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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[OBTENCIÓN DE ANTICUERPOS ESPECÍFICOS PARA LA DETECCIÓN DEL Tamarillo leaf malformation virus (TALMV) EN TOMATE DE ÁRBOL]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Specific Antibodies to Detect Tamarillo leaf malformation virus (TaLMV) in Tamarillo]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[In Colombia, yields of tamarillo are seriously affected by a complex viral disease known as virosis. This pathology was first reported in 1991 in the north of Antioquia and currently affects all tamarillo growing regions in the country. Recent works have demonstrated the association of two potyviruses (potyviridae) with this disease: Potato virus Y (PVY) and Tamarillo leaf malformation virus (TaLMV, proposed species). Specific diagnostic tools are required for early asymptomatic detection of these viruses and tamarillo certification programs. In this study, we report the obtention of TaLMV specific antibodies using a 15 residues peptide mimicking the N-terminal coat protein. Specificity and sensitivity of the anti-TaLMV antibodies was determined by ELISA and dot-blot using recombinant protein and synthetic peptides as controls. The usefulness of these antibodies was validated from a preliminary trial of TaLMV detection in plant samples obtained from tamarillo crops in eastern Antioquia and results were compared with a TaMLV specific coat RT-PCR detection protocol.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font face="verdana" size="2">      <P align="center"><font size="4">OBTENCI&Oacute;N DE ANTICUERPOS ESPEC&Iacute;FICOS PARA LA DETECCI&Oacute;N DEL <I>Tamarillo leaf malformation virus </I>(TALMV) EN TOMATE DE &Aacute;RBOL </font> </P >     <p align="center" >Specific Antibodies to Detect <I>Tamarillo leaf malformation virus </I>(TaLMV) in Tamarillo </p >     <P   >YULIANA GALLO GARC&Iacute;A<Sup>1</Sup>, (c)M.Sc.; MAURICIO MAR&Iacute;N MONTOYA<Sup>2</Sup>, Ph. D.; PABLO ANDR&Eacute;S GUTI&Eacute;RREZ<Sup>1</Sup>, Ph. D. </P>     <p><Sup>1 </Sup>Laboratorio de Microbiolog&iacute;a Industrial, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia, Sede Medell&iacute;n. Colombia. <a href="ymgallo@unal.com">ymgallo@unal.com</a></p>      <p><Sup>2 </Sup>Laboratorio de Biolog&iacute;a Celular y Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia, Sede Medell&iacute;n. Colombia. <a href="mamarinm@unal.edu.co">mamarinm@unal.edu.co</a> Correspondencia: Prof. Pablo Andr&eacute;s Guti&eacute;rrez, Departamento de Biociencias, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia Sede Medell&iacute;n. Colombia. A.A. 3840. Fax: 57 4 430 93 41. <a href="paguties@unal.edu.co">paguties@unal.edu.co</a> </P >     <P   >Presentado 21 de enero de 2011, aceptado 2 de junio de 2011, correcciones 29 de junio de 2011. </P > <hr size="1">     <p    >RESUMEN </p >     <P   >En Colombia el rendimiento del cultivo de tomate de &aacute;rbol se ha visto seriamente afectado por la expansi&oacute;n de una enfermedad conocida como virosis de tomate de &aacute;rbol. Esta patolog&iacute;a se registr&oacute; inicialmente en 1991 en el norte de Antioquia y su expansi&oacute;n ha alcanzado todas las regiones cultivadoras de este frutal en el pa&iacute;s. Trabajos recientes han detectado la presencia de por lo menos dos especies del g&eacute;nero <I>Potyvirus </I>(Potyviridae) asociadas a esta enfermedad en los cultivos de tomate de &aacute;rbol de Antioquia: <I>Potato virus </I>Y (PVY) y <I>Tamarillo leaf malformation virus </I>(TaLMV, especie propuesta). Con el fin de reducir la diseminaci&oacute;n de estos pat&oacute;genos virales en el pa&iacute;s, es necesario contar con herramientas de diagn&oacute;stico que permitan la certificaci&oacute;n del material de siembra y la detecci&oacute;n temprana en plantas asintom&aacute;ticas. En este trabajo se obtuvieron anticuerpos policlonales espec&iacute;ficos para la detecci&oacute;n del virus TaLMV utilizando una regi&oacute;n antig&eacute;nica de 15 residuos de la c&aacute;pside viral. La sensibilidad y especificidad de los anticuerpos anti-TaLMV fue evaluada mediante pruebas de ELISA y <I>dot-blot </I>utilizando prote&iacute;na recombinante y p&eacute;ptidos sint&eacute;ticos como controles. La utilidad de estos anticuerpos fue validada a partir de una prueba piloto de detecci&oacute;n de TaLMV en muestras de plantas de tomate de &aacute;rbol con y sin s&iacute;ntomas de virosis obtenidas en el oriente antioque&ntilde;o. Los resultados serol&oacute;gicos fueron comparados con los niveles de detecci&oacute;n que ofrece la t&eacute;cnica de RT-PCR con cebadores espec&iacute;ficos para la c&aacute;pside viral de TaLMV. </P >     <P   >Palabras clave: anticuerpos, ELISA, <I>Potyvirus</I>, TaLMV, tomate de &aacute;rbol. </P > <hr size="1">     ]]></body>
<body><![CDATA[<p    >ABSTRACT </p >     <P   >In Colombia, yields of tamarillo are seriously affected by a complex viral disease known as virosis. This pathology was first reported in 1991 in the north of Antioquia and currently affects all tamarillo growing regions in the country. Recent works have demonstrated the association of two <I>potyvirus</I>es (potyviridae) with this disease: <I>Potato virus </I>Y (PVY) and <I>Tamarillo leaf malformation virus </I>(TaLMV, proposed species). Specific diagnostic tools are required for early asymptomatic detection of these viruses and tamarillo certification programs. In this study, we report the obtention of TaLMV specific antibodies using a 15 residues peptide mimicking the N-terminal coat protein. Specificity and sensitivity of the anti-TaLMV antibodies was determined by ELISA and <I>dot-blot </I>using recombinant protein and synthetic peptides as controls. The usefulness of these antibodies was validated from a preliminary trial of TaLMV detection in plant samples obtained from tamarillo crops in eastern Antioquia and results were compared with a TaMLV specific coat RT-PCR detection protocol. </P >     <P   >Key words: Antibody, ELISA, <I>Potyvirus</I>, TaLMV, Tamarillo. </P > <hr size="1">     <p    >INTRODUCCI&Oacute;N </p >     <P   >El tomate de &aacute;rbol (<I>Solanum betaceum </I>Cav.), es un frutal de origen andino cultivado principalmente en Colombia, Ecuador, Per&uacute; y Venezuela (Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural, 2006). Esta fruta presenta excelentes propiedades organol&eacute;pticas y nutricionales que la hacen muy atractiva para la industria de alimentos y bebidas (Bernal y Tamayo, 2003). En Colombia, este cultivo se extiende a 18 departamentos con un &aacute;rea total de siembra de 7.646 ha, concentradas principalmente en Antioquia y Cundinamarca. La siembra de tomate de &aacute;rbol se ha convertido en una alternativa viable para la sustituci&oacute;n de cultivos de il&iacute;citos y tradicionales de baja rentabilidad (Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural, 2006); desafortunadamente, los rendimientos y el per&iacute;odo productivo del cultivo en Colombia se ven seriamente afectados por la expansi&oacute;n de la enfermedad conocida como virosis de tomate de &aacute;rbol (Ayala <I>et al.</I>, 2010). Esta enfermedad se registr&oacute; por primera vez en 1991 en el norte de Antioquia (Tamayo, 1990; 1996) y se extendi&oacute; pr&aacute;cticamente a todas las regiones del pa&iacute;s, tal como lo demuestran estudios recientes en Antioquia, Boyac&aacute;, Cundinamarca, Nari&ntilde;o y Putumayo (Betancourth <I>et al.</I>, 2003; Cruz, 2005; Cuspoca, 2007; Gil <I>et al.</I>, 2009; Jaramillo, 2009; Ayala <I>et al.</I>, 2010). </P >     <P   >Los s&iacute;ntomas asociados a la virosis de tomate de &aacute;rbol incluyen la presencia de mosaicos con ampollamientos, deformaciones foliares y cambios en la apariencia de flores y frutos (Jaramillo, 2009). Tambi&eacute;n es posible la ocurrencia de s&iacute;ntomas m&aacute;s espec&iacute;ficos como bandeamiento de venas, grabados no geom&eacute;tricos en hojas y frutos, amarilla-miento de venas, manchas aceitosas, anillos necr&oacute;ticos y bronceamiento del tejido foliar (Ayala <I>et al.</I>, 2010). Varios estudios han establecido que esta enfermedad es causada por un complejo viral que incluye las especies de virus isom&eacute;tricos: <I>Cucumber mosaic virus </I>(CMV), <I>Alfalfa mosaic virus </I>(AMV), <I>Potato leaf roll virus </I>(PLRV), adem&aacute;s de los virus flexuosos del g&eacute;nero <I>Potyvirus </I>PVY y TaLMV (Gil <I>et al.</I>, 2009; Jaramillo, 2009; Ayala <I>et al.</I>, 2010; &Aacute;lvarez <I>et al.</I>, 2011). El virus TaLMV fue reportado por Ayala <I>et al.</I>, 2010, a partir de comparaciones de secuencias de regiones parciales de los genes de inclusi&oacute;n nuclear (Nib) y c&aacute;pside, que demostraron niveles de identidad inferiores al 70% entre las especies del grupo <I>Potyvirus </I>conocidos, siendo el <I>Colombian Datura virus </I>(CDV) el que present&oacute; mayores niveles de identidad. </P >     <P   >El incremento en incidencia y severidad de la virosis de tomate de &aacute;rbol en el pa&iacute;s, es ocasionado por deficiencias en las pr&aacute;cticas de manejo que realizan los agricultores y por la ausencia de semilla certificada (&Aacute;lvarez, 2009). A diferencia de otras patolog&iacute;as, las enfermedades virales no pueden ser tratadas con agroqu&iacute;micos, por lo que su diagn&oacute;stico equivocado tambi&eacute;n trae consigo graves consecuencias sobre costos de producci&oacute;n y ambiente (Bernal <I>et al.</I>, 1998; Khan y Dijkstra, 2006). La infecci&oacute;n de plantas por virus debe ser controlada de manera preventiva con medidas de manejo que limiten el aumento y dispersi&oacute;n de poblaciones de los agentes vectores, el uso de variedades resistentes y, en particular, el empleo de material vegetal libre de virus (Bernal <I>et al.</I>, 1998; Khan y Dijkstra, 2006). Esto &uacute;ltimo requiere del desarrollo de metodolog&iacute;as especiales que permitan la detecci&oacute;n de virus en plantas asintom&aacute;ticas. Las t&eacute;cnicas m&aacute;s utilizadas para este fin se basan en pruebas serol&oacute;gicas (<I>western-blot, dot-blot</I>, ELISA y flujo lateral) o en amplificaci&oacute;n de regiones diagn&oacute;sticas de los genomas virales mediante RT-PCR (Craig <I>et al.</I>, 2004). </P >     <P   >Las pruebas inmunol&oacute;gicas no solo permiten la detecci&oacute;n sino tambi&eacute;n la identificaci&oacute;n de virus, de una manera f&aacute;cil, sensible y a un costo razonable. Cuando los anticuerpos han sido producidos bajo esquemas estrictos de calidad, su utilizaci&oacute;n ofrece niveles apropiados de especificidad, sensibilidad y reproducibilidad (Craig <I>et al.</I>, 2004). Sin embargo, el &eacute;xito de estas pruebas depende de la disponibilidad de anticuerpos espec&iacute;ficos para las prote&iacute;nas producidas por las diferentes especies virales. porque la nueva especie propuesta de potyvirus TaLMV ha sido recientemente registrada en cultivos de tomate de &aacute;rbol en Colombia, es fundamental la generaci&oacute;n de herramientas de diagn&oacute;stico que permitan su detecci&oacute;n en los programas de manejo integrado de enfermedades que se realizan en este cultivo. Pese a que en la actualidad existen anticuerpos para la detecci&oacute;n gen&eacute;rica de potyvirus y algunas especies de importancia, no existen anticuerpos espec&iacute;ficos para la detecci&oacute;n de TaLMV. </P >     <P   >Recientemente Ayala <I>et al.</I>, 2010, determinaron la secuencia nucleot&iacute;dica del virus TaLMV entre dos regiones conservadas correspondientes a los genes codificantes para la prote&iacute;na de inclusi&oacute;n nuclear b y la c&aacute;pside. La regi&oacute;n N-terminal de la c&aacute;pside es el segmento m&aacute;s variable entre los potyvirus y contiene los principales ep&iacute;topes espec&iacute;ficos (Urcuqui-Inchima <I>et al.</I>, 2001). Estas dos caracter&iacute;sticas sustentan la hip&oacute;tesis de que es posible generar anticuerpos para el reconocimiento de variantes de potyvirus utilizando p&eacute;ptidos correspondientes a secuencias del extremo amino de la c&aacute;pside viral. En este trabajo se reporta la obtenci&oacute;n de anticuerpos policlonales espec&iacute;ficos para la detecci&oacute;n del virus TaLMV. Como ant&iacute;geno, se utiliz&oacute; un p&eacute;ptido sint&eacute;tico dise&ntilde;ado a partir de la regi&oacute;n variable del extremo N-terminal del gen de la c&aacute;pside viral. La sensibilidad de los anticuerpos, fue evaluada mediante pruebas de ELISA y <I>dot</I><I>blot </I>utilizando prote&iacute;na recombinante y p&eacute;ptidos sint&eacute;ticos como controles. La utilidad de estos anticuerpos para la detecci&oacute;n del virus TaLMV en muestras de cultivos de tomate de &aacute;rbol fue comparada con la amplificaci&oacute;n parcial del gen de la prote&iacute;na de c&aacute;pside mediante RT-PCR. Se realiz&oacute; una prueba piloto para validar el uso de los anticuerpos a partir de plantas de tomate de &aacute;rbol sintom&aacute;ticas y no sintom&aacute;ticas. Finalmente, se evalu&oacute; la presencia de dicho virus en plantas de papa con el fin de verificar la posibilidad de infecci&oacute;n cruzada entre estas dos especies de solan&aacute;ceas que comparten agroecosis-temas en las regiones andinas de Colombia. </P >     <p    >MATERIALES Y M&Eacute;TODOS </p >     ]]></body>
<body><![CDATA[<p  >COLECCI&Oacute;N DE MATERIAL VEGETAL </p >     <P   >Las muestras de las plantas de tomate de &aacute;rbol sintom&aacute;ticas utilizadas en las evaluaciones serol&oacute;gicas de TaLMV, fueron obtenidas en el corregimiento de Santa Elena (Medell&iacute;n). Para la realizaci&oacute;n de la prueba piloto de detecci&oacute;n, se obtuvieron en total 22 muestras de tejido foliar, de las cuales cinco muestras proven&iacute;an de plantas sintom&aacute;ticas y cinco de no sintom&aacute;ticas, en igual n&uacute;mero de cultivos de los municipios de La Ceja y La Uni&oacute;n (Antioquia). Adicionalmente, con el fin de evaluar la presencia del TaLMV en cultivos de papa, en estos mismos municipios se recolectaron nueve muestras foliares de plantas de papa con s&iacute;ntomas virales y tres de asintom&aacute;ticas. </P >     <p >CLONACI&Oacute;N DE LA REGI&Oacute;N N-TERMINAL DE LA C&Aacute;PSIDE DE TALMV </p >     <P   >El ARN molde necesario para la t&eacute;cnica de RT-PCR se obtuvo de tejido foliar de plantas de tomate de &aacute;rbol con el <I>kit RNeasy plant mini </I>(Qiagen, California, USA). Las reacciones de RT-PCR se realizaron en dos pasos (<I>Two-Step </I>RT-PCR) utilizando los cebadores TaLMVCP1F (5&rsquo;gggaattc<U>CATATG</U>GCTGATAAACTTGATGCCGG-3&rsquo;) y TaLMVCPR (5&rsquo;cgc<U>GGATCC</U><I>TCA</I>AGTGCATGAGATTTATTACTTGC 3&rsquo;) dise&ntilde;ados a partir de la secuencia reportada por Ayala <I>et al.</I>, 2010. Estos oligonucle&oacute;tidos contienen secuencias blanco para las enzimas de restricci&oacute;n <I>Nde</I>I y <I>Bam</I>HI, respectivamente. Los nucle&oacute;tidos extras en el extremo 5&rsquo; se adicionaron para garantizar buena eficiencia de corte, durante el proceso de clonaci&oacute;n. Las reacciones de retrotranscripci&oacute;n consistieron de un volumen de 20 &micro;L, incluyendo 1,9 &micro;L de agua, 4 &micro;L de buffer RT 5X, 4 &micro;L de MgCl2 25 mM, 2 &micro;L de dNTPs 10 mM, 1 &micro;L de cebador reverso 10 &micro;M, 0,1 &micro;l de inhibidor de RNasa (40 U/&micro;L), 2L de enzima M-MuLV transcriptasa reversa (20 U/&micro;L; Fermentas, Lituania) y 5 &micro;L de ARN. La reacci&oacute;n se llev&oacute; a cabo a 37 &deg;C por 60 min y 75 &deg;C por 15 min. Las muestras fueron mantenidas a 4&deg; C hasta su uso en el PCR posterior. </P >     <P   >Las reacciones de PCR se realizaron en un volumen de 25 &micro;L con 16,2 &micro;L de agua destilada est&eacute;ril, 2,5 &micro;L de buffer de enzima 10X, 1,8 &micro;L de MgCl2 25 mM, 0,5 &micro;L de dNTPs 10 mM, 0,5 &micro;L de cada cebador para clonaci&oacute;n 10 &micro;M, 0,2 &micro;L de Taq ADN polimerasa (5 U/&micro;L; Fermentas) y 2,5 &micro;l de ADNc. El programa de PCR consisti&oacute; en 95 &deg;C por 30 seg, seguido de 35 ciclos de 95 &deg;C por 30 seg, 52 &deg;C por 45 seg, 72 &deg;C por 45 seg y una extensi&oacute;n final a 72 &deg;C por 5 min, utilizando un termociclador T3 (Biometra, G&ouml;ttingen, Alemania). Despu&eacute;s de verificar el tama&ntilde;o del amplic&oacute;n en gel de agarosa a 1,5%, este fue clonado en el pl&aacute;smido pET15b (EMD Biosciences) utilizado los sitios <I>Nde</I>I y <I>Bam</I>HI de la regi&oacute;n de policlonaci&oacute;n. La presencia del inserto se confirm&oacute; mediante PCR de colonias, an&aacute;lisis de restricci&oacute;n de pl&aacute;smidos purificados con el <I>kit </I>QIAprep&reg; Spin Miniprep (Qiagen) y secuenciaci&oacute;n en ambos sentidos en la compa&ntilde;&iacute;a Macrogen (Corea del Sur). </P >     <p  >EXPRESI&Oacute;N Y PURIFICACI&Oacute;N DE LA C&Aacute;PSIDE VIRAL </p >     <P   >La prote&iacute;na recombinante de la regi&oacute;n N-terminal de la c&aacute;pside de TaLMV fue expresada en la cepa de <I>E. coli </I>BL21 (DE3). Se cultivaron 1.000 mL de medio LB suplementado con ampicilina &#91; 100 &micro;g/mL&#93; a 37 &deg;C y 250 rpm. Al alcanzar una densidad &oacute;ptica a 600 nm de 0,6 - 0,8, se indujo la producci&oacute;n de prote&iacute;na recombinante mediante adici&oacute;n de IPTG 0,1 mM. La expresi&oacute;n se llev&oacute; a cabo durante 4 horas a 30 &deg;C. El bot&oacute;n bacteriano fue recolectado mediante centrifugaci&oacute;n y conservado a -80 &deg;C. Para la purificaci&oacute;n se utiliz&oacute; el sistema Profinity TM IMAC Uncharged Resin (Bio-Rad, EE.UU.). El <I>pellet </I>fue tratado en condiciones no desnaturalizantes siguiendo las recomendaciones del fabricante. La columna fue lavada con 5 vol&uacute;menes de columna (VC) de tamp&oacute;n acetato (NaAc 50 mM, NaCl 0,3 M, pH 4,0) y cargada con 5 VC de NiSO4 200 mM. Finalmente, se hizo un lavado con 5 VC de agua destilada y equilibr&oacute; la columna con tamp&oacute;n de lisis (50 mM de NaH2PO4, 300 mM NaCl, 5 mM imidazol y lisozima 20 &micro;L/g). El lisado celular se pas&oacute; a trav&eacute;s de la columna equilibrada seguido de 5 VC de la soluci&oacute;n de lavado (50 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, 10 mM imidazol, pH 8,0). Para la eluci&oacute;n de la prote&iacute;na recombinante se utiliz&oacute; el buffer de eluci&oacute;n (50 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, 400 mM imidazole, pH 8,0). La pureza y peso molecular de la prote&iacute;na purificada fueron evaluados mediante SDS-PAGE (Laemmli, 1970). La concentraci&oacute;n de prote&iacute;na fue determinada por absorbancia a 280 nm en un espectrofot&oacute;metro Genesys 6 (<I>Thermo Scientific</I>) utilizando el coeficiente de extinci&oacute;n te&oacute;rico (Edelhoch, 1967). </P >     <p   >PRODUCCI&Oacute;N DE ANTICUERPOS </p >     <P   >El p&eacute;ptido TaLMV(p) fue dise&ntilde;ado con el m&eacute;todo de Hopp y Woods, 1981, implementado en el programa BioEdit (Hall, 1999) utilizando un promedio local de hidrofilicidad de 15 amino&aacute;cidos. Para el alineamiento m&uacute;ltiple se utilizaron las siguientes secuencias de c&aacute;pside, las siglas utilizadas en el art&iacute;culo y c&oacute;digos de acceso a GenBank se indican en par&eacute;ntesis: <I>Lily mottle virus </I>(LMV, AAN23111), <I>Colombian Datura virus </I>(CDV, CAJ34668.1), <I>Tobacco vein banding mosaic virus </I>(TVBV, AAA62491.1), <I>Lupine mosaic virus </I>(LLLMV, YP_0041 23732.1), <I>Narcissus late season yellows virus </I>(NLSYV, CAD38487.1), <I>Turnip mosaic virus </I>(TMV, BAF31158.1), <I>Sunflower mild mosaic virus </I>(SMMV, ADC43151.1), <I>Spiranthes mosaic virus </I>3 (SMV3, ACI06097.1) y <I>Vanilla distortion mosaic virus </I>(VDMV, AAY43686.1). El alineamiento m&uacute;ltiple se realiz&oacute; con el programa Clustal (Thompson <I>et al.</I>, 1994). El p&eacute;ptido antig&eacute;nico, TaLMV(p) seleccionado, corresponde a la secuencia TGKNVEKKDNQDKTL. </P >     <P   >El p&eacute;ptido TaLMV(p) fue sintetizado por la compa&ntilde;&iacute;a GenScript (New Jersey, EE.UU.) mediante el m&eacute;todo de fase s&oacute;lida y verificado por espectrometr&iacute;a de masas y HPLC. Los anticuerpos fueron producidos en dos conejos utilizando p&eacute;ptido sint&eacute;tico TaLMV(p) conjugado con hemocianina KLH. Se adicion&oacute; una ciste&iacute;na C-terminal para facilitar la conjugaci&oacute;n. Se realiz&oacute; una inoculaci&oacute;n primaria con 0.5 mg de p&eacute;ptido conjugado por conejo y tres refuerzos con igual cantidad de ant&iacute;geno a los dias 14, 35 y 56. Los anticuerpos fueron purificados en columnas por afinidad y resuspendidos en PBS, pH 7,4, obteni&eacute;ndose una cantidad total de 28,09 mg. El t&iacute;tulo de anticuerpos fue determinado mediante ELISA utilizando 100 &micro;L de p&eacute;ptido a una concentraci&oacute;n de 4 g/mL por pozo, en PBS pH 7,4. Para el revelado se utilizaron anticuerpos anti-conejo producidos en cabra conjugados a fosfatasa alkalina (BioRad; H+L). </P >     ]]></body>
<body><![CDATA[<p >DETECCI&Oacute;N POR ELISA </H6 >     <P    >Se utilizaron los anticuerpos policlonales producidos por ambos conejos contra el p&eacute;ptido TaLMV(p). La concentraci&oacute;n m&iacute;nima para la detecci&oacute;n se determin&oacute; a partir de diluciones seriadas de 1:1000 a 1:512000 del p&eacute;ptido dise&ntilde;ado y la prote&iacute;na recombinante purificada. La especificidad de los anticuerpos fue establecida mediante comparaci&oacute;n con los controles positivos de la compa&ntilde;&iacute;a Agdia (Indiana, EE.UU.) para la detecci&oacute;n gen&eacute;rica de potyvirus y el virus PVY. Tambi&eacute;n se utiliz&oacute; prote&iacute;na recombinante de la c&aacute;pside de PVA y TaLMV. La efectividad de las pruebas de ELISA fue contrastada con pruebas comerciales para la detecci&oacute;n de potyvirus transmitidos por &aacute;fidos, de la compa&ntilde;&iacute;a Agdia. Para estas pruebas se tomaron fracciones de las hojas de muestras sintom&aacute;ticas y previamente evaluadas como positivas para dichos virus mediante RT-PCR, se pesaron 100 mg de tejido foliar, macer&aacute;ndose con buffer de extracci&oacute;n y realiz&aacute;ndose el procedimiento est&aacute;ndar del DAS-ELISA, siguiendo las instrucciones del fabricante. Las lecturas de densidad &oacute;ptica fueron obtenidas en un equipo Multiscan (Labsystem, Finlandia). Cada prueba incluy&oacute; el p&eacute;ptido como control positivo a una concentraci&oacute;n de 0,1 &micro;M y el buffer de extracci&oacute;n como control negativo. Los pozos considerados con reacci&oacute;n positiva fueron aquellos en los cuales la lectura de absorbancia a 405 nm tuviera un valor m&iacute;nimo del doble de la lectura obtenida en el control negativo, siguiendo el criterio de Matthews, 1993. </P >     <p    >DETECCI&Oacute;N POR <I>WESTERN BLOT </I></p >     <P    >Los muestras fueron corridas en un gel SDS-PAGE 10% (Laemmli, 1970) y transferidas a una membrana de nitrocelulosa (Bio-Rad) durante una hora a 115 V en buffer de transferencia (192 mM glicina y 25 mM Tris base). La membrana fue bloqueada con leche descremada en polvo a 5% en buffer TBS-T 1X (150 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl, 0,1% Tween 20, pH 7,4) durante una hora a temperatura ambiente con agitaci&oacute;n. Para el revelado, se incub&oacute; la membrana durante tres horas con una diluci&oacute;n 1:1.000 (1,15 &micro;g/mL) de anticuerpo primario anti-TaLMV diluido en TBS-T. Luego de realizar tres lavados con TBS-T 1X, se llev&oacute; a cabo la incubaci&oacute;n del segundo anticuerpo anti-conejo conjugado con fosfatasa alcalina (Bio-Rad) con las mismas condiciones y concentraciones descritas anteriormente. La detecci&oacute;n se realiz&oacute; utilizanto el <I>kit alkaline phosphatase conjugate substrate </I>de BIORAD (EE.UU.), siguiendo las recomendaciones del fabricante. </P >     <p  >RESULTADOS Y DISCUSI&Oacute;N </p >     <p    >AN&Aacute;LISIS DE SECUENCIAS Y DETERMINACI&Oacute;N DE REGIONES ANTIG&Eacute;NICAS </p >     <P    >La mayor&iacute;a de los m&eacute;todos de predicci&oacute;n de ep&iacute;topes lineales estan basados en correlaciones entre las propiedades fisicoqu&iacute;micas de los amino&aacute;cidos y la localizaci&oacute;n de los ep&iacute;topes en el ant&iacute;geno (Wee <I>et al.</I>, 2010). Pese a que en la actualidad existe gran cantidad de m&eacute;todos de predicci&oacute;n que incluyen diversas escalas de hidrofilicidad, flexibilidad o accesibilidad al solvente; se ha demostrado que ninguno de estos programas es significativamente mejor en la predicci&oacute;n de ep&iacute;topes lineales (Blythe y Flower, 2005). Por esta raz&oacute;n y debido a su simpleza, decidimos utilizar el m&eacute;todo de Hopp y Woods, 1981. Este procedimiento fue dise&ntilde;ado para predecir determinantes antig&eacute;nicos en una prote&iacute;na, asumiendo que estos se encuentran expuestos en la superficie y corresponden a regiones hidrof&iacute;licas. Con el fin de garantizar buena especificidad en el reconocimiento de variantes de potyvirus se correlacion&oacute; este an&aacute;lisis con la variabilidad de la c&aacute;pside (<a href="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11f1.jpg" target="_blank">Fig. 1</a>). En el caso de TaLMV, la regi&oacute;n de mayor variabilidad corresponde a la de m&aacute;xima antigenicidad y por lo tanto cumple con los requerimientos necesarios para la generaci&oacute;n de anticuerpos espec&iacute;ficos. Los resultados del an&aacute;lisis llevaron a dise&ntilde;ar para el virus TaLMV un p&eacute;ptido con potencial antig&eacute;nico con la siguiente secuencia: TGKNVEKKDNQDKTL y con el cual se obtuvieron 29,08 mg de anticuerpos de conejo a partir de una inoculaci&oacute;n con 5 mg de p&eacute;ptido conjugado con hemocianina (KLH-TaLMV). El t&iacute;tulo de los anticuerpos anti-TaLMV fue inferior a 1:512.000 (<a href="#tabla1">Tabla 1</a>). </P >      <p>    <center><a name="tabla1"></a><img src="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11t1.jpg"></center>     <p    >PRODUCCI&Oacute;N DE C&Aacute;PSIDE RECOMBINANTE DE TALMV </p >     ]]></body>
<body><![CDATA[<P    >Con el fin de contar con un control positivo para pruebas de detecci&oacute;n futuras y para determinar la especificidad de los anticuerpos se clon&oacute; y expres&oacute; un segmento de la prote&iacute;na de la c&aacute;pside de TaLMV. La prote&iacute;na recombinante se gener&oacute; a partir de la secuencia codificante para la regi&oacute;n 1-77 de la c&aacute;pside del virus TaLMV y se expres&oacute; como una prote&iacute;na de fusi&oacute;n con colas de histidina en el extremo amino, TaLMV(r). Esta regi&oacute;n comprende el extremo variable N-terminal responsable de la transmisi&oacute;n viral (1-36) y una porci&oacute;n de la regi&oacute;n central conservada (37-77). Esta prote&iacute;na se expres&oacute; en <I>E. coli </I>BL21 (DE3) y pudo ser detectada en geles SDS-PAGE a partir de la primera hora de inducci&oacute;n con IPTG (<a href="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11f2.jpg" target="_blank">Fig. 2A</a>). La prote&iacute;na recombinante present&oacute; una migraci&oacute;n electrofor&eacute;tica compatible con un peso molecular esperado de 10.679 Da. Sin embargo, una vez purificada la prote&iacute;na, fue evidente la presencia de otras bandas de alto peso molecular m&uacute;ltiplos de la prote&iacute;na monom&eacute;rica (<a href="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11f2.jpg" target="_blank">Fig. 2B</a>). Dichas bandas fueron reconocidas por el anticuerpo espec&iacute;fico anti-TaLMV, aunque parece que este tiene mayor afinidad por la forma dim&eacute;rica de la prote&iacute;na (<a href="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11f2.jpg" target="_blank">Fig. 2C</a>). Estos d&iacute;meros desaparecen en presencia de EDTA 1 mM (datos no mostrados), lo cual sugiere una agregaci&oacute;n de la prote&iacute;na recombinante mediada por metales, un fen&oacute;meno frecuente en prote&iacute;nas purificadas por el sistema de polihistidina, pero irrelevante para su utilizaci&oacute;n como control serol&oacute;gico (Sprules <I>et al.</I>, 1998). </P >      <p >ESPECIFICIDAD DEL P&Eacute;PTIDO TALMV(P) Y DE ANTICUERPOS ANTI-TALMV </p >     <P    >Para descartar la posibilidad de reacci&oacute;n cruzada del p&eacute;ptido TaLMV(p) se llev&oacute; a cabo una prueba de ELISA con tres anticuerpos diferentes: anti-Poty (gen&eacute;rico para potyvirus), anti-PVY y anti-TaLMV(p) (<a href="#fig3">Fig. 3A</a>). Dicha prueba demuestra que ni los anticuerpos gen&eacute;ricos para potyvirus ni espec&iacute;ficos para la detecci&oacute;n de PVY reconocen la regi&oacute;n N-terminal de TaLMV. En ambas pruebas, la lectura de ELISA contra el p&eacute;ptido sint&eacute;tico fue inferior al control negativo. Los resultados anteriores son los esperados porque para poder realizar un reconocimiento gen&eacute;rico, dichos anticuerpos deben estar dise&ntilde;ados para detectar la regi&oacute;n central conservada de la c&aacute;pside de potyvirus y no el extremo variable amino terminal. Lo anterior contrasta con el resultado de ELISA utilizando losanticuerpos anti-TaLMV que arroj&oacute; valores de absorbancia muy superiores a los del control negativo. Es claro que la regi&oacute;n variable de TaLMV no presenta reacci&oacute;n cruzada con otros anticuerpos para potytivirus, lo cual es &uacute;til para el diagn&oacute;stico espec&iacute;fico de TaLMV. La especificidad de los anticuerpos anti-TaLMV fue evaluada por ELISA utilizando los controles positivos de dos pruebas comerciales (anti-<I>Potyvirus </I>y anti-PVY), c&aacute;pside recombinante de PVA, p&eacute;ptido TaLMV(p) y la prote&iacute;na recombinante de una porci&oacute;n NIb-c&aacute;pside de TaLMV(r) (<a href="#fig3">Fig. 3B</a>). </P >     <p>    <center><a name="fig3"></a><img src="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11f3.jpg"></center>     <P   >Los resultados de la prueba indican que el anticuerpo anti-TaLMV solo reconoce TaLMV (p) y TaLMV(r), lo cual resulta altamente deseable para el uso comercial de dichos anticuerpos. Solamente la prote&iacute;na recombinante PVA di&oacute; un valor de absorbancia ligeramente superior al l&iacute;mite determinado por el control negativo, lo que podr&iacute;a indicar una relaci&oacute;n filogen&eacute;tica entre ambos virus, para lo cual se hace necesario obtener una secuencia m&aacute;s extensa del genoma de TaLMV, de manera que se pueda evaluar con m&aacute;s detalle dicha situaci&oacute;n. Las pruebas de especificidad demuestran que el p&eacute;ptido antig&eacute;nico es altamente espec&iacute;fico para el virus TaLMV y puede ser utilizado como herramienta de diagn&oacute;stico para este componente etiol&oacute;gico de la enfermedad de la virosis de tomate de &aacute;rbol. </P >     <p >L&Iacute;MITE DE DETECCI&Oacute;N </p >     <P    >Para conocer las sensibilidad de los anticuerpos en pruebas de ELISA y <I>dot-blot </I>se determin&oacute; la concentraci&oacute;n m&iacute;nima de p&eacute;ptido detectable. Para la prueba ELISA, a&uacute;n a la m&iacute;mina concentraci&oacute;n utilizada (1 nM) el valor de absorbancia fue bastante alto: 2,32 (<a href="#fig4">Fig. 4A</a>). Lo anterior sugiere que el l&iacute;mite inferior de detecci&oacute;n sea aproximadamente un orden de magnitud inferior, aproximadamente 0,1 nM. Asumiendo que la c&aacute;pside de un potyvirus est&aacute; constituido por aproximadamente 2.000 caps&oacute;meros (Urcuqui-Inchima <I>et al.</I>, 2001), estimamos que mediante pruebas de ELISA la absorbacia obtenida permite detectar concentraciones de hasta 10<Sup>4 </Sup>part&iacute;culas virales de TaLMV por microlitro. En el caso de la detecci&oacute;n en membranas mediante <I>dot-blot</I>, el l&iacute;mite de detecci&oacute;n corresponde a una concentraci&oacute;n 1 &micro;M (<a href="#fig4">Fig. 4B</a>). Lo anterior equivale a una sensibilidad 10.000 veces menor respecto a ELISA y un t&iacute;tulo viral de 10<Sup>8 </Sup>part&iacute;culas virales por microlitro. Con el fin de establecer s&iacute; este l&iacute;mite de detecci&oacute;n es razoble para el diagn&oacute;stico de muestras vegetales, se realiz&oacute; un prueba de <I>dot-blot </I>utilizando plantas con y sin s&iacute;ntomas virales (<a href="#fig4">Fig. 4C</a>). Como control positivo se utiliz&oacute; el p&eacute;ptido TaLMV (p). En el caso de plantas sintom&aacute;ticas siempre se observ&oacute; una zona de coloraci&oacute;n conc&eacute;ntrica a la zona de fijaci&oacute;n de la muestra (<a href="#fig4">Fig. 4C</a>, derecha). </P >     <p>    <center><a name="fig4"></a><img src="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11f4.jpg"></center>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p >PRUEBA PILOTO CON MUESTRAS DE CAMPO </p >     <P   >La utilidad de los nuevos anticuerpos fue evaluada a partir de muestras obtenidas directamente de cultivos de tomate de &aacute;rbol del oriente antioque&ntilde;o y contrastada con la detecci&oacute;n con anticuerpos comerciales y RT-PCR (<a href="#fig5">Fig. 5A</a>). Con este fin, se recolectaron cinco plantas asintom&aacute;ticas de tomate de &aacute;rbol (AT1-5) y un n&uacute;mero igual de plantas sintom&aacute;ticas (ST1-5). Como control negativo se utilizaron plantas producidas mediante cultivo de meristemos y presumiblemente libres de virus. Todas las muestras sintom&aacute;ticas fueron positivas para la presencia de potyvirus utilizando anticuerpos comerciales (OD entre 2,3 y 4,0). Los valores de absorbancia para las muestras asintom&aacute;ticas fueron significativamente menores a los de las plantas con s&iacute;ntomas (OD entre 0,32 y 0,67), pero superiores o muy cercanas al l&iacute;mite inferior establecido para considerar la prueba como positiva (0,33). Lo anterior confirma observaciones de Jaramillo, 2009, que indican que la falta de s&iacute;ntomas en plantas de tomate de &aacute;rbol no corresponde necesariamente a la ausencia de virus. La prueba de ELISA con los anticuerpos anti-TaLMV indic&oacute; la presencia de este virus en cuatro plantas asintom&aacute;ticas: AT1, AT3, AT4 y AT5; y cuatro sintom&aacute;ticas: ST2, ST3, ST4 y ST5. Ninguna de las plantas obtenidas por cultivo de tejidos fue positiva con los anticuerpos utilizados (datos no mostrados). </P >     <p>    <center><a name="fig5"></a><img src="img/revistas/abc/v16n2/v16n2a11f5.jpg"></center>     <P   >La detecci&oacute;n serol&oacute;gica de TaLMV fue contrastada con la amplificaci&oacute;n parcial del gen de la prote&iacute;na de c&aacute;pside a partir de muestras sintom&aacute;ticas mediante RT-PCR utilizando cebadores espec&iacute;ficos para este virus. Los resultados de la amplificaci&oacute;n sugieren claramente la presencia del virus en todas las plantas sintom&aacute;ticas y una asintom&aacute;tica (AT4). Te&oacute;ricamente la prueba de RT-PCR es m&aacute;s sensible para la detecci&oacute;n de virus de plantas que las pruebas serol&oacute;gicas (Craig <I>et al.</I>, 2004). Sin embargo, la amplificaci&oacute;n es altamente dependiente de la calidad del ARN extra&iacute;do y de la presencia de inhibidores de RT y DNA polimerasa (Hsu <I>et al.</I>, 2005). Esto explicar&iacute;a algunos de los problemas de amplificaci&oacute;n en muestras positivas por ELISA, m&aacute;s a&uacute;n cuando Jaramillo, 2009; &Aacute;lvarez, 2010 reportan que la oxidaci&oacute;n de las muestras de tomate de &aacute;rbol una vez maceradas, a&uacute;n bajo tratamientos con agentes reductores, afecta dram&aacute;ticamente la eficiencia de las reacciones de RT-PCR. Estos mismos autores plantearon la posibilidad de transmisi&oacute;n cruzada de virus entre cultivos de papa y tomate de &aacute;rbol. Esta hip&oacute;tesis est&aacute; fundamentada en la detecci&oacute;n de cepas virales PVY y PLRV en plantas de tomate de &aacute;rbol (&Aacute;lvarez <I>et al.</I>, 2011); con secuencias id&eacute;nticas a las encontradas por Gil, 2010, en papa. Para este fin, se eval&uacute;o la presencia de potyvirus y TaLMV en tres plantas de papa asintom&aacute;ticas (AP1-3) y nueve plantas con s&iacute;ntomas virales (SP1-9) como amarillamientos, mosaicos, enanismos y/o aclareamiento de venas secundarias. Las muestras fueron colectadas en la misma zona de recolecci&oacute;n del material de tomate de &aacute;rbol (municipios de La Uni&oacute;n y La Ceja), donde confluyen ambos cultivos. Los anticuerpos gen&eacute;ricos comerciales detectaron altos niveles de potyvirus en las muestras de papa sintom&aacute;ticas SP5-SP9. La muestra SP2 fue positiva pero con bajos niveles de t&iacute;tulo viral. Todas las dem&aacute;s muestras fueron negativas. La detecci&oacute;n con anticuerpos anti-TaLMV fue positiva para plantas de papa sintom&aacute;ticas PS7 y PS8. La detecci&oacute;n de TaLMV mediante RT-PCR fue positiva para las muestras SP1, SP2, SP5 y SP7 (<a href="#fig5">Fig. 5B</a>). Estos resultados apoyan la hip&oacute;tesis de transmisi&oacute;n cruzada de virus entre papa y tomate de &aacute;rbol y reafirman la necesidad de establecer evaluaciones biol&oacute;gicas de patogenicidad cruzada. En el caso que dichas pruebas confirmar&aacute;n los resultados serol&oacute;gicos y moleculares aqu&iacute; encontrados, ser&iacute;a fundamental revisar los sistemas de producci&oacute;n en las zonas productoras de estas solan&aacute;ceas y ajustar sus programas de manejo integrado de enfermedades.</P >     <P   > El control de enfermedades virales en plantas requiere de un manejo diferente respecto a otras patolog&iacute;as. El &eacute;xito en su control radica principalmente en una combinaci&oacute;n de buenas pr&aacute;cticas de manejo y en la disponibilidad de herramientas diagn&oacute;sticas de detecci&oacute;n temprana. Esto &uacute;ltimo requiere un conocimiento apropiado de la biolog&iacute;a del virus. Desafortunadamente, la mayor&iacute;a de los sistemas comerciales de detecci&oacute;n est&aacute;n dise&ntilde;ados para evaluar la infecci&oacute;n por virus de importancia econ&oacute;mica global, dejando a un lado patolog&iacute;as asociadas a cultivos ex&oacute;ticos como tomate de &aacute;rbol. Algunas de las herramientas m&aacute;s eficientes de detecci&oacute;n, como <I>western-blot, dot-blot</I>, ELISA y flujo lateral, requieren de la obtenci&oacute;n de anticuerpos espec&iacute;ficos que, por lo general, son dif&iacute;ciles de lograr. En este trabajo hemos demostrado la viabilidad de utilizar p&eacute;ptidos sint&eacute;ticos para la producci&oacute;n de anticuerpos espec&iacute;ficos. Para el caso de los potyvirus, el dise&ntilde;o del ant&iacute;geno requiere del conocimiento de la secuencia N-terminal de la c&aacute;pside viral. Nuestro procedimiento difiere significativamente de metodolog&iacute;as cl&aacute;sicas que requieren de la purificaci&oacute;n del virus a partir de plantas infectadas, los cuales son bastante laboriosos, costosos y no garantizan la producci&oacute;n de anticuerpos de alta especificidad (Craig <I>et al.</I>, 2004; Khan y Dijkstra, 2006). Por otra parte, hemos demostrado la utilidad de estos anticuerpos en la detecci&oacute;n de variantes de potyvirus espec&iacute;ficas para nuestro pa&iacute;s mediante m&eacute;todos inmunodiagn&oacute;sticos como ELISA y <I>dot-blot</I>. Esto hace viable la implementaci&oacute;n de m&eacute;todos de diagn&oacute;stico <I>in situ </I>de f&aacute;cil utilizaci&oacute;n como las pruebas de flujo lateral, lo cual constituir&iacute;a un aporte importante para el manejo de fitopat&oacute;genos de importancia econ&oacute;mica en Colombia. </P >     <p  >AGRADECIMIENTOS </p >     <P    >Esta investigaci&oacute;n fue financiada por el proyecto COLCIENCIAS C&oacute;digo 1118-40520317 Contrato 408-2007 y por la Universidad Nacional de Colombia, sede Medell&iacute;n a trav&eacute;s del proyecto DIME BICENTENARIO 2008-2009: 20101007745. </P >     <p   >BIBLIOGRAF&Iacute;A </p >     <!-- ref --><P    >&Aacute;LVAREZ J. Caracterizaci&oacute;n serol&oacute;gica y molecular de virus asociados al material de siembra de tomate de &aacute;rbol (<I>Solanum betaceum </I>Bosh) en Colombia &#91; Tesis de Maestr&iacute;a&#93;. Bogot&aacute;: Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia; 2009. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000062&pid=S0120-548X201100020001100001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >&Aacute;LVAREZ J, COTES JM, MAR&Iacute;N M. Detecci&oacute;n de virus asociados al material de siembra de tomate de &aacute;rbol en Colombia. Biotec Sector Agrop y Agroind. 2011;9(1):43-50. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000063&pid=S0120-548X201100020001100002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >AYALA M, GONZ&Aacute;LEZ P, GUTI&Eacute;RREZ P, COTES JM, MAR&Iacute;N M. Caracterizaci&oacute;n serol&oacute;gica y molecular de potyvirus asociados a la virosis del tomate de &aacute;rbol en Antioquia (Colombia). Acta biol Colomb. 2010;15(3):1-37. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000064&pid=S0120-548X201100020001100003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >BERNAL JA, SALDARRIAGA A, ZAPATA JL. Evaluaci&oacute;n de la transmisi&oacute;n del virus del tomate de &aacute;rbol. &#91; Informe final&#93;. CORPOICA-PRONATTA; 1998. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000065&pid=S0120-548X201100020001100004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >BERNAL JA, TAMAYO PJ. Tecnolog&iacute;a para el cultivo del tomate de &aacute;rbol. Manual t&eacute;cnico n.&ordm; 3. Centro de Investigaci&oacute;n La Selva. Corpoica; 2003. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000066&pid=S0120-548X201100020001100005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >BETANCOURTH C, GOYES R, BRAVO DA. Caracterizaci&oacute;n biol&oacute;gica de un virus del tomate de &aacute;rbol (<I>Solanum betaceum </I>Send) en el departamento de Nari&ntilde;o. Fitopatol Colomb. 2003;27:7-10. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000067&pid=S0120-548X201100020001100006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >BLYTHE MJ, FLOWER DR: Benchmarking B cell epitope prediction underperformance of existing methods. Protein Sci. 2005;14:246-248. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000068&pid=S0120-548X201100020001100007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >CRAIG G, STEPHEN W, WYLIE J, JONES M. Diagnosis of plant viral pathogens. Curr Sci india. 2004;86:1604-1607. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000069&pid=S0120-548X201100020001100008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >CRUZ J. Identificaci&oacute;n de virus en <I>Solanum betaceum </I>&#91; Trabajo de grado&#93;. Bogot&aacute;: Facultad de Agronom&iacute;a. Universidad Nacional de Colombia; 2005. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000070&pid=S0120-548X201100020001100009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >CUSPOCA J. Evaluaci&oacute;n de virus de tomate de &aacute;rbol (<I>Solanum betaceum</I>) en plantas indicadoras y su detecci&oacute;n por PCR &#91; Trabajo de grado&#93;. Bogot&aacute;: Facultad de Agronom&iacute;a. Universidad Nacional de Colombia; 2007. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000071&pid=S0120-548X201100020001100010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >EDELHOCH H. Spectroscopic determination of tryptophan and tyrosine in proteins. Biochemistry-US. 1967;6(7):1948-1954. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000072&pid=S0120-548X201100020001100011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >GIL JF. Diagn&oacute;stico y caracterizaci&oacute;n molecular de virus asociados al cultivo de la papa en Colombia, con &eacute;nfasis en el virus mop-top (PMTV, Pomovirus) &#91; Tesis de Maestr&iacute;a&#93;. Medell&iacute;n: Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia; 2010. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000073&pid=S0120-548X201100020001100012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >GIL JF, AYALA ML, MAR&Iacute;N M, GONZ&Aacute;LEZ P. Identificaci&oacute;n de <I>potyvirus </I>en cultivos de tomate de &aacute;rbol (<I>Solanum betaceum </I>cav.) en Antioquia mediante detecci&oacute;n serol&oacute;gica. Rev Polit&eacute;cnica. 2009;5:112-120. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000074&pid=S0120-548X201100020001100013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >HALL TA. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucl Acid S. 1999;41:95-98. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000075&pid=S0120-548X201100020001100014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >HOPP TP, WOODS RK. Predictions of protein antigenic determinants from amino acid sequences. Proc Natl Acad Sci USA. 1981;78(6):3824-3828. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000076&pid=S0120-548X201100020001100015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >HSU YC, YEH TJ, CHANG YC. A new combination of RT-PCR and reverse dot blot hybridization for rapid detection and identification of <I>potyvirus</I>es. J Virol Methods. 2005;128:54-60. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000077&pid=S0120-548X201100020001100016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >JARAMILLO M. An&aacute;lisis serol&oacute;gico y molecular de virus asociados al cultivo de tomate de &aacute;rbol (<I>Solanum betaceum</I>) en Colombia &#91; Tesis de Maestr&iacute;a&#93;. Medell&iacute;n: Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia; 2009. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000078&pid=S0120-548X201100020001100017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >KHAN J, DIJKSTRA J. Handbook of plant virology. Londres: Food Product Press Oxford; 2006. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000079&pid=S0120-548X201100020001100018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >LAEMMLI UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970;227(5259):680-685. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000080&pid=S0120-548X201100020001100019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >MATTHEWS REF. Diagnosis of plant virus diseases. New Zealand: CRC Press; 1993. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000081&pid=S0120-548X201100020001100020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >MINISTERIO DE AGRICULTURA Y DESARROLLO RURAL 2006. Observatorio agrocadenas Colombia. &#91; Citado, diciembre de 2008&#93;; Disponible en: <a href="http://www.agrocadenas.gov.co" target="_blank">http://www.agrocadenas.gov.co</a>. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000082&pid=S0120-548X201100020001100021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >SPRULES T, GREEN N, FEATHERSTONE M, GEHRING K. Nickel-induced oligomerization of proteins containing 10-histidine tags. Biotechniques. 1998;25(1):20-22. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000083&pid=S0120-548X201100020001100022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >TAMAYO PJ. Mosaico del tomate de &aacute;rbol. Ascolfi Inf. 1990;16:54-55. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000084&pid=S0120-548X201100020001100023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >TAMAYO PJ. Enfermedades virales del tomate de &aacute;rbol (<I>Cyphomandra betacea </I>(Cav.) Sendt. en Colombia. Ascolfi Inf. 1996;22:26-29. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000085&pid=S0120-548X201100020001100024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >THOMPSON JD, HIGGINS DG, GIBSON TJ. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Res. 1994;22:4673-4680. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000086&pid=S0120-548X201100020001100025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >URCUQUI-INCHIMA S, HAENNI AL, BERNARDI F. <I>Potyvirus </I>proteins: a wealth of functions. Virus Res. 2001;74:157-175. </P >     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000087&pid=S0120-548X201100020001100026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P    >WEE LJ, SIMARMATA D, KAM YW, NG LF, TONG JC. SVM-based prediction of linear B-cell epitopes using Bayes Feature Extraction. BMC Genomics. 2010;4:S21. </P > </font>     &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000088&pid=S0120-548X201100020001100027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> ]]></body><back>
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