culo publicado por Borchardt, <i>et al</i>., en el 2003, se demostr&oacute; que los virus pueden difundirse a trav&eacute;s de la tierra por 408 m de distancia y 64 m de profundidad <sup>(22)</sup>. En un espacio como la instituci&oacute;n donde se recolectaron las muestras, hay una actividad agropecuaria que posibilitar&iacute;a la presencia de virus ent&eacute;ricos de origen bovino o porcino en el suelo, los cuales podr&iacute;an migrar y penetrar en la tuber&iacute;a del agua potable. La segunda hip&oacute;tesis es la presencia de virus en aguas potables, lo cual puede deberse a que los sistemas de purificaci&oacute;n del agua no logran eliminar totalmente la carga viral, lo que permite la permanencia de algunos virus.</p>      <p>Parte de la discusi&oacute;n que se genera cuando se demuestra la presencia de virus en el agua y se trata de asociar con problemas de salud p&uacute;blica, es si la t&eacute;cnica de detecci&oacute;n es lo suficientemente sensible y espec&iacute;fica y si no es inhibida por las sustancias presentes en la muestra. Para superar este problema, se podr&iacute;a recurrir a cambiar el m&eacute;todo de concentraci&oacute;n del agua y a aumentar el volumen de la muestra analizada. Para ello, se propondr&iacute;a trabajar el m&eacute;todo de adsorci&oacute;n elusi&oacute;n que recibe y filtra m&aacute;s de 10 litros, y cambiar la tradicional RT-PCR por una PCR en tiempo real, la cual, adem&aacute;s de ser m&aacute;s sensible, ha sido propuesta como alternativa para trabajar virus no cultivables en c&eacute;lulas, como el norovirus <sup>(13)</sup>. Teniendo en cuenta que en este trabajo no se utilizaron estas t&eacute;cnicas, es probable que se hayan presentado resultados falsos negativos, si la cantidad de virus presente no alcanz&oacute; a ser detectada con las pruebas utilizadas. No obstante, el haber encontrado segmentos gen&oacute;micos virales en 8 de 64 muestreos, lo que significa el 12,5 %, es suficiente para aceptar la presencia de virus en el agua de consumo de este predio.</p>      <p>Lo &uacute;ltimo que vale la pena discutir es si el agua analizada podr&iacute;a estar asociada con los brotes de diarrea presentes en la poblaci&oacute;n. Para responder a esta pregunta se tendr&iacute;a que confirmar la capacidad infecciosa de los virus y se tendr&iacute;a que saber si el serotipo viral presente en la muestra pertenece a un virus con tropismo humano, lo cual no se ha confirmado en este estudio. Teniendo en cuenta que la zona es semirrural y que alrededor de ella existen fincas con ganado bovino, podr&iacute;a pensarse en que estos virus son de origen vacuno y no humano. Para confirmar esto, deber&iacute;an incluirse en trabajos posteriores, t&eacute;cnicas de amplificaci&oacute;n y secuenciaci&oacute;n de segmentos virales trabajadas con herramientas filogen&eacute;ticas.</p>      <p><b>Agradecimientos</b></p>      <p>Este trabajo fue financiado por la Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales, UDCA, y se llev&oacute; a cabo en colaboraci&oacute;n con el Departamento de Microbiolog&iacute;a de la Pontificia Universidad Javeriana.</p>      <p>Correspondencia: Mar&iacute;a Fernanda Guti&eacute;rrez. Departamento de Microbiolog&iacute;a, Universidad Javeriana, Bogot&aacute;, Colombia. Tel 320 8320 ext 4102, cel 310 2707567 Correo electr&oacute;nico: <a href="mailto:mfgutier@javeriana.edu.co">mfgutier@javeriana.edu.co</a> </p>      <p><b>Referencias</b></p>      <!-- ref --><p>1. Gratacap B. Detection of human and animal rotavirus sequences en drinking water. Appl Environ Microbiol. 2000;66:2690-2.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000081&pid=S0123-9392201200020000300001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>2. Deetz TR, Smith EM, Goyal SM, Gerba CP, Vollet JJ, Tsai L, <i>et al</i>. Occurrence of rota-and enteroviruses in drinking and enviromental water in a developing nation. Wat Res. 1984;18:567-71.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000082&pid=S0123-9392201200020000300002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>3. Espinosa A. Infectivity and genome persistence of rotavirus and astrovirus in groundwater and surface water. Wat Res. 2008;42:2618-28.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000083&pid=S0123-9392201200020000300003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>4. Keswick BH, Gerba CP, DuPont HL, Rose JB. Detection of enteric viruses in treated drinking water. Appl Environ Microbiol. 1984;47:1290-4.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000084&pid=S0123-9392201200020000300004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>5. Smith EM, Gerba CP. Development of a method for detection of human rotavirus in water and sewage. Appl Environ Microbiol. 1982;43:1440-9.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000085&pid=S0123-9392201200020000300005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>6. Soule H. Ultrafiltration and reverse transcription-polymerase chain reaction: An efficient process for poliovirus, rotavirus and hepatitis A virus detection in water.Wat Res. 2000;34:1063-7.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000086&pid=S0123-9392201200020000300006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>7. Gonzalez M. Detecci&oacute;n de poliovirus en aguas residuales de Armenia, Colombia. Rev Salud P&uacute;blica (Bogot&aacute;). 2006;8:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000087&pid=S0123-9392201200020000300007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>8. Gutierrez M. Presence of viral proteins in drinkable water -Sufficient condition to consider water a vector of viral transmission? Wat Res. 2007;41:373-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000088&pid=S0123-9392201200020000300008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>9. Moreno S. An&aacute;lisis filogen&eacute;tico de las cepas de rotavirus y virus de la hepatitis A encontradas en agua de consumo en el municipio de Quibd&oacute;, Choc&oacute;. Biom&eacute;dica. 2009;29(2).&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000089&pid=S0123-9392201200020000300009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>10. Gutierrez M. Virus diversity of acute diarrhea in tropical highlands. Rev Latinoam Microbiol. 2006;8:17-23.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000090&pid=S0123-9392201200020000300010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>11. Guti&eacute;rrez M. Comportamiento de la diarrea causada por virus y bacterias en regiones cercanas a la zona ecuatorial. Colombia M&eacute;dica. 2005;36(Supl.1): &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000091&pid=S0123-9392201200020000300011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>12. Mart&iacute;nez L. Etiolog&iacute;a de la enfermedad diarreica aguda en ni&ntilde;os menores de 5 a&ntilde;os en la poblaci&oacute;n de Quibd&oacute;. El calicivirus, un nuevo hallazgo. Pediatr&iacute;a. 2005;40:43-52.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000092&pid=S0123-9392201200020000300012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>13. Gregory J. Improved detection and quantitation of norovirus from water. Journal of Virological Methods. 2011;172:38-45.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000093&pid=S0123-9392201200020000300013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>14. Frankhouser R. Molecular epidemiology of Norwalk-like viruses in outbreaks of gastroenteritis in the United States. J Infect Dis. 1998;178:1571-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000094&pid=S0123-9392201200020000300014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>15. Gouvea V. Polymesase chain reaction amplification and typing of rotavirus nucleic acid from stool specimens. J Clin Microbiol. 1990;28:276-82.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000095&pid=S0123-9392201200020000300015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>16. Panangala V, Liu l, Sun G, Worley S, Mitra A. Inactivation of rotavirus by new polymeric water desinfectants. J Virol Meth. 1997;66:263-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000096&pid=S0123-9392201200020000300016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>17. Gerba P, Rose J, Haas N, Crabtree K. Waterborne rotavirus: A risk assessment. Water Res. 1996;30:2929-40.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000097&pid=S0123-9392201200020000300017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>18. Raphael R, Sattar S, Springthorpe S. Long-term survival of human rotavirus in raw and treated river water. Can J Microbiol. 1984;31:124-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000098&pid=S0123-9392201200020000300018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>19. Abad F, Pinto R, Diez J, Bosch A. Desinfection of human enteric viruses in water by copper and silver in combination of low levels of chlorine. Appl Environ Mircobiol. 1994;60:2377-83.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000099&pid=S0123-9392201200020000300019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>20. Chalapati V, Metcalf T, MElnick J. Development of a method for concentration of rotavirus to recovery of rotavirus from estuarine waters. Appl Environ Microbiol. 1986;52:484-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000100&pid=S0123-9392201200020000300020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>21. Griffin DW, Donaldson KA, Paul JH, Rose JB. Pathogenic human viruses in coastal waters. Clin Microbiol Rev. 2003;16:129-43.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000101&pid=S0123-9392201200020000300021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>22. Borchardt MA, Bertz PD, Spencer SK, Battigelli DA. Incidence of enteric viruses in groundwater from household wells in Wisconsin. Appl Environ Microbiol. 2003;69:1172-80.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000102&pid=S0123-9392201200020000300022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> ]]></body><back>
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