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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Análisis de polimorfismos en los genes tripanotión reductasa y cruzipaína en cepas colombianas de Trypanosoma cruzi]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Analysis of polymorphisms in the trypanothione reductase and cruzipain genes in Colombian strains of Trypanosoma cruzi]]></article-title>
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<self-uri xlink:href="http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&amp;pid=S0120-41572007000500006&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><self-uri xlink:href="http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_abstract&amp;pid=S0120-41572007000500006&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><self-uri xlink:href="http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_pdf&amp;pid=S0120-41572007000500006&amp;lng=en&amp;nrm=iso"></self-uri><abstract abstract-type="short" xml:lang="es"><p><![CDATA[Introducción. Los estudios genéticos en Trypanosoma cruzi han buscado establecer asociaciones de variantes genéticas del parásito con manifestaciones clínicas de la enfermedad, origen biológico y geográfico de los aislamientos; sin embargo, los resultados de asociación con los marcadores comúnmente usados en estos estudios han generado mucha controversia, principalmente en la asociación de grupos con características clínicas y epidemiológicas de la enfermedad. Objetivo. Se planteó determinar la variabilidad de genes que codifican para las proteínas tripanotión reductasa y cruzipaína, involucradas en mecanismos de infección y supervivencia del parásito en el hospedador mamífero, y probar la asociación de variantes génicas con origen biológico y geográfico de cepas colombianas de T. cruzi. Materiales y métodos. Se tipificaron por reacción en cadena de la polimerasa- polimorfismo de longitud del fragmento de restricción seis SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) en tripanotión reductasa y ocho SNPs en cruzipaína en 36 cepas colombianas de T. cruzi de diferentes regiones y origen biológico. Resultados. Con las enzimas Acy I y Hae III se determinaron tres genotipos para tripanotión reductasa. Para cruzipaína se identificaron seis genotipos con las enzimas Rsa I, Ban I y Bsu 36I. Conclusiones. Para tripanotión reductasa no fue posible establecer una asociación con el origen biológico o geográfico; sin embargo los alelos producidos en las posiciones 102 y 210, permitieron discriminar los grupos tradicionales I y II. Con los genotipos obtenidos para cruzipaína se establecieron relaciones a estos grupos, origen biológico y geográfico. Los resultados sugieren la utilidad de estos genes como marcadores moleculares para determinar y diferenciar variedades genéticas en T. cruzi]]></p></abstract>
<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Introduction. Genetic studies of Trypanosoma cruzi have tried to establish relations between genetic variants and their biological characteristics, such as clinical manifestations, host or geographic origin. However, much controversy exists on the associations between the commonly used DNA markers with group, clinical characteristics and disease epidemiology. Objective. In this study determined the variability of the genes that code for the proteins trypanothione reductase and cruzipain, both involved in the infection and survival of the parasite in the mammalian host, was studied and the association between genetic polymorphism and biological and geographic sources in Colombian T. cruzi strains was examined. Materials and methods. The genotypes for each of six SNPs (single nucleotide polymorphisms) for trypanothione reductase and eight SNPs for cruzipain genes were identified by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism.in 36 T. cruzi Colombian stocks from several regions and biological origins. Results. Three genotypes were identified for trypanothione reductase with Acy I and Hae III enzymes and six genotypes for cruzipain with the Rsa I, Ban I and Bsu 36I enzymes. Conclusions. For trypanothione reductase ,an association was not established with biological or geographical origin; however, alleles at positions 102 and 210 allowed discrimination with groups I and II. For cruzipain, specific genotypes were associated with group, biological and geographic origin. The usefulness of molecular markers on these genes was demonstrated for the determination and differentiation of genetic varieties in T. cruzi.]]></p></abstract>
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<kwd lng="es"><![CDATA[Trypanosoma cruzi]]></kwd>
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</front><body><![CDATA[   <B><FONT FACE="Arial" SIZE=4>    <P ALIGN="CENTER">An&aacute;lisis de polimorfismos en los genes tripanoti&oacute;n reductasa y cruzipa&iacute;na en cepas colombianas de <I>Trypanosoma cruzi</i></P> </font></B><FONT FACE="Arial">    <P ALIGN="CENTER">Winston Rojas <SUP>1</SUP>, Maria Antonieta Caro <SUP>1</SUP>, Juan Guillermo Lopera <SUP>1</SUP>, Omar Triana <SUP>2</SUP>, Juan Carlos Dib <SUP>2</SUP>, Gabriel Bedoya <SUP>1</sup></P>    <P> <SUP>1</sup> Gen&eacute;tica Molecular, Universidad de Antioquia, Medell&iacute;n, Colombia. </P>     <P><SUP>2</sup> Grupo de Chagas, Universidad de Antioquia, Medell&iacute;n, Colombia.</P> </FONT><FONT FACE="Arial" SIZE=3>    <P>Recibido: 20/12/05; aceptado: 07/04/06</P> </FONT><B></B>    <P><FONT FACE="Arial"><B>Introducci&oacute;n. </b></font><FONT FACE="Arial">Los estudios gen&eacute;ticos en <I>Trypanosoma cruzi</I> han buscado establecer asociaciones de variantes gen&eacute;ticas del par&aacute;sito con manifestaciones cl&iacute;nicas de la enfermedad, origen biol&oacute;gico y geogr&aacute;fico de los aislamientos; sin embargo, los resultados de asociaci&oacute;n con los marcadores com&uacute;nmente usados en estos estudios han generado mucha controversia, principalmente en la asociaci&oacute;n de grupos con caracter&iacute;sticas cl&iacute;nicas y epidemiol&oacute;gicas de la enfermedad.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P><B>Objetivo. </b>Se plante&oacute; determinar la variabilidad de genes que codifican para las prote&iacute;nas tripanoti&oacute;n reductasa y cruzipa&iacute;na<I>,</I> involucradas en mecanismos de infecci&oacute;n y supervivencia del par&aacute;sito en el hospedador mam&iacute;fero, y probar la asociaci&oacute;n de variantes g&eacute;nicas con origen biol&oacute;gico y geogr&aacute;fico de cepas colombianas de <I>T. cruzi</I>.</P>     <P><B>Materiales y m&eacute;todos.</b> Se tipificaron por reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa- polimorfismo de longitud del fragmento de restricci&oacute;n seis SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) en tripanoti&oacute;n reductasa y ocho SNPs en cruzipa&iacute;na en 36 cepas colombianas de <I>T. cruzi</I> de diferentes regiones y origen biol&oacute;gico.</P>     <P><B>Resultados.</b> Con las enzimas <I>Acy</I> I y <I>Hae</I> III se determinaron tres genotipos para tripanoti&oacute;n reductasa. Para cruzipa&iacute;na se identificaron seis genotipos con las enzimas <I>Rsa</I> I, <I>Ban</I> I y <I>Bsu</I> 36I.</P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P><B>Conclusiones.</b> Para tripanoti&oacute;n reductasa<I> </I>no fue posible establecer una asociaci&oacute;n con el origen biol&oacute;gico o geogr&aacute;fico; sin embargo los alelos producidos en las posiciones 102 y 210, permitieron discriminar los grupos tradicionales I y II. Con los genotipos obtenidos para cruzipa&iacute;na se establecieron relaciones a estos grupos, origen biol&oacute;gico y geogr&aacute;fico. Los resultados sugieren la utilidad de estos genes como marcadores moleculares para determinar y diferenciar variedades gen&eacute;ticas en <I>T. cruzi</I>.</P>     <P><B>Palabras clave:</b> <I>Trypanosoma cruzi</I>, genes protozoarios, polimorfismo, polimorfismo de longitud del fragmento de restricci&oacute;n, Colombia.</P> <B>    <P>Analysis of polymorphisms in the trypanothione reductase<I> </I>and cruzipain<I> </I>genes in Colombian strains of <I>Trypanosoma cruzi</i></P> </B>    <P><B>Introduction. </b>Genetic studies of <I>Trypanosoma cruzi</I> have tried to establish relations between genetic variants and their biological characteristics, such as clinical manifestations, host or geographic origin. However, much controversy exists on the associations between the commonly used DNA markers with group, clinical characteristics and disease epidemiology. </P>     <P><B>Objective.</b> In this study determined the variability of the genes that code for the proteins trypanothione reductase and cruzipain, both involved in the infection and survival of the parasite in the mammalian host, was studied and the association between genetic polymorphism and biological and geographic sources in Colombian<I> T. cruzi</I> strains was examined.</P>     <P><B>Materials and methods. </b>The genotypes for each of six SNPs (single nucleotide polymorphisms) for trypanothione reductase and eight SNPs for cruzipain genes were identified by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism.in 36 <I>T. cruzi</I> Colombian stocks from several regions and biological origins.</P>     <P><B>Results. </b>Three genotypes were identified for trypanothione reductase with <I>Acy</I> I and <I>Hae</I> III enzymes and six genotypes for cruzipain with the <I>Rsa</I> I, <I>Ban</I> I and <I>Bsu</I> 36I enzymes. </P>     <P><B>Conclusions. </b>For trypanothione reductase ,an association was not established with biological or geographical origin; however, alleles at positions 102 and 210 allowed discrimination with groups I and II. For cruzipain<I>,</I> specific genotypes were associated with group, biological and geographic origin. The usefulness of molecular markers on these genes was demonstrated for the determination and differentiation of genetic varieties in <I>T. cruzi</I>. </P>     <P><B>Key words: </b><I>Trypanosoma cruzi</I>, genes, protozoan polymorphism, restriction fragment length polymorphism; Colombia.</P>     <P><I>Trypanosoma cruzi,</i> el flagelado que causa la enfermedad de Chagas, realiza su ciclo de vida entre reservorios mam&iacute;feros e insectos de la familia <I>Reduviidae</I>. Para este protozoario se ha propuesto un modo de reproducci&oacute;n predominante-mente clonal (1), con lo cual se esperar&iacute;a encontrar una baja diversidad. Sin embargo, al evaluar marcadores fenot&iacute;picos, morfol&oacute;gicos y bioqu&iacute;micos (2), muchos estudios muestran, por el contrario, una alta heterogeneidad. Es razonable pensar que esta diversidad pueda estar influyendo, por lo menos en parte, en el rango variable de las manifestaciones cl&iacute;nicas de la enfermedad (2). Con este planteamiento se han emprendido estudios que buscan asociaciones entre la heterogeneidad gen&eacute;tica del par&aacute;sito y la heterogeneidad cl&iacute;nica de la enfermedad (3-9). </P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P>Con el uso de marcadores de ADN an&oacute;nimos (<I>Random Amplified Polymorphic DNA, RAPD</I>) o en los genes kADN, espaciadores interg&eacute;nicos del gen mini-ex&oacute;n,<I> </I>y en el ADN ribosomal se ha logrado determinar grupos y subgrupos de <I>T. cruzi</I> e incluso establecer un patr&oacute;n regional en relaci&oacute;n con estas divisiones (10-15). Sin embargo, hasta la fecha existe mucha controversia sobre las reales asociaciones entre los grupos y las caracter&iacute;sticas cl&iacute;nicas y epidemiol&oacute;gicas de la enfermedad, puesto que ambos grupos se han encontrado en todos los estados de transmisi&oacute;n, en diversas fases de la enfermedad y en sus diferentes rasgos fenot&iacute;picos (16). Es tambi&eacute;n razonable pensar que, de existir una asociaci&oacute;n, ser&iacute;a &uacute;til estudiar los genes involucrados en procesos como la infecci&oacute;n de la c&eacute;lula hospedera, la supervivencia y la progresi&oacute;n del ciclo de vida del par&aacute;sito, as&iacute; como aquellos &uacute;tiles en evadir la respuesta inmune del hospedero, podr&iacute;an ser un blanco importante. </P>     <P>El genoma de <I>T. cruzi</I> consta de aproximada-mente 22.570 genes, de los cuales casi el 50% conforma grupos par&aacute;logos. Entre ellos se encuentra la cruzipa&iacute;na (<I>Crp),</I> que pertenece a una familia de ciste&iacute;n peptidasas compuesta por 20 miembros por genoma haploide (17). El porcentaje restante corresponde a genes de copia &uacute;nica como la tripanoti&oacute;n reductasa<I> </I>(<I>TriR</I>) (18)<I>.</i></P>     <P>Los tripanosom&aacute;tidos carecen de la enzima glutati&oacute;n peroxidasa y para defenderse del estr&eacute;s oxidativo utilizan el tripanoti&oacute;n reducido en un sistema propio de estos organismos (19). Esta reducci&oacute;n es catalizada por la tripanoti&oacute;n reductasa, una flavoprote&iacute;na dependiente de NADPH, la cual adem&aacute;s participa en el metabolismo y detoxificaci&oacute;n de drogas y en la reducci&oacute;n de precursores para la s&iacute;ntesis de ADN (20,21). En <I>Leishmania spp. </I>este sistema<I> </I>est&aacute; involucrado en la supervivencia intracelular del par&aacute;sito (22). El gen que codifica para esta enzima tambi&eacute;n ha demostrado ser &uacute;til en la determinaci&oacute;n de grupos dentro de <I>T. cruzi</I>, pues ha revelado la existencia de cuatro grupos principales en lugar de las dos divisiones ya conocidas (18).</P>     <P>La cruzipa&iacute;na pertenece a la familia de las ciste&iacute;n proteinasas, y es codificada por un alto n&uacute;mero de genes organizados como grupos localizados en diferentes cromosomas (23,24). Por tener un elevado n&uacute;mero de copias se ha encontrado una variabilidad que va desde la ausencia de diferencias entre las copias (25) hasta formas muy divergentes, como es el caso de la cruzipa&iacute;na 2 (26,27). El dominio C terminal de la cruzipa&iacute;na es responsable del car&aacute;cter inmunodominante antig&eacute;nico de esta prote&iacute;na en infecciones humanas naturales (28), en las que la gran mayor&iacute;a de los anticuerpos detectados en el suero de pacientes chag&aacute;sicos cr&oacute;nicos est&aacute; dirigida contra este dominio (29). La cruzipa&iacute;na y su actividad como proteasa se ha implicado en funciones tan importantes como la supervivencia y la progresi&oacute;n en el ciclo de vida del par&aacute;sito (30,31), la penetraci&oacute;n e invasi&oacute;n del tripomastigote en la c&eacute;lula hospedadora (32-34), la protecci&oacute;n contra la respuesta inmune del hospedero (35) y la diseminaci&oacute;n del par&aacute;sito (2). </P>     <P>El an&aacute;lisis de las secuencias disponibles en las bases de datos para estos dos genes muestra un nivel de polimorfismo que no se ha evaluado en cepas de Colombia. Dada la importancia de estos genes en el ciclo de vida del par&aacute;sito se propuso examinar la variabilidad gen&eacute;tica de tripanoti&oacute;n reductasa<I> (TriR)</I> y cruzipa&iacute;na<I> (Crp</I>) en relaci&oacute;n con el origen geogr&aacute;fico y biol&oacute;gico en cepas de <I>T. cruzi</I> de Colombia. Conociendo la variabilidad de estos genes en cepas que circulan en nuestro pa&iacute;s, se podr&aacute; en el futuro proponer estudios de asociaci&oacute;n entre esta variabilidad y la enfermedad.</P> <B>    <P>Materiales y m&eacute;todos</P> </B></FONT>    <P><FONT FACE="Arial">Se analizaron 36 cepas colombianas de <I>T. cruzi</I> y 7 clones de la cepa Cas15, provenientes de diferentes hospederos, vectores y regiones de Colombia (</font><A HREF="#cuadro1">cuadro 1</A><FONT FACE="Arial">). Se incluyeron las cepas de referencia Tulahuen y CL clasificadas como <I>T. cruzi</I> II. Todas las cepas y los clones provinieron del banco de cepas del Laboratorio de Chagas de la Universidad de Antioquia, donde son mantenidas en medio de cultivo LIT suplementado con suero bovino fetal a 27,5°C (36). El ADN del par&aacute;sito se obtuvo por el m&eacute;todo <I>salting out </I>(37) y su concentraci&oacute;n se midi&oacute; por densidad &oacute;ptica a 260 nm (38). El ADN se disolvi&oacute; en 50 µl de H2O dd y se almacen&oacute; a -20°C para su posterior genotipificaci&oacute;n.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P><A NAME="cuadro1"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06t1.gif"></P>     <P><FONT FACE="Arial">El dise&ntilde;o experimental incluyo un an&aacute;lisis de las secuencias disponibles en www.ncbi.nlm.nih.gov y www.tigr.org. Para <I>TriR</I> se usaron 41 secuencias de ADN (</FONT><A HREF="#cuadro2">cuadro 2</A><FONT FACE="Arial">) y para <I>Crp,</I> 10 secuencias (nueve de <I>Crp</I>1 y una de <I>Crp</I>2, </FONT><A HREF="#cuadro3">cuadro 3</A><FONT FACE="Arial">), las cuales fueron alineadas usando el algoritmo Clustal W (39). Para <I>Crp</I>2 se cuenta con mayor n&uacute;mero de caracteres y por ello se us&oacute; como referencia para el alineamiento. La identificaci&oacute;n de sitios polim&oacute;rficos y su posible discriminaci&oacute;n en ensayos de reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa-polimorfismos de longitud de fragmentos de restricci&oacute;n (<I>polymerase chain reaction-restriction fragment lenght polymorphisms, PCR-RFLP</I>) se realiz&oacute; usando los programas pDRAW32 (www.acaclone.com), DAMBE (39) y DnaSP (40). Con las secuencias disponibles se dise&ntilde;aron los cebadores para el fragmento de <I>TriR</I> (TriR directo: 5´agtgttactttcgagagcg3´; Trir inverso: 5´GTAGAAGTCGGATATTTTGG3´), los cuales amplifican una regi&oacute;n de 564 pb, correspondiente a las posiciones 726 a 1.290 de la secuencia AF359000, pero numeradas en el </FONT><A HREF="#cuadro2">cuadro 2</A><FONT FACE="Arial"> como posiciones 1 a 564 seg&uacute;n el fragmento amplificado, y para el fragmento del gen <I>Crp</I> (Crp directo: 5´gttgagtgccagtggtttc3´; Crp reverso: 5´TGGTCAGGAGACACTGACC3´), los cuales producen un fragmento de 700 pb correspondiente a las posiciones 1.346 a 2.046 de la secuencia M90067 (</FONT><A HREF="#cuadro3">cuadro 3</A><FONT FACE="Arial">).</font></P><FONT FACE="Arial">     ]]></body>
<body><![CDATA[<P><A NAME="cuadro2"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06t2.gif"></P>     <P><A NAME="cuadro3"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06t3.gif"></P>     <P><FONT FACE="Arial">Las reacciones de amplificaci&oacute;n se realizaron en un volumen de 25 µL (Tris-HCl 10mM, pH 8.0, KCl 50mM, MgCL2 2.4 mM, dNTP 0.1mM, 0.1 µM de cada cebador, 1 U Taq ADN polimerasa Promega&reg; y 50 ng de ADN molde). El perfil t&eacute;rmico para ambos marcadores fue de un minuto de desnaturalizaci&oacute;n a 94°C, un minuto de alinea-miento a 54°C para <I>Crp</I> y 56°C para <I>TriR</I> y extensi&oacute;n del cebador por un minuto a 72°C, para un total de 35 ciclos para <I>Crp</I> y 30 ciclos para <I>TriR.</I> Las reacciones de amplificaci&oacute;n se observaron en electroforesis en geles de agarosa al 1,5% seguida de tinci&oacute;n con bromuro de etidio.</font></P>    <P> <FONT FACE="Arial">Los fragmentos amplificados incluyen regiones polim&oacute;rficas que pueden ser resueltas con las enzimas mostradas en las </font><A HREF="#cuadro2">cuadros 2</A><FONT FACE="Arial"> y </FONT><A HREF="#cuadro3">cuadro 3</A><FONT FACE="Arial">. Para cruzipa&iacute;na, las enzimas <I>Rsa</I> I, <I>Bsu</I> 36I y <I>Ban</I> I permiten la diferenciaci&oacute;n de polimorfismos en tercera posici&oacute;n, mientras que <I>Dra</I> III permite la identificaci&oacute;n de una transici&oacute;n A:G en la posici&oacute;n 457, la cual da lugar a un cambio de alanina por serina. Ambas formas de la cruzipa&iacute;na poseen los tres sitios de corte identificados para la enzima <I>Rsa</I> I.<I> </I>Sin embargo, a diferencia de la <I>Crp</I>1, la <I>Crp</I>2 carece de diana de corte en la posici&oacute;n 142 para la enzima <I>Ban</I> I (</FONT><A HREF="#cuadro3">cuadro 3</A><FONT FACE="Arial">). Las enzimas <I>Bsu</I> 36I y <I>Dra</I> III carecen de sitios de corte en esta isoforma (</FONT><A HREF="#cuadro3">cuadro 3).</A><FONT FACE="Arial"> Las enzimas utilizadas en el an&aacute;lisis de RFLP de tripanoti&oacute;n reductasa -<I> Acy</I> I, <I>Hae</I> III y <I>Bsm</I> AI - s&oacute;lo identifican polimorfismos en la tercera posici&oacute;n.</font></P>    <P> <FONT FACE="Arial">Para verificar la presencia de ambas formas de la cruzipaina se us&oacute; la enzima <I>Apa</I> I seg&uacute;n el protocolo descrito por Lima <I>et al</I>, 1994 (26); cruzipa&iacute;na<I> 2 </I>cuenta con un sitio de corte en la posici&oacute;n 298, distinguiendo el sitio variante 297 (</font><A HREF="#cuadro3">cuadro 3</A><FONT FACE="Arial">) y generando fragmentos de 297 y 403 pb.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P>Los productos de amplificaci&oacute;n se sometieron a digestiones simples a un volumen final de 20 µl con 1 U de enzima a 37°C por 16 horas. Una al&iacute;cuota de 12 µL se analiz&oacute; en geles de agarosa al 3% te&ntilde;idos con bromuro de etidio. El resultado de la digesti&oacute;n fue registrado en un analizador de im&aacute;genes Gel Doc (BioRad, USA). Los patrones de bandas obtenidos fueron analizados con el <I>software</I> Imagej 1.33 (http://rsb.info.nih.gov/ij) y Quantity One (BioRad, USA). Para cada cepa y para cada gen se definieron los genotipos de acuerdo con los patrones observados en los electroferogramas.</P> <B>    <P>Resultados</P> </B></FONT>    <P><FONT FACE="Arial">Los productos de amplificaci&oacute;n obtenidos en los ensayos de PCR para <I>TrR</I> y <I>Crp</I> se muestran en la </font><A HREF="#figura1">figura 1</A><FONT FACE="Arial">. Algunos de los perfiles de las digestio-nes simples se muestran en las </FONT><A HREF="#figura2">figuras 2</A><FONT FACE="Arial"> ,</FONT><A HREF="#figura4">figuras 4</A><FONT FACE="Arial">,</FONT><A HREF="#figura5">figuras 5</A><FONT FACE="Arial">,</FONT><A HREF="#figura6">figuras 6</A><FONT FACE="Arial"> .</font></P><FONT FACE="Arial">     ]]></body>
<body><![CDATA[<P><A NAME="figura1"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06i1.jpg"></P>     <P><A NAME="figura2"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06i2.jpg"></P>     <P><FONT FACE="Arial">Los resultados de las digestiones se representan como genotipos compuestos de las digestiones simples. De seis sitios evaluados para <I>TriR,</I> s&oacute;lo dos mostraron polimorfismo. S&oacute;lo la combinaci&oacute;n de los genotipos obtenidos para las enzimas <I>Hae</I> III y <I>Acy</I> I muestran patrones polim&oacute;rficos, denominados <I>TriR</I> 1, 2 y 3 (</FONT><A HREF="#cudro4">cuadro 4</A><FONT FACE="Arial">). El genotipo <I>TriR</I> 3 puede definirse con certeza debido a que el corte s&oacute;lo se presenta ante la presencia de los alelos C y G para los sitios <I>Acy </I>I-102 y <I>Hae </I>III-210, respectivamente; este genotipo, presente en 35 de 38 cepas, se encuentra en las cepas caracterizadas como <I>T. cruzi</I> I, en las cuales es definido por la ausencia del alelo T en ambas posiciones (</FONT><A HREF="#cuadro4">cuadro 4</A><FONT FACE="Arial">). El genotipo <I>TriR</I> 1, heterocig&oacute;tico para ambas posiciones, se encontr&oacute; en las dos cepas de referencia, de acuerdo con lo reportado en las bases de datos (</FONT><A HREF="#cuadro2">cuadro 2</A><FONT FACE="Arial">, identificaciones de acceso: AF358997 y AF359002 para Tulahuen y AF358999 y AF358998 para CL), mientras que el genotipo <I>TriR</I> 2 se encontr&oacute; en la cepa AF1 proveniente de Amalfi, Antioquia (</FONT><A HREF="#cuadro4">cuadro 4</A><FONT FACE="Arial">). Para estos dos genotipos se infiere el alelo T en ambas posiciones debido a que es el polimorfismo alternativo presente en las secuencias analizadas y a que no se reporta otro sitio polim&oacute;rfico alrededor de la diana de reconocimiento de la enzima. La distribuci&oacute;n de estos genotipos no mostr&oacute; ninguna asociaci&oacute;n con origen geogr&aacute;fico o biol&oacute;gico (datos no mostrados).</font></P><FONT FACE="Arial">     <P><A NAME="cuadro4"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06t4.gif"></P>     <P><FONT FACE="Arial">En los ensayos de digesti&oacute;n para <I>Crp,</I> la enzima <I>Apa</I> I permiti&oacute; identificar la cruzipa&iacute;na 2 diferenciada por el polimorfismo en la posici&oacute;n 297 (</FONT><A HREF="#figura3">figura 3</A><FONT FACE="Arial">). La presencia de por lo menos dos copias resulta en patrones de digesti&oacute;n complejos, en los que es posible obtener m&aacute;s de dos alelos para cada posici&oacute;n; para facilitar el an&aacute;lisis, denominamos como genotipo "heterocigoto" a aquel que pose&iacute;a m&aacute;s de un alelo en un locus, lo cual puede corresponder a diferencias entre copias de <I>Crp</I> o a una condici&oacute;n heterocig&oacute;tica en sentido estricto.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P><A NAME="figura3"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06i3.jpg"></P>     ]]></body>
<body><![CDATA[<P><A NAME="figura4"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06i4.jpg"></P>     <P><A NAME="figura5"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06i5.jpg"></P>     <P><A NAME="figura6"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06i6.jpg"></P>      <P><FONT FACE="Arial">Basados en las secuencias reportadas para <I>Crp</I>, los sitios 150 a 153 representan una diana de reconocimiento para la enzima <I>Rsa</I> I con corte en la posici&oacute;n 151 (</FONT><A HREF="#cuadro3">cuadro 3</A><FONT FACE="Arial">); estos sitios se reportan monom&oacute;rficos en todas las secuencias (datos no mostrados), pero en algunas cepas analizadas en este estudio dicha diana se perdi&oacute; originando genotipos heterocigotos; sus alelos se representan como 1/0 debido a que no se puede comprobar cu&aacute;l es el sitio polim&oacute;rfico dentro de la diana de reconocimiento de la enzima (</FONT><A HREF="#cuadro5">cuadro 5</A><FONT FACE="Arial">). Los alelos <I>Ban </I>I-C y <I>Rsa</I> I-C en las posiciones 231 y 432, respectivamente, se definen con certeza porque la enzima s&oacute;lo corta cuando &eacute;stos est&aacute;n presentes. Los alelos <I>Ban</I> I-T, <I>Bsu</I> 36I-G y <I>Rsa</I> I-T en las posiciones 231, 258 y 432 se infieren debido a que es el polimorfismo alternativo reportado en las secuencias analizadas y a que no se reporta otro polimorfismo alrededor de la diana de reconocimiento para cada enzima. Los sitios evaluados con la enzima <I>Dra</I> III fueron monom&oacute;rficos y por esto no se consideran en los genotipos compuestos.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P><A NAME="cuadro5"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06t5.gif"></P>     <P><FONT FACE="Arial">A diferencia de <I>TriR,</I> y probablemente por la presencia de m&aacute;s de una copia, para <I>Crp</I> se obtuvieron seis genotipos compuestos represen-tados como <I>Crp</I> 1 a <I>Crp</I> 6 (</FONT><A HREF="#cuadro5">cuadro 5</A><FONT FACE="Arial">). El genotipo <I>Crp</I> 5, homocig&oacute;tico para todos los loci, agrupa 26 cepas clasificadas como <I>T. cruzi</I> I (</FONT><A HREF="#cuadro5">cuadro 5</A><FONT FACE="Arial">). El genotipo <I>Crp</I> 1 se encontr&oacute; en las cepas del grupo <I>T. cruzi</I> II y es diferenciado por la presencia del alelo T en la posici&oacute;n 258 (</FONT><A HREF="#cuadro5">cuadro 5</A><FONT FACE="Arial">). &Eacute;ste y el genotipo <I>Crp </I>3 son los m&aacute;s polim&oacute;rficos; los genotipos <I>Crp</I> 2, <I>Crp</I> 4 y <I>Crp</I> 6 mostraron polimorfismo en la diana alrededor del sitio 151; adicionalmente, <I>Crp</I> 2 vari&oacute; en la posici&oacute;n 432, y <I>Crp</I> 4 y <I>Crp</I> 6 variaron en la posici&oacute;n 231 (</FONT><A HREF="#cuadro5">cuadro 5</A><FONT FACE="Arial">).</font></P>    ]]></body>
<body><![CDATA[<P> <FONT FACE="Arial">Para <I>Crp</I> fue posible establecer algunas asociacio-nes entre los genotipos y el origen geogr&aacute;fico y biol&oacute;gico de las cepas (</font><A HREF="#cuadro6">cuadro 6</A><FONT FACE="Arial">). Cuando se consider&oacute; el origen geogr&aacute;fico, la regi&oacute;n del oriente (departamento de Casanare) mostr&oacute; ser m&aacute;s diversa, con cuatro de los seis genotipos; dos de ellos, <I>Crp</I> 3 y <I>Crp</I> 6, son espec&iacute;ficos de esta regi&oacute;n y son diferenciados por el alelo T en el sitio 231. El genotipo <I>Crp</I> 2 se encuentra en el noroccidente (Sucre, Magdalena, Sierra Nevada) y oriente de Colombia (Casanare); este genotipo tambi&eacute;n se encontr&oacute; en aislamientos de <I>Rhodnius prolixus</I>, <I>Pastrongylus</I> <I>geniculatus</I> y <I>Eratyrus cuspidatus</I>; entre los hospedadores mam&iacute;feros este genotipo s&oacute;lo se encontr&oacute; en <I>Didelphis marsupialis</I> (</FONT><A HREF="#cuadro6">cuadro 6</A><FONT FACE="Arial">). El genotipo <I>Crp</I> 4 tiene una distribuci&oacute;n similar al genotipo <I>Crp</I> 2, pero est&aacute; ausente en la Sierra Nevada de Santa Marta; este genotipo est&aacute; asociado a <I>R. prolixus</I> y <I>Triatoma dimidiata</I>, principales vectores domiciliados.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P><A NAME="cuadro6"></A></P> </FONT>    <P ALIGN="CENTER"><IMG SRC="/img/revistas/bio/v27s1/1sa06t6.gif"></P>     <P><FONT FACE="Arial">El genotipo <I>Crp </I>5 fue el m&aacute;s frecuente; se present&oacute; en todas las regiones del occidente de la cordillera oriental, en la totalidad de los hospederos mam&iacute;feros y en la mayor&iacute;a de los insectos vectores, a excepci&oacute;n de <I>E. cuspidatus; </I>es el &uacute;nico genotipo encontrado en los 10 aislamientos de <I>Rhodnius pallescens. </I>En <I>R. prolixus</I> se encontr&oacute; el mayor n&uacute;mero de genotipos (<I>Crp </I>2, <I>Crp </I>4, <I>Crp </I>5 y <I>Crp </I>6).</font></P><FONT FACE="Arial"> <B>    <P>Discusi&oacute;n </P> </B></FONT>    <P><FONT FACE="Arial">La evaluaci&oacute;n de <I>TriR</I> con las enzimas <I>Acy</I> I y <I>Hae</I> III permiti&oacute; distinguir cepas de los grupos previamente descritos con otros marcadores moleculares. Las cepas del grupo <I>T. cruzi</I> I evaluadas en este estudio mostraron en las posiciones 102 y 211 ausencia del alelo T (</font><A HREF="#cuadro4">cuadro 4</A><FONT FACE="Arial">). Al considerar las secuencias reportadas, el alelo T en la posici&oacute;n 102 est&aacute; ausente de todas las cepas del grupo I, como tambi&eacute;n en algunas del grupo II; el alelo T en la posici&oacute;n 211 fue consistente con las cepas del grupo <I>T. cruzi</I> II en nuestros ensayos; sin embargo, los datos de secuencias muestran que este alelo tambi&eacute;n puede estar presente en cepas de <I>T. cruzi</I> I (</FONT><A HREF="#cuadro2">cuadro 2</A><FONT FACE="Arial">), por lo que no puede consider&aacute;rsele un alelo espec&iacute;fico de grupo.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P>El gen<I> TriR</I> es codificado por un locus &uacute;nico en el genoma de <I>T. cruzi</I> (18) y la condici&oacute;n heterocig&oacute;tica observada en el genotipo compuesto <I>TriR</I> 1 (C/T y G/T) podr&iacute;a reflejar cualquiera de varias situaciones: una combinaci&oacute;n de clones en la cepa (41-43), o una heterocigosis "real" causada por mutaci&oacute;n o intercambio gen&eacute;tico dentro del grupo <I>T. cruzi</I> II (18,44-47). Si se considera la naturaleza heterog&eacute;nea de los aislamientos originales de cepas de <I>T. cruzi </I>(42), ello podr&iacute;a argumentarse a favor de la primera situaci&oacute;n. Sin embargo, no es posible descartar que los genotipos heterocigotos encontrados representen eventos antiguos de intercambio g&eacute;nico (18,44-47), en particular en el sitio 210, el cual puede ser producto de intercambio entre genotipos homocigotos.</P>     <P>La evaluaci&oacute;n del gen <I>TriR</I> en cepas de Colombia mostr&oacute; en nuestro an&aacute;lisis una baja diversidad de genotipos. El c&aacute;lculo del polimorfismo (q) y diversidad nucleot&iacute;dica (p) a partir de las secuencias reportadas para este gen fue de 0,0083+/-0,00186 y 0,011+/-0,00062, respectiva-mente. Una relaci&oacute;n de menor polimorfismo con una mayor diversidad permite suponer que se trata de un gen sujeto a selecci&oacute;n, o que efectivamente existe una estructura clonal en las cepas de Colombia; sin embargo, esta afirmaci&oacute;n requerir&iacute;a de confirmaci&oacute;n, dado que los rangos de estos valores se superponen. Esta afirmaci&oacute;n puede contradecirse si se considera que el polimorfismo en dichas secuencias se localiza en terceras posiciones del cod&oacute;n, dando lugar a cambios neutros. La tripanoti&oacute;n reductasa cumple una funci&oacute;n en la detoxificaci&oacute;n de productos end&oacute;genos y ex&oacute;genos en el ciclo de vida del par&aacute;sito y nuestros resultados no muestran una asociaci&oacute;n con origen biol&oacute;gico; ello sugiere que, de estar sujeta a selecci&oacute;n, su fuerza no ha operado diferencialmente entre los distintos or&iacute;genes biol&oacute;gicos y geogr&aacute;ficos de donde proceden las cepas. Por este bajo polimorfismo, esta prote&iacute;na podr&iacute;a constituirse en un blanco adecuado para dise&ntilde;os terap&eacute;uticos (48,49).</P>     <P>La presencia de por lo menos dos formas de <I>Crp</I> hace m&aacute;s complejo el an&aacute;lisis tanto de los genotipos como de su asociaci&oacute;n con or&iacute;genes geogr&aacute;ficos y biol&oacute;gicos. El mayor polimorfismo de este gen (cuatro sitios polim&oacute;rficos de ocho sitios evaluados, excluido el sitio <I>Apa</I> I) dio lugar a seis genotipos, en contraste con tres genotipos para <I>TriR,</I> lo cual concuerda con la presencia de m&aacute;s de una copia del gen. Desde este punto de vista, muchas cepas (genotipo <I>Crp</I> 5) podr&iacute;an representar eventos de concertaci&oacute;n g&eacute;nica (50-52) en los que los loci de ambas copias son homocig&oacute;ticos; pero esto requiere asumir hip&oacute;tesis <I>ad hoc</I> de mutaci&oacute;n para los mismos loci en otras cepas (genotipos <I>Crp </I>1 a 4).</P>     <P>Algunos estudios previos con cepas de Colombia han podido establecer relaciones entre genotipos de <I>T. cruzi</I> con ciclos de transmisi&oacute;n (53,54). En este estudio no fue posible establecer relaciones entre genotipos <I>TriR</I> y <I>Crp</I> y ciclos de transmisi&oacute;n, debido a que no se evaluaron cepas aisladas de vectores domiciliados; las cepas SN se obtuvieron de <I>R. prolixus</I> al interior de las viviendas, pero su ubicaci&oacute;n dentro de un nicho selv&aacute;tico en la Sierra Nevada de Santa Marta podr&iacute;a introducir errores en dichas comparaciones. Sin embargo, se pudo evaluar la relaci&oacute;n entre genotipos y el origen geogr&aacute;fico y biol&oacute;gico de las cepas, en particular con las especies de vectores.</P> </FONT>    ]]></body>
<body><![CDATA[<P><FONT FACE="Arial">En cuanto a <I>Crp</I>, se puede concluir que el departamento del Casanare es la regi&oacute;n con m&aacute;s diversidad de genotipos (</font><A HREF="#cuadro6">cuadro 6</A><FONT FACE="Arial">). De acuerdo con esto, en estudios previos (53,55) se determin&oacute; que la regi&oacute;n de los Llanos Orientales exhibi&oacute; un alto n&uacute;mero de fenotipos isoenzim&aacute;ticos. Dada la alta prevalencia de la enfermedad en esta regi&oacute;n (IV Reuni&oacute;n de la Comisi&oacute;n Intergubernamental de la Iniciativa Andina de Control de la Transmisi&oacute;n Vectorial y Transfusional de Chagas. Guayaquil, 2003;56,57), valdr&iacute;a la pena formular hip&oacute;tesis sobre la diversidad de <I>T. cruzi</I> en relaci&oacute;n con la eficacia biol&oacute;gica (58) y con la epidemiolog&iacute;a de la enfermedad.</font></P><FONT FACE="Arial">     <P>En cuanto a las asociaciones con los vectores, tambi&eacute;n se puede concluir que en <I>R. pallescens</I>, el vector/hospedero de donde proviene el mayor n&uacute;mero de cepas en este estudio, se encontr&oacute; exclusivamente el genotipo compuesto<I> Crp 5</I>; vale la pena evaluar tambi&eacute;n una hip&oacute;tesis de especificad par&aacute;sito-vector ampliando los marcadores en aislamientos de este vector. En contraste, en las dem&aacute;s especies de vectores se encontr&oacute; m&aacute;s de un genotipo; en <I>R. prolixus</I>, principal vector de la enfermedad de Chagas en el pa&iacute;s, se encontr&oacute; el mayor n&uacute;mero de genotipos; &eacute;ste es un insecto ampliamente distribuido en regiones distantes de Colombia; la importancia de este aspecto tambi&eacute;n puede evaluarse en relaci&oacute;n con sus implicaciones por sus h&aacute;bitos antropof&iacute;licos y su domiciliaci&oacute;n. Las cepas provenientes de <I>P. geniculatus</I>, aunque con una distribuci&oacute;n m&aacute;s restringida, tambi&eacute;n mostraron tres de seis genotipos; esta diferencia en la diversidad genot&iacute;pica entre especies podr&iacute;a reflejar el efecto de filtros biol&oacute;gicos selectivamente diferentes (59,60).</P>     <P>Usando marcadores de isoenzimas, RAPDs y ADNr, se ha podido demostrar la mayor prevalencia del grupo <I>T. cruzi</I> I en el pa&iacute;s (53-55,61). Con dos sistemas diferentes en genes codificadores de prote&iacute;nas tambi&eacute;n fue posible en este estudio reproducir esta observaci&oacute;n, agrup&aacute;ndose la mayor&iacute;a de cepas del grupo I dentro de los genotipos <I>TriR </I>3 y <I>Crp </I>5; esta consistencia de agrupaci&oacute;n con diferentes sistemas refuerza as&iacute; la estructura clonal de las poblaciones de <I>T. cruzi</I>.</P>     <P>Los resultados de este estudio sugieren que estos genes son &uacute;tiles como posibles marcadores moleculares para determinar y diferenciar variedades gen&eacute;ticas en <I>T. cruzi,</I> y permiten plantear la futura evaluaci&oacute;n de la hip&oacute;tesis sobre la interacci&oacute;n par&aacute;sito-hospedero.</P> <B>    <P>Conflicto de intereses</P> </B>    <P>Los autores declaramos que no existe ning&uacute;n conflicto de intereses. </P> <B>    <P>Financiaci&oacute;n</P> </B>    <P>El estudio fue desarrollado como parte del proyecto 1115-04-14387 financiado por Conciencias.</P>     <P>Correspondencia:</BR>     <BR>Winston Rojas, Calle 62 # 52-59, Sede de Investigaci&oacute;n Universitaria (SIU), 4 piso- 430, Medell&iacute;n, Colombia. Tel. (4) 2106464, fax: (4) 210 64 69.     ]]></body>
<body><![CDATA[<BR><A HREF="mailto:winstonrojas@yahoo.com"><FONT FACE="Arial">winstonrojas@yahoo.com</FONT></A></P> <B><FONT FACE="Arial">     <P>Referencias</P> </font></B><FONT FACE="Arial">    <!-- ref --><P>1. <B>Tibayrenc M, Kjellberg F, Ayala FJ.</B> A clonal theory of parasitic protozoa: the population structures of <I>Entamoeba, Giardia, Leishmania, Naegleria, Plasmodium, Trichomonas </I>and <I>Trypanosoma </I>and their medical and taxonomical consequences. Proc Natl Acad Sci USA 1990;87:2414-8. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000085&pid=S0120-4157200700050000600001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>2. <B>Scharfstein J, Morrot A.</B> A role for extracellular amastigotes in the immunopathology of Chagas disease. Mem Inst Oswaldo Cruz 1999;94(Suppl 1):51-63.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000086&pid=S0120-4157200700050000600002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>3. <B>Brener Z.</B> Biology of <I>Trypanosoma cruzi</I>. Annu Rev Microbiol 1973;27:347-82.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000087&pid=S0120-4157200700050000600003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>4. <B>Melo RC, Brener Z.</B> Tissue tropism of different <I>Trypanosoma cruzi</I> strains. 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Mem Inst Oswaldo<I> Cruz</I> 1987;82:209-18. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000091&pid=S0120-4157200700050000600007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>8. <B>Neal RA, van Bueren J.</B> Comparative studies of drug susceptibility of five strains of <I>Trypanosoma cruzi</I> <I>in vivo</I> and <I>in vitro</I>. Trans R Soc Trop Med Hyg 1988;82:709-14. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000092&pid=S0120-4157200700050000600008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>9. <B>Vago AR, Andrade LO, Leite AA, d’Avila Reis D, Macedo AM, Adad SJ, <I>et</I> <I>al</I>.</B> Genetic characterization of <I>Trypanosoma cruzi</I> directly from tissues of patients with chronic Chagas disease: differential distribution of genetic types into diverse organs. Am J Pathol 2000;156:1805-9.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000093&pid=S0120-4157200700050000600009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>10.<B> Morel C, Chiari E, Camargo EP, Mattei DM, Romanha AJ, Simpson L.</B> Strains and clones of <I>Trypanosoma cruzi</I> can be characterized by pattern of restriction endonuclease products of kinetoplast DNA minicircles. Proc Natl Acad Sci USA 1980;77:6810-4.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000094&pid=S0120-4157200700050000600010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>11. <B>Souto RP, Zingales B.</B> Sensitive detection and strain classification of <I>Trypanosoma cruzi</I> by amplification of a ribosomal RNA sequence. Mol Biochem Parasitol 1993;62:45-52.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000095&pid=S0120-4157200700050000600011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>12. <B>Tibayrenc M, Neubauer K, Barnabe C, Guerrini F, Skarecky D, Ayala FJ. </B>Genetic characterization of six parasitic protozoa: parity between random-primer DNA typing and multilocus enzyme electrophoresis. Proc Natl Acad Sci USA 1993; 90:1335-9.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000096&pid=S0120-4157200700050000600012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>13. <B>Souto RP, Fernandes O, Macedo AM, Campbell DA, Zingales B.</B> DNA markers define two major phylogenetic lineages of <I>Trypanosoma cruzi</I>. Mol Biochem Parasitol 1996;83:141-52.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000097&pid=S0120-4157200700050000600013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>14. <B>Momen H.</B> Taxonomy of <I>Trypanosoma cruzi</I>: a commentary on characterization and nomenclature. Mem Inst Oswaldo Cruz 1999;94(Suppl. 1):181-4.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000098&pid=S0120-4157200700050000600014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>15. <B>Brisse S, Dujardin JC, Tibayrenc M. </B>Identification of six <I>Trypanosoma cruzi </I>lineages by sequence-characterized amplified region markers. Mol Biochem Parasitol 2000;111:95-105.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000099&pid=S0120-4157200700050000600015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>16. <B>Brisse S, Barnab&eacute; C, Tibayrenc M.</B> <I>Trypanosoma cruzi</I>: How many relevant phylogenetic subdivisions are there? Parasitol Today 1998;14:178-9.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000100&pid=S0120-4157200700050000600016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>17. <B>El-Sayed NM, Myler PJ, Bartholomeu DC, Nilsson D, Aggarwal G, Tran A, <I>et al</I>.</B> The genome sequence of <I>Trypanosoma cruzi</I>, etiologic agent of Chagas disease. Science 2005;309:409-15.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000101&pid=S0120-4157200700050000600017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>18. <B>Machado CA, Ayala FJ.</B> Nucleotide sequences provide evidence of genetic exchange among distantly related lineages of<I> Trypanosoma cruzi</I>. Proc Natl Acad Sci USA 2001;98:7396-401.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000102&pid=S0120-4157200700050000600018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>19.<B> Krieger S, Schwarz W, Ariyanayagam MR, Fairlamb AH, Krauth-Siegel RL, Clayton C.</B> Trypanosomes lacking trypanothione reductase are avirulent and show increased sensitivity to oxidative stress. Mol Microbiol 2000;35:542-52. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000103&pid=S0120-4157200700050000600019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>20. <B>Schmidt A, Krauth-Siegel RL.</B> Enzymes of the trypanothione metabolism as targets for antitrypanosomal drug development. Curr Top Med Chem 2002;11:1239-59. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000104&pid=S0120-4157200700050000600020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>21. <B>Fairlamb AH, Cerami A.</B> Metabolism and functions of trypanothione in the Kinetoplastida. Annu Rev Microbiol 1992;46:695-729. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000105&pid=S0120-4157200700050000600021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>22. <B>Dumas C, Ouellette M, Tovar J, Cunningham ML, Fairlamb AH, Tamar S, <I>et al</I>. </B>Disruption of the trypanothione reductase gene of <I>Leishmania</I> decreases its ability to survive oxidative stress in macrophages. 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J Biol Chem 1992;267:7411-20.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000107&pid=S0120-4157200700050000600023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>24. <B>Campetella O, Henriksson J, Aslund A, Frasch AC, Petterson U, Cazzulo JJ.</B> The major cysteine proteinase (cruzipain) from <I>Trypanosoma cruzi</I> is encoded by multiple polymorphic tandemly organized genes located on different chromosomes. Mol Biochem Parasitol 1992;50:225-34.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000108&pid=S0120-4157200700050000600024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --> 25. <B><font color="#0000ff"> </font>Tomas AM</B></FONT><B><FONT FACE="Arial">, </font></B><B><FONT FACE="Arial">Kelly</font></B> <B><FONT FACE="Arial">JM</font></B><B><FONT FACE="Arial">.</font></B> <FONT FACE="Arial">Stage-regulated expression of cruzipain, the major cysteine protease of <I>Trypanosoma cruzi</I> is independent of the level of RNA1</FONT><FONT FACE="Arial">.</FONT><FONT FACE="Arial">Mol Biochem Parasitol </FONT><FONT FACE="Arial">1996</FONT><FONT FACE="Arial">;</FONT><FONT FACE="Arial">76</FONT><FONT FACE="Arial">:</FONT><FONT FACE="Arial">91-103</FONT><FONT FACE="Arial">.</FONT><FONT FACE="Arial">    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000109&pid=S0120-4157200700050000600025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>26. <B>Lima AP, Tessier DC, Thomas DY, Scharfstein J, Storrer AC, Vernet T.</B> Identification of new cysteine protease gene isoforms in <I>Trypanosoma cruzi</I>. Mol Biochem Parasitol 1994;67:333-8.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000110&pid=S0120-4157200700050000600026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>27. <B>Lima AP, dos Reis FC, Serveau C, Lalmanach, Juliano L, M&eacute;nard R, <I>et al</I>.</B> Cysteine protease isoforms from <I>Trypanosoma cruzi</I>, cruzipain 2 and cruzain, present different substrate preference and susceptibility to inhibitor. Mol Biochem Parasitol 2001;114:41-52.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000111&pid=S0120-4157200700050000600027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>28. <B>Cazzulo JJ, Stoka V, Turk V.</B> Cruzipain, the major cysteine proteinase from the protozoan parasite <I>Trypanosoma cruzi. </I>Biol Chem 1997;378:1-10.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000112&pid=S0120-4157200700050000600028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>29. <B>Cazzulo JJ. </B>Cruzipain, major cysteine proteinase of <I>Trypanosoma cruzi</I>: sequence and genomic organization of the codifying genes.<I> </I>Medicina (B Aires) 1999;59 (Suppl. 2):7-10. &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000113&pid=S0120-4157200700050000600029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>30.<B> Engel JC, Doyle PS, Hsieh I, McKerrow JH.</B> Cysteine protease inhibitors cure an experimental <I>Trypanosoma cruzi</I> infection. J Exp Med 1998;188:725-34.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000114&pid=S0120-4157200700050000600030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>31. <B>Klemba M, Goldberg DE. </B>Biological roles of proteases in parasitic protozoa. Annu Rev Biochem 2002<I>;</I>71:275-305.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000115&pid=S0120-4157200700050000600031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>32. <B>Del Nery E, Juliano MA, Lima AP, Schafstein J, Juliano</B> <B>L.</B> Kininogenase activity by the major cysteinyl proteinase (cruzipain) from <I>Trypanosoma cruzi</I>. 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J Exp Med 2000;192:1289-300.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=000117&pid=S0120-4157200700050000600033&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><P>34. <B>Aparicio IM, Scharfstein J, Lima AP.</B> A new cruzipain-mediated pathway of human cell invasion by <I>Trypanosoma cruzi </I>requires trypomastigote membranes. 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