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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Caracterización molecular de introducciones colombianas de caña flecha utilizando la técnica AFLP]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Wild cane (Gynerium sagittatum Aubl.) fiber is used as raw material for to make "hat vueltiao". A molecular characterization using AFLP was carriet out to estimate genetic variability of 25 accessions planted at the University of Cordoba, associated with geographical and morphological traits. Multiple discrimination correspondence analyses of introductions separated four groups, based on craft handling and agronomic attributes desirable. There was little correlation between geographic distance and genetic differentiation, indicating an anthropic flows by asexual reproduction.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  <font face="verdana" size="2">     <p><b>    <center><font face="verdana" size="4">Caracterizaci&oacute;n molecular de introducciones colombianas de caña flecha utilizando la t&eacute;cnica AFLP</font></center></b></p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">Molecular characterization of colombian wild cane accesions with AFLP</font></center></b></p>     <p><b>    <center>Hernando Rivera Jim&eacute;nez,<sup>1</sup> Franco Alirio Vallejo Cabrera,<sup>1</sup> Isidro Su&aacute;rez Padron <sup>2</sup></center></b></p>     <p><sup>1</sup>Facultad de Ciencias Agropecuarias. Universidad Nacional de Colombia. Sede Palmira. A.A 237. Palmira, Valle del Cauca, Colombia.     <br><sup>2</sup>Facultad de Ciencias Agr&iacute;colas. Universidad de C&oacute;rdoba. A.A 354. Monter&iacute;a, C&oacute;rdoba, Colombia. Autor para correspondencia: <a href="mailto:hriveraj@palmira.unal.edu.co">hriveraj@palmira.unal.edu.co</a><a href="mailto:favellejoc@palmira.unal.edu.co">favellejoc@palmira.unal.edu.co </a><a href="mailto:isuarez@sinu.unicordoba.edu.co">isuarez@sinu.unicordoba.edu.co</a> </p>     <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center>REC.: 13-05-08. ACEPT.: 14-11-08</center></p> <hr size="1">     <p><b>RESUMEN</b></p>     <p><b>La fibra de la caña flecha <i>Gynerium sagittatum</i> (Aubl.) se utiliza como materia prima para fabricar el &#34;sombrero vueltiao&#34;, sombrero t&iacute;pico de la costa caribeña colombiana. Se realiz&oacute; la caracterizaci&oacute;n molecular con AFLP para estimar variabilidad gen&eacute;tica teniendo en cuenta criterios geogr&aacute;ficos y morfol&oacute;gicos de 25 introducciones colombianas del banco de germoplasma de la Universidad de C&oacute;rdoba. El an&aacute;lisis de correspondencia m&uacute;ltiple discrimin&oacute; las introducciones en cuatro grupos, donde se identificaron caracter&iacute;sticas de importancia artesanal (comercial) y atributos agron&oacute;micos. Se observ&oacute; escasa correlaci&oacute;n entre distancia geogr&aacute;fica y diferenciaci&oacute;n gen&eacute;tica, lo cual indic&oacute; flujos antr&oacute;picos por la reproducci&oacute;n asexual del material.</b></p>     <p><b>Palabras claves:</b> <i>Gynerium sagittatum</i> (Aubl.); variabilidad gen&eacute;tica; distancia geogr&aacute;fica.</p> <hr size="1">     <p><b>ABSTRACT</b></p>     <p><b>Wild cane (<i>Gynerium sagittatum</i> Aubl.) fiber is used as raw material for to make &#34;hat vueltiao&#34;. A molecular characterization using AFLP was carriet out to estimate genetic variability of 25 accessions planted at the University of Cordoba, associated with geographical and morphological traits. Multiple discrimination correspondence analyses of introductions separated four groups, based on craft handling and agronomic attributes desirable. There was little correlation between geographic distance and genetic differentiation, indicating an anthropic flows by asexual reproduction.</b></p>     <p><b>Key words:</b> <i>Gynerium sagittatum</i> (Aubl.); genetic variability; geographical distance.</p> <hr size="1">     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">INTRODUCCI&Oacute;N</font></center></b></p>     <p>La fibra de caña flecha <i>Gynerium sagittatum</i> (Aubl.), materia prima para la elaboraci&oacute;n de artesan&iacute;as como el sombrero &#34;vueltiao&#34; (Zorro y Prieto, 1999), es nativa del oeste de la India y se distribuye desde el sur de M&eacute;xico hasta Paraguay. En Colombia se distribuye en gran parte de la geograf&iacute;a y se localiza espont&aacute;neamente a lo largo de riberas de los r&iacute;os y zonas de altas precipitaciones (Aram&eacute;ndiz <i>et al</i>., 2005). La acci&oacute;n antr&oacute;pica indiscriminada, la ganader&iacute;a y la agricultura est&aacute;n conduciendo a la destrucci&oacute;n del h&aacute;bitat y a la reducci&oacute;n de la variabilidad gen&eacute;tica.</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>La evaluaci&oacute;n morfo-agron&oacute;mica de la colecci&oacute;n de 25 introducciones de caña flecha de la Universidad de C&oacute;rdoba mostr&oacute; poca variaci&oacute;n en caracteres altamente heredables y adem&aacute;s puede ser dif&iacute;cil de medir la expresi&oacute;n de las caracter&iacute;sticas sujetas a variaci&oacute;n ambiental (Aramendiz <i>et al</i>., 2005).</p>     <p>Como estas limitaciones se pueden superar analizando el polimorfismo del ADN (Karpa <i>et. al</i>., 1997) la investigaci&oacute;n busc&oacute; determinar la variabilidad gen&eacute;tica de la colecci&oacute;n de caña flecha de la Universidad de C&oacute;rdoba mediante la caracterizaci&oacute;n molecular con marcadores AFLP.</p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">MATERIALES Y M&Eacute;TODOS</font></center></b></p>     <p>La investigaci&oacute;n se realiz&oacute; en el Instituto Alexander von Humboldt CIAT utilizando 25 accesiones de caña flecha cultivadas y silvestres, procedentes de diferentes regiones de Colombia.</p>     <p>El tejido foliar sin nervadura central se macer&oacute; con nitr&oacute;geno l&iacute;quido y se almacen&oacute; a -196&deg;C. La extracci&oacute;n de ADN se realiz&oacute; con base en el protocolo QIAGEN-2004 modificado por Rivera <i>et al</i>. (2006) determinando cantidad, concentraci&oacute;n y pureza. El ADN se someti&oacute; a digesti&oacute;n previa con enzimas de restricci&oacute;n, adicionando posteriormente adaptadores a los fragmentos generados. Mediante el uso de PCR y de cebadores complementarios a la secuencia de los adaptadores, se hizo una preamplificaci&oacute;n +1/+1 nucle&oacute;tidos adicionales. Despu&eacute;s se amplificaron fragmentos con selecci&oacute;n de cebadores +3/+3 nucle&oacute;tidos mediante 8 combinaciones de pares de cebadores que generaron loci polim&oacute;rficos (Vos <i>et al</i>., 1995). Los productos de AFLP<sup>TM</sup> se separaron en geles de acrilamida al 6.0 %. Las tinciones de las bandas se realizaron con nitrato de plata y se revelaron en un rango de lectura entre 20 y 330 pb.</p>     <p>La presencia (1) o ausencia (0) de bandas espec&iacute;ficas se transformaron en una matriz binaria. La matriz de similaridad se calcul&oacute; con el paquete estad&iacute;stico GELSTATS y se construy&oacute; el dendrograma para agrupar las diferentes variantes. La diversidad gen&eacute;tica se estim&oacute; con el &iacute;ndice de Dice adaptado para datos moleculares por Nei y Li (1979).</p>     <p>El &iacute;ndice promedio de los valores de similitud, por par de individuos se estim&oacute; mediante la ecuaci&oacute;n: S<sub><i>ij</i></sub> = 2a / (2a+b+c); en la cual S<sub><i>ij</i></sub> es la similitud entre los individuos <i>i</i> y <i>j, a</i> el n&uacute;mero de loci compartidos por <i>i</i> y <i>j, b</i> el n&uacute;mero de loci presentes en <i>i</i> pero ausentes en <i>j</i>, y <i>c</i> el n&uacute;mero de loci presentes en <i>j</i> pero ausentes en <i>i</i>.</p>     <p>Las matrices y los dendrogramas de similitud se calcularon con el programa NTSYS-PC, versi&oacute;n 2.02i mediante el m&eacute;todo UPGMA y el agrupamiento SAHN (Rohlf, 1998), respectivamente. Para el an&aacute;lisis de los datos de AFLP (Besse <i>et al</i>., 1998) se estudiaron las relaciones entre individuos, mediante el an&aacute;lisis de correspondencia m&uacute;ltiple (ACM) con toda la poblaci&oacute;n, para obtener una representaci&oacute;n gr&aacute;fica de la estructura o relaci&oacute;n de parentesco de las introducciones.</p>     <p><b>    ]]></body>
<body><![CDATA[<center><font face="verdana" size="3">RESULTADOS Y DISCUSI&Oacute;N</font></center></b></p>     <p><b>Reacci&oacute;n de Amplificaci&oacute;n de AFLP.</b></p>     <p>La reacci&oacute;n de amplificaci&oacute;n mostr&oacute; que la combinaci&oacute;n de cebadores en los primeros cuatro tratamientos present&oacute; mayor polimorfismo (<a href="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a01t01.gif" target="blank">Tabla 1</a>). Los cebadores (E-ACC/M-CAG) y (E-ACA/M-CAT) presentaron mayor porcentaje de polimorfismo y menor n&uacute;mero de loci totales. Parte de las combinaciones de cebadores utilizados en caña flecha se tomaron de trabajos recientes en caña de az&uacute;car por ser esta especie muy cercana al g&eacute;nero <i>Gynerium</i> (Selvi <i>et al</i>., 2005).</p>     <p><b>Discriminaci&oacute;n de introducciones de caña flecha</b></p>     <p>Con las cuatro combinaciones se obtuvieron 223 loci que variaron desde 43 (E-ACC/M-CAG) hasta 72 (E-ACA/M-CTA), en promedio 55,75 por cebador y 75 fueron polim&oacute;rficos (Tabla 1). La combinaci&oacute;n E-ACC/M-CAG (<a href="#Figura 1">Figura 1 </a>) mostr&oacute; mayor porcentaje de polimorfismo; 17 de los 43 loci fueron polim&oacute;rficos. Con la combinaci&oacute;n E-ACA/M-CAT se obtuvieron 38. 46% de los fragmentos de ADN amplificados y 20 de los 52 loci mostraron polimorfismo.</p>     <p>    <center><a name="Figura 1"><img src="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a02f01.jpg"></a></center></p>     <p>Con las combinaciones E-ACA/M-CTA y E-ACT/M-CAA se obtuvieron polimorfismos de 31.94% y 25.80% (Tabla 1). Cada combinaci&oacute;n present&oacute; perfiles diferentes de loci en la poblaci&oacute;n de introducciones, sugiriendo que con ellas se logr&oacute; el an&aacute;lisis adecuado del genoma e identificar la variabilidad gen&eacute;tica de la especie.</p>     <p><b>An&aacute;lisis de Correspondencia M&uacute;ltiple (ACM)</b></p>     <p>Al unir las matrices de las cuatro combinaciones de cebadores en el ACM bidimensional los individuos tendieron a distribuirse en cuatro grupos (<a href="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a02f02.jpg" target="blank">Figura 2 </a>), similar a la reportada por Aram&eacute;ndiz <i>et al</i>. (2005).</p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p>El segundo (1, 13, 20b, 23, 5, 14, 22, 2, 6, 8, 16 y 15) y el cuarto grupo (24) presentaron fibra de textura suave, pubescencia escasa de la vaina verde y pared gruesa del tallo, as&iacute; mismo se asociaron con el &aacute;rea &uacute;til de la nervadura inferior y di&aacute;metro delgado del tallo. Estas introducciones, que reciben el nombre de &#34;criollas&#34;, fueron recolectadas en los municipios de San Andr&eacute;s de Sotavento, Sahag&uacute;n, Ci&eacute;naga de Oro y Montel&iacute;bano (departamento de C&oacute;rdoba).</p>     <p>Los individuos de los grupos 1 y 3, equivalentes al segundo grupo reportado por Aram&eacute;ndiz <i>et al</i>, (2005), se caracterizaron por textura gruesa, abundante pubescencia en la base de la hoja y vaina, pared delgada del tallo, di&aacute;metro del tallo delgado a ligeramente grueso, &aacute;rea &uacute;til de la nervadura inferior intermedia y &aacute;ngulo agudo de la hoja. La mayor&iacute;a de las introducciones provienen de Tierralta y San Andr&eacute;s de Sotavento (C&oacute;rdoba); Caucasia (Antioquia) y Chinchin&aacute; (Caldas), y se denominan caña flecha, caña brava y martinera, por la textura &aacute;spera no apta para elaborar artesan&iacute;as finas.</p>     <p>Mediante el coeficiente UPGMA (M&eacute;todo de agrupamiento por pares, utilizando el promedio aritm&eacute;tico no ponderado) se formaron cuatro grupos. De acuerdo con la evidencia, la agrupaci&oacute;n de las introducciones de caña flecha se puede deber a la constituci&oacute;n gen&eacute;tica y no a condiciones ambientales o geogr&aacute;ficas. Con los datos de pasaporte no se pudo establecer correlaci&oacute;n entre grupos de introducciones y sitios de colecta. Los agrupamientos parecen obedecer a similitudes de tipo gen&eacute;tico como textura de fibra, pubescencias vainas, color de vaina y grosor de la pared del tallo.</p>     <p>El an&aacute;lisis de conglomerados (SAHN) detect&oacute; alta variabilidad genot&iacute;pica entre las introducciones recolectadas. De acuerdo con el dendrograma se conformaron cuatro grupos gen&eacute;ticos seg&uacute;n las caracter&iacute;sticas morfoagron&oacute;micas (<a href="img/revistas/acag/v57n4/v57n4a02f03.jpg" target="blank">Figura 3 </a>). Los genotipos de caña flecha son producto de la selecci&oacute;n por parte de los productores, y los criterios de selecci&oacute;n se relacionan con formas culturales generalizadas para comunidades espec&iacute;ficas.</p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">CONCLUSIONES</font></center></b></p>     <p>La variaci&oacute;n molecular en caña flecha, detectada por medio de la t&eacute;cnica AFLP, mostr&oacute; cuatro grupos diferenciados por caracter&iacute;sticas artesanales y atributos deseables como textura de fibra, grosor del tallo y &aacute;rea &uacute;til de la nervadura inferior.</p>     <p>El grado de diferenciaci&oacute;n gen&eacute;tica entre las introducciones de <i>G. sagittatum</i> fue alto.</p>     <p>Existi&oacute; poca correlaci&oacute;n entre distancia geogr&aacute;fica y nivel de diferenciaci&oacute;n gen&eacute;tica.</p>     <p>    ]]></body>
<body><![CDATA[<p><b>    <center><font face="verdana" size="3">AGRADECIMIENTOS</font></center></b></p>     <p>El art&iacute;culo se deriv&oacute; de la tesis de Maestr&iacute;a de H. J. Rivera J., que se adelant&oacute; con la cooperaci&oacute;n del laboratorio de Biolog&iacute;a Molecular del Instituto de Investigaci&oacute;n de Recursos Biol&oacute;gicos Alexander von Humboldt de Palmira, Valle del Cauca, Colombia; de las Universidades de C&oacute;rdoba – Monter&iacute;a y Nacional de Colombia Sede Pamira.</p>     <p><b>    <center><font face="verdana" size="3">BIBLIOGRAF&Iacute;A</font></center></b></p>     <!-- ref --><p>1. Aram&eacute;ndiz, H.; Espitia, M.; Robles, J. 2005. Colecci&oacute;n, caracterizaci&oacute;n morfoagron&oacute;mica y producci&oacute;n de semilla de caña flecha <i>Gynerium sagittatum</i> (Aubl.) del caribe colombiano. Monter&iacute;a: Universidad de C&oacute;rdoba. p17-60.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000058&pid=S0120-2812200800040000200001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>2. Besse, P. G.; Taylor, B.; Carroll, N.; Berding, D. B.; McIntyre, C. L. 1998. Assessing genetic diversity in a sugarcane germplasm collection using an automated AFLP analysis. <i>Genetic</i> 104: 143-153.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000059&pid=S0120-2812200800040000200002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>3. Karpa, K.; Bhat, K.V.; Ayad, W.G.; Hodgkin, T. 1997. Molecular Tools in Plant Genetic Resources Conservation: A Guide to the Tecnologies. Rome, Italy: IPGRI. (Technical Bulletin No. 2).&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000060&pid=S0120-2812200800040000200003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>4. Nei, M.; Li, W. H. 1979. Mathematical Model for Studying Genetic Variation in Terms of Restriction Endo Nucleases. <i>Proc Natl Acad Sci</i> (USA) 76(10): 5269-5273.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000061&pid=S0120-2812200800040000200004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>5. Rivera. H. J.; Vallejo. F. C.; Su&aacute;rez. I.; Palacios, J. D. 2006. Estandarizaci&oacute;n de la t&eacute;cnica AFLP para la caracterizaci&oacute;n de accesiones colombianas de caña flecha (<i>Gynerium sagittatum</i> (<i>Aubl.</i>)). <i>En</i>: Congreso de la Asociaci&oacute;n Colombiana de Fitomejoramiento y Producci&oacute;n de Cultivos, 11, Universidad de Nariño, San Juan de Pasto.<a  href=http://www.fitomejoramientocolombia.org/documentos/Trabajos%20aceptados%20y%20horario.doc. target="blank">http://www.fitomejoramientocolombia.org/documentos/Trabajos%20aceptados%20y%20horario.doc.</a> Acceso: 11-12-2007.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000062&pid=S0120-2812200800040000200005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>6. Rohlf, F. J. 1998. NTSYS-PC, Numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 1.60. Aplied Biostatistics, New York.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000063&pid=S0120-2812200800040000200006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>7. Selvi, A.; Nair, N.V.; Noyer, J. L.; Singh, N. K.; Balasundaram, N.; <i>et al</i>., 2005. Genomic Constitution and Genetic Relationship among the Tropical and Subtropical Indian Sugarcane Cultivars Revealed by AFLP. <i>Crop Sci</i> 45: 1750-1757.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000064&pid=S0120-2812200800040000200007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>8. Vos, P.; Hogers, R.; Bleeker, M.; Reijans, M.; Van De Lee, T.; Hornes, M.; Frijters, A.; Pot, J.; Peleman, J.; Kuiper, M.; Zabeau, M. 1995. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. <i>Nucleic Acids Res</i> 23 :4407-4414&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000065&pid=S0120-2812200800040000200008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p>9. Z Zorro, W. A.; Prieto, F. V. 1999. Aproximaci&oacute;n a la problem&aacute;tica econ&oacute;mica productiva de la comunidad ind&iacute;gena Zen&uacute;. Trabajo de Grado (Zootec). Santaf&eacute; de Bogot&aacute;: Universidad Nacional de Colombia. p. 369.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000066&pid=S0120-2812200800040000200009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> ]]></body><back>
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